logo

Genes within 1Mb (chr6:132606183:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 204708 sc-eQTL 6.12e-02 -0.252 0.134 0.13 B L1
ENSG00000079950 STX7 92985 sc-eQTL 2.00e-01 0.0653 0.0508 0.13 B L1
ENSG00000112282 MED23 977941 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0743 0.101 0.13 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -157276 sc-eQTL 2.34e-01 0.114 0.0955 0.13 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -208386 sc-eQTL 3.87e-02 -0.119 0.0573 0.13 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -207156 sc-eQTL 2.06e-01 0.154 0.121 0.13 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 474295 sc-eQTL 3.23e-01 0.0791 0.0798 0.13 B L1
ENSG00000079950 STX7 92985 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00095 0.0981 0.13 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 977941 sc-eQTL 8.75e-01 0.0123 0.0779 0.13 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -157276 sc-eQTL 1.74e-01 0.115 0.0846 0.13 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -208386 sc-eQTL 1.19e-01 -0.09 0.0574 0.13 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -207156 sc-eQTL 1.85e-01 0.155 0.116 0.13 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 92985 sc-eQTL 5.65e-01 0.0556 0.0965 0.13 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 977941 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0565 0.0951 0.13 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -157276 sc-eQTL 3.28e-01 0.11 0.113 0.13 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -208386 sc-eQTL 1.18e-02 -0.0964 0.038 0.13 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -207156 sc-eQTL 9.10e-01 0.0132 0.117 0.13 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 92985 sc-eQTL 2.35e-01 -0.104 0.0874 0.133 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -128582 sc-eQTL 1.47e-01 0.157 0.108 0.133 DC L1
ENSG00000112282 MED23 977941 sc-eQTL 5.02e-01 0.0857 0.128 0.133 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -107872 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00118 0.117 0.133 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -157276 sc-eQTL 4.53e-01 0.0943 0.125 0.133 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -208386 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0193 0.0704 0.133 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -207156 sc-eQTL 8.97e-01 0.0144 0.111 0.133 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -496945 sc-eQTL 8.82e-02 0.173 0.101 0.133 DC L1
ENSG00000079950 STX7 92985 sc-eQTL 1.20e-01 0.102 0.0652 0.13 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -128582 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0512 0.113 0.13 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 977941 sc-eQTL 3.19e-01 -0.106 0.107 0.13 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -107872 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0203 0.121 0.13 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -157276 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0123 0.0855 0.13 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -208386 sc-eQTL 2.28e-01 -0.0617 0.0511 0.13 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -207156 sc-eQTL 8.80e-02 0.173 0.101 0.13 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 92985 sc-eQTL 8.02e-01 0.0251 0.1 0.131 NK L1
ENSG00000112282 MED23 977941 sc-eQTL 5.92e-01 -0.049 0.0915 0.131 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -157276 sc-eQTL 2.17e-01 0.154 0.124 0.131 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -208386 sc-eQTL 1.09e-01 -0.0825 0.0512 0.131 NK L1
ENSG00000079950 STX7 92985 sc-eQTL 3.40e-01 0.0954 0.0998 0.13 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 977941 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0878 0.125 0.13 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -157276 sc-eQTL 1.64e-01 0.168 0.12 0.13 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -208386 sc-eQTL 1.70e-01 -0.0658 0.0478 0.13 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -207156 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0126 0.131 0.13 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 204708 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0812 0.143 0.128 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 92985 sc-eQTL 5.97e-01 0.071 0.134 0.128 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 977941 sc-eQTL 1.33e-01 -0.223 0.148 0.128 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -157276 sc-eQTL 3.06e-01 0.146 0.142 0.128 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -208386 sc-eQTL 6.26e-02 -0.142 0.0757 0.128 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -207156 sc-eQTL 2.79e-02 0.293 0.132 0.128 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 474295 sc-eQTL 2.15e-01 -0.158 0.127 0.128 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 204708 sc-eQTL 1.83e-01 -0.167 0.125 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 92985 sc-eQTL 8.56e-01 0.0149 0.0821 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 977941 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0376 0.125 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -157276 sc-eQTL 6.27e-01 0.0601 0.124 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -208386 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0154 0.0757 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -207156 sc-eQTL 4.08e-01 0.113 0.136 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 474295 sc-eQTL 8.08e-01 0.0281 0.116 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 204708 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0912 0.123 0.129 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 92985 sc-eQTL 1.37e-01 0.144 0.0963 0.129 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 977941 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00968 0.125 0.129 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -157276 sc-eQTL 4.02e-01 -0.106 0.126 0.129 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -208386 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0517 0.0609 0.129 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -207156 sc-eQTL 2.54e-01 0.145 0.127 0.129 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 474295 sc-eQTL 7.87e-01 0.0321 0.119 0.129 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 204708 sc-eQTL 2.54e-01 -0.159 0.14 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 92985 sc-eQTL 2.45e-01 0.071 0.061 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 977941 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0816 0.109 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -157276 sc-eQTL 3.93e-01 0.102 0.119 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -208386 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0809 0.0674 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -207156 sc-eQTL 2.26e-01 0.158 0.13 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 474295 sc-eQTL 4.51e-01 0.0652 0.0863 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 204708 sc-eQTL 4.22e-01 -0.107 0.132 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 92985 sc-eQTL 5.36e-01 0.0447 0.0722 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 977941 sc-eQTL 4.67e-01 0.0972 0.133 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -157276 sc-eQTL 2.02e-01 0.169 0.132 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -208386 sc-eQTL 2.13e-01 -0.0875 0.07 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -207156 sc-eQTL 1.72e-01 0.183 0.133 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 474295 sc-eQTL 5.93e-01 0.0497 0.0929 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 92985 sc-eQTL 3.98e-01 -0.113 0.133 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 977941 sc-eQTL 6.39e-01 0.0652 0.139 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -157276 sc-eQTL 3.56e-02 0.282 0.133 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -208386 sc-eQTL 8.80e-01 -0.00943 0.0622 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -207156 sc-eQTL 3.00e-01 -0.13 0.125 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 92985 sc-eQTL 3.81e-01 0.0925 0.105 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 977941 sc-eQTL 6.06e-01 0.0464 0.09 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -157276 sc-eQTL 1.98e-01 0.126 0.0974 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -208386 sc-eQTL 3.13e-01 -0.064 0.0633 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -207156 sc-eQTL 4.85e-01 0.0853 0.122 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 92985 sc-eQTL 8.36e-01 0.0242 0.117 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 977941 sc-eQTL 7.55e-01 0.0308 0.0986 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -157276 sc-eQTL 1.91e-01 0.151 0.115 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -208386 sc-eQTL 1.32e-01 -0.0901 0.0596 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -207156 sc-eQTL 3.11e-01 0.141 0.138 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 92985 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0687 0.136 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 977941 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0996 0.126 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -157276 sc-eQTL 4.39e-01 -0.102 0.131 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -208386 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0562 0.0536 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -207156 sc-eQTL 3.25e-01 0.132 0.133 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 92985 sc-eQTL 8.15e-02 0.192 0.11 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 977941 sc-eQTL 9.64e-02 -0.188 0.113 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -157276 sc-eQTL 1.36e-01 0.187 0.125 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -208386 sc-eQTL 3.58e-02 -0.141 0.0666 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -207156 sc-eQTL 3.77e-01 0.115 0.13 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 92985 sc-eQTL 9.25e-01 0.0127 0.135 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 977941 sc-eQTL 2.25e-01 -0.131 0.108 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -157276 sc-eQTL 9.70e-01 0.00431 0.116 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -208386 sc-eQTL 4.86e-02 -0.131 0.0658 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -207156 sc-eQTL 3.84e-01 0.116 0.133 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 92985 sc-eQTL 5.72e-01 0.0766 0.135 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 977941 sc-eQTL 5.19e-02 0.263 0.134 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -157276 sc-eQTL 2.51e-02 0.299 0.132 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -208386 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0524 0.0653 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -207156 sc-eQTL 2.52e-02 0.319 0.142 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 92985 sc-eQTL 4.78e-01 0.0973 0.137 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 977941 sc-eQTL 9.07e-01 0.0155 0.132 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -157276 sc-eQTL 8.59e-01 0.0243 0.136 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -208386 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0582 0.0733 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -207156 sc-eQTL 2.10e-01 -0.174 0.138 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 92985 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0847 0.127 0.128 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 977941 sc-eQTL 3.08e-01 -0.135 0.132 0.128 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -157276 sc-eQTL 4.42e-01 0.0993 0.129 0.128 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -208386 sc-eQTL 7.74e-01 0.0182 0.0635 0.128 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -207156 sc-eQTL 3.26e-01 -0.131 0.133 0.128 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 92985 sc-eQTL 4.09e-01 -0.108 0.131 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 977941 sc-eQTL 7.37e-01 0.0466 0.139 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -157276 sc-eQTL 5.42e-01 0.0815 0.133 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -208386 sc-eQTL 2.01e-01 -0.0948 0.074 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 92985 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0302 0.106 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 977941 sc-eQTL 9.58e-01 0.00577 0.109 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -157276 sc-eQTL 2.29e-01 0.16 0.132 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -208386 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0558 0.0526 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 92985 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0488 0.13 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 977941 sc-eQTL 2.31e-01 -0.158 0.131 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -157276 sc-eQTL 1.48e-01 0.191 0.131 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -208386 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0247 0.0615 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 92985 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0159 0.116 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 977941 sc-eQTL 8.71e-01 0.0196 0.12 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -157276 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0608 0.13 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -208386 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0333 0.0708 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 204708 sc-eQTL 5.82e-01 0.0722 0.131 0.122 PB L2
ENSG00000079950 STX7 92985 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0146 0.109 0.122 PB L2
ENSG00000112282 MED23 977941 sc-eQTL 3.85e-03 0.423 0.143 0.122 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -157276 sc-eQTL 2.01e-01 -0.171 0.133 0.122 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -208386 sc-eQTL 1.02e-01 0.124 0.075 0.122 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -207156 sc-eQTL 7.94e-01 0.0373 0.142 0.122 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 474295 sc-eQTL 1.79e-01 -0.126 0.0928 0.122 PB L2
ENSG00000079950 STX7 92985 sc-eQTL 4.20e-02 0.244 0.119 0.13 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 977941 sc-eQTL 8.96e-01 0.0177 0.135 0.13 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -157276 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0576 0.129 0.13 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -208386 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0429 0.0487 0.13 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -207156 sc-eQTL 4.44e-01 0.0967 0.126 0.13 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 92985 sc-eQTL 2.82e-01 0.14 0.13 0.13 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 977941 sc-eQTL 5.13e-01 0.0876 0.134 0.13 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -157276 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0206 0.11 0.13 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -208386 sc-eQTL 6.16e-02 -0.0903 0.0481 0.13 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -207156 sc-eQTL 1.03e-01 0.223 0.136 0.13 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 92985 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0903 0.113 0.132 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -128582 sc-eQTL 5.45e-01 0.0678 0.112 0.132 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 977941 sc-eQTL 2.53e-01 0.167 0.145 0.132 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -107872 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0536 0.132 0.132 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -157276 sc-eQTL 3.06e-01 0.131 0.128 0.132 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -208386 sc-eQTL 2.65e-01 0.0706 0.0632 0.132 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -207156 sc-eQTL 2.32e-01 0.15 0.125 0.132 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -496945 sc-eQTL 3.60e-01 0.0919 0.1 0.132 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 92985 sc-eQTL 1.53e-01 0.121 0.0847 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -128582 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00382 0.12 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 977941 sc-eQTL 2.84e-01 -0.127 0.119 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -107872 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0436 0.121 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -157276 sc-eQTL 8.61e-01 -0.017 0.0971 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -208386 sc-eQTL 4.72e-02 -0.107 0.0534 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -207156 sc-eQTL 7.40e-01 0.0345 0.104 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 92985 sc-eQTL 9.20e-01 0.00918 0.0917 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -128582 sc-eQTL 3.82e-01 -0.1 0.114 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 977941 sc-eQTL 9.65e-01 0.00545 0.124 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -107872 sc-eQTL 9.53e-01 0.00733 0.124 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -157276 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0895 0.0812 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -208386 sc-eQTL 6.51e-01 0.0265 0.0586 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -207156 sc-eQTL 1.74e-01 0.148 0.108 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 92985 sc-eQTL 5.90e-01 0.0856 0.158 0.127 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 977941 sc-eQTL 6.46e-02 -0.313 0.168 0.127 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -157276 sc-eQTL 6.45e-01 0.0807 0.175 0.127 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -208386 sc-eQTL 2.68e-01 0.074 0.0664 0.127 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -207156 sc-eQTL 3.22e-02 0.367 0.17 0.127 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 92985 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0757 0.122 0.131 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -128582 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0747 0.124 0.131 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 977941 sc-eQTL 7.70e-01 0.0398 0.136 0.131 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -107872 sc-eQTL 9.55e-01 0.00696 0.122 0.131 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -157276 sc-eQTL 6.35e-01 0.0591 0.124 0.131 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -208386 sc-eQTL 4.92e-01 0.0372 0.054 0.131 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -207156 sc-eQTL 6.40e-02 0.243 0.131 0.131 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 92985 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0482 0.0912 0.131 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -128582 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0106 0.129 0.131 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 977941 sc-eQTL 3.69e-01 -0.117 0.13 0.131 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -107872 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0579 0.128 0.131 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -157276 sc-eQTL 9.32e-01 0.0105 0.123 0.131 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -208386 sc-eQTL 8.78e-01 -0.00951 0.0616 0.131 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -207156 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0207 0.109 0.131 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 92985 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0921 0.105 0.133 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -128582 sc-eQTL 3.73e-01 0.0945 0.106 0.133 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 977941 sc-eQTL 1.99e-01 -0.19 0.147 0.133 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -107872 sc-eQTL 3.14e-01 0.109 0.108 0.133 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -157276 sc-eQTL 3.78e-01 0.113 0.128 0.133 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -208386 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0381 0.0884 0.133 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -207156 sc-eQTL 3.48e-01 -0.123 0.131 0.133 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -496945 sc-eQTL 1.13e-01 0.198 0.124 0.133 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 204708 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0552 0.132 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 92985 sc-eQTL 4.48e-01 0.057 0.075 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 977941 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0897 0.115 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -157276 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00142 0.119 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -208386 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0131 0.0677 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -207156 sc-eQTL 9.67e-02 0.206 0.123 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 474295 sc-eQTL 4.83e-01 -0.084 0.12 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 204708 sc-eQTL 1.86e-01 -0.186 0.14 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 92985 sc-eQTL 1.54e-01 0.0822 0.0574 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 977941 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0217 0.108 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -157276 sc-eQTL 1.61e-01 0.157 0.112 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -208386 sc-eQTL 1.91e-01 -0.0887 0.0675 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -207156 sc-eQTL 1.35e-01 0.191 0.127 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 474295 sc-eQTL 2.05e-01 0.103 0.081 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 92985 sc-eQTL 1.54e-01 0.101 0.0708 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -128582 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0446 0.116 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 977941 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0665 0.111 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -107872 sc-eQTL 9.44e-01 0.00844 0.121 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -157276 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0478 0.0799 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -208386 sc-eQTL 1.85e-01 -0.0726 0.0546 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -207156 sc-eQTL 3.88e-01 0.0842 0.0973 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 92985 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0889 0.0864 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -128582 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0976 0.127 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 977941 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0953 0.124 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -107872 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0213 0.126 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -157276 sc-eQTL 6.64e-01 0.0518 0.119 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -208386 sc-eQTL 7.16e-01 0.0184 0.0505 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -207156 sc-eQTL 4.45e-01 0.0938 0.123 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 92985 sc-eQTL 8.57e-01 0.0181 0.1 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 977941 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0378 0.0975 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -157276 sc-eQTL 2.51e-01 0.146 0.127 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -208386 sc-eQTL 1.97e-01 -0.0669 0.0517 0.129 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 -107872 pQTL 0.00724 -0.137 0.0511 0.0 0.0 0.128

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000228495 \N 474268 5.85e-07 3.47e-07 1e-07 3.57e-07 9.72e-08 1.74e-07 4.42e-07 1.21e-07 2.81e-07 2.06e-07 4.13e-07 3.08e-07 5.54e-07 1.01e-07 1.48e-07 1.84e-07 2.11e-07 3.44e-07 1.77e-07 1.15e-07 1.92e-07 2.99e-07 3.03e-07 1.29e-07 4.88e-07 2.46e-07 2.24e-07 2.01e-07 2.84e-07 4.51e-07 2e-07 7.12e-08 4.35e-08 1.16e-07 2.61e-07 8.75e-08 1.01e-07 9.58e-08 4.23e-08 5.54e-08 5.23e-08 3.27e-07 2.99e-08 1.62e-08 1.15e-07 1.88e-08 1.11e-07 1.24e-08 6.46e-08