logo

Genes within 1Mb (chr6:132673990:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 272515 sc-eQTL 7.31e-01 0.05 0.145 0.103 B L1
ENSG00000079950 STX7 160792 sc-eQTL 1.38e-01 -0.0811 0.0545 0.103 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -89469 sc-eQTL 2.20e-01 0.126 0.103 0.103 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -140579 sc-eQTL 1.05e-01 -0.101 0.0619 0.103 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -139349 sc-eQTL 4.52e-01 0.0986 0.131 0.103 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 542102 sc-eQTL 1.18e-01 -0.134 0.0855 0.103 B L1
ENSG00000079950 STX7 160792 sc-eQTL 6.87e-01 0.0429 0.106 0.103 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -89469 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0314 0.0921 0.103 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -140579 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0203 0.0626 0.103 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -139349 sc-eQTL 9.32e-01 0.0109 0.127 0.103 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 160792 sc-eQTL 7.19e-01 0.0377 0.105 0.103 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -89469 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0565 0.122 0.103 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -140579 sc-eQTL 8.00e-01 0.0106 0.0418 0.103 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -139349 sc-eQTL 9.11e-01 0.0141 0.126 0.103 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 160792 sc-eQTL 2.06e-02 0.221 0.0947 0.099 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -60775 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00242 0.119 0.099 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -40065 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0475 0.128 0.099 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -89469 sc-eQTL 4.03e-01 0.115 0.137 0.099 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -140579 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0375 0.077 0.099 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -139349 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0646 0.122 0.099 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -429138 sc-eQTL 1.06e-01 -0.179 0.11 0.099 DC L1
ENSG00000079950 STX7 160792 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0247 0.0715 0.103 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -60775 sc-eQTL 3.93e-01 -0.105 0.123 0.103 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -40065 sc-eQTL 2.40e-03 -0.397 0.129 0.103 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -89469 sc-eQTL 2.70e-01 0.103 0.093 0.103 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -140579 sc-eQTL 2.67e-01 0.062 0.0557 0.103 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -139349 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0769 0.11 0.103 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 160792 sc-eQTL 3.55e-01 -0.101 0.108 0.103 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -89469 sc-eQTL 3.12e-01 0.137 0.135 0.103 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -140579 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0525 0.0559 0.103 NK L1
ENSG00000079950 STX7 160792 sc-eQTL 6.08e-01 0.0564 0.11 0.103 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -89469 sc-eQTL 3.97e-01 -0.112 0.133 0.103 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -140579 sc-eQTL 8.84e-01 -0.00769 0.0526 0.103 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -139349 sc-eQTL 5.96e-01 0.0765 0.144 0.103 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 272515 sc-eQTL 9.04e-01 0.0181 0.15 0.102 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 160792 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0359 0.14 0.102 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -89469 sc-eQTL 9.35e-01 0.0121 0.149 0.102 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -140579 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00355 0.0801 0.102 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -139349 sc-eQTL 4.34e-01 0.11 0.14 0.102 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 542102 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0823 0.134 0.102 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 272515 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0788 0.132 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 160792 sc-eQTL 1.11e-01 -0.137 0.0858 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -89469 sc-eQTL 6.77e-01 0.0543 0.13 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -140579 sc-eQTL 5.12e-02 -0.155 0.0789 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -139349 sc-eQTL 5.81e-01 0.0792 0.143 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 542102 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0168 0.122 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 272515 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0826 0.138 0.103 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 160792 sc-eQTL 1.95e-01 -0.14 0.108 0.103 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -89469 sc-eQTL 1.49e-01 0.204 0.141 0.103 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -140579 sc-eQTL 1.01e-01 -0.112 0.0677 0.103 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -139349 sc-eQTL 9.64e-01 0.00642 0.142 0.103 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 542102 sc-eQTL 3.24e-01 -0.131 0.132 0.103 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 272515 sc-eQTL 5.84e-01 0.0823 0.15 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 160792 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0282 0.0656 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -89469 sc-eQTL 3.50e-01 0.119 0.127 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -140579 sc-eQTL 2.30e-01 -0.0871 0.0724 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -139349 sc-eQTL 5.83e-01 0.077 0.14 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 542102 sc-eQTL 8.11e-02 -0.161 0.0921 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 272515 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0378 0.141 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 160792 sc-eQTL 1.09e-02 -0.195 0.0758 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -89469 sc-eQTL 6.44e-01 0.0654 0.141 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -140579 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0373 0.0748 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -139349 sc-eQTL 9.02e-01 0.0175 0.143 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 542102 sc-eQTL 2.62e-01 -0.111 0.0987 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 160792 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0168 0.159 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -89469 sc-eQTL 2.44e-01 0.186 0.159 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -140579 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0289 0.0739 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -139349 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0867 0.149 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 160792 sc-eQTL 7.94e-01 0.0307 0.117 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -89469 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0188 0.109 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -140579 sc-eQTL 7.68e-01 0.0208 0.0705 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -139349 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0198 0.136 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 160792 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0828 0.128 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -89469 sc-eQTL 1.99e-01 -0.162 0.125 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -140579 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0371 0.0652 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -139349 sc-eQTL 7.71e-01 0.0441 0.151 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 160792 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0246 0.15 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -89469 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0474 0.144 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -140579 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0281 0.059 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -139349 sc-eQTL 2.49e-01 0.169 0.146 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 160792 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0446 0.118 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -89469 sc-eQTL 5.00e-01 0.0903 0.134 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -140579 sc-eQTL 3.85e-01 0.0623 0.0716 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -139349 sc-eQTL 7.20e-01 0.0499 0.139 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 160792 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0275 0.152 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -89469 sc-eQTL 3.62e-01 -0.119 0.131 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -140579 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0682 0.0747 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -139349 sc-eQTL 6.35e-01 0.0714 0.15 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 160792 sc-eQTL 1.15e-01 0.237 0.149 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -89469 sc-eQTL 3.58e-01 -0.137 0.149 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -140579 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0127 0.0728 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -139349 sc-eQTL 1.78e-01 0.215 0.159 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 160792 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0279 0.158 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -89469 sc-eQTL 3.22e-01 0.155 0.156 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -140579 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00546 0.0843 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -139349 sc-eQTL 1.19e-01 -0.248 0.158 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 160792 sc-eQTL 6.29e-01 0.0692 0.143 0.097 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -89469 sc-eQTL 5.63e-02 0.277 0.144 0.097 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -140579 sc-eQTL 4.78e-01 0.0508 0.0715 0.097 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -139349 sc-eQTL 1.63e-01 0.209 0.149 0.097 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 160792 sc-eQTL 3.96e-01 -0.123 0.144 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -89469 sc-eQTL 5.76e-01 0.0821 0.147 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -140579 sc-eQTL 5.91e-01 -0.044 0.0818 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 160792 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0473 0.116 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -89469 sc-eQTL 3.47e-01 0.136 0.144 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -140579 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0402 0.0574 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 160792 sc-eQTL 1.08e-01 -0.227 0.141 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -89469 sc-eQTL 3.36e-01 0.138 0.143 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -140579 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0103 0.0669 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 160792 sc-eQTL 7.28e-02 -0.224 0.124 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -89469 sc-eQTL 4.31e-01 0.111 0.141 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -140579 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0242 0.0764 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 272515 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0403 0.151 0.111 PB L2
ENSG00000079950 STX7 160792 sc-eQTL 6.15e-01 0.0635 0.126 0.111 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -89469 sc-eQTL 9.18e-01 0.0158 0.154 0.111 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -140579 sc-eQTL 4.21e-01 0.0705 0.0872 0.111 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -139349 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0298 0.164 0.111 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 542102 sc-eQTL 9.43e-01 0.00768 0.108 0.111 PB L2
ENSG00000079950 STX7 160792 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0293 0.128 0.104 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -89469 sc-eQTL 1.40e-01 -0.202 0.136 0.104 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -140579 sc-eQTL 8.42e-01 0.0103 0.0517 0.104 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -139349 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00609 0.134 0.104 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 160792 sc-eQTL 2.19e-01 0.172 0.139 0.103 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -89469 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0904 0.117 0.103 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -140579 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0259 0.0519 0.103 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -139349 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0725 0.147 0.103 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 160792 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00757 0.122 0.107 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -60775 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0688 0.121 0.107 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -40065 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0666 0.142 0.107 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -89469 sc-eQTL 9.20e-01 0.0139 0.139 0.107 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -140579 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0484 0.0683 0.107 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -139349 sc-eQTL 9.28e-01 0.0122 0.135 0.107 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -429138 sc-eQTL 3.02e-01 -0.112 0.108 0.107 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 160792 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0209 0.0915 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -60775 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0841 0.129 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -40065 sc-eQTL 5.30e-02 -0.252 0.129 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -89469 sc-eQTL 1.33e-01 0.156 0.104 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -140579 sc-eQTL 7.91e-02 0.101 0.0575 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -139349 sc-eQTL 3.24e-01 -0.11 0.111 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 160792 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0468 0.0998 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -60775 sc-eQTL 6.14e-01 -0.063 0.125 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -40065 sc-eQTL 4.03e-03 -0.386 0.133 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -89469 sc-eQTL 2.07e-01 0.112 0.0883 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -140579 sc-eQTL 5.04e-01 0.0427 0.0638 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -139349 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0509 0.118 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 160792 sc-eQTL 4.33e-01 -0.132 0.168 0.103 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -89469 sc-eQTL 2.14e-02 -0.424 0.182 0.103 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -140579 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0473 0.0706 0.103 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -139349 sc-eQTL 1.87e-01 -0.241 0.182 0.103 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 160792 sc-eQTL 8.50e-01 0.025 0.132 0.102 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -60775 sc-eQTL 4.54e-01 0.0998 0.133 0.102 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -40065 sc-eQTL 2.44e-01 -0.153 0.131 0.102 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -89469 sc-eQTL 3.49e-02 0.281 0.132 0.102 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -140579 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0151 0.0583 0.102 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -139349 sc-eQTL 3.35e-01 -0.137 0.142 0.102 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 160792 sc-eQTL 7.71e-01 0.0292 0.1 0.102 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -60775 sc-eQTL 3.11e-01 0.143 0.141 0.102 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -40065 sc-eQTL 1.24e-01 -0.216 0.14 0.102 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -89469 sc-eQTL 2.53e-02 0.3 0.133 0.102 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -140579 sc-eQTL 7.12e-01 -0.025 0.0677 0.102 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -139349 sc-eQTL 1.34e-01 0.179 0.119 0.102 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 160792 sc-eQTL 3.83e-01 0.0995 0.114 0.107 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -60775 sc-eQTL 2.77e-01 0.125 0.114 0.107 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -40065 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0649 0.117 0.107 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -89469 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0796 0.139 0.107 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -140579 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0392 0.0958 0.107 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -139349 sc-eQTL 2.92e-01 -0.15 0.141 0.107 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -429138 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0862 0.136 0.107 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 272515 sc-eQTL 4.91e-01 0.0974 0.141 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 160792 sc-eQTL 6.86e-02 -0.146 0.0795 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -89469 sc-eQTL 2.56e-01 0.144 0.126 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -140579 sc-eQTL 4.54e-02 -0.144 0.0715 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -139349 sc-eQTL 4.40e-01 0.102 0.132 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 542102 sc-eQTL 2.35e-01 -0.152 0.127 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 272515 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00111 0.15 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 160792 sc-eQTL 1.95e-01 -0.0799 0.0614 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -89469 sc-eQTL 3.52e-01 0.112 0.12 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -140579 sc-eQTL 3.01e-01 -0.075 0.0723 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -139349 sc-eQTL 7.86e-01 0.0371 0.137 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 542102 sc-eQTL 9.34e-02 -0.145 0.0863 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 160792 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0393 0.0771 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -60775 sc-eQTL 3.16e-01 -0.126 0.125 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -40065 sc-eQTL 2.98e-03 -0.386 0.128 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -89469 sc-eQTL 3.58e-01 0.0797 0.0865 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -140579 sc-eQTL 2.10e-01 0.0744 0.0592 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -139349 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0889 0.106 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 160792 sc-eQTL 7.33e-01 0.032 0.0936 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -60775 sc-eQTL 7.05e-01 0.0523 0.138 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -40065 sc-eQTL 1.35e-01 -0.204 0.136 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -89469 sc-eQTL 3.19e-02 0.275 0.127 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -140579 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0298 0.0546 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -139349 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0131 0.133 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 160792 sc-eQTL 3.06e-01 -0.112 0.109 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -89469 sc-eQTL 2.34e-01 0.164 0.137 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -140579 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0366 0.0562 0.103 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000093134 VNN3 -60775 eQTL 0.00188 0.0747 0.0239 0.0 0.0 0.0952
ENSG00000112299 VNN1 -40065 eQTL 1.96e-08 -0.2 0.0352 0.0 0.0 0.0952
ENSG00000112303 VNN2 -89469 pQTL 6.89e-06 0.179 0.0395 0.0 0.0 0.099
ENSG00000112303 VNN2 -89469 eQTL 0.00255 0.0644 0.0213 0.0 0.0 0.0952
ENSG00000234484 AL032821.1 -78685 eQTL 1.29e-05 -0.223 0.0508 0.0 0.0 0.0952

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000093134 VNN3 -60775 7.02e-05 9.38e-06 1.35e-06 4.02e-06 1.56e-06 5.91e-06 1.02e-05 1.1e-06 6.1e-06 4.01e-06 9.14e-06 3.52e-06 1.14e-05 3.34e-06 2.37e-06 5.78e-06 3.71e-06 7.72e-06 2.23e-06 1.7e-06 3.38e-06 8.49e-06 6.42e-06 1.96e-06 9.75e-06 2.49e-06 4.34e-06 1.83e-06 7.85e-06 7.22e-06 4.48e-06 5.74e-07 8.38e-07 2.63e-06 1.9e-06 9.86e-07 1e-06 4.51e-07 1.3e-06 7.17e-07 5.21e-07 8.05e-06 1.4e-06 1.99e-07 6.87e-07 1.22e-06 8.85e-07 6.3e-07 4.68e-07
ENSG00000112299 VNN1 -40065 8.78e-05 1.19e-05 1.89e-06 5.54e-06 2.36e-06 8.52e-06 1.33e-05 1.46e-06 1e-05 5.03e-06 1.19e-05 5.17e-06 1.58e-05 3.78e-06 3.67e-06 6.66e-06 4.74e-06 1.17e-05 2.66e-06 2.65e-06 5.71e-06 1.18e-05 8.88e-06 3.3e-06 1.3e-05 4.12e-06 5.53e-06 3.43e-06 1.22e-05 8e-06 6.59e-06 1.05e-06 1.12e-06 3.06e-06 3.3e-06 1.71e-06 1.23e-06 1.6e-06 2.15e-06 9.95e-07 8.22e-07 1.25e-05 2.36e-06 1.68e-07 7.75e-07 9.69e-07 1.75e-06 7.12e-07 5.39e-07
ENSG00000112303 VNN2 -89469 4.42e-05 6.21e-06 7.29e-07 3.21e-06 1.35e-06 4.15e-06 8.61e-06 9.69e-07 4.94e-06 2.48e-06 5.94e-06 3.38e-06 8.17e-06 1.97e-06 9.88e-07 3.98e-06 1.94e-06 3.89e-06 1.5e-06 1.02e-06 3.01e-06 6.67e-06 4.62e-06 1.42e-06 7.21e-06 1.98e-06 2.3e-06 1.71e-06 5.3e-06 4.39e-06 2.65e-06 4.2e-07 5.37e-07 1.57e-06 2.03e-06 9.09e-07 9.07e-07 4.74e-07 8.1e-07 4.28e-07 2.08e-07 6.04e-06 9.1e-07 1.49e-07 5.95e-07 3.22e-07 1.04e-06 2.35e-07 2.72e-07
ENSG00000234484 AL032821.1 -78685 5.35e-05 7.87e-06 6.35e-07 3.37e-06 1.64e-06 4.58e-06 9.45e-06 1.04e-06 4.6e-06 2.76e-06 6.97e-06 3.18e-06 1e-05 2.07e-06 1.54e-06 4.51e-06 2.72e-06 5.37e-06 1.49e-06 1.15e-06 2.77e-06 7.69e-06 4.76e-06 1.81e-06 8.44e-06 2.1e-06 3.09e-06 1.67e-06 6.35e-06 5e-06 3.29e-06 4.15e-07 7.24e-07 1.9e-06 2.23e-06 9.23e-07 9.38e-07 3.74e-07 9.06e-07 5.21e-07 3.05e-07 7.37e-06 1.29e-06 1.74e-07 7.89e-07 4.3e-07 1.17e-06 2.26e-07 3.41e-07