logo

Genes within 1Mb (chr6:132636010:ACT:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 234535 sc-eQTL 5.54e-01 0.0819 0.138 0.12 B L1
ENSG00000079950 STX7 122812 sc-eQTL 1.10e-01 -0.0831 0.0518 0.12 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -127449 sc-eQTL 6.26e-01 0.0478 0.0979 0.12 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -178559 sc-eQTL 6.00e-02 -0.111 0.0587 0.12 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -177329 sc-eQTL 4.33e-01 0.0977 0.124 0.12 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 504122 sc-eQTL 1.06e-01 -0.132 0.0813 0.12 B L1
ENSG00000079950 STX7 122812 sc-eQTL 5.99e-01 0.0533 0.101 0.12 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -127449 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0659 0.0876 0.12 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -178559 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00544 0.0597 0.12 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -177329 sc-eQTL 6.61e-01 0.053 0.121 0.12 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 122812 sc-eQTL 8.43e-01 0.0198 0.1 0.12 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -127449 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0556 0.117 0.12 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -178559 sc-eQTL 8.85e-01 0.00578 0.0399 0.12 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -177329 sc-eQTL 3.85e-01 0.105 0.121 0.12 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 122812 sc-eQTL 2.00e-02 0.213 0.0907 0.117 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -98755 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0725 0.114 0.117 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -78045 sc-eQTL 3.62e-01 -0.112 0.123 0.117 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -127449 sc-eQTL 6.47e-01 0.0604 0.132 0.117 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -178559 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00282 0.0738 0.117 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -177329 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0891 0.117 0.117 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -467118 sc-eQTL 6.47e-02 -0.196 0.105 0.117 DC L1
ENSG00000079950 STX7 122812 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0348 0.0683 0.12 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -98755 sc-eQTL 6.64e-01 -0.051 0.117 0.12 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -78045 sc-eQTL 1.70e-03 -0.392 0.123 0.12 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -127449 sc-eQTL 3.47e-01 0.0837 0.0888 0.12 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -178559 sc-eQTL 2.89e-01 0.0566 0.0532 0.12 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -177329 sc-eQTL 8.59e-01 0.0188 0.106 0.12 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 122812 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0848 0.103 0.12 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -127449 sc-eQTL 6.90e-01 0.051 0.128 0.12 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -178559 sc-eQTL 8.46e-02 -0.0911 0.0526 0.12 NK L1
ENSG00000079950 STX7 122812 sc-eQTL 9.86e-01 0.00179 0.104 0.12 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -127449 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0891 0.126 0.12 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -178559 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0301 0.0498 0.12 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -177329 sc-eQTL 7.32e-01 0.0469 0.136 0.12 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 234535 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0196 0.145 0.112 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 122812 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0214 0.136 0.112 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -127449 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0215 0.145 0.112 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -178559 sc-eQTL 9.06e-01 0.00923 0.0778 0.112 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -177329 sc-eQTL 7.53e-01 0.043 0.136 0.112 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 504122 sc-eQTL 9.07e-01 0.0153 0.13 0.112 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 234535 sc-eQTL 8.86e-01 0.0181 0.126 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 122812 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0681 0.0825 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -127449 sc-eQTL 2.22e-01 0.152 0.124 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -178559 sc-eQTL 6.80e-02 -0.139 0.0756 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -177329 sc-eQTL 2.52e-01 0.157 0.137 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 504122 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0312 0.117 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 234535 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0572 0.13 0.121 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 122812 sc-eQTL 2.91e-01 -0.108 0.102 0.121 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -127449 sc-eQTL 3.54e-02 0.279 0.132 0.121 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -178559 sc-eQTL 1.71e-01 -0.0879 0.064 0.121 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -177329 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0435 0.134 0.121 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 504122 sc-eQTL 4.96e-01 -0.085 0.125 0.121 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 234535 sc-eQTL 8.86e-01 0.0205 0.143 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 122812 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0585 0.0623 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -127449 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0101 0.121 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -178559 sc-eQTL 1.48e-01 -0.0999 0.0687 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -177329 sc-eQTL 7.96e-01 0.0345 0.133 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 504122 sc-eQTL 1.30e-01 -0.133 0.0878 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 234535 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0436 0.134 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 122812 sc-eQTL 1.15e-02 -0.184 0.0721 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -127449 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000473 0.134 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -178559 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0368 0.0711 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -177329 sc-eQTL 8.91e-01 0.0186 0.136 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 504122 sc-eQTL 1.82e-01 -0.125 0.0937 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 122812 sc-eQTL 9.73e-01 0.00498 0.148 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -127449 sc-eQTL 2.36e-01 0.177 0.149 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -178559 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0409 0.0691 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -177329 sc-eQTL 4.53e-01 -0.105 0.139 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 122812 sc-eQTL 8.61e-01 0.0195 0.111 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -127449 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0634 0.103 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -178559 sc-eQTL 5.66e-01 0.0385 0.067 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -177329 sc-eQTL 8.40e-01 0.026 0.129 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 122812 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0553 0.121 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -127449 sc-eQTL 9.73e-02 -0.197 0.118 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -178559 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0249 0.0618 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -177329 sc-eQTL 6.28e-01 0.0693 0.143 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 122812 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0228 0.141 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -127449 sc-eQTL 6.14e-01 0.0686 0.136 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -178559 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0298 0.0556 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -177329 sc-eQTL 3.82e-02 0.286 0.137 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 122812 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0152 0.113 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -127449 sc-eQTL 4.60e-01 0.0948 0.128 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -178559 sc-eQTL 8.51e-01 0.0129 0.0686 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -177329 sc-eQTL 5.48e-01 0.0798 0.133 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 122812 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0296 0.144 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -127449 sc-eQTL 2.63e-01 -0.139 0.124 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -178559 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0735 0.0708 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -177329 sc-eQTL 2.22e-01 0.174 0.142 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 122812 sc-eQTL 3.34e-01 0.138 0.142 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -127449 sc-eQTL 1.41e-01 -0.208 0.141 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -178559 sc-eQTL 7.21e-01 0.0247 0.0689 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -177329 sc-eQTL 2.83e-01 0.162 0.151 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 122812 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0614 0.151 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -127449 sc-eQTL 2.20e-01 0.184 0.149 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -178559 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0352 0.0806 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -177329 sc-eQTL 5.07e-01 -0.101 0.152 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 122812 sc-eQTL 9.23e-01 0.013 0.135 0.115 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -127449 sc-eQTL 1.30e-01 0.207 0.136 0.115 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -178559 sc-eQTL 6.06e-01 0.0348 0.0673 0.115 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -177329 sc-eQTL 1.62e-01 0.197 0.141 0.115 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 122812 sc-eQTL 3.66e-01 -0.126 0.139 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -127449 sc-eQTL 8.65e-01 0.0241 0.141 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -178559 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0716 0.0787 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 122812 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0389 0.11 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -127449 sc-eQTL 5.95e-01 0.0729 0.137 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -178559 sc-eQTL 1.14e-01 -0.0859 0.0541 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 122812 sc-eQTL 2.63e-02 -0.3 0.134 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -127449 sc-eQTL 7.60e-01 0.042 0.137 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -178559 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0266 0.064 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 122812 sc-eQTL 2.10e-01 -0.148 0.118 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -127449 sc-eQTL 8.40e-01 0.027 0.133 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -178559 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0711 0.0722 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 234535 sc-eQTL 4.86e-01 0.101 0.145 0.133 PB L2
ENSG00000079950 STX7 122812 sc-eQTL 5.62e-01 0.0704 0.121 0.133 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -127449 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0476 0.148 0.133 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -178559 sc-eQTL 4.94e-01 0.0576 0.0839 0.133 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -177329 sc-eQTL 4.07e-01 0.131 0.157 0.133 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 504122 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0243 0.104 0.133 PB L2
ENSG00000079950 STX7 122812 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0707 0.123 0.122 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -127449 sc-eQTL 2.41e-01 -0.155 0.132 0.122 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -178559 sc-eQTL 9.00e-01 -0.00627 0.05 0.122 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -177329 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0234 0.129 0.122 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 122812 sc-eQTL 2.02e-01 0.169 0.132 0.12 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -127449 sc-eQTL 3.44e-01 -0.106 0.112 0.12 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -178559 sc-eQTL 8.72e-01 -0.008 0.0495 0.12 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -177329 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0337 0.14 0.12 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 122812 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0378 0.115 0.124 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -98755 sc-eQTL 3.65e-01 -0.104 0.114 0.124 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -78045 sc-eQTL 2.82e-01 -0.145 0.134 0.124 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -127449 sc-eQTL 8.65e-01 0.0222 0.131 0.124 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -178559 sc-eQTL 8.88e-01 -0.00916 0.0648 0.124 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -177329 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0113 0.128 0.124 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -467118 sc-eQTL 9.76e-02 -0.169 0.102 0.124 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 122812 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0283 0.0876 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -98755 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0317 0.124 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -78045 sc-eQTL 3.12e-02 -0.268 0.124 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -127449 sc-eQTL 1.99e-01 0.128 0.0995 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -178559 sc-eQTL 1.14e-01 0.0875 0.0551 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -177329 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0494 0.107 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 122812 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0536 0.0952 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -98755 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0128 0.119 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -78045 sc-eQTL 6.11e-03 -0.352 0.127 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -127449 sc-eQTL 3.08e-01 0.0863 0.0844 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -178559 sc-eQTL 5.73e-01 0.0344 0.0609 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -177329 sc-eQTL 9.21e-01 0.0112 0.113 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 122812 sc-eQTL 3.00e-01 -0.168 0.161 0.118 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -127449 sc-eQTL 6.60e-02 -0.328 0.177 0.118 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -178559 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0582 0.0681 0.118 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -177329 sc-eQTL 3.86e-01 -0.153 0.176 0.118 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 122812 sc-eQTL 6.08e-01 0.0658 0.128 0.12 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -98755 sc-eQTL 6.74e-01 0.0543 0.129 0.12 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -78045 sc-eQTL 2.48e-01 -0.147 0.127 0.12 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -127449 sc-eQTL 6.14e-02 0.242 0.129 0.12 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -178559 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0126 0.0565 0.12 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -177329 sc-eQTL 2.78e-01 -0.149 0.137 0.12 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 122812 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0527 0.0948 0.12 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -98755 sc-eQTL 5.86e-01 0.0729 0.134 0.12 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -78045 sc-eQTL 1.49e-01 -0.191 0.132 0.12 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -127449 sc-eQTL 1.48e-02 0.309 0.126 0.12 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -178559 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0186 0.0641 0.12 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -177329 sc-eQTL 1.53e-01 0.161 0.113 0.12 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 122812 sc-eQTL 9.98e-02 0.176 0.106 0.127 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -98755 sc-eQTL 5.49e-01 0.0646 0.108 0.127 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -78045 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0643 0.11 0.127 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -127449 sc-eQTL 4.38e-01 -0.101 0.13 0.127 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -178559 sc-eQTL 8.69e-01 0.0149 0.09 0.127 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -177329 sc-eQTL 3.01e-01 -0.138 0.133 0.127 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -467118 sc-eQTL 4.22e-01 -0.102 0.127 0.127 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 234535 sc-eQTL 4.49e-01 0.102 0.135 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 122812 sc-eQTL 1.87e-01 -0.101 0.0763 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -127449 sc-eQTL 7.47e-02 0.215 0.12 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -178559 sc-eQTL 2.71e-02 -0.152 0.0682 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -177329 sc-eQTL 2.81e-01 0.137 0.126 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 504122 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0781 0.122 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 234535 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0345 0.143 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 122812 sc-eQTL 7.01e-02 -0.106 0.0584 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -127449 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00911 0.114 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -178559 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0826 0.0689 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -177329 sc-eQTL 9.00e-01 0.0164 0.13 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 504122 sc-eQTL 9.79e-02 -0.137 0.0823 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 122812 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0484 0.0738 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -98755 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0714 0.12 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -78045 sc-eQTL 2.37e-03 -0.378 0.123 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -127449 sc-eQTL 4.46e-01 0.0632 0.0829 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -178559 sc-eQTL 2.60e-01 0.0641 0.0567 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -177329 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000396 0.101 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 122812 sc-eQTL 9.46e-01 0.0061 0.0896 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -98755 sc-eQTL 9.44e-01 0.00923 0.132 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -78045 sc-eQTL 1.12e-01 -0.207 0.13 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -127449 sc-eQTL 3.37e-02 0.26 0.122 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -178559 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0259 0.0522 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -177329 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0413 0.127 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 122812 sc-eQTL 3.63e-01 -0.094 0.103 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -127449 sc-eQTL 5.94e-01 0.0697 0.131 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -178559 sc-eQTL 1.46e-01 -0.0775 0.0531 0.121 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000093134 VNN3 -98755 eQTL 0.0141 0.0581 0.0236 0.0 0.0 0.101
ENSG00000112299 VNN1 -78045 eQTL 1.91e-07 -0.182 0.0348 0.0 0.0 0.101
ENSG00000112303 VNN2 -127449 pQTL 0.00138 0.124 0.0388 0.0 0.0 0.106
ENSG00000112303 VNN2 -127449 eQTL 0.0238 0.0476 0.021 0.0 0.0 0.101
ENSG00000234484 AL032821.1 -116665 eQTL 0.000315 -0.182 0.0502 0.0 0.0 0.101

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000093134 VNN3 -98755 7.05e-06 1.24e-05 3.08e-06 4.37e-06 1.56e-06 1.68e-06 1.01e-05 8.73e-07 6.04e-06 2.09e-06 1.06e-05 3.67e-06 1.14e-05 3.69e-06 3.46e-06 5.65e-06 4.59e-06 7.7e-06 1.94e-06 2.52e-06 3.42e-06 8.33e-06 4.62e-06 3.21e-06 1.25e-05 2.25e-06 3.93e-06 3.66e-06 6.12e-06 7.69e-06 3.43e-06 3.41e-07 7.31e-07 2.74e-06 1.97e-06 2.07e-06 1.79e-06 4.24e-07 1.3e-06 1.88e-07 2.29e-07 5.84e-06 2.66e-06 2.5e-07 3.29e-07 1.07e-06 1.03e-06 2.49e-07 9.51e-08
ENSG00000112299 VNN1 -78045 9.21e-06 1.58e-05 4.31e-06 6.2e-06 2.44e-06 1.95e-06 1.23e-05 1.07e-06 9.51e-06 3.34e-06 1.35e-05 5.59e-06 1.55e-05 4.65e-06 5.07e-06 6.57e-06 6.37e-06 9.83e-06 2.72e-06 2.79e-06 5.26e-06 1.1e-05 6.67e-06 3.85e-06 1.54e-05 3.36e-06 4.8e-06 4.83e-06 8.58e-06 7.97e-06 4.97e-06 4.43e-07 1.07e-06 3.24e-06 3.31e-06 2.77e-06 2.04e-06 6.18e-07 8.84e-07 3.41e-07 4.16e-07 8.07e-06 3.07e-06 3.18e-07 6.11e-07 1.61e-06 1.38e-06 2.72e-07 2.27e-07
ENSG00000112303 VNN2 -127449 4.85e-06 9.43e-06 2.65e-06 3.51e-06 1.43e-06 9.88e-07 9.06e-06 4.77e-07 4.54e-06 1.21e-06 8.87e-06 3.34e-06 9.94e-06 3.86e-06 2.07e-06 3.91e-06 3.74e-06 4.99e-06 1.5e-06 1.51e-06 2.79e-06 7.58e-06 3.42e-06 2.01e-06 9.83e-06 1.96e-06 2.33e-06 2.62e-06 4.38e-06 5.42e-06 2.81e-06 2.1e-07 7.92e-07 2.14e-06 2.27e-06 1.3e-06 1.65e-06 4.68e-07 1.11e-06 2.94e-07 2.69e-07 4.93e-06 2.21e-06 1.47e-07 2.5e-07 6.92e-07 7.28e-07 8.42e-08 6.36e-08
ENSG00000234484 AL032821.1 -116665 5.72e-06 1e-05 2.97e-06 3.88e-06 1.59e-06 1.19e-06 9.6e-06 6.05e-07 4.77e-06 1.43e-06 8.91e-06 3.37e-06 1.04e-05 3.85e-06 2.37e-06 4.41e-06 3.75e-06 5.96e-06 1.45e-06 1.63e-06 2.77e-06 7.51e-06 3.84e-06 2.18e-06 1.07e-05 2.19e-06 2.87e-06 3.1e-06 4.47e-06 6.4e-06 2.57e-06 2.62e-07 5.51e-07 2.3e-06 2.03e-06 1.61e-06 1.73e-06 4.73e-07 1.17e-06 3.34e-07 3.53e-07 5.33e-06 2.43e-06 1.9e-07 3.14e-07 1.02e-06 9.78e-07 3.75e-08 5.81e-08