Genes within 1Mb (chr6:132709260:CT:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 307785 sc-eQTL 2.12e-01 0.167 0.133 0.12 B L1
ENSG00000079950 STX7 196062 sc-eQTL 9.16e-01 0.00532 0.0504 0.12 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -54199 sc-eQTL 3.98e-01 0.0801 0.0945 0.12 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -105309 sc-eQTL 6.48e-01 0.0261 0.0572 0.12 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -104079 sc-eQTL 2.66e-03 0.359 0.118 0.12 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 577372 sc-eQTL 6.54e-01 0.0355 0.079 0.12 B L1
ENSG00000079950 STX7 196062 sc-eQTL 1.14e-01 -0.154 0.0973 0.12 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -54199 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0709 0.0847 0.12 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -105309 sc-eQTL 3.32e-01 0.0559 0.0575 0.12 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -104079 sc-eQTL 1.00e-01 0.191 0.116 0.12 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 196062 sc-eQTL 9.89e-02 -0.158 0.0955 0.12 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -54199 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0435 0.112 0.12 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -105309 sc-eQTL 6.00e-01 0.0201 0.0383 0.12 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -104079 sc-eQTL 5.70e-02 0.22 0.115 0.12 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 196062 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0997 0.0891 0.115 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -25505 sc-eQTL 6.15e-01 0.0558 0.111 0.115 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -4795 sc-eQTL 9.49e-03 0.308 0.118 0.115 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -54199 sc-eQTL 1.75e-02 0.302 0.126 0.115 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -105309 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0105 0.0718 0.115 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -104079 sc-eQTL 7.11e-01 0.0421 0.114 0.115 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -393868 sc-eQTL 1.99e-01 0.133 0.103 0.115 DC L1
ENSG00000079950 STX7 196062 sc-eQTL 1.32e-01 -0.0985 0.0651 0.12 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -25505 sc-eQTL 2.94e-01 0.118 0.112 0.12 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -4795 sc-eQTL 1.31e-10 0.741 0.11 0.12 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -54199 sc-eQTL 3.91e-01 0.0732 0.0851 0.12 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -105309 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0154 0.0511 0.12 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -104079 sc-eQTL 1.05e-01 0.163 0.1 0.12 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 196062 sc-eQTL 9.87e-01 0.00158 0.0988 0.118 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -54199 sc-eQTL 2.39e-05 0.509 0.118 0.118 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -105309 sc-eQTL 4.57e-02 0.101 0.0504 0.118 NK L1
ENSG00000079950 STX7 196062 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0451 0.099 0.12 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -54199 sc-eQTL 3.66e-02 0.249 0.119 0.12 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -105309 sc-eQTL 2.51e-01 0.0545 0.0473 0.12 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -104079 sc-eQTL 9.98e-02 0.214 0.129 0.12 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 307785 sc-eQTL 5.40e-01 0.0812 0.132 0.122 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 196062 sc-eQTL 2.51e-01 -0.142 0.123 0.122 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -54199 sc-eQTL 1.92e-01 0.172 0.131 0.122 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -105309 sc-eQTL 3.65e-01 0.064 0.0705 0.122 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -104079 sc-eQTL 5.60e-01 0.0722 0.124 0.122 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 577372 sc-eQTL 7.78e-01 0.0332 0.118 0.122 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 307785 sc-eQTL 2.23e-01 0.151 0.123 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 196062 sc-eQTL 8.41e-01 0.0163 0.081 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -54199 sc-eQTL 3.70e-01 0.11 0.122 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -105309 sc-eQTL 6.24e-01 0.0367 0.0747 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -104079 sc-eQTL 6.29e-03 0.365 0.132 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 577372 sc-eQTL 4.33e-01 0.0898 0.114 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 307785 sc-eQTL 7.32e-01 0.0425 0.124 0.119 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 196062 sc-eQTL 1.92e-01 -0.127 0.0971 0.119 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -54199 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00476 0.128 0.119 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -105309 sc-eQTL 3.26e-01 0.0604 0.0613 0.119 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -104079 sc-eQTL 4.83e-01 0.09 0.128 0.119 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 577372 sc-eQTL 9.67e-01 0.00499 0.12 0.119 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 307785 sc-eQTL 2.73e-02 0.305 0.137 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 196062 sc-eQTL 9.21e-01 0.00603 0.0607 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -54199 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0163 0.118 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -105309 sc-eQTL 5.21e-01 0.0431 0.0671 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -104079 sc-eQTL 7.87e-02 0.227 0.129 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 577372 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0779 0.0857 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 307785 sc-eQTL 6.20e-01 0.0652 0.131 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 196062 sc-eQTL 4.58e-01 0.0532 0.0715 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -54199 sc-eQTL 5.55e-01 0.0776 0.131 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -105309 sc-eQTL 5.82e-01 0.0383 0.0696 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -104079 sc-eQTL 2.49e-02 0.296 0.131 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 577372 sc-eQTL 5.52e-02 0.176 0.0912 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 196062 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0741 0.134 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -54199 sc-eQTL 5.72e-01 0.0764 0.135 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -105309 sc-eQTL 2.89e-01 0.0661 0.0622 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -104079 sc-eQTL 5.90e-02 0.237 0.125 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 196062 sc-eQTL 8.75e-01 0.0166 0.106 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -54199 sc-eQTL 8.75e-01 0.0154 0.0979 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -105309 sc-eQTL 3.79e-01 0.0559 0.0634 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -104079 sc-eQTL 2.85e-01 0.131 0.122 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 196062 sc-eQTL 9.49e-03 -0.297 0.113 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -54199 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0762 0.113 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -105309 sc-eQTL 8.69e-01 0.00974 0.0588 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -104079 sc-eQTL 3.35e-01 0.131 0.136 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 196062 sc-eQTL 1.62e-01 -0.188 0.134 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -54199 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0949 0.129 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -105309 sc-eQTL 9.43e-01 0.0038 0.053 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -104079 sc-eQTL 3.77e-02 0.273 0.13 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 196062 sc-eQTL 2.76e-02 -0.243 0.11 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -54199 sc-eQTL 2.00e-01 0.161 0.126 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -105309 sc-eQTL 3.78e-01 0.0595 0.0673 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -104079 sc-eQTL 2.26e-02 0.297 0.129 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 196062 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00922 0.134 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -54199 sc-eQTL 1.33e-01 -0.174 0.115 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -105309 sc-eQTL 4.87e-01 0.0461 0.0662 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -104079 sc-eQTL 1.43e-01 0.194 0.132 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 196062 sc-eQTL 2.07e-01 -0.169 0.133 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -54199 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0876 0.133 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -105309 sc-eQTL 7.39e-01 0.0216 0.0647 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -104079 sc-eQTL 6.79e-02 0.258 0.141 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 196062 sc-eQTL 8.51e-01 0.027 0.143 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -54199 sc-eQTL 6.68e-01 0.0611 0.142 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -105309 sc-eQTL 1.53e-02 0.184 0.0753 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -104079 sc-eQTL 3.06e-01 -0.148 0.144 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 196062 sc-eQTL 1.14e-01 -0.2 0.126 0.119 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -54199 sc-eQTL 6.13e-01 0.0652 0.129 0.119 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -105309 sc-eQTL 4.64e-01 0.0464 0.0632 0.119 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -104079 sc-eQTL 1.35e-01 0.198 0.132 0.119 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 196062 sc-eQTL 3.55e-01 0.122 0.132 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -54199 sc-eQTL 5.39e-01 0.0826 0.134 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -105309 sc-eQTL 1.18e-01 0.117 0.0744 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 196062 sc-eQTL 7.18e-01 -0.038 0.105 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -54199 sc-eQTL 2.95e-04 0.469 0.127 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -105309 sc-eQTL 1.08e-02 0.132 0.0513 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 196062 sc-eQTL 2.78e-01 0.142 0.13 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -54199 sc-eQTL 4.25e-04 0.459 0.128 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -105309 sc-eQTL 7.06e-02 0.111 0.0611 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 196062 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0545 0.115 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -54199 sc-eQTL 2.83e-04 0.462 0.125 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -105309 sc-eQTL 2.15e-01 0.0868 0.0699 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 307785 sc-eQTL 9.09e-01 -0.017 0.148 0.122 PB L2
ENSG00000079950 STX7 196062 sc-eQTL 3.15e-01 -0.125 0.123 0.122 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -54199 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0135 0.151 0.122 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -105309 sc-eQTL 3.94e-01 0.0733 0.0857 0.122 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -104079 sc-eQTL 5.05e-01 -0.108 0.161 0.122 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 577372 sc-eQTL 9.34e-01 0.00875 0.106 0.122 PB L2
ENSG00000079950 STX7 196062 sc-eQTL 6.01e-01 -0.063 0.12 0.12 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -54199 sc-eQTL 2.95e-01 0.135 0.129 0.12 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -105309 sc-eQTL 8.28e-01 0.0106 0.0488 0.12 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -104079 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0248 0.126 0.12 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 196062 sc-eQTL 1.84e-01 -0.173 0.13 0.12 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -54199 sc-eQTL 9.61e-01 0.00536 0.11 0.12 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -105309 sc-eQTL 1.77e-01 0.0656 0.0484 0.12 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -104079 sc-eQTL 3.46e-01 0.13 0.137 0.12 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 196062 sc-eQTL 8.31e-02 -0.195 0.112 0.115 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -25505 sc-eQTL 2.50e-01 0.129 0.112 0.115 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -4795 sc-eQTL 3.95e-02 0.27 0.13 0.115 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -54199 sc-eQTL 2.14e-01 0.159 0.128 0.115 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -105309 sc-eQTL 6.65e-01 0.0275 0.0634 0.115 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -104079 sc-eQTL 2.57e-01 0.142 0.125 0.115 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -393868 sc-eQTL 3.29e-01 0.098 0.1 0.115 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 196062 sc-eQTL 2.31e-01 -0.102 0.0847 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -25505 sc-eQTL 4.67e-01 0.0873 0.12 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -4795 sc-eQTL 6.75e-09 0.676 0.112 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -54199 sc-eQTL 4.26e-01 0.0772 0.0967 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -105309 sc-eQTL 7.80e-01 -0.015 0.0538 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -104079 sc-eQTL 2.55e-02 0.231 0.103 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 196062 sc-eQTL 2.66e-01 -0.102 0.0913 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -25505 sc-eQTL 1.17e-01 0.179 0.114 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -4795 sc-eQTL 6.33e-07 0.601 0.117 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -54199 sc-eQTL 3.16e-01 0.0816 0.0811 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -105309 sc-eQTL 5.06e-01 0.039 0.0585 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -104079 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00852 0.108 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 196062 sc-eQTL 7.49e-01 0.0475 0.148 0.13 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -54199 sc-eQTL 3.24e-02 0.349 0.161 0.13 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -105309 sc-eQTL 6.42e-01 0.0291 0.0624 0.13 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -104079 sc-eQTL 9.77e-01 0.00469 0.162 0.13 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 196062 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0144 0.123 0.12 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -25505 sc-eQTL 2.83e-01 -0.134 0.124 0.12 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -4795 sc-eQTL 3.43e-04 0.434 0.119 0.12 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -54199 sc-eQTL 6.44e-01 0.0579 0.125 0.12 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -105309 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0328 0.0544 0.12 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -104079 sc-eQTL 3.16e-01 0.133 0.132 0.12 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 196062 sc-eQTL 8.56e-02 -0.16 0.0927 0.12 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -25505 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00175 0.132 0.12 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -4795 sc-eQTL 1.04e-07 0.673 0.122 0.12 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -54199 sc-eQTL 6.17e-01 -0.063 0.126 0.12 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -105309 sc-eQTL 8.72e-01 0.0102 0.0631 0.12 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -104079 sc-eQTL 3.50e-01 -0.104 0.111 0.12 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 196062 sc-eQTL 1.70e-01 -0.152 0.11 0.11 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -25505 sc-eQTL 3.08e-01 0.114 0.111 0.11 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -4795 sc-eQTL 9.57e-02 0.189 0.113 0.11 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -54199 sc-eQTL 8.15e-04 0.445 0.13 0.11 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -105309 sc-eQTL 2.31e-01 -0.112 0.0927 0.11 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -104079 sc-eQTL 2.92e-01 -0.145 0.137 0.11 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -393868 sc-eQTL 4.30e-01 0.104 0.132 0.11 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 307785 sc-eQTL 3.37e-01 0.126 0.131 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 196062 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0885 0.074 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -54199 sc-eQTL 2.83e-01 0.126 0.117 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -105309 sc-eQTL 4.56e-01 0.0499 0.0668 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -104079 sc-eQTL 1.29e-02 0.304 0.121 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 577372 sc-eQTL 3.69e-01 0.107 0.118 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 307785 sc-eQTL 9.59e-02 0.23 0.138 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 196062 sc-eQTL 5.24e-01 0.0363 0.0569 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -54199 sc-eQTL 5.05e-01 0.0737 0.11 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -105309 sc-eQTL 7.72e-01 0.0194 0.0669 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -104079 sc-eQTL 8.76e-03 0.328 0.124 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 577372 sc-eQTL 8.55e-01 0.0147 0.0801 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 196062 sc-eQTL 2.23e-01 -0.086 0.0704 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -25505 sc-eQTL 2.16e-01 0.142 0.115 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -4795 sc-eQTL 7.34e-10 0.708 0.11 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -54199 sc-eQTL 4.14e-01 0.0649 0.0792 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -105309 sc-eQTL 9.08e-01 0.0063 0.0544 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -104079 sc-eQTL 5.36e-02 0.186 0.096 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 196062 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0814 0.0871 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -25505 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0848 0.128 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -4795 sc-eQTL 1.84e-06 0.592 0.12 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -54199 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0445 0.12 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -105309 sc-eQTL 4.93e-01 -0.035 0.0509 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -104079 sc-eQTL 5.34e-01 0.077 0.123 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 196062 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00103 0.0992 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -54199 sc-eQTL 4.68e-06 0.562 0.119 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -105309 sc-eQTL 2.94e-02 0.111 0.0507 0.119 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000093134 VNN3 -25505 eQTL 0.00925 0.0618 0.0237 0.0 0.0 0.0981
ENSG00000112299 VNN1 -4795 pQTL 7.18e-19 0.494 0.0549 0.0 0.0 0.103
ENSG00000112299 VNN1 -4795 eQTL 3.53e-16 0.284 0.0342 0.0 0.0 0.0981
ENSG00000112303 VNN2 -54199 pQTL 0.0212 -0.0937 0.0406 0.0 0.0 0.103
ENSG00000112303 VNN2 -54199 eQTL 0.165 -0.0293 0.0211 0.00107 0.0 0.0981
ENSG00000234484 AL032821.1 -43415 eQTL 0.00537 -0.141 0.0505 0.0 0.0 0.0981


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112299 VNN1 -4795 0.00014 8.47e-05 1.6e-05 2.04e-05 7.46e-06 2.21e-05 6.74e-05 5.07e-06 5.27e-05 1.99e-05 5.76e-05 2.88e-05 9.09e-05 2.56e-05 1.21e-05 3.9e-05 4.47e-05 3.77e-05 1.31e-05 7.2e-06 2.48e-05 7.05e-05 5.88e-05 1.24e-05 9.35e-05 1.34e-05 2.52e-05 1.55e-05 5.97e-05 4.08e-05 3.09e-05 1.61e-06 2.21e-06 8.2e-06 1.56e-05 7.75e-06 3.52e-06 3.17e-06 5.03e-06 3.3e-06 1.72e-06 8.37e-05 1.17e-05 4.6e-07 3.85e-06 5.15e-06 6.16e-06 1.8e-06 1.54e-06
ENSG00000234484 AL032821.1 -43415 8.01e-05 3.1e-05 4.28e-06 1.35e-05 2.26e-06 1.04e-05 2.17e-05 2.03e-06 1.64e-05 5.5e-06 2.04e-05 7.45e-06 3.11e-05 7.35e-06 5.07e-06 8.04e-06 1.53e-05 1.22e-05 3.6e-06 2.84e-06 6.47e-06 1.28e-05 1.95e-05 4.78e-06 2.69e-05 5.08e-06 6.66e-06 4.18e-06 2.39e-05 1.74e-05 1.16e-05 9.05e-07 1.3e-06 3.31e-06 9.11e-06 3.74e-06 1.78e-06 2.7e-06 2.19e-06 6.69e-07 7.88e-07 3.92e-05 2.68e-06 2.73e-07 7.94e-07 2.34e-06 2.08e-06 6.68e-07 5.67e-07