logo

Genes within 1Mb (chr6:132610318:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 208843 sc-eQTL 1.14e-01 -0.267 0.168 0.073 B L1
ENSG00000079950 STX7 97120 sc-eQTL 4.06e-01 0.0531 0.0638 0.073 B L1
ENSG00000112282 MED23 982076 sc-eQTL 6.55e-01 0.057 0.127 0.073 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -153141 sc-eQTL 1.58e-01 0.17 0.12 0.073 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -204251 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0519 0.0725 0.073 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -203021 sc-eQTL 5.11e-01 0.101 0.153 0.073 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 478430 sc-eQTL 5.93e-01 0.0537 0.1 0.073 B L1
ENSG00000079950 STX7 97120 sc-eQTL 4.70e-01 0.0902 0.125 0.073 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 982076 sc-eQTL 4.05e-01 0.0824 0.0989 0.073 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -153141 sc-eQTL 1.43e-01 -0.158 0.108 0.073 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -204251 sc-eQTL 7.61e-02 -0.13 0.0729 0.073 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -203021 sc-eQTL 6.81e-01 0.0612 0.149 0.073 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 97120 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0393 0.122 0.073 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 982076 sc-eQTL 8.23e-01 0.027 0.12 0.073 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -153141 sc-eQTL 9.75e-02 0.236 0.142 0.073 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -204251 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0302 0.0487 0.073 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -203021 sc-eQTL 4.95e-02 0.288 0.146 0.073 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 97120 sc-eQTL 3.37e-01 0.11 0.114 0.07 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -124447 sc-eQTL 6.05e-01 0.0735 0.142 0.07 DC L1
ENSG00000112282 MED23 982076 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0429 0.167 0.07 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -103737 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0508 0.153 0.07 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -153141 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0118 0.164 0.07 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -204251 sc-eQTL 8.58e-01 0.0164 0.0919 0.07 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -203021 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0373 0.145 0.07 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -492810 sc-eQTL 3.34e-01 0.128 0.132 0.07 DC L1
ENSG00000079950 STX7 97120 sc-eQTL 7.01e-01 0.0318 0.0827 0.073 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -124447 sc-eQTL 2.38e-01 -0.168 0.142 0.073 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 982076 sc-eQTL 8.67e-01 0.0225 0.135 0.073 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -103737 sc-eQTL 4.96e-04 0.525 0.148 0.073 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -153141 sc-eQTL 5.09e-01 0.0713 0.108 0.073 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -204251 sc-eQTL 2.68e-02 -0.142 0.0639 0.073 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -203021 sc-eQTL 4.24e-01 0.102 0.128 0.073 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 97120 sc-eQTL 9.52e-01 -0.0074 0.123 0.073 NK L1
ENSG00000112282 MED23 982076 sc-eQTL 1.46e-01 0.163 0.112 0.073 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -153141 sc-eQTL 4.74e-02 -0.303 0.152 0.073 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -204251 sc-eQTL 1.57e-01 -0.0898 0.0632 0.073 NK L1
ENSG00000079950 STX7 97120 sc-eQTL 2.95e-02 0.271 0.124 0.073 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 982076 sc-eQTL 2.42e-02 0.351 0.155 0.073 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -153141 sc-eQTL 5.90e-01 0.0817 0.151 0.073 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -204251 sc-eQTL 4.48e-01 0.0456 0.06 0.073 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -203021 sc-eQTL 4.58e-01 0.122 0.164 0.073 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 208843 sc-eQTL 1.10e-02 0.428 0.167 0.071 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 97120 sc-eQTL 1.73e-01 0.217 0.158 0.071 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 982076 sc-eQTL 5.75e-03 -0.482 0.172 0.071 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -153141 sc-eQTL 1.46e-01 0.246 0.168 0.071 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -204251 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000407 0.0908 0.071 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -203021 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0754 0.159 0.071 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 478430 sc-eQTL 4.75e-01 0.108 0.151 0.071 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 208843 sc-eQTL 3.03e-01 -0.162 0.156 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 97120 sc-eQTL 1.79e-01 0.138 0.102 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 982076 sc-eQTL 4.14e-01 0.128 0.156 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -153141 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0248 0.155 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -204251 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0983 0.0944 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -203021 sc-eQTL 1.24e-01 0.262 0.17 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 478430 sc-eQTL 3.97e-01 -0.123 0.145 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 208843 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0931 0.155 0.071 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 97120 sc-eQTL 7.06e-01 -0.046 0.122 0.071 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 982076 sc-eQTL 7.04e-02 0.283 0.156 0.071 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -153141 sc-eQTL 8.42e-01 0.0317 0.159 0.071 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -204251 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0388 0.0767 0.071 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -203021 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0375 0.16 0.071 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 478430 sc-eQTL 7.05e-01 0.0566 0.149 0.071 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 208843 sc-eQTL 1.17e-02 -0.434 0.171 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 97120 sc-eQTL 6.45e-01 0.035 0.0757 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 982076 sc-eQTL 2.82e-01 -0.146 0.135 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -153141 sc-eQTL 7.06e-01 0.0556 0.147 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -204251 sc-eQTL 2.98e-02 -0.181 0.0829 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -203021 sc-eQTL 1.71e-01 0.221 0.161 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 478430 sc-eQTL 6.43e-01 0.0496 0.107 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 208843 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0932 0.163 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 97120 sc-eQTL 8.80e-01 0.0135 0.089 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 982076 sc-eQTL 4.56e-01 0.123 0.164 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -153141 sc-eQTL 3.74e-01 0.145 0.163 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -204251 sc-eQTL 1.45e-01 -0.126 0.0861 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -203021 sc-eQTL 4.90e-01 -0.114 0.165 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 478430 sc-eQTL 6.39e-01 0.0537 0.114 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 97120 sc-eQTL 9.07e-01 0.0191 0.163 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 982076 sc-eQTL 3.07e-01 0.173 0.169 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -153141 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0862 0.164 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -204251 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0454 0.0758 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -203021 sc-eQTL 1.85e-01 0.202 0.152 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 97120 sc-eQTL 4.10e-01 0.108 0.131 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 982076 sc-eQTL 6.26e-01 0.0547 0.112 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -153141 sc-eQTL 2.07e-01 -0.153 0.121 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -204251 sc-eQTL 2.23e-01 -0.0961 0.0786 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -203021 sc-eQTL 6.44e-01 0.0703 0.152 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 97120 sc-eQTL 9.53e-01 0.00873 0.149 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 982076 sc-eQTL 7.87e-01 0.0338 0.125 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -153141 sc-eQTL 1.16e-01 -0.23 0.146 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -204251 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0401 0.076 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -203021 sc-eQTL 8.62e-01 0.0307 0.176 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 97120 sc-eQTL 2.92e-01 0.183 0.173 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 982076 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0762 0.16 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -153141 sc-eQTL 2.95e-01 0.174 0.166 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -204251 sc-eQTL 1.41e-01 -0.1 0.0679 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -203021 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0925 0.17 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 97120 sc-eQTL 5.81e-01 0.0762 0.138 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 982076 sc-eQTL 5.63e-01 0.0818 0.141 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -153141 sc-eQTL 5.53e-01 0.093 0.156 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -204251 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0335 0.0838 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -203021 sc-eQTL 1.90e-02 0.379 0.16 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 97120 sc-eQTL 1.35e-01 -0.252 0.168 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 982076 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0686 0.136 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -153141 sc-eQTL 2.89e-01 0.155 0.146 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -204251 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0746 0.0834 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -203021 sc-eQTL 2.51e-01 0.192 0.167 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 97120 sc-eQTL 2.94e-01 -0.183 0.174 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 982076 sc-eQTL 6.61e-01 0.0771 0.175 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -153141 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0888 0.173 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -204251 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0193 0.0845 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -203021 sc-eQTL 5.63e-01 -0.107 0.185 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 97120 sc-eQTL 6.41e-01 0.0802 0.172 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 982076 sc-eQTL 3.95e-01 0.141 0.165 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -153141 sc-eQTL 6.70e-01 0.0728 0.171 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -204251 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0512 0.0919 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -203021 sc-eQTL 9.98e-01 0.00034 0.174 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 97120 sc-eQTL 1.63e-01 0.22 0.157 0.071 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 982076 sc-eQTL 8.71e-02 0.281 0.164 0.071 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -153141 sc-eQTL 8.53e-01 0.0297 0.16 0.071 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -204251 sc-eQTL 8.26e-01 0.0173 0.0787 0.071 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -203021 sc-eQTL 5.90e-01 0.089 0.165 0.071 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 97120 sc-eQTL 3.00e-01 0.172 0.166 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 982076 sc-eQTL 4.34e-01 -0.138 0.176 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -153141 sc-eQTL 7.32e-02 0.302 0.168 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -204251 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0255 0.0942 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 97120 sc-eQTL 7.60e-01 0.0396 0.13 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 982076 sc-eQTL 4.01e-01 0.112 0.133 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -153141 sc-eQTL 4.07e-01 -0.134 0.162 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -204251 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0333 0.0643 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 97120 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0797 0.163 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 982076 sc-eQTL 1.80e-01 0.221 0.164 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -153141 sc-eQTL 1.90e-01 -0.216 0.164 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -204251 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0892 0.0766 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 97120 sc-eQTL 4.47e-01 -0.115 0.151 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 982076 sc-eQTL 8.99e-02 0.265 0.155 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -153141 sc-eQTL 5.86e-04 -0.577 0.165 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -204251 sc-eQTL 2.52e-01 -0.106 0.092 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 208843 sc-eQTL 9.62e-01 0.00775 0.164 0.078 PB L2
ENSG00000079950 STX7 97120 sc-eQTL 5.17e-01 0.0891 0.137 0.078 PB L2
ENSG00000112282 MED23 982076 sc-eQTL 2.37e-01 0.221 0.185 0.078 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -153141 sc-eQTL 9.48e-01 0.011 0.168 0.078 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -204251 sc-eQTL 1.58e-01 0.134 0.0943 0.078 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -203021 sc-eQTL 9.91e-02 -0.293 0.176 0.078 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 478430 sc-eQTL 5.70e-03 0.319 0.113 0.078 PB L2
ENSG00000079950 STX7 97120 sc-eQTL 4.77e-01 0.107 0.15 0.074 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 982076 sc-eQTL 1.17e-01 0.266 0.169 0.074 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -153141 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0546 0.162 0.074 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -204251 sc-eQTL 3.02e-01 0.0631 0.061 0.074 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -203021 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0844 0.158 0.074 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 97120 sc-eQTL 2.38e-01 0.193 0.163 0.073 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 982076 sc-eQTL 5.93e-01 -0.09 0.168 0.073 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -153141 sc-eQTL 8.49e-01 0.0263 0.138 0.073 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -204251 sc-eQTL 9.74e-01 -0.002 0.0609 0.073 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -203021 sc-eQTL 1.22e-01 0.266 0.171 0.073 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 97120 sc-eQTL 7.74e-01 0.0417 0.145 0.066 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -124447 sc-eQTL 3.33e-01 0.139 0.144 0.066 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 982076 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0262 0.187 0.066 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -103737 sc-eQTL 9.34e-01 0.014 0.169 0.066 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -153141 sc-eQTL 4.57e-01 0.123 0.165 0.066 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -204251 sc-eQTL 2.83e-01 0.0873 0.0811 0.066 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -203021 sc-eQTL 1.60e-01 -0.226 0.16 0.066 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -492810 sc-eQTL 7.78e-01 0.0364 0.129 0.066 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 97120 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0564 0.107 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -124447 sc-eQTL 6.72e-01 -0.064 0.151 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 982076 sc-eQTL 8.38e-01 0.0306 0.149 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -103737 sc-eQTL 4.21e-03 0.433 0.15 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -153141 sc-eQTL 9.60e-01 0.00609 0.122 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -204251 sc-eQTL 3.67e-02 -0.141 0.067 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -203021 sc-eQTL 2.06e-01 0.165 0.13 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 97120 sc-eQTL 5.23e-02 0.227 0.116 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -124447 sc-eQTL 1.11e-01 -0.233 0.146 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 982076 sc-eQTL 9.98e-01 0.000492 0.159 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -103737 sc-eQTL 7.58e-03 0.422 0.156 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -153141 sc-eQTL 1.98e-01 0.134 0.104 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -204251 sc-eQTL 2.06e-01 -0.0948 0.0748 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -203021 sc-eQTL 3.30e-01 -0.135 0.139 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 97120 sc-eQTL 7.31e-02 0.33 0.183 0.076 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 982076 sc-eQTL 3.78e-01 0.175 0.198 0.076 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -153141 sc-eQTL 3.73e-01 0.182 0.204 0.076 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -204251 sc-eQTL 5.53e-01 0.0462 0.0777 0.076 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -203021 sc-eQTL 1.36e-02 0.492 0.197 0.076 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 97120 sc-eQTL 1.41e-01 0.233 0.158 0.071 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -124447 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0357 0.16 0.071 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 982076 sc-eQTL 5.41e-01 0.107 0.176 0.071 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -103737 sc-eQTL 6.06e-01 0.0816 0.158 0.071 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -153141 sc-eQTL 6.36e-02 0.297 0.159 0.071 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -204251 sc-eQTL 8.75e-01 0.011 0.07 0.071 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -203021 sc-eQTL 4.55e-01 0.127 0.17 0.071 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 97120 sc-eQTL 3.35e-01 0.113 0.117 0.07 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -124447 sc-eQTL 1.67e-01 0.228 0.165 0.07 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 982076 sc-eQTL 8.75e-01 0.0263 0.168 0.07 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -103737 sc-eQTL 2.79e-03 0.486 0.16 0.07 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -153141 sc-eQTL 9.47e-01 0.0105 0.158 0.07 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -204251 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0753 0.079 0.07 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -203021 sc-eQTL 1.82e-01 -0.186 0.139 0.07 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 97120 sc-eQTL 1.41e-01 0.194 0.132 0.073 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -124447 sc-eQTL 8.31e-01 0.0285 0.133 0.073 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 982076 sc-eQTL 4.36e-01 0.145 0.186 0.073 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -103737 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0812 0.136 0.073 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -153141 sc-eQTL 7.39e-03 -0.429 0.158 0.073 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -204251 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0428 0.111 0.073 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -203021 sc-eQTL 3.95e-01 0.14 0.164 0.073 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -492810 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0183 0.158 0.073 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 208843 sc-eQTL 2.91e-01 -0.174 0.164 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 97120 sc-eQTL 1.96e-01 0.12 0.0929 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 982076 sc-eQTL 7.25e-01 0.0502 0.143 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -153141 sc-eQTL 8.41e-01 0.0296 0.147 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -204251 sc-eQTL 1.90e-01 -0.11 0.0837 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -203021 sc-eQTL 5.88e-02 0.291 0.153 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 478430 sc-eQTL 6.88e-01 0.0598 0.149 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 208843 sc-eQTL 5.86e-02 -0.326 0.172 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 97120 sc-eQTL 9.82e-01 0.00161 0.071 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 982076 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0316 0.133 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -153141 sc-eQTL 3.24e-01 0.136 0.138 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -204251 sc-eQTL 8.22e-02 -0.145 0.0829 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -203021 sc-eQTL 5.10e-01 0.104 0.157 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 478430 sc-eQTL 5.54e-01 0.0592 0.0999 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 97120 sc-eQTL 6.75e-01 0.0373 0.0889 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -124447 sc-eQTL 2.51e-01 -0.166 0.144 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 982076 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00268 0.139 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -103737 sc-eQTL 2.06e-03 0.461 0.148 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -153141 sc-eQTL 7.48e-01 0.0322 0.0999 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -204251 sc-eQTL 3.77e-02 -0.142 0.0678 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -203021 sc-eQTL 5.00e-01 0.0823 0.122 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 97120 sc-eQTL 3.73e-01 0.0969 0.109 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -124447 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00509 0.16 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 982076 sc-eQTL 8.16e-01 0.0363 0.156 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -103737 sc-eQTL 3.36e-02 0.336 0.157 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -153141 sc-eQTL 1.37e-01 0.222 0.149 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -204251 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0113 0.0634 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -203021 sc-eQTL 2.46e-01 0.179 0.154 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 97120 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0894 0.124 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 982076 sc-eQTL 4.41e-02 0.241 0.119 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -153141 sc-eQTL 3.42e-02 -0.33 0.155 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -204251 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0686 0.0637 0.073 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 97120 eQTL 0.00439 -0.0748 0.0262 0.0 0.0 0.0918
ENSG00000112282 MED23 982076 eQTL 0.0271 -0.0609 0.0275 0.0 0.0 0.0918
ENSG00000112299 VNN1 -103737 pQTL 3.65e-11 0.395 0.0592 0.0 0.0 0.0874
ENSG00000112299 VNN1 -103737 eQTL 9.47e-09 0.205 0.0354 0.0 0.0 0.0918
ENSG00000118523 CCN2 658946 pQTL 0.000564 -0.124 0.0359 0.00268 0.0 0.0874

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112299 VNN1 -103737 8.08e-06 1.09e-05 1.3e-06 1.28e-05 2.1e-06 5.45e-06 1.19e-05 1.55e-06 9.91e-06 4.1e-06 1.04e-05 5.26e-06 3.56e-05 5.19e-06 2.17e-06 5.68e-06 6.45e-06 6.21e-06 2.7e-06 4.51e-06 4.11e-06 7.65e-06 7.38e-06 5.14e-06 1.61e-05 3e-06 3.58e-06 3.57e-06 8.58e-06 1.61e-05 6.53e-06 1.52e-06 1.17e-06 6.71e-06 7.79e-06 2.75e-06 3.13e-06 2.02e-06 6.91e-06 4.63e-06 1.78e-06 1.25e-05 1.57e-06 1.61e-07 6.8e-07 1.49e-06 1.16e-06 6.09e-07 4.23e-07