logo

Genes within 1Mb (chr6:132590096:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 188621 sc-eQTL 3.32e-02 -0.423 0.197 0.058 B L1
ENSG00000079950 STX7 76898 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0107 0.0752 0.058 B L1
ENSG00000112282 MED23 961854 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00958 0.15 0.058 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -173363 sc-eQTL 4.45e-01 0.108 0.141 0.058 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -224473 sc-eQTL 2.26e-01 -0.103 0.0851 0.058 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -223243 sc-eQTL 9.49e-01 -0.0115 0.18 0.058 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 458208 sc-eQTL 7.56e-01 0.0367 0.118 0.058 B L1
ENSG00000079950 STX7 76898 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0641 0.147 0.058 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 961854 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0384 0.117 0.058 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -173363 sc-eQTL 6.53e-01 0.0575 0.128 0.058 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -224473 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00499 0.0867 0.058 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -223243 sc-eQTL 3.76e-01 0.155 0.175 0.058 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 76898 sc-eQTL 5.71e-01 0.082 0.144 0.058 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 961854 sc-eQTL 2.81e-01 0.153 0.142 0.058 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -173363 sc-eQTL 6.37e-02 0.312 0.167 0.058 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -224473 sc-eQTL 7.00e-01 0.0223 0.0577 0.058 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -223243 sc-eQTL 2.46e-01 0.202 0.174 0.058 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 76898 sc-eQTL 4.72e-03 0.383 0.134 0.054 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -144669 sc-eQTL 6.67e-01 -0.073 0.169 0.054 DC L1
ENSG00000112282 MED23 961854 sc-eQTL 7.80e-01 0.0556 0.199 0.054 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -123959 sc-eQTL 3.92e-01 -0.157 0.183 0.054 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -173363 sc-eQTL 8.94e-01 0.0262 0.196 0.054 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -224473 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0626 0.11 0.054 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -223243 sc-eQTL 5.44e-01 -0.105 0.174 0.054 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -513032 sc-eQTL 6.84e-01 0.0644 0.158 0.054 DC L1
ENSG00000079950 STX7 76898 sc-eQTL 2.37e-01 0.114 0.0959 0.058 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -144669 sc-eQTL 2.11e-01 -0.207 0.165 0.058 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 961854 sc-eQTL 4.06e-01 0.131 0.157 0.058 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -123959 sc-eQTL 9.94e-02 -0.292 0.177 0.058 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -173363 sc-eQTL 5.03e-01 0.0841 0.125 0.058 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -224473 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0504 0.0751 0.058 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -223243 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0295 0.149 0.058 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 76898 sc-eQTL 4.39e-01 -0.114 0.147 0.058 NK L1
ENSG00000112282 MED23 961854 sc-eQTL 3.18e-01 0.134 0.134 0.058 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -173363 sc-eQTL 1.48e-01 0.264 0.182 0.058 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -224473 sc-eQTL 6.15e-01 0.0381 0.0757 0.058 NK L1
ENSG00000079950 STX7 76898 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0875 0.149 0.058 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 961854 sc-eQTL 4.12e-01 0.152 0.185 0.058 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -173363 sc-eQTL 5.50e-01 -0.108 0.18 0.058 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -224473 sc-eQTL 3.98e-01 0.0603 0.0712 0.058 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -223243 sc-eQTL 9.93e-01 0.00183 0.195 0.058 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 188621 sc-eQTL 6.22e-01 0.101 0.204 0.064 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 76898 sc-eQTL 3.91e-01 -0.164 0.191 0.064 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 961854 sc-eQTL 6.22e-01 -0.105 0.212 0.064 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -173363 sc-eQTL 4.19e-01 0.164 0.203 0.064 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -224473 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0608 0.109 0.064 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -223243 sc-eQTL 5.35e-01 0.119 0.191 0.064 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 458208 sc-eQTL 2.49e-01 -0.21 0.181 0.064 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 188621 sc-eQTL 9.04e-01 0.0225 0.186 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 76898 sc-eQTL 3.30e-01 -0.119 0.121 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 961854 sc-eQTL 7.77e-01 0.0524 0.185 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -173363 sc-eQTL 4.47e-01 -0.139 0.183 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -224473 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0883 0.112 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -223243 sc-eQTL 3.75e-01 -0.179 0.202 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 458208 sc-eQTL 6.80e-01 0.071 0.172 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 188621 sc-eQTL 1.92e-01 -0.24 0.183 0.056 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 76898 sc-eQTL 3.50e-01 -0.135 0.144 0.056 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 961854 sc-eQTL 5.16e-01 -0.121 0.186 0.056 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -173363 sc-eQTL 8.67e-01 0.0316 0.189 0.056 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -224473 sc-eQTL 6.03e-01 0.0474 0.091 0.056 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -223243 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0811 0.19 0.056 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 458208 sc-eQTL 8.99e-01 0.0225 0.177 0.056 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 188621 sc-eQTL 1.51e-01 -0.3 0.208 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 76898 sc-eQTL 6.79e-01 0.0378 0.0913 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 961854 sc-eQTL 6.52e-01 0.0739 0.164 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -173363 sc-eQTL 7.10e-01 -0.066 0.177 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -224473 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0769 0.101 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -223243 sc-eQTL 2.77e-01 0.212 0.194 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 458208 sc-eQTL 4.28e-02 0.26 0.128 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 188621 sc-eQTL 9.01e-02 -0.328 0.193 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 76898 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0805 0.106 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 961854 sc-eQTL 3.19e-01 0.195 0.195 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -173363 sc-eQTL 1.36e-01 0.289 0.193 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -224473 sc-eQTL 4.78e-01 -0.073 0.103 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -223243 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0609 0.196 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 458208 sc-eQTL 4.59e-01 0.101 0.136 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 76898 sc-eQTL 6.81e-01 0.0875 0.212 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 961854 sc-eQTL 5.19e-01 -0.143 0.221 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -173363 sc-eQTL 9.99e-01 0.000326 0.214 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -224473 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0686 0.099 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -223243 sc-eQTL 2.66e-01 -0.222 0.199 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 76898 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0457 0.159 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 961854 sc-eQTL 2.36e-01 -0.16 0.135 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -173363 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0402 0.147 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -224473 sc-eQTL 9.78e-01 0.00259 0.0953 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -223243 sc-eQTL 4.38e-01 0.142 0.183 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 76898 sc-eQTL 1.58e-01 -0.247 0.174 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 961854 sc-eQTL 6.12e-01 0.0747 0.147 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -173363 sc-eQTL 3.79e-01 0.152 0.172 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -224473 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0222 0.0894 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -223243 sc-eQTL 2.16e-01 0.256 0.206 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 76898 sc-eQTL 3.83e-01 0.176 0.201 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 961854 sc-eQTL 9.55e-01 -0.0104 0.186 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -173363 sc-eQTL 7.48e-01 0.0621 0.193 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -224473 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0217 0.0793 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -223243 sc-eQTL 4.58e-01 -0.146 0.197 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 76898 sc-eQTL 1.94e-01 0.213 0.164 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 961854 sc-eQTL 1.47e-01 0.244 0.168 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -173363 sc-eQTL 9.93e-02 0.307 0.186 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -224473 sc-eQTL 6.80e-01 0.0412 0.0999 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -223243 sc-eQTL 5.92e-01 0.104 0.194 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 76898 sc-eQTL 2.94e-01 -0.217 0.206 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 961854 sc-eQTL 4.05e-01 0.138 0.166 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -173363 sc-eQTL 2.06e-01 0.225 0.178 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -224473 sc-eQTL 9.80e-01 0.0025 0.102 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -223243 sc-eQTL 3.12e-01 0.207 0.204 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 76898 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0578 0.204 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 961854 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00332 0.205 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -173363 sc-eQTL 1.61e-01 -0.283 0.202 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -224473 sc-eQTL 4.42e-01 0.076 0.0986 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -223243 sc-eQTL 9.95e-01 0.00146 0.216 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 76898 sc-eQTL 9.55e-01 -0.0123 0.219 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 961854 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00404 0.211 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -173363 sc-eQTL 1.10e-01 0.347 0.217 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -224473 sc-eQTL 6.67e-01 0.0505 0.117 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -223243 sc-eQTL 6.26e-01 0.108 0.222 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 76898 sc-eQTL 3.13e-01 -0.195 0.193 0.056 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 961854 sc-eQTL 6.03e-01 0.105 0.202 0.056 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -173363 sc-eQTL 4.90e-01 -0.136 0.197 0.056 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -224473 sc-eQTL 3.86e-02 0.199 0.0958 0.056 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -223243 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0754 0.203 0.056 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 76898 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0597 0.199 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 961854 sc-eQTL 6.30e-01 0.101 0.21 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -173363 sc-eQTL 1.74e-01 0.275 0.201 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -224473 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0536 0.113 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 76898 sc-eQTL 3.26e-01 0.153 0.156 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 961854 sc-eQTL 9.93e-02 0.264 0.159 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -173363 sc-eQTL 2.70e-02 0.429 0.193 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -224473 sc-eQTL 2.82e-01 0.0832 0.0771 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 76898 sc-eQTL 6.05e-01 0.0976 0.188 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 961854 sc-eQTL 2.97e-01 0.199 0.19 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -173363 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0184 0.191 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -224473 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0358 0.0888 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 76898 sc-eQTL 2.25e-03 -0.516 0.167 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 961854 sc-eQTL 5.21e-01 0.114 0.176 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -173363 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0949 0.192 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -224473 sc-eQTL 3.70e-01 0.0933 0.104 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 188621 sc-eQTL 1.16e-01 -0.317 0.2 0.067 PB L2
ENSG00000079950 STX7 76898 sc-eQTL 5.45e-01 0.103 0.169 0.067 PB L2
ENSG00000112282 MED23 961854 sc-eQTL 9.88e-01 0.00338 0.23 0.067 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -173363 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0526 0.207 0.067 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -224473 sc-eQTL 3.63e-01 0.107 0.117 0.067 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -223243 sc-eQTL 1.69e-01 -0.302 0.218 0.067 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 458208 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0491 0.145 0.067 PB L2
ENSG00000079950 STX7 76898 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0146 0.175 0.059 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 961854 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0457 0.197 0.059 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -173363 sc-eQTL 2.82e-01 -0.202 0.187 0.059 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -224473 sc-eQTL 2.82e-01 0.0764 0.0708 0.059 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -223243 sc-eQTL 1.41e-01 -0.27 0.183 0.059 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 76898 sc-eQTL 5.62e-01 0.113 0.195 0.058 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 961854 sc-eQTL 2.90e-01 -0.212 0.2 0.058 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -173363 sc-eQTL 3.43e-01 -0.156 0.164 0.058 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -224473 sc-eQTL 8.09e-01 0.0176 0.0726 0.058 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -223243 sc-eQTL 9.50e-01 0.0128 0.205 0.058 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 76898 sc-eQTL 1.18e-01 0.276 0.176 0.056 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -144669 sc-eQTL 5.39e-01 -0.108 0.175 0.056 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 961854 sc-eQTL 9.66e-01 0.00976 0.228 0.056 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -123959 sc-eQTL 2.63e-01 -0.231 0.206 0.056 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -173363 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0588 0.201 0.056 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -224473 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0107 0.0993 0.056 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -223243 sc-eQTL 4.61e-01 -0.145 0.196 0.056 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -513032 sc-eQTL 5.48e-01 0.0946 0.157 0.056 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 76898 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0294 0.123 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -144669 sc-eQTL 1.28e-01 -0.265 0.173 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 961854 sc-eQTL 9.10e-02 0.29 0.171 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -123959 sc-eQTL 1.49e-01 -0.254 0.175 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -173363 sc-eQTL 5.23e-01 0.0899 0.14 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -224473 sc-eQTL 1.32e-01 -0.117 0.0776 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -223243 sc-eQTL 1.67e-01 -0.208 0.15 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 76898 sc-eQTL 7.90e-03 0.35 0.131 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -144669 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0692 0.166 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 961854 sc-eQTL 3.23e-01 -0.178 0.18 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -123959 sc-eQTL 1.60e-01 -0.252 0.179 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -173363 sc-eQTL 3.21e-01 0.117 0.118 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -224473 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0437 0.0848 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -223243 sc-eQTL 4.87e-01 0.109 0.157 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 76898 sc-eQTL 9.59e-01 0.0093 0.182 0.056 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -144669 sc-eQTL 2.88e-01 -0.196 0.184 0.056 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 961854 sc-eQTL 7.76e-01 0.0576 0.202 0.056 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -123959 sc-eQTL 4.30e-01 -0.144 0.182 0.056 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -173363 sc-eQTL 3.21e-01 0.184 0.184 0.056 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -224473 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0499 0.0804 0.056 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -223243 sc-eQTL 4.15e-01 -0.16 0.196 0.056 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 76898 sc-eQTL 8.19e-01 0.0314 0.137 0.057 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -144669 sc-eQTL 3.38e-01 0.185 0.193 0.057 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 961854 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0595 0.196 0.057 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -123959 sc-eQTL 2.11e-02 -0.44 0.189 0.057 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -173363 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0306 0.184 0.057 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -224473 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0467 0.0924 0.057 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -223243 sc-eQTL 8.86e-01 0.0233 0.163 0.057 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 76898 sc-eQTL 4.44e-02 0.312 0.154 0.056 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -144669 sc-eQTL 5.15e-01 0.102 0.157 0.056 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 961854 sc-eQTL 9.63e-01 -0.0102 0.219 0.056 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -123959 sc-eQTL 8.77e-01 0.0248 0.16 0.056 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -173363 sc-eQTL 3.35e-01 -0.184 0.19 0.056 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -224473 sc-eQTL 3.49e-01 -0.123 0.131 0.056 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -223243 sc-eQTL 4.77e-01 0.138 0.194 0.056 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -513032 sc-eQTL 2.42e-01 0.217 0.185 0.056 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 188621 sc-eQTL 2.75e-01 -0.21 0.192 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 76898 sc-eQTL 3.15e-01 -0.11 0.109 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 961854 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0289 0.167 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -173363 sc-eQTL 9.50e-01 0.0108 0.173 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -224473 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0453 0.0983 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -223243 sc-eQTL 5.41e-01 -0.11 0.18 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 458208 sc-eQTL 9.13e-01 0.0191 0.174 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 188621 sc-eQTL 5.84e-02 -0.39 0.205 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 76898 sc-eQTL 8.85e-01 0.0123 0.0849 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 961854 sc-eQTL 3.68e-01 0.143 0.159 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -173363 sc-eQTL 4.83e-01 0.116 0.165 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -224473 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0644 0.0996 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -223243 sc-eQTL 9.57e-01 0.0102 0.188 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 458208 sc-eQTL 1.38e-01 0.177 0.119 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 76898 sc-eQTL 2.70e-01 0.114 0.103 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -144669 sc-eQTL 1.54e-01 -0.239 0.167 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 961854 sc-eQTL 3.75e-01 0.143 0.161 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -123959 sc-eQTL 1.28e-01 -0.266 0.174 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -173363 sc-eQTL 3.79e-01 0.102 0.116 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -224473 sc-eQTL 1.31e-01 -0.12 0.079 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -223243 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0599 0.141 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 76898 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0547 0.128 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -144669 sc-eQTL 5.74e-01 -0.106 0.188 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 961854 sc-eQTL 6.11e-01 0.093 0.183 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -123959 sc-eQTL 1.33e-02 -0.458 0.183 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -173363 sc-eQTL 6.97e-01 0.0684 0.175 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -224473 sc-eQTL 9.86e-01 0.00129 0.0744 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -223243 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0476 0.181 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 76898 sc-eQTL 3.51e-01 -0.138 0.147 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 961854 sc-eQTL 1.54e-01 0.204 0.143 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -173363 sc-eQTL 2.79e-01 0.202 0.186 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -224473 sc-eQTL 5.30e-01 0.0479 0.0761 0.058 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 -123959 eQTL 0.0135 -0.108 0.0436 0.0 0.0 0.0613
ENSG00000154269 ENPP3 961654 eQTL 0.00755 -0.131 0.0491 0.00178 0.0 0.0613
ENSG00000234484 AL032821.1 -162579 eQTL 0.00358 -0.182 0.0624 0.0 0.0 0.0613

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000154269 ENPP3 961654 2.74e-07 1.19e-07 3.88e-08 1.82e-07 9.21e-08 1e-07 1.49e-07 5.37e-08 1.45e-07 4.74e-08 1.62e-07 8.55e-08 1.45e-07 6.56e-08 6.17e-08 7.3e-08 3.98e-08 1.26e-07 5.39e-08 4.04e-08 1.04e-07 1.27e-07 1.34e-07 3.42e-08 1.4e-07 1.14e-07 1.06e-07 9.57e-08 1.08e-07 1.07e-07 9.64e-08 3.89e-08 3.16e-08 8.44e-08 8.38e-08 3.93e-08 5.02e-08 9.23e-08 6.54e-08 3.98e-08 5.14e-08 1.35e-07 4.7e-08 2.79e-08 5.7e-08 1.83e-08 1.19e-07 3.95e-09 4.85e-08