logo

Genes within 1Mb (chr6:132675460:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 273985 sc-eQTL 1.25e-01 -0.229 0.149 0.094 B L1
ENSG00000079950 STX7 162262 sc-eQTL 7.28e-01 0.0196 0.0564 0.094 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -87999 sc-eQTL 2.44e-02 0.238 0.105 0.094 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -139109 sc-eQTL 1.70e-01 -0.0879 0.0638 0.094 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -137879 sc-eQTL 4.90e-01 0.0933 0.135 0.094 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 543572 sc-eQTL 7.90e-01 0.0236 0.0885 0.094 B L1
ENSG00000079950 STX7 162262 sc-eQTL 1.91e-01 0.142 0.109 0.094 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -87999 sc-eQTL 7.06e-01 0.0357 0.0944 0.094 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -139109 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0636 0.064 0.094 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -137879 sc-eQTL 5.21e-01 0.0834 0.13 0.094 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 162262 sc-eQTL 8.38e-01 0.022 0.107 0.094 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -87999 sc-eQTL 2.36e-02 0.283 0.124 0.094 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -139109 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0443 0.0428 0.094 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -137879 sc-eQTL 3.36e-01 0.125 0.129 0.094 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 162262 sc-eQTL 2.22e-01 0.12 0.0978 0.092 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -59305 sc-eQTL 3.91e-01 0.105 0.122 0.092 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -38595 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0912 0.131 0.092 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -87999 sc-eQTL 8.11e-01 0.0337 0.141 0.092 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -139109 sc-eQTL 9.90e-01 0.00098 0.0788 0.092 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -137879 sc-eQTL 2.54e-01 0.142 0.124 0.092 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -427668 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0691 0.113 0.092 DC L1
ENSG00000079950 STX7 162262 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0857 0.0745 0.094 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -59305 sc-eQTL 8.15e-02 -0.223 0.127 0.094 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -38595 sc-eQTL 2.69e-05 0.568 0.132 0.094 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -87999 sc-eQTL 2.86e-02 0.212 0.0963 0.094 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -139109 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0482 0.0583 0.094 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -137879 sc-eQTL 7.09e-01 0.0431 0.115 0.094 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 162262 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0148 0.111 0.092 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -87999 sc-eQTL 2.33e-02 -0.313 0.137 0.092 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -139109 sc-eQTL 3.56e-01 -0.053 0.0573 0.092 NK L1
ENSG00000079950 STX7 162262 sc-eQTL 9.84e-01 0.0023 0.113 0.094 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -87999 sc-eQTL 5.60e-01 0.08 0.137 0.094 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -139109 sc-eQTL 4.00e-01 0.0458 0.0543 0.094 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -137879 sc-eQTL 2.29e-01 0.179 0.148 0.094 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 273985 sc-eQTL 7.23e-02 0.268 0.148 0.097 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 162262 sc-eQTL 6.12e-01 0.0711 0.14 0.097 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -87999 sc-eQTL 4.22e-01 0.12 0.149 0.097 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -139109 sc-eQTL 8.46e-01 0.0155 0.0799 0.097 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -137879 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0422 0.14 0.097 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 543572 sc-eQTL 4.19e-01 0.108 0.133 0.097 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 273985 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00669 0.138 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 162262 sc-eQTL 4.90e-01 0.0623 0.0902 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -87999 sc-eQTL 6.40e-01 0.0635 0.136 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -139109 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0762 0.0831 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -137879 sc-eQTL 5.27e-01 0.0949 0.15 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 543572 sc-eQTL 6.69e-01 0.0546 0.127 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 273985 sc-eQTL 7.55e-01 0.0427 0.137 0.095 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 162262 sc-eQTL 9.07e-01 0.0126 0.107 0.095 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -87999 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0386 0.14 0.095 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -139109 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0424 0.0676 0.095 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -137879 sc-eQTL 4.13e-01 0.116 0.141 0.095 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 543572 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0142 0.132 0.095 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 273985 sc-eQTL 1.48e-02 -0.372 0.151 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 162262 sc-eQTL 8.32e-01 0.0142 0.067 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -87999 sc-eQTL 2.28e-01 0.157 0.13 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -139109 sc-eQTL 1.75e-02 -0.175 0.0732 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -137879 sc-eQTL 2.70e-01 0.158 0.143 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 543572 sc-eQTL 6.56e-01 0.0423 0.0947 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 273985 sc-eQTL 9.24e-01 0.0139 0.146 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 162262 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0382 0.0793 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -87999 sc-eQTL 1.25e-01 0.223 0.145 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -139109 sc-eQTL 2.02e-01 -0.0982 0.0768 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -137879 sc-eQTL 8.39e-01 -0.03 0.147 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 543572 sc-eQTL 9.31e-01 0.00886 0.102 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 162262 sc-eQTL 9.33e-01 0.0122 0.146 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -87999 sc-eQTL 1.43e-01 -0.215 0.147 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -139109 sc-eQTL 1.96e-01 -0.0881 0.0678 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -137879 sc-eQTL 2.89e-01 0.146 0.137 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 162262 sc-eQTL 1.74e-01 0.158 0.116 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -87999 sc-eQTL 5.24e-01 0.0685 0.107 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -139109 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0415 0.0697 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -137879 sc-eQTL 4.90e-01 0.0926 0.134 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 162262 sc-eQTL 5.67e-01 0.0741 0.129 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -87999 sc-eQTL 2.11e-01 -0.16 0.127 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -139109 sc-eQTL 8.44e-01 0.0131 0.0662 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -137879 sc-eQTL 4.91e-01 0.106 0.153 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 162262 sc-eQTL 2.49e-02 0.332 0.147 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -87999 sc-eQTL 9.87e-01 0.00238 0.143 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -139109 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0246 0.0585 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -137879 sc-eQTL 3.75e-01 -0.129 0.145 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 162262 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0416 0.124 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -87999 sc-eQTL 3.05e-01 0.145 0.141 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -139109 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0403 0.0754 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -137879 sc-eQTL 2.01e-01 0.187 0.146 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 162262 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0133 0.147 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -87999 sc-eQTL 1.82e-02 0.297 0.125 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -139109 sc-eQTL 8.58e-01 -0.013 0.0724 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -137879 sc-eQTL 7.91e-01 0.0385 0.145 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 162262 sc-eQTL 1.66e-01 -0.201 0.145 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -87999 sc-eQTL 2.37e-01 -0.171 0.144 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -139109 sc-eQTL 6.33e-01 0.0336 0.0703 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -137879 sc-eQTL 4.28e-01 -0.122 0.154 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 162262 sc-eQTL 8.39e-01 0.0321 0.158 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -87999 sc-eQTL 5.72e-01 0.0889 0.157 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -139109 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0756 0.0843 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -137879 sc-eQTL 6.23e-01 0.0787 0.16 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 162262 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00503 0.142 0.093 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -87999 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0376 0.144 0.093 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -139109 sc-eQTL 3.07e-01 0.0725 0.0708 0.093 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -137879 sc-eQTL 3.91e-01 0.128 0.149 0.093 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 162262 sc-eQTL 5.71e-01 0.0845 0.149 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -87999 sc-eQTL 2.49e-01 0.174 0.151 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -139109 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0414 0.0843 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 162262 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0145 0.119 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -87999 sc-eQTL 8.27e-02 -0.258 0.148 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -139109 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0279 0.059 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 162262 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0542 0.142 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -87999 sc-eQTL 1.85e-02 -0.338 0.142 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -139109 sc-eQTL 2.46e-01 -0.0778 0.0669 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 162262 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0817 0.131 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -87999 sc-eQTL 1.64e-02 -0.352 0.145 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -139109 sc-eQTL 1.56e-01 -0.113 0.0796 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 273985 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0398 0.168 0.089 PB L2
ENSG00000079950 STX7 162262 sc-eQTL 4.08e-01 -0.116 0.139 0.089 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -87999 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00602 0.171 0.089 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -139109 sc-eQTL 6.29e-01 0.0469 0.0969 0.089 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -137879 sc-eQTL 1.39e-01 -0.268 0.18 0.089 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 543572 sc-eQTL 3.42e-01 0.114 0.119 0.089 PB L2
ENSG00000079950 STX7 162262 sc-eQTL 5.29e-01 0.0853 0.135 0.096 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -87999 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0303 0.145 0.096 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -139109 sc-eQTL 4.31e-01 0.0433 0.0548 0.096 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -137879 sc-eQTL 7.81e-01 0.0395 0.142 0.096 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 162262 sc-eQTL 3.08e-01 0.146 0.143 0.094 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -87999 sc-eQTL 4.38e-01 0.0936 0.12 0.094 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -139109 sc-eQTL 7.63e-01 0.0161 0.0533 0.094 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -137879 sc-eQTL 3.23e-01 0.149 0.15 0.094 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 162262 sc-eQTL 7.41e-01 0.0417 0.126 0.09 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -59305 sc-eQTL 4.39e-01 0.0968 0.125 0.09 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -38595 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0933 0.147 0.09 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -87999 sc-eQTL 1.37e-01 0.212 0.142 0.09 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -139109 sc-eQTL 8.35e-01 0.0147 0.0707 0.09 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -137879 sc-eQTL 9.60e-01 0.007 0.14 0.09 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -427668 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0535 0.112 0.09 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 162262 sc-eQTL 6.52e-02 -0.177 0.0956 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -59305 sc-eQTL 2.25e-01 -0.165 0.136 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -38595 sc-eQTL 6.69e-05 0.538 0.132 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -87999 sc-eQTL 6.65e-02 0.201 0.109 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -139109 sc-eQTL 5.66e-01 -0.035 0.061 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -137879 sc-eQTL 2.67e-01 0.13 0.117 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 162262 sc-eQTL 4.69e-01 0.0757 0.104 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -59305 sc-eQTL 1.16e-01 -0.205 0.13 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -38595 sc-eQTL 4.39e-04 0.492 0.138 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -87999 sc-eQTL 2.02e-03 0.284 0.0908 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -139109 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0563 0.0667 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -137879 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0983 0.124 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 162262 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0358 0.156 0.1 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -87999 sc-eQTL 8.39e-02 0.297 0.171 0.1 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -139109 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00158 0.0656 0.1 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -137879 sc-eQTL 2.05e-01 0.215 0.169 0.1 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 162262 sc-eQTL 6.50e-01 0.0638 0.14 0.091 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -59305 sc-eQTL 2.28e-01 0.171 0.141 0.091 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -38595 sc-eQTL 5.92e-02 0.264 0.139 0.091 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -87999 sc-eQTL 3.52e-02 0.299 0.141 0.091 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -139109 sc-eQTL 4.24e-01 0.0497 0.0619 0.091 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -137879 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0396 0.151 0.091 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 162262 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00122 0.105 0.088 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -59305 sc-eQTL 2.79e-01 0.16 0.147 0.088 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -38595 sc-eQTL 2.57e-04 0.528 0.142 0.088 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -87999 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0556 0.141 0.088 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -139109 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0691 0.0706 0.088 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -137879 sc-eQTL 2.86e-01 -0.133 0.125 0.088 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 162262 sc-eQTL 6.92e-01 0.0453 0.114 0.099 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -59305 sc-eQTL 3.60e-01 -0.105 0.115 0.099 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -38595 sc-eQTL 2.60e-01 -0.132 0.116 0.099 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -87999 sc-eQTL 1.47e-02 -0.337 0.137 0.099 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -139109 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0781 0.0957 0.099 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -137879 sc-eQTL 5.04e-01 0.0949 0.142 0.099 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -427668 sc-eQTL 1.70e-01 -0.186 0.135 0.099 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 273985 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00721 0.147 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 162262 sc-eQTL 3.64e-01 0.0754 0.0829 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -87999 sc-eQTL 7.16e-01 0.0479 0.131 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -139109 sc-eQTL 1.47e-01 -0.109 0.0745 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -137879 sc-eQTL 3.65e-01 0.125 0.137 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 543572 sc-eQTL 2.07e-01 0.167 0.132 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 273985 sc-eQTL 1.04e-01 -0.248 0.152 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 162262 sc-eQTL 6.68e-01 -0.027 0.0629 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -87999 sc-eQTL 3.12e-02 0.262 0.121 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -139109 sc-eQTL 3.51e-02 -0.155 0.0731 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -137879 sc-eQTL 5.19e-01 0.0901 0.139 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 543572 sc-eQTL 7.72e-01 0.0258 0.0886 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 162262 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0957 0.08 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -59305 sc-eQTL 8.36e-02 -0.226 0.13 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -38595 sc-eQTL 2.12e-05 0.569 0.131 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -87999 sc-eQTL 2.53e-02 0.201 0.0892 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -139109 sc-eQTL 4.10e-01 -0.051 0.0618 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -137879 sc-eQTL 7.24e-01 0.0389 0.11 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 162262 sc-eQTL 8.12e-01 0.0233 0.0978 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -59305 sc-eQTL 5.37e-01 0.0889 0.144 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -38595 sc-eQTL 1.11e-03 0.46 0.139 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -87999 sc-eQTL 5.10e-01 0.0887 0.134 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -139109 sc-eQTL 8.54e-01 0.0105 0.0571 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -137879 sc-eQTL 4.82e-01 0.0975 0.138 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 162262 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0367 0.112 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -87999 sc-eQTL 2.11e-02 -0.325 0.14 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -139109 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0471 0.0578 0.093 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 162262 pQTL 0.0458 -0.0731 0.0366 0.0 0.0 0.0997
ENSG00000079950 STX7 162262 eQTL 1.66e-05 -0.105 0.0243 0.00147 0.0 0.105
ENSG00000093134 VNN3 -59305 eQTL 0.0125 0.0562 0.0225 0.0 0.0 0.105
ENSG00000112299 VNN1 -38595 pQTL 1.93e-19 0.503 0.0549 0.0 0.0 0.0997
ENSG00000112299 VNN1 -38595 eQTL 5.23e-06 0.152 0.0332 0.0 0.0 0.105
ENSG00000118523 CCN2 724088 pQTL 0.0122 -0.0849 0.0338 0.00138 0.0 0.0997
ENSG00000234484 AL032821.1 -77215 eQTL 4.07e-05 -0.196 0.0476 0.0 0.0 0.105

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079950 STX7 162262 4.3e-06 3.93e-06 7.85e-07 1.8e-06 1.12e-06 1.19e-06 2.84e-06 1.01e-06 3.32e-06 1.94e-06 4.08e-06 2.74e-06 6.46e-06 1.3e-06 1.4e-06 2.43e-06 1.83e-06 2.72e-06 1.36e-06 9.88e-07 1.93e-06 4.2e-06 3.49e-06 1.62e-06 4.78e-06 1.34e-06 2.2e-06 1.44e-06 4.17e-06 3.61e-06 1.94e-06 5.42e-07 8.13e-07 1.75e-06 2.01e-06 8.53e-07 9.27e-07 4.91e-07 1.06e-06 3.79e-07 5.18e-07 4.47e-06 4.65e-07 1.58e-07 4.54e-07 3.05e-07 8.4e-07 3.35e-07 3.41e-07
ENSG00000112299 VNN1 -38595 1.33e-05 1.19e-05 2.59e-06 7.15e-06 2.34e-06 6.2e-06 1.48e-05 2.2e-06 1.07e-05 6.2e-06 1.49e-05 6.31e-06 2.07e-05 4.08e-06 3.88e-06 7.65e-06 6.4e-06 1.14e-05 3.56e-06 3.36e-06 6.46e-06 1.18e-05 1.16e-05 4.81e-06 2.02e-05 4.65e-06 6.69e-06 5.03e-06 1.42e-05 1.43e-05 7.4e-06 9.57e-07 1.45e-06 4.31e-06 5.33e-06 3.17e-06 1.77e-06 2.14e-06 2.66e-06 1.97e-06 1.59e-06 1.53e-05 1.68e-06 2.86e-07 1.48e-06 2e-06 2.05e-06 8.56e-07 6.19e-07
ENSG00000234484 AL032821.1 -77215 7.86e-06 8.28e-06 1.34e-06 4.07e-06 2.18e-06 4.1e-06 9.65e-06 1.59e-06 6.18e-06 4.42e-06 9.35e-06 4.5e-06 1.15e-05 3.47e-06 2.02e-06 5.75e-06 3.76e-06 5.96e-06 2.68e-06 2.65e-06 4.39e-06 7.6e-06 6.71e-06 3.17e-06 1.15e-05 3.09e-06 4.39e-06 2.66e-06 7.82e-06 7.8e-06 4.13e-06 8.89e-07 1.21e-06 3.24e-06 2.91e-06 2.09e-06 1.74e-06 1.6e-06 1.57e-06 9.79e-07 9.41e-07 9.18e-06 1.16e-06 2.07e-07 8.03e-07 1.3e-06 1.26e-06 7.55e-07 4.19e-07