Genes within 1Mb (chr6:132660644:CT:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 259169 sc-eQTL 4.71e-01 0.101 0.139 0.1 B L1
ENSG00000079950 STX7 147446 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00586 0.0526 0.1 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -102815 sc-eQTL 1.63e-01 0.138 0.0985 0.1 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -153925 sc-eQTL 5.60e-01 0.0349 0.0598 0.1 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -152695 sc-eQTL 3.10e-03 0.369 0.123 0.1 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 528756 sc-eQTL 5.10e-01 0.0545 0.0826 0.1 B L1
ENSG00000079950 STX7 147446 sc-eQTL 2.65e-01 -0.115 0.103 0.1 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -102815 sc-eQTL 8.05e-01 -0.022 0.0891 0.1 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -153925 sc-eQTL 8.78e-01 0.00927 0.0606 0.1 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -152695 sc-eQTL 2.18e-01 0.151 0.122 0.1 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 147446 sc-eQTL 1.02e-01 -0.165 0.101 0.1 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -102815 sc-eQTL 6.56e-01 0.0528 0.118 0.1 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -153925 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0202 0.0404 0.1 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -152695 sc-eQTL 3.91e-02 0.251 0.121 0.1 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 147446 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0804 0.0946 0.097 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -74121 sc-eQTL 7.73e-01 0.0339 0.118 0.097 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -53411 sc-eQTL 2.29e-02 0.287 0.125 0.097 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -102815 sc-eQTL 3.20e-02 0.29 0.134 0.097 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -153925 sc-eQTL 7.09e-01 0.0284 0.0761 0.097 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -152695 sc-eQTL 2.87e-01 0.128 0.12 0.097 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -442484 sc-eQTL 4.12e-01 0.09 0.109 0.097 DC L1
ENSG00000079950 STX7 147446 sc-eQTL 1.56e-01 -0.0986 0.0692 0.1 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -74121 sc-eQTL 2.26e-01 0.145 0.119 0.1 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -53411 sc-eQTL 4.88e-09 0.723 0.118 0.1 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -102815 sc-eQTL 7.23e-02 0.162 0.09 0.1 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -153925 sc-eQTL 8.45e-01 0.0106 0.0543 0.1 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -152695 sc-eQTL 4.55e-01 0.0803 0.107 0.1 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 147446 sc-eQTL 6.49e-01 0.0474 0.104 0.099 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -102815 sc-eQTL 7.31e-06 0.568 0.123 0.099 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -153925 sc-eQTL 1.98e-01 0.069 0.0534 0.099 NK L1
ENSG00000079950 STX7 147446 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0313 0.105 0.1 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -102815 sc-eQTL 1.59e-02 0.304 0.125 0.1 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -153925 sc-eQTL 6.47e-01 0.0231 0.0503 0.1 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -152695 sc-eQTL 6.55e-02 0.253 0.137 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 259169 sc-eQTL 7.94e-01 0.0367 0.141 0.099 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 147446 sc-eQTL 4.63e-02 -0.262 0.13 0.099 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -102815 sc-eQTL 6.45e-02 0.259 0.139 0.099 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -153925 sc-eQTL 7.43e-01 0.0247 0.0752 0.099 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152695 sc-eQTL 4.13e-01 0.108 0.132 0.099 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 528756 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0124 0.126 0.099 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 259169 sc-eQTL 8.59e-01 0.0231 0.13 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 147446 sc-eQTL 9.35e-01 0.00701 0.0853 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -102815 sc-eQTL 2.24e-01 0.156 0.128 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -153925 sc-eQTL 6.33e-01 0.0376 0.0787 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152695 sc-eQTL 2.36e-02 0.319 0.14 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 528756 sc-eQTL 2.01e-01 0.154 0.12 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 259169 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0202 0.131 0.101 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 147446 sc-eQTL 2.84e-01 -0.11 0.102 0.101 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -102815 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0589 0.134 0.101 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -153925 sc-eQTL 5.92e-01 0.0347 0.0647 0.101 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152695 sc-eQTL 6.85e-01 0.0548 0.135 0.101 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 528756 sc-eQTL 9.35e-01 0.0103 0.126 0.101 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 259169 sc-eQTL 1.73e-02 0.347 0.145 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 147446 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00555 0.064 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -102815 sc-eQTL 6.30e-01 0.0599 0.124 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -153925 sc-eQTL 2.38e-01 0.0835 0.0706 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152695 sc-eQTL 2.25e-02 0.31 0.135 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 528756 sc-eQTL 2.46e-01 -0.105 0.0902 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 259169 sc-eQTL 8.91e-01 0.0191 0.139 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 147446 sc-eQTL 6.65e-01 0.0327 0.0755 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -102815 sc-eQTL 6.01e-01 0.0725 0.139 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -153925 sc-eQTL 4.08e-01 0.0607 0.0733 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152695 sc-eQTL 2.21e-02 0.319 0.138 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 528756 sc-eQTL 7.14e-02 0.175 0.0963 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 147446 sc-eQTL 9.70e-02 -0.236 0.142 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -102815 sc-eQTL 4.72e-01 0.104 0.144 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -153925 sc-eQTL 4.81e-01 0.0469 0.0664 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152695 sc-eQTL 6.72e-02 0.245 0.133 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 147446 sc-eQTL 5.87e-01 0.0603 0.111 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -102815 sc-eQTL 5.36e-01 0.0637 0.103 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -153925 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00237 0.0667 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152695 sc-eQTL 4.90e-01 0.0887 0.128 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 147446 sc-eQTL 5.12e-02 -0.235 0.12 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -102815 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0514 0.119 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -153925 sc-eQTL 9.71e-01 0.00223 0.0617 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152695 sc-eQTL 2.74e-01 0.156 0.143 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 147446 sc-eQTL 2.06e-01 -0.179 0.141 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -102815 sc-eQTL 4.54e-01 -0.101 0.135 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -153925 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0149 0.0556 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152695 sc-eQTL 8.66e-03 0.36 0.136 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 147446 sc-eQTL 4.54e-02 -0.232 0.115 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -102815 sc-eQTL 7.27e-02 0.237 0.131 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -153925 sc-eQTL 3.21e-01 0.0704 0.0707 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152695 sc-eQTL 1.04e-01 0.223 0.136 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 147446 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0283 0.142 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -102815 sc-eQTL 2.84e-01 -0.132 0.122 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -153925 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00772 0.0703 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152695 sc-eQTL 1.32e-01 0.212 0.14 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 147446 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0632 0.141 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -102815 sc-eQTL 5.29e-01 -0.088 0.139 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -153925 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0314 0.068 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152695 sc-eQTL 5.82e-02 0.282 0.148 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 147446 sc-eQTL 9.40e-01 0.0115 0.152 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -102815 sc-eQTL 5.78e-01 0.0842 0.151 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -153925 sc-eQTL 1.89e-01 0.107 0.0809 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152695 sc-eQTL 2.30e-01 -0.184 0.153 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 147446 sc-eQTL 5.42e-02 -0.259 0.134 0.1 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -102815 sc-eQTL 5.18e-01 0.0887 0.137 0.1 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -153925 sc-eQTL 4.39e-01 0.0522 0.0673 0.1 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152695 sc-eQTL 2.60e-01 0.159 0.141 0.1 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 147446 sc-eQTL 4.34e-01 0.111 0.141 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -102815 sc-eQTL 4.16e-01 0.117 0.143 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -153925 sc-eQTL 3.43e-01 0.0757 0.0797 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 147446 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0628 0.111 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -102815 sc-eQTL 4.72e-05 0.552 0.133 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -153925 sc-eQTL 9.82e-02 0.0906 0.0545 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 147446 sc-eQTL 6.54e-02 0.251 0.135 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -102815 sc-eQTL 9.56e-04 0.451 0.134 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -153925 sc-eQTL 1.80e-01 0.0861 0.064 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 147446 sc-eQTL 8.54e-01 0.0225 0.122 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -102815 sc-eQTL 1.69e-04 0.508 0.133 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -153925 sc-eQTL 2.79e-01 0.0806 0.0743 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 259169 sc-eQTL 9.20e-01 0.0152 0.152 0.104 PB L2
ENSG00000079950 STX7 147446 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0575 0.127 0.104 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -102815 sc-eQTL 5.28e-01 0.0978 0.155 0.104 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -153925 sc-eQTL 9.24e-01 0.00841 0.0879 0.104 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152695 sc-eQTL 3.43e-01 -0.156 0.164 0.104 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 528756 sc-eQTL 6.21e-01 0.0537 0.108 0.104 PB L2
ENSG00000079950 STX7 147446 sc-eQTL 9.47e-01 0.00839 0.126 0.1 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -102815 sc-eQTL 2.35e-01 0.161 0.135 0.1 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -153925 sc-eQTL 8.34e-01 0.0107 0.0512 0.1 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152695 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0997 0.132 0.1 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 147446 sc-eQTL 4.36e-01 -0.107 0.137 0.1 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -102815 sc-eQTL 7.22e-01 -0.041 0.115 0.1 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -153925 sc-eQTL 3.34e-01 0.0492 0.0508 0.1 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152695 sc-eQTL 5.83e-01 0.079 0.144 0.1 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 147446 sc-eQTL 2.61e-01 -0.132 0.117 0.098 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -74121 sc-eQTL 2.94e-01 0.122 0.116 0.098 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -53411 sc-eQTL 1.76e-01 0.185 0.137 0.098 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -102815 sc-eQTL 1.46e-01 0.194 0.133 0.098 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -153925 sc-eQTL 6.37e-01 0.0312 0.066 0.098 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152695 sc-eQTL 7.34e-02 0.233 0.13 0.098 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -442484 sc-eQTL 5.67e-01 0.0599 0.104 0.098 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 147446 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0577 0.0889 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -74121 sc-eQTL 3.96e-01 0.107 0.126 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -53411 sc-eQTL 6.85e-09 0.708 0.117 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -102815 sc-eQTL 5.29e-02 0.196 0.101 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -153925 sc-eQTL 7.53e-01 0.0177 0.0563 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152695 sc-eQTL 2.14e-01 0.135 0.108 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 147446 sc-eQTL 2.72e-01 -0.105 0.0957 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -74121 sc-eQTL 8.73e-02 0.204 0.119 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -53411 sc-eQTL 7.87e-06 0.569 0.124 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -102815 sc-eQTL 1.54e-01 0.121 0.0848 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -153925 sc-eQTL 3.53e-01 0.057 0.0613 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152695 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0681 0.114 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 147446 sc-eQTL 8.59e-01 0.0273 0.153 0.109 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -102815 sc-eQTL 5.87e-02 0.319 0.167 0.109 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -153925 sc-eQTL 9.51e-01 0.00396 0.0645 0.109 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152695 sc-eQTL 3.49e-01 0.156 0.166 0.109 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 147446 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0249 0.129 0.102 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -74121 sc-eQTL 2.71e-01 -0.143 0.13 0.102 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -53411 sc-eQTL 3.75e-04 0.45 0.124 0.102 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -102815 sc-eQTL 1.35e-01 0.195 0.13 0.102 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -153925 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00299 0.0568 0.102 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152695 sc-eQTL 2.53e-01 0.158 0.138 0.102 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 147446 sc-eQTL 8.33e-03 -0.256 0.096 0.102 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -74121 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0303 0.138 0.102 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -53411 sc-eQTL 3.94e-07 0.673 0.128 0.102 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -102815 sc-eQTL 3.54e-01 0.122 0.131 0.102 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -153925 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00754 0.066 0.102 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152695 sc-eQTL 3.75e-01 -0.103 0.116 0.102 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 147446 sc-eQTL 8.44e-02 -0.201 0.116 0.09 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -74121 sc-eQTL 5.14e-01 0.0768 0.117 0.09 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -53411 sc-eQTL 1.85e-01 0.158 0.119 0.09 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -102815 sc-eQTL 1.69e-02 0.338 0.14 0.09 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -153925 sc-eQTL 3.35e-02 -0.207 0.0967 0.09 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152695 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0694 0.145 0.09 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -442484 sc-eQTL 4.58e-01 0.103 0.139 0.09 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 259169 sc-eQTL 8.29e-01 0.03 0.139 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 147446 sc-eQTL 1.95e-01 -0.102 0.0782 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -102815 sc-eQTL 2.39e-01 0.146 0.124 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -153925 sc-eQTL 5.16e-01 0.046 0.0707 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -152695 sc-eQTL 7.08e-02 0.234 0.129 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 528756 sc-eQTL 5.64e-01 0.0724 0.125 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 259169 sc-eQTL 1.07e-01 0.235 0.145 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 147446 sc-eQTL 7.19e-01 0.0215 0.0599 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -102815 sc-eQTL 3.02e-01 0.12 0.116 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -153925 sc-eQTL 4.02e-01 0.059 0.0702 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -152695 sc-eQTL 2.81e-03 0.393 0.13 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 528756 sc-eQTL 8.67e-01 0.0142 0.0843 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 147446 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0736 0.0743 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -74121 sc-eQTL 1.73e-01 0.165 0.121 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -53411 sc-eQTL 1.44e-08 0.692 0.117 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -102815 sc-eQTL 1.08e-01 0.134 0.0832 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -153925 sc-eQTL 4.37e-01 0.0446 0.0573 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -152695 sc-eQTL 4.80e-01 0.0722 0.102 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 147446 sc-eQTL 9.46e-02 -0.154 0.0917 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -74121 sc-eQTL 4.48e-01 -0.103 0.136 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -53411 sc-eQTL 1.62e-06 0.629 0.127 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -102815 sc-eQTL 2.02e-01 0.162 0.126 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -153925 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0346 0.0538 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -152695 sc-eQTL 3.07e-01 0.134 0.13 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 147446 sc-eQTL 6.44e-01 0.0483 0.104 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -102815 sc-eQTL 1.19e-06 0.626 0.125 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -153925 sc-eQTL 1.75e-01 0.0731 0.0537 0.099 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 -53411 pQTL 1.42e-18 0.508 0.0569 0.0 0.0 0.0914
ENSG00000112299 VNN1 -53411 eQTL 8.01e-14 0.268 0.0354 0.0 0.0 0.0883
ENSG00000112306 RPS12 -153925 eQTL 0.0432 0.0204 0.0101 0.0 0.0 0.0883
ENSG00000234484 AL032821.1 -92031 eQTL 0.0206 -0.121 0.052 0.0 0.0 0.0883


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina