logo

Genes within 1Mb (chr6:132612337:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 210862 sc-eQTL 6.81e-02 -0.294 0.16 0.081 B L1
ENSG00000079950 STX7 99139 sc-eQTL 2.13e-01 0.0758 0.0607 0.081 B L1
ENSG00000112282 MED23 984095 sc-eQTL 5.67e-01 0.0695 0.121 0.081 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -151122 sc-eQTL 1.16e-01 0.18 0.114 0.081 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -202232 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0511 0.0692 0.081 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -201002 sc-eQTL 3.46e-01 0.137 0.145 0.081 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 480449 sc-eQTL 6.31e-01 0.046 0.0956 0.081 B L1
ENSG00000079950 STX7 99139 sc-eQTL 4.29e-01 0.0942 0.119 0.081 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 984095 sc-eQTL 3.25e-01 0.0932 0.0944 0.081 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -151122 sc-eQTL 1.84e-01 -0.137 0.103 0.081 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -202232 sc-eQTL 2.54e-01 -0.08 0.07 0.081 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -201002 sc-eQTL 6.92e-01 0.0563 0.142 0.081 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 99139 sc-eQTL 8.41e-01 0.0234 0.117 0.081 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 984095 sc-eQTL 2.05e-01 0.146 0.115 0.081 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -151122 sc-eQTL 1.56e-01 0.193 0.136 0.081 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -202232 sc-eQTL 7.98e-01 0.012 0.0466 0.081 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -201002 sc-eQTL 8.94e-02 0.239 0.14 0.081 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 99139 sc-eQTL 7.63e-01 0.0335 0.111 0.077 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -122428 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00281 0.138 0.077 DC L1
ENSG00000112282 MED23 984095 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0782 0.161 0.077 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -101718 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0793 0.148 0.077 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -151122 sc-eQTL 7.66e-01 0.0473 0.159 0.077 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -202232 sc-eQTL 8.69e-01 0.0147 0.0891 0.077 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -201002 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0434 0.141 0.077 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -490791 sc-eQTL 5.89e-01 0.0694 0.128 0.077 DC L1
ENSG00000079950 STX7 99139 sc-eQTL 1.00e+00 -4.04e-06 0.0798 0.081 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -122428 sc-eQTL 9.32e-02 -0.23 0.136 0.081 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 984095 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00189 0.13 0.081 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -101718 sc-eQTL 1.14e-03 0.474 0.144 0.081 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -151122 sc-eQTL 3.27e-01 0.102 0.104 0.081 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -202232 sc-eQTL 1.29e-02 -0.154 0.0614 0.081 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -201002 sc-eQTL 1.22e-01 0.191 0.123 0.081 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 99139 sc-eQTL 9.21e-01 0.0118 0.12 0.082 NK L1
ENSG00000112282 MED23 984095 sc-eQTL 2.71e-01 0.12 0.109 0.082 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -151122 sc-eQTL 8.47e-02 -0.256 0.148 0.082 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -202232 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0414 0.0616 0.082 NK L1
ENSG00000079950 STX7 99139 sc-eQTL 1.01e-01 0.197 0.119 0.081 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 984095 sc-eQTL 1.69e-02 0.356 0.148 0.081 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -151122 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0252 0.145 0.081 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -202232 sc-eQTL 2.15e-01 0.0713 0.0573 0.081 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -201002 sc-eQTL 3.01e-01 0.163 0.157 0.081 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 210862 sc-eQTL 2.30e-03 0.497 0.161 0.077 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 99139 sc-eQTL 2.93e-01 0.163 0.154 0.077 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 984095 sc-eQTL 6.85e-03 -0.46 0.168 0.077 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -151122 sc-eQTL 1.61e-01 0.23 0.164 0.077 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -202232 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00627 0.0883 0.077 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -201002 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0142 0.155 0.077 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 480449 sc-eQTL 6.85e-01 0.0599 0.147 0.077 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 210862 sc-eQTL 1.80e-01 -0.2 0.149 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 99139 sc-eQTL 1.28e-01 0.149 0.0974 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 984095 sc-eQTL 1.32e-01 0.224 0.148 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -151122 sc-eQTL 4.08e-01 -0.122 0.147 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -202232 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0771 0.0902 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -201002 sc-eQTL 6.40e-02 0.301 0.161 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 480449 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0761 0.138 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 210862 sc-eQTL 2.72e-01 -0.163 0.148 0.08 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 99139 sc-eQTL 8.70e-01 0.0191 0.117 0.08 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 984095 sc-eQTL 5.49e-01 0.0902 0.15 0.08 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -151122 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0538 0.152 0.08 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -202232 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0453 0.0734 0.08 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -201002 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0883 0.153 0.08 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 480449 sc-eQTL 5.46e-01 0.0863 0.143 0.08 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 210862 sc-eQTL 9.09e-03 -0.435 0.165 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 99139 sc-eQTL 3.49e-01 0.0686 0.0732 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 984095 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0406 0.131 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -151122 sc-eQTL 2.72e-01 0.156 0.142 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -202232 sc-eQTL 9.83e-02 -0.134 0.0806 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -201002 sc-eQTL 1.54e-01 0.223 0.156 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 480449 sc-eQTL 3.82e-01 0.0906 0.103 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 210862 sc-eQTL 3.30e-01 -0.154 0.158 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 99139 sc-eQTL 6.39e-01 0.0404 0.0861 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 984095 sc-eQTL 8.49e-01 0.0303 0.159 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -151122 sc-eQTL 3.25e-01 0.156 0.158 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -202232 sc-eQTL 1.98e-01 -0.108 0.0834 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -201002 sc-eQTL 4.29e-01 -0.126 0.16 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 480449 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00453 0.111 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 99139 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0458 0.157 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 984095 sc-eQTL 3.30e-01 0.159 0.163 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -151122 sc-eQTL 3.59e-01 -0.146 0.158 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -202232 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000582 0.0733 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -201002 sc-eQTL 4.15e-01 0.121 0.148 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 99139 sc-eQTL 4.61e-01 0.0931 0.126 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 984095 sc-eQTL 6.43e-01 0.05 0.108 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -151122 sc-eQTL 2.50e-01 -0.135 0.117 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -202232 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0678 0.0758 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -201002 sc-eQTL 7.22e-01 0.052 0.146 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 99139 sc-eQTL 5.06e-01 0.0938 0.141 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 984095 sc-eQTL 5.15e-01 0.0773 0.118 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -151122 sc-eQTL 2.75e-01 -0.152 0.139 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -202232 sc-eQTL 9.05e-01 0.00857 0.0721 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -201002 sc-eQTL 6.53e-01 0.0751 0.167 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 99139 sc-eQTL 2.86e-01 0.175 0.164 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 984095 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0472 0.151 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -151122 sc-eQTL 1.87e-01 0.208 0.157 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -202232 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0673 0.0644 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -201002 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0608 0.16 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 99139 sc-eQTL 3.32e-01 0.129 0.133 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 984095 sc-eQTL 1.99e-01 0.175 0.136 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -151122 sc-eQTL 9.14e-01 0.0163 0.151 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -202232 sc-eQTL 6.87e-01 0.0325 0.0807 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -201002 sc-eQTL 7.57e-02 0.277 0.155 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 99139 sc-eQTL 2.43e-01 -0.188 0.16 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 984095 sc-eQTL 9.61e-01 0.00639 0.129 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -151122 sc-eQTL 3.11e-01 0.141 0.139 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -202232 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0329 0.0795 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -201002 sc-eQTL 2.97e-01 0.166 0.159 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 99139 sc-eQTL 3.35e-01 -0.159 0.165 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 984095 sc-eQTL 4.10e-01 0.137 0.165 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -151122 sc-eQTL 7.75e-01 -0.047 0.164 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -202232 sc-eQTL 4.15e-01 0.0651 0.0797 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -201002 sc-eQTL 5.67e-01 -0.1 0.175 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 99139 sc-eQTL 8.52e-01 -0.031 0.166 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 984095 sc-eQTL 2.07e-01 0.202 0.159 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -151122 sc-eQTL 5.60e-01 0.0964 0.165 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -202232 sc-eQTL 8.16e-01 0.0207 0.0888 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -201002 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0129 0.168 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 99139 sc-eQTL 2.17e-01 0.187 0.151 0.08 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 984095 sc-eQTL 3.73e-02 0.328 0.156 0.08 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -151122 sc-eQTL 6.21e-01 -0.076 0.154 0.08 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -202232 sc-eQTL 5.54e-01 0.0447 0.0755 0.08 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -201002 sc-eQTL 6.05e-01 0.0821 0.158 0.08 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 99139 sc-eQTL 3.68e-01 0.144 0.159 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 984095 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00449 0.169 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -151122 sc-eQTL 5.64e-02 0.308 0.161 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -202232 sc-eQTL 9.50e-01 0.00563 0.0903 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 99139 sc-eQTL 6.78e-01 0.0525 0.126 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 984095 sc-eQTL 7.78e-01 0.0367 0.13 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -151122 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0965 0.158 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -202232 sc-eQTL 8.27e-01 0.0137 0.0627 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 99139 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0475 0.155 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 984095 sc-eQTL 1.52e-01 0.224 0.156 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -151122 sc-eQTL 2.92e-01 -0.165 0.157 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -202232 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0434 0.0731 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 99139 sc-eQTL 7.73e-01 -0.042 0.146 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 984095 sc-eQTL 1.42e-01 0.221 0.15 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -151122 sc-eQTL 1.48e-03 -0.515 0.16 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -202232 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0353 0.0888 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 210862 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0209 0.157 0.089 PB L2
ENSG00000079950 STX7 99139 sc-eQTL 6.70e-01 0.056 0.131 0.089 PB L2
ENSG00000112282 MED23 984095 sc-eQTL 9.96e-02 0.292 0.176 0.089 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -151122 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0288 0.16 0.089 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -202232 sc-eQTL 2.11e-01 0.114 0.0902 0.089 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -201002 sc-eQTL 1.65e-01 -0.236 0.169 0.089 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 480449 sc-eQTL 3.50e-03 0.322 0.108 0.089 PB L2
ENSG00000079950 STX7 99139 sc-eQTL 5.33e-01 0.0895 0.143 0.083 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 984095 sc-eQTL 2.41e-01 0.189 0.161 0.083 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -151122 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0798 0.154 0.083 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -202232 sc-eQTL 1.03e-01 0.0948 0.0579 0.083 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -201002 sc-eQTL 2.71e-01 -0.166 0.15 0.083 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 99139 sc-eQTL 3.34e-01 0.15 0.156 0.081 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 984095 sc-eQTL 5.02e-01 -0.108 0.16 0.081 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -151122 sc-eQTL 8.49e-01 0.025 0.131 0.081 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -202232 sc-eQTL 4.57e-01 0.0432 0.0579 0.081 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -201002 sc-eQTL 1.81e-01 0.219 0.163 0.081 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 99139 sc-eQTL 9.37e-01 0.0111 0.14 0.073 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -122428 sc-eQTL 6.55e-01 0.0621 0.139 0.073 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 984095 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0727 0.181 0.073 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -101718 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0312 0.163 0.073 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -151122 sc-eQTL 4.32e-01 0.125 0.159 0.073 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -202232 sc-eQTL 3.39e-01 0.0751 0.0783 0.073 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -201002 sc-eQTL 2.13e-01 -0.193 0.155 0.073 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -490791 sc-eQTL 9.62e-01 0.00588 0.124 0.073 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 99139 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0505 0.103 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -122428 sc-eQTL 2.61e-01 -0.163 0.145 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 984095 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0174 0.143 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -101718 sc-eQTL 7.87e-03 0.386 0.144 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -151122 sc-eQTL 6.73e-01 0.0494 0.117 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -202232 sc-eQTL 8.95e-03 -0.169 0.064 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -201002 sc-eQTL 2.01e-01 0.16 0.125 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 99139 sc-eQTL 3.75e-01 0.101 0.113 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -122428 sc-eQTL 8.56e-02 -0.243 0.141 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 984095 sc-eQTL 8.23e-01 0.0343 0.154 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -101718 sc-eQTL 3.07e-02 0.331 0.152 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -151122 sc-eQTL 3.50e-01 0.0941 0.1 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -202232 sc-eQTL 1.87e-01 -0.0956 0.0722 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -201002 sc-eQTL 9.32e-01 0.0114 0.134 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 99139 sc-eQTL 2.23e-02 0.404 0.175 0.085 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 984095 sc-eQTL 1.44e-01 0.279 0.19 0.085 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -151122 sc-eQTL 9.34e-01 0.0164 0.197 0.085 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -202232 sc-eQTL 1.59e-01 0.105 0.0745 0.085 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -201002 sc-eQTL 3.97e-03 0.551 0.188 0.085 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 99139 sc-eQTL 1.97e-01 0.198 0.153 0.078 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -122428 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0755 0.155 0.078 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 984095 sc-eQTL 6.85e-01 0.0692 0.17 0.078 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -101718 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0524 0.153 0.078 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -151122 sc-eQTL 1.14e-01 0.246 0.155 0.078 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -202232 sc-eQTL 7.08e-01 0.0254 0.0678 0.078 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -201002 sc-eQTL 2.42e-01 0.193 0.165 0.078 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 99139 sc-eQTL 3.48e-01 0.107 0.113 0.077 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -122428 sc-eQTL 4.13e-02 0.326 0.158 0.077 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 984095 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0407 0.162 0.077 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -101718 sc-eQTL 3.65e-03 0.458 0.156 0.077 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -151122 sc-eQTL 8.29e-01 0.033 0.153 0.077 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -202232 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0689 0.0765 0.077 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -201002 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0425 0.135 0.077 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 99139 sc-eQTL 4.70e-01 0.0942 0.13 0.079 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -122428 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0193 0.131 0.079 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 984095 sc-eQTL 6.41e-01 0.0853 0.183 0.079 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -101718 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0595 0.133 0.079 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -151122 sc-eQTL 5.68e-02 -0.301 0.157 0.079 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -202232 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0393 0.109 0.079 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -201002 sc-eQTL 6.61e-01 0.0711 0.162 0.079 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -490791 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0568 0.155 0.079 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 210862 sc-eQTL 2.22e-01 -0.192 0.157 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 99139 sc-eQTL 9.62e-02 0.148 0.0888 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 984095 sc-eQTL 7.07e-01 0.0514 0.137 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -151122 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0815 0.141 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -202232 sc-eQTL 2.04e-01 -0.102 0.0803 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -201002 sc-eQTL 4.66e-02 0.293 0.146 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 480449 sc-eQTL 6.64e-01 0.062 0.143 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 210862 sc-eQTL 3.28e-02 -0.355 0.165 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 99139 sc-eQTL 6.67e-01 0.0295 0.0685 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 984095 sc-eQTL 9.49e-01 0.00829 0.129 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -151122 sc-eQTL 1.74e-01 0.181 0.133 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -202232 sc-eQTL 1.73e-01 -0.11 0.0802 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -201002 sc-eQTL 5.34e-01 0.0946 0.152 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 480449 sc-eQTL 6.09e-01 0.0494 0.0964 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 99139 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00827 0.0854 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -122428 sc-eQTL 1.01e-01 -0.228 0.138 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 984095 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00946 0.134 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -101718 sc-eQTL 4.67e-03 0.407 0.142 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -151122 sc-eQTL 5.22e-01 0.0615 0.0959 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -202232 sc-eQTL 1.96e-02 -0.153 0.065 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -201002 sc-eQTL 2.35e-01 0.139 0.117 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 99139 sc-eQTL 3.95e-01 0.0898 0.105 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -122428 sc-eQTL 6.01e-01 0.0813 0.155 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 984095 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0332 0.151 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -101718 sc-eQTL 4.72e-02 0.305 0.153 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -151122 sc-eQTL 1.25e-01 0.222 0.144 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -202232 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000447 0.0616 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -201002 sc-eQTL 7.27e-02 0.268 0.148 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 99139 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0526 0.12 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 984095 sc-eQTL 1.37e-01 0.174 0.116 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -151122 sc-eQTL 5.51e-02 -0.292 0.151 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -202232 sc-eQTL 8.35e-01 -0.013 0.0623 0.082 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 99139 eQTL 0.00934 -0.0657 0.0252 0.0 0.0 0.105
ENSG00000112299 VNN1 -101718 pQTL 7.61e-12 0.393 0.0568 0.0 0.0 0.0983
ENSG00000112299 VNN1 -101718 eQTL 1.21e-07 0.182 0.0341 0.0 0.0 0.105
ENSG00000118523 CCN2 660965 pQTL 0.00018 -0.129 0.0345 0.00169 0.0 0.0983

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112299 VNN1 -101718 4.99e-06 5.16e-06 6.82e-07 3.42e-06 1.54e-06 1.57e-06 6.29e-06 1.25e-06 4.9e-06 2.81e-06 6.67e-06 3.31e-06 8.29e-06 1.76e-06 1.06e-06 4e-06 1.93e-06 4.01e-06 1.47e-06 1.51e-06 2.71e-06 5.53e-06 4.74e-06 1.99e-06 8.14e-06 2.08e-06 2.39e-06 1.78e-06 5.03e-06 4.67e-06 2.69e-06 4.46e-07 7.66e-07 2.22e-06 2.03e-06 1.17e-06 1.06e-06 4.51e-07 9.69e-07 6.1e-07 7.59e-07 6.66e-06 5.26e-07 1.64e-07 7.54e-07 1.08e-06 1.16e-06 6.84e-07 5.28e-07