Genes within 1Mb (chr6:132693823:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 292348 sc-eQTL 1.73e-01 0.184 0.135 0.111 B L1
ENSG00000079950 STX7 180625 sc-eQTL 7.16e-01 0.0186 0.0511 0.111 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -69636 sc-eQTL 2.57e-01 0.109 0.0958 0.111 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -120746 sc-eQTL 7.50e-01 0.0186 0.0581 0.111 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -119516 sc-eQTL 6.66e-03 0.329 0.12 0.111 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 561935 sc-eQTL 2.91e-01 0.0848 0.08 0.111 B L1
ENSG00000079950 STX7 180625 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0921 0.0994 0.111 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -69636 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0223 0.0863 0.111 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -120746 sc-eQTL 6.41e-01 0.0274 0.0586 0.111 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -119516 sc-eQTL 3.19e-01 0.118 0.118 0.111 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 180625 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0979 0.0978 0.111 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -69636 sc-eQTL 9.61e-01 0.00554 0.114 0.111 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -120746 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000301 0.0391 0.111 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -119516 sc-eQTL 2.53e-01 0.135 0.118 0.111 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 180625 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0532 0.0921 0.106 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -40942 sc-eQTL 4.56e-01 0.0854 0.114 0.106 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -20232 sc-eQTL 2.91e-02 0.268 0.122 0.106 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -69636 sc-eQTL 1.49e-02 0.319 0.13 0.106 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -120746 sc-eQTL 9.08e-01 0.00861 0.074 0.106 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -119516 sc-eQTL 4.81e-01 0.0826 0.117 0.106 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -409305 sc-eQTL 4.03e-01 0.0892 0.106 0.106 DC L1
ENSG00000079950 STX7 180625 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0644 0.0669 0.111 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -40942 sc-eQTL 1.09e-01 0.184 0.114 0.111 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -20232 sc-eQTL 4.27e-11 0.777 0.112 0.111 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -69636 sc-eQTL 3.59e-01 0.0802 0.0872 0.111 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -120746 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0176 0.0523 0.111 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -119516 sc-eQTL 2.18e-01 0.127 0.103 0.111 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 180625 sc-eQTL 5.64e-01 0.0581 0.101 0.109 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -69636 sc-eQTL 8.05e-06 0.547 0.119 0.109 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -120746 sc-eQTL 1.49e-01 0.0747 0.0516 0.109 NK L1
ENSG00000079950 STX7 180625 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00902 0.101 0.111 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -69636 sc-eQTL 2.24e-02 0.278 0.121 0.111 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -120746 sc-eQTL 3.77e-01 0.0429 0.0484 0.111 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -119516 sc-eQTL 1.52e-01 0.19 0.132 0.111 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 292348 sc-eQTL 3.49e-01 0.126 0.134 0.115 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 180625 sc-eQTL 1.62e-01 -0.176 0.126 0.115 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -69636 sc-eQTL 9.91e-02 0.221 0.133 0.115 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -120746 sc-eQTL 5.16e-01 0.0469 0.072 0.115 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -119516 sc-eQTL 6.20e-01 0.0626 0.126 0.115 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 561935 sc-eQTL 6.74e-01 0.0506 0.12 0.115 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 292348 sc-eQTL 2.66e-01 0.14 0.126 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 180625 sc-eQTL 4.73e-01 0.0593 0.0825 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -69636 sc-eQTL 3.84e-01 0.108 0.124 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -120746 sc-eQTL 4.83e-01 0.0535 0.0761 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -119516 sc-eQTL 1.55e-02 0.33 0.135 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 561935 sc-eQTL 3.54e-01 0.108 0.116 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 292348 sc-eQTL 9.45e-01 0.00882 0.127 0.112 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 180625 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0683 0.0992 0.112 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -69636 sc-eQTL 6.94e-01 0.051 0.13 0.112 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -120746 sc-eQTL 3.92e-01 0.0536 0.0625 0.112 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -119516 sc-eQTL 5.46e-01 0.0788 0.13 0.112 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 561935 sc-eQTL 7.55e-01 0.038 0.122 0.112 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 292348 sc-eQTL 1.14e-02 0.356 0.139 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 180625 sc-eQTL 9.34e-01 0.00514 0.0618 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -69636 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000769 0.12 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -120746 sc-eQTL 3.94e-01 0.0583 0.0683 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -119516 sc-eQTL 9.47e-02 0.22 0.131 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 561935 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0408 0.0873 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 292348 sc-eQTL 3.00e-01 0.138 0.133 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 180625 sc-eQTL 4.39e-01 0.0561 0.0724 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -69636 sc-eQTL 7.35e-01 0.0451 0.133 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -120746 sc-eQTL 4.38e-01 0.0547 0.0704 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -119516 sc-eQTL 3.40e-02 0.284 0.133 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 561935 sc-eQTL 2.27e-02 0.211 0.0921 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 180625 sc-eQTL 2.91e-01 -0.144 0.136 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -69636 sc-eQTL 6.47e-01 0.0633 0.138 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -120746 sc-eQTL 2.45e-01 0.0741 0.0635 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -119516 sc-eQTL 6.88e-02 0.233 0.127 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 180625 sc-eQTL 5.69e-01 0.0612 0.107 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -69636 sc-eQTL 6.63e-01 0.0433 0.0994 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -120746 sc-eQTL 8.02e-01 0.0162 0.0645 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -119516 sc-eQTL 6.63e-01 0.0541 0.124 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 180625 sc-eQTL 7.97e-02 -0.206 0.117 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -69636 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0425 0.116 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -120746 sc-eQTL 9.49e-01 0.00382 0.0601 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -119516 sc-eQTL 4.25e-01 0.111 0.139 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 180625 sc-eQTL 2.64e-01 -0.152 0.136 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -69636 sc-eQTL 9.33e-01 -0.011 0.131 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -120746 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00334 0.0537 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -119516 sc-eQTL 3.23e-02 0.284 0.132 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 180625 sc-eQTL 4.44e-02 -0.225 0.111 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -69636 sc-eQTL 1.10e-01 0.204 0.127 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -120746 sc-eQTL 1.72e-01 0.0933 0.0681 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -119516 sc-eQTL 7.75e-02 0.233 0.132 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 180625 sc-eQTL 8.22e-01 0.0309 0.137 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -69636 sc-eQTL 1.94e-01 -0.154 0.118 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -120746 sc-eQTL 9.61e-01 0.0033 0.0678 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -119516 sc-eQTL 3.18e-01 0.136 0.136 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 180625 sc-eQTL 3.73e-01 -0.121 0.136 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -69636 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0965 0.135 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -120746 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0173 0.0659 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -119516 sc-eQTL 8.15e-02 0.251 0.143 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 180625 sc-eQTL 5.44e-01 0.0894 0.147 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -69636 sc-eQTL 6.25e-01 0.0715 0.146 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -120746 sc-eQTL 2.53e-02 0.175 0.0777 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -119516 sc-eQTL 2.21e-01 -0.182 0.148 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 180625 sc-eQTL 5.63e-02 -0.247 0.128 0.11 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -69636 sc-eQTL 7.98e-01 0.0338 0.132 0.11 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -120746 sc-eQTL 3.65e-01 0.0587 0.0647 0.11 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -119516 sc-eQTL 1.90e-01 0.178 0.135 0.11 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 180625 sc-eQTL 2.60e-01 0.153 0.135 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -69636 sc-eQTL 5.64e-01 0.0795 0.138 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -120746 sc-eQTL 2.78e-01 0.0832 0.0766 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 180625 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0252 0.107 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -69636 sc-eQTL 1.13e-04 0.508 0.129 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -120746 sc-eQTL 4.22e-02 0.107 0.0526 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 180625 sc-eQTL 8.08e-02 0.233 0.133 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -69636 sc-eQTL 3.75e-04 0.475 0.131 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -120746 sc-eQTL 2.23e-01 0.077 0.0629 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 180625 sc-eQTL 7.90e-01 0.0315 0.118 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -69636 sc-eQTL 8.60e-05 0.513 0.128 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -120746 sc-eQTL 6.68e-01 0.031 0.0721 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 292348 sc-eQTL 8.81e-01 0.0229 0.152 0.111 PB L2
ENSG00000079950 STX7 180625 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0505 0.127 0.111 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -69636 sc-eQTL 7.19e-01 0.0559 0.155 0.111 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -120746 sc-eQTL 8.11e-01 0.0211 0.088 0.111 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -119516 sc-eQTL 3.94e-01 -0.141 0.165 0.111 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 561935 sc-eQTL 9.94e-01 0.000789 0.108 0.111 PB L2
ENSG00000079950 STX7 180625 sc-eQTL 9.81e-01 -0.0029 0.122 0.111 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -69636 sc-eQTL 1.41e-01 0.193 0.13 0.111 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -120746 sc-eQTL 6.36e-01 0.0235 0.0496 0.111 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -119516 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0389 0.128 0.111 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 180625 sc-eQTL 1.98e-01 -0.171 0.132 0.111 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -69636 sc-eQTL 9.46e-01 0.00762 0.112 0.111 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -120746 sc-eQTL 3.09e-01 0.0503 0.0493 0.111 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -119516 sc-eQTL 5.63e-01 0.0808 0.14 0.111 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 180625 sc-eQTL 1.57e-01 -0.16 0.113 0.11 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -40942 sc-eQTL 1.41e-01 0.166 0.112 0.11 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -20232 sc-eQTL 1.81e-01 0.177 0.132 0.11 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -69636 sc-eQTL 1.34e-01 0.194 0.129 0.11 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -120746 sc-eQTL 7.16e-01 0.0233 0.0638 0.11 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -119516 sc-eQTL 2.45e-01 0.147 0.126 0.11 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -409305 sc-eQTL 3.90e-01 0.0869 0.101 0.11 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 180625 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0807 0.0865 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -40942 sc-eQTL 2.09e-01 0.154 0.122 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -20232 sc-eQTL 1.06e-09 0.723 0.113 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -69636 sc-eQTL 3.45e-01 0.0934 0.0986 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -120746 sc-eQTL 9.60e-01 0.00275 0.0549 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -119516 sc-eQTL 4.50e-02 0.211 0.105 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 180625 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0739 0.0929 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -40942 sc-eQTL 4.52e-02 0.232 0.115 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -20232 sc-eQTL 2.39e-07 0.632 0.118 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -69636 sc-eQTL 2.48e-01 0.0955 0.0824 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -120746 sc-eQTL 5.18e-01 0.0385 0.0595 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -119516 sc-eQTL 6.05e-01 -0.057 0.11 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 180625 sc-eQTL 9.98e-01 0.00037 0.147 0.121 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -69636 sc-eQTL 8.76e-02 0.277 0.161 0.121 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -120746 sc-eQTL 5.82e-01 0.0341 0.0618 0.121 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -119516 sc-eQTL 9.72e-01 0.00568 0.16 0.121 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 180625 sc-eQTL 9.57e-01 0.00672 0.125 0.111 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -40942 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0193 0.126 0.111 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -20232 sc-eQTL 1.34e-04 0.469 0.12 0.111 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -69636 sc-eQTL 4.74e-01 0.0908 0.127 0.111 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -120746 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00227 0.0552 0.111 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -119516 sc-eQTL 2.47e-01 0.155 0.134 0.111 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 180625 sc-eQTL 7.01e-02 -0.169 0.0929 0.113 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -40942 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0222 0.132 0.113 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -20232 sc-eQTL 4.24e-07 0.644 0.123 0.113 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -69636 sc-eQTL 9.23e-01 0.0121 0.126 0.113 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -120746 sc-eQTL 9.26e-01 0.00585 0.0633 0.113 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -119516 sc-eQTL 3.63e-01 -0.102 0.112 0.113 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 180625 sc-eQTL 2.67e-01 -0.125 0.112 0.105 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -40942 sc-eQTL 2.01e-01 0.145 0.113 0.105 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -20232 sc-eQTL 5.96e-02 0.216 0.114 0.105 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -69636 sc-eQTL 7.98e-03 0.36 0.134 0.105 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -120746 sc-eQTL 7.11e-02 -0.17 0.0934 0.105 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -119516 sc-eQTL 4.35e-01 -0.109 0.139 0.105 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -409305 sc-eQTL 4.75e-01 0.0956 0.133 0.105 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 292348 sc-eQTL 4.32e-01 0.105 0.134 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 180625 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0479 0.0758 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -69636 sc-eQTL 2.44e-01 0.14 0.12 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -120746 sc-eQTL 3.82e-01 0.0598 0.0683 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -119516 sc-eQTL 6.06e-02 0.235 0.125 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 561935 sc-eQTL 3.22e-01 0.12 0.121 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 292348 sc-eQTL 3.43e-02 0.297 0.139 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 180625 sc-eQTL 4.49e-01 0.0438 0.0577 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -69636 sc-eQTL 5.30e-01 0.0706 0.112 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -120746 sc-eQTL 5.82e-01 0.0374 0.0679 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -119516 sc-eQTL 1.20e-02 0.32 0.126 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 561935 sc-eQTL 4.45e-01 0.0622 0.0813 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 180625 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0533 0.0718 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -40942 sc-eQTL 6.67e-02 0.214 0.116 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -20232 sc-eQTL 1.56e-10 0.747 0.111 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -69636 sc-eQTL 4.05e-01 0.0673 0.0807 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -120746 sc-eQTL 6.48e-01 0.0253 0.0554 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -119516 sc-eQTL 1.56e-01 0.14 0.0982 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 180625 sc-eQTL 4.30e-01 -0.07 0.0886 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -40942 sc-eQTL 9.72e-01 0.00462 0.131 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -20232 sc-eQTL 8.99e-07 0.618 0.122 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -69636 sc-eQTL 8.56e-01 0.0221 0.122 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -120746 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0382 0.0517 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -119516 sc-eQTL 3.49e-01 0.118 0.125 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 180625 sc-eQTL 6.09e-01 0.0517 0.101 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -69636 sc-eQTL 1.23e-06 0.603 0.121 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -120746 sc-eQTL 1.24e-01 0.0801 0.0518 0.11 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000093134 VNN3 -40942 eQTL 0.0069 0.0645 0.0238 0.0 0.0 0.0967
ENSG00000112299 VNN1 -20232 pQTL 1.23e-24 0.57 0.0545 0.0 0.0 0.101
ENSG00000112299 VNN1 -20232 eQTL 1.18e-14 0.27 0.0345 0.0 0.0 0.0967
ENSG00000112303 VNN2 -69636 pQTL 0.0358 -0.0857 0.0408 0.0 0.0 0.101
ENSG00000234484 AL032821.1 -58852 eQTL 0.0047 -0.144 0.0508 0.0 0.0 0.0967


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000093134 VNN3 -40942 9.4e-05 1.13e-05 1.25e-06 4.51e-06 2.18e-06 7.76e-06 1.09e-05 1.34e-06 9.59e-06 4.99e-06 1.08e-05 5.06e-06 1.27e-05 3.66e-06 4.14e-06 7.34e-06 3.97e-06 1.17e-05 2.7e-06 2.41e-06 4.21e-06 1.16e-05 7.23e-06 2.18e-06 1.22e-05 2.66e-06 5.48e-06 2.41e-06 9.22e-06 7.9e-06 5.46e-06 4.88e-07 5.02e-07 2.75e-06 2.59e-06 1.17e-06 9.73e-07 9.53e-07 9.07e-07 8.86e-07 4.48e-07 1.29e-05 1.82e-06 2.06e-07 7.75e-07 9.54e-07 1.32e-06 2.72e-07 4.55e-07
ENSG00000112299 VNN1 -20232 7.28e-05 1.71e-05 2.59e-06 7.89e-06 2.5e-06 1.15e-05 2.04e-05 2.16e-06 1.64e-05 7.3e-06 1.8e-05 7.15e-06 2.24e-05 6.43e-06 5.22e-06 1.11e-05 7.67e-06 1.84e-05 3.68e-06 3.15e-06 6.46e-06 1.84e-05 1.37e-05 3.66e-06 2.18e-05 4.65e-06 7.95e-06 5.22e-06 1.5e-05 1.24e-05 1.03e-05 9.86e-07 1.27e-06 3.52e-06 5.17e-06 2.56e-06 1.71e-06 2e-06 1.99e-06 1.27e-06 9.9e-07 1.99e-05 2.68e-06 1.68e-07 9.12e-07 1.75e-06 2.32e-06 7.11e-07 5.93e-07
ENSG00000234484 AL032821.1 -58852 8.36e-05 9.39e-06 9.77e-07 3.5e-06 1.5e-06 6.03e-06 9.71e-06 1.09e-06 5.67e-06 4.06e-06 7.96e-06 2.94e-06 1.02e-05 3.83e-06 2.98e-06 6.38e-06 2.92e-06 7.79e-06 2.23e-06 1.39e-06 2.77e-06 8.99e-06 5.11e-06 1.46e-06 8.96e-06 1.9e-06 4.33e-06 1.77e-06 6.66e-06 7.11e-06 3.84e-06 5.42e-07 7.35e-07 1.62e-06 2.06e-06 8.84e-07 9.08e-07 4.58e-07 1.05e-06 5.21e-07 2.4e-07 8.77e-06 1.43e-06 1.31e-07 5.95e-07 7.77e-07 9.61e-07 2.18e-07 5.96e-07