Genes within 1Mb (chr6:132723901:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 322426 sc-eQTL 3.18e-02 -0.261 0.121 0.158 B L1
ENSG00000079950 STX7 210703 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0214 0.0461 0.158 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -39558 sc-eQTL 9.30e-03 0.224 0.0853 0.158 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -90668 sc-eQTL 6.10e-02 -0.0979 0.052 0.158 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -89438 sc-eQTL 7.51e-01 0.0351 0.11 0.158 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 592013 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0327 0.0723 0.158 B L1
ENSG00000079950 STX7 210703 sc-eQTL 3.18e-01 0.089 0.0889 0.158 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -39558 sc-eQTL 3.77e-01 0.0682 0.077 0.158 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -90668 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0129 0.0524 0.158 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -89438 sc-eQTL 2.33e-01 0.126 0.106 0.158 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 210703 sc-eQTL 5.48e-01 0.0535 0.0888 0.158 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -39558 sc-eQTL 7.02e-02 0.187 0.103 0.158 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -90668 sc-eQTL 7.37e-01 0.0119 0.0355 0.158 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -89438 sc-eQTL 8.90e-01 0.0148 0.107 0.158 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 210703 sc-eQTL 2.61e-01 0.0947 0.084 0.153 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -10864 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0783 0.104 0.153 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 9846 sc-eQTL 6.09e-01 0.0578 0.113 0.153 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -39558 sc-eQTL 9.69e-03 0.31 0.119 0.153 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -90668 sc-eQTL 9.04e-01 0.00816 0.0676 0.153 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -89438 sc-eQTL 7.41e-01 0.0355 0.107 0.153 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -379227 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0992 0.0972 0.153 DC L1
ENSG00000079950 STX7 210703 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0239 0.0608 0.158 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -10864 sc-eQTL 1.41e-01 -0.153 0.104 0.158 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 9846 sc-eQTL 7.19e-01 0.0405 0.112 0.158 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -39558 sc-eQTL 6.68e-10 0.469 0.0725 0.158 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -90668 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0391 0.0475 0.158 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -89438 sc-eQTL 1.17e-02 0.236 0.0926 0.158 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 210703 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0291 0.0918 0.157 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -39558 sc-eQTL 4.75e-02 0.226 0.113 0.157 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -90668 sc-eQTL 9.19e-01 0.00478 0.0473 0.157 NK L1
ENSG00000079950 STX7 210703 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0492 0.094 0.158 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -39558 sc-eQTL 9.39e-02 0.19 0.113 0.158 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -90668 sc-eQTL 4.77e-01 0.0321 0.045 0.158 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -89438 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0287 0.123 0.158 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 322426 sc-eQTL 1.73e-01 -0.167 0.122 0.163 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 210703 sc-eQTL 2.38e-01 -0.136 0.114 0.163 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -39558 sc-eQTL 3.59e-02 0.255 0.121 0.163 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -90668 sc-eQTL 4.78e-01 0.0465 0.0654 0.163 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -89438 sc-eQTL 1.41e-01 0.169 0.114 0.163 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 592013 sc-eQTL 2.33e-02 -0.246 0.108 0.163 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 322426 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00177 0.111 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 210703 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0564 0.0725 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -39558 sc-eQTL 2.51e-01 0.125 0.109 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -90668 sc-eQTL 3.74e-02 -0.139 0.0663 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -89438 sc-eQTL 5.16e-01 0.0784 0.121 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 592013 sc-eQTL 6.15e-01 0.0517 0.103 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 322426 sc-eQTL 9.36e-01 0.00923 0.114 0.159 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 210703 sc-eQTL 5.67e-01 0.0512 0.0894 0.159 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -39558 sc-eQTL 8.28e-02 0.202 0.116 0.159 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -90668 sc-eQTL 9.59e-02 -0.0937 0.056 0.159 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -89438 sc-eQTL 2.27e-01 -0.142 0.117 0.159 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 592013 sc-eQTL 5.09e-01 0.0724 0.11 0.159 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 322426 sc-eQTL 1.96e-01 -0.163 0.126 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 210703 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0244 0.0551 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -39558 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0205 0.107 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -90668 sc-eQTL 1.86e-01 -0.0805 0.0607 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -89438 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0723 0.118 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 592013 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0173 0.0779 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 322426 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0802 0.118 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 210703 sc-eQTL 2.15e-01 -0.0797 0.0641 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -39558 sc-eQTL 4.86e-01 0.0823 0.118 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -90668 sc-eQTL 9.38e-01 0.00485 0.0625 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -89438 sc-eQTL 5.48e-02 0.228 0.118 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 592013 sc-eQTL 2.26e-01 -0.1 0.0824 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 210703 sc-eQTL 3.16e-02 0.277 0.128 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -39558 sc-eQTL 7.13e-02 0.235 0.129 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -90668 sc-eQTL 1.31e-01 0.091 0.06 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -89438 sc-eQTL 3.06e-01 0.125 0.121 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 210703 sc-eQTL 1.98e-01 0.124 0.0958 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -39558 sc-eQTL 3.50e-01 0.0832 0.0889 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -90668 sc-eQTL 7.72e-01 0.0167 0.0578 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -89438 sc-eQTL 5.76e-01 0.0622 0.111 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 210703 sc-eQTL 3.44e-01 -0.101 0.106 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -39558 sc-eQTL 7.78e-01 0.0295 0.105 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -90668 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0218 0.0542 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -89438 sc-eQTL 1.25e-01 0.192 0.125 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 210703 sc-eQTL 9.33e-01 0.0103 0.123 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -39558 sc-eQTL 5.67e-02 -0.225 0.117 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -90668 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0272 0.0486 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -89438 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00229 0.121 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 210703 sc-eQTL 8.54e-01 0.0189 0.103 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -39558 sc-eQTL 1.64e-02 0.279 0.115 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -90668 sc-eQTL 1.19e-01 0.0975 0.0622 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -89438 sc-eQTL 4.24e-01 0.0971 0.121 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 210703 sc-eQTL 3.82e-01 -0.108 0.123 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -39558 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0636 0.106 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -90668 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00449 0.0609 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -89438 sc-eQTL 4.36e-01 0.0951 0.122 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 210703 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0449 0.126 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -39558 sc-eQTL 6.47e-01 0.0575 0.125 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -90668 sc-eQTL 7.81e-01 -0.017 0.0612 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -89438 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00822 0.134 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 210703 sc-eQTL 1.64e-01 -0.184 0.132 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -39558 sc-eQTL 9.15e-02 0.222 0.131 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -90668 sc-eQTL 7.97e-02 0.124 0.0703 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -89438 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0813 0.134 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 210703 sc-eQTL 9.22e-02 -0.21 0.124 0.147 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -39558 sc-eQTL 1.98e-01 0.163 0.126 0.147 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -90668 sc-eQTL 1.64e-01 0.0868 0.0621 0.147 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -89438 sc-eQTL 3.11e-01 0.132 0.13 0.147 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 210703 sc-eQTL 5.05e-01 0.0803 0.12 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -39558 sc-eQTL 7.18e-02 0.22 0.121 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -90668 sc-eQTL 5.95e-01 0.0363 0.0681 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 210703 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0442 0.0977 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -39558 sc-eQTL 3.58e-02 0.256 0.121 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -90668 sc-eQTL 3.07e-01 0.0495 0.0484 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 210703 sc-eQTL 1.23e-01 -0.184 0.119 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -39558 sc-eQTL 2.75e-01 0.132 0.12 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -90668 sc-eQTL 8.63e-01 0.0097 0.0562 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 210703 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0653 0.106 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -39558 sc-eQTL 2.62e-01 0.134 0.119 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -90668 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0161 0.0647 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 322426 sc-eQTL 2.19e-01 -0.152 0.123 0.167 PB L2
ENSG00000079950 STX7 210703 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0689 0.103 0.167 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -39558 sc-eQTL 8.30e-01 0.0272 0.126 0.167 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -90668 sc-eQTL 4.23e-01 0.0575 0.0715 0.167 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -89438 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0781 0.134 0.167 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 592013 sc-eQTL 8.23e-01 0.0198 0.0883 0.167 PB L2
ENSG00000079950 STX7 210703 sc-eQTL 7.40e-02 0.194 0.108 0.161 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -39558 sc-eQTL 4.16e-01 0.0951 0.117 0.161 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -90668 sc-eQTL 1.96e-02 0.103 0.0437 0.161 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -89438 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0922 0.114 0.161 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 210703 sc-eQTL 6.89e-01 -0.049 0.122 0.158 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -39558 sc-eQTL 7.13e-01 0.0379 0.103 0.158 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -90668 sc-eQTL 3.63e-01 0.0414 0.0454 0.158 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -89438 sc-eQTL 3.24e-01 0.127 0.128 0.158 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 210703 sc-eQTL 4.02e-01 0.0898 0.107 0.149 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -10864 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0355 0.106 0.149 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 9846 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0315 0.125 0.149 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -39558 sc-eQTL 3.08e-02 0.262 0.12 0.149 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -90668 sc-eQTL 9.14e-01 0.00652 0.0602 0.149 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -89438 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0259 0.119 0.149 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -379227 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0626 0.0952 0.149 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 210703 sc-eQTL 3.61e-01 0.0702 0.0767 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -10864 sc-eQTL 1.37e-01 -0.161 0.108 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 9846 sc-eQTL 7.93e-01 0.0288 0.11 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -39558 sc-eQTL 3.35e-09 0.498 0.0807 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -90668 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0164 0.0487 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -89438 sc-eQTL 2.72e-02 0.206 0.0928 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 210703 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0936 0.0845 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -10864 sc-eQTL 9.36e-01 0.00851 0.106 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 9846 sc-eQTL 5.00e-01 0.0775 0.115 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -39558 sc-eQTL 1.89e-11 0.48 0.0677 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -90668 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0155 0.0542 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -89438 sc-eQTL 2.10e-01 0.126 0.1 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 210703 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0825 0.138 0.155 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -39558 sc-eQTL 4.86e-01 0.106 0.152 0.155 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -90668 sc-eQTL 4.33e-01 0.0455 0.0579 0.155 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -89438 sc-eQTL 4.44e-01 0.115 0.15 0.155 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 210703 sc-eQTL 2.68e-01 -0.124 0.112 0.158 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -10864 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0127 0.113 0.158 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 9846 sc-eQTL 1.64e-01 0.155 0.111 0.158 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -39558 sc-eQTL 2.41e-01 0.133 0.113 0.158 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -90668 sc-eQTL 6.56e-01 -0.022 0.0494 0.158 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -89438 sc-eQTL 4.30e-01 0.095 0.12 0.158 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 210703 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0679 0.0837 0.156 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -10864 sc-eQTL 9.57e-02 0.197 0.117 0.156 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 9846 sc-eQTL 1.53e-02 0.283 0.116 0.156 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -39558 sc-eQTL 4.32e-01 0.0887 0.113 0.156 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -90668 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0441 0.0565 0.156 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -89438 sc-eQTL 5.40e-01 0.0613 0.0999 0.156 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 210703 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0564 0.0965 0.153 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -10864 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00893 0.0972 0.153 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 9846 sc-eQTL 3.64e-03 0.284 0.0963 0.153 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -39558 sc-eQTL 4.43e-02 0.236 0.116 0.153 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -90668 sc-eQTL 3.01e-01 0.0838 0.0809 0.153 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -89438 sc-eQTL 4.31e-01 0.0947 0.12 0.153 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -379227 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0803 0.115 0.153 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 322426 sc-eQTL 8.35e-01 0.0248 0.119 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 210703 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0609 0.0673 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -39558 sc-eQTL 1.92e-02 0.248 0.105 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -90668 sc-eQTL 1.34e-02 -0.149 0.0599 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -89438 sc-eQTL 8.25e-01 0.0247 0.111 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 592013 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00508 0.108 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 322426 sc-eQTL 1.82e-01 -0.169 0.126 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 210703 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0382 0.0519 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -39558 sc-eQTL 3.38e-01 0.0968 0.101 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -90668 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0619 0.0609 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -89438 sc-eQTL 4.49e-01 0.0872 0.115 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 592013 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0403 0.0731 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 210703 sc-eQTL 8.15e-01 0.0153 0.0656 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -10864 sc-eQTL 1.49e-01 -0.154 0.106 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 9846 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00771 0.111 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -39558 sc-eQTL 9.56e-11 0.455 0.0667 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -90668 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0283 0.0505 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -89438 sc-eQTL 3.13e-02 0.193 0.089 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 210703 sc-eQTL 8.60e-02 -0.137 0.0796 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -10864 sc-eQTL 6.31e-01 0.0567 0.118 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 9846 sc-eQTL 1.11e-02 0.295 0.115 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -39558 sc-eQTL 2.50e-01 0.127 0.11 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -90668 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0287 0.0467 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -89438 sc-eQTL 1.40e-01 0.167 0.113 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 210703 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0725 0.092 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -39558 sc-eQTL 4.00e-02 0.239 0.116 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -90668 sc-eQTL 6.64e-01 0.0207 0.0476 0.157 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 210703 eQTL 0.0144 -0.0599 0.0244 0.0 0.0 0.122
ENSG00000093134 VNN3 -10864 eQTL 1.76e-09 0.134 0.0221 0.0 0.0 0.122
ENSG00000112299 VNN1 9846 pQTL 0.00123 0.177 0.0545 0.0 0.0 0.122
ENSG00000112299 VNN1 9846 eQTL 0.0192 -0.0783 0.0334 0.0 0.0 0.122
ENSG00000112303 VNN2 -39558 pQTL 9.09e-21 0.363 0.0381 0.0139 0.0141 0.122
ENSG00000112303 VNN2 -39558 eQTL 6.21e-09 0.115 0.0196 0.0 0.0 0.122
ENSG00000146409 SLC18B1 -89438 eQTL 0.00262 0.103 0.0342 0.0 0.0 0.122
ENSG00000234484 AL032821.1 -28774 eQTL 8.8e-20 -0.427 0.0459 0.0 0.0034 0.122


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000093134 VNN3 -10864 0.000167 1.69e-05 2.64e-06 1.15e-05 2.97e-06 2.28e-05 2.37e-05 2.19e-06 1.63e-05 7.9e-06 1.92e-05 7.7e-06 2.76e-05 4.65e-06 5.11e-06 1.22e-05 8.14e-06 2.86e-05 2.99e-06 3.59e-06 8.07e-06 2.28e-05 1.77e-05 3.99e-06 2.66e-05 5.36e-06 8.18e-06 5.53e-06 1.61e-05 1.5e-05 9.55e-06 1.01e-06 1.2e-06 3.78e-06 6.94e-06 2.63e-06 1.79e-06 2.26e-06 2.08e-06 2.07e-06 1.21e-06 2.65e-05 4.6e-06 1.68e-07 1.81e-06 1.74e-06 3.24e-06 7.28e-07 4.34e-07
ENSG00000112303 VNN2 -39558 0.000202 1.2e-05 1.34e-06 7.18e-06 2.42e-06 1.8e-05 1.51e-05 1.26e-06 9.63e-06 5.57e-06 1.21e-05 5.33e-06 1.58e-05 3.85e-06 3.62e-06 8.18e-06 5.31e-06 1.87e-05 1.92e-06 2.58e-06 6.14e-06 1.26e-05 9.94e-06 2.84e-06 1.67e-05 4.45e-06 6.33e-06 3.43e-06 1.07e-05 8.64e-06 4.81e-06 8.39e-07 7.23e-07 2.93e-06 4.6e-06 1.18e-06 1.21e-06 9.43e-07 1.32e-06 1.03e-06 8.54e-07 1.74e-05 3.46e-06 1.98e-07 8.22e-07 9.91e-07 1.93e-06 2.26e-07 3.26e-07
ENSG00000146409 SLC18B1 -89438 0.000173 5.1e-06 6.25e-07 3.29e-06 1.12e-06 5.16e-06 8.17e-06 6.72e-07 4.99e-06 2.12e-06 4.29e-06 3.21e-06 7.44e-06 1.34e-06 1.43e-06 3.85e-06 2e-06 5.21e-06 1.29e-06 9.69e-07 2.9e-06 5.5e-06 4.58e-06 1.76e-06 6.44e-06 2.02e-06 2.49e-06 1.51e-06 4.45e-06 4.18e-06 1.98e-06 5.42e-07 5.48e-07 1.77e-06 2.04e-06 7.36e-07 8.6e-07 4.21e-07 1.18e-06 8.68e-07 2.66e-07 8.34e-06 1.4e-06 4.22e-08 3.27e-07 3.58e-07 1e-06 3.75e-08 1.93e-07
ENSG00000234484 AL032821.1 -28774 0.000197 1.33e-05 1.49e-06 8.75e-06 2.34e-06 2.06e-05 1.91e-05 1.8e-06 1.07e-05 6.12e-06 1.4e-05 6.14e-06 1.99e-05 3.59e-06 4.37e-06 9.51e-06 6.37e-06 2.37e-05 2.66e-06 2.78e-06 6.46e-06 1.65e-05 1.24e-05 3.24e-06 2.14e-05 4.96e-06 7.53e-06 4.62e-06 1.26e-05 1.07e-05 6.24e-06 1.01e-06 1.07e-06 3.31e-06 5.17e-06 1.54e-06 1.65e-06 1.84e-06 1.82e-06 1.26e-06 9.79e-07 2.02e-05 4.23e-06 1.85e-07 8.89e-07 1.03e-06 2.32e-06 5.36e-07 4.68e-07