logo

Genes within 1Mb (chr6:132630121:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 228646 sc-eQTL 5.54e-01 0.0819 0.138 0.12 B L1
ENSG00000079950 STX7 116923 sc-eQTL 1.10e-01 -0.0831 0.0518 0.12 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -133338 sc-eQTL 6.26e-01 0.0478 0.0979 0.12 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -184448 sc-eQTL 6.00e-02 -0.111 0.0587 0.12 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -183218 sc-eQTL 4.33e-01 0.0977 0.124 0.12 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 498233 sc-eQTL 1.06e-01 -0.132 0.0813 0.12 B L1
ENSG00000079950 STX7 116923 sc-eQTL 5.99e-01 0.0533 0.101 0.12 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -133338 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0659 0.0876 0.12 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -184448 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00544 0.0597 0.12 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -183218 sc-eQTL 6.61e-01 0.053 0.121 0.12 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 116923 sc-eQTL 8.43e-01 0.0198 0.1 0.12 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -133338 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0556 0.117 0.12 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -184448 sc-eQTL 8.85e-01 0.00578 0.0399 0.12 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -183218 sc-eQTL 3.85e-01 0.105 0.121 0.12 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 116923 sc-eQTL 2.00e-02 0.213 0.0907 0.117 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -104644 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0725 0.114 0.117 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -83934 sc-eQTL 3.62e-01 -0.112 0.123 0.117 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -133338 sc-eQTL 6.47e-01 0.0604 0.132 0.117 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -184448 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00282 0.0738 0.117 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -183218 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0891 0.117 0.117 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -473007 sc-eQTL 6.47e-02 -0.196 0.105 0.117 DC L1
ENSG00000079950 STX7 116923 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0348 0.0683 0.12 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -104644 sc-eQTL 6.64e-01 -0.051 0.117 0.12 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -83934 sc-eQTL 1.70e-03 -0.392 0.123 0.12 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -133338 sc-eQTL 3.47e-01 0.0837 0.0888 0.12 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -184448 sc-eQTL 2.89e-01 0.0566 0.0532 0.12 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -183218 sc-eQTL 8.59e-01 0.0188 0.106 0.12 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 116923 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0848 0.103 0.12 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -133338 sc-eQTL 6.90e-01 0.051 0.128 0.12 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -184448 sc-eQTL 8.46e-02 -0.0911 0.0526 0.12 NK L1
ENSG00000079950 STX7 116923 sc-eQTL 9.86e-01 0.00179 0.104 0.12 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -133338 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0891 0.126 0.12 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -184448 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0301 0.0498 0.12 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -183218 sc-eQTL 7.32e-01 0.0469 0.136 0.12 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 228646 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0196 0.145 0.112 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 116923 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0214 0.136 0.112 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -133338 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0215 0.145 0.112 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -184448 sc-eQTL 9.06e-01 0.00923 0.0778 0.112 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -183218 sc-eQTL 7.53e-01 0.043 0.136 0.112 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 498233 sc-eQTL 9.07e-01 0.0153 0.13 0.112 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 228646 sc-eQTL 8.86e-01 0.0181 0.126 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 116923 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0681 0.0825 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -133338 sc-eQTL 2.22e-01 0.152 0.124 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -184448 sc-eQTL 6.80e-02 -0.139 0.0756 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -183218 sc-eQTL 2.52e-01 0.157 0.137 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 498233 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0312 0.117 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 228646 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0572 0.13 0.121 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 116923 sc-eQTL 2.91e-01 -0.108 0.102 0.121 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -133338 sc-eQTL 3.54e-02 0.279 0.132 0.121 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -184448 sc-eQTL 1.71e-01 -0.0879 0.064 0.121 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -183218 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0435 0.134 0.121 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 498233 sc-eQTL 4.96e-01 -0.085 0.125 0.121 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 228646 sc-eQTL 8.86e-01 0.0205 0.143 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 116923 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0585 0.0623 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -133338 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0101 0.121 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -184448 sc-eQTL 1.48e-01 -0.0999 0.0687 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -183218 sc-eQTL 7.96e-01 0.0345 0.133 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 498233 sc-eQTL 1.30e-01 -0.133 0.0878 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 228646 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0436 0.134 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 116923 sc-eQTL 1.15e-02 -0.184 0.0721 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -133338 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000473 0.134 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -184448 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0368 0.0711 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -183218 sc-eQTL 8.91e-01 0.0186 0.136 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 498233 sc-eQTL 1.82e-01 -0.125 0.0937 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 116923 sc-eQTL 9.73e-01 0.00498 0.148 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -133338 sc-eQTL 2.36e-01 0.177 0.149 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -184448 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0409 0.0691 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -183218 sc-eQTL 4.53e-01 -0.105 0.139 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 116923 sc-eQTL 8.61e-01 0.0195 0.111 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -133338 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0634 0.103 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -184448 sc-eQTL 5.66e-01 0.0385 0.067 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -183218 sc-eQTL 8.40e-01 0.026 0.129 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 116923 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0553 0.121 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -133338 sc-eQTL 9.73e-02 -0.197 0.118 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -184448 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0249 0.0618 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -183218 sc-eQTL 6.28e-01 0.0693 0.143 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 116923 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0228 0.141 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -133338 sc-eQTL 6.14e-01 0.0686 0.136 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -184448 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0298 0.0556 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -183218 sc-eQTL 3.82e-02 0.286 0.137 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 116923 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0152 0.113 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -133338 sc-eQTL 4.60e-01 0.0948 0.128 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -184448 sc-eQTL 8.51e-01 0.0129 0.0686 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -183218 sc-eQTL 5.48e-01 0.0798 0.133 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 116923 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0296 0.144 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -133338 sc-eQTL 2.63e-01 -0.139 0.124 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -184448 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0735 0.0708 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -183218 sc-eQTL 2.22e-01 0.174 0.142 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 116923 sc-eQTL 3.34e-01 0.138 0.142 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -133338 sc-eQTL 1.41e-01 -0.208 0.141 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -184448 sc-eQTL 7.21e-01 0.0247 0.0689 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -183218 sc-eQTL 2.83e-01 0.162 0.151 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 116923 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0614 0.151 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -133338 sc-eQTL 2.20e-01 0.184 0.149 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -184448 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0352 0.0806 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -183218 sc-eQTL 5.07e-01 -0.101 0.152 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 116923 sc-eQTL 9.23e-01 0.013 0.135 0.115 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -133338 sc-eQTL 1.30e-01 0.207 0.136 0.115 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -184448 sc-eQTL 6.06e-01 0.0348 0.0673 0.115 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -183218 sc-eQTL 1.62e-01 0.197 0.141 0.115 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 116923 sc-eQTL 3.66e-01 -0.126 0.139 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -133338 sc-eQTL 8.65e-01 0.0241 0.141 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -184448 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0716 0.0787 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 116923 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0389 0.11 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -133338 sc-eQTL 5.95e-01 0.0729 0.137 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -184448 sc-eQTL 1.14e-01 -0.0859 0.0541 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 116923 sc-eQTL 2.63e-02 -0.3 0.134 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -133338 sc-eQTL 7.60e-01 0.042 0.137 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -184448 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0266 0.064 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 116923 sc-eQTL 2.10e-01 -0.148 0.118 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -133338 sc-eQTL 8.40e-01 0.027 0.133 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -184448 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0711 0.0722 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 228646 sc-eQTL 4.86e-01 0.101 0.145 0.133 PB L2
ENSG00000079950 STX7 116923 sc-eQTL 5.62e-01 0.0704 0.121 0.133 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -133338 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0476 0.148 0.133 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -184448 sc-eQTL 4.94e-01 0.0576 0.0839 0.133 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -183218 sc-eQTL 4.07e-01 0.131 0.157 0.133 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 498233 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0243 0.104 0.133 PB L2
ENSG00000079950 STX7 116923 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0707 0.123 0.122 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -133338 sc-eQTL 2.41e-01 -0.155 0.132 0.122 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -184448 sc-eQTL 9.00e-01 -0.00627 0.05 0.122 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -183218 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0234 0.129 0.122 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 116923 sc-eQTL 2.02e-01 0.169 0.132 0.12 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -133338 sc-eQTL 3.44e-01 -0.106 0.112 0.12 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -184448 sc-eQTL 8.72e-01 -0.008 0.0495 0.12 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -183218 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0337 0.14 0.12 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 116923 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0378 0.115 0.124 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -104644 sc-eQTL 3.65e-01 -0.104 0.114 0.124 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -83934 sc-eQTL 2.82e-01 -0.145 0.134 0.124 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -133338 sc-eQTL 8.65e-01 0.0222 0.131 0.124 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -184448 sc-eQTL 8.88e-01 -0.00916 0.0648 0.124 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -183218 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0113 0.128 0.124 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -473007 sc-eQTL 9.76e-02 -0.169 0.102 0.124 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 116923 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0283 0.0876 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -104644 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0317 0.124 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -83934 sc-eQTL 3.12e-02 -0.268 0.124 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -133338 sc-eQTL 1.99e-01 0.128 0.0995 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -184448 sc-eQTL 1.14e-01 0.0875 0.0551 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -183218 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0494 0.107 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 116923 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0536 0.0952 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -104644 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0128 0.119 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -83934 sc-eQTL 6.11e-03 -0.352 0.127 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -133338 sc-eQTL 3.08e-01 0.0863 0.0844 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -184448 sc-eQTL 5.73e-01 0.0344 0.0609 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -183218 sc-eQTL 9.21e-01 0.0112 0.113 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 116923 sc-eQTL 3.00e-01 -0.168 0.161 0.118 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -133338 sc-eQTL 6.60e-02 -0.328 0.177 0.118 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -184448 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0582 0.0681 0.118 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -183218 sc-eQTL 3.86e-01 -0.153 0.176 0.118 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 116923 sc-eQTL 6.08e-01 0.0658 0.128 0.12 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -104644 sc-eQTL 6.74e-01 0.0543 0.129 0.12 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -83934 sc-eQTL 2.48e-01 -0.147 0.127 0.12 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -133338 sc-eQTL 6.14e-02 0.242 0.129 0.12 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -184448 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0126 0.0565 0.12 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -183218 sc-eQTL 2.78e-01 -0.149 0.137 0.12 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 116923 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0527 0.0948 0.12 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -104644 sc-eQTL 5.86e-01 0.0729 0.134 0.12 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -83934 sc-eQTL 1.49e-01 -0.191 0.132 0.12 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -133338 sc-eQTL 1.48e-02 0.309 0.126 0.12 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -184448 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0186 0.0641 0.12 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -183218 sc-eQTL 1.53e-01 0.161 0.113 0.12 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 116923 sc-eQTL 9.98e-02 0.176 0.106 0.127 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -104644 sc-eQTL 5.49e-01 0.0646 0.108 0.127 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -83934 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0643 0.11 0.127 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -133338 sc-eQTL 4.38e-01 -0.101 0.13 0.127 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -184448 sc-eQTL 8.69e-01 0.0149 0.09 0.127 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -183218 sc-eQTL 3.01e-01 -0.138 0.133 0.127 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -473007 sc-eQTL 4.22e-01 -0.102 0.127 0.127 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 228646 sc-eQTL 4.49e-01 0.102 0.135 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 116923 sc-eQTL 1.87e-01 -0.101 0.0763 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -133338 sc-eQTL 7.47e-02 0.215 0.12 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -184448 sc-eQTL 2.71e-02 -0.152 0.0682 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -183218 sc-eQTL 2.81e-01 0.137 0.126 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 498233 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0781 0.122 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 228646 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0345 0.143 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 116923 sc-eQTL 7.01e-02 -0.106 0.0584 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -133338 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00911 0.114 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -184448 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0826 0.0689 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -183218 sc-eQTL 9.00e-01 0.0164 0.13 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 498233 sc-eQTL 9.79e-02 -0.137 0.0823 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 116923 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0484 0.0738 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -104644 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0714 0.12 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -83934 sc-eQTL 2.37e-03 -0.378 0.123 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -133338 sc-eQTL 4.46e-01 0.0632 0.0829 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -184448 sc-eQTL 2.60e-01 0.0641 0.0567 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -183218 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000396 0.101 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 116923 sc-eQTL 9.46e-01 0.0061 0.0896 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -104644 sc-eQTL 9.44e-01 0.00923 0.132 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -83934 sc-eQTL 1.12e-01 -0.207 0.13 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -133338 sc-eQTL 3.37e-02 0.26 0.122 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -184448 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0259 0.0522 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -183218 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0413 0.127 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 116923 sc-eQTL 3.63e-01 -0.094 0.103 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -133338 sc-eQTL 5.94e-01 0.0697 0.131 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -184448 sc-eQTL 1.46e-01 -0.0775 0.0531 0.121 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000093134 VNN3 -104644 eQTL 0.0141 0.0581 0.0236 0.0 0.0 0.101
ENSG00000112299 VNN1 -83934 eQTL 1.91e-07 -0.182 0.0348 0.0 0.0 0.101
ENSG00000112303 VNN2 -133338 pQTL 0.00138 0.124 0.0388 0.0 0.0 0.106
ENSG00000112303 VNN2 -133338 eQTL 0.0238 0.0476 0.021 0.0 0.0 0.101
ENSG00000234484 AL032821.1 -122554 eQTL 0.000315 -0.182 0.0502 0.0 0.0 0.101

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000093134 VNN3 -104644 5.07e-06 5.1e-06 6.38e-07 3.47e-06 1.47e-06 1.55e-06 6.53e-06 1.25e-06 4.84e-06 2.82e-06 6.67e-06 3.31e-06 8.41e-06 1.65e-06 9e-07 3.91e-06 2.01e-06 3.98e-06 1.56e-06 1.61e-06 2.8e-06 5.38e-06 4.77e-06 1.99e-06 8.25e-06 2.07e-06 2.55e-06 1.71e-06 5.45e-06 5.42e-06 2.68e-06 4.74e-07 7.77e-07 2.39e-06 1.9e-06 1.3e-06 1.02e-06 5.46e-07 1.2e-06 7.55e-07 8.78e-07 6.8e-06 5.62e-07 1.61e-07 7.77e-07 1.06e-06 1.04e-06 6.82e-07 5.81e-07
ENSG00000112299 VNN1 -83934 6.16e-06 7.18e-06 1.05e-06 3.88e-06 2.04e-06 2.58e-06 8.96e-06 1.43e-06 5.25e-06 3.86e-06 8.89e-06 3.63e-06 1.09e-05 3.14e-06 1.58e-06 5.06e-06 3.81e-06 3.89e-06 2.27e-06 2.52e-06 3.56e-06 7.46e-06 5.58e-06 2.76e-06 9.65e-06 2.75e-06 3.64e-06 2.51e-06 7e-06 7.88e-06 3.51e-06 6.32e-07 9.77e-07 2.93e-06 2.59e-06 2.11e-06 1.41e-06 1.32e-06 1.64e-06 1.02e-06 1e-06 8.2e-06 8.79e-07 1.35e-07 7.51e-07 1.02e-06 9.08e-07 7.2e-07 5.08e-07
ENSG00000112303 VNN2 -133338 4.2e-06 4.75e-06 8.75e-07 2.43e-06 1.64e-06 1.39e-06 3.71e-06 9.78e-07 4.53e-06 2.35e-06 4.75e-06 3.5e-06 7.71e-06 2.15e-06 1.35e-06 3.34e-06 2.06e-06 3.09e-06 1.41e-06 1.15e-06 2.98e-06 4.48e-06 3.54e-06 1.48e-06 5.16e-06 1.72e-06 2.6e-06 1.79e-06 4.21e-06 4.02e-06 2.17e-06 5.42e-07 4.68e-07 1.52e-06 2.19e-06 9.71e-07 9.46e-07 4.24e-07 9.23e-07 4.88e-07 6.91e-07 5.32e-06 3.82e-07 1.58e-07 6.1e-07 6.92e-07 1.01e-06 5.05e-07 3.6e-07
ENSG00000234484 AL032821.1 -122554 4.54e-06 4.86e-06 6.9e-07 2.73e-06 1.59e-06 1.68e-06 4.27e-06 1.09e-06 5.16e-06 2.4e-06 5.25e-06 3.49e-06 7.09e-06 2.31e-06 1.31e-06 3.85e-06 1.78e-06 3.53e-06 1.54e-06 1.15e-06 3.04e-06 4.95e-06 4.24e-06 1.57e-06 6.54e-06 1.94e-06 2.42e-06 1.75e-06 4.46e-06 4.23e-06 2.72e-06 4.19e-07 6.32e-07 1.74e-06 2.04e-06 1.17e-06 1.08e-06 4.57e-07 8.53e-07 5.75e-07 7.41e-07 5.74e-06 4.01e-07 1.56e-07 7.74e-07 1.03e-06 1.13e-06 6.9e-07 4.68e-07