logo

Genes within 1Mb (chr6:132597375:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 195900 sc-eQTL 9.55e-01 0.00733 0.13 0.122 B L1
ENSG00000079950 STX7 84177 sc-eQTL 5.25e-02 0.0946 0.0485 0.122 B L1
ENSG00000112282 MED23 969133 sc-eQTL 7.51e-01 -0.031 0.0975 0.122 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -166084 sc-eQTL 8.98e-02 -0.156 0.0914 0.122 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -217194 sc-eQTL 4.22e-02 -0.113 0.0551 0.122 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -215964 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0494 0.117 0.122 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 465487 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0764 0.0766 0.122 B L1
ENSG00000079950 STX7 84177 sc-eQTL 2.98e-01 0.0996 0.0955 0.122 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 969133 sc-eQTL 9.86e-01 0.00138 0.076 0.122 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -166084 sc-eQTL 3.15e-01 0.0834 0.0827 0.122 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -217194 sc-eQTL 9.90e-01 -0.000705 0.0564 0.122 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -215964 sc-eQTL 4.72e-01 0.0821 0.114 0.122 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 84177 sc-eQTL 5.16e-01 0.0619 0.0951 0.122 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 969133 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0694 0.0937 0.122 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -166084 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0122 0.111 0.122 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -217194 sc-eQTL 9.35e-01 0.0031 0.038 0.122 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -215964 sc-eQTL 8.69e-01 0.0189 0.115 0.122 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 84177 sc-eQTL 2.47e-01 0.0974 0.0839 0.128 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -137390 sc-eQTL 5.98e-02 -0.196 0.103 0.128 DC L1
ENSG00000112282 MED23 969133 sc-eQTL 2.26e-01 -0.148 0.122 0.128 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -116680 sc-eQTL 2.19e-01 0.138 0.112 0.128 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -166084 sc-eQTL 3.11e-01 -0.122 0.12 0.128 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -217194 sc-eQTL 5.74e-01 0.0381 0.0676 0.128 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -215964 sc-eQTL 2.72e-01 -0.117 0.107 0.128 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -505753 sc-eQTL 2.84e-01 0.104 0.0971 0.128 DC L1
ENSG00000079950 STX7 84177 sc-eQTL 7.93e-03 0.169 0.0631 0.122 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -137390 sc-eQTL 2.82e-01 0.118 0.11 0.122 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 969133 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0304 0.105 0.122 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -116680 sc-eQTL 1.72e-02 0.281 0.117 0.122 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -166084 sc-eQTL 2.27e-01 -0.101 0.0833 0.122 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -217194 sc-eQTL 7.20e-01 -0.018 0.0501 0.122 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -215964 sc-eQTL 3.67e-01 0.0895 0.0989 0.122 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 84177 sc-eQTL 1.99e-01 0.125 0.0971 0.122 NK L1
ENSG00000112282 MED23 969133 sc-eQTL 4.51e-01 0.0672 0.089 0.122 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -166084 sc-eQTL 7.72e-01 0.0351 0.121 0.122 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -217194 sc-eQTL 4.26e-01 -0.04 0.0501 0.122 NK L1
ENSG00000079950 STX7 84177 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00319 0.0972 0.122 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 969133 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0685 0.121 0.122 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -166084 sc-eQTL 8.32e-01 0.025 0.118 0.122 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -217194 sc-eQTL 4.03e-01 0.039 0.0465 0.122 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -215964 sc-eQTL 3.94e-01 0.109 0.127 0.122 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 195900 sc-eQTL 2.13e-01 0.176 0.141 0.107 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 84177 sc-eQTL 1.65e-02 0.316 0.13 0.107 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 969133 sc-eQTL 9.10e-01 0.0166 0.147 0.107 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -166084 sc-eQTL 2.81e-01 -0.152 0.141 0.107 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -217194 sc-eQTL 2.30e-01 -0.0907 0.0753 0.107 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -215964 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0799 0.132 0.107 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 465487 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00249 0.126 0.107 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 195900 sc-eQTL 3.29e-01 0.116 0.118 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 84177 sc-eQTL 1.48e-01 0.112 0.0772 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 969133 sc-eQTL 6.69e-01 0.0505 0.118 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -166084 sc-eQTL 1.43e-01 -0.171 0.116 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -217194 sc-eQTL 1.48e-01 -0.103 0.0712 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -215964 sc-eQTL 2.30e-01 -0.155 0.128 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 465487 sc-eQTL 3.31e-01 0.106 0.109 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 195900 sc-eQTL 1.18e-01 0.186 0.119 0.123 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 84177 sc-eQTL 1.08e-01 0.15 0.093 0.123 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 969133 sc-eQTL 2.22e-01 0.147 0.12 0.123 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -166084 sc-eQTL 9.80e-01 -0.0031 0.122 0.123 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -217194 sc-eQTL 1.93e-01 -0.0767 0.0587 0.123 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -215964 sc-eQTL 3.54e-01 0.114 0.123 0.123 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 465487 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0641 0.115 0.123 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 195900 sc-eQTL 2.74e-01 0.151 0.138 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 84177 sc-eQTL 1.06e-02 0.153 0.0595 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 969133 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0807 0.108 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -166084 sc-eQTL 9.57e-01 0.00641 0.117 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -217194 sc-eQTL 1.51e-02 -0.162 0.0659 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -215964 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0666 0.129 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 465487 sc-eQTL 1.80e-01 -0.114 0.0851 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 195900 sc-eQTL 4.00e-01 -0.106 0.126 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 84177 sc-eQTL 1.33e-02 0.17 0.0679 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 969133 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0293 0.127 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -166084 sc-eQTL 5.47e-02 -0.242 0.125 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -217194 sc-eQTL 6.16e-03 -0.182 0.0658 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -215964 sc-eQTL 5.60e-01 0.0745 0.128 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 465487 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0564 0.0885 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 84177 sc-eQTL 3.54e-01 0.117 0.126 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 969133 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0726 0.132 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -166084 sc-eQTL 9.81e-01 0.00306 0.128 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -217194 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0616 0.0588 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -215964 sc-eQTL 3.52e-01 0.111 0.119 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 84177 sc-eQTL 5.75e-01 0.0583 0.104 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 969133 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0188 0.0886 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -166084 sc-eQTL 7.75e-01 0.0275 0.0962 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -217194 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0319 0.0624 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -215964 sc-eQTL 7.08e-01 0.045 0.12 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 84177 sc-eQTL 3.07e-01 0.118 0.115 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 969133 sc-eQTL 5.43e-01 0.059 0.0969 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -166084 sc-eQTL 3.49e-01 0.106 0.113 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -217194 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0155 0.0589 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -215964 sc-eQTL 9.49e-01 0.00877 0.137 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 84177 sc-eQTL 1.00e+00 8.08e-05 0.129 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 969133 sc-eQTL 3.57e-01 -0.11 0.119 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -166084 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00428 0.124 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -217194 sc-eQTL 4.24e-01 0.0407 0.0508 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -215964 sc-eQTL 4.71e-01 0.0913 0.126 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 84177 sc-eQTL 8.01e-01 0.0269 0.106 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 969133 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0714 0.109 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -166084 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0402 0.121 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -217194 sc-eQTL 7.46e-01 -0.021 0.0646 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -215964 sc-eQTL 1.39e-01 0.185 0.124 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 84177 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0436 0.13 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 969133 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0812 0.104 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -166084 sc-eQTL 5.73e-01 0.0632 0.112 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -217194 sc-eQTL 4.73e-01 0.046 0.064 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -215964 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0703 0.128 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 84177 sc-eQTL 5.25e-01 0.0801 0.126 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 969133 sc-eQTL 8.97e-01 0.0164 0.126 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -166084 sc-eQTL 1.51e-01 0.18 0.124 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -217194 sc-eQTL 4.72e-01 0.0439 0.0609 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -215964 sc-eQTL 2.51e-01 -0.153 0.133 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 84177 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0847 0.135 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 969133 sc-eQTL 5.90e-01 0.07 0.13 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -166084 sc-eQTL 1.80e-01 -0.18 0.134 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -217194 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00626 0.0723 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -215964 sc-eQTL 7.83e-01 0.0376 0.137 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 84177 sc-eQTL 3.32e-01 0.119 0.123 0.123 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 969133 sc-eQTL 1.66e-01 -0.178 0.128 0.123 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -166084 sc-eQTL 3.29e-01 0.122 0.125 0.123 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -217194 sc-eQTL 8.88e-01 0.0087 0.0615 0.123 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -215964 sc-eQTL 7.24e-01 0.0455 0.129 0.123 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 84177 sc-eQTL 3.16e-01 -0.127 0.126 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 969133 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00149 0.134 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -166084 sc-eQTL 4.32e-01 0.101 0.128 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -217194 sc-eQTL 9.09e-01 0.00822 0.0717 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 84177 sc-eQTL 1.08e-01 0.165 0.102 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 969133 sc-eQTL 8.13e-01 0.025 0.105 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -166084 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0145 0.128 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -217194 sc-eQTL 1.44e-01 -0.0742 0.0506 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 84177 sc-eQTL 3.64e-01 -0.118 0.13 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 969133 sc-eQTL 3.00e-01 0.136 0.131 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -166084 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0785 0.132 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -217194 sc-eQTL 1.00e-01 -0.1 0.0609 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 84177 sc-eQTL 1.37e-01 0.166 0.111 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 969133 sc-eQTL 3.80e-01 0.102 0.116 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -166084 sc-eQTL 3.29e-01 0.123 0.126 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -217194 sc-eQTL 1.56e-01 -0.0969 0.068 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 195900 sc-eQTL 4.43e-01 -0.105 0.136 0.122 PB L2
ENSG00000079950 STX7 84177 sc-eQTL 8.93e-01 0.0153 0.114 0.122 PB L2
ENSG00000112282 MED23 969133 sc-eQTL 6.61e-01 -0.068 0.155 0.122 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -166084 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0376 0.139 0.122 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -217194 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0928 0.0785 0.122 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -215964 sc-eQTL 4.60e-01 0.109 0.148 0.122 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 465487 sc-eQTL 4.34e-01 0.0762 0.0971 0.122 PB L2
ENSG00000079950 STX7 84177 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0338 0.119 0.122 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 969133 sc-eQTL 5.53e-01 0.0796 0.134 0.122 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -166084 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00399 0.128 0.122 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -217194 sc-eQTL 8.40e-01 -0.00979 0.0483 0.122 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -215964 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0743 0.125 0.122 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 84177 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0445 0.124 0.122 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 969133 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0322 0.128 0.122 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -166084 sc-eQTL 1.46e-01 0.152 0.104 0.122 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -217194 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0179 0.0463 0.122 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -215964 sc-eQTL 8.71e-01 0.0213 0.131 0.122 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 84177 sc-eQTL 2.11e-02 0.248 0.107 0.127 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -137390 sc-eQTL 3.17e-01 -0.108 0.107 0.127 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 969133 sc-eQTL 1.49e-01 -0.201 0.139 0.127 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -116680 sc-eQTL 7.17e-02 0.227 0.125 0.127 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -166084 sc-eQTL 8.26e-02 -0.213 0.122 0.127 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -217194 sc-eQTL 7.45e-01 0.0198 0.0607 0.127 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -215964 sc-eQTL 3.88e-01 -0.104 0.12 0.127 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -505753 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00397 0.0962 0.127 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 84177 sc-eQTL 6.99e-02 0.149 0.0819 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -137390 sc-eQTL 3.34e-01 0.113 0.116 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 969133 sc-eQTL 2.72e-01 0.127 0.115 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -116680 sc-eQTL 1.36e-02 0.289 0.116 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -166084 sc-eQTL 8.72e-02 -0.161 0.0935 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -217194 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00504 0.0523 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -215964 sc-eQTL 9.79e-01 0.00266 0.101 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 84177 sc-eQTL 2.26e-01 0.109 0.0896 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -137390 sc-eQTL 3.64e-01 0.102 0.112 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 969133 sc-eQTL 9.36e-02 -0.204 0.121 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -116680 sc-eQTL 6.48e-02 0.224 0.121 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -166084 sc-eQTL 7.93e-01 -0.021 0.0799 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -217194 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0272 0.0575 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -215964 sc-eQTL 1.59e-01 0.15 0.106 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 84177 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0662 0.137 0.145 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 969133 sc-eQTL 2.45e-01 0.171 0.147 0.145 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -166084 sc-eQTL 8.27e-01 0.0333 0.152 0.145 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -217194 sc-eQTL 2.96e-01 0.0606 0.0577 0.145 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -215964 sc-eQTL 9.97e-01 0.000566 0.15 0.145 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 84177 sc-eQTL 9.86e-01 0.00215 0.123 0.124 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -137390 sc-eQTL 1.52e-01 0.177 0.123 0.124 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 969133 sc-eQTL 1.01e-01 -0.222 0.135 0.124 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -116680 sc-eQTL 6.23e-01 0.0601 0.122 0.124 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -166084 sc-eQTL 1.97e-01 -0.16 0.124 0.124 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -217194 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0076 0.0541 0.124 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -215964 sc-eQTL 6.64e-01 0.0573 0.132 0.124 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 84177 sc-eQTL 2.21e-02 0.201 0.0873 0.124 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -137390 sc-eQTL 8.29e-01 -0.027 0.125 0.124 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 969133 sc-eQTL 6.84e-01 0.0516 0.126 0.124 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -116680 sc-eQTL 4.01e-01 0.104 0.124 0.124 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -166084 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0576 0.119 0.124 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -217194 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0501 0.0597 0.124 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -215964 sc-eQTL 3.89e-01 -0.091 0.105 0.124 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 84177 sc-eQTL 6.47e-01 0.0459 0.0999 0.13 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -137390 sc-eQTL 1.35e-01 -0.15 0.1 0.13 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 969133 sc-eQTL 9.20e-01 0.0141 0.14 0.13 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -116680 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0701 0.102 0.13 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -166084 sc-eQTL 4.64e-01 0.0894 0.122 0.13 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -217194 sc-eQTL 9.36e-01 0.00679 0.084 0.13 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -215964 sc-eQTL 7.99e-01 0.0316 0.124 0.13 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -505753 sc-eQTL 5.89e-01 0.0643 0.119 0.13 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 195900 sc-eQTL 8.68e-02 0.219 0.127 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 84177 sc-eQTL 8.08e-02 0.127 0.0721 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 969133 sc-eQTL 2.79e-01 0.12 0.111 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -166084 sc-eQTL 2.40e-01 -0.135 0.115 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -217194 sc-eQTL 1.65e-01 -0.0909 0.0652 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -215964 sc-eQTL 1.88e-01 -0.158 0.12 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 465487 sc-eQTL 2.78e-01 0.126 0.116 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 195900 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0402 0.135 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 84177 sc-eQTL 7.02e-03 0.148 0.0544 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 969133 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0987 0.104 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -166084 sc-eQTL 2.49e-01 -0.124 0.107 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -217194 sc-eQTL 2.10e-03 -0.198 0.0636 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -215964 sc-eQTL 9.35e-01 0.00995 0.123 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 465487 sc-eQTL 8.32e-02 -0.135 0.0774 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 84177 sc-eQTL 5.40e-02 0.134 0.0689 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -137390 sc-eQTL 2.71e-01 0.125 0.113 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 969133 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0194 0.109 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -116680 sc-eQTL 1.05e-02 0.301 0.116 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -166084 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0735 0.078 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -217194 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0145 0.0536 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -215964 sc-eQTL 3.33e-01 0.0924 0.0951 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 84177 sc-eQTL 1.74e-01 0.115 0.0841 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -137390 sc-eQTL 2.14e-01 0.154 0.124 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 969133 sc-eQTL 3.27e-01 -0.119 0.121 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -116680 sc-eQTL 3.18e-01 0.123 0.123 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -166084 sc-eQTL 2.81e-01 -0.125 0.116 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -217194 sc-eQTL 7.46e-01 -0.016 0.0492 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -215964 sc-eQTL 2.61e-01 -0.134 0.119 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 84177 sc-eQTL 9.34e-02 0.163 0.097 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 969133 sc-eQTL 4.89e-01 0.0656 0.0947 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -166084 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0103 0.124 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -217194 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0513 0.0503 0.121 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 84177 eQTL 5.25e-15 0.195 0.0246 0.0 0.0 0.11
ENSG00000112299 VNN1 -116680 pQTL 0.000355 0.205 0.0572 0.0 0.0 0.109
ENSG00000112299 VNN1 -116680 eQTL 0.0103 0.0889 0.0346 0.0 0.0 0.11
ENSG00000118523 CCN2 646003 pQTL 0.0198 -0.0802 0.0344 0.0 0.0 0.109

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079950 STX7 84177 7.7e-06 9.5e-06 1.29e-06 5.59e-06 2.25e-06 4.2e-06 1.14e-05 1.49e-06 8.38e-06 4.75e-06 1.08e-05 5.23e-06 1.44e-05 3.56e-06 2.49e-06 6.36e-06 4.04e-06 6.85e-06 2.58e-06 2.62e-06 4.61e-06 8.03e-06 7.56e-06 3.36e-06 1.49e-05 2.97e-06 4.69e-06 3.98e-06 1.1e-05 9.09e-06 4.6e-06 1.07e-06 1.17e-06 2.99e-06 4.23e-06 2.77e-06 1.87e-06 1.9e-06 1.72e-06 1e-06 8.74e-07 1.19e-05 1.23e-06 2.5e-07 7.05e-07 1.62e-06 1.32e-06 7.13e-07 4.66e-07