Genes within 1Mb (chr6:132810238:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 408763 sc-eQTL 3.49e-01 -0.153 0.163 0.079 B L1
ENSG00000079950 STX7 297040 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0201 0.0617 0.079 B L1
ENSG00000112303 VNN2 46779 sc-eQTL 1.58e-01 0.163 0.115 0.079 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -4331 sc-eQTL 8.23e-01 0.0157 0.0702 0.079 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -3101 sc-eQTL 1.86e-13 -1.02 0.13 0.079 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 678350 sc-eQTL 2.06e-01 0.122 0.0965 0.079 B L1
ENSG00000079950 STX7 297040 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0698 0.12 0.079 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 46779 sc-eQTL 6.17e-01 0.0521 0.104 0.079 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -4331 sc-eQTL 1.75e-01 -0.0959 0.0704 0.079 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -3101 sc-eQTL 8.16e-16 -1.07 0.123 0.079 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 297040 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0856 0.118 0.079 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 46779 sc-eQTL 3.58e-02 -0.289 0.137 0.079 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -4331 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0473 0.0471 0.079 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -3101 sc-eQTL 3.80e-12 -0.937 0.127 0.079 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 297040 sc-eQTL 2.79e-01 -0.114 0.105 0.083 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 75473 sc-eQTL 3.54e-01 0.122 0.131 0.083 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 96183 sc-eQTL 4.30e-01 -0.112 0.141 0.083 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 46779 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0515 0.151 0.083 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -4331 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0741 0.0847 0.083 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -3101 sc-eQTL 4.47e-01 -0.102 0.134 0.083 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -292890 sc-eQTL 1.91e-02 -0.285 0.121 0.083 DC L1
ENSG00000079950 STX7 297040 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0625 0.0818 0.079 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 75473 sc-eQTL 3.33e-01 -0.136 0.14 0.079 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 96183 sc-eQTL 6.56e-01 0.0675 0.151 0.079 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 46779 sc-eQTL 1.88e-01 -0.14 0.106 0.079 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -4331 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0381 0.0639 0.079 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -3101 sc-eQTL 2.46e-05 -0.523 0.121 0.079 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 297040 sc-eQTL 4.58e-02 -0.242 0.121 0.079 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 46779 sc-eQTL 3.71e-01 -0.136 0.151 0.079 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -4331 sc-eQTL 3.63e-02 -0.131 0.062 0.079 NK L1
ENSG00000079950 STX7 297040 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0476 0.122 0.079 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 46779 sc-eQTL 4.50e-01 -0.112 0.148 0.079 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -4331 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0226 0.0586 0.079 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -3101 sc-eQTL 3.44e-06 -0.727 0.152 0.079 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 408763 sc-eQTL 4.34e-02 -0.325 0.16 0.089 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 297040 sc-eQTL 9.26e-01 -0.014 0.151 0.089 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 46779 sc-eQTL 1.45e-01 0.234 0.16 0.089 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -4331 sc-eQTL 5.60e-01 0.0504 0.0862 0.089 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -3101 sc-eQTL 1.55e-02 -0.363 0.149 0.089 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 678350 sc-eQTL 1.42e-01 -0.211 0.143 0.089 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 408763 sc-eQTL 2.77e-01 -0.164 0.151 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 297040 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00848 0.0989 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 46779 sc-eQTL 5.64e-01 0.086 0.149 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -4331 sc-eQTL 2.70e-01 0.101 0.091 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -3101 sc-eQTL 2.16e-04 -0.599 0.159 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 678350 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0246 0.14 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 408763 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0741 0.152 0.08 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 297040 sc-eQTL 4.21e-01 0.0961 0.119 0.08 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 46779 sc-eQTL 7.70e-01 0.0457 0.156 0.08 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -4331 sc-eQTL 9.61e-01 -0.0037 0.0753 0.08 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -3101 sc-eQTL 2.10e-03 -0.478 0.153 0.08 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 678350 sc-eQTL 4.88e-01 0.102 0.146 0.08 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 408763 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00531 0.17 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 297040 sc-eQTL 6.51e-01 0.0336 0.0742 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 46779 sc-eQTL 7.77e-02 0.254 0.143 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -4331 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0378 0.082 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -3101 sc-eQTL 1.16e-07 -0.813 0.148 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 678350 sc-eQTL 1.79e-01 0.141 0.104 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 408763 sc-eQTL 4.45e-01 0.128 0.168 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 297040 sc-eQTL 1.95e-01 -0.118 0.091 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 46779 sc-eQTL 2.23e-01 0.205 0.167 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -4331 sc-eQTL 1.56e-01 0.126 0.0884 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -3101 sc-eQTL 6.25e-05 -0.666 0.163 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 678350 sc-eQTL 6.24e-01 0.0576 0.117 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 297040 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0262 0.164 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 46779 sc-eQTL 3.29e-01 -0.162 0.166 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -4331 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0165 0.0767 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -3101 sc-eQTL 1.36e-01 -0.23 0.154 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 297040 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0735 0.129 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 46779 sc-eQTL 3.89e-01 0.103 0.119 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -4331 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0545 0.0774 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -3101 sc-eQTL 1.08e-12 -1.0 0.132 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 297040 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0708 0.144 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 46779 sc-eQTL 5.23e-02 -0.274 0.14 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -4331 sc-eQTL 1.43e-01 -0.107 0.073 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -3101 sc-eQTL 3.02e-06 -0.774 0.161 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 297040 sc-eQTL 6.44e-01 0.0757 0.164 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 46779 sc-eQTL 3.42e-01 -0.149 0.157 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -4331 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0681 0.0643 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -3101 sc-eQTL 1.56e-04 -0.596 0.155 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 297040 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00718 0.136 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 46779 sc-eQTL 1.59e-02 -0.371 0.152 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -4331 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0845 0.0825 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -3101 sc-eQTL 1.20e-08 -0.881 0.148 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 297040 sc-eQTL 3.15e-01 -0.166 0.165 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 46779 sc-eQTL 2.24e-01 -0.174 0.143 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -4331 sc-eQTL 6.51e-01 -0.037 0.0818 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -3101 sc-eQTL 1.35e-05 -0.7 0.157 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 297040 sc-eQTL 1.60e-01 0.227 0.161 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 46779 sc-eQTL 5.68e-01 0.0917 0.161 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -4331 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0325 0.0783 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -3101 sc-eQTL 1.48e-04 -0.64 0.165 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 297040 sc-eQTL 8.10e-01 0.0423 0.176 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 46779 sc-eQTL 4.72e-01 -0.126 0.175 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -4331 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0969 0.0938 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -3101 sc-eQTL 3.92e-01 -0.152 0.177 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 297040 sc-eQTL 2.30e-01 -0.186 0.154 0.08 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 46779 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0811 0.158 0.08 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -4331 sc-eQTL 3.70e-01 0.0695 0.0774 0.08 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -3101 sc-eQTL 7.83e-03 -0.429 0.16 0.08 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 297040 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0578 0.163 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 46779 sc-eQTL 6.03e-02 -0.31 0.164 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -4331 sc-eQTL 1.26e-02 -0.229 0.091 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 297040 sc-eQTL 2.67e-02 -0.285 0.128 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 46779 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0422 0.162 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -4331 sc-eQTL 3.31e-03 -0.187 0.0629 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 297040 sc-eQTL 4.52e-01 -0.125 0.167 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 46779 sc-eQTL 6.98e-01 0.0655 0.169 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -4331 sc-eQTL 1.41e-02 -0.192 0.0775 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 297040 sc-eQTL 3.32e-01 -0.138 0.142 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 46779 sc-eQTL 4.14e-01 -0.131 0.159 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -4331 sc-eQTL 7.05e-02 -0.156 0.086 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 408763 sc-eQTL 8.95e-01 0.0236 0.179 0.089 PB L2
ENSG00000079950 STX7 297040 sc-eQTL 5.59e-01 0.0873 0.149 0.089 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 46779 sc-eQTL 4.98e-01 0.124 0.182 0.089 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -4331 sc-eQTL 1.13e-01 0.163 0.102 0.089 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -3101 sc-eQTL 1.67e-01 -0.267 0.192 0.089 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 678350 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0522 0.127 0.089 PB L2
ENSG00000079950 STX7 297040 sc-eQTL 1.58e-01 0.211 0.149 0.078 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 46779 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0226 0.16 0.078 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -4331 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0581 0.0605 0.078 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -3101 sc-eQTL 1.87e-02 -0.367 0.155 0.078 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 297040 sc-eQTL 1.21e-01 -0.243 0.156 0.079 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 46779 sc-eQTL 9.47e-01 0.00873 0.132 0.079 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -4331 sc-eQTL 6.87e-01 0.0236 0.0585 0.079 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -3101 sc-eQTL 2.67e-04 -0.594 0.16 0.079 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 297040 sc-eQTL 5.03e-01 0.0906 0.135 0.085 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 75473 sc-eQTL 9.52e-01 0.00808 0.134 0.085 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 96183 sc-eQTL 4.18e-01 -0.128 0.158 0.085 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 46779 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0474 0.154 0.085 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -4331 sc-eQTL 4.00e-01 -0.064 0.0758 0.085 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -3101 sc-eQTL 3.81e-01 -0.132 0.15 0.085 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -292890 sc-eQTL 1.02e-01 -0.196 0.119 0.085 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 297040 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0671 0.104 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 75473 sc-eQTL 4.61e-01 -0.109 0.147 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 96183 sc-eQTL 4.81e-01 0.105 0.148 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 46779 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0095 0.119 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -4331 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00291 0.066 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -3101 sc-eQTL 2.88e-02 -0.277 0.126 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 297040 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0566 0.114 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 75473 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0869 0.143 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 96183 sc-eQTL 3.30e-01 0.151 0.155 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 46779 sc-eQTL 3.09e-01 -0.103 0.101 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -4331 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0565 0.073 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -3101 sc-eQTL 3.51e-05 -0.549 0.13 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 297040 sc-eQTL 1.60e-01 -0.25 0.177 0.085 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 46779 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0574 0.197 0.085 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -4331 sc-eQTL 3.34e-01 0.0726 0.0749 0.085 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -3101 sc-eQTL 1.14e-02 -0.487 0.19 0.085 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 297040 sc-eQTL 7.59e-01 0.0469 0.153 0.08 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 75473 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0759 0.154 0.08 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 96183 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0356 0.152 0.08 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 46779 sc-eQTL 3.79e-01 -0.136 0.155 0.08 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -4331 sc-eQTL 2.39e-01 -0.0794 0.0672 0.08 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -3101 sc-eQTL 1.75e-02 -0.388 0.162 0.08 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 297040 sc-eQTL 8.16e-01 -0.027 0.116 0.077 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 75473 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0199 0.164 0.077 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 96183 sc-eQTL 9.67e-01 0.00685 0.163 0.077 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 46779 sc-eQTL 1.18e-01 -0.244 0.156 0.077 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -4331 sc-eQTL 1.60e-01 0.11 0.0782 0.077 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -3101 sc-eQTL 9.30e-01 0.0122 0.139 0.077 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 297040 sc-eQTL 3.51e-02 -0.255 0.12 0.09 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 75473 sc-eQTL 3.52e-01 0.114 0.122 0.09 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 96183 sc-eQTL 8.36e-02 -0.215 0.123 0.09 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 46779 sc-eQTL 3.86e-01 -0.129 0.148 0.09 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -4331 sc-eQTL 3.05e-01 -0.105 0.102 0.09 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -3101 sc-eQTL 5.50e-02 -0.289 0.149 0.09 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -292890 sc-eQTL 8.10e-02 -0.252 0.143 0.09 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 408763 sc-eQTL 2.07e-02 -0.37 0.159 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 297040 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0142 0.0909 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 46779 sc-eQTL 3.80e-01 0.126 0.144 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -4331 sc-eQTL 3.96e-01 0.0696 0.0818 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -3101 sc-eQTL 1.27e-06 -0.71 0.142 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 678350 sc-eQTL 8.77e-01 0.0225 0.145 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 408763 sc-eQTL 4.72e-01 0.122 0.17 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 297040 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0414 0.0698 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 46779 sc-eQTL 1.37e-02 0.332 0.134 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -4331 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00545 0.082 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -3101 sc-eQTL 1.14e-09 -0.903 0.142 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 678350 sc-eQTL 2.12e-01 0.123 0.0979 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 297040 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0665 0.0878 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 75473 sc-eQTL 3.91e-01 -0.123 0.143 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 96183 sc-eQTL 5.38e-01 0.092 0.149 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 46779 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0786 0.0986 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -4331 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0436 0.0677 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -3101 sc-eQTL 1.17e-04 -0.457 0.116 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 297040 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0266 0.108 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 75473 sc-eQTL 8.18e-01 0.0366 0.158 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 96183 sc-eQTL 6.62e-01 0.0687 0.157 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 46779 sc-eQTL 1.18e-01 -0.231 0.147 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -4331 sc-eQTL 9.79e-01 0.00166 0.0628 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -3101 sc-eQTL 9.11e-03 -0.395 0.15 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 297040 sc-eQTL 4.74e-02 -0.241 0.121 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 46779 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0811 0.155 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -4331 sc-eQTL 6.34e-03 -0.171 0.062 0.08 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079931 MOXD1 408763 eQTL 0.000477 -0.175 0.0499 0.00118 0.0 0.0937
ENSG00000079950 STX7 297040 pQTL 0.0113 -0.095 0.0375 0.0 0.0 0.095
ENSG00000093134 VNN3 75473 eQTL 5.99e-05 -0.0973 0.0241 0.0 0.0 0.0937
ENSG00000112299 VNN1 96183 pQTL 8.66e-06 0.257 0.0576 0.0 0.0 0.095
ENSG00000112299 VNN1 96183 eQTL 1.03e-05 0.159 0.0359 0.00251 0.0 0.0937
ENSG00000112303 VNN2 46779 pQTL 0.00158 -0.132 0.0417 0.0 0.0 0.095
ENSG00000112303 VNN2 46779 eQTL 0.0112 -0.0548 0.0216 0.00197 0.0 0.0937
ENSG00000146409 SLC18B1 -3101 eQTL 3.92e-113 -0.74 0.0284 0.0 0.0 0.0937
ENSG00000234484 AL032821.1 57563 eQTL 6.33e-06 0.233 0.0513 0.0 0.0 0.0937


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000093134 VNN3 75473 7.6e-06 9.35e-06 1.63e-06 5.34e-06 2.28e-06 4.22e-06 1.02e-05 2.08e-06 9.4e-06 4.99e-06 1.13e-05 5.47e-06 1.36e-05 3.88e-06 2.54e-06 6.62e-06 4.55e-06 7.6e-06 2.97e-06 2.82e-06 5.79e-06 9.08e-06 7.62e-06 3.36e-06 1.31e-05 4.43e-06 5.48e-06 3.75e-06 1.03e-05 8.21e-06 5.07e-06 1.05e-06 1.21e-06 3.69e-06 4.61e-06 2.77e-06 1.79e-06 1.95e-06 2.11e-06 1.26e-06 1.52e-06 1.16e-05 1.38e-06 3.6e-07 1.05e-06 1.78e-06 1.8e-06 7.33e-07 6.34e-07
ENSG00000112299 VNN1 96183 5.81e-06 7.73e-06 1.3e-06 3.95e-06 2.24e-06 2.7e-06 9.07e-06 1.92e-06 6.18e-06 4.35e-06 9e-06 4.49e-06 1.11e-05 3.14e-06 1.62e-06 5.83e-06 3.72e-06 4.58e-06 2.64e-06 2.74e-06 4.55e-06 7.66e-06 6.05e-06 3.21e-06 1.03e-05 3.51e-06 4.48e-06 2.54e-06 7.12e-06 7.87e-06 3.97e-06 1.07e-06 1.22e-06 3.06e-06 3.31e-06 2.7e-06 1.83e-06 1.85e-06 2e-06 9.77e-07 1.11e-06 8.42e-06 1.31e-06 2.62e-07 7.98e-07 1.53e-06 1.4e-06 6.92e-07 5.01e-07
ENSG00000146409 SLC18B1 -3101 6.23e-05 5.73e-05 1.55e-05 2.8e-05 1.35e-05 3.15e-05 8.77e-05 1.04e-05 6.3e-05 2.98e-05 8.21e-05 3.58e-05 0.000101 2.99e-05 1.42e-05 4.49e-05 4.15e-05 5.13e-05 2.17e-05 1.89e-05 3.75e-05 7.05e-05 6.21e-05 2.7e-05 8.82e-05 2.21e-05 3.07e-05 2.53e-05 7.13e-05 7.91e-05 4.38e-05 5.77e-06 8.44e-06 1.93e-05 2.5e-05 1.57e-05 9.21e-06 9.89e-06 1.24e-05 8.71e-06 4.43e-06 6.64e-05 8.52e-06 1.71e-06 7.56e-06 1.14e-05 9.22e-06 5.86e-06 5.43e-06
ENSG00000234484 AL032821.1 57563 9.54e-06 1.14e-05 2.57e-06 7.29e-06 2.5e-06 5.46e-06 1.25e-05 2.62e-06 1.12e-05 6.2e-06 1.43e-05 6.55e-06 1.88e-05 3.97e-06 3.62e-06 8.14e-06 6.4e-06 9.99e-06 3.68e-06 3.64e-06 6.51e-06 1.14e-05 1.07e-05 4.78e-06 1.95e-05 5.01e-06 7.27e-06 5e-06 1.37e-05 1.16e-05 7.11e-06 1.22e-06 1.38e-06 4.56e-06 5.87e-06 3.76e-06 2.04e-06 2.4e-06 2.96e-06 2.07e-06 1.7e-06 1.37e-05 1.84e-06 4.43e-07 1.88e-06 2.34e-06 2.47e-06 1.24e-06 1.06e-06