Genes within 1Mb (chr6:132628579:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 227104 sc-eQTL 7.63e-01 0.0386 0.128 0.139 B L1
ENSG00000079950 STX7 115381 sc-eQTL 1.97e-01 -0.0621 0.048 0.139 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -134880 sc-eQTL 4.03e-01 0.0758 0.0905 0.139 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -185990 sc-eQTL 6.24e-02 -0.102 0.0544 0.139 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -184760 sc-eQTL 6.02e-01 0.0603 0.115 0.139 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 496691 sc-eQTL 1.25e-01 -0.116 0.0753 0.139 B L1
ENSG00000079950 STX7 115381 sc-eQTL 5.34e-01 0.0587 0.0941 0.139 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -134880 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0693 0.0814 0.139 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -185990 sc-eQTL 8.74e-01 0.00878 0.0555 0.139 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -184760 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0541 0.112 0.139 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 115381 sc-eQTL 6.06e-01 0.0483 0.0933 0.139 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -134880 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0673 0.109 0.139 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -185990 sc-eQTL 5.90e-01 0.0201 0.0372 0.139 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -184760 sc-eQTL 7.71e-01 0.0328 0.113 0.139 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 115381 sc-eQTL 1.25e-01 0.133 0.0863 0.135 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -106186 sc-eQTL 2.69e-01 -0.119 0.107 0.135 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -85476 sc-eQTL 1.46e-01 -0.169 0.116 0.135 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -134880 sc-eQTL 6.25e-01 0.0608 0.124 0.135 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -185990 sc-eQTL 8.99e-01 -0.00889 0.0697 0.135 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -184760 sc-eQTL 2.63e-01 -0.123 0.11 0.135 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -474549 sc-eQTL 1.28e-02 -0.248 0.0988 0.135 DC L1
ENSG00000079950 STX7 115381 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0751 0.0626 0.139 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -106186 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0948 0.108 0.139 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -85476 sc-eQTL 1.09e-03 -0.375 0.113 0.139 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -134880 sc-eQTL 4.05e-01 0.0683 0.0818 0.139 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -185990 sc-eQTL 7.15e-01 0.018 0.0491 0.139 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -184760 sc-eQTL 9.72e-01 0.00337 0.0971 0.139 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 115381 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0948 0.0956 0.139 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -134880 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00127 0.119 0.139 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -185990 sc-eQTL 1.50e-01 -0.0709 0.0491 0.139 NK L1
ENSG00000079950 STX7 115381 sc-eQTL 9.11e-01 0.0108 0.0967 0.139 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -134880 sc-eQTL 1.26e-01 -0.178 0.116 0.139 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -185990 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0267 0.0463 0.139 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -184760 sc-eQTL 9.25e-01 -0.012 0.127 0.139 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 227104 sc-eQTL 5.76e-01 0.0751 0.134 0.13 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 115381 sc-eQTL 4.21e-01 -0.101 0.125 0.13 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -134880 sc-eQTL 5.23e-01 0.0854 0.134 0.13 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -185990 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0051 0.0717 0.13 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -184760 sc-eQTL 5.49e-01 0.0753 0.125 0.13 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 496691 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0275 0.12 0.13 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 227104 sc-eQTL 9.81e-01 -0.0028 0.118 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 115381 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0401 0.0771 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -134880 sc-eQTL 3.29e-01 0.113 0.116 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -185990 sc-eQTL 7.91e-02 -0.125 0.0706 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -184760 sc-eQTL 1.29e-01 0.194 0.127 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 496691 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00119 0.109 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 227104 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0841 0.12 0.14 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 115381 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0535 0.0945 0.14 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -134880 sc-eQTL 5.95e-02 0.232 0.123 0.14 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -185990 sc-eQTL 1.61e-01 -0.0835 0.0593 0.14 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -184760 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0701 0.124 0.14 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 496691 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0896 0.116 0.14 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 227104 sc-eQTL 9.77e-01 0.0038 0.133 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 115381 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0206 0.0581 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -134880 sc-eQTL 3.91e-01 0.0969 0.113 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -185990 sc-eQTL 8.00e-02 -0.112 0.0638 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -184760 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0208 0.124 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 496691 sc-eQTL 2.57e-01 -0.093 0.0819 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 227104 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0695 0.125 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 115381 sc-eQTL 6.14e-02 -0.127 0.0678 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -134880 sc-eQTL 9.47e-01 0.00828 0.125 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -185990 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0633 0.0663 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -184760 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0245 0.127 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 496691 sc-eQTL 1.36e-01 -0.131 0.0874 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 115381 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0202 0.136 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -134880 sc-eQTL 4.44e-01 0.105 0.137 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -185990 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0351 0.0632 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -184760 sc-eQTL 1.59e-01 -0.179 0.127 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 115381 sc-eQTL 9.27e-01 0.00949 0.103 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -134880 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0684 0.0952 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -185990 sc-eQTL 5.62e-01 0.0358 0.0618 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -184760 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0816 0.119 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 115381 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00467 0.112 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -134880 sc-eQTL 1.48e-01 -0.159 0.11 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -185990 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00187 0.0572 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -184760 sc-eQTL 9.51e-01 0.00822 0.132 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 115381 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00888 0.13 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -134880 sc-eQTL 5.72e-01 0.0708 0.125 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -185990 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0211 0.0513 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -184760 sc-eQTL 8.58e-02 0.219 0.127 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 115381 sc-eQTL 6.38e-01 0.0498 0.105 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -134880 sc-eQTL 9.19e-01 0.0122 0.12 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -185990 sc-eQTL 5.47e-01 0.0387 0.0641 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -184760 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0138 0.124 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 115381 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0241 0.133 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -134880 sc-eQTL 1.71e-01 -0.157 0.114 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -185990 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0397 0.0658 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -184760 sc-eQTL 4.33e-01 0.104 0.132 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 115381 sc-eQTL 2.62e-01 0.147 0.131 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -134880 sc-eQTL 2.68e-01 -0.145 0.13 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -185990 sc-eQTL 4.16e-01 0.0519 0.0636 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -184760 sc-eQTL 4.22e-01 0.112 0.139 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 115381 sc-eQTL 4.60e-01 -0.103 0.139 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -134880 sc-eQTL 3.49e-01 0.13 0.138 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -185990 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0495 0.0744 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -184760 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0637 0.141 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 115381 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0101 0.124 0.134 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -134880 sc-eQTL 3.90e-01 0.109 0.126 0.134 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -185990 sc-eQTL 7.83e-01 0.0172 0.0622 0.134 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -184760 sc-eQTL 4.38e-01 0.101 0.13 0.134 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 115381 sc-eQTL 2.12e-01 -0.16 0.128 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -134880 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0245 0.131 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -185990 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0774 0.0725 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 115381 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0665 0.102 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -134880 sc-eQTL 7.53e-01 0.0402 0.127 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -185990 sc-eQTL 1.46e-01 -0.0735 0.0503 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 115381 sc-eQTL 1.19e-01 -0.196 0.125 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -134880 sc-eQTL 9.17e-01 0.0133 0.128 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -185990 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00323 0.0594 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 115381 sc-eQTL 2.00e-01 -0.141 0.11 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -134880 sc-eQTL 8.89e-01 0.0173 0.124 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -185990 sc-eQTL 5.23e-01 -0.043 0.0672 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 227104 sc-eQTL 6.13e-01 0.0713 0.141 0.152 PB L2
ENSG00000079950 STX7 115381 sc-eQTL 8.87e-01 0.0168 0.117 0.152 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -134880 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0511 0.143 0.152 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -185990 sc-eQTL 2.86e-01 0.087 0.0811 0.152 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -184760 sc-eQTL 6.75e-01 0.0641 0.153 0.152 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 496691 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00557 0.1 0.152 PB L2
ENSG00000079950 STX7 115381 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0273 0.116 0.141 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -134880 sc-eQTL 1.20e-01 -0.192 0.123 0.141 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -185990 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00335 0.0469 0.141 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -184760 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0999 0.121 0.141 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 115381 sc-eQTL 3.95e-01 0.105 0.123 0.139 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -134880 sc-eQTL 2.84e-01 -0.111 0.104 0.139 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -185990 sc-eQTL 6.75e-01 0.0193 0.0459 0.139 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -184760 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0204 0.13 0.139 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 115381 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0954 0.109 0.141 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -106186 sc-eQTL 1.62e-01 -0.152 0.108 0.141 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -85476 sc-eQTL 1.16e-01 -0.2 0.127 0.141 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -134880 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0307 0.124 0.141 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -185990 sc-eQTL 9.88e-01 0.000895 0.0613 0.141 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -184760 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0465 0.121 0.141 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -474549 sc-eQTL 6.44e-02 -0.179 0.0962 0.141 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 115381 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0528 0.081 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -106186 sc-eQTL 3.28e-01 -0.112 0.114 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -85476 sc-eQTL 1.38e-02 -0.283 0.114 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -134880 sc-eQTL 3.33e-01 0.0895 0.0922 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -185990 sc-eQTL 4.08e-01 0.0425 0.0513 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -184760 sc-eQTL 2.63e-01 -0.111 0.0987 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 115381 sc-eQTL 9.16e-02 -0.148 0.0874 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -106186 sc-eQTL 9.92e-01 0.00105 0.11 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -85476 sc-eQTL 3.45e-03 -0.346 0.117 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -134880 sc-eQTL 5.73e-01 0.044 0.0781 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -185990 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0112 0.0563 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -184760 sc-eQTL 5.57e-01 0.0613 0.104 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 115381 sc-eQTL 4.10e-01 -0.121 0.147 0.139 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -134880 sc-eQTL 2.63e-02 -0.359 0.16 0.139 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -185990 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0309 0.0619 0.139 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -184760 sc-eQTL 4.62e-01 -0.118 0.16 0.139 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 115381 sc-eQTL 8.36e-01 0.0247 0.119 0.138 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -106186 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0285 0.12 0.138 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -85476 sc-eQTL 1.01e-01 -0.194 0.118 0.138 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -134880 sc-eQTL 1.82e-01 0.161 0.12 0.138 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -185990 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0339 0.0524 0.138 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -184760 sc-eQTL 3.78e-01 -0.113 0.127 0.138 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 115381 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0417 0.0883 0.138 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -106186 sc-eQTL 6.82e-01 0.0511 0.125 0.138 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -85476 sc-eQTL 6.88e-02 -0.225 0.123 0.138 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -134880 sc-eQTL 2.87e-02 0.259 0.118 0.138 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -185990 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0224 0.0597 0.138 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -184760 sc-eQTL 1.04e-01 0.171 0.105 0.138 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 115381 sc-eQTL 2.03e-01 0.127 0.0996 0.147 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -106186 sc-eQTL 7.40e-01 0.0335 0.101 0.147 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -85476 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0877 0.102 0.147 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -134880 sc-eQTL 9.22e-01 -0.012 0.122 0.147 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -185990 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0196 0.0841 0.147 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -184760 sc-eQTL 1.92e-01 -0.162 0.124 0.147 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -474549 sc-eQTL 1.95e-01 -0.154 0.118 0.147 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 227104 sc-eQTL 5.73e-01 0.0707 0.125 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 115381 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0695 0.0709 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -134880 sc-eQTL 1.23e-01 0.173 0.112 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -185990 sc-eQTL 2.95e-02 -0.139 0.0633 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -184760 sc-eQTL 2.11e-01 0.147 0.117 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 496691 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0895 0.113 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 227104 sc-eQTL 6.80e-01 -0.055 0.133 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 115381 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0593 0.0545 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -134880 sc-eQTL 5.25e-01 0.0674 0.106 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -185990 sc-eQTL 1.25e-01 -0.0985 0.0638 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -184760 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0336 0.121 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 496691 sc-eQTL 1.11e-01 -0.122 0.0765 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 115381 sc-eQTL 1.32e-01 -0.102 0.0675 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -106186 sc-eQTL 3.12e-01 -0.112 0.11 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -85476 sc-eQTL 1.58e-03 -0.361 0.113 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -134880 sc-eQTL 5.04e-01 0.0511 0.0762 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -185990 sc-eQTL 6.94e-01 0.0206 0.0523 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -184760 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0294 0.0931 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 115381 sc-eQTL 9.10e-01 -0.00942 0.0831 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -106186 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0298 0.122 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -85476 sc-eQTL 6.41e-02 -0.224 0.12 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -134880 sc-eQTL 7.15e-02 0.205 0.113 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -185990 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0337 0.0484 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -184760 sc-eQTL 9.50e-01 0.00733 0.118 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 115381 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0998 0.096 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -134880 sc-eQTL 8.63e-01 0.021 0.122 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -185990 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0571 0.0496 0.14 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 -85476 eQTL 5.72e-07 -0.158 0.0314 0.0 0.0 0.13
ENSG00000112303 VNN2 -134880 pQTL 0.00365 0.104 0.0356 0.0 0.0 0.132
ENSG00000234484 AL032821.1 -124096 eQTL 0.00507 -0.127 0.0454 0.0 0.0 0.13


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112299 VNN1 -85476 5.68e-06 6.14e-06 9.68e-07 3.49e-06 1.98e-06 1.93e-06 8.67e-06 1.36e-06 4.81e-06 3.4e-06 8.06e-06 2.94e-06 1.02e-05 2.39e-06 1.3e-06 4.63e-06 3.09e-06 3.68e-06 2.2e-06 2.41e-06 3.42e-06 6.89e-06 5.31e-06 2.6e-06 9e-06 2.46e-06 3.51e-06 2.36e-06 6.87e-06 7.66e-06 3.25e-06 5.91e-07 1.05e-06 2.78e-06 2.35e-06 2.11e-06 1.36e-06 1.25e-06 1.4e-06 9.87e-07 9.92e-07 8.22e-06 6.7e-07 1.35e-07 7.18e-07 9.76e-07 9.16e-07 7.13e-07 4.77e-07
ENSG00000112306 \N -185990 2.41e-06 2.55e-06 4.43e-07 1.74e-06 7.59e-07 8.4e-07 1.82e-06 7.94e-07 1.92e-06 9.75e-07 2.47e-06 1.34e-06 3.51e-06 1.42e-06 9.32e-07 1.77e-06 1.22e-06 2.3e-06 1.42e-06 1.42e-06 1.34e-06 3.02e-06 2.3e-06 1.24e-06 3.4e-06 1.13e-06 1.39e-06 1.8e-06 2.28e-06 1.97e-06 1.55e-06 3.79e-07 6.2e-07 1.18e-06 1.23e-06 1e-06 7.47e-07 4.46e-07 1.17e-06 3.99e-07 2.66e-07 3.22e-06 5.13e-07 1.81e-07 3.61e-07 3.14e-07 8.19e-07 1.98e-07 1.75e-07