Genes within 1Mb (chr6:132602434:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 200959 sc-eQTL 1.96e-02 -0.285 0.121 0.171 B L1
ENSG00000079950 STX7 89236 sc-eQTL 3.97e-01 0.0393 0.0463 0.171 B L1
ENSG00000112282 MED23 974192 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0859 0.0923 0.171 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -161025 sc-eQTL 1.60e-01 0.122 0.0868 0.171 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -212135 sc-eQTL 2.45e-02 -0.118 0.0521 0.171 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -210905 sc-eQTL 2.47e-01 0.128 0.111 0.171 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 470546 sc-eQTL 4.25e-01 0.058 0.0727 0.171 B L1
ENSG00000079950 STX7 89236 sc-eQTL 9.95e-01 0.00056 0.0913 0.171 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 974192 sc-eQTL 9.51e-01 0.00443 0.0725 0.171 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -161025 sc-eQTL 1.82e-01 0.105 0.0787 0.171 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -212135 sc-eQTL 1.03e-01 -0.0874 0.0534 0.171 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -210905 sc-eQTL 6.64e-02 0.199 0.108 0.171 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 89236 sc-eQTL 3.18e-01 0.088 0.0881 0.171 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 974192 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0304 0.0869 0.171 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -161025 sc-eQTL 6.07e-02 0.193 0.102 0.171 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -212135 sc-eQTL 4.23e-02 -0.0712 0.0349 0.171 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -210905 sc-eQTL 3.62e-01 0.097 0.106 0.171 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 89236 sc-eQTL 6.03e-01 0.0419 0.0805 0.173 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -132331 sc-eQTL 1.30e-01 0.151 0.0993 0.173 DC L1
ENSG00000112282 MED23 974192 sc-eQTL 5.48e-01 0.0704 0.117 0.173 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -111621 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0754 0.108 0.173 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -161025 sc-eQTL 4.38e-01 0.0896 0.115 0.173 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -212135 sc-eQTL 9.32e-01 0.00553 0.0647 0.173 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -210905 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00557 0.102 0.173 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -500694 sc-eQTL 6.59e-02 0.171 0.0924 0.173 DC L1
ENSG00000079950 STX7 89236 sc-eQTL 9.49e-02 0.0998 0.0595 0.171 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -132331 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0845 0.103 0.171 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 974192 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0484 0.0976 0.171 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -111621 sc-eQTL 1.80e-01 -0.148 0.11 0.171 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -161025 sc-eQTL 6.18e-01 0.039 0.078 0.171 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -212135 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0247 0.0468 0.171 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -210905 sc-eQTL 2.46e-01 0.107 0.0923 0.171 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 89236 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0241 0.0913 0.172 NK L1
ENSG00000112282 MED23 974192 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0527 0.0834 0.172 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -161025 sc-eQTL 2.76e-02 0.249 0.112 0.172 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -212135 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0555 0.0469 0.172 NK L1
ENSG00000079950 STX7 89236 sc-eQTL 3.52e-01 0.0841 0.0901 0.171 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 974192 sc-eQTL 9.13e-01 0.0123 0.113 0.171 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -161025 sc-eQTL 2.15e-01 0.135 0.109 0.171 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -212135 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0306 0.0433 0.171 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -210905 sc-eQTL 8.72e-01 0.0192 0.119 0.171 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 200959 sc-eQTL 4.27e-01 -0.103 0.13 0.176 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 89236 sc-eQTL 9.07e-01 0.0142 0.122 0.176 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 974192 sc-eQTL 1.09e-01 -0.215 0.134 0.176 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -161025 sc-eQTL 1.57e-01 0.183 0.129 0.176 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -212135 sc-eQTL 5.20e-02 -0.134 0.0686 0.176 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -210905 sc-eQTL 4.34e-02 0.244 0.12 0.176 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 470546 sc-eQTL 9.21e-02 -0.195 0.115 0.176 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 200959 sc-eQTL 3.56e-01 -0.106 0.115 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 89236 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0527 0.075 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 974192 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0486 0.114 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -161025 sc-eQTL 4.48e-01 0.0859 0.113 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -212135 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0166 0.0693 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -210905 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0353 0.125 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 470546 sc-eQTL 6.20e-01 0.0527 0.106 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 200959 sc-eQTL 1.60e-01 -0.159 0.113 0.17 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 89236 sc-eQTL 3.49e-01 0.0834 0.0889 0.17 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 974192 sc-eQTL 9.98e-01 0.000234 0.115 0.17 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -161025 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0533 0.116 0.17 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -212135 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00406 0.0561 0.17 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -210905 sc-eQTL 1.73e-01 0.16 0.117 0.17 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 470546 sc-eQTL 7.10e-01 0.0406 0.109 0.17 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 200959 sc-eQTL 1.74e-01 -0.173 0.127 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 89236 sc-eQTL 3.93e-01 0.0476 0.0556 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 974192 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0538 0.0997 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -161025 sc-eQTL 6.11e-01 0.055 0.108 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -212135 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0729 0.0614 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -210905 sc-eQTL 8.74e-02 0.203 0.118 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 470546 sc-eQTL 1.67e-01 0.109 0.0783 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 200959 sc-eQTL 2.61e-01 -0.136 0.121 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 89236 sc-eQTL 5.76e-01 0.0371 0.0662 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 974192 sc-eQTL 6.17e-01 0.0612 0.122 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -161025 sc-eQTL 9.18e-02 0.204 0.121 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -212135 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0748 0.0642 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -210905 sc-eQTL 2.76e-01 0.134 0.122 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 470546 sc-eQTL 7.20e-01 0.0305 0.0851 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 89236 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0578 0.122 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 974192 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0333 0.127 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -161025 sc-eQTL 1.80e-02 0.29 0.122 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -212135 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0185 0.057 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -210905 sc-eQTL 1.48e-01 -0.166 0.114 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 89236 sc-eQTL 4.61e-01 0.0722 0.0977 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 974192 sc-eQTL 1.00e+00 3.36e-05 0.0835 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -161025 sc-eQTL 3.16e-01 0.091 0.0904 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -212135 sc-eQTL 3.24e-01 -0.058 0.0587 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -210905 sc-eQTL 1.56e-01 0.16 0.113 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 89236 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0468 0.109 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 974192 sc-eQTL 6.19e-01 0.0457 0.0917 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -161025 sc-eQTL 2.30e-01 0.129 0.107 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -212135 sc-eQTL 1.47e-01 -0.0807 0.0555 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -210905 sc-eQTL 1.85e-01 0.171 0.129 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 89236 sc-eQTL 9.30e-01 0.0109 0.125 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 974192 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0936 0.114 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -161025 sc-eQTL 2.63e-01 -0.134 0.119 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -212135 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0476 0.0489 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -210905 sc-eQTL 8.09e-01 0.0295 0.122 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 89236 sc-eQTL 7.32e-02 0.18 0.0997 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 974192 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0898 0.103 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -161025 sc-eQTL 7.30e-02 0.204 0.113 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -212135 sc-eQTL 1.38e-01 -0.0904 0.0608 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -210905 sc-eQTL 3.39e-01 0.113 0.118 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 89236 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0148 0.122 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 974192 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0883 0.0983 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -161025 sc-eQTL 3.66e-01 0.0956 0.105 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -212135 sc-eQTL 9.61e-02 -0.1 0.0601 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -210905 sc-eQTL 1.74e-01 0.165 0.121 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 89236 sc-eQTL 5.08e-01 0.0817 0.123 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 974192 sc-eQTL 1.55e-01 0.176 0.123 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -161025 sc-eQTL 7.74e-02 0.216 0.121 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -212135 sc-eQTL 8.88e-01 -0.00842 0.0597 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -210905 sc-eQTL 2.40e-02 0.294 0.129 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 89236 sc-eQTL 7.47e-01 0.0416 0.129 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 974192 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0226 0.124 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -161025 sc-eQTL 3.10e-01 0.13 0.128 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -212135 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00289 0.069 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -210905 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0739 0.13 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 89236 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0822 0.115 0.169 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 974192 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0298 0.121 0.169 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -161025 sc-eQTL 5.52e-01 0.0701 0.118 0.169 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -212135 sc-eQTL 3.70e-01 0.0519 0.0577 0.169 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -210905 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0981 0.121 0.169 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 89236 sc-eQTL 2.50e-01 -0.139 0.12 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 974192 sc-eQTL 9.81e-01 0.00297 0.128 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -161025 sc-eQTL 3.54e-01 0.114 0.122 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -212135 sc-eQTL 1.73e-01 -0.0929 0.068 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 89236 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0197 0.097 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 974192 sc-eQTL 8.10e-01 0.024 0.0997 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -161025 sc-eQTL 1.96e-02 0.282 0.12 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -212135 sc-eQTL 6.04e-01 -0.025 0.0481 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 89236 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00411 0.119 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 974192 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0495 0.12 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -161025 sc-eQTL 1.59e-01 0.169 0.12 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -212135 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0365 0.0559 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 89236 sc-eQTL 1.19e-01 -0.165 0.105 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 974192 sc-eQTL 8.69e-01 0.0181 0.11 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -161025 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0128 0.119 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -212135 sc-eQTL 8.39e-01 0.0131 0.0647 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 200959 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0367 0.125 0.159 PB L2
ENSG00000079950 STX7 89236 sc-eQTL 9.05e-01 0.0125 0.104 0.159 PB L2
ENSG00000112282 MED23 974192 sc-eQTL 3.33e-02 0.3 0.139 0.159 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -161025 sc-eQTL 2.87e-01 -0.136 0.127 0.159 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -212135 sc-eQTL 7.27e-02 0.129 0.0713 0.159 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -210905 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0298 0.136 0.159 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 470546 sc-eQTL 1.21e-01 -0.138 0.0882 0.159 PB L2
ENSG00000079950 STX7 89236 sc-eQTL 3.88e-02 0.224 0.108 0.172 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 974192 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0154 0.122 0.172 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -161025 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0795 0.117 0.172 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -212135 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0138 0.0442 0.172 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -210905 sc-eQTL 9.16e-01 0.0121 0.114 0.172 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 89236 sc-eQTL 1.64e-01 0.165 0.118 0.171 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 974192 sc-eQTL 7.00e-01 0.0471 0.122 0.171 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -161025 sc-eQTL 3.37e-01 -0.096 0.0999 0.171 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -212135 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0456 0.0442 0.171 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -210905 sc-eQTL 7.78e-02 0.22 0.124 0.171 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 89236 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0264 0.103 0.176 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -132331 sc-eQTL 3.71e-01 0.0914 0.102 0.176 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 974192 sc-eQTL 3.18e-01 0.133 0.133 0.176 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -111621 sc-eQTL 1.97e-01 -0.155 0.12 0.176 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -161025 sc-eQTL 4.27e-01 0.0931 0.117 0.176 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -212135 sc-eQTL 2.37e-01 0.0683 0.0576 0.176 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -210905 sc-eQTL 5.25e-01 0.0728 0.114 0.176 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -500694 sc-eQTL 2.25e-01 0.111 0.0912 0.176 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 89236 sc-eQTL 4.83e-01 0.0545 0.0777 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -132331 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0561 0.11 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 974192 sc-eQTL 9.70e-01 -0.0041 0.109 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -111621 sc-eQTL 3.01e-01 -0.115 0.111 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -161025 sc-eQTL 4.97e-01 0.0603 0.0886 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -212135 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0587 0.0491 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -210905 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0539 0.0949 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 89236 sc-eQTL 1.32e-01 0.126 0.0832 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -132331 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0874 0.104 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 974192 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0866 0.113 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -111621 sc-eQTL 3.34e-01 -0.11 0.113 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -161025 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0159 0.0743 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -212135 sc-eQTL 5.96e-01 0.0284 0.0535 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -210905 sc-eQTL 1.48e-01 0.143 0.0986 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 89236 sc-eQTL 2.90e-01 0.152 0.143 0.167 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 974192 sc-eQTL 2.14e-01 -0.191 0.153 0.167 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -161025 sc-eQTL 8.10e-01 0.0381 0.159 0.167 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -212135 sc-eQTL 1.88e-01 0.0794 0.06 0.167 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -210905 sc-eQTL 3.06e-01 0.16 0.156 0.167 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 89236 sc-eQTL 6.05e-01 -0.058 0.112 0.171 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -132331 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0951 0.113 0.171 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 974192 sc-eQTL 7.02e-01 0.0476 0.124 0.171 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -111621 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0554 0.112 0.171 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -161025 sc-eQTL 5.19e-01 0.0734 0.113 0.171 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -212135 sc-eQTL 7.30e-01 0.017 0.0494 0.171 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -210905 sc-eQTL 2.15e-01 0.149 0.12 0.171 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 89236 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0109 0.0826 0.172 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -132331 sc-eQTL 3.72e-01 0.104 0.116 0.172 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 974192 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0985 0.118 0.172 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -111621 sc-eQTL 1.62e-02 -0.277 0.114 0.172 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -161025 sc-eQTL 8.53e-01 0.0206 0.111 0.172 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -212135 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0143 0.0558 0.172 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -210905 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0147 0.0986 0.172 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 89236 sc-eQTL 6.98e-01 0.0375 0.0963 0.178 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -132331 sc-eQTL 3.40e-01 0.0926 0.0967 0.178 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 974192 sc-eQTL 2.27e-01 -0.163 0.135 0.178 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -111621 sc-eQTL 4.62e-01 0.0727 0.0985 0.178 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -161025 sc-eQTL 6.74e-01 0.0495 0.117 0.178 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -212135 sc-eQTL 5.37e-01 -0.05 0.0808 0.178 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -210905 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0465 0.12 0.178 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -500694 sc-eQTL 4.01e-02 0.234 0.113 0.178 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 200959 sc-eQTL 2.06e-01 -0.152 0.12 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 89236 sc-eQTL 9.92e-01 0.00071 0.0681 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 974192 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0893 0.104 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -161025 sc-eQTL 5.66e-01 0.0618 0.108 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -212135 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00461 0.0614 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -210905 sc-eQTL 4.76e-01 0.0804 0.113 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 470546 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0421 0.109 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 200959 sc-eQTL 9.55e-02 -0.213 0.127 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 89236 sc-eQTL 2.33e-01 0.0625 0.0523 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 974192 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0114 0.0985 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -161025 sc-eQTL 1.62e-01 0.142 0.101 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -212135 sc-eQTL 2.22e-01 -0.0753 0.0614 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -210905 sc-eQTL 1.21e-01 0.18 0.116 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 470546 sc-eQTL 1.57e-01 0.104 0.0735 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 89236 sc-eQTL 1.29e-01 0.0984 0.0647 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -132331 sc-eQTL 3.91e-01 -0.091 0.106 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 974192 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0223 0.102 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -111621 sc-eQTL 3.58e-01 -0.102 0.11 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -161025 sc-eQTL 8.20e-01 0.0167 0.073 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -212135 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0404 0.05 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -210905 sc-eQTL 7.63e-01 0.027 0.0891 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 89236 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0618 0.0784 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -132331 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0365 0.115 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 974192 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0491 0.112 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -111621 sc-eQTL 3.74e-02 -0.237 0.113 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -161025 sc-eQTL 6.22e-01 0.0533 0.108 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -212135 sc-eQTL 6.70e-01 0.0195 0.0458 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -210905 sc-eQTL 6.42e-01 0.0518 0.111 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 89236 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0361 0.0914 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 974192 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0177 0.0888 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -161025 sc-eQTL 4.69e-02 0.229 0.115 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -212135 sc-eQTL 4.22e-01 -0.038 0.0472 0.17 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 -111621 pQTL 0.00149 -0.147 0.0463 0.0 0.0 0.168
ENSG00000112299 VNN1 -111621 eQTL 0.0495 -0.0562 0.0286 0.0 0.0 0.164
ENSG00000234484 AL032821.1 -150241 eQTL 0.0158 -0.0989 0.0409 0.0 0.0 0.164


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina