logo

Genes within 1Mb (chr6:132583694:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 182219 sc-eQTL 3.75e-01 -0.134 0.15 0.1 B L1
ENSG00000079950 STX7 70496 sc-eQTL 1.13e-01 0.09 0.0565 0.1 B L1
ENSG00000112282 MED23 955452 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0403 0.113 0.1 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -179765 sc-eQTL 1.88e-01 0.141 0.106 0.1 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -230875 sc-eQTL 2.79e-01 -0.07 0.0644 0.1 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -229645 sc-eQTL 2.19e-01 0.167 0.136 0.1 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 451806 sc-eQTL 5.79e-01 0.0496 0.0892 0.1 B L1
ENSG00000079950 STX7 70496 sc-eQTL 4.23e-01 0.0871 0.108 0.1 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 955452 sc-eQTL 8.87e-01 0.0123 0.0862 0.1 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -179765 sc-eQTL 1.09e-01 0.15 0.0935 0.1 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -230875 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0132 0.064 0.1 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -229645 sc-eQTL 1.75e-01 0.175 0.129 0.1 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 70496 sc-eQTL 5.20e-01 0.0691 0.107 0.1 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 955452 sc-eQTL 1.98e-01 -0.136 0.105 0.1 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -179765 sc-eQTL 7.69e-01 0.0369 0.125 0.1 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -230875 sc-eQTL 1.74e-01 -0.0582 0.0427 0.1 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -229645 sc-eQTL 9.80e-01 0.00329 0.13 0.1 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 70496 sc-eQTL 2.85e-01 -0.104 0.097 0.104 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -151071 sc-eQTL 3.31e-01 0.117 0.12 0.104 DC L1
ENSG00000112282 MED23 955452 sc-eQTL 7.24e-01 0.0501 0.142 0.104 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -130361 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0505 0.13 0.104 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -179765 sc-eQTL 3.22e-01 0.138 0.139 0.104 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -230875 sc-eQTL 3.54e-01 0.0724 0.0779 0.104 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -229645 sc-eQTL 1.25e-01 0.189 0.123 0.104 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -519434 sc-eQTL 2.52e-01 0.129 0.112 0.104 DC L1
ENSG00000079950 STX7 70496 sc-eQTL 3.80e-01 0.0652 0.0742 0.1 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -151071 sc-eQTL 1.80e-01 -0.171 0.127 0.1 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 955452 sc-eQTL 2.99e-01 -0.126 0.121 0.1 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -130361 sc-eQTL 1.23e-01 -0.212 0.137 0.1 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -179765 sc-eQTL 8.84e-01 0.0141 0.0969 0.1 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -230875 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00547 0.0581 0.1 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -229645 sc-eQTL 8.89e-02 0.195 0.114 0.1 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 70496 sc-eQTL 9.16e-01 0.0118 0.112 0.101 NK L1
ENSG00000112282 MED23 955452 sc-eQTL 2.75e-01 -0.112 0.102 0.101 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -179765 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00726 0.139 0.101 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -230875 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0496 0.0576 0.101 NK L1
ENSG00000079950 STX7 70496 sc-eQTL 9.69e-01 0.00439 0.114 0.1 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 955452 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0342 0.142 0.1 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -179765 sc-eQTL 2.50e-01 0.158 0.138 0.1 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -230875 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0498 0.0546 0.1 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -229645 sc-eQTL 4.74e-01 0.107 0.15 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 182219 sc-eQTL 4.99e-01 -0.103 0.153 0.099 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 70496 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00781 0.143 0.099 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 955452 sc-eQTL 2.49e-01 -0.183 0.158 0.099 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -179765 sc-eQTL 5.06e-01 0.101 0.152 0.099 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -230875 sc-eQTL 1.69e-01 -0.112 0.0812 0.099 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -229645 sc-eQTL 7.05e-03 0.382 0.14 0.099 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 451806 sc-eQTL 2.09e-01 -0.171 0.136 0.099 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 182219 sc-eQTL 3.57e-01 -0.127 0.138 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 70496 sc-eQTL 5.50e-01 0.0541 0.0904 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 955452 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0707 0.138 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -179765 sc-eQTL 1.29e-01 0.207 0.136 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -230875 sc-eQTL 4.82e-01 0.0587 0.0834 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -229645 sc-eQTL 8.23e-01 0.0337 0.15 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 451806 sc-eQTL 5.77e-01 0.0713 0.128 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 182219 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0385 0.138 0.101 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 70496 sc-eQTL 1.70e-01 0.148 0.108 0.101 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 955452 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00103 0.139 0.101 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -179765 sc-eQTL 1.98e-01 -0.182 0.141 0.101 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -230875 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0104 0.0681 0.101 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -229645 sc-eQTL 1.65e-02 0.339 0.14 0.101 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 451806 sc-eQTL 3.17e-01 -0.133 0.132 0.101 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 182219 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0865 0.156 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 70496 sc-eQTL 2.55e-01 0.0775 0.0679 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 955452 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0117 0.122 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -179765 sc-eQTL 3.08e-01 0.135 0.132 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -230875 sc-eQTL 8.77e-01 0.0117 0.0753 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -229645 sc-eQTL 3.19e-01 0.145 0.145 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 451806 sc-eQTL 3.86e-01 0.0835 0.0961 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 182219 sc-eQTL 8.74e-01 0.0232 0.146 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 70496 sc-eQTL 4.12e-01 0.0655 0.0797 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 955452 sc-eQTL 5.65e-01 0.0848 0.147 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -179765 sc-eQTL 2.79e-01 0.159 0.146 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -230875 sc-eQTL 7.47e-01 0.0251 0.0776 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -229645 sc-eQTL 2.26e-01 0.179 0.147 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 451806 sc-eQTL 9.89e-01 0.00147 0.103 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 70496 sc-eQTL 5.01e-01 -0.102 0.151 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 955452 sc-eQTL 3.53e-01 0.146 0.157 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -179765 sc-eQTL 9.03e-03 0.396 0.15 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -230875 sc-eQTL 7.66e-01 0.021 0.0706 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -229645 sc-eQTL 3.60e-02 -0.297 0.141 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 70496 sc-eQTL 2.77e-01 0.127 0.117 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 955452 sc-eQTL 8.78e-01 0.0154 0.1 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -179765 sc-eQTL 1.62e-01 0.152 0.108 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -230875 sc-eQTL 9.31e-01 0.00614 0.0705 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -229645 sc-eQTL 2.48e-01 0.157 0.135 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 70496 sc-eQTL 6.51e-01 0.0585 0.129 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 955452 sc-eQTL 5.42e-01 0.0663 0.109 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -179765 sc-eQTL 1.65e-01 0.177 0.127 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -230875 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00193 0.0661 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -229645 sc-eQTL 5.55e-01 0.0903 0.153 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 70496 sc-eQTL 6.02e-01 0.0793 0.152 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 955452 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0322 0.14 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -179765 sc-eQTL 3.87e-02 -0.3 0.144 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -230875 sc-eQTL 6.43e-01 0.0277 0.0597 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -229645 sc-eQTL 5.32e-01 0.0929 0.148 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 70496 sc-eQTL 3.52e-01 0.116 0.124 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 955452 sc-eQTL 1.84e-01 -0.169 0.127 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -179765 sc-eQTL 6.99e-01 0.0546 0.141 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -230875 sc-eQTL 2.23e-01 -0.0921 0.0753 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -229645 sc-eQTL 6.17e-01 0.0733 0.146 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 70496 sc-eQTL 3.08e-01 0.152 0.149 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 955452 sc-eQTL 2.44e-02 -0.269 0.119 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -179765 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0229 0.129 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -230875 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0203 0.0737 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -229645 sc-eQTL 2.84e-01 0.158 0.147 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 70496 sc-eQTL 7.78e-01 0.0429 0.152 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 955452 sc-eQTL 6.58e-02 0.28 0.151 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -179765 sc-eQTL 7.50e-04 0.502 0.146 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -230875 sc-eQTL 5.69e-01 0.0419 0.0734 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -229645 sc-eQTL 2.34e-01 0.192 0.16 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 70496 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0715 0.154 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 955452 sc-eQTL 2.26e-01 0.18 0.148 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -179765 sc-eQTL 8.09e-01 0.0372 0.154 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -230875 sc-eQTL 6.79e-01 0.0343 0.0826 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -229645 sc-eQTL 8.90e-02 -0.265 0.155 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 70496 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0255 0.144 0.1 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 955452 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0597 0.15 0.1 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -179765 sc-eQTL 5.32e-01 0.0916 0.146 0.1 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -230875 sc-eQTL 7.90e-01 0.0191 0.0719 0.1 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -229645 sc-eQTL 9.19e-01 0.0153 0.151 0.1 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 70496 sc-eQTL 3.35e-01 -0.142 0.146 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 955452 sc-eQTL 4.47e-01 0.118 0.155 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -179765 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0965 0.149 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -230875 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00907 0.0831 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 70496 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0999 0.118 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 955452 sc-eQTL 2.13e-01 -0.151 0.121 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -179765 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0791 0.148 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -230875 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0631 0.0585 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 70496 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0162 0.144 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 955452 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0355 0.146 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -179765 sc-eQTL 2.05e-01 0.185 0.145 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -230875 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0068 0.068 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 70496 sc-eQTL 9.60e-01 0.00654 0.129 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 955452 sc-eQTL 8.20e-01 0.0304 0.133 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -179765 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0852 0.145 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -230875 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00182 0.0786 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 182219 sc-eQTL 4.71e-01 0.11 0.153 0.093 PB L2
ENSG00000079950 STX7 70496 sc-eQTL 1.08e-01 -0.205 0.126 0.093 PB L2
ENSG00000112282 MED23 955452 sc-eQTL 1.25e-01 0.265 0.172 0.093 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -179765 sc-eQTL 4.61e-01 -0.115 0.156 0.093 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -230875 sc-eQTL 7.36e-01 0.0299 0.0885 0.093 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -229645 sc-eQTL 5.20e-01 0.107 0.166 0.093 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 451806 sc-eQTL 2.44e-01 -0.127 0.108 0.093 PB L2
ENSG00000079950 STX7 70496 sc-eQTL 3.36e-01 0.128 0.133 0.1 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 955452 sc-eQTL 8.20e-01 0.0341 0.15 0.1 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -179765 sc-eQTL 8.03e-01 0.0358 0.143 0.1 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -230875 sc-eQTL 9.79e-01 0.0014 0.0541 0.1 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -229645 sc-eQTL 2.90e-01 0.148 0.14 0.1 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 70496 sc-eQTL 1.22e-01 0.222 0.143 0.1 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 955452 sc-eQTL 1.17e-01 0.231 0.147 0.1 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -179765 sc-eQTL 5.96e-01 0.0642 0.121 0.1 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -230875 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0249 0.0535 0.1 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -229645 sc-eQTL 1.28e-01 0.23 0.15 0.1 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 70496 sc-eQTL 2.38e-01 -0.146 0.123 0.107 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -151071 sc-eQTL 5.64e-01 0.0711 0.123 0.107 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 955452 sc-eQTL 5.14e-01 0.104 0.16 0.107 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -130361 sc-eQTL 4.40e-01 -0.112 0.144 0.107 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -179765 sc-eQTL 1.90e-01 0.184 0.14 0.107 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -230875 sc-eQTL 2.03e-01 0.0885 0.0693 0.107 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -229645 sc-eQTL 3.54e-02 0.289 0.136 0.107 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -519434 sc-eQTL 5.42e-01 0.0673 0.11 0.107 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 70496 sc-eQTL 2.70e-01 0.105 0.095 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -151071 sc-eQTL 3.12e-01 -0.136 0.134 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 955452 sc-eQTL 1.46e-01 -0.193 0.132 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -130361 sc-eQTL 9.39e-02 -0.227 0.135 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -179765 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00799 0.109 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -230875 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0104 0.0603 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -229645 sc-eQTL 8.43e-01 0.0231 0.116 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 70496 sc-eQTL 2.53e-01 -0.117 0.103 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -151071 sc-eQTL 3.68e-01 -0.116 0.128 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 955452 sc-eQTL 6.34e-01 0.0663 0.139 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -130361 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0992 0.139 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -179765 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0587 0.0912 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -230875 sc-eQTL 4.97e-01 0.0447 0.0657 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -229645 sc-eQTL 1.18e-01 0.19 0.121 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 70496 sc-eQTL 5.22e-01 -0.116 0.181 0.097 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 955452 sc-eQTL 3.66e-01 -0.176 0.194 0.097 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -179765 sc-eQTL 6.69e-01 0.0861 0.201 0.097 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -230875 sc-eQTL 9.05e-02 0.129 0.0758 0.097 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -229645 sc-eQTL 1.90e-02 0.46 0.194 0.097 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 70496 sc-eQTL 3.14e-01 -0.137 0.136 0.1 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -151071 sc-eQTL 5.35e-01 0.0855 0.137 0.1 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 955452 sc-eQTL 9.37e-01 0.0119 0.151 0.1 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -130361 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0113 0.136 0.1 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -179765 sc-eQTL 8.98e-01 0.0177 0.138 0.1 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -230875 sc-eQTL 7.21e-01 0.0215 0.0602 0.1 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -229645 sc-eQTL 4.56e-02 0.292 0.145 0.1 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 70496 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0334 0.103 0.1 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -151071 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0735 0.145 0.1 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 955452 sc-eQTL 7.45e-01 -0.048 0.147 0.1 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -130361 sc-eQTL 8.48e-02 -0.248 0.143 0.1 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -179765 sc-eQTL 6.83e-01 0.0568 0.139 0.1 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -230875 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00652 0.0695 0.1 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -229645 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000642 0.123 0.1 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 70496 sc-eQTL 3.22e-01 -0.118 0.119 0.099 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -151071 sc-eQTL 7.04e-01 0.0458 0.12 0.099 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 955452 sc-eQTL 2.27e-01 -0.202 0.167 0.099 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -130361 sc-eQTL 5.71e-01 0.0694 0.122 0.099 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -179765 sc-eQTL 4.90e-01 0.101 0.146 0.099 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -230875 sc-eQTL 7.68e-01 0.0297 0.1 0.099 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -229645 sc-eQTL 3.49e-01 -0.139 0.148 0.099 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -519434 sc-eQTL 4.47e-01 0.108 0.142 0.099 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 182219 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0189 0.146 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 70496 sc-eQTL 1.61e-01 0.116 0.0821 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 955452 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0739 0.126 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -179765 sc-eQTL 9.08e-01 0.0152 0.13 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -230875 sc-eQTL 7.21e-01 0.0266 0.0743 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -229645 sc-eQTL 1.52e-01 0.195 0.136 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 451806 sc-eQTL 1.82e-01 -0.175 0.131 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 182219 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0779 0.156 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 70496 sc-eQTL 1.16e-01 0.1 0.0636 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 955452 sc-eQTL 8.36e-01 0.0249 0.12 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -179765 sc-eQTL 1.74e-01 0.169 0.124 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -230875 sc-eQTL 9.28e-01 0.00684 0.0752 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -229645 sc-eQTL 2.06e-01 0.179 0.141 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 451806 sc-eQTL 2.55e-01 0.103 0.0898 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 70496 sc-eQTL 6.69e-01 0.0342 0.0798 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -151071 sc-eQTL 2.49e-01 -0.15 0.13 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 955452 sc-eQTL 4.05e-01 -0.104 0.125 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -130361 sc-eQTL 2.47e-01 -0.157 0.135 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -179765 sc-eQTL 7.14e-01 -0.033 0.0897 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -230875 sc-eQTL 7.78e-01 0.0174 0.0615 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -229645 sc-eQTL 4.25e-01 0.0873 0.109 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 70496 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0807 0.0962 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -151071 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0375 0.142 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 955452 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0666 0.138 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -130361 sc-eQTL 3.41e-01 -0.134 0.14 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -179765 sc-eQTL 8.55e-01 0.0243 0.132 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -230875 sc-eQTL 9.07e-01 0.00661 0.0562 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -229645 sc-eQTL 5.64e-01 0.0788 0.136 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 70496 sc-eQTL 9.07e-01 0.0132 0.112 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 955452 sc-eQTL 3.08e-01 -0.111 0.109 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -179765 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00719 0.142 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -230875 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0427 0.0579 0.099 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 70496 pQTL 0.00678 0.0942 0.0347 0.0 0.0 0.111
ENSG00000112299 VNN1 -130361 pQTL 0.000554 -0.186 0.0536 0.0 0.0 0.111

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina