logo

Genes within 1Mb (chr6:132617703:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 216228 sc-eQTL 1.88e-02 0.348 0.147 0.096 B L1
ENSG00000079950 STX7 104505 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0628 0.056 0.096 B L1
ENSG00000112282 MED23 989461 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00528 0.112 0.096 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -145756 sc-eQTL 3.35e-01 -0.102 0.105 0.096 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -196866 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0508 0.0637 0.096 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -195636 sc-eQTL 9.18e-01 0.0138 0.134 0.096 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 485815 sc-eQTL 1.76e-02 -0.208 0.0869 0.096 B L1
ENSG00000079950 STX7 104505 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0931 0.107 0.096 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 989461 sc-eQTL 8.26e-01 0.0188 0.0854 0.096 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -145756 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0488 0.0932 0.096 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -196866 sc-eQTL 7.38e-01 0.0212 0.0634 0.096 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -195636 sc-eQTL 9.75e-02 0.212 0.127 0.096 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 104505 sc-eQTL 6.11e-01 0.0553 0.109 0.096 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 989461 sc-eQTL 6.67e-01 0.0461 0.107 0.096 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -145756 sc-eQTL 6.74e-01 0.0534 0.127 0.096 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -196866 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0103 0.0433 0.096 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -195636 sc-eQTL 2.07e-01 0.165 0.131 0.096 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 104505 sc-eQTL 3.26e-01 0.0987 0.1 0.099 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -117062 sc-eQTL 2.54e-01 -0.142 0.124 0.099 DC L1
ENSG00000112282 MED23 989461 sc-eQTL 3.44e-01 0.138 0.146 0.099 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -96352 sc-eQTL 3.43e-01 0.128 0.134 0.099 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -145756 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00504 0.144 0.099 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -196866 sc-eQTL 2.49e-01 0.0929 0.0804 0.099 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -195636 sc-eQTL 3.15e-01 0.128 0.127 0.099 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -485425 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0931 0.116 0.099 DC L1
ENSG00000079950 STX7 104505 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0143 0.0734 0.096 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -117062 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0119 0.126 0.096 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 989461 sc-eQTL 6.68e-02 0.219 0.119 0.096 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -96352 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0434 0.135 0.096 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -145756 sc-eQTL 3.54e-01 0.0886 0.0954 0.096 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -196866 sc-eQTL 1.89e-01 0.0752 0.0571 0.096 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -195636 sc-eQTL 5.05e-01 0.0757 0.113 0.096 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 104505 sc-eQTL 2.81e-01 0.12 0.111 0.094 NK L1
ENSG00000112282 MED23 989461 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0619 0.102 0.094 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -145756 sc-eQTL 4.59e-01 -0.103 0.138 0.094 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -196866 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0184 0.0573 0.094 NK L1
ENSG00000079950 STX7 104505 sc-eQTL 3.61e-01 0.103 0.112 0.096 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 989461 sc-eQTL 3.08e-01 -0.143 0.14 0.096 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -145756 sc-eQTL 3.40e-01 0.129 0.135 0.096 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -196866 sc-eQTL 3.23e-01 0.0532 0.0536 0.096 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -195636 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0543 0.147 0.096 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 216228 sc-eQTL 4.79e-01 0.104 0.147 0.105 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 104505 sc-eQTL 5.27e-01 -0.087 0.137 0.105 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 989461 sc-eQTL 5.00e-01 0.103 0.152 0.105 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -145756 sc-eQTL 4.16e-01 0.119 0.146 0.105 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -196866 sc-eQTL 4.37e-01 0.061 0.0783 0.105 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -195636 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0604 0.137 0.105 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 485815 sc-eQTL 4.27e-01 0.104 0.131 0.105 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 216228 sc-eQTL 1.62e-02 0.329 0.136 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 104505 sc-eQTL 6.17e-01 0.0451 0.0901 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 989461 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0559 0.137 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -145756 sc-eQTL 3.36e-01 0.131 0.136 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -196866 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0776 0.083 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -195636 sc-eQTL 4.27e-01 0.119 0.15 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 485815 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0778 0.127 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 216228 sc-eQTL 2.06e-01 0.177 0.139 0.097 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 104505 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0231 0.11 0.097 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 989461 sc-eQTL 4.73e-01 -0.102 0.141 0.097 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -145756 sc-eQTL 8.35e-01 -0.03 0.143 0.097 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -196866 sc-eQTL 6.74e-01 0.0291 0.0691 0.097 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -195636 sc-eQTL 3.01e-01 0.149 0.144 0.097 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 485815 sc-eQTL 8.73e-01 0.0215 0.134 0.097 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 216228 sc-eQTL 2.81e-01 0.169 0.157 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 104505 sc-eQTL 3.53e-02 -0.144 0.068 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 989461 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00173 0.123 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -145756 sc-eQTL 3.46e-02 -0.281 0.132 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -196866 sc-eQTL 9.61e-01 0.00367 0.076 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -195636 sc-eQTL 3.66e-01 -0.133 0.146 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 485815 sc-eQTL 5.03e-02 -0.189 0.0962 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 216228 sc-eQTL 1.17e-01 0.228 0.145 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 104505 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0797 0.0793 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 989461 sc-eQTL 6.69e-01 0.0629 0.147 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -145756 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0244 0.146 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -196866 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0543 0.0772 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -195636 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0388 0.147 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 485815 sc-eQTL 1.50e-01 -0.147 0.102 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 104505 sc-eQTL 2.59e-01 -0.17 0.15 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 989461 sc-eQTL 4.86e-01 0.109 0.156 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -145756 sc-eQTL 9.17e-01 0.0159 0.152 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -196866 sc-eQTL 5.54e-01 0.0415 0.0701 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -195636 sc-eQTL 2.81e-01 0.152 0.141 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 104505 sc-eQTL 3.00e-01 -0.12 0.116 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 989461 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00972 0.0991 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -145756 sc-eQTL 4.69e-01 -0.078 0.107 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -196866 sc-eQTL 8.55e-01 0.0128 0.0698 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -195636 sc-eQTL 3.34e-01 0.13 0.134 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 104505 sc-eQTL 6.18e-01 0.0643 0.129 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 989461 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00834 0.108 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -145756 sc-eQTL 3.66e-01 0.115 0.127 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -196866 sc-eQTL 4.63e-01 0.0483 0.0657 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -195636 sc-eQTL 5.64e-02 0.29 0.151 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 104505 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0515 0.149 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 989461 sc-eQTL 4.29e-01 -0.109 0.137 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -145756 sc-eQTL 1.65e-01 0.199 0.143 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -196866 sc-eQTL 6.72e-01 0.0249 0.0587 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -195636 sc-eQTL 1.56e-02 0.351 0.144 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 104505 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0315 0.124 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 989461 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0943 0.127 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -145756 sc-eQTL 4.84e-01 0.099 0.141 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -196866 sc-eQTL 4.51e-01 0.0571 0.0755 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -195636 sc-eQTL 9.28e-01 0.0132 0.147 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 104505 sc-eQTL 1.01e-01 0.244 0.148 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 989461 sc-eQTL 2.83e-01 0.128 0.119 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -145756 sc-eQTL 8.70e-01 0.0211 0.128 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -196866 sc-eQTL 8.95e-01 0.00967 0.0735 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -195636 sc-eQTL 2.86e-01 0.157 0.147 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 104505 sc-eQTL 8.60e-01 -0.026 0.147 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 989461 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0769 0.148 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -145756 sc-eQTL 3.25e-01 -0.144 0.146 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -196866 sc-eQTL 4.01e-01 0.0598 0.0712 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -195636 sc-eQTL 5.95e-01 0.0831 0.156 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 104505 sc-eQTL 9.95e-01 0.000906 0.156 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 989461 sc-eQTL 5.03e-01 0.101 0.15 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -145756 sc-eQTL 7.71e-02 -0.274 0.154 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -196866 sc-eQTL 1.86e-01 -0.111 0.0832 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -195636 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0224 0.158 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 104505 sc-eQTL 8.70e-01 0.0232 0.142 0.097 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 989461 sc-eQTL 1.31e-01 -0.223 0.147 0.097 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -145756 sc-eQTL 7.18e-01 0.0521 0.144 0.097 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -196866 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0226 0.0709 0.097 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -195636 sc-eQTL 3.97e-01 -0.126 0.148 0.097 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 104505 sc-eQTL 3.78e-01 -0.133 0.15 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 989461 sc-eQTL 8.49e-02 -0.274 0.158 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -145756 sc-eQTL 5.83e-01 -0.084 0.153 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -196866 sc-eQTL 3.78e-01 0.0751 0.085 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 104505 sc-eQTL 1.25e-01 0.183 0.119 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 989461 sc-eQTL 3.55e-01 -0.113 0.123 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -145756 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0738 0.149 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -196866 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0304 0.0593 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 104505 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0386 0.146 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 989461 sc-eQTL 2.47e-02 0.329 0.145 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -145756 sc-eQTL 1.88e-01 -0.194 0.147 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -196866 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0481 0.0687 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 104505 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00443 0.131 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 989461 sc-eQTL 2.69e-01 0.15 0.135 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -145756 sc-eQTL 1.69e-01 -0.203 0.147 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -196866 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0194 0.0799 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 216228 sc-eQTL 2.02e-01 0.2 0.156 0.104 PB L2
ENSG00000079950 STX7 104505 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0216 0.131 0.104 PB L2
ENSG00000112282 MED23 989461 sc-eQTL 3.96e-01 -0.151 0.177 0.104 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -145756 sc-eQTL 2.60e-01 0.18 0.159 0.104 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -196866 sc-eQTL 2.59e-01 -0.102 0.0903 0.104 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -195636 sc-eQTL 5.04e-01 0.114 0.17 0.104 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 485815 sc-eQTL 5.89e-01 0.0606 0.112 0.104 PB L2
ENSG00000079950 STX7 104505 sc-eQTL 8.95e-02 0.23 0.135 0.096 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 989461 sc-eQTL 2.43e-01 0.178 0.152 0.096 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -145756 sc-eQTL 1.65e-01 0.201 0.145 0.096 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -196866 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0109 0.055 0.096 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -195636 sc-eQTL 2.55e-01 0.162 0.142 0.096 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 104505 sc-eQTL 3.73e-01 -0.127 0.142 0.096 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 989461 sc-eQTL 4.80e-01 0.104 0.146 0.096 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -145756 sc-eQTL 9.13e-01 0.0131 0.12 0.096 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -196866 sc-eQTL 9.81e-01 0.00129 0.0531 0.096 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -195636 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0352 0.15 0.096 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 104505 sc-eQTL 9.80e-01 0.0032 0.127 0.09 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -117062 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0349 0.126 0.09 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 989461 sc-eQTL 5.91e-01 0.088 0.164 0.09 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -96352 sc-eQTL 8.68e-01 0.0245 0.148 0.09 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -145756 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0221 0.144 0.09 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -196866 sc-eQTL 5.63e-01 0.0413 0.0711 0.09 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -195636 sc-eQTL 8.83e-01 0.0209 0.141 0.09 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -485425 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0521 0.113 0.09 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 104505 sc-eQTL 1.56e-01 -0.134 0.0943 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -117062 sc-eQTL 9.47e-01 0.00896 0.134 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 989461 sc-eQTL 7.23e-02 0.237 0.131 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -96352 sc-eQTL 3.72e-01 -0.121 0.135 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -145756 sc-eQTL 3.33e-01 0.105 0.108 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -196866 sc-eQTL 1.83e-01 0.0798 0.0597 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -195636 sc-eQTL 6.94e-01 0.0455 0.116 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 104505 sc-eQTL 1.46e-01 0.149 0.102 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -117062 sc-eQTL 9.47e-01 0.00853 0.129 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 989461 sc-eQTL 1.99e-01 0.179 0.139 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -96352 sc-eQTL 4.24e-01 0.112 0.139 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -145756 sc-eQTL 4.35e-01 0.0714 0.0913 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -196866 sc-eQTL 5.25e-01 0.0419 0.0658 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -195636 sc-eQTL 2.47e-01 0.141 0.122 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 104505 sc-eQTL 9.38e-01 0.0142 0.183 0.076 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 989461 sc-eQTL 2.31e-01 -0.234 0.195 0.076 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -145756 sc-eQTL 5.46e-01 -0.122 0.202 0.076 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -196866 sc-eQTL 6.84e-01 0.0313 0.0769 0.076 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -195636 sc-eQTL 1.20e-01 0.309 0.197 0.076 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 104505 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0292 0.141 0.098 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -117062 sc-eQTL 9.40e-01 0.0108 0.142 0.098 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 989461 sc-eQTL 3.42e-01 -0.148 0.156 0.098 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -96352 sc-eQTL 5.27e-01 0.0889 0.14 0.098 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -145756 sc-eQTL 6.96e-01 0.0558 0.143 0.098 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -196866 sc-eQTL 7.48e-01 -0.02 0.0621 0.098 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -195636 sc-eQTL 6.38e-01 0.0713 0.151 0.098 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 104505 sc-eQTL 2.42e-01 -0.122 0.104 0.093 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -117062 sc-eQTL 1.32e-01 -0.222 0.146 0.093 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 989461 sc-eQTL 3.96e-01 -0.127 0.149 0.093 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -96352 sc-eQTL 8.85e-01 0.0211 0.146 0.093 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -145756 sc-eQTL 9.08e-02 0.237 0.14 0.093 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -196866 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0149 0.0705 0.093 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -195636 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0135 0.125 0.093 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 104505 sc-eQTL 5.35e-01 0.0735 0.118 0.088 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -117062 sc-eQTL 2.77e-01 -0.129 0.119 0.088 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 989461 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0775 0.166 0.088 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -96352 sc-eQTL 5.12e-01 0.0795 0.121 0.088 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -145756 sc-eQTL 7.75e-01 0.0413 0.144 0.088 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -196866 sc-eQTL 4.64e-01 0.0729 0.0992 0.088 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -195636 sc-eQTL 6.55e-01 0.0658 0.147 0.088 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -485425 sc-eQTL 3.19e-01 -0.14 0.14 0.088 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 216228 sc-eQTL 3.20e-02 0.314 0.145 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 104505 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00475 0.0833 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 989461 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0968 0.127 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -145756 sc-eQTL 9.10e-01 0.0149 0.132 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -196866 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0507 0.075 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -195636 sc-eQTL 4.89e-01 0.0953 0.138 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 485815 sc-eQTL 9.01e-01 0.0166 0.133 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 216228 sc-eQTL 1.51e-01 0.222 0.154 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 104505 sc-eQTL 1.06e-01 -0.102 0.0631 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 989461 sc-eQTL 8.29e-01 0.0258 0.119 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -145756 sc-eQTL 6.61e-02 -0.226 0.122 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -196866 sc-eQTL 7.89e-01 -0.02 0.0746 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -195636 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0725 0.141 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 485815 sc-eQTL 3.76e-02 -0.185 0.0885 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 104505 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0247 0.0792 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -117062 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00534 0.129 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 989461 sc-eQTL 2.96e-02 0.269 0.123 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -96352 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0147 0.135 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -145756 sc-eQTL 5.61e-01 0.0518 0.0889 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -196866 sc-eQTL 1.77e-01 0.0822 0.0608 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -195636 sc-eQTL 4.22e-01 0.0872 0.108 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 104505 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0133 0.0988 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -117062 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0904 0.145 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 989461 sc-eQTL 2.97e-01 -0.148 0.141 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -96352 sc-eQTL 9.91e-01 0.00171 0.144 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -145756 sc-eQTL 1.55e-01 0.193 0.135 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -196866 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0278 0.0576 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -195636 sc-eQTL 7.41e-01 0.0463 0.14 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 104505 sc-eQTL 2.79e-01 0.121 0.111 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 989461 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0547 0.108 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -145756 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0922 0.141 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -196866 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0312 0.0577 0.095 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 104505 eQTL 0.00799 -0.0722 0.0272 0.0 0.0 0.0927
ENSG00000112299 VNN1 -96352 pQTL 0.00643 0.162 0.0592 0.0 0.0 0.0957
ENSG00000146409 SLC18B1 -195636 eQTL 0.00502 0.107 0.0381 0.0 0.0 0.0927

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112282 \N 989461 2.66e-07 1.1e-07 3.59e-08 1.79e-07 8.92e-08 9.71e-08 1.41e-07 5.33e-08 1.41e-07 4.38e-08 1.59e-07 7.75e-08 1.26e-07 6.38e-08 5.55e-08 7.5e-08 4.48e-08 1.14e-07 5.19e-08 4.03e-08 1.04e-07 1.27e-07 1.26e-07 4.13e-08 1.33e-07 1.19e-07 1.12e-07 9.15e-08 1.02e-07 1.11e-07 9.58e-08 4.07e-08 3.09e-08 8.82e-08 8.93e-08 3.97e-08 4.89e-08 9.65e-08 7.63e-08 3.03e-08 4.36e-08 1.35e-07 4.1e-08 1.2e-08 7.79e-08 1.69e-08 1.25e-07 3.99e-09 4.85e-08
ENSG00000146409 SLC18B1 -195636 1.4e-06 2.2e-06 2.52e-07 1.43e-06 4.41e-07 6.38e-07 1.24e-06 4.04e-07 1.71e-06 7.04e-07 1.87e-06 1.32e-06 2.84e-06 8.7e-07 3.86e-07 9.61e-07 1.12e-06 1.27e-06 5.56e-07 6.44e-07 6.15e-07 1.92e-06 1.64e-06 8.33e-07 2.62e-06 8.38e-07 1e-06 1.05e-06 1.68e-06 1.67e-06 7.53e-07 2.55e-07 3.99e-07 6.13e-07 8.59e-07 6.4e-07 6.55e-07 3.46e-07 5e-07 2.27e-07 3.35e-07 2.51e-06 3.53e-07 1.81e-07 3.12e-07 3.05e-07 2.69e-07 2.49e-07 2.44e-07