Genes within 1Mb (chr6:132797352:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 395877 sc-eQTL 3.49e-01 -0.153 0.163 0.079 B L1
ENSG00000079950 STX7 284154 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0201 0.0617 0.079 B L1
ENSG00000112303 VNN2 33893 sc-eQTL 1.58e-01 0.163 0.115 0.079 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -17217 sc-eQTL 8.23e-01 0.0157 0.0702 0.079 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -15987 sc-eQTL 1.86e-13 -1.02 0.13 0.079 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 665464 sc-eQTL 2.06e-01 0.122 0.0965 0.079 B L1
ENSG00000079950 STX7 284154 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0698 0.12 0.079 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 33893 sc-eQTL 6.17e-01 0.0521 0.104 0.079 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -17217 sc-eQTL 1.75e-01 -0.0959 0.0704 0.079 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -15987 sc-eQTL 8.16e-16 -1.07 0.123 0.079 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 284154 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0856 0.118 0.079 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 33893 sc-eQTL 3.58e-02 -0.289 0.137 0.079 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -17217 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0473 0.0471 0.079 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -15987 sc-eQTL 3.80e-12 -0.937 0.127 0.079 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 284154 sc-eQTL 2.79e-01 -0.114 0.105 0.083 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 62587 sc-eQTL 3.54e-01 0.122 0.131 0.083 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 83297 sc-eQTL 4.30e-01 -0.112 0.141 0.083 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 33893 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0515 0.151 0.083 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -17217 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0741 0.0847 0.083 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -15987 sc-eQTL 4.47e-01 -0.102 0.134 0.083 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -305776 sc-eQTL 1.91e-02 -0.285 0.121 0.083 DC L1
ENSG00000079950 STX7 284154 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0625 0.0818 0.079 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 62587 sc-eQTL 3.33e-01 -0.136 0.14 0.079 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 83297 sc-eQTL 6.56e-01 0.0675 0.151 0.079 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 33893 sc-eQTL 1.88e-01 -0.14 0.106 0.079 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -17217 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0381 0.0639 0.079 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -15987 sc-eQTL 2.46e-05 -0.523 0.121 0.079 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 284154 sc-eQTL 4.58e-02 -0.242 0.121 0.079 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 33893 sc-eQTL 3.71e-01 -0.136 0.151 0.079 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -17217 sc-eQTL 3.63e-02 -0.131 0.062 0.079 NK L1
ENSG00000079950 STX7 284154 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0476 0.122 0.079 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 33893 sc-eQTL 4.50e-01 -0.112 0.148 0.079 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -17217 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0226 0.0586 0.079 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -15987 sc-eQTL 3.44e-06 -0.727 0.152 0.079 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 395877 sc-eQTL 4.34e-02 -0.325 0.16 0.089 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 284154 sc-eQTL 9.26e-01 -0.014 0.151 0.089 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 33893 sc-eQTL 1.45e-01 0.234 0.16 0.089 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -17217 sc-eQTL 5.60e-01 0.0504 0.0862 0.089 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -15987 sc-eQTL 1.55e-02 -0.363 0.149 0.089 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 665464 sc-eQTL 1.42e-01 -0.211 0.143 0.089 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 395877 sc-eQTL 2.77e-01 -0.164 0.151 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 284154 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00848 0.0989 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 33893 sc-eQTL 5.64e-01 0.086 0.149 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -17217 sc-eQTL 2.70e-01 0.101 0.091 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -15987 sc-eQTL 2.16e-04 -0.599 0.159 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 665464 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0246 0.14 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 395877 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0741 0.152 0.08 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 284154 sc-eQTL 4.21e-01 0.0961 0.119 0.08 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 33893 sc-eQTL 7.70e-01 0.0457 0.156 0.08 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -17217 sc-eQTL 9.61e-01 -0.0037 0.0753 0.08 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -15987 sc-eQTL 2.10e-03 -0.478 0.153 0.08 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 665464 sc-eQTL 4.88e-01 0.102 0.146 0.08 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 395877 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00531 0.17 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 284154 sc-eQTL 6.51e-01 0.0336 0.0742 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 33893 sc-eQTL 7.77e-02 0.254 0.143 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -17217 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0378 0.082 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -15987 sc-eQTL 1.16e-07 -0.813 0.148 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 665464 sc-eQTL 1.79e-01 0.141 0.104 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 395877 sc-eQTL 4.45e-01 0.128 0.168 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 284154 sc-eQTL 1.95e-01 -0.118 0.091 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 33893 sc-eQTL 2.23e-01 0.205 0.167 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -17217 sc-eQTL 1.56e-01 0.126 0.0884 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -15987 sc-eQTL 6.25e-05 -0.666 0.163 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 665464 sc-eQTL 6.24e-01 0.0576 0.117 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 284154 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0262 0.164 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 33893 sc-eQTL 3.29e-01 -0.162 0.166 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -17217 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0165 0.0767 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -15987 sc-eQTL 1.36e-01 -0.23 0.154 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 284154 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0735 0.129 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 33893 sc-eQTL 3.89e-01 0.103 0.119 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -17217 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0545 0.0774 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -15987 sc-eQTL 1.08e-12 -1.0 0.132 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 284154 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0708 0.144 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 33893 sc-eQTL 5.23e-02 -0.274 0.14 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -17217 sc-eQTL 1.43e-01 -0.107 0.073 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -15987 sc-eQTL 3.02e-06 -0.774 0.161 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 284154 sc-eQTL 6.44e-01 0.0757 0.164 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 33893 sc-eQTL 3.42e-01 -0.149 0.157 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -17217 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0681 0.0643 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -15987 sc-eQTL 1.56e-04 -0.596 0.155 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 284154 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00718 0.136 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 33893 sc-eQTL 1.59e-02 -0.371 0.152 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -17217 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0845 0.0825 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -15987 sc-eQTL 1.20e-08 -0.881 0.148 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 284154 sc-eQTL 3.15e-01 -0.166 0.165 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 33893 sc-eQTL 2.24e-01 -0.174 0.143 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -17217 sc-eQTL 6.51e-01 -0.037 0.0818 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -15987 sc-eQTL 1.35e-05 -0.7 0.157 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 284154 sc-eQTL 1.60e-01 0.227 0.161 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 33893 sc-eQTL 5.68e-01 0.0917 0.161 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -17217 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0325 0.0783 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -15987 sc-eQTL 1.48e-04 -0.64 0.165 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 284154 sc-eQTL 8.10e-01 0.0423 0.176 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 33893 sc-eQTL 4.72e-01 -0.126 0.175 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -17217 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0969 0.0938 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -15987 sc-eQTL 3.92e-01 -0.152 0.177 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 284154 sc-eQTL 2.30e-01 -0.186 0.154 0.08 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 33893 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0811 0.158 0.08 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -17217 sc-eQTL 3.70e-01 0.0695 0.0774 0.08 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -15987 sc-eQTL 7.83e-03 -0.429 0.16 0.08 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 284154 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0578 0.163 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 33893 sc-eQTL 6.03e-02 -0.31 0.164 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -17217 sc-eQTL 1.26e-02 -0.229 0.091 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 284154 sc-eQTL 2.67e-02 -0.285 0.128 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 33893 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0422 0.162 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -17217 sc-eQTL 3.31e-03 -0.187 0.0629 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 284154 sc-eQTL 4.52e-01 -0.125 0.167 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 33893 sc-eQTL 6.98e-01 0.0655 0.169 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -17217 sc-eQTL 1.41e-02 -0.192 0.0775 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 284154 sc-eQTL 3.32e-01 -0.138 0.142 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 33893 sc-eQTL 4.14e-01 -0.131 0.159 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -17217 sc-eQTL 7.05e-02 -0.156 0.086 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 395877 sc-eQTL 8.95e-01 0.0236 0.179 0.089 PB L2
ENSG00000079950 STX7 284154 sc-eQTL 5.59e-01 0.0873 0.149 0.089 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 33893 sc-eQTL 4.98e-01 0.124 0.182 0.089 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -17217 sc-eQTL 1.13e-01 0.163 0.102 0.089 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -15987 sc-eQTL 1.67e-01 -0.267 0.192 0.089 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 665464 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0522 0.127 0.089 PB L2
ENSG00000079950 STX7 284154 sc-eQTL 1.58e-01 0.211 0.149 0.078 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 33893 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0226 0.16 0.078 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -17217 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0581 0.0605 0.078 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -15987 sc-eQTL 1.87e-02 -0.367 0.155 0.078 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 284154 sc-eQTL 1.21e-01 -0.243 0.156 0.079 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 33893 sc-eQTL 9.47e-01 0.00873 0.132 0.079 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -17217 sc-eQTL 6.87e-01 0.0236 0.0585 0.079 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -15987 sc-eQTL 2.67e-04 -0.594 0.16 0.079 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 284154 sc-eQTL 5.03e-01 0.0906 0.135 0.085 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 62587 sc-eQTL 9.52e-01 0.00808 0.134 0.085 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 83297 sc-eQTL 4.18e-01 -0.128 0.158 0.085 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 33893 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0474 0.154 0.085 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -17217 sc-eQTL 4.00e-01 -0.064 0.0758 0.085 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -15987 sc-eQTL 3.81e-01 -0.132 0.15 0.085 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -305776 sc-eQTL 1.02e-01 -0.196 0.119 0.085 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 284154 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0671 0.104 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 62587 sc-eQTL 4.61e-01 -0.109 0.147 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 83297 sc-eQTL 4.81e-01 0.105 0.148 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 33893 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0095 0.119 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -17217 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00291 0.066 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -15987 sc-eQTL 2.88e-02 -0.277 0.126 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 284154 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0566 0.114 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 62587 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0869 0.143 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 83297 sc-eQTL 3.30e-01 0.151 0.155 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 33893 sc-eQTL 3.09e-01 -0.103 0.101 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -17217 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0565 0.073 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -15987 sc-eQTL 3.51e-05 -0.549 0.13 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 284154 sc-eQTL 1.60e-01 -0.25 0.177 0.085 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 33893 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0574 0.197 0.085 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -17217 sc-eQTL 3.34e-01 0.0726 0.0749 0.085 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -15987 sc-eQTL 1.14e-02 -0.487 0.19 0.085 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 284154 sc-eQTL 7.59e-01 0.0469 0.153 0.08 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 62587 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0759 0.154 0.08 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 83297 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0356 0.152 0.08 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 33893 sc-eQTL 3.79e-01 -0.136 0.155 0.08 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -17217 sc-eQTL 2.39e-01 -0.0794 0.0672 0.08 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -15987 sc-eQTL 1.75e-02 -0.388 0.162 0.08 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 284154 sc-eQTL 8.16e-01 -0.027 0.116 0.077 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 62587 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0199 0.164 0.077 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 83297 sc-eQTL 9.67e-01 0.00685 0.163 0.077 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 33893 sc-eQTL 1.18e-01 -0.244 0.156 0.077 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -17217 sc-eQTL 1.60e-01 0.11 0.0782 0.077 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -15987 sc-eQTL 9.30e-01 0.0122 0.139 0.077 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 284154 sc-eQTL 3.51e-02 -0.255 0.12 0.09 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 62587 sc-eQTL 3.52e-01 0.114 0.122 0.09 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 83297 sc-eQTL 8.36e-02 -0.215 0.123 0.09 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 33893 sc-eQTL 3.86e-01 -0.129 0.148 0.09 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -17217 sc-eQTL 3.05e-01 -0.105 0.102 0.09 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -15987 sc-eQTL 5.50e-02 -0.289 0.149 0.09 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -305776 sc-eQTL 8.10e-02 -0.252 0.143 0.09 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 395877 sc-eQTL 2.07e-02 -0.37 0.159 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 284154 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0142 0.0909 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 33893 sc-eQTL 3.80e-01 0.126 0.144 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -17217 sc-eQTL 3.96e-01 0.0696 0.0818 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -15987 sc-eQTL 1.27e-06 -0.71 0.142 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 665464 sc-eQTL 8.77e-01 0.0225 0.145 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 395877 sc-eQTL 4.72e-01 0.122 0.17 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 284154 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0414 0.0698 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 33893 sc-eQTL 1.37e-02 0.332 0.134 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -17217 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00545 0.082 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -15987 sc-eQTL 1.14e-09 -0.903 0.142 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 665464 sc-eQTL 2.12e-01 0.123 0.0979 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 284154 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0665 0.0878 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 62587 sc-eQTL 3.91e-01 -0.123 0.143 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 83297 sc-eQTL 5.38e-01 0.092 0.149 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 33893 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0786 0.0986 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -17217 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0436 0.0677 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -15987 sc-eQTL 1.17e-04 -0.457 0.116 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 284154 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0266 0.108 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 62587 sc-eQTL 8.18e-01 0.0366 0.158 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 83297 sc-eQTL 6.62e-01 0.0687 0.157 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 33893 sc-eQTL 1.18e-01 -0.231 0.147 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -17217 sc-eQTL 9.79e-01 0.00166 0.0628 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -15987 sc-eQTL 9.11e-03 -0.395 0.15 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 284154 sc-eQTL 4.74e-02 -0.241 0.121 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 33893 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0811 0.155 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -17217 sc-eQTL 6.34e-03 -0.171 0.062 0.08 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079931 MOXD1 395877 eQTL 0.000549 -0.173 0.0498 0.00108 0.0 0.0947
ENSG00000079950 STX7 284154 pQTL 0.012 -0.0941 0.0374 0.0 0.0 0.0957
ENSG00000093134 VNN3 62587 eQTL 3.17e-05 -0.101 0.0241 0.0 0.0 0.0947
ENSG00000112299 VNN1 83297 pQTL 1.05e-05 0.255 0.0576 0.0 0.0 0.0957
ENSG00000112299 VNN1 83297 eQTL 1.61e-05 0.155 0.0358 0.00601 0.0 0.0947
ENSG00000112303 VNN2 33893 pQTL 0.00154 -0.132 0.0416 0.0 0.0 0.0957
ENSG00000112303 VNN2 33893 eQTL 0.00663 -0.0585 0.0215 0.00159 0.0 0.0947
ENSG00000146409 SLC18B1 -15987 eQTL 1.47e-112 -0.737 0.0284 0.0 0.0 0.0947
ENSG00000234484 AL032821.1 44677 eQTL 3.28e-06 0.24 0.0512 0.0 0.0 0.0947


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000093134 VNN3 62587 1e-05 6.14e-06 6.03e-07 3.81e-06 8e-07 3.11e-06 4.66e-06 9.98e-07 4.57e-06 1.99e-06 4.9e-06 3.43e-06 7.77e-06 2.13e-06 1.09e-06 3.13e-06 1.83e-06 3.57e-06 1.51e-06 1.01e-06 1.64e-06 4.77e-06 3.6e-06 1.84e-06 5.95e-06 1.32e-06 2.29e-06 1.37e-06 4.3e-06 3e-06 2.12e-06 5.42e-07 5.68e-07 1.71e-06 1.98e-06 8.85e-07 9.39e-07 4.91e-07 1.3e-06 4.27e-07 2.08e-07 5.74e-06 4.2e-07 1.63e-07 3.99e-07 6.03e-07 9.94e-07 2.2e-07 2.75e-07
ENSG00000112299 VNN1 83297 5.93e-06 4.57e-06 2.8e-07 2.61e-06 4.89e-07 1.7e-06 2.25e-06 5.79e-07 1.8e-06 8.51e-07 2.49e-06 1.4e-06 3.49e-06 1.44e-06 1e-06 1.77e-06 9.77e-07 2.2e-06 5.55e-07 1.21e-06 6.35e-07 3.03e-06 2.23e-06 1e-06 4.06e-06 1.2e-06 1.61e-06 1.38e-06 2e-06 1.61e-06 1.64e-06 3.05e-07 3.27e-07 1.24e-06 1.9e-06 4.86e-07 7.59e-07 4.41e-07 7.83e-07 3.65e-07 2.74e-07 3.56e-06 6.27e-07 1.99e-07 2.96e-07 3.1e-07 8.19e-07 1.38e-07 8.44e-08
ENSG00000146409 SLC18B1 -15987 5.17e-05 2.13e-05 3.46e-06 1.13e-05 2.75e-06 1.26e-05 2.38e-05 2.68e-06 1.67e-05 8.48e-06 2.19e-05 8.78e-06 2.66e-05 5.92e-06 5.35e-06 1.03e-05 8.14e-06 1.52e-05 3.87e-06 4.14e-06 7.77e-06 1.94e-05 1.85e-05 4.43e-06 2.78e-05 5.39e-06 8.05e-06 6.41e-06 1.75e-05 1.33e-05 1.05e-05 1.34e-06 1.34e-06 4.05e-06 8.64e-06 2.9e-06 1.79e-06 2.74e-06 3.22e-06 1.76e-06 1.69e-06 2.26e-05 2.65e-06 3.24e-07 1.13e-06 2.59e-06 2.9e-06 8.41e-07 4.51e-07
ENSG00000234484 AL032821.1 44677 1.53e-05 9.38e-06 6.41e-07 5.25e-06 1.61e-06 5.12e-06 9.72e-06 1.2e-06 5.2e-06 3.34e-06 8.88e-06 4.15e-06 1.01e-05 2.7e-06 2.01e-06 4.63e-06 2.76e-06 3.84e-06 1.54e-06 1.72e-06 2.83e-06 7.74e-06 5.37e-06 1.65e-06 9.94e-06 2.21e-06 4.36e-06 1.73e-06 6.45e-06 4.97e-06 3.37e-06 5.72e-07 5.91e-07 2.53e-06 3.64e-06 9.06e-07 9.95e-07 5.57e-07 1.12e-06 7.17e-07 6.93e-07 8.16e-06 1.09e-06 1.52e-07 3.7e-07 9.29e-07 9.51e-07 5.06e-07 1.74e-07