logo

Genes within 1Mb (chr6:132604071:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 202596 sc-eQTL 6.12e-02 -0.252 0.134 0.13 B L1
ENSG00000079950 STX7 90873 sc-eQTL 2.00e-01 0.0653 0.0508 0.13 B L1
ENSG00000112282 MED23 975829 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0743 0.101 0.13 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -159388 sc-eQTL 2.34e-01 0.114 0.0955 0.13 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -210498 sc-eQTL 3.87e-02 -0.119 0.0573 0.13 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -209268 sc-eQTL 2.06e-01 0.154 0.121 0.13 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 472183 sc-eQTL 3.23e-01 0.0791 0.0798 0.13 B L1
ENSG00000079950 STX7 90873 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00095 0.0981 0.13 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 975829 sc-eQTL 8.75e-01 0.0123 0.0779 0.13 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -159388 sc-eQTL 1.74e-01 0.115 0.0846 0.13 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -210498 sc-eQTL 1.19e-01 -0.09 0.0574 0.13 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -209268 sc-eQTL 1.85e-01 0.155 0.116 0.13 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 90873 sc-eQTL 5.65e-01 0.0556 0.0965 0.13 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 975829 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0565 0.0951 0.13 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -159388 sc-eQTL 3.28e-01 0.11 0.113 0.13 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -210498 sc-eQTL 1.18e-02 -0.0964 0.038 0.13 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -209268 sc-eQTL 9.10e-01 0.0132 0.117 0.13 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 90873 sc-eQTL 2.35e-01 -0.104 0.0874 0.133 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -130694 sc-eQTL 1.47e-01 0.157 0.108 0.133 DC L1
ENSG00000112282 MED23 975829 sc-eQTL 5.02e-01 0.0857 0.128 0.133 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -109984 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00118 0.117 0.133 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -159388 sc-eQTL 4.53e-01 0.0943 0.125 0.133 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -210498 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0193 0.0704 0.133 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -209268 sc-eQTL 8.97e-01 0.0144 0.111 0.133 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -499057 sc-eQTL 8.82e-02 0.173 0.101 0.133 DC L1
ENSG00000079950 STX7 90873 sc-eQTL 1.20e-01 0.102 0.0652 0.13 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -130694 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0512 0.113 0.13 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 975829 sc-eQTL 3.19e-01 -0.106 0.107 0.13 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -109984 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0203 0.121 0.13 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -159388 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0123 0.0855 0.13 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -210498 sc-eQTL 2.28e-01 -0.0617 0.0511 0.13 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -209268 sc-eQTL 8.80e-02 0.173 0.101 0.13 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 90873 sc-eQTL 8.02e-01 0.0251 0.1 0.131 NK L1
ENSG00000112282 MED23 975829 sc-eQTL 5.92e-01 -0.049 0.0915 0.131 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -159388 sc-eQTL 2.17e-01 0.154 0.124 0.131 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -210498 sc-eQTL 1.09e-01 -0.0825 0.0512 0.131 NK L1
ENSG00000079950 STX7 90873 sc-eQTL 3.40e-01 0.0954 0.0998 0.13 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 975829 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0878 0.125 0.13 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -159388 sc-eQTL 1.64e-01 0.168 0.12 0.13 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -210498 sc-eQTL 1.70e-01 -0.0658 0.0478 0.13 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -209268 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0126 0.131 0.13 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 202596 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0812 0.143 0.128 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 90873 sc-eQTL 5.97e-01 0.071 0.134 0.128 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 975829 sc-eQTL 1.33e-01 -0.223 0.148 0.128 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -159388 sc-eQTL 3.06e-01 0.146 0.142 0.128 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -210498 sc-eQTL 6.26e-02 -0.142 0.0757 0.128 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209268 sc-eQTL 2.79e-02 0.293 0.132 0.128 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 472183 sc-eQTL 2.15e-01 -0.158 0.127 0.128 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 202596 sc-eQTL 1.83e-01 -0.167 0.125 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 90873 sc-eQTL 8.56e-01 0.0149 0.0821 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 975829 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0376 0.125 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -159388 sc-eQTL 6.27e-01 0.0601 0.124 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -210498 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0154 0.0757 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209268 sc-eQTL 4.08e-01 0.113 0.136 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 472183 sc-eQTL 8.08e-01 0.0281 0.116 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 202596 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0912 0.123 0.129 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 90873 sc-eQTL 1.37e-01 0.144 0.0963 0.129 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 975829 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00968 0.125 0.129 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -159388 sc-eQTL 4.02e-01 -0.106 0.126 0.129 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -210498 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0517 0.0609 0.129 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209268 sc-eQTL 2.54e-01 0.145 0.127 0.129 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 472183 sc-eQTL 7.87e-01 0.0321 0.119 0.129 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 202596 sc-eQTL 2.54e-01 -0.159 0.14 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 90873 sc-eQTL 2.45e-01 0.071 0.061 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 975829 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0816 0.109 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -159388 sc-eQTL 3.93e-01 0.102 0.119 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -210498 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0809 0.0674 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209268 sc-eQTL 2.26e-01 0.158 0.13 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 472183 sc-eQTL 4.51e-01 0.0652 0.0863 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 202596 sc-eQTL 4.22e-01 -0.107 0.132 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 90873 sc-eQTL 5.36e-01 0.0447 0.0722 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 975829 sc-eQTL 4.67e-01 0.0972 0.133 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -159388 sc-eQTL 2.02e-01 0.169 0.132 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -210498 sc-eQTL 2.13e-01 -0.0875 0.07 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209268 sc-eQTL 1.72e-01 0.183 0.133 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 472183 sc-eQTL 5.93e-01 0.0497 0.0929 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 90873 sc-eQTL 3.98e-01 -0.113 0.133 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 975829 sc-eQTL 6.39e-01 0.0652 0.139 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -159388 sc-eQTL 3.56e-02 0.282 0.133 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -210498 sc-eQTL 8.80e-01 -0.00943 0.0622 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209268 sc-eQTL 3.00e-01 -0.13 0.125 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 90873 sc-eQTL 3.81e-01 0.0925 0.105 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 975829 sc-eQTL 6.06e-01 0.0464 0.09 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -159388 sc-eQTL 1.98e-01 0.126 0.0974 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -210498 sc-eQTL 3.13e-01 -0.064 0.0633 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209268 sc-eQTL 4.85e-01 0.0853 0.122 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 90873 sc-eQTL 8.36e-01 0.0242 0.117 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 975829 sc-eQTL 7.55e-01 0.0308 0.0986 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -159388 sc-eQTL 1.91e-01 0.151 0.115 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -210498 sc-eQTL 1.32e-01 -0.0901 0.0596 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209268 sc-eQTL 3.11e-01 0.141 0.138 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 90873 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0687 0.136 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 975829 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0996 0.126 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -159388 sc-eQTL 4.39e-01 -0.102 0.131 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -210498 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0562 0.0536 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209268 sc-eQTL 3.25e-01 0.132 0.133 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 90873 sc-eQTL 8.15e-02 0.192 0.11 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 975829 sc-eQTL 9.64e-02 -0.188 0.113 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -159388 sc-eQTL 1.36e-01 0.187 0.125 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -210498 sc-eQTL 3.58e-02 -0.141 0.0666 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209268 sc-eQTL 3.77e-01 0.115 0.13 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 90873 sc-eQTL 9.25e-01 0.0127 0.135 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 975829 sc-eQTL 2.25e-01 -0.131 0.108 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -159388 sc-eQTL 9.70e-01 0.00431 0.116 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -210498 sc-eQTL 4.86e-02 -0.131 0.0658 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209268 sc-eQTL 3.84e-01 0.116 0.133 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 90873 sc-eQTL 5.72e-01 0.0766 0.135 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 975829 sc-eQTL 5.19e-02 0.263 0.134 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -159388 sc-eQTL 2.51e-02 0.299 0.132 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -210498 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0524 0.0653 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209268 sc-eQTL 2.52e-02 0.319 0.142 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 90873 sc-eQTL 4.78e-01 0.0973 0.137 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 975829 sc-eQTL 9.07e-01 0.0155 0.132 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -159388 sc-eQTL 8.59e-01 0.0243 0.136 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -210498 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0582 0.0733 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209268 sc-eQTL 2.10e-01 -0.174 0.138 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 90873 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0847 0.127 0.128 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 975829 sc-eQTL 3.08e-01 -0.135 0.132 0.128 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -159388 sc-eQTL 4.42e-01 0.0993 0.129 0.128 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -210498 sc-eQTL 7.74e-01 0.0182 0.0635 0.128 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209268 sc-eQTL 3.26e-01 -0.131 0.133 0.128 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 90873 sc-eQTL 4.09e-01 -0.108 0.131 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 975829 sc-eQTL 7.37e-01 0.0466 0.139 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -159388 sc-eQTL 5.42e-01 0.0815 0.133 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -210498 sc-eQTL 2.01e-01 -0.0948 0.074 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 90873 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0302 0.106 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 975829 sc-eQTL 9.58e-01 0.00577 0.109 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -159388 sc-eQTL 2.29e-01 0.16 0.132 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -210498 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0558 0.0526 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 90873 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0488 0.13 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 975829 sc-eQTL 2.31e-01 -0.158 0.131 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -159388 sc-eQTL 1.48e-01 0.191 0.131 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -210498 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0247 0.0615 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 90873 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0159 0.116 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 975829 sc-eQTL 8.71e-01 0.0196 0.12 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -159388 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0608 0.13 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -210498 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0333 0.0708 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 202596 sc-eQTL 5.82e-01 0.0722 0.131 0.122 PB L2
ENSG00000079950 STX7 90873 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0146 0.109 0.122 PB L2
ENSG00000112282 MED23 975829 sc-eQTL 3.85e-03 0.423 0.143 0.122 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -159388 sc-eQTL 2.01e-01 -0.171 0.133 0.122 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -210498 sc-eQTL 1.02e-01 0.124 0.075 0.122 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209268 sc-eQTL 7.94e-01 0.0373 0.142 0.122 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 472183 sc-eQTL 1.79e-01 -0.126 0.0928 0.122 PB L2
ENSG00000079950 STX7 90873 sc-eQTL 4.20e-02 0.244 0.119 0.13 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 975829 sc-eQTL 8.96e-01 0.0177 0.135 0.13 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -159388 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0576 0.129 0.13 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -210498 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0429 0.0487 0.13 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209268 sc-eQTL 4.44e-01 0.0967 0.126 0.13 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 90873 sc-eQTL 2.82e-01 0.14 0.13 0.13 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 975829 sc-eQTL 5.13e-01 0.0876 0.134 0.13 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -159388 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0206 0.11 0.13 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -210498 sc-eQTL 6.16e-02 -0.0903 0.0481 0.13 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209268 sc-eQTL 1.03e-01 0.223 0.136 0.13 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 90873 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0903 0.113 0.132 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -130694 sc-eQTL 5.45e-01 0.0678 0.112 0.132 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 975829 sc-eQTL 2.53e-01 0.167 0.145 0.132 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -109984 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0536 0.132 0.132 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -159388 sc-eQTL 3.06e-01 0.131 0.128 0.132 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -210498 sc-eQTL 2.65e-01 0.0706 0.0632 0.132 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209268 sc-eQTL 2.32e-01 0.15 0.125 0.132 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -499057 sc-eQTL 3.60e-01 0.0919 0.1 0.132 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 90873 sc-eQTL 1.53e-01 0.121 0.0847 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -130694 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00382 0.12 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 975829 sc-eQTL 2.84e-01 -0.127 0.119 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -109984 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0436 0.121 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -159388 sc-eQTL 8.61e-01 -0.017 0.0971 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -210498 sc-eQTL 4.72e-02 -0.107 0.0534 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209268 sc-eQTL 7.40e-01 0.0345 0.104 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 90873 sc-eQTL 9.20e-01 0.00918 0.0917 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -130694 sc-eQTL 3.82e-01 -0.1 0.114 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 975829 sc-eQTL 9.65e-01 0.00545 0.124 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -109984 sc-eQTL 9.53e-01 0.00733 0.124 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -159388 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0895 0.0812 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -210498 sc-eQTL 6.51e-01 0.0265 0.0586 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209268 sc-eQTL 1.74e-01 0.148 0.108 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 90873 sc-eQTL 5.90e-01 0.0856 0.158 0.127 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 975829 sc-eQTL 6.46e-02 -0.313 0.168 0.127 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -159388 sc-eQTL 6.45e-01 0.0807 0.175 0.127 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -210498 sc-eQTL 2.68e-01 0.074 0.0664 0.127 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209268 sc-eQTL 3.22e-02 0.367 0.17 0.127 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 90873 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0757 0.122 0.131 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -130694 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0747 0.124 0.131 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 975829 sc-eQTL 7.70e-01 0.0398 0.136 0.131 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -109984 sc-eQTL 9.55e-01 0.00696 0.122 0.131 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -159388 sc-eQTL 6.35e-01 0.0591 0.124 0.131 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -210498 sc-eQTL 4.92e-01 0.0372 0.054 0.131 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209268 sc-eQTL 6.40e-02 0.243 0.131 0.131 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 90873 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0482 0.0912 0.131 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -130694 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0106 0.129 0.131 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 975829 sc-eQTL 3.69e-01 -0.117 0.13 0.131 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -109984 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0579 0.128 0.131 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -159388 sc-eQTL 9.32e-01 0.0105 0.123 0.131 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -210498 sc-eQTL 8.78e-01 -0.00951 0.0616 0.131 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209268 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0207 0.109 0.131 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 90873 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0921 0.105 0.133 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -130694 sc-eQTL 3.73e-01 0.0945 0.106 0.133 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 975829 sc-eQTL 1.99e-01 -0.19 0.147 0.133 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -109984 sc-eQTL 3.14e-01 0.109 0.108 0.133 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -159388 sc-eQTL 3.78e-01 0.113 0.128 0.133 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -210498 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0381 0.0884 0.133 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209268 sc-eQTL 3.48e-01 -0.123 0.131 0.133 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -499057 sc-eQTL 1.13e-01 0.198 0.124 0.133 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 202596 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0552 0.132 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 90873 sc-eQTL 4.48e-01 0.057 0.075 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 975829 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0897 0.115 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -159388 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00142 0.119 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -210498 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0131 0.0677 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -209268 sc-eQTL 9.67e-02 0.206 0.123 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 472183 sc-eQTL 4.83e-01 -0.084 0.12 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 202596 sc-eQTL 1.86e-01 -0.186 0.14 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 90873 sc-eQTL 1.54e-01 0.0822 0.0574 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 975829 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0217 0.108 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -159388 sc-eQTL 1.61e-01 0.157 0.112 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -210498 sc-eQTL 1.91e-01 -0.0887 0.0675 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -209268 sc-eQTL 1.35e-01 0.191 0.127 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 472183 sc-eQTL 2.05e-01 0.103 0.081 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 90873 sc-eQTL 1.54e-01 0.101 0.0708 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -130694 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0446 0.116 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 975829 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0665 0.111 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -109984 sc-eQTL 9.44e-01 0.00844 0.121 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -159388 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0478 0.0799 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -210498 sc-eQTL 1.85e-01 -0.0726 0.0546 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -209268 sc-eQTL 3.88e-01 0.0842 0.0973 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 90873 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0889 0.0864 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -130694 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0976 0.127 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 975829 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0953 0.124 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -109984 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0213 0.126 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -159388 sc-eQTL 6.64e-01 0.0518 0.119 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -210498 sc-eQTL 7.16e-01 0.0184 0.0505 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -209268 sc-eQTL 4.45e-01 0.0938 0.123 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 90873 sc-eQTL 8.57e-01 0.0181 0.1 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 975829 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0378 0.0975 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -159388 sc-eQTL 2.51e-01 0.146 0.127 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -210498 sc-eQTL 1.97e-01 -0.0669 0.0517 0.129 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 -109984 pQTL 0.00588 -0.141 0.0511 0.0 0.0 0.128

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000228495 \N 472156 7.76e-07 2.67e-07 7.87e-08 2.87e-07 1.07e-07 1.19e-07 4.09e-07 6.72e-08 2.56e-07 1.46e-07 3.66e-07 1.96e-07 5.54e-07 8.85e-08 9.2e-08 1.26e-07 9.53e-08 2.9e-07 7.53e-08 8.87e-08 1.33e-07 2.3e-07 2.56e-07 5.11e-08 4.54e-07 1.76e-07 1.48e-07 1.7e-07 2.11e-07 2.26e-07 2e-07 5.4e-08 4.76e-08 1.02e-07 1.39e-07 5.14e-08 5.67e-08 7.49e-08 4.9e-08 8.2e-08 3.6e-08 2.8e-07 3.13e-08 1.43e-08 5.4e-08 9.86e-09 8.21e-08 0.0 4.67e-08