Genes within 1Mb (chr6:132743683:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 342208 sc-eQTL 2.45e-02 -0.269 0.119 0.158 B L1
ENSG00000079950 STX7 230485 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0195 0.0453 0.158 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -19776 sc-eQTL 1.28e-02 0.211 0.0839 0.158 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -70886 sc-eQTL 4.20e-02 -0.104 0.051 0.158 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -69656 sc-eQTL 7.43e-01 0.0355 0.108 0.158 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 611795 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0172 0.0711 0.158 B L1
ENSG00000079950 STX7 230485 sc-eQTL 3.79e-01 0.0771 0.0874 0.158 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -19776 sc-eQTL 5.12e-01 0.0498 0.0758 0.158 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -70886 sc-eQTL 7.87e-01 -0.014 0.0516 0.158 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -69656 sc-eQTL 3.02e-01 0.108 0.104 0.158 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 230485 sc-eQTL 4.91e-01 0.0602 0.0872 0.158 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -19776 sc-eQTL 6.06e-02 0.191 0.101 0.158 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -70886 sc-eQTL 6.55e-01 0.0156 0.0348 0.158 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -69656 sc-eQTL 9.73e-01 0.00363 0.105 0.158 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 230485 sc-eQTL 3.65e-01 0.0747 0.0823 0.153 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 8918 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0788 0.102 0.153 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 29628 sc-eQTL 5.45e-01 0.0669 0.11 0.153 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -19776 sc-eQTL 7.77e-03 0.312 0.116 0.153 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -70886 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00737 0.0662 0.153 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -69656 sc-eQTL 7.26e-01 0.0367 0.105 0.153 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -359445 sc-eQTL 1.80e-01 -0.128 0.095 0.153 DC L1
ENSG00000079950 STX7 230485 sc-eQTL 8.77e-01 -0.00924 0.0598 0.158 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 8918 sc-eQTL 2.19e-01 -0.126 0.102 0.158 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 29628 sc-eQTL 7.69e-01 0.0325 0.11 0.158 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -19776 sc-eQTL 1.04e-10 0.48 0.0706 0.158 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -70886 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0496 0.0466 0.158 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -69656 sc-eQTL 2.09e-02 0.212 0.0913 0.158 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 230485 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0271 0.0906 0.157 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -19776 sc-eQTL 5.89e-02 0.212 0.112 0.157 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -70886 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00153 0.0466 0.157 NK L1
ENSG00000079950 STX7 230485 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0413 0.0927 0.158 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -19776 sc-eQTL 7.55e-02 0.199 0.111 0.158 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -70886 sc-eQTL 5.49e-01 0.0267 0.0445 0.158 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -69656 sc-eQTL 9.38e-01 0.00948 0.122 0.158 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 342208 sc-eQTL 1.72e-01 -0.164 0.119 0.163 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 230485 sc-eQTL 1.55e-01 -0.16 0.112 0.163 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -19776 sc-eQTL 2.97e-02 0.259 0.118 0.163 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -70886 sc-eQTL 4.57e-01 0.0478 0.0641 0.163 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -69656 sc-eQTL 2.15e-01 0.139 0.112 0.163 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 611795 sc-eQTL 3.58e-02 -0.224 0.106 0.163 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 342208 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0388 0.109 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 230485 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0398 0.0714 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -19776 sc-eQTL 2.56e-01 0.122 0.107 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -70886 sc-eQTL 2.97e-02 -0.143 0.0652 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -69656 sc-eQTL 5.00e-01 0.0801 0.119 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 611795 sc-eQTL 7.32e-01 0.0345 0.101 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 342208 sc-eQTL 8.23e-01 0.0251 0.112 0.159 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 230485 sc-eQTL 4.14e-01 0.0719 0.0879 0.159 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -19776 sc-eQTL 9.47e-02 0.192 0.114 0.159 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -70886 sc-eQTL 8.98e-02 -0.094 0.0551 0.159 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -69656 sc-eQTL 1.51e-01 -0.166 0.115 0.159 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 611795 sc-eQTL 4.98e-01 0.0732 0.108 0.159 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 342208 sc-eQTL 2.37e-01 -0.147 0.124 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 230485 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0282 0.0542 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -19776 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0153 0.105 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -70886 sc-eQTL 1.28e-01 -0.0912 0.0596 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -69656 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0783 0.116 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 611795 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0182 0.0766 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 342208 sc-eQTL 3.75e-01 -0.103 0.116 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 230485 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0709 0.0632 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -19776 sc-eQTL 5.11e-01 0.0765 0.116 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -70886 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0229 0.0616 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -69656 sc-eQTL 2.86e-02 0.256 0.116 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 611795 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0883 0.0813 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 230485 sc-eQTL 5.67e-02 0.243 0.127 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -19776 sc-eQTL 1.03e-01 0.21 0.128 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -70886 sc-eQTL 2.31e-01 0.0714 0.0594 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -69656 sc-eQTL 3.93e-01 0.103 0.12 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 230485 sc-eQTL 2.11e-01 0.118 0.0943 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -19776 sc-eQTL 5.04e-01 0.0587 0.0876 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -70886 sc-eQTL 7.41e-01 0.0188 0.0569 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -69656 sc-eQTL 7.09e-01 0.0409 0.109 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 230485 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0938 0.104 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -19776 sc-eQTL 6.44e-01 0.0474 0.103 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -70886 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0209 0.0532 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -69656 sc-eQTL 2.10e-01 0.154 0.123 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 230485 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0182 0.121 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -19776 sc-eQTL 8.48e-02 -0.2 0.116 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -70886 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0196 0.0478 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -69656 sc-eQTL 7.42e-01 0.0392 0.119 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 230485 sc-eQTL 8.26e-01 0.0222 0.101 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -19776 sc-eQTL 1.64e-02 0.274 0.113 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -70886 sc-eQTL 9.70e-02 0.102 0.0612 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -69656 sc-eQTL 4.17e-01 0.0969 0.119 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 230485 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0725 0.121 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -19776 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0379 0.105 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -70886 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00457 0.0599 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -69656 sc-eQTL 5.99e-01 0.0632 0.12 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 230485 sc-eQTL 6.57e-01 -0.055 0.124 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -19776 sc-eQTL 4.16e-01 0.0999 0.122 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -70886 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0225 0.0598 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -69656 sc-eQTL 7.37e-01 -0.044 0.131 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 230485 sc-eQTL 1.37e-01 -0.194 0.13 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -19776 sc-eQTL 1.60e-01 0.182 0.129 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -70886 sc-eQTL 1.21e-01 0.108 0.0694 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -69656 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0746 0.132 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 230485 sc-eQTL 9.49e-02 -0.203 0.121 0.147 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -19776 sc-eQTL 1.63e-01 0.173 0.123 0.147 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -70886 sc-eQTL 1.84e-01 0.081 0.0608 0.147 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -69656 sc-eQTL 2.73e-01 0.14 0.128 0.147 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 230485 sc-eQTL 4.38e-01 0.0917 0.118 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -19776 sc-eQTL 7.33e-02 0.215 0.119 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -70886 sc-eQTL 6.69e-01 0.0287 0.0669 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 230485 sc-eQTL 5.47e-01 -0.058 0.0962 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -19776 sc-eQTL 4.34e-02 0.242 0.119 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -70886 sc-eQTL 3.86e-01 0.0415 0.0477 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 230485 sc-eQTL 2.76e-01 -0.128 0.117 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -19776 sc-eQTL 3.32e-01 0.115 0.119 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -70886 sc-eQTL 9.07e-01 0.00649 0.0554 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 230485 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0483 0.104 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -19776 sc-eQTL 2.44e-01 0.137 0.117 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -70886 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0133 0.0638 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 342208 sc-eQTL 2.55e-01 -0.142 0.124 0.163 PB L2
ENSG00000079950 STX7 230485 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0515 0.104 0.163 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -19776 sc-eQTL 9.14e-01 0.0137 0.127 0.163 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -70886 sc-eQTL 3.71e-01 0.0646 0.0719 0.163 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -69656 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0456 0.135 0.163 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 611795 sc-eQTL 7.69e-01 0.0262 0.0889 0.163 PB L2
ENSG00000079950 STX7 230485 sc-eQTL 4.88e-02 0.211 0.106 0.161 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -19776 sc-eQTL 4.29e-01 0.0912 0.115 0.161 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -70886 sc-eQTL 2.77e-02 0.0956 0.0431 0.161 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -69656 sc-eQTL 5.41e-01 -0.069 0.113 0.161 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 230485 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0549 0.12 0.158 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -19776 sc-eQTL 8.12e-01 0.024 0.101 0.158 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -70886 sc-eQTL 2.65e-01 0.0497 0.0445 0.158 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -69656 sc-eQTL 3.37e-01 0.121 0.126 0.158 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 230485 sc-eQTL 4.36e-01 0.0813 0.104 0.151 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 8918 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0409 0.103 0.151 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 29628 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0163 0.122 0.151 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -19776 sc-eQTL 3.74e-02 0.246 0.117 0.151 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -70886 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0053 0.0585 0.151 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -69656 sc-eQTL 9.04e-01 -0.014 0.116 0.151 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -359445 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0534 0.0926 0.151 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 230485 sc-eQTL 4.68e-01 0.0551 0.0757 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 8918 sc-eQTL 2.24e-01 -0.13 0.107 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 29628 sc-eQTL 9.37e-01 0.00853 0.108 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -19776 sc-eQTL 1.03e-09 0.505 0.0791 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -70886 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0227 0.0479 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -69656 sc-eQTL 4.90e-02 0.182 0.0917 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 230485 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0564 0.0832 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 8918 sc-eQTL 9.64e-01 0.00475 0.104 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 29628 sc-eQTL 5.52e-01 0.0673 0.113 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -19776 sc-eQTL 1.29e-11 0.475 0.0663 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -70886 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0203 0.0532 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -69656 sc-eQTL 2.26e-01 0.119 0.0982 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 230485 sc-eQTL 6.87e-01 -0.054 0.133 0.158 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -19776 sc-eQTL 4.57e-01 0.11 0.147 0.158 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -70886 sc-eQTL 4.42e-01 0.0433 0.0562 0.158 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -69656 sc-eQTL 3.91e-01 0.125 0.145 0.158 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 230485 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0997 0.11 0.158 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 8918 sc-eQTL 9.86e-01 0.00191 0.111 0.158 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 29628 sc-eQTL 1.66e-01 0.152 0.109 0.158 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -19776 sc-eQTL 2.32e-01 0.134 0.111 0.158 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -70886 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0304 0.0486 0.158 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -69656 sc-eQTL 6.23e-01 0.0582 0.118 0.158 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 230485 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0464 0.0827 0.156 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 8918 sc-eQTL 1.10e-01 0.186 0.116 0.156 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 29628 sc-eQTL 1.61e-02 0.277 0.114 0.156 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -19776 sc-eQTL 4.23e-01 0.0894 0.111 0.156 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -70886 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0669 0.0557 0.156 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -69656 sc-eQTL 5.24e-01 0.063 0.0986 0.156 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 230485 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0575 0.0947 0.153 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 8918 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00087 0.0955 0.153 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 29628 sc-eQTL 2.88e-03 0.286 0.0944 0.153 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -19776 sc-eQTL 3.59e-02 0.241 0.114 0.153 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -70886 sc-eQTL 3.73e-01 0.071 0.0795 0.153 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -69656 sc-eQTL 3.54e-01 0.109 0.118 0.153 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -359445 sc-eQTL 2.39e-01 -0.133 0.112 0.153 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 342208 sc-eQTL 9.93e-01 0.00104 0.117 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 230485 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0457 0.0662 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -19776 sc-eQTL 2.69e-02 0.231 0.104 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -70886 sc-eQTL 1.01e-02 -0.153 0.0588 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -69656 sc-eQTL 9.86e-01 0.00198 0.11 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 611795 sc-eQTL 9.57e-01 0.00568 0.106 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 342208 sc-eQTL 1.72e-01 -0.17 0.124 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 230485 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0365 0.051 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -19776 sc-eQTL 3.36e-01 0.0955 0.099 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -70886 sc-eQTL 2.13e-01 -0.0747 0.0598 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -69656 sc-eQTL 3.99e-01 0.0956 0.113 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 611795 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0364 0.0719 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 230485 sc-eQTL 7.06e-01 0.0243 0.0644 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 8918 sc-eQTL 2.30e-01 -0.126 0.105 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 29628 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0198 0.109 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -19776 sc-eQTL 1.59e-11 0.463 0.0649 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -70886 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0343 0.0495 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -69656 sc-eQTL 4.64e-02 0.175 0.0874 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 230485 sc-eQTL 1.51e-01 -0.113 0.0785 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 8918 sc-eQTL 5.68e-01 0.0663 0.116 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 29628 sc-eQTL 1.03e-02 0.293 0.113 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -19776 sc-eQTL 2.17e-01 0.134 0.108 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -70886 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0461 0.0459 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -69656 sc-eQTL 1.81e-01 0.149 0.111 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 230485 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0721 0.0908 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -19776 sc-eQTL 4.85e-02 0.226 0.114 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -70886 sc-eQTL 7.67e-01 0.014 0.047 0.157 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 230485 eQTL 0.00892 -0.0644 0.0246 0.0 0.0 0.122
ENSG00000093134 VNN3 8918 eQTL 9.28e-09 0.129 0.0223 0.0 0.0 0.122
ENSG00000112299 VNN1 29628 pQTL 0.000409 0.195 0.0549 0.0 0.0 0.121
ENSG00000112299 VNN1 29628 eQTL 0.036 -0.0707 0.0337 0.0 0.0 0.122
ENSG00000112303 VNN2 -19776 pQTL 6.65e-21 0.366 0.0384 0.0373 0.0387 0.121
ENSG00000112303 VNN2 -19776 eQTL 9.78e-08 0.107 0.0198 0.0 0.0 0.122
ENSG00000146409 SLC18B1 -69656 eQTL 0.000696 0.117 0.0344 0.0 0.0 0.122
ENSG00000234484 AL032821.1 -8992 eQTL 7.41e-19 -0.42 0.0464 0.0 0.00547 0.122


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000093134 VNN3 8918 0.000162 2.04e-05 4.84e-06 9.8e-06 2.44e-06 2.03e-05 2.83e-05 2.15e-06 1.85e-05 8.95e-06 1.91e-05 7.55e-06 3.26e-05 7.61e-06 5.23e-06 1.18e-05 8.54e-06 2.23e-05 5.37e-06 3.29e-06 8.88e-06 2.66e-05 1.82e-05 5.74e-06 2.35e-05 5.33e-06 7.98e-06 6.38e-06 2.03e-05 1.63e-05 1.29e-05 1.45e-06 1.71e-06 4.93e-06 5.47e-06 2.8e-06 1.74e-06 1.95e-06 3.25e-06 2.01e-06 1.12e-06 2.12e-05 2.68e-06 1.81e-07 1.93e-06 1.7e-06 3.24e-06 7.39e-07 5.35e-07
ENSG00000112303 VNN2 -19776 0.000182 1.76e-05 4.17e-06 9e-06 2.32e-06 2.01e-05 2.48e-05 1.81e-06 1.67e-05 7.84e-06 1.71e-05 6.84e-06 2.93e-05 7.19e-06 5.14e-06 1.07e-05 8.25e-06 2.06e-05 4.61e-06 3.12e-06 8.07e-06 2.44e-05 1.59e-05 5.14e-06 2.05e-05 4.5e-06 7.54e-06 5.39e-06 1.77e-05 1.49e-05 1.24e-05 1.24e-06 1.57e-06 4.3e-06 4.89e-06 2.59e-06 1.83e-06 1.96e-06 2.99e-06 1.76e-06 9.79e-07 1.86e-05 2.64e-06 1.89e-07 1.7e-06 1.73e-06 2.91e-06 7.04e-07 4.58e-07
ENSG00000234484 AL032821.1 -8992 0.000162 2.04e-05 4.84e-06 9.8e-06 2.44e-06 2.03e-05 2.83e-05 2.15e-06 1.85e-05 8.95e-06 1.91e-05 7.45e-06 3.26e-05 7.61e-06 5.23e-06 1.18e-05 8.54e-06 2.23e-05 5.37e-06 3.29e-06 8.78e-06 2.66e-05 1.82e-05 5.74e-06 2.35e-05 5.33e-06 7.94e-06 6.38e-06 2.03e-05 1.63e-05 1.29e-05 1.45e-06 1.71e-06 4.93e-06 5.47e-06 2.83e-06 1.74e-06 1.95e-06 3.25e-06 2.01e-06 1.12e-06 2.08e-05 2.68e-06 1.81e-07 1.93e-06 1.7e-06 3.21e-06 7.39e-07 5.35e-07