Genes within 1Mb (chr6:132662056:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 260581 sc-eQTL 4.71e-01 0.101 0.139 0.1 B L1
ENSG00000079950 STX7 148858 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00586 0.0526 0.1 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -101403 sc-eQTL 1.63e-01 0.138 0.0985 0.1 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -152513 sc-eQTL 5.60e-01 0.0349 0.0598 0.1 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -151283 sc-eQTL 3.10e-03 0.369 0.123 0.1 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 530168 sc-eQTL 5.10e-01 0.0545 0.0826 0.1 B L1
ENSG00000079950 STX7 148858 sc-eQTL 2.65e-01 -0.115 0.103 0.1 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -101403 sc-eQTL 8.05e-01 -0.022 0.0891 0.1 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -152513 sc-eQTL 8.78e-01 0.00927 0.0606 0.1 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -151283 sc-eQTL 2.18e-01 0.151 0.122 0.1 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 148858 sc-eQTL 1.02e-01 -0.165 0.101 0.1 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -101403 sc-eQTL 6.56e-01 0.0528 0.118 0.1 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -152513 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0202 0.0404 0.1 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -151283 sc-eQTL 3.91e-02 0.251 0.121 0.1 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 148858 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0804 0.0946 0.097 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -72709 sc-eQTL 7.73e-01 0.0339 0.118 0.097 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -51999 sc-eQTL 2.29e-02 0.287 0.125 0.097 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -101403 sc-eQTL 3.20e-02 0.29 0.134 0.097 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -152513 sc-eQTL 7.09e-01 0.0284 0.0761 0.097 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -151283 sc-eQTL 2.87e-01 0.128 0.12 0.097 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -441072 sc-eQTL 4.12e-01 0.09 0.109 0.097 DC L1
ENSG00000079950 STX7 148858 sc-eQTL 1.56e-01 -0.0986 0.0692 0.1 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -72709 sc-eQTL 2.26e-01 0.145 0.119 0.1 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -51999 sc-eQTL 4.88e-09 0.723 0.118 0.1 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -101403 sc-eQTL 7.23e-02 0.162 0.09 0.1 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -152513 sc-eQTL 8.45e-01 0.0106 0.0543 0.1 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -151283 sc-eQTL 4.55e-01 0.0803 0.107 0.1 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 148858 sc-eQTL 6.49e-01 0.0474 0.104 0.099 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -101403 sc-eQTL 7.31e-06 0.568 0.123 0.099 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -152513 sc-eQTL 1.98e-01 0.069 0.0534 0.099 NK L1
ENSG00000079950 STX7 148858 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0313 0.105 0.1 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -101403 sc-eQTL 1.59e-02 0.304 0.125 0.1 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -152513 sc-eQTL 6.47e-01 0.0231 0.0503 0.1 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -151283 sc-eQTL 6.55e-02 0.253 0.137 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 260581 sc-eQTL 7.94e-01 0.0367 0.141 0.099 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 148858 sc-eQTL 4.63e-02 -0.262 0.13 0.099 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -101403 sc-eQTL 6.45e-02 0.259 0.139 0.099 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -152513 sc-eQTL 7.43e-01 0.0247 0.0752 0.099 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -151283 sc-eQTL 4.13e-01 0.108 0.132 0.099 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 530168 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0124 0.126 0.099 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 260581 sc-eQTL 8.59e-01 0.0231 0.13 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 148858 sc-eQTL 9.35e-01 0.00701 0.0853 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -101403 sc-eQTL 2.24e-01 0.156 0.128 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -152513 sc-eQTL 6.33e-01 0.0376 0.0787 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -151283 sc-eQTL 2.36e-02 0.319 0.14 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 530168 sc-eQTL 2.01e-01 0.154 0.12 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 260581 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0202 0.131 0.101 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 148858 sc-eQTL 2.84e-01 -0.11 0.102 0.101 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -101403 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0589 0.134 0.101 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -152513 sc-eQTL 5.92e-01 0.0347 0.0647 0.101 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -151283 sc-eQTL 6.85e-01 0.0548 0.135 0.101 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 530168 sc-eQTL 9.35e-01 0.0103 0.126 0.101 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 260581 sc-eQTL 1.73e-02 0.347 0.145 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 148858 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00555 0.064 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -101403 sc-eQTL 6.30e-01 0.0599 0.124 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -152513 sc-eQTL 2.38e-01 0.0835 0.0706 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -151283 sc-eQTL 2.25e-02 0.31 0.135 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 530168 sc-eQTL 2.46e-01 -0.105 0.0902 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 260581 sc-eQTL 8.91e-01 0.0191 0.139 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 148858 sc-eQTL 6.65e-01 0.0327 0.0755 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -101403 sc-eQTL 6.01e-01 0.0725 0.139 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -152513 sc-eQTL 4.08e-01 0.0607 0.0733 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -151283 sc-eQTL 2.21e-02 0.319 0.138 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 530168 sc-eQTL 7.14e-02 0.175 0.0963 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 148858 sc-eQTL 9.70e-02 -0.236 0.142 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -101403 sc-eQTL 4.72e-01 0.104 0.144 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -152513 sc-eQTL 4.81e-01 0.0469 0.0664 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -151283 sc-eQTL 6.72e-02 0.245 0.133 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 148858 sc-eQTL 5.87e-01 0.0603 0.111 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -101403 sc-eQTL 5.36e-01 0.0637 0.103 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -152513 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00237 0.0667 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -151283 sc-eQTL 4.90e-01 0.0887 0.128 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 148858 sc-eQTL 5.12e-02 -0.235 0.12 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -101403 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0514 0.119 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -152513 sc-eQTL 9.71e-01 0.00223 0.0617 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -151283 sc-eQTL 2.74e-01 0.156 0.143 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 148858 sc-eQTL 2.06e-01 -0.179 0.141 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -101403 sc-eQTL 4.54e-01 -0.101 0.135 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -152513 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0149 0.0556 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -151283 sc-eQTL 8.66e-03 0.36 0.136 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 148858 sc-eQTL 4.54e-02 -0.232 0.115 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -101403 sc-eQTL 7.27e-02 0.237 0.131 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -152513 sc-eQTL 3.21e-01 0.0704 0.0707 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -151283 sc-eQTL 1.04e-01 0.223 0.136 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 148858 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0283 0.142 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -101403 sc-eQTL 2.84e-01 -0.132 0.122 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -152513 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00772 0.0703 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -151283 sc-eQTL 1.32e-01 0.212 0.14 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 148858 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0632 0.141 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -101403 sc-eQTL 5.29e-01 -0.088 0.139 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -152513 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0314 0.068 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -151283 sc-eQTL 5.82e-02 0.282 0.148 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 148858 sc-eQTL 9.40e-01 0.0115 0.152 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -101403 sc-eQTL 5.78e-01 0.0842 0.151 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -152513 sc-eQTL 1.89e-01 0.107 0.0809 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -151283 sc-eQTL 2.30e-01 -0.184 0.153 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 148858 sc-eQTL 5.42e-02 -0.259 0.134 0.1 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -101403 sc-eQTL 5.18e-01 0.0887 0.137 0.1 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -152513 sc-eQTL 4.39e-01 0.0522 0.0673 0.1 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -151283 sc-eQTL 2.60e-01 0.159 0.141 0.1 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 148858 sc-eQTL 4.34e-01 0.111 0.141 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -101403 sc-eQTL 4.16e-01 0.117 0.143 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -152513 sc-eQTL 3.43e-01 0.0757 0.0797 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 148858 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0628 0.111 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -101403 sc-eQTL 4.72e-05 0.552 0.133 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -152513 sc-eQTL 9.82e-02 0.0906 0.0545 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 148858 sc-eQTL 6.54e-02 0.251 0.135 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -101403 sc-eQTL 9.56e-04 0.451 0.134 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -152513 sc-eQTL 1.80e-01 0.0861 0.064 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 148858 sc-eQTL 8.54e-01 0.0225 0.122 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -101403 sc-eQTL 1.69e-04 0.508 0.133 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -152513 sc-eQTL 2.79e-01 0.0806 0.0743 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 260581 sc-eQTL 9.20e-01 0.0152 0.152 0.104 PB L2
ENSG00000079950 STX7 148858 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0575 0.127 0.104 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -101403 sc-eQTL 5.28e-01 0.0978 0.155 0.104 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -152513 sc-eQTL 9.24e-01 0.00841 0.0879 0.104 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -151283 sc-eQTL 3.43e-01 -0.156 0.164 0.104 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 530168 sc-eQTL 6.21e-01 0.0537 0.108 0.104 PB L2
ENSG00000079950 STX7 148858 sc-eQTL 9.47e-01 0.00839 0.126 0.1 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -101403 sc-eQTL 2.35e-01 0.161 0.135 0.1 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -152513 sc-eQTL 8.34e-01 0.0107 0.0512 0.1 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -151283 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0997 0.132 0.1 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 148858 sc-eQTL 4.36e-01 -0.107 0.137 0.1 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -101403 sc-eQTL 7.22e-01 -0.041 0.115 0.1 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -152513 sc-eQTL 3.34e-01 0.0492 0.0508 0.1 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -151283 sc-eQTL 5.83e-01 0.079 0.144 0.1 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 148858 sc-eQTL 2.61e-01 -0.132 0.117 0.098 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -72709 sc-eQTL 2.94e-01 0.122 0.116 0.098 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -51999 sc-eQTL 1.76e-01 0.185 0.137 0.098 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -101403 sc-eQTL 1.46e-01 0.194 0.133 0.098 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -152513 sc-eQTL 6.37e-01 0.0312 0.066 0.098 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -151283 sc-eQTL 7.34e-02 0.233 0.13 0.098 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -441072 sc-eQTL 5.67e-01 0.0599 0.104 0.098 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 148858 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0577 0.0889 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -72709 sc-eQTL 3.96e-01 0.107 0.126 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -51999 sc-eQTL 6.85e-09 0.708 0.117 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -101403 sc-eQTL 5.29e-02 0.196 0.101 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -152513 sc-eQTL 7.53e-01 0.0177 0.0563 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -151283 sc-eQTL 2.14e-01 0.135 0.108 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 148858 sc-eQTL 2.72e-01 -0.105 0.0957 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -72709 sc-eQTL 8.73e-02 0.204 0.119 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -51999 sc-eQTL 7.87e-06 0.569 0.124 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -101403 sc-eQTL 1.54e-01 0.121 0.0848 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -152513 sc-eQTL 3.53e-01 0.057 0.0613 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -151283 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0681 0.114 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 148858 sc-eQTL 8.59e-01 0.0273 0.153 0.109 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -101403 sc-eQTL 5.87e-02 0.319 0.167 0.109 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -152513 sc-eQTL 9.51e-01 0.00396 0.0645 0.109 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -151283 sc-eQTL 3.49e-01 0.156 0.166 0.109 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 148858 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0249 0.129 0.102 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -72709 sc-eQTL 2.71e-01 -0.143 0.13 0.102 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -51999 sc-eQTL 3.75e-04 0.45 0.124 0.102 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -101403 sc-eQTL 1.35e-01 0.195 0.13 0.102 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -152513 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00299 0.0568 0.102 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -151283 sc-eQTL 2.53e-01 0.158 0.138 0.102 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 148858 sc-eQTL 8.33e-03 -0.256 0.096 0.102 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -72709 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0303 0.138 0.102 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -51999 sc-eQTL 3.94e-07 0.673 0.128 0.102 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -101403 sc-eQTL 3.54e-01 0.122 0.131 0.102 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -152513 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00754 0.066 0.102 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -151283 sc-eQTL 3.75e-01 -0.103 0.116 0.102 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 148858 sc-eQTL 8.44e-02 -0.201 0.116 0.09 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -72709 sc-eQTL 5.14e-01 0.0768 0.117 0.09 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -51999 sc-eQTL 1.85e-01 0.158 0.119 0.09 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -101403 sc-eQTL 1.69e-02 0.338 0.14 0.09 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -152513 sc-eQTL 3.35e-02 -0.207 0.0967 0.09 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -151283 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0694 0.145 0.09 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -441072 sc-eQTL 4.58e-01 0.103 0.139 0.09 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 260581 sc-eQTL 8.29e-01 0.03 0.139 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 148858 sc-eQTL 1.95e-01 -0.102 0.0782 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -101403 sc-eQTL 2.39e-01 0.146 0.124 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -152513 sc-eQTL 5.16e-01 0.046 0.0707 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -151283 sc-eQTL 7.08e-02 0.234 0.129 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 530168 sc-eQTL 5.64e-01 0.0724 0.125 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 260581 sc-eQTL 1.07e-01 0.235 0.145 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 148858 sc-eQTL 7.19e-01 0.0215 0.0599 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -101403 sc-eQTL 3.02e-01 0.12 0.116 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -152513 sc-eQTL 4.02e-01 0.059 0.0702 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -151283 sc-eQTL 2.81e-03 0.393 0.13 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 530168 sc-eQTL 8.67e-01 0.0142 0.0843 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 148858 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0736 0.0743 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -72709 sc-eQTL 1.73e-01 0.165 0.121 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -51999 sc-eQTL 1.44e-08 0.692 0.117 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -101403 sc-eQTL 1.08e-01 0.134 0.0832 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -152513 sc-eQTL 4.37e-01 0.0446 0.0573 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -151283 sc-eQTL 4.80e-01 0.0722 0.102 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 148858 sc-eQTL 9.46e-02 -0.154 0.0917 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -72709 sc-eQTL 4.48e-01 -0.103 0.136 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -51999 sc-eQTL 1.62e-06 0.629 0.127 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -101403 sc-eQTL 2.02e-01 0.162 0.126 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -152513 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0346 0.0538 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -151283 sc-eQTL 3.07e-01 0.134 0.13 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 148858 sc-eQTL 6.44e-01 0.0483 0.104 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -101403 sc-eQTL 1.19e-06 0.626 0.125 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -152513 sc-eQTL 1.75e-01 0.0731 0.0537 0.099 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 -51999 pQTL 1.21e-18 0.509 0.0568 0.0 0.0 0.0914
ENSG00000112299 VNN1 -51999 eQTL 7.65e-14 0.268 0.0353 0.0 0.0 0.0883
ENSG00000112306 RPS12 -152513 eQTL 0.0434 0.0204 0.0101 0.0 0.0 0.0883
ENSG00000234484 AL032821.1 -90619 eQTL 0.0211 -0.12 0.052 0.0 0.0 0.0883


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000093134 \N -72709 1.6e-05 1.25e-05 2.86e-06 7.65e-06 2.4e-06 6.65e-06 1.85e-05 2.18e-06 1.14e-05 6.12e-06 1.6e-05 6.53e-06 1.81e-05 4.54e-06 4.71e-06 7.94e-06 8.11e-06 1.09e-05 3.47e-06 3.29e-06 6.47e-06 1.18e-05 1.1e-05 4.68e-06 2.02e-05 5.37e-06 7.96e-06 5.03e-06 1.39e-05 1.02e-05 7.01e-06 1.12e-06 1.4e-06 3.64e-06 6.34e-06 2.68e-06 1.78e-06 2.13e-06 2.42e-06 1.74e-06 1.02e-06 1.67e-05 2.68e-06 3.78e-07 1.15e-06 1.74e-06 2.02e-06 6.55e-07 6.33e-07
ENSG00000112299 VNN1 -51999 2.51e-05 1.69e-05 3.64e-06 9.4e-06 3.06e-06 8.67e-06 2.42e-05 2.48e-06 1.64e-05 7.65e-06 2.1e-05 8.32e-06 2.53e-05 6.43e-06 5.31e-06 9.71e-06 1e-05 1.46e-05 4.67e-06 4.29e-06 8.02e-06 1.6e-05 1.58e-05 5.66e-06 2.59e-05 5.96e-06 8.81e-06 6.87e-06 1.7e-05 1.31e-05 1.03e-05 1.47e-06 1.92e-06 4.07e-06 7.8e-06 3.71e-06 1.73e-06 2.69e-06 3.2e-06 2.23e-06 1.11e-06 2.08e-05 2.72e-06 3.66e-07 1.91e-06 2.34e-06 3.02e-06 8.24e-07 1.19e-06
ENSG00000234484 AL032821.1 -90619 1.37e-05 1.12e-05 2.53e-06 6.74e-06 2.48e-06 5.81e-06 1.27e-05 1.77e-06 9.91e-06 5.36e-06 1.3e-05 5.73e-06 1.38e-05 3.56e-06 3.97e-06 6.67e-06 6.5e-06 8e-06 3.14e-06 2.85e-06 6.01e-06 9.86e-06 8.65e-06 3.7e-06 1.48e-05 5.13e-06 7.29e-06 3.91e-06 1.14e-05 8.21e-06 5.42e-06 1.08e-06 1.28e-06 3.29e-06 5.42e-06 2.31e-06 1.72e-06 2e-06 2.04e-06 1.26e-06 8.2e-07 1.33e-05 2.34e-06 3.78e-07 8.44e-07 1.63e-06 1.82e-06 7.14e-07 4.59e-07