Genes within 1Mb (chr6:132653513:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 252038 sc-eQTL 2.80e-01 0.14 0.129 0.13 B L1
ENSG00000079950 STX7 140315 sc-eQTL 2.98e-01 0.0507 0.0486 0.13 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -109946 sc-eQTL 4.03e-01 0.0767 0.0914 0.13 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -161056 sc-eQTL 3.78e-01 0.0488 0.0553 0.13 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -159826 sc-eQTL 9.29e-03 0.301 0.115 0.13 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 521625 sc-eQTL 2.90e-02 0.166 0.0756 0.13 B L1
ENSG00000079950 STX7 140315 sc-eQTL 7.08e-01 0.0356 0.0949 0.13 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -109946 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0089 0.0822 0.13 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -161056 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00346 0.0559 0.13 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -159826 sc-eQTL 3.83e-01 0.0987 0.113 0.13 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 140315 sc-eQTL 4.87e-01 0.065 0.0935 0.13 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -109946 sc-eQTL 5.03e-01 0.0732 0.109 0.13 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -161056 sc-eQTL 9.40e-01 0.0028 0.0373 0.13 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -159826 sc-eQTL 7.50e-02 0.2 0.112 0.13 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 140315 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0389 0.088 0.124 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -81252 sc-eQTL 2.35e-01 -0.129 0.109 0.124 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -60542 sc-eQTL 7.05e-02 0.213 0.117 0.124 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -109946 sc-eQTL 6.78e-02 0.23 0.125 0.124 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -161056 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0201 0.0707 0.124 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -159826 sc-eQTL 6.99e-01 0.0433 0.112 0.124 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -449615 sc-eQTL 5.30e-01 0.064 0.102 0.124 DC L1
ENSG00000079950 STX7 140315 sc-eQTL 1.23e-01 -0.0988 0.0638 0.13 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -81252 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0356 0.11 0.13 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -60542 sc-eQTL 1.66e-01 0.164 0.118 0.13 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -109946 sc-eQTL 1.04e-01 0.136 0.0831 0.13 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -161056 sc-eQTL 6.46e-01 0.023 0.0501 0.13 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -159826 sc-eQTL 2.22e-01 0.121 0.0988 0.13 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 140315 sc-eQTL 6.42e-01 0.0451 0.0969 0.129 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -109946 sc-eQTL 2.17e-02 0.276 0.119 0.129 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -161056 sc-eQTL 2.57e-01 0.0566 0.0498 0.129 NK L1
ENSG00000079950 STX7 140315 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0739 0.0965 0.13 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -109946 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0192 0.117 0.13 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -161056 sc-eQTL 8.81e-01 -0.00696 0.0463 0.13 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -159826 sc-eQTL 3.24e-02 0.27 0.125 0.13 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 252038 sc-eQTL 6.58e-01 0.0568 0.128 0.138 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 140315 sc-eQTL 1.91e-01 -0.157 0.119 0.138 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -109946 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0454 0.128 0.138 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -161056 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0659 0.0683 0.138 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -159826 sc-eQTL 7.28e-01 0.0418 0.12 0.138 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 521625 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00838 0.114 0.138 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 252038 sc-eQTL 9.46e-01 0.00825 0.122 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 140315 sc-eQTL 1.38e-01 0.118 0.0793 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -109946 sc-eQTL 5.52e-01 0.0714 0.12 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -161056 sc-eQTL 6.24e-01 -0.036 0.0735 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -159826 sc-eQTL 5.56e-02 0.253 0.131 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 521625 sc-eQTL 1.79e-01 0.151 0.112 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 252038 sc-eQTL 8.55e-01 0.0222 0.122 0.129 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 140315 sc-eQTL 9.84e-01 0.00192 0.0954 0.129 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -109946 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0465 0.125 0.129 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -161056 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00544 0.0601 0.129 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -159826 sc-eQTL 2.27e-01 -0.151 0.125 0.129 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 521625 sc-eQTL 4.63e-01 0.0859 0.117 0.129 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 252038 sc-eQTL 3.25e-02 0.288 0.134 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 140315 sc-eQTL 5.49e-01 0.0355 0.0591 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -109946 sc-eQTL 6.50e-01 0.0522 0.115 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -161056 sc-eQTL 3.26e-01 0.0642 0.0652 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -159826 sc-eQTL 1.03e-02 0.321 0.124 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 521625 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0533 0.0835 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 252038 sc-eQTL 6.43e-01 0.06 0.129 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 140315 sc-eQTL 4.92e-01 0.0485 0.0704 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -109946 sc-eQTL 8.07e-01 0.0316 0.129 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -161056 sc-eQTL 4.97e-01 0.0465 0.0685 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -159826 sc-eQTL 6.50e-02 0.241 0.13 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 521625 sc-eQTL 3.09e-03 0.266 0.0888 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 140315 sc-eQTL 4.36e-01 -0.103 0.132 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -109946 sc-eQTL 4.38e-01 -0.104 0.134 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -161056 sc-eQTL 5.26e-01 0.0392 0.0618 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -159826 sc-eQTL 1.46e-01 0.181 0.124 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 140315 sc-eQTL 2.02e-01 0.13 0.102 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -109946 sc-eQTL 4.97e-01 0.0642 0.0945 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -161056 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0156 0.0614 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -159826 sc-eQTL 3.56e-01 0.109 0.118 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 140315 sc-eQTL 8.44e-02 -0.192 0.111 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -109946 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0129 0.11 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -161056 sc-eQTL 4.96e-01 0.0388 0.0569 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -159826 sc-eQTL 9.94e-01 0.001 0.132 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 140315 sc-eQTL 7.63e-01 0.0392 0.13 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -109946 sc-eQTL 3.37e-01 -0.12 0.124 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -161056 sc-eQTL 8.58e-01 -0.00915 0.0511 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -159826 sc-eQTL 8.76e-02 0.216 0.126 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 140315 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0917 0.108 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -109946 sc-eQTL 1.89e-01 0.162 0.123 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -161056 sc-eQTL 4.43e-02 0.132 0.0653 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -159826 sc-eQTL 9.16e-02 0.215 0.127 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 140315 sc-eQTL 9.04e-02 0.218 0.128 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -109946 sc-eQTL 8.65e-01 0.0189 0.111 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -161056 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0135 0.0636 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -159826 sc-eQTL 7.99e-02 0.223 0.127 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 140315 sc-eQTL 7.19e-01 -0.046 0.128 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -109946 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0984 0.127 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -161056 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0363 0.0617 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -159826 sc-eQTL 4.27e-01 0.108 0.135 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 140315 sc-eQTL 5.84e-01 0.0756 0.138 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -109946 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0246 0.137 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -161056 sc-eQTL 2.27e-01 0.0892 0.0735 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -159826 sc-eQTL 2.39e-02 -0.314 0.138 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 140315 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0486 0.125 0.128 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -109946 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0697 0.127 0.128 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -161056 sc-eQTL 9.61e-01 0.00306 0.0626 0.128 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -159826 sc-eQTL 1.13e-02 0.33 0.129 0.128 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 140315 sc-eQTL 1.90e-01 0.169 0.128 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -109946 sc-eQTL 2.52e-01 0.15 0.131 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -161056 sc-eQTL 9.64e-01 0.00326 0.073 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 140315 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0159 0.103 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -109946 sc-eQTL 4.40e-02 0.259 0.128 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -161056 sc-eQTL 3.58e-02 0.107 0.0506 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 140315 sc-eQTL 9.12e-02 0.216 0.127 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -109946 sc-eQTL 1.80e-01 0.174 0.129 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -161056 sc-eQTL 5.06e-01 0.0403 0.0604 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 140315 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00185 0.113 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -109946 sc-eQTL 2.61e-02 0.281 0.125 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -161056 sc-eQTL 3.97e-01 0.0583 0.0687 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 252038 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00225 0.138 0.137 PB L2
ENSG00000079950 STX7 140315 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00547 0.116 0.137 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -109946 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0795 0.141 0.137 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -161056 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0157 0.0802 0.137 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -159826 sc-eQTL 7.66e-01 0.0449 0.15 0.137 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 521625 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0303 0.0987 0.137 PB L2
ENSG00000079950 STX7 140315 sc-eQTL 7.85e-01 -0.032 0.117 0.128 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -109946 sc-eQTL 1.40e-01 0.185 0.125 0.128 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -161056 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0217 0.0475 0.128 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -159826 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0873 0.123 0.128 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 140315 sc-eQTL 3.38e-01 0.122 0.128 0.13 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -109946 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00627 0.108 0.13 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -161056 sc-eQTL 9.42e-01 0.00349 0.0476 0.13 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -159826 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0105 0.134 0.13 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 140315 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0146 0.108 0.129 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -81252 sc-eQTL 2.33e-01 -0.127 0.107 0.129 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -60542 sc-eQTL 7.47e-02 0.224 0.125 0.129 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -109946 sc-eQTL 4.97e-01 0.0833 0.122 0.129 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -161056 sc-eQTL 2.10e-01 0.0758 0.0602 0.129 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -159826 sc-eQTL 4.87e-01 0.0834 0.12 0.129 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -449615 sc-eQTL 3.34e-01 0.0925 0.0955 0.129 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 140315 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0611 0.0819 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -81252 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0467 0.116 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -60542 sc-eQTL 6.92e-02 0.212 0.116 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -109946 sc-eQTL 9.54e-02 0.156 0.0929 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -161056 sc-eQTL 7.90e-01 0.0138 0.0519 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -159826 sc-eQTL 9.91e-03 0.257 0.0986 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 140315 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0849 0.0883 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -81252 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0213 0.111 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -60542 sc-eQTL 6.61e-01 0.0527 0.12 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -109946 sc-eQTL 6.24e-02 0.146 0.078 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -161056 sc-eQTL 5.85e-01 0.031 0.0566 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -159826 sc-eQTL 2.15e-01 -0.13 0.104 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 140315 sc-eQTL 6.61e-01 -0.063 0.143 0.13 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -109946 sc-eQTL 4.47e-01 0.12 0.158 0.13 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -161056 sc-eQTL 9.41e-01 0.00447 0.0603 0.13 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -159826 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0191 0.156 0.13 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 140315 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0948 0.118 0.133 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -81252 sc-eQTL 9.66e-02 -0.197 0.118 0.133 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -60542 sc-eQTL 8.32e-02 0.203 0.117 0.133 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -109946 sc-eQTL 3.78e-01 0.105 0.119 0.133 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -161056 sc-eQTL 9.60e-01 0.00264 0.0521 0.133 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -159826 sc-eQTL 8.65e-01 0.0215 0.127 0.133 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 140315 sc-eQTL 4.34e-02 -0.182 0.0896 0.133 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -81252 sc-eQTL 1.44e-01 -0.186 0.127 0.133 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -60542 sc-eQTL 3.59e-03 0.366 0.124 0.133 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -109946 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00641 0.122 0.133 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -161056 sc-eQTL 3.71e-01 0.0547 0.061 0.133 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -159826 sc-eQTL 2.58e-01 -0.122 0.108 0.133 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 140315 sc-eQTL 4.66e-01 -0.079 0.108 0.119 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -81252 sc-eQTL 5.20e-01 0.0701 0.109 0.119 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -60542 sc-eQTL 8.45e-01 0.0217 0.111 0.119 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -109946 sc-eQTL 3.49e-03 0.381 0.128 0.119 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -161056 sc-eQTL 4.92e-03 -0.253 0.0886 0.119 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -159826 sc-eQTL 9.42e-01 0.00982 0.135 0.119 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -449615 sc-eQTL 5.98e-01 0.0679 0.129 0.119 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 252038 sc-eQTL 3.86e-01 0.11 0.127 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 140315 sc-eQTL 6.78e-01 0.03 0.0722 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -109946 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0289 0.114 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -161056 sc-eQTL 8.21e-01 0.0148 0.0651 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -159826 sc-eQTL 3.15e-01 0.12 0.119 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 521625 sc-eQTL 8.24e-01 0.0257 0.115 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 252038 sc-eQTL 9.59e-02 0.224 0.134 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 140315 sc-eQTL 3.99e-01 0.0467 0.0553 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -109946 sc-eQTL 4.07e-01 0.0893 0.107 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -161056 sc-eQTL 3.61e-01 0.0595 0.065 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -159826 sc-eQTL 1.19e-02 0.307 0.121 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 521625 sc-eQTL 2.03e-01 0.0992 0.0777 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 140315 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0706 0.0684 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -81252 sc-eQTL 8.72e-01 -0.018 0.112 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -60542 sc-eQTL 1.64e-01 0.162 0.116 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -109946 sc-eQTL 6.74e-02 0.141 0.0765 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -161056 sc-eQTL 6.39e-01 0.0248 0.0528 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -159826 sc-eQTL 1.53e-01 0.134 0.0936 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 140315 sc-eQTL 4.38e-02 -0.17 0.0836 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -81252 sc-eQTL 1.98e-02 -0.288 0.123 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -60542 sc-eQTL 4.52e-02 0.245 0.122 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -109946 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0104 0.116 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -161056 sc-eQTL 2.79e-01 0.0533 0.0491 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -159826 sc-eQTL 4.17e-01 0.0969 0.119 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 140315 sc-eQTL 6.16e-01 0.0487 0.0971 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -109946 sc-eQTL 9.10e-03 0.318 0.121 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -161056 sc-eQTL 1.26e-01 0.0766 0.0499 0.129 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000093134 VNN3 -81252 eQTL 0.000348 0.0755 0.021 0.0 0.0 0.135
ENSG00000112299 VNN1 -60542 eQTL 0.00731 0.0844 0.0314 0.0 0.0 0.135
ENSG00000112306 RPS12 -161056 eQTL 0.0244 0.0197 0.00873 0.00123 0.0 0.135
ENSG00000146409 SLC18B1 -159826 eQTL 0.00124 0.104 0.0322 0.0 0.0 0.135
ENSG00000234484 AL032821.1 -99162 eQTL 2.22e-06 -0.213 0.0446 0.0 0.0 0.135


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000093134 VNN3 -81252 5.53e-06 6.7e-06 6.38e-07 3.49e-06 1.67e-06 1.55e-06 8.17e-06 1.25e-06 4.6e-06 3.05e-06 7.76e-06 2.82e-06 9.82e-06 2.19e-06 9.51e-07 3.99e-06 2.73e-06 3.87e-06 1.58e-06 1.58e-06 2.8e-06 5.77e-06 4.66e-06 1.96e-06 9e-06 2.16e-06 2.65e-06 1.73e-06 6.08e-06 6.54e-06 3.29e-06 4.61e-07 7.92e-07 2.26e-06 1.93e-06 1.32e-06 1.04e-06 5.61e-07 1.12e-06 5.94e-07 7.35e-07 8.39e-06 6.31e-07 1.52e-07 8.03e-07 1.07e-06 1.17e-06 6.58e-07 5.13e-07
ENSG00000112299 VNN1 -60542 7.7e-06 9.23e-06 1.34e-06 4.32e-06 1.94e-06 3.71e-06 9.57e-06 1.5e-06 6.61e-06 4.38e-06 1.04e-05 4.64e-06 1.2e-05 3.87e-06 2e-06 5.69e-06 3.8e-06 4.84e-06 2.56e-06 2.59e-06 4.25e-06 7.6e-06 6.71e-06 2.85e-06 1.21e-05 2.84e-06 4.22e-06 3.14e-06 8.02e-06 7.83e-06 4.49e-06 7.78e-07 9.77e-07 2.83e-06 3.19e-06 2.07e-06 1.47e-06 1.57e-06 1.62e-06 9.64e-07 8.81e-07 1.04e-05 1.04e-06 1.64e-07 6.94e-07 1.28e-06 9.03e-07 7.13e-07 5.78e-07
ENSG00000146409 SLC18B1 -159826 2.7e-06 2.7e-06 3.2e-07 2.02e-06 4.53e-07 7.73e-07 2.13e-06 6.85e-07 1.89e-06 1.11e-06 2.52e-06 1.46e-06 3.64e-06 1.35e-06 9.23e-07 1.54e-06 1.22e-06 2.24e-06 1.13e-06 1.31e-06 1.15e-06 3.02e-06 2.42e-06 1.01e-06 3.74e-06 1.33e-06 1.31e-06 1.8e-06 2.45e-06 1.98e-06 1.86e-06 3.1e-07 5.66e-07 1.22e-06 1.31e-06 9.27e-07 7.94e-07 4.4e-07 1.13e-06 3.96e-07 2.11e-07 3.37e-06 5.13e-07 2.06e-07 2.97e-07 3.11e-07 6.43e-07 2.45e-07 1.89e-07
ENSG00000234484 AL032821.1 -99162 4.53e-06 5.15e-06 8.15e-07 3.05e-06 1.53e-06 1.58e-06 5.49e-06 9.79e-07 5.26e-06 2.44e-06 5.78e-06 3.34e-06 7.51e-06 1.94e-06 1.33e-06 3.71e-06 1.87e-06 3.51e-06 1.57e-06 1.19e-06 3.1e-06 4.9e-06 4.64e-06 1.35e-06 7.21e-06 1.95e-06 2.49e-06 1.77e-06 4.44e-06 4.34e-06 2.89e-06 5.06e-07 5.23e-07 1.57e-06 2.09e-06 1.18e-06 9.81e-07 4.57e-07 8.6e-07 4.56e-07 5.19e-07 6.1e-06 4.01e-07 1.63e-07 5.79e-07 9.32e-07 9.78e-07 5.05e-07 3.9e-07