Genes within 1Mb (chr6:132613976:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 212501 sc-eQTL 3.93e-01 -0.118 0.138 0.113 B L1
ENSG00000079950 STX7 100778 sc-eQTL 9.41e-01 0.00389 0.0523 0.113 B L1
ENSG00000112282 MED23 985734 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0296 0.104 0.113 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -149483 sc-eQTL 8.63e-01 0.017 0.0983 0.113 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -200593 sc-eQTL 5.65e-01 0.0342 0.0594 0.113 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -199363 sc-eQTL 1.75e-01 0.17 0.125 0.113 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 482088 sc-eQTL 1.63e-01 -0.114 0.0817 0.113 B L1
ENSG00000079950 STX7 100778 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0586 0.1 0.113 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 985734 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0876 0.0793 0.113 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -149483 sc-eQTL 4.25e-01 0.0693 0.0867 0.113 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -200593 sc-eQTL 1.65e-01 0.0818 0.0587 0.113 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -199363 sc-eQTL 1.85e-01 0.158 0.119 0.113 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 100778 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0358 0.0986 0.113 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 985734 sc-eQTL 9.16e-02 -0.164 0.0965 0.113 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -149483 sc-eQTL 6.54e-01 0.0517 0.115 0.113 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -200593 sc-eQTL 4.70e-01 0.0284 0.0393 0.113 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -199363 sc-eQTL 9.22e-02 0.2 0.118 0.113 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 100778 sc-eQTL 8.46e-02 -0.156 0.0902 0.113 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -120789 sc-eQTL 1.94e-01 0.146 0.112 0.113 DC L1
ENSG00000112282 MED23 985734 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0903 0.132 0.113 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -100079 sc-eQTL 3.89e-01 -0.105 0.121 0.113 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -149483 sc-eQTL 3.73e-01 -0.116 0.13 0.113 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -200593 sc-eQTL 4.62e-02 0.145 0.0723 0.113 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -199363 sc-eQTL 5.54e-01 0.0684 0.115 0.113 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -489152 sc-eQTL 2.81e-01 0.113 0.105 0.113 DC L1
ENSG00000079950 STX7 100778 sc-eQTL 5.82e-01 0.0371 0.0672 0.113 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -120789 sc-eQTL 3.53e-01 -0.107 0.115 0.113 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 985734 sc-eQTL 2.48e-01 -0.127 0.109 0.113 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -100079 sc-eQTL 3.25e-01 -0.122 0.124 0.113 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -149483 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0302 0.0877 0.113 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -200593 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0318 0.0525 0.113 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -199363 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0412 0.104 0.113 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 100778 sc-eQTL 7.00e-02 -0.186 0.102 0.114 NK L1
ENSG00000112282 MED23 985734 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0883 0.094 0.114 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -149483 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0675 0.128 0.114 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -200593 sc-eQTL 5.05e-01 0.0354 0.053 0.114 NK L1
ENSG00000079950 STX7 100778 sc-eQTL 2.41e-01 -0.12 0.102 0.113 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 985734 sc-eQTL 9.70e-01 0.00485 0.128 0.113 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -149483 sc-eQTL 7.84e-01 0.034 0.124 0.113 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -200593 sc-eQTL 8.61e-01 -0.00865 0.0492 0.113 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -199363 sc-eQTL 8.61e-01 0.0236 0.135 0.113 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 212501 sc-eQTL 1.02e-01 -0.24 0.146 0.112 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 100778 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0985 0.138 0.112 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 985734 sc-eQTL 2.76e-01 -0.167 0.152 0.112 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -149483 sc-eQTL 3.02e-01 0.152 0.146 0.112 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -200593 sc-eQTL 5.95e-01 0.0418 0.0786 0.112 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199363 sc-eQTL 6.86e-01 0.0557 0.138 0.112 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 482088 sc-eQTL 5.55e-02 -0.251 0.13 0.112 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 212501 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0765 0.127 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 100778 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0972 0.0826 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 985734 sc-eQTL 3.00e-01 -0.131 0.126 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -149483 sc-eQTL 2.04e-01 0.159 0.124 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -200593 sc-eQTL 3.98e-02 0.157 0.0757 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199363 sc-eQTL 6.94e-01 0.0542 0.138 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 482088 sc-eQTL 6.99e-01 0.0454 0.117 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 212501 sc-eQTL 1.72e-02 0.303 0.126 0.112 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 100778 sc-eQTL 6.50e-01 0.0455 0.1 0.112 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 985734 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0399 0.129 0.112 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -149483 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0324 0.131 0.112 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -200593 sc-eQTL 8.87e-02 0.107 0.0628 0.112 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199363 sc-eQTL 1.25e-01 0.202 0.131 0.112 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 482088 sc-eQTL 1.29e-01 -0.186 0.122 0.112 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 212501 sc-eQTL 4.34e-01 -0.113 0.144 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 100778 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00441 0.0628 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 985734 sc-eQTL 4.90e-01 0.0777 0.112 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -149483 sc-eQTL 5.69e-01 0.0696 0.122 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -200593 sc-eQTL 4.21e-01 0.0559 0.0694 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199363 sc-eQTL 1.70e-01 0.184 0.133 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 482088 sc-eQTL 8.25e-01 0.0196 0.0888 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 212501 sc-eQTL 1.99e-01 -0.176 0.136 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 100778 sc-eQTL 3.42e-01 0.0709 0.0744 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 985734 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0333 0.138 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -149483 sc-eQTL 6.12e-01 0.0695 0.137 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -200593 sc-eQTL 6.06e-01 0.0374 0.0724 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199363 sc-eQTL 1.67e-01 0.191 0.138 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 482088 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0605 0.0958 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 100778 sc-eQTL 6.18e-01 0.0687 0.138 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 985734 sc-eQTL 3.20e-01 -0.143 0.143 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -149483 sc-eQTL 1.57e-01 0.196 0.138 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -200593 sc-eQTL 8.34e-01 0.0135 0.0642 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199363 sc-eQTL 5.59e-02 -0.247 0.128 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 100778 sc-eQTL 4.56e-01 0.0806 0.108 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 985734 sc-eQTL 2.20e-01 -0.113 0.0919 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -149483 sc-eQTL 5.78e-01 0.0557 0.1 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -200593 sc-eQTL 1.43e-01 0.0949 0.0646 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199363 sc-eQTL 2.10e-01 0.156 0.125 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 100778 sc-eQTL 1.41e-01 -0.176 0.119 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 985734 sc-eQTL 4.96e-01 0.0687 0.101 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -149483 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0195 0.118 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -200593 sc-eQTL 3.38e-01 0.0587 0.0611 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199363 sc-eQTL 8.34e-01 0.0297 0.142 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 100778 sc-eQTL 4.77e-01 0.0987 0.139 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 985734 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0807 0.128 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -149483 sc-eQTL 1.65e-01 -0.184 0.133 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -200593 sc-eQTL 1.54e-01 0.0778 0.0543 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199363 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00501 0.136 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 100778 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0321 0.114 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 985734 sc-eQTL 1.87e-01 -0.155 0.117 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -149483 sc-eQTL 8.87e-01 0.0185 0.13 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -200593 sc-eQTL 6.47e-02 -0.128 0.0691 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199363 sc-eQTL 2.18e-01 0.166 0.134 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 100778 sc-eQTL 7.27e-01 0.0478 0.137 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 985734 sc-eQTL 1.15e-01 -0.173 0.109 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -149483 sc-eQTL 7.65e-01 0.0354 0.118 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -200593 sc-eQTL 2.70e-01 0.0746 0.0675 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199363 sc-eQTL 2.06e-01 0.171 0.135 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 100778 sc-eQTL 2.60e-01 -0.152 0.134 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 985734 sc-eQTL 4.98e-01 0.0916 0.135 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -149483 sc-eQTL 2.58e-01 0.151 0.133 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -200593 sc-eQTL 4.36e-02 0.131 0.0644 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199363 sc-eQTL 3.35e-01 0.138 0.142 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 100778 sc-eQTL 7.29e-01 0.0497 0.143 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 985734 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00929 0.138 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -149483 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0642 0.142 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -200593 sc-eQTL 1.42e-01 0.112 0.0762 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199363 sc-eQTL 4.72e-01 -0.104 0.145 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 100778 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0583 0.129 0.115 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 985734 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0946 0.135 0.115 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -149483 sc-eQTL 6.50e-01 0.0598 0.131 0.115 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -200593 sc-eQTL 1.80e-01 0.0867 0.0644 0.115 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199363 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0258 0.136 0.115 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 100778 sc-eQTL 1.70e-01 -0.186 0.135 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 985734 sc-eQTL 5.29e-01 0.0902 0.143 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -149483 sc-eQTL 7.94e-01 -0.036 0.138 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -200593 sc-eQTL 4.33e-01 0.06 0.0765 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 100778 sc-eQTL 1.11e-01 -0.174 0.109 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 985734 sc-eQTL 3.70e-01 -0.101 0.112 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -149483 sc-eQTL 3.67e-01 -0.124 0.137 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -200593 sc-eQTL 4.35e-01 0.0424 0.0542 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 100778 sc-eQTL 4.47e-01 0.102 0.133 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 985734 sc-eQTL 8.18e-01 -0.031 0.135 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -149483 sc-eQTL 9.56e-01 0.00753 0.135 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -200593 sc-eQTL 4.01e-01 0.0528 0.0628 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 100778 sc-eQTL 4.39e-03 -0.333 0.116 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 985734 sc-eQTL 7.96e-01 0.0315 0.122 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -149483 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0704 0.133 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -200593 sc-eQTL 2.72e-02 0.158 0.0712 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 212501 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0957 0.173 0.081 PB L2
ENSG00000079950 STX7 100778 sc-eQTL 2.33e-01 -0.172 0.144 0.081 PB L2
ENSG00000112282 MED23 985734 sc-eQTL 7.20e-02 0.352 0.194 0.081 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -149483 sc-eQTL 2.94e-01 -0.186 0.176 0.081 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -200593 sc-eQTL 2.56e-01 0.114 0.0998 0.081 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199363 sc-eQTL 4.96e-01 -0.128 0.188 0.081 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 482088 sc-eQTL 1.48e-01 -0.179 0.123 0.081 PB L2
ENSG00000079950 STX7 100778 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0743 0.127 0.111 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 985734 sc-eQTL 8.98e-01 0.0185 0.143 0.111 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -149483 sc-eQTL 8.83e-01 0.0201 0.137 0.111 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -200593 sc-eQTL 8.88e-01 -0.00732 0.0517 0.111 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199363 sc-eQTL 1.24e-01 0.205 0.133 0.111 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 100778 sc-eQTL 3.93e-01 -0.115 0.134 0.113 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 985734 sc-eQTL 9.32e-01 0.0119 0.138 0.113 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -149483 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0938 0.113 0.113 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -200593 sc-eQTL 3.28e-01 0.0489 0.0499 0.113 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199363 sc-eQTL 9.13e-02 0.238 0.14 0.113 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 100778 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000667 0.119 0.115 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -120789 sc-eQTL 1.55e-01 0.167 0.117 0.115 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 985734 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0896 0.153 0.115 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -100079 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0715 0.138 0.115 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -149483 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0461 0.135 0.115 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -200593 sc-eQTL 2.55e-01 0.0757 0.0664 0.115 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199363 sc-eQTL 4.27e-02 0.266 0.13 0.115 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -489152 sc-eQTL 7.47e-01 0.0341 0.105 0.115 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 100778 sc-eQTL 2.57e-01 0.0986 0.0867 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -120789 sc-eQTL 6.75e-02 -0.224 0.122 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 985734 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00631 0.122 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -100079 sc-eQTL 7.29e-02 -0.222 0.123 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -149483 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0771 0.099 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -200593 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0581 0.0549 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199363 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0888 0.106 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 100778 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0293 0.0941 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -120789 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00782 0.118 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 985734 sc-eQTL 2.55e-01 -0.145 0.127 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -100079 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0336 0.128 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -149483 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0821 0.0834 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -200593 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0556 0.0601 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199363 sc-eQTL 3.54e-01 0.103 0.111 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 100778 sc-eQTL 4.87e-01 -0.102 0.146 0.124 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 985734 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0441 0.157 0.124 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -149483 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0124 0.162 0.124 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -200593 sc-eQTL 2.51e-01 0.0708 0.0614 0.124 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199363 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0641 0.159 0.124 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 100778 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0986 0.127 0.111 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -120789 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0309 0.128 0.111 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 985734 sc-eQTL 1.50e-01 -0.202 0.14 0.111 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -100079 sc-eQTL 4.27e-01 0.101 0.126 0.111 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -149483 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0353 0.129 0.111 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -200593 sc-eQTL 2.04e-01 0.0711 0.0557 0.111 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199363 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0744 0.136 0.111 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 100778 sc-eQTL 9.29e-01 0.0086 0.0963 0.109 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -120789 sc-eQTL 3.83e-01 0.118 0.136 0.109 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 985734 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0593 0.138 0.109 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -100079 sc-eQTL 2.63e-01 -0.151 0.134 0.109 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -149483 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0559 0.13 0.109 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -200593 sc-eQTL 8.87e-01 0.00922 0.065 0.109 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199363 sc-eQTL 8.42e-01 0.0229 0.115 0.109 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 100778 sc-eQTL 2.47e-01 -0.129 0.111 0.107 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -120789 sc-eQTL 7.35e-01 0.0381 0.112 0.107 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 985734 sc-eQTL 9.70e-01 0.00593 0.157 0.107 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -100079 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0139 0.115 0.107 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -149483 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00716 0.136 0.107 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -200593 sc-eQTL 9.97e-02 0.154 0.0931 0.107 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199363 sc-eQTL 3.82e-01 -0.122 0.139 0.107 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -489152 sc-eQTL 6.16e-01 0.0668 0.133 0.107 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 212501 sc-eQTL 5.56e-01 0.0785 0.133 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 100778 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0708 0.0754 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 985734 sc-eQTL 2.26e-01 -0.14 0.115 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -149483 sc-eQTL 2.80e-01 0.129 0.119 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -200593 sc-eQTL 4.64e-02 0.135 0.0674 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -199363 sc-eQTL 2.57e-01 0.142 0.125 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 482088 sc-eQTL 2.11e-01 -0.151 0.12 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 212501 sc-eQTL 3.40e-01 -0.137 0.144 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 100778 sc-eQTL 7.43e-01 0.0194 0.0591 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 985734 sc-eQTL 5.72e-01 0.0628 0.111 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -149483 sc-eQTL 4.78e-01 0.0815 0.115 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -200593 sc-eQTL 5.12e-01 0.0456 0.0694 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -199363 sc-eQTL 8.69e-02 0.224 0.13 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 482088 sc-eQTL 9.06e-01 -0.00986 0.0832 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 100778 sc-eQTL 6.51e-01 0.0328 0.0724 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -120789 sc-eQTL 2.79e-01 -0.128 0.118 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 985734 sc-eQTL 7.05e-01 -0.043 0.113 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -100079 sc-eQTL 1.56e-01 -0.174 0.122 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -149483 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0403 0.0813 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -200593 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0562 0.0557 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -199363 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0225 0.0993 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 100778 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0786 0.0888 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -120789 sc-eQTL 5.69e-01 0.0746 0.131 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 985734 sc-eQTL 9.57e-02 -0.212 0.127 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -100079 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0381 0.13 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -149483 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00201 0.122 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -200593 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00517 0.0519 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -199363 sc-eQTL 1.91e-01 -0.165 0.125 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 100778 sc-eQTL 4.31e-02 -0.208 0.102 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 985734 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0702 0.0999 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -149483 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0995 0.13 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -200593 sc-eQTL 3.98e-01 0.045 0.0531 0.112 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 100778 pQTL 0.0102 0.0953 0.0371 0.0 0.0 0.103
ENSG00000112282 MED23 985734 eQTL 0.0329 -0.0575 0.0269 0.00227 0.0 0.103
ENSG00000112299 VNN1 -100079 pQTL 4.48e-10 -0.356 0.0566 0.0 0.0 0.103
ENSG00000112303 VNN2 -149483 eQTL 0.343 0.0199 0.021 0.00122 0.0 0.103
ENSG00000146409 SLC18B1 -199363 eQTL 0.0311 0.0778 0.036 0.0 0.0 0.103


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000154269 \N 985534 2.74e-07 1.3e-07 5.35e-08 2.01e-07 1.01e-07 9.9e-08 1.49e-07 5.2e-08 1.44e-07 4.57e-08 1.54e-07 9e-08 1.41e-07 6.76e-08 6.18e-08 7.3e-08 4.09e-08 1.26e-07 6.07e-08 4.8e-08 1.08e-07 1.23e-07 1.34e-07 3.49e-08 1.4e-07 1.14e-07 1.07e-07 9.92e-08 1.08e-07 1.07e-07 9.64e-08 4.93e-08 3.68e-08 8.44e-08 7.36e-08 2.68e-08 5.02e-08 9.23e-08 7.2e-08 3.86e-08 3.59e-08 1.33e-07 5.2e-08 7.35e-09 4.67e-08 1.86e-08 1.22e-07 1.91e-09 4.9e-08
ENSG00000228495 \N 482061 1.01e-06 8.69e-07 3.06e-07 3.63e-07 1.78e-07 3.18e-07 6.18e-07 1.59e-07 6.03e-07 2.43e-07 1.07e-06 5.35e-07 9.23e-07 1.84e-07 4.03e-07 3.36e-07 6.98e-07 4.27e-07 3.43e-07 4.71e-07 2.52e-07 4.14e-07 3.84e-07 2.49e-07 9.82e-07 2.54e-07 4.34e-07 5.33e-07 4.63e-07 6.81e-07 3.56e-07 2.89e-07 1.81e-07 1.69e-07 3.71e-07 3.95e-07 6.25e-07 1.24e-07 6.81e-08 8.66e-09 8.81e-08 4.95e-07 5.53e-08 1.14e-07 1.92e-07 4.28e-08 1.58e-07 8.96e-08 6.26e-08