logo

Genes within 1Mb (chr6:132613224:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 211749 sc-eQTL 4.45e-01 0.114 0.149 0.107 B L1
ENSG00000079950 STX7 100026 sc-eQTL 2.95e-01 0.0588 0.056 0.107 B L1
ENSG00000112282 MED23 984982 sc-eQTL 3.16e-01 0.112 0.112 0.107 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -150235 sc-eQTL 3.62e-01 0.0963 0.105 0.107 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -201345 sc-eQTL 8.96e-02 0.108 0.0634 0.107 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -200115 sc-eQTL 2.73e-02 0.295 0.133 0.107 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 481336 sc-eQTL 4.53e-02 0.176 0.0873 0.107 B L1
ENSG00000079950 STX7 100026 sc-eQTL 9.54e-01 0.00627 0.109 0.107 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 984982 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0974 0.0861 0.107 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -150235 sc-eQTL 5.40e-01 0.0579 0.0942 0.107 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -201345 sc-eQTL 3.32e-01 0.0621 0.0639 0.107 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -200115 sc-eQTL 5.38e-01 0.0798 0.13 0.107 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 100026 sc-eQTL 5.45e-01 0.0657 0.108 0.107 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 984982 sc-eQTL 3.98e-01 0.0904 0.107 0.107 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -150235 sc-eQTL 4.39e-01 0.0979 0.126 0.107 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -201345 sc-eQTL 5.73e-01 0.0244 0.0432 0.107 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -200115 sc-eQTL 2.51e-01 0.15 0.13 0.107 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 100026 sc-eQTL 2.66e-01 -0.113 0.101 0.104 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -121541 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0879 0.125 0.104 DC L1
ENSG00000112282 MED23 984982 sc-eQTL 4.08e-01 -0.122 0.147 0.104 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -100831 sc-eQTL 2.01e-01 0.173 0.135 0.104 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -150235 sc-eQTL 1.86e-01 0.192 0.144 0.104 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -201345 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0585 0.0812 0.104 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -200115 sc-eQTL 3.29e-01 0.126 0.128 0.104 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -489904 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0173 0.117 0.104 DC L1
ENSG00000079950 STX7 100026 sc-eQTL 2.96e-02 -0.162 0.0738 0.107 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -121541 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0303 0.128 0.107 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 984982 sc-eQTL 3.73e-01 0.108 0.121 0.107 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -100831 sc-eQTL 6.19e-01 0.0686 0.138 0.107 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -150235 sc-eQTL 4.22e-01 0.0782 0.0972 0.107 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -201345 sc-eQTL 5.51e-01 0.0348 0.0583 0.107 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -200115 sc-eQTL 3.93e-01 0.0987 0.115 0.107 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 100026 sc-eQTL 5.02e-01 0.0744 0.111 0.107 NK L1
ENSG00000112282 MED23 984982 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00394 0.101 0.107 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -150235 sc-eQTL 3.82e-02 0.285 0.136 0.107 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -201345 sc-eQTL 5.77e-02 0.108 0.0565 0.107 NK L1
ENSG00000079950 STX7 100026 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0813 0.113 0.107 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 984982 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0451 0.142 0.107 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -150235 sc-eQTL 2.91e-01 -0.145 0.137 0.107 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -201345 sc-eQTL 7.45e-01 0.0178 0.0545 0.107 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -200115 sc-eQTL 5.64e-01 0.0861 0.149 0.107 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 211749 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0512 0.164 0.102 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 100026 sc-eQTL 2.79e-01 -0.167 0.154 0.102 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 984982 sc-eQTL 2.49e-01 0.197 0.17 0.102 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -150235 sc-eQTL 6.62e-02 -0.301 0.163 0.102 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -201345 sc-eQTL 4.88e-01 -0.061 0.0878 0.102 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -200115 sc-eQTL 3.98e-01 0.13 0.154 0.102 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 481336 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0574 0.147 0.102 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 211749 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0825 0.141 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 100026 sc-eQTL 2.58e-01 0.104 0.092 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 984982 sc-eQTL 1.82e-01 0.187 0.14 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -150235 sc-eQTL 9.02e-01 0.0172 0.139 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -201345 sc-eQTL 7.87e-01 0.023 0.0851 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -200115 sc-eQTL 1.29e-01 0.232 0.152 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 481336 sc-eQTL 2.31e-02 0.295 0.129 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 211749 sc-eQTL 3.98e-01 -0.119 0.14 0.108 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 100026 sc-eQTL 7.78e-01 0.0311 0.11 0.108 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 984982 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0483 0.142 0.108 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -150235 sc-eQTL 8.58e-01 0.0259 0.144 0.108 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -201345 sc-eQTL 5.76e-01 0.0388 0.0694 0.108 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -200115 sc-eQTL 1.02e-01 -0.237 0.144 0.108 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 481336 sc-eQTL 6.09e-01 0.0692 0.135 0.108 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 211749 sc-eQTL 5.85e-02 0.296 0.155 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 100026 sc-eQTL 4.96e-01 0.0467 0.0685 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 984982 sc-eQTL 6.23e-01 0.0604 0.123 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -150235 sc-eQTL 7.29e-02 0.238 0.132 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -201345 sc-eQTL 6.25e-02 0.141 0.0752 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -200115 sc-eQTL 4.45e-02 0.293 0.145 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 481336 sc-eQTL 6.93e-01 0.0383 0.0968 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 211749 sc-eQTL 6.89e-01 0.0608 0.152 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 100026 sc-eQTL 6.01e-01 0.0433 0.0826 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 984982 sc-eQTL 4.69e-01 0.111 0.152 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -150235 sc-eQTL 4.16e-01 -0.124 0.151 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -201345 sc-eQTL 1.40e-01 0.118 0.0799 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -200115 sc-eQTL 1.98e-01 0.197 0.153 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 481336 sc-eQTL 2.04e-02 0.245 0.105 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 100026 sc-eQTL 2.38e-01 -0.18 0.152 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 984982 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0984 0.158 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -150235 sc-eQTL 1.05e-01 -0.249 0.153 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -201345 sc-eQTL 3.96e-01 0.0604 0.071 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -200115 sc-eQTL 1.59e-01 0.202 0.143 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 100026 sc-eQTL 7.96e-01 0.0303 0.117 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 984982 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0426 0.0999 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -150235 sc-eQTL 2.10e-01 0.136 0.108 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -201345 sc-eQTL 4.64e-01 0.0516 0.0703 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -200115 sc-eQTL 5.57e-01 0.0797 0.135 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 100026 sc-eQTL 4.37e-01 -0.101 0.129 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 984982 sc-eQTL 2.11e-01 -0.136 0.108 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -150235 sc-eQTL 9.05e-01 0.0153 0.128 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -201345 sc-eQTL 1.38e-01 0.0979 0.0658 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -200115 sc-eQTL 9.58e-01 0.00804 0.153 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 100026 sc-eQTL 3.43e-01 0.144 0.151 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 984982 sc-eQTL 6.02e-01 0.0729 0.139 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -150235 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0819 0.145 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -201345 sc-eQTL 7.19e-01 0.0215 0.0596 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -200115 sc-eQTL 6.64e-01 0.0643 0.148 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 100026 sc-eQTL 3.93e-01 -0.108 0.126 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 984982 sc-eQTL 9.55e-01 0.00738 0.129 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -150235 sc-eQTL 7.17e-01 0.052 0.143 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -201345 sc-eQTL 1.20e-02 0.192 0.0757 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -200115 sc-eQTL 4.98e-01 0.101 0.149 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 100026 sc-eQTL 8.06e-02 0.262 0.149 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 984982 sc-eQTL 3.22e-01 0.12 0.121 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -150235 sc-eQTL 3.52e-01 0.121 0.129 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -201345 sc-eQTL 4.31e-01 0.0585 0.0742 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -200115 sc-eQTL 2.26e-01 0.18 0.149 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 100026 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0375 0.15 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 984982 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0259 0.151 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -150235 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0861 0.149 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -201345 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0505 0.0725 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -200115 sc-eQTL 9.69e-01 0.00616 0.159 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 100026 sc-eQTL 6.76e-01 0.0675 0.161 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 984982 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00752 0.155 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -150235 sc-eQTL 2.77e-01 0.174 0.16 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -201345 sc-eQTL 4.02e-01 0.0724 0.0862 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -200115 sc-eQTL 1.38e-01 -0.242 0.162 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 100026 sc-eQTL 8.16e-01 0.0336 0.144 0.106 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 984982 sc-eQTL 7.85e-01 0.0411 0.151 0.106 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -150235 sc-eQTL 2.91e-01 -0.155 0.146 0.106 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -201345 sc-eQTL 3.94e-01 0.0615 0.072 0.106 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -200115 sc-eQTL 4.30e-01 0.119 0.151 0.106 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 100026 sc-eQTL 2.87e-01 0.16 0.15 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 984982 sc-eQTL 1.92e-01 0.207 0.158 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -150235 sc-eQTL 7.25e-01 0.0536 0.152 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -201345 sc-eQTL 2.64e-01 0.0948 0.0847 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 100026 sc-eQTL 9.96e-01 0.000567 0.118 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 984982 sc-eQTL 7.36e-01 0.0409 0.121 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -150235 sc-eQTL 3.17e-01 0.147 0.147 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -201345 sc-eQTL 1.41e-02 0.143 0.0577 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 100026 sc-eQTL 2.79e-01 0.157 0.144 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 984982 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0203 0.146 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -150235 sc-eQTL 8.45e-02 0.252 0.145 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -201345 sc-eQTL 2.69e-01 0.0754 0.068 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 100026 sc-eQTL 3.89e-01 0.111 0.129 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 984982 sc-eQTL 2.55e-01 -0.152 0.133 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -150235 sc-eQTL 5.46e-03 0.401 0.143 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -201345 sc-eQTL 1.12e-01 0.125 0.0784 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 211749 sc-eQTL 6.62e-01 -0.07 0.16 0.111 PB L2
ENSG00000079950 STX7 100026 sc-eQTL 2.63e-01 -0.149 0.133 0.111 PB L2
ENSG00000112282 MED23 984982 sc-eQTL 9.40e-01 0.0137 0.182 0.111 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -150235 sc-eQTL 7.92e-01 0.0431 0.163 0.111 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -201345 sc-eQTL 6.74e-01 0.039 0.0925 0.111 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -200115 sc-eQTL 1.17e-01 0.271 0.172 0.111 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 481336 sc-eQTL 6.35e-01 0.0542 0.114 0.111 PB L2
ENSG00000079950 STX7 100026 sc-eQTL 4.19e-01 -0.11 0.136 0.104 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 984982 sc-eQTL 9.31e-01 0.0133 0.153 0.104 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -150235 sc-eQTL 2.19e-01 0.18 0.146 0.104 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -201345 sc-eQTL 5.98e-01 0.0292 0.0553 0.104 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -200115 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0628 0.143 0.104 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 100026 sc-eQTL 7.56e-01 0.0459 0.148 0.107 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 984982 sc-eQTL 1.06e-01 -0.245 0.151 0.107 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -150235 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0142 0.124 0.107 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -201345 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0105 0.0549 0.107 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -200115 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0618 0.155 0.107 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 100026 sc-eQTL 3.91e-01 -0.106 0.124 0.11 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -121541 sc-eQTL 4.84e-02 -0.242 0.122 0.11 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 984982 sc-eQTL 4.98e-01 -0.108 0.16 0.11 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -100831 sc-eQTL 8.47e-02 0.249 0.144 0.11 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -150235 sc-eQTL 9.15e-01 0.0151 0.141 0.11 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -201345 sc-eQTL 5.42e-01 0.0425 0.0695 0.11 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -200115 sc-eQTL 4.91e-01 0.0949 0.138 0.11 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -489904 sc-eQTL 3.45e-01 0.104 0.11 0.11 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 100026 sc-eQTL 1.43e-01 -0.141 0.0956 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -121541 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0474 0.136 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 984982 sc-eQTL 6.43e-01 0.0624 0.134 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -100831 sc-eQTL 2.78e-01 0.149 0.137 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -150235 sc-eQTL 2.05e-01 0.139 0.109 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -201345 sc-eQTL 1.00e+00 -2.52e-05 0.0608 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -200115 sc-eQTL 1.05e-01 0.19 0.117 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 100026 sc-eQTL 2.11e-01 -0.13 0.104 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -121541 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0374 0.13 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 984982 sc-eQTL 2.64e-01 0.157 0.141 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -100831 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0695 0.141 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -150235 sc-eQTL 6.40e-01 0.0433 0.0923 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -201345 sc-eQTL 6.61e-01 0.0292 0.0665 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -200115 sc-eQTL 8.77e-01 -0.019 0.123 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 100026 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00752 0.164 0.103 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 984982 sc-eQTL 7.40e-01 0.0583 0.175 0.103 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -150235 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0949 0.181 0.103 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -201345 sc-eQTL 6.98e-01 0.0268 0.0689 0.103 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -200115 sc-eQTL 3.13e-01 -0.18 0.178 0.103 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 100026 sc-eQTL 1.14e-01 -0.218 0.137 0.109 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -121541 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0651 0.139 0.109 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 984982 sc-eQTL 2.74e-01 0.167 0.152 0.109 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -100831 sc-eQTL 1.67e-01 0.19 0.137 0.109 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -150235 sc-eQTL 6.91e-02 0.253 0.139 0.109 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -201345 sc-eQTL 5.75e-01 0.0342 0.0608 0.109 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -200115 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0199 0.148 0.109 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 100026 sc-eQTL 1.59e-01 -0.147 0.104 0.106 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -121541 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0258 0.148 0.106 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 984982 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0468 0.149 0.106 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -100831 sc-eQTL 3.28e-01 0.143 0.146 0.106 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -150235 sc-eQTL 8.66e-01 0.0238 0.141 0.106 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -201345 sc-eQTL 6.59e-02 0.129 0.07 0.106 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -200115 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0746 0.125 0.106 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 100026 sc-eQTL 2.46e-01 -0.145 0.124 0.099 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -121541 sc-eQTL 7.92e-01 0.0333 0.126 0.099 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 984982 sc-eQTL 3.45e-01 -0.166 0.175 0.099 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -100831 sc-eQTL 8.60e-01 0.0227 0.128 0.099 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -150235 sc-eQTL 1.50e-02 0.368 0.15 0.099 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -201345 sc-eQTL 7.58e-02 -0.186 0.104 0.099 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -200115 sc-eQTL 4.14e-01 0.127 0.155 0.099 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -489904 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00527 0.149 0.099 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 211749 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00475 0.148 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 100026 sc-eQTL 4.56e-01 0.0625 0.0837 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 984982 sc-eQTL 1.06e-01 0.207 0.127 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -150235 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0789 0.132 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -201345 sc-eQTL 4.71e-01 0.0545 0.0754 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -200115 sc-eQTL 2.43e-01 0.162 0.138 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 481336 sc-eQTL 8.90e-01 0.0185 0.134 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 211749 sc-eQTL 1.26e-01 0.239 0.155 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 100026 sc-eQTL 3.50e-01 0.0599 0.064 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 984982 sc-eQTL 5.95e-01 0.0642 0.12 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -150235 sc-eQTL 2.22e-01 0.152 0.124 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -201345 sc-eQTL 4.84e-02 0.148 0.0747 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -200115 sc-eQTL 1.09e-01 0.227 0.141 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 481336 sc-eQTL 1.85e-01 0.12 0.09 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 100026 sc-eQTL 6.18e-02 -0.15 0.0799 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -121541 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0164 0.131 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 984982 sc-eQTL 3.37e-01 0.121 0.126 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -100831 sc-eQTL 5.27e-01 0.0866 0.137 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -150235 sc-eQTL 3.86e-01 0.0786 0.0904 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -201345 sc-eQTL 7.96e-01 0.0161 0.0621 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -200115 sc-eQTL 3.01e-01 0.114 0.11 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 100026 sc-eQTL 6.04e-02 -0.184 0.0972 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -121541 sc-eQTL 2.36e-01 -0.171 0.144 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 984982 sc-eQTL 4.70e-01 0.102 0.14 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -100831 sc-eQTL 5.88e-01 0.0775 0.143 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -150235 sc-eQTL 8.35e-01 0.0281 0.135 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -201345 sc-eQTL 5.73e-03 0.157 0.0561 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -200115 sc-eQTL 5.24e-01 0.0886 0.139 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 100026 sc-eQTL 4.23e-01 0.0889 0.111 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 984982 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00695 0.108 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -150235 sc-eQTL 1.64e-02 0.335 0.138 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -201345 sc-eQTL 4.56e-02 0.114 0.0568 0.108 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112303 VNN2 -150235 eQTL 0.565 -0.0116 0.0201 0.00117 0.0 0.121
ENSG00000146409 SLC18B1 -200115 eQTL 0.0158 0.0834 0.0345 0.0 0.0 0.121
ENSG00000234484 AL032821.1 -139451 eQTL 0.0229 -0.11 0.0482 0.0 0.0 0.121

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina