Genes within 1Mb (chr6:132610782:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 209307 sc-eQTL 1.49e-01 -0.157 0.108 0.207 B L1
ENSG00000079950 STX7 97584 sc-eQTL 3.18e-02 -0.0878 0.0406 0.207 B L1
ENSG00000112282 MED23 982540 sc-eQTL 6.47e-01 0.0376 0.0818 0.207 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -152677 sc-eQTL 1.60e-01 0.108 0.0768 0.207 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -203787 sc-eQTL 1.31e-01 -0.0704 0.0464 0.207 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -202557 sc-eQTL 1.85e-01 -0.13 0.0978 0.207 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 478894 sc-eQTL 6.31e-01 0.031 0.0644 0.207 B L1
ENSG00000079950 STX7 97584 sc-eQTL 5.70e-01 0.0452 0.0794 0.207 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 982540 sc-eQTL 3.45e-01 0.0595 0.0629 0.207 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -152677 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0295 0.0688 0.207 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -203787 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0123 0.0468 0.207 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -202557 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0344 0.0946 0.207 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 97584 sc-eQTL 5.87e-01 0.0434 0.0797 0.207 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 982540 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00385 0.0786 0.207 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -152677 sc-eQTL 4.44e-01 0.0713 0.093 0.207 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -203787 sc-eQTL 9.95e-01 0.000201 0.0318 0.207 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -202557 sc-eQTL 1.63e-01 -0.134 0.0958 0.207 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 97584 sc-eQTL 9.35e-03 0.192 0.0731 0.198 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -123983 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0438 0.0921 0.198 DC L1
ENSG00000112282 MED23 982540 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0368 0.108 0.198 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -103273 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0985 0.0993 0.198 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -152677 sc-eQTL 9.69e-02 0.176 0.106 0.198 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -203787 sc-eQTL 1.06e-01 -0.0964 0.0593 0.198 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -202557 sc-eQTL 2.20e-01 -0.116 0.0941 0.198 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -492346 sc-eQTL 3.29e-01 -0.084 0.0858 0.198 DC L1
ENSG00000079950 STX7 97584 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0276 0.0539 0.207 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -123983 sc-eQTL 4.04e-01 0.0773 0.0924 0.207 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 982540 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0327 0.0879 0.207 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -103273 sc-eQTL 3.11e-01 -0.101 0.0994 0.207 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -152677 sc-eQTL 3.00e-01 0.0728 0.0701 0.207 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -203787 sc-eQTL 8.93e-01 -0.00568 0.0421 0.207 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -202557 sc-eQTL 2.35e-01 0.099 0.0831 0.207 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 97584 sc-eQTL 9.05e-01 -0.00984 0.0826 0.206 NK L1
ENSG00000112282 MED23 982540 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0745 0.0754 0.206 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -152677 sc-eQTL 5.72e-01 0.0582 0.103 0.206 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -203787 sc-eQTL 8.85e-01 0.00618 0.0426 0.206 NK L1
ENSG00000079950 STX7 97584 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0663 0.0819 0.207 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 982540 sc-eQTL 1.61e-01 -0.143 0.102 0.207 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -152677 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0658 0.0991 0.207 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -203787 sc-eQTL 2.19e-01 0.0483 0.0392 0.207 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -202557 sc-eQTL 7.31e-01 0.037 0.108 0.207 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 209307 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0122 0.116 0.202 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 97584 sc-eQTL 8.45e-01 0.0213 0.109 0.202 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 982540 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0264 0.12 0.202 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -152677 sc-eQTL 1.90e-01 0.151 0.115 0.202 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -203787 sc-eQTL 6.32e-01 0.0298 0.062 0.202 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -202557 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0981 0.108 0.202 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 478894 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0109 0.104 0.202 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 209307 sc-eQTL 9.06e-01 0.0118 0.0998 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 97584 sc-eQTL 1.31e-01 -0.0984 0.065 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 982540 sc-eQTL 6.58e-01 0.044 0.0994 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -152677 sc-eQTL 7.53e-01 0.031 0.0984 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -203787 sc-eQTL 1.19e-01 -0.0937 0.0599 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -202557 sc-eQTL 2.86e-01 0.116 0.108 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 478894 sc-eQTL 4.56e-01 0.0687 0.0921 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 209307 sc-eQTL 3.46e-02 -0.217 0.102 0.209 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 97584 sc-eQTL 1.74e-02 -0.191 0.0797 0.209 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 982540 sc-eQTL 7.80e-01 0.0291 0.104 0.209 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -152677 sc-eQTL 1.98e-01 0.136 0.105 0.209 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -203787 sc-eQTL 6.92e-02 -0.0923 0.0505 0.209 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -202557 sc-eQTL 9.57e-02 -0.177 0.106 0.209 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 478894 sc-eQTL 1.36e-01 -0.147 0.0985 0.209 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 209307 sc-eQTL 1.55e-01 -0.16 0.112 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 97584 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0417 0.0492 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 982540 sc-eQTL 1.07e-01 0.142 0.0878 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -152677 sc-eQTL 9.77e-01 0.00282 0.0957 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -203787 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0611 0.0544 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -202557 sc-eQTL 9.32e-02 -0.176 0.105 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 478894 sc-eQTL 6.79e-01 0.0288 0.0696 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 209307 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0992 0.106 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 97584 sc-eQTL 6.55e-02 -0.106 0.0574 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 982540 sc-eQTL 7.59e-01 0.0329 0.107 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -152677 sc-eQTL 2.75e-01 0.116 0.106 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -203787 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0305 0.0562 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -202557 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0917 0.107 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 478894 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0526 0.0743 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 97584 sc-eQTL 8.70e-01 0.0185 0.113 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 982540 sc-eQTL 9.23e-01 0.0113 0.117 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -152677 sc-eQTL 9.47e-01 0.00761 0.114 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -203787 sc-eQTL 3.66e-01 0.0475 0.0525 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -202557 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0276 0.106 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 97584 sc-eQTL 8.48e-01 0.0166 0.0863 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 982540 sc-eQTL 4.78e-01 0.0523 0.0736 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -152677 sc-eQTL 8.51e-01 0.0151 0.08 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -203787 sc-eQTL 8.84e-01 -0.00757 0.0519 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -202557 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0367 0.0998 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 97584 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00631 0.0955 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 982540 sc-eQTL 2.29e-01 -0.0965 0.08 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -152677 sc-eQTL 3.50e-01 -0.088 0.0939 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -203787 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0527 0.0487 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -202557 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0237 0.113 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 97584 sc-eQTL 2.84e-01 0.118 0.11 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 982540 sc-eQTL 1.03e-01 0.165 0.101 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -152677 sc-eQTL 6.43e-01 -0.049 0.106 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -203787 sc-eQTL 2.03e-01 -0.0551 0.0431 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -202557 sc-eQTL 5.67e-01 0.0617 0.108 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 97584 sc-eQTL 4.54e-01 0.0682 0.0909 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 982540 sc-eQTL 1.85e-01 0.124 0.0929 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -152677 sc-eQTL 7.56e-01 0.0322 0.103 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -203787 sc-eQTL 1.64e-01 0.0769 0.0551 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -202557 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0472 0.107 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 97584 sc-eQTL 3.62e-01 -0.102 0.111 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 982540 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00539 0.0896 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -152677 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0259 0.0961 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -203787 sc-eQTL 1.10e-01 -0.0878 0.0547 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -202557 sc-eQTL 3.12e-01 -0.112 0.11 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 97584 sc-eQTL 5.33e-01 0.07 0.112 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 982540 sc-eQTL 6.73e-02 0.205 0.112 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -152677 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0278 0.111 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -203787 sc-eQTL 4.31e-01 0.0427 0.0541 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -202557 sc-eQTL 8.07e-01 -0.029 0.119 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 97584 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0843 0.115 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 982540 sc-eQTL 3.32e-01 -0.108 0.111 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -152677 sc-eQTL 3.66e-01 0.104 0.114 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -203787 sc-eQTL 7.71e-01 0.018 0.0617 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -202557 sc-eQTL 1.01e-01 0.191 0.116 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 97584 sc-eQTL 1.19e-01 -0.167 0.107 0.201 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 982540 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0321 0.112 0.201 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -152677 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0277 0.109 0.201 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -203787 sc-eQTL 2.32e-01 0.0641 0.0535 0.201 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -202557 sc-eQTL 5.84e-01 0.0616 0.112 0.201 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 97584 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0871 0.106 0.211 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 982540 sc-eQTL 7.72e-01 0.0328 0.113 0.211 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -152677 sc-eQTL 4.55e-01 -0.081 0.108 0.211 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -203787 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0394 0.0603 0.211 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 97584 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0216 0.0882 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 982540 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00294 0.0906 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -152677 sc-eQTL 1.91e-01 0.144 0.11 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -203787 sc-eQTL 7.19e-01 0.0158 0.0437 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 97584 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0606 0.107 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 982540 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0705 0.108 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -152677 sc-eQTL 1.15e-01 0.171 0.108 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -203787 sc-eQTL 8.09e-01 0.0122 0.0506 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 97584 sc-eQTL 8.20e-01 0.0218 0.0958 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 982540 sc-eQTL 1.62e-01 -0.139 0.0986 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -152677 sc-eQTL 9.68e-01 0.00439 0.108 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -203787 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0396 0.0584 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 209307 sc-eQTL 3.34e-01 -0.109 0.113 0.219 PB L2
ENSG00000079950 STX7 97584 sc-eQTL 2.37e-01 0.111 0.0938 0.219 PB L2
ENSG00000112282 MED23 982540 sc-eQTL 4.36e-01 -0.1 0.128 0.219 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -152677 sc-eQTL 2.56e-01 -0.131 0.115 0.219 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -203787 sc-eQTL 3.35e-01 0.0631 0.0652 0.219 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -202557 sc-eQTL 3.09e-01 -0.125 0.122 0.219 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 478894 sc-eQTL 1.12e-01 -0.128 0.0797 0.219 PB L2
ENSG00000079950 STX7 97584 sc-eQTL 4.74e-01 0.0701 0.0977 0.211 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 982540 sc-eQTL 1.69e-01 -0.151 0.11 0.211 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -152677 sc-eQTL 9.54e-01 0.00609 0.105 0.211 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -203787 sc-eQTL 1.19e-01 0.0618 0.0395 0.211 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -202557 sc-eQTL 9.49e-01 0.00663 0.103 0.211 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 97584 sc-eQTL 4.57e-01 0.0813 0.109 0.207 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 982540 sc-eQTL 8.01e-01 0.0283 0.112 0.207 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -152677 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00602 0.092 0.207 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -203787 sc-eQTL 9.57e-01 0.0022 0.0407 0.207 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -202557 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0335 0.115 0.207 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 97584 sc-eQTL 2.02e-01 0.121 0.0942 0.202 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -123983 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0588 0.0939 0.202 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 982540 sc-eQTL 4.64e-01 0.0895 0.122 0.202 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -103273 sc-eQTL 1.63e-01 -0.154 0.11 0.202 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -152677 sc-eQTL 3.68e-01 0.0969 0.107 0.202 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -203787 sc-eQTL 9.60e-02 -0.0882 0.0527 0.202 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -202557 sc-eQTL 8.32e-01 0.0224 0.105 0.202 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -492346 sc-eQTL 2.46e-01 -0.0975 0.0838 0.202 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 97584 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0143 0.0697 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -123983 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0266 0.0985 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 982540 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00837 0.0973 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -103273 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0626 0.0993 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -152677 sc-eQTL 1.79e-01 0.107 0.0791 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -203787 sc-eQTL 6.05e-01 0.0228 0.0441 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -202557 sc-eQTL 3.93e-01 0.0727 0.085 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 97584 sc-eQTL 1.06e-02 -0.194 0.0751 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -123983 sc-eQTL 1.52e-02 0.23 0.0939 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 982540 sc-eQTL 5.75e-01 -0.058 0.103 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -103273 sc-eQTL 7.27e-02 -0.185 0.103 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -152677 sc-eQTL 2.78e-01 0.0735 0.0675 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -203787 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0105 0.0488 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -202557 sc-eQTL 1.97e-01 0.116 0.0899 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 97584 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0833 0.123 0.206 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 982540 sc-eQTL 8.39e-02 -0.228 0.131 0.206 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -152677 sc-eQTL 4.47e-01 -0.104 0.136 0.206 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -203787 sc-eQTL 8.70e-01 0.00854 0.052 0.206 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -202557 sc-eQTL 7.89e-01 -0.036 0.134 0.206 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 97584 sc-eQTL 1.39e-01 0.149 0.1 0.204 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -123983 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00348 0.102 0.204 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 982540 sc-eQTL 5.37e-02 0.215 0.111 0.204 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -103273 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0568 0.1 0.204 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -152677 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0608 0.102 0.204 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -203787 sc-eQTL 1.23e-01 -0.0684 0.0442 0.204 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -202557 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0881 0.108 0.204 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 97584 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00261 0.0751 0.201 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -123983 sc-eQTL 5.39e-01 0.0652 0.106 0.201 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 982540 sc-eQTL 1.61e-01 -0.15 0.107 0.201 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -103273 sc-eQTL 9.25e-03 -0.272 0.103 0.201 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -152677 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0247 0.101 0.201 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -203787 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0491 0.0506 0.201 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -202557 sc-eQTL 9.98e-01 0.000188 0.0897 0.201 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 97584 sc-eQTL 2.53e-01 0.0978 0.0854 0.212 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -123983 sc-eQTL 6.87e-01 0.0348 0.0863 0.212 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 982540 sc-eQTL 1.67e-01 -0.166 0.12 0.212 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -103273 sc-eQTL 7.82e-01 0.0244 0.0878 0.212 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -152677 sc-eQTL 4.54e-02 0.208 0.103 0.212 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -203787 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0394 0.0719 0.212 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -202557 sc-eQTL 8.36e-02 -0.184 0.106 0.212 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -492346 sc-eQTL 9.12e-01 0.0113 0.102 0.212 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 209307 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0401 0.107 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 97584 sc-eQTL 1.48e-02 -0.147 0.0599 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 982540 sc-eQTL 7.63e-01 0.0281 0.093 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -152677 sc-eQTL 1.57e-01 0.136 0.0957 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -203787 sc-eQTL 4.04e-02 -0.112 0.0542 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -202557 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0485 0.1 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 478894 sc-eQTL 9.73e-01 0.00324 0.097 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 209307 sc-eQTL 7.97e-02 -0.196 0.111 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 97584 sc-eQTL 1.72e-01 -0.0628 0.0459 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 982540 sc-eQTL 2.69e-01 0.0957 0.0862 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -152677 sc-eQTL 5.43e-01 0.0545 0.0894 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -203787 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0524 0.054 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -202557 sc-eQTL 1.34e-01 -0.153 0.102 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 478894 sc-eQTL 6.68e-01 0.0279 0.0648 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 97584 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0625 0.0581 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -123983 sc-eQTL 5.44e-01 0.0577 0.0949 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 982540 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0562 0.0912 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -103273 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0857 0.0989 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -152677 sc-eQTL 1.63e-01 0.0912 0.0652 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -203787 sc-eQTL 9.74e-01 0.00148 0.0449 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -202557 sc-eQTL 1.57e-01 0.113 0.0796 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 97584 sc-eQTL 2.73e-01 0.0778 0.0707 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -123983 sc-eQTL 8.61e-01 0.0183 0.104 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 982540 sc-eQTL 5.69e-01 0.058 0.101 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -103273 sc-eQTL 4.44e-02 -0.207 0.102 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -152677 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0487 0.0974 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -203787 sc-eQTL 7.14e-02 -0.0744 0.041 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -202557 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0905 0.1 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 97584 sc-eQTL 8.48e-01 0.0159 0.083 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 982540 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0858 0.0804 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -152677 sc-eQTL 5.07e-01 0.0697 0.105 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -203787 sc-eQTL 7.90e-01 0.0114 0.0429 0.207 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112282 MED23 982540 eQTL 0.0109 0.0529 0.0207 0.0 0.0 0.19
ENSG00000112299 VNN1 -103273 pQTL 0.00207 0.132 0.0429 0.0 0.0 0.194
ENSG00000112299 VNN1 -103273 eQTL 3.59e-06 -0.125 0.0268 0.0 0.0 0.19
ENSG00000112303 VNN2 -152677 pQTL 9.85e-05 0.12 0.0308 0.0 0.0 0.194
ENSG00000234484 AL032821.1 -141893 eQTL 0.0157 -0.0938 0.0388 0.0 0.0 0.19


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112282 MED23 982540 3.92e-07 4e-07 1.63e-07 3.17e-07 1.07e-07 2.46e-07 5.01e-07 7.79e-08 4.18e-07 1.89e-07 4.88e-07 3.62e-07 1.03e-06 1.6e-07 2.26e-07 1.46e-07 1.18e-07 3.02e-07 2.51e-07 4.65e-07 1.34e-07 2.51e-07 2.67e-07 1.8e-07 7.42e-07 2.34e-07 1.87e-07 2.74e-07 2.57e-07 8.48e-07 3.38e-07 4.44e-08 5.38e-08 3.51e-07 3.5e-07 7.57e-08 6.37e-07 1.27e-07 3.2e-07 2.55e-07 2.88e-07 2.72e-07 1.65e-08 7.3e-08 8.45e-08 4.53e-08 9.98e-08 2.31e-08 5.49e-08
ENSG00000112299 VNN1 -103273 9.27e-06 1.26e-05 2.73e-06 1.47e-05 2.3e-06 6.55e-06 1.68e-05 2.2e-06 1.35e-05 5.48e-06 1.33e-05 6.8e-06 3.85e-05 7.21e-06 3.88e-06 7.21e-06 8.06e-06 9.66e-06 4.31e-06 6.77e-06 6.46e-06 1.02e-05 1.12e-05 7.92e-06 2.46e-05 4.47e-06 5.97e-06 5.39e-06 1.38e-05 2.41e-05 1.01e-05 1.63e-06 1.71e-06 8.68e-06 1.04e-05 4.4e-06 4.4e-06 3.12e-06 7.12e-06 5.5e-06 2.16e-06 1.45e-05 2.36e-06 4.09e-07 1.07e-06 2.34e-06 1.8e-06 8.24e-07 4.51e-07
ENSG00000112306 \N -203787 5.22e-06 7.69e-06 1.33e-06 7.89e-06 1.83e-06 4.1e-06 9.17e-06 1.18e-06 5.94e-06 3.31e-06 7.68e-06 4.44e-06 1.81e-05 3.87e-06 1.66e-06 4.58e-06 3.79e-06 3.84e-06 2.55e-06 3.72e-06 2.84e-06 5.49e-06 5.12e-06 3.37e-06 1.15e-05 2.19e-06 2.95e-06 2.84e-06 6.75e-06 9.8e-06 4.46e-06 1.19e-06 1.26e-06 4.75e-06 5.42e-06 2.19e-06 2.7e-06 1.99e-06 3.99e-06 3.6e-06 1.81e-06 7.91e-06 1.28e-06 2.8e-07 8.11e-07 1.62e-06 1.02e-06 7.58e-07 6.01e-07