Genes within 1Mb (chr6:132714672:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 313197 sc-eQTL 1.43e-01 0.201 0.137 0.107 B L1
ENSG00000079950 STX7 201474 sc-eQTL 7.10e-01 0.0193 0.0518 0.107 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -48787 sc-eQTL 2.41e-01 0.114 0.0971 0.107 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -99897 sc-eQTL 8.88e-01 0.00834 0.0589 0.107 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -98667 sc-eQTL 1.78e-03 0.383 0.121 0.107 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 582784 sc-eQTL 2.30e-01 0.0977 0.0811 0.107 B L1
ENSG00000079950 STX7 201474 sc-eQTL 3.17e-01 -0.101 0.101 0.107 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -48787 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0279 0.0873 0.107 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -99897 sc-eQTL 5.24e-01 0.0379 0.0593 0.107 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -98667 sc-eQTL 1.79e-01 0.161 0.12 0.107 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 201474 sc-eQTL 3.02e-01 -0.102 0.099 0.107 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -48787 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0189 0.116 0.107 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -99897 sc-eQTL 9.50e-01 0.0025 0.0396 0.107 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -98667 sc-eQTL 1.37e-01 0.178 0.119 0.107 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 201474 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0546 0.0931 0.101 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -20093 sc-eQTL 5.37e-01 0.0715 0.115 0.101 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 617 sc-eQTL 5.78e-02 0.236 0.124 0.101 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -48787 sc-eQTL 3.43e-02 0.281 0.132 0.101 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -99897 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00222 0.0748 0.101 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -98667 sc-eQTL 3.61e-01 0.108 0.118 0.101 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -388456 sc-eQTL 2.84e-01 0.116 0.107 0.101 DC L1
ENSG00000079950 STX7 201474 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0774 0.0676 0.107 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -20093 sc-eQTL 1.43e-01 0.17 0.116 0.107 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 617 sc-eQTL 3.02e-10 0.754 0.114 0.107 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -48787 sc-eQTL 4.64e-01 0.0648 0.0883 0.107 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -99897 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0114 0.053 0.107 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -98667 sc-eQTL 1.54e-01 0.149 0.104 0.107 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 201474 sc-eQTL 4.66e-01 0.074 0.101 0.105 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -48787 sc-eQTL 1.09e-05 0.544 0.121 0.105 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -99897 sc-eQTL 2.03e-01 0.0666 0.0521 0.105 NK L1
ENSG00000079950 STX7 201474 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0165 0.102 0.107 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -48787 sc-eQTL 4.21e-02 0.25 0.122 0.107 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -99897 sc-eQTL 4.37e-01 0.0381 0.0489 0.107 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -98667 sc-eQTL 1.18e-01 0.21 0.133 0.107 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 313197 sc-eQTL 2.37e-01 0.161 0.136 0.11 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 201474 sc-eQTL 2.87e-01 -0.136 0.127 0.11 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -48787 sc-eQTL 1.79e-01 0.182 0.135 0.11 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -99897 sc-eQTL 6.40e-01 0.0341 0.0729 0.11 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -98667 sc-eQTL 6.14e-01 0.0644 0.128 0.11 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 582784 sc-eQTL 7.51e-01 0.0387 0.122 0.11 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 313197 sc-eQTL 1.97e-01 0.164 0.127 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 201474 sc-eQTL 5.31e-01 0.0524 0.0835 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -48787 sc-eQTL 4.32e-01 0.099 0.126 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -99897 sc-eQTL 5.16e-01 0.0501 0.077 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -98667 sc-eQTL 1.31e-02 0.342 0.137 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 582784 sc-eQTL 2.54e-01 0.134 0.118 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 313197 sc-eQTL 8.01e-01 0.0322 0.128 0.108 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 201474 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0727 0.1 0.108 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -48787 sc-eQTL 7.24e-01 0.0465 0.131 0.108 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -99897 sc-eQTL 4.05e-01 0.0526 0.0631 0.108 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -98667 sc-eQTL 2.83e-01 0.142 0.132 0.108 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 582784 sc-eQTL 7.35e-01 0.0417 0.123 0.108 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 313197 sc-eQTL 1.35e-02 0.351 0.141 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 201474 sc-eQTL 7.33e-01 0.0213 0.0624 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -48787 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00628 0.121 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -99897 sc-eQTL 5.73e-01 0.039 0.069 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -98667 sc-eQTL 4.65e-02 0.264 0.132 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 582784 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0322 0.0882 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 313197 sc-eQTL 3.07e-01 0.137 0.134 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 201474 sc-eQTL 4.90e-01 0.0505 0.0731 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -48787 sc-eQTL 5.68e-01 0.0768 0.134 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -99897 sc-eQTL 7.25e-01 0.0251 0.0711 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -98667 sc-eQTL 2.49e-02 0.303 0.134 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 582784 sc-eQTL 2.21e-02 0.214 0.0929 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 201474 sc-eQTL 2.60e-01 -0.155 0.138 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -48787 sc-eQTL 4.35e-01 0.109 0.139 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -99897 sc-eQTL 4.04e-01 0.0537 0.0642 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -98667 sc-eQTL 3.88e-02 0.267 0.128 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 201474 sc-eQTL 5.45e-01 0.0658 0.109 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -48787 sc-eQTL 6.79e-01 0.0417 0.101 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -99897 sc-eQTL 6.04e-01 0.0339 0.0653 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -98667 sc-eQTL 4.81e-01 0.0885 0.126 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 201474 sc-eQTL 6.74e-02 -0.217 0.118 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -48787 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0523 0.117 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -99897 sc-eQTL 8.86e-01 0.00876 0.0609 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -98667 sc-eQTL 3.66e-01 0.127 0.141 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 201474 sc-eQTL 2.05e-01 -0.174 0.137 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -48787 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0288 0.132 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -99897 sc-eQTL 8.40e-01 0.0109 0.0542 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -98667 sc-eQTL 3.34e-02 0.285 0.133 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 201474 sc-eQTL 4.54e-02 -0.227 0.113 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -48787 sc-eQTL 1.39e-01 0.191 0.129 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -99897 sc-eQTL 2.03e-01 0.0881 0.0691 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -98667 sc-eQTL 3.85e-02 0.277 0.133 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 201474 sc-eQTL 7.40e-01 0.046 0.139 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -48787 sc-eQTL 2.48e-01 -0.138 0.119 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -99897 sc-eQTL 7.23e-01 0.0243 0.0685 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -98667 sc-eQTL 2.25e-01 0.166 0.137 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 201474 sc-eQTL 2.63e-01 -0.154 0.137 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -48787 sc-eQTL 3.65e-01 -0.124 0.136 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -99897 sc-eQTL 8.30e-01 0.0143 0.0665 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -98667 sc-eQTL 1.14e-01 0.23 0.145 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 201474 sc-eQTL 5.47e-01 0.0898 0.149 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -48787 sc-eQTL 8.54e-01 0.0273 0.148 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -99897 sc-eQTL 2.22e-02 0.181 0.0786 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -98667 sc-eQTL 2.76e-01 -0.164 0.15 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 201474 sc-eQTL 1.17e-01 -0.205 0.13 0.106 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -48787 sc-eQTL 7.24e-01 0.0471 0.133 0.106 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -99897 sc-eQTL 4.50e-01 0.0495 0.0654 0.106 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -98667 sc-eQTL 1.42e-01 0.201 0.137 0.106 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 201474 sc-eQTL 2.61e-01 0.153 0.136 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -48787 sc-eQTL 4.56e-01 0.103 0.138 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -99897 sc-eQTL 3.53e-01 0.0716 0.077 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 201474 sc-eQTL 9.44e-01 0.00764 0.108 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -48787 sc-eQTL 2.34e-04 0.489 0.131 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -99897 sc-eQTL 5.02e-02 0.104 0.053 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 201474 sc-eQTL 7.83e-02 0.236 0.134 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -48787 sc-eQTL 1.22e-03 0.435 0.133 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -99897 sc-eQTL 2.54e-01 0.0723 0.0632 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 201474 sc-eQTL 9.12e-01 0.0131 0.118 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -48787 sc-eQTL 7.09e-05 0.519 0.128 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -99897 sc-eQTL 8.50e-01 0.0137 0.0722 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 313197 sc-eQTL 8.76e-01 0.0239 0.153 0.107 PB L2
ENSG00000079950 STX7 201474 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0578 0.128 0.107 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -48787 sc-eQTL 9.90e-01 0.00189 0.156 0.107 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -99897 sc-eQTL 5.81e-01 0.049 0.0887 0.107 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -98667 sc-eQTL 4.26e-01 -0.133 0.166 0.107 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 582784 sc-eQTL 9.74e-01 0.00362 0.109 0.107 PB L2
ENSG00000079950 STX7 201474 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0502 0.124 0.107 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -48787 sc-eQTL 2.05e-01 0.168 0.132 0.107 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -99897 sc-eQTL 7.24e-01 0.0177 0.0501 0.107 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -98667 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0206 0.13 0.107 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 201474 sc-eQTL 2.57e-01 -0.153 0.135 0.107 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -48787 sc-eQTL 6.85e-01 0.0461 0.114 0.107 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -99897 sc-eQTL 3.55e-01 0.0465 0.0501 0.107 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -98667 sc-eQTL 3.87e-01 0.123 0.142 0.107 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 201474 sc-eQTL 1.10e-01 -0.184 0.114 0.105 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -20093 sc-eQTL 2.29e-01 0.137 0.114 0.105 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 617 sc-eQTL 1.52e-01 0.193 0.134 0.105 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -48787 sc-eQTL 2.04e-01 0.167 0.131 0.105 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -99897 sc-eQTL 6.40e-01 0.0303 0.0647 0.105 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -98667 sc-eQTL 2.60e-01 0.144 0.128 0.105 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -388456 sc-eQTL 3.17e-01 0.103 0.102 0.105 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 201474 sc-eQTL 3.45e-01 -0.083 0.0876 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -20093 sc-eQTL 2.93e-01 0.13 0.124 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 617 sc-eQTL 1.58e-08 0.682 0.116 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -48787 sc-eQTL 5.33e-01 0.0624 0.1 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -99897 sc-eQTL 8.39e-01 0.0113 0.0556 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -98667 sc-eQTL 4.01e-02 0.219 0.106 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 201474 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0983 0.0941 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -20093 sc-eQTL 5.31e-02 0.227 0.117 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 617 sc-eQTL 5.24e-07 0.624 0.121 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -48787 sc-eQTL 3.33e-01 0.0812 0.0836 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -99897 sc-eQTL 5.88e-01 0.0327 0.0603 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -98667 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0298 0.112 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 201474 sc-eQTL 8.52e-01 0.0277 0.148 0.118 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -48787 sc-eQTL 1.19e-01 0.255 0.162 0.118 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -99897 sc-eQTL 6.68e-01 0.0268 0.0624 0.118 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -98667 sc-eQTL 9.01e-01 0.02 0.161 0.118 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 201474 sc-eQTL 9.52e-01 0.00761 0.127 0.107 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -20093 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0361 0.128 0.107 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 617 sc-eQTL 9.24e-04 0.414 0.123 0.107 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -48787 sc-eQTL 6.75e-01 0.0539 0.129 0.107 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -99897 sc-eQTL 9.14e-01 0.00604 0.056 0.107 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -98667 sc-eQTL 2.79e-01 0.148 0.136 0.107 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 201474 sc-eQTL 1.46e-01 -0.139 0.0953 0.109 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -20093 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00888 0.135 0.109 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 617 sc-eQTL 1.84e-07 0.677 0.125 0.109 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -48787 sc-eQTL 9.92e-01 0.00123 0.129 0.109 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -99897 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00234 0.0647 0.109 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -98667 sc-eQTL 2.53e-01 -0.131 0.114 0.109 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 201474 sc-eQTL 2.96e-01 -0.118 0.113 0.102 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -20093 sc-eQTL 2.03e-01 0.145 0.113 0.102 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 617 sc-eQTL 4.34e-02 0.233 0.114 0.102 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -48787 sc-eQTL 4.99e-03 0.383 0.134 0.102 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -99897 sc-eQTL 7.90e-02 -0.166 0.0941 0.102 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -98667 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0671 0.141 0.102 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -388456 sc-eQTL 4.32e-01 0.106 0.134 0.102 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 313197 sc-eQTL 2.94e-01 0.142 0.135 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 201474 sc-eQTL 4.82e-01 -0.054 0.0766 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -48787 sc-eQTL 2.79e-01 0.131 0.121 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -99897 sc-eQTL 3.90e-01 0.0594 0.069 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -98667 sc-eQTL 2.94e-02 0.275 0.125 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 582784 sc-eQTL 3.12e-01 0.124 0.122 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 313197 sc-eQTL 5.68e-02 0.27 0.141 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 201474 sc-eQTL 3.50e-01 0.0546 0.0583 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -48787 sc-eQTL 4.90e-01 0.0783 0.113 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -99897 sc-eQTL 7.62e-01 0.0208 0.0686 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -98667 sc-eQTL 3.39e-03 0.376 0.127 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 582784 sc-eQTL 3.69e-01 0.0738 0.0821 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 201474 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0684 0.0728 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -20093 sc-eQTL 1.01e-01 0.195 0.118 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 617 sc-eQTL 1.31e-09 0.721 0.114 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -48787 sc-eQTL 5.40e-01 0.0503 0.0819 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -99897 sc-eQTL 5.90e-01 0.0303 0.0561 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -98667 sc-eQTL 9.12e-02 0.169 0.0993 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 201474 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0542 0.09 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -20093 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00805 0.132 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 617 sc-eQTL 3.62e-06 0.594 0.125 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -48787 sc-eQTL 9.93e-01 -0.0011 0.124 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -99897 sc-eQTL 4.58e-01 -0.039 0.0525 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -98667 sc-eQTL 4.37e-01 0.0993 0.127 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 201474 sc-eQTL 5.16e-01 0.0661 0.102 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -48787 sc-eQTL 2.93e-06 0.588 0.122 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -99897 sc-eQTL 1.29e-01 0.0798 0.0523 0.106 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000093134 VNN3 -20093 eQTL 0.00189 0.0785 0.0252 0.0 0.0 0.0903
ENSG00000112299 VNN1 617 pQTL 9.61e-21 0.554 0.0583 0.0 0.0 0.0932
ENSG00000112299 VNN1 617 eQTL 8.94e-14 0.277 0.0366 0.0 0.0 0.0903
ENSG00000112303 VNN2 -48787 eQTL 0.248 -0.026 0.0225 0.00104 0.0 0.0903
ENSG00000234484 AL032821.1 -38003 eQTL 0.00081 -0.18 0.0537 0.0 0.0 0.0903


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000093134 VNN3 -20093 3.92e-05 3.14e-05 6.07e-06 1.48e-05 5.71e-06 1.39e-05 4.36e-05 4.37e-06 2.93e-05 1.45e-05 3.61e-05 1.65e-05 4.49e-05 1.28e-05 6.95e-06 1.77e-05 1.61e-05 2.44e-05 7.49e-06 6.54e-06 1.42e-05 3.08e-05 2.99e-05 8.53e-06 4.05e-05 7.94e-06 1.41e-05 1.22e-05 3.11e-05 2.37e-05 1.95e-05 1.64e-06 2.59e-06 6.69e-06 1.12e-05 5.47e-06 2.85e-06 3.18e-06 4.54e-06 3.24e-06 1.74e-06 3.51e-05 3.68e-06 3.62e-07 2.48e-06 3.59e-06 4.08e-06 1.61e-06 1.5e-06
ENSG00000112299 VNN1 617 0.000149 0.000107 1.79e-05 3.72e-05 1.72e-05 4.43e-05 0.000127 1.51e-05 9.51e-05 4.88e-05 0.000136 4.68e-05 0.000151 4.37e-05 1.97e-05 7.01e-05 5.63e-05 8.86e-05 2.51e-05 1.96e-05 5.17e-05 0.00012 0.000115 2.74e-05 0.000133 3.17e-05 5.12e-05 3.81e-05 0.000108 7.59e-05 5.97e-05 4.89e-06 9.05e-06 1.66e-05 2.89e-05 1.52e-05 7.41e-06 9.25e-06 1.17e-05 6.44e-06 2.54e-06 0.000115 1.57e-05 1.13e-06 9e-06 1.33e-05 1.29e-05 5.84e-06 6.57e-06
ENSG00000234484 AL032821.1 -38003 4.04e-05 2.76e-05 5.07e-06 1.3e-05 4.49e-06 1.24e-05 3.71e-05 3.75e-06 2.39e-05 1.19e-05 3.05e-05 1.37e-05 3.85e-05 1.05e-05 6.21e-06 1.43e-05 1.33e-05 2.16e-05 6.27e-06 5.36e-06 1.15e-05 2.53e-05 2.52e-05 6.81e-06 3.46e-05 6.74e-06 1.19e-05 9.67e-06 2.71e-05 1.97e-05 1.66e-05 1.58e-06 2.29e-06 5.43e-06 9.6e-06 4.55e-06 2.36e-06 2.99e-06 4.1e-06 2.92e-06 1.66e-06 2.87e-05 3.46e-06 3.59e-07 2.13e-06 2.96e-06 3.8e-06 1.49e-06 1.55e-06