logo

Genes within 1Mb (chr6:132614726:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 213251 sc-eQTL 1.20e-01 -0.261 0.167 0.073 B L1
ENSG00000079950 STX7 101528 sc-eQTL 3.91e-01 0.0545 0.0634 0.073 B L1
ENSG00000112282 MED23 986484 sc-eQTL 8.18e-01 0.0291 0.127 0.073 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -148733 sc-eQTL 2.38e-01 0.141 0.119 0.073 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -199843 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0575 0.0721 0.073 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -198613 sc-eQTL 5.10e-01 0.1 0.152 0.073 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 482838 sc-eQTL 7.81e-01 0.0277 0.0997 0.073 B L1
ENSG00000079950 STX7 101528 sc-eQTL 4.16e-01 0.101 0.124 0.073 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 986484 sc-eQTL 2.84e-01 0.105 0.098 0.073 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -148733 sc-eQTL 1.57e-01 -0.152 0.107 0.073 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -199843 sc-eQTL 6.51e-02 -0.134 0.0723 0.073 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -198613 sc-eQTL 7.21e-01 0.0528 0.147 0.073 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 101528 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00833 0.121 0.073 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 986484 sc-eQTL 4.35e-01 0.0935 0.119 0.073 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -148733 sc-eQTL 1.39e-01 0.21 0.141 0.073 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -199843 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0243 0.0484 0.073 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -198613 sc-eQTL 7.21e-02 0.263 0.145 0.073 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 101528 sc-eQTL 4.20e-01 0.092 0.114 0.07 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -120039 sc-eQTL 6.12e-01 0.0718 0.141 0.07 DC L1
ENSG00000112282 MED23 986484 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0818 0.166 0.07 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -99329 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0602 0.152 0.07 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -148733 sc-eQTL 9.71e-01 0.00597 0.163 0.07 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -199843 sc-eQTL 8.38e-01 0.0188 0.0915 0.07 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -198613 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0616 0.145 0.07 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -488402 sc-eQTL 2.66e-01 0.147 0.131 0.07 DC L1
ENSG00000079950 STX7 101528 sc-eQTL 7.29e-01 0.0287 0.0827 0.073 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -120039 sc-eQTL 2.11e-01 -0.177 0.142 0.073 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 986484 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0274 0.135 0.073 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -99329 sc-eQTL 3.05e-04 0.544 0.148 0.073 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -148733 sc-eQTL 4.15e-01 0.0879 0.108 0.073 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -199843 sc-eQTL 2.17e-02 -0.148 0.0638 0.073 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -198613 sc-eQTL 2.12e-01 0.16 0.127 0.073 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 101528 sc-eQTL 9.34e-01 0.0102 0.123 0.073 NK L1
ENSG00000112282 MED23 986484 sc-eQTL 2.92e-01 0.118 0.112 0.073 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -148733 sc-eQTL 5.95e-02 -0.287 0.152 0.073 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -199843 sc-eQTL 2.04e-01 -0.0803 0.063 0.073 NK L1
ENSG00000079950 STX7 101528 sc-eQTL 4.95e-02 0.244 0.124 0.073 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 986484 sc-eQTL 2.19e-02 0.355 0.154 0.073 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -148733 sc-eQTL 7.57e-01 0.0467 0.151 0.073 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -199843 sc-eQTL 3.39e-01 0.0572 0.0597 0.073 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -198613 sc-eQTL 2.77e-01 0.178 0.163 0.073 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 213251 sc-eQTL 3.20e-03 0.494 0.165 0.071 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 101528 sc-eQTL 1.58e-01 0.224 0.158 0.071 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 986484 sc-eQTL 5.53e-03 -0.484 0.172 0.071 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -148733 sc-eQTL 1.29e-01 0.256 0.168 0.071 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -199843 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00344 0.0906 0.071 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198613 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0967 0.159 0.071 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 482838 sc-eQTL 5.78e-01 0.0843 0.151 0.071 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 213251 sc-eQTL 3.86e-01 -0.135 0.156 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 101528 sc-eQTL 1.43e-01 0.15 0.102 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 986484 sc-eQTL 3.89e-01 0.134 0.155 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -148733 sc-eQTL 5.05e-01 -0.103 0.154 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -199843 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0962 0.094 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198613 sc-eQTL 1.96e-01 0.219 0.169 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 482838 sc-eQTL 1.76e-01 -0.195 0.144 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 213251 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0489 0.155 0.071 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 101528 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0171 0.121 0.071 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 986484 sc-eQTL 1.96e-01 0.202 0.156 0.071 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -148733 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0352 0.159 0.071 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -199843 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0369 0.0764 0.071 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198613 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0379 0.159 0.071 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 482838 sc-eQTL 6.10e-01 0.0759 0.149 0.071 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 213251 sc-eQTL 1.05e-02 -0.439 0.17 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 101528 sc-eQTL 5.79e-01 0.0419 0.0754 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 986484 sc-eQTL 3.10e-01 -0.137 0.135 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -148733 sc-eQTL 6.10e-01 0.0749 0.146 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -199843 sc-eQTL 3.81e-02 -0.172 0.0826 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198613 sc-eQTL 1.01e-01 0.264 0.16 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 482838 sc-eQTL 6.93e-01 0.0421 0.107 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 213251 sc-eQTL 4.61e-01 -0.12 0.163 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 101528 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00115 0.0889 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 986484 sc-eQTL 5.77e-01 0.0917 0.164 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -148733 sc-eQTL 3.49e-01 0.153 0.163 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -199843 sc-eQTL 1.56e-01 -0.122 0.086 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198613 sc-eQTL 4.25e-01 -0.132 0.165 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 482838 sc-eQTL 8.37e-01 0.0235 0.114 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 101528 sc-eQTL 9.34e-01 0.0135 0.163 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 986484 sc-eQTL 3.22e-01 0.168 0.169 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -148733 sc-eQTL 4.97e-01 -0.112 0.164 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -199843 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0394 0.0758 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198613 sc-eQTL 1.74e-01 0.208 0.152 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 101528 sc-eQTL 3.03e-01 0.135 0.13 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 986484 sc-eQTL 5.29e-01 0.0703 0.111 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -148733 sc-eQTL 2.00e-01 -0.155 0.121 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -199843 sc-eQTL 2.05e-01 -0.0995 0.0782 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198613 sc-eQTL 7.03e-01 0.0577 0.151 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 101528 sc-eQTL 6.95e-01 0.0579 0.147 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 986484 sc-eQTL 5.77e-01 0.0693 0.124 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -148733 sc-eQTL 1.49e-01 -0.21 0.145 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -199843 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0448 0.0753 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198613 sc-eQTL 8.26e-01 0.0383 0.175 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 101528 sc-eQTL 3.72e-01 0.154 0.172 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 986484 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0543 0.159 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -148733 sc-eQTL 2.05e-01 0.21 0.165 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -199843 sc-eQTL 1.32e-01 -0.102 0.0675 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198613 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0751 0.169 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 101528 sc-eQTL 6.42e-01 0.064 0.137 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 986484 sc-eQTL 4.56e-01 0.105 0.141 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -148733 sc-eQTL 7.39e-01 0.0519 0.156 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -199843 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0295 0.0835 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198613 sc-eQTL 3.24e-02 0.345 0.16 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 101528 sc-eQTL 2.65e-01 -0.187 0.168 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 986484 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00825 0.135 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -148733 sc-eQTL 2.87e-01 0.154 0.145 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -199843 sc-eQTL 2.78e-01 -0.09 0.0828 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198613 sc-eQTL 2.54e-01 0.19 0.166 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 101528 sc-eQTL 3.95e-01 -0.148 0.174 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 986484 sc-eQTL 4.58e-01 0.13 0.174 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -148733 sc-eQTL 5.35e-01 -0.107 0.173 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -199843 sc-eQTL 9.18e-01 0.00871 0.0842 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198613 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0564 0.184 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 101528 sc-eQTL 6.92e-01 0.068 0.171 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 986484 sc-eQTL 4.55e-01 0.123 0.165 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -148733 sc-eQTL 7.15e-01 0.0623 0.17 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -199843 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0257 0.0916 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198613 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0449 0.173 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 101528 sc-eQTL 2.10e-01 0.196 0.156 0.071 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 986484 sc-eQTL 8.59e-02 0.281 0.163 0.071 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -148733 sc-eQTL 8.54e-01 0.0295 0.16 0.071 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -199843 sc-eQTL 6.81e-01 0.0323 0.0784 0.071 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198613 sc-eQTL 4.94e-01 0.113 0.164 0.071 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 101528 sc-eQTL 3.08e-01 0.169 0.166 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 986484 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0972 0.175 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -148733 sc-eQTL 6.28e-02 0.313 0.167 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -199843 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0221 0.0939 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 101528 sc-eQTL 5.63e-01 0.075 0.129 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 986484 sc-eQTL 7.15e-01 0.0487 0.133 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -148733 sc-eQTL 4.53e-01 -0.122 0.162 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -199843 sc-eQTL 8.16e-01 -0.015 0.0642 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 101528 sc-eQTL 5.17e-01 -0.105 0.162 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 986484 sc-eQTL 2.92e-01 0.173 0.163 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -148733 sc-eQTL 1.61e-01 -0.229 0.163 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -199843 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0668 0.0763 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 101528 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0783 0.151 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 986484 sc-eQTL 1.37e-01 0.231 0.155 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -148733 sc-eQTL 6.09e-04 -0.573 0.165 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -199843 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0892 0.0917 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 213251 sc-eQTL 9.73e-01 0.00547 0.163 0.081 PB L2
ENSG00000079950 STX7 101528 sc-eQTL 3.55e-01 0.126 0.136 0.081 PB L2
ENSG00000112282 MED23 986484 sc-eQTL 1.46e-01 0.268 0.183 0.081 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -148733 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0389 0.166 0.081 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -199843 sc-eQTL 2.07e-01 0.119 0.0937 0.081 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198613 sc-eQTL 1.49e-01 -0.254 0.175 0.081 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 482838 sc-eQTL 7.63e-03 0.306 0.113 0.081 PB L2
ENSG00000079950 STX7 101528 sc-eQTL 5.66e-01 0.086 0.149 0.074 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 986484 sc-eQTL 2.33e-01 0.2 0.168 0.074 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -148733 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0972 0.16 0.074 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -199843 sc-eQTL 3.17e-01 0.0608 0.0605 0.074 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198613 sc-eQTL 4.20e-01 -0.127 0.157 0.074 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 101528 sc-eQTL 3.24e-01 0.16 0.162 0.073 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 986484 sc-eQTL 4.94e-01 -0.114 0.167 0.073 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -148733 sc-eQTL 7.57e-01 0.0423 0.137 0.073 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -199843 sc-eQTL 9.99e-01 4.89e-05 0.0605 0.073 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198613 sc-eQTL 2.03e-01 0.217 0.17 0.073 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 101528 sc-eQTL 7.34e-01 0.049 0.144 0.066 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -120039 sc-eQTL 3.72e-01 0.128 0.143 0.066 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 986484 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0671 0.186 0.066 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -99329 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00342 0.168 0.066 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -148733 sc-eQTL 3.20e-01 0.163 0.164 0.066 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -199843 sc-eQTL 2.81e-01 0.0873 0.0807 0.066 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198613 sc-eQTL 2.07e-01 -0.202 0.16 0.066 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -488402 sc-eQTL 6.81e-01 0.0528 0.128 0.066 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 101528 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0677 0.107 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -120039 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0605 0.151 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 986484 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0177 0.149 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -99329 sc-eQTL 1.55e-03 0.477 0.149 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -148733 sc-eQTL 7.88e-01 0.0328 0.122 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -199843 sc-eQTL 2.58e-02 -0.15 0.0669 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198613 sc-eQTL 1.60e-01 0.183 0.13 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 101528 sc-eQTL 5.36e-02 0.226 0.116 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -120039 sc-eQTL 7.38e-02 -0.261 0.145 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 986484 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0147 0.159 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -99329 sc-eQTL 1.32e-02 0.392 0.157 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -148733 sc-eQTL 1.69e-01 0.143 0.104 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -199843 sc-eQTL 2.00e-01 -0.0962 0.0748 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198613 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0694 0.139 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 101528 sc-eQTL 2.28e-02 0.413 0.179 0.076 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 986484 sc-eQTL 2.37e-01 0.232 0.195 0.076 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -148733 sc-eQTL 6.99e-01 0.0784 0.202 0.076 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -199843 sc-eQTL 3.72e-01 0.0688 0.0768 0.076 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198613 sc-eQTL 8.00e-03 0.522 0.194 0.076 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 101528 sc-eQTL 1.32e-01 0.237 0.157 0.071 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -120039 sc-eQTL 7.88e-01 -0.043 0.16 0.071 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 986484 sc-eQTL 6.26e-01 0.0854 0.175 0.071 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -99329 sc-eQTL 7.68e-01 0.0465 0.158 0.071 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -148733 sc-eQTL 6.29e-02 0.297 0.159 0.071 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -199843 sc-eQTL 7.08e-01 0.0262 0.0697 0.071 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198613 sc-eQTL 3.47e-01 0.16 0.169 0.071 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 101528 sc-eQTL 3.05e-01 0.12 0.117 0.07 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -120039 sc-eQTL 7.89e-02 0.289 0.164 0.07 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 986484 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00857 0.167 0.07 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -99329 sc-eQTL 1.78e-03 0.507 0.16 0.07 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -148733 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00478 0.158 0.07 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -199843 sc-eQTL 2.30e-01 -0.0949 0.0788 0.07 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198613 sc-eQTL 3.55e-01 -0.129 0.139 0.07 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 101528 sc-eQTL 2.46e-01 0.153 0.132 0.073 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -120039 sc-eQTL 7.47e-01 0.0429 0.133 0.073 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 986484 sc-eQTL 4.70e-01 0.134 0.185 0.073 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -99329 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0734 0.135 0.073 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -148733 sc-eQTL 1.31e-02 -0.397 0.158 0.073 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -199843 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0557 0.111 0.073 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198613 sc-eQTL 7.09e-01 0.0614 0.164 0.073 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -488402 sc-eQTL 9.32e-01 0.0134 0.157 0.073 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 213251 sc-eQTL 4.76e-01 -0.117 0.163 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 101528 sc-eQTL 1.37e-01 0.138 0.0922 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 986484 sc-eQTL 9.59e-01 0.00734 0.142 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -148733 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0444 0.147 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -199843 sc-eQTL 1.94e-01 -0.108 0.0832 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -198613 sc-eQTL 1.09e-01 0.245 0.152 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 482838 sc-eQTL 9.63e-01 0.00686 0.148 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 213251 sc-eQTL 4.86e-02 -0.339 0.171 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 101528 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00586 0.0707 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 986484 sc-eQTL 7.29e-01 -0.046 0.133 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -148733 sc-eQTL 3.03e-01 0.142 0.137 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -199843 sc-eQTL 9.39e-02 -0.139 0.0826 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -198613 sc-eQTL 4.38e-01 0.122 0.157 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 482838 sc-eQTL 7.18e-01 0.036 0.0996 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 101528 sc-eQTL 7.16e-01 0.0324 0.0888 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -120039 sc-eQTL 2.34e-01 -0.172 0.144 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 986484 sc-eQTL 7.63e-01 -0.042 0.139 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -99329 sc-eQTL 1.28e-03 0.481 0.147 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -148733 sc-eQTL 5.90e-01 0.0538 0.0997 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -199843 sc-eQTL 2.99e-02 -0.148 0.0677 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -198613 sc-eQTL 3.04e-01 0.125 0.121 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 101528 sc-eQTL 3.13e-01 0.11 0.108 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -120039 sc-eQTL 8.20e-01 0.0364 0.16 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 986484 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00404 0.156 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -99329 sc-eQTL 3.10e-02 0.34 0.157 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -148733 sc-eQTL 1.52e-01 0.214 0.149 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -199843 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0142 0.0634 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -198613 sc-eQTL 1.40e-01 0.227 0.153 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 101528 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0606 0.124 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 986484 sc-eQTL 1.35e-01 0.179 0.119 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -148733 sc-eQTL 3.77e-02 -0.324 0.155 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -199843 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0533 0.0638 0.073 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 101528 pQTL 0.0298 -0.0856 0.0393 0.0 0.0 0.0853
ENSG00000079950 STX7 101528 eQTL 0.00335 -0.0777 0.0264 0.0 0.0 0.0903
ENSG00000112282 MED23 986484 eQTL 0.0367 -0.0581 0.0278 0.0 0.0 0.0903
ENSG00000112299 VNN1 -99329 pQTL 3.64e-12 0.42 0.0598 0.0 0.0 0.0853
ENSG00000112299 VNN1 -99329 eQTL 1.14e-09 0.219 0.0356 0.0 0.0 0.0903
ENSG00000118523 CCN2 663354 pQTL 0.000262 -0.133 0.0363 0.00263 0.0 0.0853

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112299 VNN1 -99329 1.54e-05 9.88e-06 2.95e-06 6.54e-06 2.35e-06 7.23e-06 1.53e-05 1.5e-06 1.06e-05 5.92e-06 1.17e-05 5.89e-06 2.06e-05 4.46e-06 3.18e-06 6.97e-06 5.45e-06 1.05e-05 4.02e-06 2.79e-06 6.81e-06 1.15e-05 8.9e-06 3.26e-06 1.72e-05 3.62e-06 6.02e-06 4.58e-06 1.45e-05 1.19e-05 6.63e-06 1.02e-06 1.24e-06 3.64e-06 4.81e-06 2.75e-06 1.91e-06 2e-06 2.14e-06 9.8e-07 1.07e-06 1.17e-05 2.36e-06 1.67e-07 7.99e-07 1.67e-06 1.73e-06 8.09e-07 4.73e-07