logo

Genes within 1Mb (chr6:132730172:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 328697 sc-eQTL 3.18e-02 -0.261 0.121 0.158 B L1
ENSG00000079950 STX7 216974 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0214 0.0461 0.158 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -33287 sc-eQTL 9.30e-03 0.224 0.0853 0.158 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -84397 sc-eQTL 6.10e-02 -0.0979 0.052 0.158 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -83167 sc-eQTL 7.51e-01 0.0351 0.11 0.158 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 598284 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0327 0.0723 0.158 B L1
ENSG00000079950 STX7 216974 sc-eQTL 3.18e-01 0.089 0.0889 0.158 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -33287 sc-eQTL 3.77e-01 0.0682 0.077 0.158 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -84397 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0129 0.0524 0.158 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -83167 sc-eQTL 2.33e-01 0.126 0.106 0.158 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 216974 sc-eQTL 5.48e-01 0.0535 0.0888 0.158 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -33287 sc-eQTL 7.02e-02 0.187 0.103 0.158 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -84397 sc-eQTL 7.37e-01 0.0119 0.0355 0.158 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -83167 sc-eQTL 8.90e-01 0.0148 0.107 0.158 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 216974 sc-eQTL 2.61e-01 0.0947 0.084 0.153 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -4593 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0783 0.104 0.153 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 16117 sc-eQTL 6.09e-01 0.0578 0.113 0.153 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -33287 sc-eQTL 9.69e-03 0.31 0.119 0.153 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -84397 sc-eQTL 9.04e-01 0.00816 0.0676 0.153 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -83167 sc-eQTL 7.41e-01 0.0355 0.107 0.153 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -372956 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0992 0.0972 0.153 DC L1
ENSG00000079950 STX7 216974 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0239 0.0608 0.158 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -4593 sc-eQTL 1.41e-01 -0.153 0.104 0.158 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 16117 sc-eQTL 7.19e-01 0.0405 0.112 0.158 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -33287 sc-eQTL 6.68e-10 0.469 0.0725 0.158 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -84397 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0391 0.0475 0.158 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -83167 sc-eQTL 1.17e-02 0.236 0.0926 0.158 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 216974 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0291 0.0918 0.157 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -33287 sc-eQTL 4.75e-02 0.226 0.113 0.157 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -84397 sc-eQTL 9.19e-01 0.00478 0.0473 0.157 NK L1
ENSG00000079950 STX7 216974 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0492 0.094 0.158 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -33287 sc-eQTL 9.39e-02 0.19 0.113 0.158 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -84397 sc-eQTL 4.77e-01 0.0321 0.045 0.158 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -83167 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0287 0.123 0.158 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 328697 sc-eQTL 1.73e-01 -0.167 0.122 0.163 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 216974 sc-eQTL 2.38e-01 -0.136 0.114 0.163 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -33287 sc-eQTL 3.59e-02 0.255 0.121 0.163 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -84397 sc-eQTL 4.78e-01 0.0465 0.0654 0.163 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -83167 sc-eQTL 1.41e-01 0.169 0.114 0.163 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 598284 sc-eQTL 2.33e-02 -0.246 0.108 0.163 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 328697 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00177 0.111 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 216974 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0564 0.0725 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -33287 sc-eQTL 2.51e-01 0.125 0.109 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -84397 sc-eQTL 3.74e-02 -0.139 0.0663 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -83167 sc-eQTL 5.16e-01 0.0784 0.121 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 598284 sc-eQTL 6.15e-01 0.0517 0.103 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 328697 sc-eQTL 9.36e-01 0.00923 0.114 0.159 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 216974 sc-eQTL 5.67e-01 0.0512 0.0894 0.159 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -33287 sc-eQTL 8.28e-02 0.202 0.116 0.159 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -84397 sc-eQTL 9.59e-02 -0.0937 0.056 0.159 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -83167 sc-eQTL 2.27e-01 -0.142 0.117 0.159 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 598284 sc-eQTL 5.09e-01 0.0724 0.11 0.159 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 328697 sc-eQTL 1.96e-01 -0.163 0.126 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 216974 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0244 0.0551 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -33287 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0205 0.107 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -84397 sc-eQTL 1.86e-01 -0.0805 0.0607 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -83167 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0723 0.118 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 598284 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0173 0.0779 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 328697 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0802 0.118 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 216974 sc-eQTL 2.15e-01 -0.0797 0.0641 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -33287 sc-eQTL 4.86e-01 0.0823 0.118 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -84397 sc-eQTL 9.38e-01 0.00485 0.0625 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -83167 sc-eQTL 5.48e-02 0.228 0.118 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 598284 sc-eQTL 2.26e-01 -0.1 0.0824 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 216974 sc-eQTL 3.16e-02 0.277 0.128 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -33287 sc-eQTL 7.13e-02 0.235 0.129 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -84397 sc-eQTL 1.31e-01 0.091 0.06 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -83167 sc-eQTL 3.06e-01 0.125 0.121 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 216974 sc-eQTL 1.98e-01 0.124 0.0958 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -33287 sc-eQTL 3.50e-01 0.0832 0.0889 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -84397 sc-eQTL 7.72e-01 0.0167 0.0578 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -83167 sc-eQTL 5.76e-01 0.0622 0.111 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 216974 sc-eQTL 3.44e-01 -0.101 0.106 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -33287 sc-eQTL 7.78e-01 0.0295 0.105 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -84397 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0218 0.0542 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -83167 sc-eQTL 1.25e-01 0.192 0.125 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 216974 sc-eQTL 9.33e-01 0.0103 0.123 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -33287 sc-eQTL 5.67e-02 -0.225 0.117 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -84397 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0272 0.0486 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -83167 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00229 0.121 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 216974 sc-eQTL 8.54e-01 0.0189 0.103 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -33287 sc-eQTL 1.64e-02 0.279 0.115 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -84397 sc-eQTL 1.19e-01 0.0975 0.0622 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -83167 sc-eQTL 4.24e-01 0.0971 0.121 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 216974 sc-eQTL 3.82e-01 -0.108 0.123 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -33287 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0636 0.106 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -84397 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00449 0.0609 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -83167 sc-eQTL 4.36e-01 0.0951 0.122 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 216974 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0449 0.126 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -33287 sc-eQTL 6.47e-01 0.0575 0.125 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -84397 sc-eQTL 7.81e-01 -0.017 0.0612 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -83167 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00822 0.134 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 216974 sc-eQTL 1.64e-01 -0.184 0.132 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -33287 sc-eQTL 9.15e-02 0.222 0.131 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -84397 sc-eQTL 7.97e-02 0.124 0.0703 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -83167 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0813 0.134 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 216974 sc-eQTL 9.22e-02 -0.21 0.124 0.147 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -33287 sc-eQTL 1.98e-01 0.163 0.126 0.147 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -84397 sc-eQTL 1.64e-01 0.0868 0.0621 0.147 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -83167 sc-eQTL 3.11e-01 0.132 0.13 0.147 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 216974 sc-eQTL 5.05e-01 0.0803 0.12 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -33287 sc-eQTL 7.18e-02 0.22 0.121 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -84397 sc-eQTL 5.95e-01 0.0363 0.0681 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 216974 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0442 0.0977 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -33287 sc-eQTL 3.58e-02 0.256 0.121 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -84397 sc-eQTL 3.07e-01 0.0495 0.0484 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 216974 sc-eQTL 1.23e-01 -0.184 0.119 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -33287 sc-eQTL 2.75e-01 0.132 0.12 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -84397 sc-eQTL 8.63e-01 0.0097 0.0562 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 216974 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0653 0.106 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -33287 sc-eQTL 2.62e-01 0.134 0.119 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -84397 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0161 0.0647 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 328697 sc-eQTL 2.19e-01 -0.152 0.123 0.167 PB L2
ENSG00000079950 STX7 216974 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0689 0.103 0.167 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -33287 sc-eQTL 8.30e-01 0.0272 0.126 0.167 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -84397 sc-eQTL 4.23e-01 0.0575 0.0715 0.167 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -83167 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0781 0.134 0.167 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 598284 sc-eQTL 8.23e-01 0.0198 0.0883 0.167 PB L2
ENSG00000079950 STX7 216974 sc-eQTL 7.40e-02 0.194 0.108 0.161 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -33287 sc-eQTL 4.16e-01 0.0951 0.117 0.161 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -84397 sc-eQTL 1.96e-02 0.103 0.0437 0.161 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -83167 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0922 0.114 0.161 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 216974 sc-eQTL 6.89e-01 -0.049 0.122 0.158 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -33287 sc-eQTL 7.13e-01 0.0379 0.103 0.158 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -84397 sc-eQTL 3.63e-01 0.0414 0.0454 0.158 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -83167 sc-eQTL 3.24e-01 0.127 0.128 0.158 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 216974 sc-eQTL 4.02e-01 0.0898 0.107 0.149 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -4593 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0355 0.106 0.149 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 16117 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0315 0.125 0.149 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -33287 sc-eQTL 3.08e-02 0.262 0.12 0.149 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -84397 sc-eQTL 9.14e-01 0.00652 0.0602 0.149 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -83167 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0259 0.119 0.149 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -372956 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0626 0.0952 0.149 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 216974 sc-eQTL 3.61e-01 0.0702 0.0767 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -4593 sc-eQTL 1.37e-01 -0.161 0.108 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 16117 sc-eQTL 7.93e-01 0.0288 0.11 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -33287 sc-eQTL 3.35e-09 0.498 0.0807 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -84397 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0164 0.0487 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -83167 sc-eQTL 2.72e-02 0.206 0.0928 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 216974 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0936 0.0845 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -4593 sc-eQTL 9.36e-01 0.00851 0.106 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 16117 sc-eQTL 5.00e-01 0.0775 0.115 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -33287 sc-eQTL 1.89e-11 0.48 0.0677 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -84397 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0155 0.0542 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -83167 sc-eQTL 2.10e-01 0.126 0.1 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 216974 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0825 0.138 0.155 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -33287 sc-eQTL 4.86e-01 0.106 0.152 0.155 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -84397 sc-eQTL 4.33e-01 0.0455 0.0579 0.155 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -83167 sc-eQTL 4.44e-01 0.115 0.15 0.155 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 216974 sc-eQTL 2.68e-01 -0.124 0.112 0.158 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -4593 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0127 0.113 0.158 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 16117 sc-eQTL 1.64e-01 0.155 0.111 0.158 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -33287 sc-eQTL 2.41e-01 0.133 0.113 0.158 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -84397 sc-eQTL 6.56e-01 -0.022 0.0494 0.158 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -83167 sc-eQTL 4.30e-01 0.095 0.12 0.158 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 216974 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0679 0.0837 0.156 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -4593 sc-eQTL 9.57e-02 0.197 0.117 0.156 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 16117 sc-eQTL 1.53e-02 0.283 0.116 0.156 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -33287 sc-eQTL 4.32e-01 0.0887 0.113 0.156 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -84397 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0441 0.0565 0.156 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -83167 sc-eQTL 5.40e-01 0.0613 0.0999 0.156 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 216974 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0564 0.0965 0.153 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -4593 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00893 0.0972 0.153 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 16117 sc-eQTL 3.64e-03 0.284 0.0963 0.153 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -33287 sc-eQTL 4.43e-02 0.236 0.116 0.153 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -84397 sc-eQTL 3.01e-01 0.0838 0.0809 0.153 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -83167 sc-eQTL 4.31e-01 0.0947 0.12 0.153 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -372956 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0803 0.115 0.153 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 328697 sc-eQTL 8.35e-01 0.0248 0.119 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 216974 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0609 0.0673 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -33287 sc-eQTL 1.92e-02 0.248 0.105 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -84397 sc-eQTL 1.34e-02 -0.149 0.0599 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -83167 sc-eQTL 8.25e-01 0.0247 0.111 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 598284 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00508 0.108 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 328697 sc-eQTL 1.82e-01 -0.169 0.126 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 216974 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0382 0.0519 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -33287 sc-eQTL 3.38e-01 0.0968 0.101 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -84397 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0619 0.0609 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -83167 sc-eQTL 4.49e-01 0.0872 0.115 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 598284 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0403 0.0731 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 216974 sc-eQTL 8.15e-01 0.0153 0.0656 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -4593 sc-eQTL 1.49e-01 -0.154 0.106 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 16117 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00771 0.111 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -33287 sc-eQTL 9.56e-11 0.455 0.0667 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -84397 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0283 0.0505 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -83167 sc-eQTL 3.13e-02 0.193 0.089 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 216974 sc-eQTL 8.60e-02 -0.137 0.0796 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -4593 sc-eQTL 6.31e-01 0.0567 0.118 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 16117 sc-eQTL 1.11e-02 0.295 0.115 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -33287 sc-eQTL 2.50e-01 0.127 0.11 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -84397 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0287 0.0467 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -83167 sc-eQTL 1.40e-01 0.167 0.113 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 216974 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0725 0.092 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -33287 sc-eQTL 4.00e-02 0.239 0.116 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -84397 sc-eQTL 6.64e-01 0.0207 0.0476 0.157 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 216974 eQTL 0.0126 -0.0612 0.0245 0.0 0.0 0.122
ENSG00000093134 VNN3 -4593 eQTL 2.43e-09 0.133 0.0221 0.0 0.0 0.122
ENSG00000112299 VNN1 16117 pQTL 0.0013 0.176 0.0547 0.0 0.0 0.121
ENSG00000112299 VNN1 16117 eQTL 0.0192 -0.0785 0.0335 0.0 0.0 0.122
ENSG00000112303 VNN2 -33287 pQTL 7.910000000000001e-21 0.364 0.0382 0.0152 0.0158 0.121
ENSG00000112303 VNN2 -33287 eQTL 4.67e-09 0.116 0.0197 0.0 0.0 0.122
ENSG00000146409 SLC18B1 -83167 eQTL 0.00251 0.104 0.0343 0.0 0.0 0.122
ENSG00000234484 AL032821.1 -22503 eQTL 1.25e-19 -0.427 0.0461 0.0 0.00308 0.122

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000093134 VNN3 -4593 3.75e-05 3.34e-05 6.45e-06 1.6e-05 6.17e-06 1.54e-05 4.7e-05 4.92e-06 3.31e-05 1.64e-05 4.06e-05 1.87e-05 5.08e-05 1.48e-05 7.32e-06 2.04e-05 1.86e-05 2.71e-05 8.31e-06 7.31e-06 1.69e-05 3.5e-05 3.3e-05 9.89e-06 4.78e-05 8.49e-06 1.53e-05 1.36e-05 3.39e-05 2.85e-05 2.17e-05 1.61e-06 2.95e-06 7.58e-06 1.25e-05 6.2e-06 3.48e-06 3.23e-06 5.26e-06 3.56e-06 1.71e-06 3.92e-05 3.8e-06 4.29e-07 2.71e-06 4.34e-06 4.3e-06 1.72e-06 1.5e-06
ENSG00000112303 VNN2 -33287 1.25e-05 1.38e-05 2.56e-06 7.87e-06 2.58e-06 6.2e-06 1.53e-05 2.12e-06 1.07e-05 5.89e-06 1.58e-05 6.49e-06 2.16e-05 4.76e-06 3.88e-06 7.36e-06 6.57e-06 9.78e-06 3.39e-06 3.12e-06 6.5e-06 1.12e-05 1.14e-05 3.39e-06 2.22e-05 4.48e-06 6.68e-06 4.85e-06 1.42e-05 1.24e-05 7.65e-06 9.92e-07 1.18e-06 3.55e-06 5.46e-06 2.82e-06 1.82e-06 2.14e-06 2.13e-06 1.21e-06 1.01e-06 1.63e-05 1.82e-06 1.61e-07 8.27e-07 1.74e-06 1.79e-06 7.87e-07 4.71e-07
ENSG00000146409 SLC18B1 -83167 5.46e-06 5.76e-06 7.29e-07 3.57e-06 1.2e-06 1.85e-06 6.46e-06 9.77e-07 5.25e-06 2.44e-06 6.44e-06 3.28e-06 8.29e-06 1.98e-06 1.21e-06 3.85e-06 1.86e-06 3.79e-06 1.54e-06 1.02e-06 3.02e-06 4.97e-06 4.48e-06 1.36e-06 8.97e-06 1.74e-06 2.35e-06 1.77e-06 4.92e-06 5.53e-06 2.83e-06 5.76e-07 4.91e-07 1.66e-06 2e-06 1.17e-06 9.55e-07 4.39e-07 8.67e-07 5.02e-07 2.79e-07 7e-06 5.96e-07 1.62e-07 4.13e-07 6.92e-07 9.76e-07 5.05e-07 3.53e-07
ENSG00000234484 AL032821.1 -22503 1.63e-05 1.93e-05 3.15e-06 1.03e-05 2.45e-06 8.49e-06 2.25e-05 2.44e-06 1.63e-05 7.9e-06 2.09e-05 8.18e-06 2.95e-05 7.44e-06 5.1e-06 9.76e-06 8.8e-06 1.39e-05 4.65e-06 4.13e-06 7.99e-06 1.55e-05 1.69e-05 4.81e-06 2.78e-05 5.31e-06 7.95e-06 6.89e-06 1.8e-05 1.67e-05 1.15e-05 1.18e-06 1.53e-06 4.07e-06 7.03e-06 3.76e-06 1.84e-06 2.71e-06 3.15e-06 2e-06 1.12e-06 2.12e-05 2.68e-06 2.36e-07 1.29e-06 2.44e-06 2.6e-06 9.75e-07 6.16e-07