logo

Genes within 1Mb (chr6:132603730:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 202255 sc-eQTL 3.99e-02 -0.275 0.133 0.132 B L1
ENSG00000079950 STX7 90532 sc-eQTL 2.72e-01 0.0557 0.0506 0.132 B L1
ENSG00000112282 MED23 975488 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0566 0.101 0.132 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -159729 sc-eQTL 2.67e-01 0.106 0.0951 0.132 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -210839 sc-eQTL 3.59e-02 -0.12 0.0571 0.132 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -209609 sc-eQTL 2.02e-01 0.155 0.121 0.132 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 471842 sc-eQTL 3.28e-01 0.0779 0.0794 0.132 B L1
ENSG00000079950 STX7 90532 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0116 0.0977 0.132 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 975488 sc-eQTL 9.04e-01 0.00936 0.0775 0.132 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -159729 sc-eQTL 2.63e-01 0.0946 0.0843 0.132 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -210839 sc-eQTL 9.01e-02 -0.0973 0.0571 0.132 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -209609 sc-eQTL 1.68e-01 0.16 0.116 0.132 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 90532 sc-eQTL 6.40e-01 0.045 0.0962 0.132 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 975488 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0422 0.0947 0.132 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -159729 sc-eQTL 3.53e-01 0.104 0.112 0.132 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -210839 sc-eQTL 1.23e-02 -0.0955 0.0378 0.132 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -209609 sc-eQTL 7.55e-01 0.0363 0.116 0.132 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 90532 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0929 0.087 0.135 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -131035 sc-eQTL 1.83e-01 0.144 0.108 0.135 DC L1
ENSG00000112282 MED23 975488 sc-eQTL 5.64e-01 0.0734 0.127 0.135 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -110325 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0153 0.117 0.135 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -159729 sc-eQTL 4.52e-01 0.0941 0.125 0.135 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -210839 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00815 0.0701 0.135 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -209609 sc-eQTL 6.66e-01 0.0479 0.111 0.135 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -499398 sc-eQTL 6.55e-02 0.185 0.1 0.135 DC L1
ENSG00000079950 STX7 90532 sc-eQTL 1.62e-01 0.0913 0.0651 0.132 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -131035 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0651 0.112 0.132 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 975488 sc-eQTL 3.16e-01 -0.107 0.106 0.132 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -110325 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0365 0.121 0.132 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -159729 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00865 0.0852 0.132 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -210839 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0489 0.051 0.132 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -209609 sc-eQTL 3.44e-02 0.213 0.1 0.132 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 90532 sc-eQTL 8.42e-01 0.02 0.0997 0.133 NK L1
ENSG00000112282 MED23 975488 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0709 0.091 0.133 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -159729 sc-eQTL 2.02e-01 0.158 0.124 0.133 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -210839 sc-eQTL 1.19e-01 -0.08 0.051 0.133 NK L1
ENSG00000079950 STX7 90532 sc-eQTL 2.89e-01 0.106 0.0993 0.132 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 975488 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0997 0.124 0.132 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -159729 sc-eQTL 2.05e-01 0.152 0.12 0.132 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -210839 sc-eQTL 1.76e-01 -0.0645 0.0475 0.132 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -209609 sc-eQTL 9.47e-01 0.00865 0.131 0.132 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 202255 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0667 0.142 0.13 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 90532 sc-eQTL 7.29e-01 0.0462 0.133 0.13 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 975488 sc-eQTL 1.75e-01 -0.2 0.147 0.13 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -159729 sc-eQTL 4.17e-01 0.115 0.142 0.13 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -210839 sc-eQTL 7.73e-02 -0.134 0.0754 0.13 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209609 sc-eQTL 1.21e-02 0.332 0.131 0.13 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 471842 sc-eQTL 2.73e-01 -0.139 0.127 0.13 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 202255 sc-eQTL 1.76e-01 -0.169 0.124 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 90532 sc-eQTL 9.31e-01 0.00706 0.0817 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 975488 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0419 0.124 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -159729 sc-eQTL 6.17e-01 0.0616 0.123 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -210839 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0225 0.0753 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209609 sc-eQTL 4.32e-01 0.107 0.135 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 471842 sc-eQTL 9.11e-01 0.0129 0.115 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 202255 sc-eQTL 4.79e-01 -0.087 0.123 0.131 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 90532 sc-eQTL 1.80e-01 0.129 0.0959 0.131 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 975488 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00296 0.124 0.131 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -159729 sc-eQTL 4.85e-01 -0.088 0.126 0.131 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -210839 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0581 0.0606 0.131 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209609 sc-eQTL 3.30e-01 0.123 0.126 0.131 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 471842 sc-eQTL 8.75e-01 0.0186 0.118 0.131 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 202255 sc-eQTL 1.97e-01 -0.179 0.139 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 90532 sc-eQTL 3.29e-01 0.0594 0.0608 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 975488 sc-eQTL 5.34e-01 -0.068 0.109 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -159729 sc-eQTL 3.92e-01 0.101 0.118 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -210839 sc-eQTL 2.13e-01 -0.0838 0.0671 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209609 sc-eQTL 1.62e-01 0.182 0.129 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 471842 sc-eQTL 3.28e-01 0.0841 0.0859 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 202255 sc-eQTL 3.33e-01 -0.128 0.132 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 90532 sc-eQTL 6.03e-01 0.0374 0.0718 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 975488 sc-eQTL 3.76e-01 0.118 0.132 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -159729 sc-eQTL 2.69e-01 0.146 0.132 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -210839 sc-eQTL 1.99e-01 -0.0897 0.0696 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209609 sc-eQTL 2.14e-01 0.166 0.133 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 471842 sc-eQTL 7.43e-01 0.0303 0.0924 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 90532 sc-eQTL 3.37e-01 -0.128 0.133 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 975488 sc-eQTL 6.42e-01 0.0644 0.138 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -159729 sc-eQTL 4.42e-02 0.269 0.133 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -210839 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0141 0.062 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209609 sc-eQTL 2.24e-01 -0.152 0.125 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 90532 sc-eQTL 4.43e-01 0.0806 0.105 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 975488 sc-eQTL 5.89e-01 0.0485 0.0896 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -159729 sc-eQTL 2.29e-01 0.117 0.097 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -210839 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0717 0.0629 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209609 sc-eQTL 4.87e-01 0.0845 0.121 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 90532 sc-eQTL 9.20e-01 0.0117 0.117 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 975488 sc-eQTL 9.83e-01 0.00206 0.0981 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -159729 sc-eQTL 2.30e-01 0.138 0.115 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -210839 sc-eQTL 1.17e-01 -0.0932 0.0593 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209609 sc-eQTL 2.81e-01 0.149 0.138 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 90532 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0894 0.136 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 975488 sc-eQTL 4.87e-01 -0.087 0.125 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -159729 sc-eQTL 3.31e-01 -0.127 0.13 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -210839 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0628 0.0533 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209609 sc-eQTL 1.98e-01 0.171 0.132 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 90532 sc-eQTL 1.21e-01 0.171 0.11 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 975488 sc-eQTL 1.41e-01 -0.166 0.113 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -159729 sc-eQTL 1.42e-01 0.184 0.125 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -210839 sc-eQTL 3.63e-02 -0.14 0.0664 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209609 sc-eQTL 4.44e-01 0.0997 0.13 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 90532 sc-eQTL 9.79e-01 0.00353 0.134 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 975488 sc-eQTL 2.67e-01 -0.119 0.107 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -159729 sc-eQTL 9.60e-01 0.00576 0.115 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -210839 sc-eQTL 4.11e-02 -0.135 0.0655 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209609 sc-eQTL 3.17e-01 0.133 0.132 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 90532 sc-eQTL 6.24e-01 0.066 0.134 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 975488 sc-eQTL 4.68e-02 0.267 0.134 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -159729 sc-eQTL 3.77e-02 0.276 0.132 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -210839 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0508 0.065 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209609 sc-eQTL 1.69e-02 0.339 0.141 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 90532 sc-eQTL 4.57e-01 0.102 0.136 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 975488 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00332 0.131 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -159729 sc-eQTL 6.79e-01 0.0562 0.136 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -210839 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0524 0.073 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209609 sc-eQTL 4.14e-01 -0.113 0.138 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 90532 sc-eQTL 5.01e-01 -0.085 0.126 0.13 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 975488 sc-eQTL 2.79e-01 -0.143 0.132 0.13 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -159729 sc-eQTL 5.22e-01 0.0822 0.128 0.13 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -210839 sc-eQTL 7.54e-01 0.0198 0.0631 0.13 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209609 sc-eQTL 4.07e-01 -0.11 0.132 0.13 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 90532 sc-eQTL 4.32e-01 -0.102 0.13 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 975488 sc-eQTL 7.73e-01 0.0397 0.138 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -159729 sc-eQTL 5.59e-01 0.0775 0.132 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -210839 sc-eQTL 2.04e-01 -0.0936 0.0735 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 90532 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0294 0.106 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 975488 sc-eQTL 9.44e-01 0.00768 0.109 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -159729 sc-eQTL 2.25e-01 0.16 0.132 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -210839 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0515 0.0524 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 90532 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0759 0.13 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 975488 sc-eQTL 1.74e-01 -0.178 0.131 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -159729 sc-eQTL 2.45e-01 0.153 0.131 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -210839 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0213 0.0612 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 90532 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0227 0.115 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 975488 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00872 0.119 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -159729 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0471 0.13 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -210839 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0282 0.0704 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 202255 sc-eQTL 5.82e-01 0.0722 0.131 0.122 PB L2
ENSG00000079950 STX7 90532 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0146 0.109 0.122 PB L2
ENSG00000112282 MED23 975488 sc-eQTL 3.85e-03 0.423 0.143 0.122 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -159729 sc-eQTL 2.01e-01 -0.171 0.133 0.122 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -210839 sc-eQTL 1.02e-01 0.124 0.075 0.122 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209609 sc-eQTL 7.94e-01 0.0373 0.142 0.122 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 471842 sc-eQTL 1.79e-01 -0.126 0.0928 0.122 PB L2
ENSG00000079950 STX7 90532 sc-eQTL 4.36e-02 0.24 0.118 0.133 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 975488 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0251 0.135 0.133 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -159729 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0826 0.128 0.133 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -210839 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0395 0.0485 0.133 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209609 sc-eQTL 5.59e-01 0.0734 0.126 0.133 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 90532 sc-eQTL 2.80e-01 0.14 0.129 0.132 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 975488 sc-eQTL 4.59e-01 0.0988 0.133 0.132 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -159729 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0489 0.109 0.132 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -210839 sc-eQTL 5.43e-02 -0.0926 0.0478 0.132 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209609 sc-eQTL 1.13e-01 0.216 0.136 0.132 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 90532 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0984 0.112 0.134 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -131035 sc-eQTL 6.21e-01 0.0553 0.112 0.134 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 975488 sc-eQTL 2.44e-01 0.169 0.145 0.134 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -110325 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0719 0.131 0.134 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -159729 sc-eQTL 3.81e-01 0.112 0.128 0.134 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -210839 sc-eQTL 2.39e-01 0.0744 0.0629 0.134 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209609 sc-eQTL 1.24e-01 0.192 0.124 0.134 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -499398 sc-eQTL 2.72e-01 0.11 0.0997 0.134 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 90532 sc-eQTL 2.47e-01 0.0983 0.0846 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -131035 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0157 0.12 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 975488 sc-eQTL 3.32e-01 -0.115 0.118 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -110325 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0528 0.121 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -159729 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0179 0.0968 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -210839 sc-eQTL 8.81e-02 -0.0914 0.0534 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209609 sc-eQTL 4.89e-01 0.0718 0.104 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 90532 sc-eQTL 9.24e-01 0.00873 0.0913 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -131035 sc-eQTL 3.39e-01 -0.109 0.114 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 975488 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0246 0.124 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -110325 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00689 0.124 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -159729 sc-eQTL 3.43e-01 -0.077 0.081 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -210839 sc-eQTL 4.92e-01 0.0402 0.0584 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209609 sc-eQTL 1.47e-01 0.157 0.108 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 90532 sc-eQTL 4.98e-01 0.106 0.156 0.13 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 975488 sc-eQTL 6.14e-02 -0.312 0.166 0.13 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -159729 sc-eQTL 6.86e-01 0.0701 0.173 0.13 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -210839 sc-eQTL 3.09e-01 0.067 0.0656 0.13 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209609 sc-eQTL 2.50e-02 0.379 0.167 0.13 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 90532 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0763 0.122 0.133 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -131035 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0658 0.123 0.133 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 975488 sc-eQTL 6.13e-01 0.0685 0.135 0.133 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -110325 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0124 0.122 0.133 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -159729 sc-eQTL 7.83e-01 0.0341 0.124 0.133 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -210839 sc-eQTL 4.34e-01 0.0421 0.0538 0.133 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209609 sc-eQTL 7.02e-02 0.237 0.13 0.133 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 90532 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0426 0.0906 0.133 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -131035 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0141 0.128 0.133 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 975488 sc-eQTL 3.01e-01 -0.134 0.129 0.133 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -110325 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0777 0.127 0.133 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -159729 sc-eQTL 8.90e-01 0.017 0.122 0.133 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -210839 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0159 0.0612 0.133 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209609 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00374 0.108 0.133 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 90532 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0604 0.104 0.136 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -131035 sc-eQTL 4.00e-01 0.0884 0.105 0.136 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 975488 sc-eQTL 1.42e-01 -0.215 0.145 0.136 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -110325 sc-eQTL 3.39e-01 0.102 0.107 0.136 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -159729 sc-eQTL 2.89e-01 0.135 0.127 0.136 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -210839 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0177 0.0876 0.136 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -209609 sc-eQTL 3.75e-01 -0.115 0.129 0.136 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -499398 sc-eQTL 9.43e-02 0.207 0.123 0.136 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 202255 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0545 0.132 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 90532 sc-eQTL 5.79e-01 0.0416 0.0748 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 975488 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0859 0.114 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -159729 sc-eQTL 9.91e-01 0.00127 0.118 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -210839 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0211 0.0674 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -209609 sc-eQTL 1.06e-01 0.2 0.123 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 471842 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0865 0.119 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 202255 sc-eQTL 1.26e-01 -0.214 0.139 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 90532 sc-eQTL 2.03e-01 0.0731 0.0572 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 975488 sc-eQTL 1.00e+00 -3.4e-05 0.108 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -159729 sc-eQTL 1.92e-01 0.145 0.111 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -210839 sc-eQTL 1.71e-01 -0.0924 0.0672 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -209609 sc-eQTL 1.21e-01 0.197 0.127 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 471842 sc-eQTL 1.82e-01 0.108 0.0805 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 90532 sc-eQTL 2.33e-01 0.0845 0.0706 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -131035 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0591 0.115 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 975488 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0696 0.111 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -110325 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00478 0.12 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -159729 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0427 0.0796 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -210839 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0568 0.0545 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -209609 sc-eQTL 2.39e-01 0.114 0.0969 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 90532 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0825 0.0862 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -131035 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0983 0.127 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 975488 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0953 0.124 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -110325 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0484 0.126 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -159729 sc-eQTL 6.81e-01 0.0489 0.119 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -210839 sc-eQTL 7.45e-01 0.0164 0.0504 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -209609 sc-eQTL 3.94e-01 0.104 0.122 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 90532 sc-eQTL 9.06e-01 0.0119 0.1 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 975488 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0591 0.097 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -159729 sc-eQTL 2.28e-01 0.153 0.126 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -210839 sc-eQTL 2.17e-01 -0.0637 0.0515 0.131 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 -110325 pQTL 0.0063 -0.14 0.0511 0.0 0.0 0.129

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000228495 \N 471815 1.04e-06 6.99e-07 1.05e-07 4.27e-07 1.07e-07 2.95e-07 5.76e-07 7.98e-08 4.18e-07 2.01e-07 6.28e-07 3.73e-07 7.53e-07 1.6e-07 2.07e-07 1.96e-07 2.34e-07 3.73e-07 1.97e-07 1.43e-07 1.8e-07 3.34e-07 3.03e-07 1.27e-07 7.94e-07 2.46e-07 2.71e-07 2.18e-07 3.56e-07 6.35e-07 2.55e-07 6.06e-08 4.28e-08 1.36e-07 3.36e-07 6.83e-08 1.18e-07 7.51e-08 4.04e-08 3.58e-08 3.43e-08 4.16e-07 4.36e-08 2.67e-08 8.68e-08 1.35e-08 7.25e-08 1.15e-08 5.54e-08