logo

Genes within 1Mb (chr6:132581276:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 179801 sc-eQTL 2.22e-01 0.125 0.102 0.241 B L1
ENSG00000079950 STX7 68078 sc-eQTL 1.64e-01 0.0537 0.0384 0.241 B L1
ENSG00000112282 MED23 953034 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0182 0.077 0.241 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -182183 sc-eQTL 8.70e-01 0.0119 0.0726 0.241 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -233293 sc-eQTL 5.54e-01 0.026 0.0439 0.241 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -232063 sc-eQTL 2.50e-01 -0.106 0.0921 0.241 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 449388 sc-eQTL 7.98e-01 0.0155 0.0606 0.241 B L1
ENSG00000079950 STX7 68078 sc-eQTL 3.89e-01 0.0647 0.075 0.241 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 953034 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0576 0.0595 0.241 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -182183 sc-eQTL 2.32e-01 0.0777 0.0648 0.241 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -233293 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00107 0.0442 0.241 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -232063 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0134 0.0895 0.241 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 68078 sc-eQTL 1.14e-01 0.117 0.0734 0.241 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 953034 sc-eQTL 2.16e-01 -0.0899 0.0725 0.241 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -182183 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0296 0.0862 0.241 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -233293 sc-eQTL 3.97e-01 -0.025 0.0294 0.241 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -232063 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0771 0.0889 0.241 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 68078 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0341 0.0678 0.245 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -153489 sc-eQTL 1.95e-01 0.109 0.0837 0.245 DC L1
ENSG00000112282 MED23 953034 sc-eQTL 4.25e-01 0.0788 0.0986 0.245 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -132779 sc-eQTL 5.04e-01 0.0608 0.0907 0.245 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -182183 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0219 0.0971 0.245 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -233293 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00284 0.0545 0.245 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -232063 sc-eQTL 1.29e-01 0.131 0.0857 0.245 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -521852 sc-eQTL 4.81e-01 0.0553 0.0783 0.245 DC L1
ENSG00000079950 STX7 68078 sc-eQTL 6.92e-01 0.0202 0.0509 0.241 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -153489 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0513 0.0873 0.241 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 953034 sc-eQTL 7.59e-01 0.0254 0.0829 0.241 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -132779 sc-eQTL 4.23e-03 -0.267 0.0922 0.241 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -182183 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0045 0.0663 0.241 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -233293 sc-eQTL 6.35e-01 0.0189 0.0397 0.241 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -232063 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0113 0.0786 0.241 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 68078 sc-eQTL 5.46e-01 0.0461 0.0762 0.242 NK L1
ENSG00000112282 MED23 953034 sc-eQTL 4.70e-02 -0.138 0.0691 0.242 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -182183 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0553 0.0948 0.242 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -233293 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00266 0.0393 0.242 NK L1
ENSG00000079950 STX7 68078 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0882 0.077 0.241 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 953034 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0432 0.0964 0.241 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -182183 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0786 0.0933 0.241 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -233293 sc-eQTL 8.35e-01 -0.00773 0.037 0.241 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -232063 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0276 0.101 0.241 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 179801 sc-eQTL 9.48e-01 0.00672 0.102 0.237 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 68078 sc-eQTL 7.90e-01 0.0256 0.0957 0.237 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 953034 sc-eQTL 1.21e-01 -0.164 0.105 0.237 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -182183 sc-eQTL 6.16e-01 0.0511 0.102 0.237 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -233293 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0429 0.0545 0.237 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232063 sc-eQTL 3.30e-01 0.0932 0.0954 0.237 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 449388 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0551 0.0911 0.237 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 179801 sc-eQTL 3.89e-01 0.0817 0.0947 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 68078 sc-eQTL 8.16e-01 0.0144 0.0621 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 953034 sc-eQTL 3.79e-01 0.0831 0.0943 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -182183 sc-eQTL 2.76e-02 0.205 0.0924 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -233293 sc-eQTL 1.52e-01 0.0818 0.057 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232063 sc-eQTL 2.68e-01 -0.114 0.103 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 449388 sc-eQTL 9.61e-01 0.00429 0.0877 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 179801 sc-eQTL 2.21e-01 -0.118 0.0958 0.244 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 68078 sc-eQTL 3.81e-01 0.0661 0.0753 0.244 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 953034 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0353 0.0972 0.244 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -182183 sc-eQTL 4.35e-02 -0.198 0.0977 0.244 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -233293 sc-eQTL 3.78e-01 0.0419 0.0475 0.244 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232063 sc-eQTL 4.80e-01 0.0701 0.0991 0.244 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 449388 sc-eQTL 1.79e-01 -0.124 0.0921 0.244 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 179801 sc-eQTL 2.48e-01 0.123 0.106 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 68078 sc-eQTL 2.03e-01 0.0593 0.0464 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 953034 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0929 0.0832 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -182183 sc-eQTL 8.22e-01 0.0204 0.0905 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -233293 sc-eQTL 6.04e-01 0.0267 0.0515 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232063 sc-eQTL 2.37e-01 -0.118 0.0991 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 449388 sc-eQTL 6.60e-01 0.029 0.0658 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 179801 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00354 0.101 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 68078 sc-eQTL 8.79e-01 -0.00837 0.055 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 953034 sc-eQTL 9.52e-01 0.00617 0.102 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -182183 sc-eQTL 4.40e-01 0.078 0.101 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -233293 sc-eQTL 3.55e-01 0.0495 0.0533 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232063 sc-eQTL 9.52e-01 0.0062 0.102 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 449388 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0692 0.0705 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 68078 sc-eQTL 6.50e-01 0.0471 0.104 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 953034 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0941 0.108 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -182183 sc-eQTL 1.55e-01 0.149 0.104 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -233293 sc-eQTL 3.23e-01 0.0478 0.0483 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232063 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0388 0.0975 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 68078 sc-eQTL 8.50e-01 0.0152 0.0801 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 953034 sc-eQTL 7.32e-01 0.0234 0.0684 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -182183 sc-eQTL 1.85e-01 0.0983 0.0739 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -233293 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00323 0.0482 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232063 sc-eQTL 8.52e-01 0.0173 0.0927 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 68078 sc-eQTL 5.61e-01 0.052 0.0893 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 953034 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0384 0.0751 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -182183 sc-eQTL 9.05e-01 0.0105 0.0881 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -233293 sc-eQTL 7.03e-01 0.0174 0.0456 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232063 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0985 0.106 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 68078 sc-eQTL 1.43e-02 0.253 0.102 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 953034 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0413 0.0955 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -182183 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0239 0.0995 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -233293 sc-eQTL 8.92e-01 -0.00557 0.0408 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232063 sc-eQTL 8.16e-01 0.0236 0.101 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 68078 sc-eQTL 9.07e-02 0.144 0.0848 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 953034 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0678 0.0874 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -182183 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0924 0.0968 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -233293 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0179 0.0519 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232063 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0855 0.1 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 68078 sc-eQTL 2.33e-01 0.122 0.102 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 953034 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0903 0.0818 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -182183 sc-eQTL 7.13e-01 0.0324 0.088 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -233293 sc-eQTL 8.84e-02 -0.0856 0.05 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232063 sc-eQTL 9.36e-01 0.00816 0.101 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 68078 sc-eQTL 4.12e-01 0.0837 0.102 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 953034 sc-eQTL 3.56e-01 0.0945 0.102 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -182183 sc-eQTL 7.52e-03 0.268 0.0993 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -233293 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0482 0.0492 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232063 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0139 0.108 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 68078 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0251 0.107 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 953034 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0131 0.103 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -182183 sc-eQTL 1.51e-01 -0.153 0.106 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -233293 sc-eQTL 9.68e-01 0.00232 0.0572 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232063 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0424 0.108 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 68078 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00467 0.0975 0.242 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 953034 sc-eQTL 4.39e-01 -0.079 0.102 0.242 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -182183 sc-eQTL 5.52e-01 -0.059 0.099 0.242 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -233293 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0425 0.0487 0.242 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232063 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0105 0.102 0.242 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 68078 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0615 0.101 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 953034 sc-eQTL 6.32e-01 0.0513 0.107 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -182183 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0608 0.103 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -233293 sc-eQTL 5.48e-01 0.0344 0.0572 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 68078 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0162 0.0811 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 953034 sc-eQTL 1.49e-01 -0.12 0.083 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -182183 sc-eQTL 8.41e-02 -0.175 0.101 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -233293 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0162 0.0403 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 68078 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0622 0.0999 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 953034 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0534 0.101 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -182183 sc-eQTL 3.32e-01 0.0982 0.101 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -233293 sc-eQTL 3.36e-01 0.0454 0.047 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 68078 sc-eQTL 9.78e-02 0.147 0.0884 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 953034 sc-eQTL 2.15e-02 -0.211 0.0909 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -182183 sc-eQTL 7.09e-01 0.0374 0.1 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -233293 sc-eQTL 8.98e-01 0.00694 0.0543 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 179801 sc-eQTL 6.22e-01 0.0583 0.118 0.226 PB L2
ENSG00000079950 STX7 68078 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0521 0.0985 0.226 PB L2
ENSG00000112282 MED23 953034 sc-eQTL 9.99e-02 0.22 0.132 0.226 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -182183 sc-eQTL 3.95e-01 -0.103 0.12 0.226 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -233293 sc-eQTL 9.99e-01 7.83e-05 0.0684 0.226 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232063 sc-eQTL 9.92e-01 0.00128 0.128 0.226 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 449388 sc-eQTL 3.99e-02 -0.172 0.0827 0.226 PB L2
ENSG00000079950 STX7 68078 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0409 0.0923 0.241 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 953034 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0392 0.104 0.241 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -182183 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00292 0.0991 0.241 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -233293 sc-eQTL 6.33e-01 0.0179 0.0375 0.241 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232063 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0265 0.097 0.241 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 68078 sc-eQTL 1.29e-01 0.15 0.0982 0.241 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 953034 sc-eQTL 4.76e-01 0.0724 0.101 0.241 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -182183 sc-eQTL 7.90e-01 0.0221 0.083 0.241 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -233293 sc-eQTL 8.07e-01 -0.009 0.0367 0.241 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232063 sc-eQTL 9.86e-02 0.171 0.103 0.241 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 68078 sc-eQTL 1.44e-01 -0.126 0.0855 0.246 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -153489 sc-eQTL 2.61e-01 0.096 0.0852 0.246 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 953034 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0479 0.111 0.246 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -132779 sc-eQTL 3.06e-01 0.103 0.1 0.246 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -182183 sc-eQTL 6.99e-01 0.0379 0.0978 0.246 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -233293 sc-eQTL 5.17e-01 0.0314 0.0483 0.246 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232063 sc-eQTL 3.08e-02 0.206 0.0945 0.246 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -521852 sc-eQTL 5.44e-01 0.0464 0.0764 0.246 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 68078 sc-eQTL 2.23e-01 0.0804 0.0658 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -153489 sc-eQTL 3.97e-01 -0.079 0.0932 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 953034 sc-eQTL 2.74e-01 -0.101 0.092 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -132779 sc-eQTL 6.21e-03 -0.256 0.0925 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -182183 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0309 0.0753 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -233293 sc-eQTL 9.82e-01 -0.000969 0.0418 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232063 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0966 0.0804 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 68078 sc-eQTL 1.94e-02 -0.165 0.0699 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -153489 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0177 0.0885 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 953034 sc-eQTL 1.95e-01 0.124 0.0957 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -132779 sc-eQTL 9.34e-03 -0.248 0.0945 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -182183 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0149 0.0629 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -233293 sc-eQTL 5.30e-01 0.0285 0.0453 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232063 sc-eQTL 3.48e-01 0.0788 0.0837 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 68078 sc-eQTL 1.57e-01 -0.163 0.115 0.239 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 953034 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0136 0.124 0.239 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -182183 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0591 0.128 0.239 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -233293 sc-eQTL 2.74e-01 0.0534 0.0486 0.239 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232063 sc-eQTL 3.29e-01 0.123 0.126 0.239 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 68078 sc-eQTL 6.60e-01 0.0417 0.0948 0.242 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -153489 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0793 0.0956 0.242 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 953034 sc-eQTL 5.15e-01 0.0685 0.105 0.242 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -132779 sc-eQTL 2.31e-01 -0.113 0.0943 0.242 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -182183 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0957 0.096 0.242 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -233293 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0277 0.0418 0.242 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232063 sc-eQTL 6.30e-01 0.0492 0.102 0.242 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 68078 sc-eQTL 8.97e-01 -0.00913 0.0703 0.244 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -153489 sc-eQTL 6.19e-01 0.0493 0.0991 0.244 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 953034 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0157 0.1 0.244 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -132779 sc-eQTL 1.00e-02 -0.252 0.0968 0.244 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -182183 sc-eQTL 9.15e-01 0.0101 0.0946 0.244 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -233293 sc-eQTL 5.48e-02 -0.0909 0.047 0.244 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232063 sc-eQTL 8.96e-01 -0.011 0.0839 0.244 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 68078 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0167 0.0831 0.24 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -153489 sc-eQTL 5.92e-01 0.0449 0.0836 0.24 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 953034 sc-eQTL 9.10e-01 0.0132 0.117 0.24 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -132779 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0317 0.0852 0.24 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -182183 sc-eQTL 3.55e-01 0.0938 0.101 0.24 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -233293 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0468 0.0697 0.24 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232063 sc-eQTL 9.80e-01 0.00264 0.103 0.24 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -521852 sc-eQTL 3.03e-01 0.102 0.0986 0.24 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 179801 sc-eQTL 2.25e-01 0.122 0.1 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 68078 sc-eQTL 2.96e-01 0.0596 0.0568 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 953034 sc-eQTL 7.66e-01 0.026 0.0872 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -182183 sc-eQTL 7.67e-01 0.0267 0.0901 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -233293 sc-eQTL 1.24e-01 0.0787 0.0511 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -232063 sc-eQTL 9.04e-01 0.0113 0.0942 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 449388 sc-eQTL 8.42e-02 -0.157 0.0903 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 179801 sc-eQTL 4.02e-01 0.0894 0.106 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 68078 sc-eQTL 2.21e-01 0.0536 0.0436 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 953034 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0631 0.082 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -182183 sc-eQTL 6.10e-01 0.0434 0.0849 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -233293 sc-eQTL 3.09e-01 0.0523 0.0513 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -232063 sc-eQTL 2.58e-01 -0.11 0.0967 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 449388 sc-eQTL 8.05e-01 0.0153 0.0616 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 68078 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0126 0.0551 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -153489 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0634 0.0898 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 953034 sc-eQTL 9.81e-01 0.0021 0.0864 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -132779 sc-eQTL 5.95e-03 -0.256 0.0921 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -182183 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0266 0.0619 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -233293 sc-eQTL 6.50e-01 0.0193 0.0425 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -232063 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0482 0.0755 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 68078 sc-eQTL 7.35e-01 0.0226 0.0668 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -153489 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0387 0.0982 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 953034 sc-eQTL 4.93e-01 0.0656 0.0956 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -132779 sc-eQTL 3.19e-02 -0.208 0.0963 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -182183 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0671 0.0917 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -233293 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0138 0.0389 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -232063 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00288 0.0946 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 68078 sc-eQTL 3.62e-01 0.0698 0.0763 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 953034 sc-eQTL 3.35e-02 -0.157 0.0735 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -182183 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0515 0.0968 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -233293 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0115 0.0395 0.241 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079931 MOXD1 179801 eQTL 0.00538 0.0931 0.0334 0.0 0.0 0.244
ENSG00000079950 STX7 68078 pQTL 0.0222 0.0579 0.0253 0.0 0.0 0.25
ENSG00000112299 VNN1 -132779 pQTL 0.00124 -0.126 0.039 0.0 0.0 0.25
ENSG00000112299 VNN1 -132779 eQTL 0.000242 -0.0885 0.024 0.0 0.0 0.244

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112299 VNN1 -132779 4.27e-06 3.99e-06 7.85e-07 1.89e-06 1.43e-06 1.01e-06 3.02e-06 9.97e-07 3.9e-06 1.97e-06 4.22e-06 2.85e-06 6.61e-06 1.34e-06 1.3e-06 2.82e-06 1.83e-06 2.74e-06 1.39e-06 9.64e-07 2.61e-06 4.27e-06 3.38e-06 1.43e-06 4.89e-06 1.65e-06 2.35e-06 1.45e-06 4.32e-06 3.6e-06 1.95e-06 5.08e-07 6.32e-07 1.59e-06 1.9e-06 9.21e-07 1e-06 4.92e-07 8.94e-07 3.71e-07 7.46e-07 4.65e-06 3.77e-07 1.55e-07 6.36e-07 4.64e-07 8.39e-07 4.4e-07 3.75e-07
ENSG00000154269 \N 952834 2.76e-07 1.3e-07 4.98e-08 1.81e-07 9.24e-08 9.9e-08 1.6e-07 5.43e-08 1.47e-07 5.67e-08 1.57e-07 1.01e-07 1.53e-07 7.13e-08 5.91e-08 7.23e-08 4.01e-08 1.4e-07 6.07e-08 4.23e-08 1.21e-07 1.26e-07 1.45e-07 3.03e-08 1.55e-07 1.22e-07 1.1e-07 9.74e-08 1.23e-07 1.07e-07 1.02e-07 3.64e-08 3.61e-08 8.56e-08 7.02e-08 3.53e-08 5.04e-08 9.26e-08 6.37e-08 3.8e-08 5.42e-08 1.4e-07 5.27e-08 2.4e-08 4.92e-08 1.84e-08 1.19e-07 3.83e-09 4.88e-08