logo

Genes within 1Mb (chr6:132656683:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 255208 sc-eQTL 5.54e-01 0.0819 0.138 0.12 B L1
ENSG00000079950 STX7 143485 sc-eQTL 1.10e-01 -0.0831 0.0518 0.12 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -106776 sc-eQTL 6.26e-01 0.0478 0.0979 0.12 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -157886 sc-eQTL 6.00e-02 -0.111 0.0587 0.12 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -156656 sc-eQTL 4.33e-01 0.0977 0.124 0.12 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 524795 sc-eQTL 1.06e-01 -0.132 0.0813 0.12 B L1
ENSG00000079950 STX7 143485 sc-eQTL 5.99e-01 0.0533 0.101 0.12 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -106776 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0659 0.0876 0.12 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -157886 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00544 0.0597 0.12 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -156656 sc-eQTL 6.61e-01 0.053 0.121 0.12 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 143485 sc-eQTL 8.43e-01 0.0198 0.1 0.12 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -106776 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0556 0.117 0.12 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -157886 sc-eQTL 8.85e-01 0.00578 0.0399 0.12 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -156656 sc-eQTL 3.85e-01 0.105 0.121 0.12 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 143485 sc-eQTL 2.00e-02 0.213 0.0907 0.117 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -78082 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0725 0.114 0.117 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -57372 sc-eQTL 3.62e-01 -0.112 0.123 0.117 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -106776 sc-eQTL 6.47e-01 0.0604 0.132 0.117 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -157886 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00282 0.0738 0.117 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -156656 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0891 0.117 0.117 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -446445 sc-eQTL 6.47e-02 -0.196 0.105 0.117 DC L1
ENSG00000079950 STX7 143485 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0348 0.0683 0.12 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -78082 sc-eQTL 6.64e-01 -0.051 0.117 0.12 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -57372 sc-eQTL 1.70e-03 -0.392 0.123 0.12 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -106776 sc-eQTL 3.47e-01 0.0837 0.0888 0.12 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -157886 sc-eQTL 2.89e-01 0.0566 0.0532 0.12 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -156656 sc-eQTL 8.59e-01 0.0188 0.106 0.12 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 143485 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0848 0.103 0.12 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -106776 sc-eQTL 6.90e-01 0.051 0.128 0.12 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -157886 sc-eQTL 8.46e-02 -0.0911 0.0526 0.12 NK L1
ENSG00000079950 STX7 143485 sc-eQTL 9.86e-01 0.00179 0.104 0.12 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -106776 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0891 0.126 0.12 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -157886 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0301 0.0498 0.12 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -156656 sc-eQTL 7.32e-01 0.0469 0.136 0.12 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 255208 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0196 0.145 0.112 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 143485 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0214 0.136 0.112 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -106776 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0215 0.145 0.112 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -157886 sc-eQTL 9.06e-01 0.00923 0.0778 0.112 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -156656 sc-eQTL 7.53e-01 0.043 0.136 0.112 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 524795 sc-eQTL 9.07e-01 0.0153 0.13 0.112 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 255208 sc-eQTL 8.86e-01 0.0181 0.126 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 143485 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0681 0.0825 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -106776 sc-eQTL 2.22e-01 0.152 0.124 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -157886 sc-eQTL 6.80e-02 -0.139 0.0756 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -156656 sc-eQTL 2.52e-01 0.157 0.137 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 524795 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0312 0.117 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 255208 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0572 0.13 0.121 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 143485 sc-eQTL 2.91e-01 -0.108 0.102 0.121 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -106776 sc-eQTL 3.54e-02 0.279 0.132 0.121 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -157886 sc-eQTL 1.71e-01 -0.0879 0.064 0.121 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -156656 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0435 0.134 0.121 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 524795 sc-eQTL 4.96e-01 -0.085 0.125 0.121 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 255208 sc-eQTL 8.86e-01 0.0205 0.143 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 143485 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0585 0.0623 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -106776 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0101 0.121 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -157886 sc-eQTL 1.48e-01 -0.0999 0.0687 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -156656 sc-eQTL 7.96e-01 0.0345 0.133 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 524795 sc-eQTL 1.30e-01 -0.133 0.0878 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 255208 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0436 0.134 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 143485 sc-eQTL 1.15e-02 -0.184 0.0721 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -106776 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000473 0.134 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -157886 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0368 0.0711 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -156656 sc-eQTL 8.91e-01 0.0186 0.136 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 524795 sc-eQTL 1.82e-01 -0.125 0.0937 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 143485 sc-eQTL 9.73e-01 0.00498 0.148 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -106776 sc-eQTL 2.36e-01 0.177 0.149 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -157886 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0409 0.0691 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -156656 sc-eQTL 4.53e-01 -0.105 0.139 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 143485 sc-eQTL 8.61e-01 0.0195 0.111 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -106776 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0634 0.103 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -157886 sc-eQTL 5.66e-01 0.0385 0.067 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -156656 sc-eQTL 8.40e-01 0.026 0.129 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 143485 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0553 0.121 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -106776 sc-eQTL 9.73e-02 -0.197 0.118 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -157886 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0249 0.0618 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -156656 sc-eQTL 6.28e-01 0.0693 0.143 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 143485 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0228 0.141 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -106776 sc-eQTL 6.14e-01 0.0686 0.136 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -157886 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0298 0.0556 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -156656 sc-eQTL 3.82e-02 0.286 0.137 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 143485 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0152 0.113 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -106776 sc-eQTL 4.60e-01 0.0948 0.128 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -157886 sc-eQTL 8.51e-01 0.0129 0.0686 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -156656 sc-eQTL 5.48e-01 0.0798 0.133 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 143485 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0296 0.144 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -106776 sc-eQTL 2.63e-01 -0.139 0.124 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -157886 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0735 0.0708 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -156656 sc-eQTL 2.22e-01 0.174 0.142 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 143485 sc-eQTL 3.34e-01 0.138 0.142 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -106776 sc-eQTL 1.41e-01 -0.208 0.141 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -157886 sc-eQTL 7.21e-01 0.0247 0.0689 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -156656 sc-eQTL 2.83e-01 0.162 0.151 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 143485 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0614 0.151 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -106776 sc-eQTL 2.20e-01 0.184 0.149 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -157886 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0352 0.0806 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -156656 sc-eQTL 5.07e-01 -0.101 0.152 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 143485 sc-eQTL 9.23e-01 0.013 0.135 0.115 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -106776 sc-eQTL 1.30e-01 0.207 0.136 0.115 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -157886 sc-eQTL 6.06e-01 0.0348 0.0673 0.115 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -156656 sc-eQTL 1.62e-01 0.197 0.141 0.115 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 143485 sc-eQTL 3.66e-01 -0.126 0.139 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -106776 sc-eQTL 8.65e-01 0.0241 0.141 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -157886 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0716 0.0787 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 143485 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0389 0.11 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -106776 sc-eQTL 5.95e-01 0.0729 0.137 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -157886 sc-eQTL 1.14e-01 -0.0859 0.0541 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 143485 sc-eQTL 2.63e-02 -0.3 0.134 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -106776 sc-eQTL 7.60e-01 0.042 0.137 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -157886 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0266 0.064 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 143485 sc-eQTL 2.10e-01 -0.148 0.118 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -106776 sc-eQTL 8.40e-01 0.027 0.133 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -157886 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0711 0.0722 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 255208 sc-eQTL 4.86e-01 0.101 0.145 0.133 PB L2
ENSG00000079950 STX7 143485 sc-eQTL 5.62e-01 0.0704 0.121 0.133 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -106776 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0476 0.148 0.133 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -157886 sc-eQTL 4.94e-01 0.0576 0.0839 0.133 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -156656 sc-eQTL 4.07e-01 0.131 0.157 0.133 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 524795 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0243 0.104 0.133 PB L2
ENSG00000079950 STX7 143485 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0707 0.123 0.122 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -106776 sc-eQTL 2.41e-01 -0.155 0.132 0.122 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -157886 sc-eQTL 9.00e-01 -0.00627 0.05 0.122 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -156656 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0234 0.129 0.122 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 143485 sc-eQTL 2.02e-01 0.169 0.132 0.12 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -106776 sc-eQTL 3.44e-01 -0.106 0.112 0.12 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -157886 sc-eQTL 8.72e-01 -0.008 0.0495 0.12 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -156656 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0337 0.14 0.12 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 143485 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0378 0.115 0.124 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -78082 sc-eQTL 3.65e-01 -0.104 0.114 0.124 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -57372 sc-eQTL 2.82e-01 -0.145 0.134 0.124 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -106776 sc-eQTL 8.65e-01 0.0222 0.131 0.124 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -157886 sc-eQTL 8.88e-01 -0.00916 0.0648 0.124 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -156656 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0113 0.128 0.124 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -446445 sc-eQTL 9.76e-02 -0.169 0.102 0.124 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 143485 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0283 0.0876 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -78082 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0317 0.124 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -57372 sc-eQTL 3.12e-02 -0.268 0.124 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -106776 sc-eQTL 1.99e-01 0.128 0.0995 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -157886 sc-eQTL 1.14e-01 0.0875 0.0551 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -156656 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0494 0.107 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 143485 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0536 0.0952 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -78082 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0128 0.119 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -57372 sc-eQTL 6.11e-03 -0.352 0.127 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -106776 sc-eQTL 3.08e-01 0.0863 0.0844 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -157886 sc-eQTL 5.73e-01 0.0344 0.0609 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -156656 sc-eQTL 9.21e-01 0.0112 0.113 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 143485 sc-eQTL 3.00e-01 -0.168 0.161 0.118 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -106776 sc-eQTL 6.60e-02 -0.328 0.177 0.118 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -157886 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0582 0.0681 0.118 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -156656 sc-eQTL 3.86e-01 -0.153 0.176 0.118 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 143485 sc-eQTL 6.08e-01 0.0658 0.128 0.12 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -78082 sc-eQTL 6.74e-01 0.0543 0.129 0.12 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -57372 sc-eQTL 2.48e-01 -0.147 0.127 0.12 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -106776 sc-eQTL 6.14e-02 0.242 0.129 0.12 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -157886 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0126 0.0565 0.12 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -156656 sc-eQTL 2.78e-01 -0.149 0.137 0.12 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 143485 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0527 0.0948 0.12 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -78082 sc-eQTL 5.86e-01 0.0729 0.134 0.12 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -57372 sc-eQTL 1.49e-01 -0.191 0.132 0.12 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -106776 sc-eQTL 1.48e-02 0.309 0.126 0.12 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -157886 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0186 0.0641 0.12 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -156656 sc-eQTL 1.53e-01 0.161 0.113 0.12 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 143485 sc-eQTL 9.98e-02 0.176 0.106 0.127 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -78082 sc-eQTL 5.49e-01 0.0646 0.108 0.127 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -57372 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0643 0.11 0.127 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -106776 sc-eQTL 4.38e-01 -0.101 0.13 0.127 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -157886 sc-eQTL 8.69e-01 0.0149 0.09 0.127 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -156656 sc-eQTL 3.01e-01 -0.138 0.133 0.127 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -446445 sc-eQTL 4.22e-01 -0.102 0.127 0.127 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 255208 sc-eQTL 4.49e-01 0.102 0.135 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 143485 sc-eQTL 1.87e-01 -0.101 0.0763 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -106776 sc-eQTL 7.47e-02 0.215 0.12 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -157886 sc-eQTL 2.71e-02 -0.152 0.0682 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -156656 sc-eQTL 2.81e-01 0.137 0.126 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 524795 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0781 0.122 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 255208 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0345 0.143 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 143485 sc-eQTL 7.01e-02 -0.106 0.0584 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -106776 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00911 0.114 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -157886 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0826 0.0689 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -156656 sc-eQTL 9.00e-01 0.0164 0.13 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 524795 sc-eQTL 9.79e-02 -0.137 0.0823 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 143485 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0484 0.0738 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -78082 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0714 0.12 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -57372 sc-eQTL 2.37e-03 -0.378 0.123 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -106776 sc-eQTL 4.46e-01 0.0632 0.0829 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -157886 sc-eQTL 2.60e-01 0.0641 0.0567 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -156656 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000396 0.101 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 143485 sc-eQTL 9.46e-01 0.0061 0.0896 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -78082 sc-eQTL 9.44e-01 0.00923 0.132 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -57372 sc-eQTL 1.12e-01 -0.207 0.13 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -106776 sc-eQTL 3.37e-02 0.26 0.122 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -157886 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0259 0.0522 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -156656 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0413 0.127 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 143485 sc-eQTL 3.63e-01 -0.094 0.103 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -106776 sc-eQTL 5.94e-01 0.0697 0.131 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -157886 sc-eQTL 1.46e-01 -0.0775 0.0531 0.121 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000093134 VNN3 -78082 eQTL 0.00841 0.0619 0.0235 0.0 0.0 0.102
ENSG00000112299 VNN1 -57372 eQTL 2.07e-07 -0.181 0.0345 0.0 0.0 0.102
ENSG00000112303 VNN2 -106776 pQTL 0.00088 0.129 0.0386 0.0 0.0 0.107
ENSG00000112303 VNN2 -106776 eQTL 0.0207 0.0483 0.0208 0.0 0.0 0.102
ENSG00000234484 AL032821.1 -95992 eQTL 0.000198 -0.186 0.0498 0.0 0.0 0.102

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000093134 VNN3 -78082 8.18e-06 9.41e-06 1.36e-06 5.03e-06 2.35e-06 4.07e-06 1.02e-05 2.12e-06 9.39e-06 4.92e-06 1.24e-05 5.35e-06 1.36e-05 3.87e-06 2.66e-06 6.38e-06 4.12e-06 7.37e-06 2.62e-06 2.77e-06 5.05e-06 9e-06 7.47e-06 3.4e-06 1.3e-05 4.31e-06 5.19e-06 4.08e-06 9.77e-06 7.84e-06 5.42e-06 1.09e-06 1.17e-06 3.24e-06 4.58e-06 2.59e-06 1.82e-06 1.84e-06 2.18e-06 9.53e-07 9.26e-07 1.2e-05 1.39e-06 2.36e-07 8.04e-07 1.71e-06 1.6e-06 7.87e-07 4.73e-07
ENSG00000112299 VNN1 -57372 1.09e-05 1.25e-05 2.31e-06 7.18e-06 2.41e-06 5.36e-06 1.34e-05 2.53e-06 1.15e-05 6.12e-06 1.58e-05 6.55e-06 1.96e-05 4.17e-06 3.8e-06 7.72e-06 6.45e-06 1e-05 3.39e-06 3.25e-06 6.66e-06 1.14e-05 1.1e-05 3.88e-06 1.95e-05 4.5e-06 7.16e-06 5.4e-06 1.34e-05 1e-05 7.63e-06 1.06e-06 1.31e-06 3.78e-06 5.44e-06 3e-06 1.78e-06 2.16e-06 2.22e-06 1.34e-06 1.2e-06 1.51e-05 1.61e-06 2.86e-07 1.27e-06 2.27e-06 1.98e-06 8.47e-07 6.19e-07
ENSG00000112303 VNN2 -106776 5.86e-06 7.73e-06 1e-06 3.75e-06 1.93e-06 2.1e-06 8.57e-06 1.75e-06 5.51e-06 4.05e-06 8.95e-06 3.57e-06 1.07e-05 2.83e-06 1.52e-06 5.06e-06 3.61e-06 3.86e-06 1.94e-06 2.41e-06 3.43e-06 7.45e-06 5.5e-06 2.15e-06 9.1e-06 2.66e-06 3.99e-06 2.43e-06 6.73e-06 6.32e-06 3.67e-06 7.35e-07 7.68e-07 2.73e-06 2.6e-06 2.09e-06 1.38e-06 1.19e-06 1.35e-06 8.19e-07 8.79e-07 8.09e-06 9.07e-07 1.47e-07 7.38e-07 1.06e-06 8.95e-07 6.96e-07 5.09e-07
ENSG00000234484 AL032821.1 -95992 6.97e-06 9.04e-06 1.32e-06 4.16e-06 2.17e-06 2.96e-06 9.53e-06 1.96e-06 6.51e-06 4.29e-06 1.03e-05 4.64e-06 1.13e-05 3.5e-06 1.86e-06 5.78e-06 3.69e-06 5e-06 2.27e-06 2.66e-06 4.39e-06 7.55e-06 6.55e-06 2.82e-06 1.08e-05 3.11e-06 4.48e-06 3.07e-06 7.34e-06 7.22e-06 4.16e-06 8.78e-07 1.09e-06 2.86e-06 3.41e-06 2.18e-06 1.63e-06 1.74e-06 1.56e-06 9.87e-07 1.03e-06 8.83e-06 1.19e-06 1.92e-07 7.05e-07 1.51e-06 1.09e-06 7.83e-07 4.49e-07