logo

Genes within 1Mb (chr6:132609059:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 207584 sc-eQTL 2.03e-01 -0.197 0.155 0.094 B L1
ENSG00000079950 STX7 95861 sc-eQTL 1.72e-01 -0.0799 0.0583 0.094 B L1
ENSG00000112282 MED23 980817 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0361 0.117 0.094 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -154400 sc-eQTL 4.44e-01 0.0843 0.11 0.094 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -205510 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0728 0.0664 0.094 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -204280 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0494 0.14 0.094 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 477171 sc-eQTL 8.62e-01 0.016 0.0919 0.094 B L1
ENSG00000079950 STX7 95861 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0773 0.113 0.094 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 980817 sc-eQTL 6.57e-03 0.242 0.0882 0.094 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -154400 sc-eQTL 9.11e-01 0.0109 0.098 0.094 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -205510 sc-eQTL 9.41e-01 0.00495 0.0666 0.094 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -204280 sc-eQTL 2.61e-01 0.151 0.134 0.094 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 95861 sc-eQTL 5.15e-01 0.0734 0.113 0.094 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 980817 sc-eQTL 4.68e-01 0.0806 0.111 0.094 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -154400 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0938 0.131 0.094 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -205510 sc-eQTL 9.45e-01 0.00312 0.045 0.094 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -204280 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0134 0.136 0.094 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 95861 sc-eQTL 2.48e-03 0.305 0.0996 0.095 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -125706 sc-eQTL 1.04e-01 0.205 0.125 0.095 DC L1
ENSG00000112282 MED23 980817 sc-eQTL 4.47e-01 0.113 0.148 0.095 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -104996 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0652 0.136 0.095 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -154400 sc-eQTL 4.34e-01 0.114 0.146 0.095 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -205510 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0467 0.0817 0.095 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -204280 sc-eQTL 6.66e-01 -0.056 0.129 0.095 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -494069 sc-eQTL 6.04e-01 0.0612 0.118 0.095 DC L1
ENSG00000079950 STX7 95861 sc-eQTL 2.36e-01 0.0909 0.0764 0.094 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -125706 sc-eQTL 1.88e-01 0.173 0.131 0.094 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 980817 sc-eQTL 9.19e-01 0.0127 0.125 0.094 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -104996 sc-eQTL 5.29e-02 -0.273 0.14 0.094 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -154400 sc-eQTL 5.80e-01 0.0553 0.0999 0.094 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -205510 sc-eQTL 7.86e-01 0.0163 0.0599 0.094 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -204280 sc-eQTL 8.49e-01 0.0226 0.118 0.094 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 95861 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0121 0.115 0.094 NK L1
ENSG00000112282 MED23 980817 sc-eQTL 8.69e-01 0.0174 0.105 0.094 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -154400 sc-eQTL 1.58e-01 0.202 0.143 0.094 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -205510 sc-eQTL 8.13e-01 0.014 0.0593 0.094 NK L1
ENSG00000079950 STX7 95861 sc-eQTL 3.70e-01 -0.106 0.118 0.094 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 980817 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0888 0.147 0.094 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -154400 sc-eQTL 8.26e-01 0.0314 0.143 0.094 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -205510 sc-eQTL 4.16e-01 0.046 0.0565 0.094 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -204280 sc-eQTL 4.63e-01 0.114 0.155 0.094 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 207584 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0624 0.176 0.087 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 95861 sc-eQTL 4.43e-01 0.127 0.165 0.087 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 980817 sc-eQTL 5.41e-01 -0.112 0.183 0.087 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -154400 sc-eQTL 6.24e-02 0.327 0.174 0.087 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -205510 sc-eQTL 4.60e-01 0.0697 0.0941 0.087 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204280 sc-eQTL 9.98e-01 0.00045 0.165 0.087 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 477171 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00207 0.157 0.087 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 207584 sc-eQTL 7.50e-01 0.0461 0.145 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 95861 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0656 0.0946 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 980817 sc-eQTL 3.72e-01 -0.129 0.144 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -154400 sc-eQTL 3.91e-01 0.122 0.142 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -205510 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0662 0.0873 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204280 sc-eQTL 7.23e-01 0.0559 0.157 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 477171 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0951 0.134 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 207584 sc-eQTL 7.03e-02 -0.266 0.146 0.095 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 95861 sc-eQTL 3.12e-01 -0.117 0.115 0.095 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 980817 sc-eQTL 1.03e-01 0.242 0.148 0.095 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -154400 sc-eQTL 7.90e-01 0.0403 0.151 0.095 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -205510 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0807 0.0726 0.095 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204280 sc-eQTL 6.74e-01 0.064 0.152 0.095 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 477171 sc-eQTL 1.63e-01 -0.197 0.141 0.095 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 207584 sc-eQTL 5.52e-01 -0.096 0.161 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 95861 sc-eQTL 6.17e-01 0.0353 0.0705 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 980817 sc-eQTL 1.59e-01 0.178 0.126 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -154400 sc-eQTL 4.45e-01 -0.105 0.137 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -205510 sc-eQTL 3.69e-01 -0.07 0.0779 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204280 sc-eQTL 9.60e-02 -0.25 0.15 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 477171 sc-eQTL 4.83e-01 0.07 0.0996 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 207584 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0845 0.151 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 95861 sc-eQTL 2.79e-02 -0.18 0.0813 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 980817 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00772 0.152 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -154400 sc-eQTL 3.27e-01 0.148 0.151 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -205510 sc-eQTL 7.61e-01 0.0243 0.0799 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204280 sc-eQTL 8.09e-01 0.0368 0.152 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 477171 sc-eQTL 3.17e-01 -0.106 0.105 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 95861 sc-eQTL 6.52e-01 0.0724 0.16 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 980817 sc-eQTL 2.91e-01 0.176 0.166 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -154400 sc-eQTL 8.65e-01 0.0275 0.162 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -205510 sc-eQTL 4.34e-01 0.0584 0.0746 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204280 sc-eQTL 7.70e-01 -0.044 0.151 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 95861 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0115 0.122 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 980817 sc-eQTL 9.88e-03 0.267 0.103 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -154400 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0095 0.113 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -205510 sc-eQTL 6.14e-01 0.0371 0.0734 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204280 sc-eQTL 3.30e-01 0.138 0.141 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 95861 sc-eQTL 2.10e-02 -0.314 0.135 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 980817 sc-eQTL 6.92e-01 0.0456 0.115 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -154400 sc-eQTL 7.31e-01 0.0464 0.135 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -205510 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0573 0.0698 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204280 sc-eQTL 6.36e-01 0.0766 0.162 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 95861 sc-eQTL 6.07e-01 0.0815 0.158 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 980817 sc-eQTL 8.79e-02 0.248 0.145 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -154400 sc-eQTL 3.09e-01 -0.154 0.151 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -205510 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0165 0.0622 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204280 sc-eQTL 5.56e-01 0.0912 0.155 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 95861 sc-eQTL 2.36e-01 0.152 0.128 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 980817 sc-eQTL 3.69e-01 0.118 0.131 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -154400 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0509 0.146 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -205510 sc-eQTL 1.61e-01 0.109 0.0776 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204280 sc-eQTL 3.73e-01 0.135 0.151 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 95861 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0844 0.156 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 980817 sc-eQTL 3.64e-01 0.114 0.125 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -154400 sc-eQTL 1.99e-01 -0.173 0.134 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -205510 sc-eQTL 3.30e-01 -0.075 0.0767 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204280 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00786 0.154 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 95861 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00787 0.154 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 980817 sc-eQTL 1.10e-01 0.246 0.153 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -154400 sc-eQTL 4.00e-01 0.128 0.152 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -205510 sc-eQTL 9.14e-01 0.00805 0.0743 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204280 sc-eQTL 9.80e-01 0.00405 0.163 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 95861 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0663 0.172 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 980817 sc-eQTL 2.07e-01 -0.208 0.165 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -154400 sc-eQTL 2.73e-02 0.375 0.169 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -205510 sc-eQTL 1.09e-01 0.147 0.0913 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204280 sc-eQTL 4.46e-01 0.132 0.173 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 95861 sc-eQTL 3.08e-01 -0.155 0.152 0.091 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 980817 sc-eQTL 9.56e-01 0.0088 0.159 0.091 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -154400 sc-eQTL 5.60e-01 0.0903 0.155 0.091 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -205510 sc-eQTL 2.68e-01 0.0843 0.0759 0.091 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204280 sc-eQTL 8.27e-01 0.035 0.16 0.091 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 95861 sc-eQTL 3.81e-01 -0.134 0.153 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 980817 sc-eQTL 1.15e-01 0.255 0.161 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -154400 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0404 0.156 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -205510 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0783 0.0866 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 95861 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0667 0.123 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 980817 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00259 0.126 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -154400 sc-eQTL 1.39e-02 0.376 0.151 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -205510 sc-eQTL 8.86e-01 0.00873 0.061 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 95861 sc-eQTL 2.29e-01 -0.184 0.152 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 980817 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0983 0.154 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -154400 sc-eQTL 1.32e-01 0.233 0.154 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -205510 sc-eQTL 7.10e-01 0.0268 0.0721 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 95861 sc-eQTL 6.90e-01 0.0537 0.135 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 980817 sc-eQTL 7.20e-01 0.0501 0.139 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -154400 sc-eQTL 8.43e-01 0.0301 0.152 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -205510 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0762 0.0821 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 207584 sc-eQTL 1.94e-01 -0.224 0.172 0.089 PB L2
ENSG00000079950 STX7 95861 sc-eQTL 1.20e-01 0.224 0.143 0.089 PB L2
ENSG00000112282 MED23 980817 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0765 0.196 0.089 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -154400 sc-eQTL 3.66e-01 -0.159 0.176 0.089 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -205510 sc-eQTL 1.65e-01 0.139 0.0993 0.089 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204280 sc-eQTL 3.84e-01 -0.163 0.187 0.089 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 477171 sc-eQTL 1.35e-01 -0.184 0.122 0.089 PB L2
ENSG00000079950 STX7 95861 sc-eQTL 1.77e-01 -0.192 0.142 0.096 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 980817 sc-eQTL 3.21e-01 -0.159 0.16 0.096 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -154400 sc-eQTL 7.58e-01 0.047 0.152 0.096 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -205510 sc-eQTL 2.62e-01 0.0646 0.0575 0.096 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204280 sc-eQTL 8.53e-01 0.0277 0.149 0.096 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 95861 sc-eQTL 5.50e-01 0.0893 0.149 0.094 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 980817 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0145 0.154 0.094 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -154400 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0515 0.126 0.094 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -205510 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00432 0.0556 0.094 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204280 sc-eQTL 1.50e-01 0.226 0.156 0.094 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 95861 sc-eQTL 2.84e-01 0.138 0.128 0.1 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -125706 sc-eQTL 1.04e-01 0.207 0.127 0.1 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 980817 sc-eQTL 2.11e-01 0.207 0.165 0.1 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -104996 sc-eQTL 4.35e-01 -0.117 0.15 0.1 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -154400 sc-eQTL 6.77e-01 0.0609 0.146 0.1 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -205510 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0819 0.0719 0.1 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204280 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0424 0.143 0.1 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -494069 sc-eQTL 7.77e-01 0.0324 0.114 0.1 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 95861 sc-eQTL 8.57e-01 0.0179 0.0994 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -125706 sc-eQTL 3.70e-01 0.126 0.14 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 980817 sc-eQTL 7.41e-01 0.046 0.139 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -104996 sc-eQTL 1.43e-01 -0.208 0.141 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -154400 sc-eQTL 3.58e-01 0.104 0.113 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -205510 sc-eQTL 4.66e-01 0.0459 0.0629 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204280 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0785 0.121 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 95861 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0101 0.108 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -125706 sc-eQTL 4.54e-02 0.268 0.133 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 980817 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0372 0.146 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -104996 sc-eQTL 5.95e-02 -0.275 0.145 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -154400 sc-eQTL 2.27e-01 0.116 0.0954 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -205510 sc-eQTL 5.68e-01 0.0394 0.0689 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204280 sc-eQTL 1.95e-01 0.165 0.127 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 95861 sc-eQTL 3.30e-01 -0.168 0.172 0.1 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 980817 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0932 0.185 0.1 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -154400 sc-eQTL 3.91e-01 0.164 0.191 0.1 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -205510 sc-eQTL 2.82e-01 0.0784 0.0725 0.1 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204280 sc-eQTL 5.30e-01 -0.118 0.188 0.1 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 95861 sc-eQTL 5.01e-01 0.0968 0.144 0.091 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -125706 sc-eQTL 6.33e-01 0.0693 0.145 0.091 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 980817 sc-eQTL 1.53e-02 0.385 0.157 0.091 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -104996 sc-eQTL 2.01e-01 -0.183 0.143 0.091 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -154400 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0419 0.146 0.091 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -205510 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0229 0.0635 0.091 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204280 sc-eQTL 8.77e-01 0.024 0.155 0.091 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 95861 sc-eQTL 5.25e-01 0.0673 0.106 0.093 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -125706 sc-eQTL 1.81e-01 0.2 0.149 0.093 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 980817 sc-eQTL 5.05e-02 -0.295 0.15 0.093 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -104996 sc-eQTL 1.05e-02 -0.377 0.146 0.093 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -154400 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0871 0.142 0.093 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -205510 sc-eQTL 1.63e-01 -0.0997 0.0712 0.093 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204280 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0129 0.126 0.093 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 95861 sc-eQTL 7.63e-03 0.301 0.111 0.107 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -125706 sc-eQTL 1.22e-01 0.177 0.114 0.107 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 980817 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0454 0.16 0.107 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -104996 sc-eQTL 8.92e-01 0.0158 0.117 0.107 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -154400 sc-eQTL 7.54e-01 0.0436 0.139 0.107 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -205510 sc-eQTL 8.32e-01 0.0204 0.0957 0.107 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204280 sc-eQTL 8.75e-01 0.0224 0.142 0.107 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -494069 sc-eQTL 2.07e-01 0.171 0.135 0.107 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 207584 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0595 0.154 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 95861 sc-eQTL 1.71e-01 -0.119 0.0871 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 980817 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0985 0.134 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -154400 sc-eQTL 3.66e-01 0.125 0.138 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -205510 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0658 0.0787 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -204280 sc-eQTL 5.95e-01 0.0769 0.145 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 477171 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0828 0.139 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 207584 sc-eQTL 3.95e-01 -0.137 0.161 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 95861 sc-eQTL 6.72e-01 -0.028 0.066 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 980817 sc-eQTL 6.18e-01 0.062 0.124 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -154400 sc-eQTL 8.99e-01 0.0162 0.128 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -205510 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0315 0.0776 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -204280 sc-eQTL 2.86e-01 -0.156 0.146 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 477171 sc-eQTL 7.33e-01 0.0318 0.093 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 95861 sc-eQTL 6.29e-01 0.0398 0.0823 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -125706 sc-eQTL 2.69e-01 0.148 0.134 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 980817 sc-eQTL 9.11e-01 0.0144 0.129 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -104996 sc-eQTL 1.11e-01 -0.222 0.139 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -154400 sc-eQTL 4.00e-01 0.0779 0.0924 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -205510 sc-eQTL 6.42e-01 0.0295 0.0634 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -204280 sc-eQTL 7.46e-01 0.0365 0.113 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 95861 sc-eQTL 3.22e-01 0.1 0.101 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -125706 sc-eQTL 3.32e-01 0.145 0.149 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 980817 sc-eQTL 7.00e-01 0.056 0.145 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -104996 sc-eQTL 6.72e-03 -0.397 0.145 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -154400 sc-eQTL 4.16e-01 -0.113 0.139 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -205510 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0724 0.0589 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -204280 sc-eQTL 9.49e-01 0.00912 0.143 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 95861 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00305 0.116 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 980817 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00813 0.113 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -154400 sc-eQTL 1.14e-01 0.232 0.146 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -205510 sc-eQTL 5.98e-01 0.0317 0.06 0.095 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 -104996 eQTL 1.11e-05 -0.173 0.0392 0.0 0.0 0.0736
ENSG00000112303 VNN2 -154400 pQTL 0.0027 0.136 0.0453 0.0 0.0 0.0755
ENSG00000154269 ENPP3 980617 eQTL 0.00289 -0.133 0.0444 0.00276 0.0 0.0736
ENSG00000234484 AL032821.1 -143616 eQTL 0.000677 -0.192 0.0564 0.0 0.0 0.0736

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000154269 ENPP3 980617 7.57e-07 6.97e-07 7.92e-08 1.15e-06 1.07e-07 3.08e-07 7.02e-07 8.11e-08 6.92e-07 1.65e-07 1.02e-06 2.04e-07 2.56e-06 2.29e-07 2.14e-07 1.1e-07 7.68e-07 3.3e-07 3.06e-07 3.42e-07 1.33e-07 2.63e-07 3.77e-07 1.71e-07 1.39e-06 2.68e-07 1.31e-07 1.67e-07 4.33e-07 1.08e-06 4.65e-07 3.66e-08 4.27e-08 6.99e-07 4.2e-07 1.36e-07 7.53e-07 7.51e-08 4.57e-07 1.92e-07 1.01e-07 5.79e-07 3.08e-08 6.48e-08 7.89e-08 1.61e-08 8.81e-08 2.1e-09 5.01e-08