Genes within 1Mb (chr6:132646598:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 245123 sc-eQTL 5.54e-01 0.0819 0.138 0.12 B L1
ENSG00000079950 STX7 133400 sc-eQTL 1.10e-01 -0.0831 0.0518 0.12 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -116861 sc-eQTL 6.26e-01 0.0478 0.0979 0.12 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -167971 sc-eQTL 6.00e-02 -0.111 0.0587 0.12 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -166741 sc-eQTL 4.33e-01 0.0977 0.124 0.12 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 514710 sc-eQTL 1.06e-01 -0.132 0.0813 0.12 B L1
ENSG00000079950 STX7 133400 sc-eQTL 5.99e-01 0.0533 0.101 0.12 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -116861 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0659 0.0876 0.12 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -167971 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00544 0.0597 0.12 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -166741 sc-eQTL 6.61e-01 0.053 0.121 0.12 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 133400 sc-eQTL 8.43e-01 0.0198 0.1 0.12 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -116861 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0556 0.117 0.12 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -167971 sc-eQTL 8.85e-01 0.00578 0.0399 0.12 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -166741 sc-eQTL 3.85e-01 0.105 0.121 0.12 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 133400 sc-eQTL 2.00e-02 0.213 0.0907 0.117 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -88167 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0725 0.114 0.117 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -67457 sc-eQTL 3.62e-01 -0.112 0.123 0.117 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -116861 sc-eQTL 6.47e-01 0.0604 0.132 0.117 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -167971 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00282 0.0738 0.117 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -166741 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0891 0.117 0.117 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -456530 sc-eQTL 6.47e-02 -0.196 0.105 0.117 DC L1
ENSG00000079950 STX7 133400 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0348 0.0683 0.12 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -88167 sc-eQTL 6.64e-01 -0.051 0.117 0.12 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -67457 sc-eQTL 1.70e-03 -0.392 0.123 0.12 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -116861 sc-eQTL 3.47e-01 0.0837 0.0888 0.12 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -167971 sc-eQTL 2.89e-01 0.0566 0.0532 0.12 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -166741 sc-eQTL 8.59e-01 0.0188 0.106 0.12 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 133400 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0848 0.103 0.12 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -116861 sc-eQTL 6.90e-01 0.051 0.128 0.12 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -167971 sc-eQTL 8.46e-02 -0.0911 0.0526 0.12 NK L1
ENSG00000079950 STX7 133400 sc-eQTL 9.86e-01 0.00179 0.104 0.12 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -116861 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0891 0.126 0.12 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -167971 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0301 0.0498 0.12 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -166741 sc-eQTL 7.32e-01 0.0469 0.136 0.12 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 245123 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0196 0.145 0.112 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 133400 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0214 0.136 0.112 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -116861 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0215 0.145 0.112 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -167971 sc-eQTL 9.06e-01 0.00923 0.0778 0.112 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -166741 sc-eQTL 7.53e-01 0.043 0.136 0.112 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 514710 sc-eQTL 9.07e-01 0.0153 0.13 0.112 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 245123 sc-eQTL 8.86e-01 0.0181 0.126 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 133400 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0681 0.0825 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -116861 sc-eQTL 2.22e-01 0.152 0.124 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -167971 sc-eQTL 6.80e-02 -0.139 0.0756 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -166741 sc-eQTL 2.52e-01 0.157 0.137 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 514710 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0312 0.117 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 245123 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0572 0.13 0.121 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 133400 sc-eQTL 2.91e-01 -0.108 0.102 0.121 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -116861 sc-eQTL 3.54e-02 0.279 0.132 0.121 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -167971 sc-eQTL 1.71e-01 -0.0879 0.064 0.121 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -166741 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0435 0.134 0.121 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 514710 sc-eQTL 4.96e-01 -0.085 0.125 0.121 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 245123 sc-eQTL 8.86e-01 0.0205 0.143 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 133400 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0585 0.0623 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -116861 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0101 0.121 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -167971 sc-eQTL 1.48e-01 -0.0999 0.0687 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -166741 sc-eQTL 7.96e-01 0.0345 0.133 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 514710 sc-eQTL 1.30e-01 -0.133 0.0878 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 245123 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0436 0.134 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 133400 sc-eQTL 1.15e-02 -0.184 0.0721 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -116861 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000473 0.134 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -167971 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0368 0.0711 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -166741 sc-eQTL 8.91e-01 0.0186 0.136 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 514710 sc-eQTL 1.82e-01 -0.125 0.0937 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 133400 sc-eQTL 9.73e-01 0.00498 0.148 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -116861 sc-eQTL 2.36e-01 0.177 0.149 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -167971 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0409 0.0691 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -166741 sc-eQTL 4.53e-01 -0.105 0.139 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 133400 sc-eQTL 8.61e-01 0.0195 0.111 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -116861 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0634 0.103 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -167971 sc-eQTL 5.66e-01 0.0385 0.067 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -166741 sc-eQTL 8.40e-01 0.026 0.129 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 133400 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0553 0.121 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -116861 sc-eQTL 9.73e-02 -0.197 0.118 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -167971 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0249 0.0618 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -166741 sc-eQTL 6.28e-01 0.0693 0.143 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 133400 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0228 0.141 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -116861 sc-eQTL 6.14e-01 0.0686 0.136 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -167971 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0298 0.0556 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -166741 sc-eQTL 3.82e-02 0.286 0.137 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 133400 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0152 0.113 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -116861 sc-eQTL 4.60e-01 0.0948 0.128 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -167971 sc-eQTL 8.51e-01 0.0129 0.0686 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -166741 sc-eQTL 5.48e-01 0.0798 0.133 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 133400 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0296 0.144 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -116861 sc-eQTL 2.63e-01 -0.139 0.124 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -167971 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0735 0.0708 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -166741 sc-eQTL 2.22e-01 0.174 0.142 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 133400 sc-eQTL 3.34e-01 0.138 0.142 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -116861 sc-eQTL 1.41e-01 -0.208 0.141 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -167971 sc-eQTL 7.21e-01 0.0247 0.0689 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -166741 sc-eQTL 2.83e-01 0.162 0.151 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 133400 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0614 0.151 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -116861 sc-eQTL 2.20e-01 0.184 0.149 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -167971 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0352 0.0806 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -166741 sc-eQTL 5.07e-01 -0.101 0.152 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 133400 sc-eQTL 9.23e-01 0.013 0.135 0.115 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -116861 sc-eQTL 1.30e-01 0.207 0.136 0.115 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -167971 sc-eQTL 6.06e-01 0.0348 0.0673 0.115 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -166741 sc-eQTL 1.62e-01 0.197 0.141 0.115 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 133400 sc-eQTL 3.66e-01 -0.126 0.139 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -116861 sc-eQTL 8.65e-01 0.0241 0.141 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -167971 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0716 0.0787 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 133400 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0389 0.11 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -116861 sc-eQTL 5.95e-01 0.0729 0.137 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -167971 sc-eQTL 1.14e-01 -0.0859 0.0541 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 133400 sc-eQTL 2.63e-02 -0.3 0.134 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -116861 sc-eQTL 7.60e-01 0.042 0.137 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -167971 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0266 0.064 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 133400 sc-eQTL 2.10e-01 -0.148 0.118 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -116861 sc-eQTL 8.40e-01 0.027 0.133 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -167971 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0711 0.0722 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 245123 sc-eQTL 4.86e-01 0.101 0.145 0.133 PB L2
ENSG00000079950 STX7 133400 sc-eQTL 5.62e-01 0.0704 0.121 0.133 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -116861 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0476 0.148 0.133 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -167971 sc-eQTL 4.94e-01 0.0576 0.0839 0.133 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -166741 sc-eQTL 4.07e-01 0.131 0.157 0.133 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 514710 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0243 0.104 0.133 PB L2
ENSG00000079950 STX7 133400 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0707 0.123 0.122 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -116861 sc-eQTL 2.41e-01 -0.155 0.132 0.122 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -167971 sc-eQTL 9.00e-01 -0.00627 0.05 0.122 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -166741 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0234 0.129 0.122 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 133400 sc-eQTL 2.02e-01 0.169 0.132 0.12 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -116861 sc-eQTL 3.44e-01 -0.106 0.112 0.12 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -167971 sc-eQTL 8.72e-01 -0.008 0.0495 0.12 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -166741 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0337 0.14 0.12 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 133400 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0378 0.115 0.124 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -88167 sc-eQTL 3.65e-01 -0.104 0.114 0.124 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -67457 sc-eQTL 2.82e-01 -0.145 0.134 0.124 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -116861 sc-eQTL 8.65e-01 0.0222 0.131 0.124 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -167971 sc-eQTL 8.88e-01 -0.00916 0.0648 0.124 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -166741 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0113 0.128 0.124 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -456530 sc-eQTL 9.76e-02 -0.169 0.102 0.124 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 133400 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0283 0.0876 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -88167 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0317 0.124 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -67457 sc-eQTL 3.12e-02 -0.268 0.124 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -116861 sc-eQTL 1.99e-01 0.128 0.0995 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -167971 sc-eQTL 1.14e-01 0.0875 0.0551 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -166741 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0494 0.107 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 133400 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0536 0.0952 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -88167 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0128 0.119 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -67457 sc-eQTL 6.11e-03 -0.352 0.127 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -116861 sc-eQTL 3.08e-01 0.0863 0.0844 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -167971 sc-eQTL 5.73e-01 0.0344 0.0609 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -166741 sc-eQTL 9.21e-01 0.0112 0.113 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 133400 sc-eQTL 3.00e-01 -0.168 0.161 0.118 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -116861 sc-eQTL 6.60e-02 -0.328 0.177 0.118 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -167971 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0582 0.0681 0.118 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -166741 sc-eQTL 3.86e-01 -0.153 0.176 0.118 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 133400 sc-eQTL 6.08e-01 0.0658 0.128 0.12 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -88167 sc-eQTL 6.74e-01 0.0543 0.129 0.12 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -67457 sc-eQTL 2.48e-01 -0.147 0.127 0.12 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -116861 sc-eQTL 6.14e-02 0.242 0.129 0.12 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -167971 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0126 0.0565 0.12 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -166741 sc-eQTL 2.78e-01 -0.149 0.137 0.12 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 133400 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0527 0.0948 0.12 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -88167 sc-eQTL 5.86e-01 0.0729 0.134 0.12 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -67457 sc-eQTL 1.49e-01 -0.191 0.132 0.12 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -116861 sc-eQTL 1.48e-02 0.309 0.126 0.12 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -167971 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0186 0.0641 0.12 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -166741 sc-eQTL 1.53e-01 0.161 0.113 0.12 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 133400 sc-eQTL 9.98e-02 0.176 0.106 0.127 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -88167 sc-eQTL 5.49e-01 0.0646 0.108 0.127 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -67457 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0643 0.11 0.127 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -116861 sc-eQTL 4.38e-01 -0.101 0.13 0.127 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -167971 sc-eQTL 8.69e-01 0.0149 0.09 0.127 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -166741 sc-eQTL 3.01e-01 -0.138 0.133 0.127 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -456530 sc-eQTL 4.22e-01 -0.102 0.127 0.127 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 245123 sc-eQTL 4.49e-01 0.102 0.135 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 133400 sc-eQTL 1.87e-01 -0.101 0.0763 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -116861 sc-eQTL 7.47e-02 0.215 0.12 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -167971 sc-eQTL 2.71e-02 -0.152 0.0682 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -166741 sc-eQTL 2.81e-01 0.137 0.126 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 514710 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0781 0.122 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 245123 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0345 0.143 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 133400 sc-eQTL 7.01e-02 -0.106 0.0584 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -116861 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00911 0.114 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -167971 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0826 0.0689 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -166741 sc-eQTL 9.00e-01 0.0164 0.13 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 514710 sc-eQTL 9.79e-02 -0.137 0.0823 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 133400 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0484 0.0738 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -88167 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0714 0.12 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -67457 sc-eQTL 2.37e-03 -0.378 0.123 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -116861 sc-eQTL 4.46e-01 0.0632 0.0829 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -167971 sc-eQTL 2.60e-01 0.0641 0.0567 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -166741 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000396 0.101 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 133400 sc-eQTL 9.46e-01 0.0061 0.0896 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -88167 sc-eQTL 9.44e-01 0.00923 0.132 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -67457 sc-eQTL 1.12e-01 -0.207 0.13 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -116861 sc-eQTL 3.37e-02 0.26 0.122 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -167971 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0259 0.0522 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -166741 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0413 0.127 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 133400 sc-eQTL 3.63e-01 -0.094 0.103 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -116861 sc-eQTL 5.94e-01 0.0697 0.131 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -167971 sc-eQTL 1.46e-01 -0.0775 0.0531 0.121 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000093134 VNN3 -88167 eQTL 0.0103 0.0606 0.0236 0.0 0.0 0.101
ENSG00000112299 VNN1 -67457 eQTL 2.05e-07 -0.182 0.0347 0.0 0.0 0.101
ENSG00000112303 VNN2 -116861 pQTL 0.0011 0.127 0.0387 0.0 0.0 0.106
ENSG00000112303 VNN2 -116861 eQTL 0.0215 0.0482 0.0209 0.0 0.0 0.101
ENSG00000234484 AL032821.1 -106077 eQTL 0.000236 -0.185 0.0501 0.0 0.0 0.101


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000093134 VNN3 -88167 5.46e-06 5.58e-06 6.57e-07 3.41e-06 1.54e-06 1.57e-06 7.6e-06 1.17e-06 4.95e-06 2.81e-06 6.99e-06 3.27e-06 9.48e-06 1.91e-06 1.04e-06 3.9e-06 2.24e-06 3.93e-06 1.5e-06 1.58e-06 2.71e-06 5.42e-06 4.69e-06 2.03e-06 8.97e-06 2.06e-06 2.27e-06 1.74e-06 5.8e-06 7.09e-06 2.59e-06 4.15e-07 7.88e-07 2.5e-06 2.03e-06 1.53e-06 1.04e-06 4.99e-07 1.24e-06 6.99e-07 8.05e-07 7.87e-06 4.37e-07 1.54e-07 6.96e-07 1.16e-06 1.16e-06 6.71e-07 6.17e-07
ENSG00000112299 VNN1 -67457 6.95e-06 8.04e-06 1.35e-06 4.03e-06 1.96e-06 3.11e-06 9.73e-06 1.3e-06 5.25e-06 3.8e-06 8.91e-06 3.84e-06 1.14e-05 3.47e-06 1.52e-06 5.06e-06 3.72e-06 4.58e-06 2.28e-06 2.57e-06 3.57e-06 7.69e-06 6.46e-06 2.82e-06 1.09e-05 2.66e-06 3.62e-06 2.43e-06 7.52e-06 7.92e-06 3.88e-06 5.87e-07 9.66e-07 2.93e-06 2.59e-06 2.13e-06 1.56e-06 1.35e-06 1.64e-06 9.98e-07 1.03e-06 8.98e-06 8.18e-07 1.73e-07 8.02e-07 9.69e-07 9.43e-07 7.34e-07 5.09e-07
ENSG00000112303 VNN2 -116861 4.62e-06 4.65e-06 8.92e-07 2.41e-06 1.32e-06 1.51e-06 4.29e-06 9.54e-07 4.09e-06 2.01e-06 4.86e-06 3.46e-06 7.03e-06 2.3e-06 1.44e-06 3.03e-06 2.09e-06 3.36e-06 1.43e-06 1.04e-06 2.67e-06 4.53e-06 3.82e-06 1.34e-06 5.89e-06 1.65e-06 2.41e-06 1.78e-06 4.48e-06 4.31e-06 2.28e-06 5.42e-07 5.51e-07 1.59e-06 2.01e-06 1.04e-06 9.28e-07 5.45e-07 9.23e-07 4.27e-07 5.82e-07 5.64e-06 3.78e-07 1.54e-07 5.01e-07 3.94e-07 8.71e-07 4.26e-07 3.42e-07
ENSG00000234484 AL032821.1 -106077 4.63e-06 4.86e-06 7.32e-07 2.89e-06 1.62e-06 1.74e-06 5.15e-06 9.79e-07 4.99e-06 2.42e-06 5.34e-06 3.49e-06 7.51e-06 2.22e-06 1.43e-06 3.71e-06 1.78e-06 3.81e-06 1.57e-06 1.15e-06 3.02e-06 4.85e-06 4.62e-06 1.71e-06 7.08e-06 1.95e-06 2.57e-06 1.84e-06 4.44e-06 5e-06 2.75e-06 5.58e-07 5.02e-07 1.81e-06 2.23e-06 1.16e-06 1.09e-06 4.58e-07 8.53e-07 5.04e-07 6.55e-07 5.67e-06 4.18e-07 1.69e-07 5.77e-07 6.92e-07 9.75e-07 5.21e-07 4.39e-07