logo

Genes within 1Mb (chr6:132614504:TGAA:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 213029 sc-eQTL 1.20e-01 -0.261 0.167 0.073 B L1
ENSG00000079950 STX7 101306 sc-eQTL 3.91e-01 0.0545 0.0634 0.073 B L1
ENSG00000112282 MED23 986262 sc-eQTL 8.18e-01 0.0291 0.127 0.073 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -148955 sc-eQTL 2.38e-01 0.141 0.119 0.073 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -200065 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0575 0.0721 0.073 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -198835 sc-eQTL 5.10e-01 0.1 0.152 0.073 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 482616 sc-eQTL 7.81e-01 0.0277 0.0997 0.073 B L1
ENSG00000079950 STX7 101306 sc-eQTL 4.16e-01 0.101 0.124 0.073 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 986262 sc-eQTL 2.84e-01 0.105 0.098 0.073 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -148955 sc-eQTL 1.57e-01 -0.152 0.107 0.073 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -200065 sc-eQTL 6.51e-02 -0.134 0.0723 0.073 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -198835 sc-eQTL 7.21e-01 0.0528 0.147 0.073 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 101306 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00833 0.121 0.073 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 986262 sc-eQTL 4.35e-01 0.0935 0.119 0.073 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -148955 sc-eQTL 1.39e-01 0.21 0.141 0.073 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -200065 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0243 0.0484 0.073 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -198835 sc-eQTL 7.21e-02 0.263 0.145 0.073 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 101306 sc-eQTL 4.20e-01 0.092 0.114 0.07 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -120261 sc-eQTL 6.12e-01 0.0718 0.141 0.07 DC L1
ENSG00000112282 MED23 986262 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0818 0.166 0.07 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -99551 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0602 0.152 0.07 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -148955 sc-eQTL 9.71e-01 0.00597 0.163 0.07 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -200065 sc-eQTL 8.38e-01 0.0188 0.0915 0.07 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -198835 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0616 0.145 0.07 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -488624 sc-eQTL 2.66e-01 0.147 0.131 0.07 DC L1
ENSG00000079950 STX7 101306 sc-eQTL 7.29e-01 0.0287 0.0827 0.073 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -120261 sc-eQTL 2.11e-01 -0.177 0.142 0.073 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 986262 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0274 0.135 0.073 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -99551 sc-eQTL 3.05e-04 0.544 0.148 0.073 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -148955 sc-eQTL 4.15e-01 0.0879 0.108 0.073 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -200065 sc-eQTL 2.17e-02 -0.148 0.0638 0.073 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -198835 sc-eQTL 2.12e-01 0.16 0.127 0.073 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 101306 sc-eQTL 9.34e-01 0.0102 0.123 0.073 NK L1
ENSG00000112282 MED23 986262 sc-eQTL 2.92e-01 0.118 0.112 0.073 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -148955 sc-eQTL 5.95e-02 -0.287 0.152 0.073 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -200065 sc-eQTL 2.04e-01 -0.0803 0.063 0.073 NK L1
ENSG00000079950 STX7 101306 sc-eQTL 4.95e-02 0.244 0.124 0.073 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 986262 sc-eQTL 2.19e-02 0.355 0.154 0.073 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -148955 sc-eQTL 7.57e-01 0.0467 0.151 0.073 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -200065 sc-eQTL 3.39e-01 0.0572 0.0597 0.073 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -198835 sc-eQTL 2.77e-01 0.178 0.163 0.073 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 213029 sc-eQTL 3.20e-03 0.494 0.165 0.071 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 101306 sc-eQTL 1.58e-01 0.224 0.158 0.071 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 986262 sc-eQTL 5.53e-03 -0.484 0.172 0.071 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -148955 sc-eQTL 1.29e-01 0.256 0.168 0.071 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -200065 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00344 0.0906 0.071 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198835 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0967 0.159 0.071 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 482616 sc-eQTL 5.78e-01 0.0843 0.151 0.071 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 213029 sc-eQTL 3.86e-01 -0.135 0.156 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 101306 sc-eQTL 1.43e-01 0.15 0.102 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 986262 sc-eQTL 3.89e-01 0.134 0.155 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -148955 sc-eQTL 5.05e-01 -0.103 0.154 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -200065 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0962 0.094 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198835 sc-eQTL 1.96e-01 0.219 0.169 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 482616 sc-eQTL 1.76e-01 -0.195 0.144 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 213029 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0489 0.155 0.071 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 101306 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0171 0.121 0.071 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 986262 sc-eQTL 1.96e-01 0.202 0.156 0.071 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -148955 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0352 0.159 0.071 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -200065 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0369 0.0764 0.071 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198835 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0379 0.159 0.071 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 482616 sc-eQTL 6.10e-01 0.0759 0.149 0.071 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 213029 sc-eQTL 1.05e-02 -0.439 0.17 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 101306 sc-eQTL 5.79e-01 0.0419 0.0754 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 986262 sc-eQTL 3.10e-01 -0.137 0.135 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -148955 sc-eQTL 6.10e-01 0.0749 0.146 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -200065 sc-eQTL 3.81e-02 -0.172 0.0826 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198835 sc-eQTL 1.01e-01 0.264 0.16 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 482616 sc-eQTL 6.93e-01 0.0421 0.107 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 213029 sc-eQTL 4.61e-01 -0.12 0.163 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 101306 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00115 0.0889 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 986262 sc-eQTL 5.77e-01 0.0917 0.164 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -148955 sc-eQTL 3.49e-01 0.153 0.163 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -200065 sc-eQTL 1.56e-01 -0.122 0.086 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198835 sc-eQTL 4.25e-01 -0.132 0.165 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 482616 sc-eQTL 8.37e-01 0.0235 0.114 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 101306 sc-eQTL 9.34e-01 0.0135 0.163 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 986262 sc-eQTL 3.22e-01 0.168 0.169 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -148955 sc-eQTL 4.97e-01 -0.112 0.164 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -200065 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0394 0.0758 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198835 sc-eQTL 1.74e-01 0.208 0.152 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 101306 sc-eQTL 3.03e-01 0.135 0.13 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 986262 sc-eQTL 5.29e-01 0.0703 0.111 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -148955 sc-eQTL 2.00e-01 -0.155 0.121 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -200065 sc-eQTL 2.05e-01 -0.0995 0.0782 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198835 sc-eQTL 7.03e-01 0.0577 0.151 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 101306 sc-eQTL 6.95e-01 0.0579 0.147 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 986262 sc-eQTL 5.77e-01 0.0693 0.124 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -148955 sc-eQTL 1.49e-01 -0.21 0.145 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -200065 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0448 0.0753 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198835 sc-eQTL 8.26e-01 0.0383 0.175 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 101306 sc-eQTL 3.72e-01 0.154 0.172 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 986262 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0543 0.159 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -148955 sc-eQTL 2.05e-01 0.21 0.165 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -200065 sc-eQTL 1.32e-01 -0.102 0.0675 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198835 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0751 0.169 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 101306 sc-eQTL 6.42e-01 0.064 0.137 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 986262 sc-eQTL 4.56e-01 0.105 0.141 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -148955 sc-eQTL 7.39e-01 0.0519 0.156 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -200065 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0295 0.0835 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198835 sc-eQTL 3.24e-02 0.345 0.16 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 101306 sc-eQTL 2.65e-01 -0.187 0.168 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 986262 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00825 0.135 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -148955 sc-eQTL 2.87e-01 0.154 0.145 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -200065 sc-eQTL 2.78e-01 -0.09 0.0828 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198835 sc-eQTL 2.54e-01 0.19 0.166 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 101306 sc-eQTL 3.95e-01 -0.148 0.174 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 986262 sc-eQTL 4.58e-01 0.13 0.174 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -148955 sc-eQTL 5.35e-01 -0.107 0.173 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -200065 sc-eQTL 9.18e-01 0.00871 0.0842 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198835 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0564 0.184 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 101306 sc-eQTL 6.92e-01 0.068 0.171 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 986262 sc-eQTL 4.55e-01 0.123 0.165 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -148955 sc-eQTL 7.15e-01 0.0623 0.17 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -200065 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0257 0.0916 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198835 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0449 0.173 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 101306 sc-eQTL 2.10e-01 0.196 0.156 0.071 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 986262 sc-eQTL 8.59e-02 0.281 0.163 0.071 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -148955 sc-eQTL 8.54e-01 0.0295 0.16 0.071 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -200065 sc-eQTL 6.81e-01 0.0323 0.0784 0.071 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198835 sc-eQTL 4.94e-01 0.113 0.164 0.071 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 101306 sc-eQTL 3.08e-01 0.169 0.166 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 986262 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0972 0.175 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -148955 sc-eQTL 6.28e-02 0.313 0.167 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -200065 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0221 0.0939 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 101306 sc-eQTL 5.63e-01 0.075 0.129 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 986262 sc-eQTL 7.15e-01 0.0487 0.133 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -148955 sc-eQTL 4.53e-01 -0.122 0.162 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -200065 sc-eQTL 8.16e-01 -0.015 0.0642 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 101306 sc-eQTL 5.17e-01 -0.105 0.162 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 986262 sc-eQTL 2.92e-01 0.173 0.163 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -148955 sc-eQTL 1.61e-01 -0.229 0.163 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -200065 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0668 0.0763 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 101306 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0783 0.151 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 986262 sc-eQTL 1.37e-01 0.231 0.155 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -148955 sc-eQTL 6.09e-04 -0.573 0.165 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -200065 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0892 0.0917 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 213029 sc-eQTL 9.73e-01 0.00547 0.163 0.081 PB L2
ENSG00000079950 STX7 101306 sc-eQTL 3.55e-01 0.126 0.136 0.081 PB L2
ENSG00000112282 MED23 986262 sc-eQTL 1.46e-01 0.268 0.183 0.081 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -148955 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0389 0.166 0.081 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -200065 sc-eQTL 2.07e-01 0.119 0.0937 0.081 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198835 sc-eQTL 1.49e-01 -0.254 0.175 0.081 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 482616 sc-eQTL 7.63e-03 0.306 0.113 0.081 PB L2
ENSG00000079950 STX7 101306 sc-eQTL 5.66e-01 0.086 0.149 0.074 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 986262 sc-eQTL 2.33e-01 0.2 0.168 0.074 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -148955 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0972 0.16 0.074 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -200065 sc-eQTL 3.17e-01 0.0608 0.0605 0.074 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198835 sc-eQTL 4.20e-01 -0.127 0.157 0.074 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 101306 sc-eQTL 3.24e-01 0.16 0.162 0.073 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 986262 sc-eQTL 4.94e-01 -0.114 0.167 0.073 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -148955 sc-eQTL 7.57e-01 0.0423 0.137 0.073 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -200065 sc-eQTL 9.99e-01 4.89e-05 0.0605 0.073 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198835 sc-eQTL 2.03e-01 0.217 0.17 0.073 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 101306 sc-eQTL 7.34e-01 0.049 0.144 0.066 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -120261 sc-eQTL 3.72e-01 0.128 0.143 0.066 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 986262 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0671 0.186 0.066 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -99551 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00342 0.168 0.066 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -148955 sc-eQTL 3.20e-01 0.163 0.164 0.066 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -200065 sc-eQTL 2.81e-01 0.0873 0.0807 0.066 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198835 sc-eQTL 2.07e-01 -0.202 0.16 0.066 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -488624 sc-eQTL 6.81e-01 0.0528 0.128 0.066 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 101306 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0677 0.107 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -120261 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0605 0.151 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 986262 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0177 0.149 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -99551 sc-eQTL 1.55e-03 0.477 0.149 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -148955 sc-eQTL 7.88e-01 0.0328 0.122 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -200065 sc-eQTL 2.58e-02 -0.15 0.0669 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198835 sc-eQTL 1.60e-01 0.183 0.13 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 101306 sc-eQTL 5.36e-02 0.226 0.116 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -120261 sc-eQTL 7.38e-02 -0.261 0.145 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 986262 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0147 0.159 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -99551 sc-eQTL 1.32e-02 0.392 0.157 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -148955 sc-eQTL 1.69e-01 0.143 0.104 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -200065 sc-eQTL 2.00e-01 -0.0962 0.0748 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198835 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0694 0.139 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 101306 sc-eQTL 2.28e-02 0.413 0.179 0.076 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 986262 sc-eQTL 2.37e-01 0.232 0.195 0.076 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -148955 sc-eQTL 6.99e-01 0.0784 0.202 0.076 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -200065 sc-eQTL 3.72e-01 0.0688 0.0768 0.076 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198835 sc-eQTL 8.00e-03 0.522 0.194 0.076 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 101306 sc-eQTL 1.32e-01 0.237 0.157 0.071 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -120261 sc-eQTL 7.88e-01 -0.043 0.16 0.071 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 986262 sc-eQTL 6.26e-01 0.0854 0.175 0.071 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -99551 sc-eQTL 7.68e-01 0.0465 0.158 0.071 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -148955 sc-eQTL 6.29e-02 0.297 0.159 0.071 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -200065 sc-eQTL 7.08e-01 0.0262 0.0697 0.071 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198835 sc-eQTL 3.47e-01 0.16 0.169 0.071 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 101306 sc-eQTL 3.05e-01 0.12 0.117 0.07 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -120261 sc-eQTL 7.89e-02 0.289 0.164 0.07 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 986262 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00857 0.167 0.07 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -99551 sc-eQTL 1.78e-03 0.507 0.16 0.07 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -148955 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00478 0.158 0.07 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -200065 sc-eQTL 2.30e-01 -0.0949 0.0788 0.07 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198835 sc-eQTL 3.55e-01 -0.129 0.139 0.07 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 101306 sc-eQTL 2.46e-01 0.153 0.132 0.073 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -120261 sc-eQTL 7.47e-01 0.0429 0.133 0.073 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 986262 sc-eQTL 4.70e-01 0.134 0.185 0.073 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -99551 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0734 0.135 0.073 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -148955 sc-eQTL 1.31e-02 -0.397 0.158 0.073 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -200065 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0557 0.111 0.073 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -198835 sc-eQTL 7.09e-01 0.0614 0.164 0.073 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -488624 sc-eQTL 9.32e-01 0.0134 0.157 0.073 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 213029 sc-eQTL 4.76e-01 -0.117 0.163 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 101306 sc-eQTL 1.37e-01 0.138 0.0922 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 986262 sc-eQTL 9.59e-01 0.00734 0.142 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -148955 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0444 0.147 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -200065 sc-eQTL 1.94e-01 -0.108 0.0832 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -198835 sc-eQTL 1.09e-01 0.245 0.152 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 482616 sc-eQTL 9.63e-01 0.00686 0.148 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 213029 sc-eQTL 4.86e-02 -0.339 0.171 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 101306 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00586 0.0707 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 986262 sc-eQTL 7.29e-01 -0.046 0.133 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -148955 sc-eQTL 3.03e-01 0.142 0.137 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -200065 sc-eQTL 9.39e-02 -0.139 0.0826 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -198835 sc-eQTL 4.38e-01 0.122 0.157 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 482616 sc-eQTL 7.18e-01 0.036 0.0996 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 101306 sc-eQTL 7.16e-01 0.0324 0.0888 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -120261 sc-eQTL 2.34e-01 -0.172 0.144 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 986262 sc-eQTL 7.63e-01 -0.042 0.139 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -99551 sc-eQTL 1.28e-03 0.481 0.147 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -148955 sc-eQTL 5.90e-01 0.0538 0.0997 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -200065 sc-eQTL 2.99e-02 -0.148 0.0677 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -198835 sc-eQTL 3.04e-01 0.125 0.121 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 101306 sc-eQTL 3.13e-01 0.11 0.108 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -120261 sc-eQTL 8.20e-01 0.0364 0.16 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 986262 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00404 0.156 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -99551 sc-eQTL 3.10e-02 0.34 0.157 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -148955 sc-eQTL 1.52e-01 0.214 0.149 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -200065 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0142 0.0634 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -198835 sc-eQTL 1.40e-01 0.227 0.153 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 101306 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0606 0.124 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 986262 sc-eQTL 1.35e-01 0.179 0.119 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -148955 sc-eQTL 3.77e-02 -0.324 0.155 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -200065 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0533 0.0638 0.073 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 101306 pQTL 0.0298 -0.0856 0.0393 0.0 0.0 0.0853
ENSG00000079950 STX7 101306 eQTL 0.00335 -0.0777 0.0264 0.0 0.0 0.0903
ENSG00000112282 MED23 986262 eQTL 0.0367 -0.0581 0.0278 0.0 0.0 0.0903
ENSG00000112299 VNN1 -99551 pQTL 3.64e-12 0.42 0.0598 0.0 0.0 0.0853
ENSG00000112299 VNN1 -99551 eQTL 1.14e-09 0.219 0.0356 0.0 0.0 0.0903
ENSG00000118523 CCN2 663132 pQTL 0.000262 -0.133 0.0363 0.00263 0.0 0.0853

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112299 VNN1 -99551 9.7e-06 7.87e-06 1.67e-06 8.21e-06 1.49e-06 2.81e-06 1.23e-05 7.35e-07 4.66e-06 2.44e-06 9.41e-06 4.64e-06 1.01e-05 2.13e-06 1.43e-06 4.01e-06 3.72e-06 6.32e-06 1.92e-06 1.15e-06 3.51e-06 9.34e-06 6.89e-06 1.88e-06 9.94e-06 2.05e-06 2.27e-06 1.89e-06 6.95e-06 7.95e-06 3.42e-06 1.92e-07 6.32e-07 2.26e-06 3.88e-06 1.18e-06 1.73e-06 1.3e-06 1.35e-06 3.63e-07 4.51e-07 8.73e-06 1.61e-06 2.91e-07 3.45e-07 1.62e-06 9.74e-07 2.23e-07 2.59e-07