Genes within 1Mb (chr6:132580596:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 179121 sc-eQTL 2.38e-02 0.284 0.125 0.141 B L1
ENSG00000079950 STX7 67398 sc-eQTL 6.97e-01 0.0185 0.0476 0.141 B L1
ENSG00000112282 MED23 952354 sc-eQTL 9.95e-01 0.000558 0.095 0.141 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -182863 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0807 0.0894 0.141 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -233973 sc-eQTL 1.01e-01 0.0886 0.0538 0.141 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -232743 sc-eQTL 1.39e-02 -0.279 0.112 0.141 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 448708 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0112 0.0748 0.141 B L1
ENSG00000079950 STX7 67398 sc-eQTL 7.02e-01 0.0359 0.0938 0.141 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 952354 sc-eQTL 1.84e-01 -0.0989 0.0741 0.141 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -182863 sc-eQTL 9.12e-01 0.00899 0.0812 0.141 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -233973 sc-eQTL 8.82e-01 0.0082 0.0552 0.141 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -232743 sc-eQTL 1.75e-01 -0.152 0.111 0.141 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 67398 sc-eQTL 1.61e-01 0.127 0.0904 0.141 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 952354 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0388 0.0894 0.141 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -182863 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0711 0.106 0.141 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -233973 sc-eQTL 9.18e-01 0.00375 0.0362 0.141 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -232743 sc-eQTL 2.77e-01 -0.119 0.109 0.141 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 67398 sc-eQTL 7.68e-01 0.0243 0.0823 0.142 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -154169 sc-eQTL 4.54e-01 0.0765 0.102 0.142 DC L1
ENSG00000112282 MED23 952354 sc-eQTL 5.03e-01 0.0803 0.12 0.142 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -133459 sc-eQTL 2.54e-01 0.126 0.11 0.142 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -182863 sc-eQTL 2.66e-01 -0.131 0.118 0.142 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -233973 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0561 0.066 0.142 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -232743 sc-eQTL 5.87e-01 0.0569 0.105 0.142 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -522532 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0107 0.0952 0.142 DC L1
ENSG00000079950 STX7 67398 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0155 0.0621 0.141 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -154169 sc-eQTL 6.88e-01 0.0429 0.107 0.141 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 952354 sc-eQTL 2.14e-01 0.126 0.101 0.141 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -133459 sc-eQTL 2.88e-02 -0.25 0.114 0.141 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -182863 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0166 0.081 0.141 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -233973 sc-eQTL 5.10e-01 0.032 0.0485 0.141 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -232743 sc-eQTL 1.10e-01 -0.153 0.0955 0.141 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 67398 sc-eQTL 5.09e-01 0.0623 0.0943 0.142 NK L1
ENSG00000112282 MED23 952354 sc-eQTL 1.25e-01 -0.132 0.0858 0.142 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -182863 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0795 0.117 0.142 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -233973 sc-eQTL 5.22e-01 0.0312 0.0486 0.142 NK L1
ENSG00000079950 STX7 67398 sc-eQTL 1.58e-01 -0.132 0.0929 0.141 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 952354 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0402 0.117 0.141 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -182863 sc-eQTL 4.95e-02 -0.221 0.112 0.141 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -233973 sc-eQTL 6.22e-01 0.0221 0.0447 0.141 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -232743 sc-eQTL 3.61e-01 -0.112 0.122 0.141 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 179121 sc-eQTL 5.19e-01 0.0822 0.127 0.138 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 67398 sc-eQTL 7.06e-01 0.0451 0.119 0.138 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 952354 sc-eQTL 3.33e-01 -0.128 0.132 0.138 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -182863 sc-eQTL 9.44e-01 0.00896 0.127 0.138 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -233973 sc-eQTL 8.68e-01 0.0113 0.068 0.138 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232743 sc-eQTL 3.12e-01 -0.12 0.119 0.138 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 448708 sc-eQTL 7.69e-01 0.0334 0.114 0.138 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 179121 sc-eQTL 6.31e-02 0.218 0.117 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 67398 sc-eQTL 8.26e-01 -0.017 0.077 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 952354 sc-eQTL 1.25e-01 0.179 0.117 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -182863 sc-eQTL 1.52e-01 0.166 0.115 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -233973 sc-eQTL 2.40e-01 0.0834 0.0708 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232743 sc-eQTL 1.17e-01 -0.2 0.127 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 448708 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0451 0.109 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 179121 sc-eQTL 2.00e-01 -0.153 0.119 0.142 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 67398 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00955 0.094 0.142 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 952354 sc-eQTL 6.56e-01 -0.054 0.121 0.142 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -182863 sc-eQTL 1.65e-01 -0.17 0.122 0.142 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -233973 sc-eQTL 2.18e-01 0.073 0.059 0.142 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232743 sc-eQTL 2.33e-01 -0.147 0.123 0.142 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 448708 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0925 0.115 0.142 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 179121 sc-eQTL 5.70e-02 0.25 0.131 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 67398 sc-eQTL 5.42e-01 0.0351 0.0575 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 952354 sc-eQTL 1.96e-01 -0.133 0.103 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -182863 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0653 0.112 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -233973 sc-eQTL 6.11e-01 0.0325 0.0637 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232743 sc-eQTL 2.06e-02 -0.283 0.121 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 448708 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0154 0.0814 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 179121 sc-eQTL 8.60e-01 -0.022 0.124 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 67398 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0596 0.0675 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 952354 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0515 0.125 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -182863 sc-eQTL 9.74e-01 0.00401 0.124 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -233973 sc-eQTL 3.88e-01 0.0568 0.0656 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232743 sc-eQTL 3.42e-01 -0.119 0.125 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 448708 sc-eQTL 2.24e-01 -0.106 0.0866 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 67398 sc-eQTL 2.75e-01 0.135 0.123 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 952354 sc-eQTL 7.10e-02 -0.232 0.128 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -182863 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0529 0.125 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -233973 sc-eQTL 3.50e-01 0.054 0.0576 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232743 sc-eQTL 2.17e-01 0.143 0.116 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 67398 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0676 0.0988 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 952354 sc-eQTL 7.70e-01 0.0247 0.0845 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -182863 sc-eQTL 6.48e-01 0.0418 0.0916 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -233973 sc-eQTL 8.76e-01 -0.00929 0.0595 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232743 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0852 0.114 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 67398 sc-eQTL 7.40e-01 0.0366 0.11 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 952354 sc-eQTL 2.50e-01 -0.107 0.0924 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -182863 sc-eQTL 3.00e-01 -0.113 0.108 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -233973 sc-eQTL 6.20e-01 0.0279 0.0563 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232743 sc-eQTL 9.76e-02 -0.216 0.13 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 67398 sc-eQTL 9.03e-03 0.335 0.127 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 952354 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0408 0.119 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -182863 sc-eQTL 1.45e-01 0.181 0.124 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -233973 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0288 0.0509 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232743 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0308 0.127 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 67398 sc-eQTL 2.05e-01 0.131 0.103 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 952354 sc-eQTL 8.68e-01 0.0176 0.106 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -182863 sc-eQTL 1.41e-01 -0.173 0.117 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -233973 sc-eQTL 5.52e-01 0.0373 0.0627 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232743 sc-eQTL 1.49e-01 -0.175 0.121 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 67398 sc-eQTL 5.44e-01 0.0757 0.125 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 952354 sc-eQTL 5.99e-01 0.0528 0.1 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -182863 sc-eQTL 5.49e-01 0.0646 0.108 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -233973 sc-eQTL 6.37e-02 -0.114 0.0611 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232743 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0986 0.123 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 67398 sc-eQTL 4.35e-01 0.0982 0.126 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 952354 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0478 0.126 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -182863 sc-eQTL 6.03e-01 0.065 0.125 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -233973 sc-eQTL 9.20e-02 -0.102 0.0604 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232743 sc-eQTL 2.52e-01 -0.153 0.133 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 67398 sc-eQTL 9.18e-01 0.0133 0.129 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 952354 sc-eQTL 2.46e-01 -0.144 0.123 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -182863 sc-eQTL 5.30e-02 -0.247 0.127 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -233973 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0204 0.0688 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232743 sc-eQTL 3.46e-01 0.123 0.13 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 67398 sc-eQTL 9.30e-01 0.0104 0.118 0.143 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 952354 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0759 0.124 0.143 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -182863 sc-eQTL 2.16e-01 -0.149 0.12 0.143 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -233973 sc-eQTL 2.02e-01 -0.0754 0.0589 0.143 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232743 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0258 0.124 0.143 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 67398 sc-eQTL 9.44e-01 0.00868 0.124 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 952354 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00719 0.132 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -182863 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0227 0.126 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -233973 sc-eQTL 4.06e-01 0.0584 0.0702 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 67398 sc-eQTL 6.37e-01 0.0476 0.101 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 952354 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0755 0.103 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -182863 sc-eQTL 9.14e-02 -0.212 0.125 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -233973 sc-eQTL 6.78e-01 0.0208 0.05 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 67398 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0799 0.121 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 952354 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0533 0.122 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -182863 sc-eQTL 9.12e-01 0.0136 0.123 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -233973 sc-eQTL 2.11e-01 0.0714 0.0569 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 67398 sc-eQTL 4.74e-02 0.215 0.108 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 952354 sc-eQTL 2.56e-03 -0.336 0.11 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -182863 sc-eQTL 3.41e-01 0.116 0.122 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -233973 sc-eQTL 8.61e-01 0.0117 0.0663 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 179121 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0108 0.141 0.133 PB L2
ENSG00000079950 STX7 67398 sc-eQTL 3.95e-01 0.1 0.118 0.133 PB L2
ENSG00000112282 MED23 952354 sc-eQTL 5.85e-01 0.0878 0.16 0.133 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -182863 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0484 0.144 0.133 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -233973 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0255 0.0818 0.133 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232743 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0896 0.153 0.133 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 448708 sc-eQTL 1.71e-01 -0.138 0.1 0.133 PB L2
ENSG00000079950 STX7 67398 sc-eQTL 1.72e-01 -0.155 0.113 0.141 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 952354 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0839 0.128 0.141 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -182863 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0303 0.122 0.141 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -233973 sc-eQTL 5.72e-01 0.026 0.046 0.141 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232743 sc-eQTL 2.16e-01 -0.147 0.119 0.141 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 67398 sc-eQTL 5.76e-01 0.0677 0.121 0.141 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 952354 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0548 0.124 0.141 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -182863 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0122 0.102 0.141 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -233973 sc-eQTL 9.27e-01 0.0041 0.045 0.141 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232743 sc-eQTL 4.60e-01 0.094 0.127 0.141 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 67398 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0833 0.106 0.139 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -154169 sc-eQTL 3.74e-01 0.0936 0.105 0.139 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 952354 sc-eQTL 2.76e-01 -0.149 0.136 0.139 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -133459 sc-eQTL 5.39e-02 0.238 0.122 0.139 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -182863 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0774 0.12 0.139 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -233973 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0172 0.0595 0.139 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232743 sc-eQTL 3.93e-01 0.101 0.118 0.139 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -522532 sc-eQTL 8.22e-01 0.0212 0.0942 0.139 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 67398 sc-eQTL 5.83e-01 0.044 0.0801 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -154169 sc-eQTL 8.60e-01 -0.02 0.113 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 952354 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0118 0.112 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -133459 sc-eQTL 5.83e-02 -0.216 0.113 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -182863 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0398 0.0913 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -233973 sc-eQTL 9.07e-01 0.00595 0.0507 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232743 sc-eQTL 1.05e-01 -0.159 0.0973 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 67398 sc-eQTL 5.97e-02 -0.162 0.0857 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -154169 sc-eQTL 6.09e-01 0.0553 0.108 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 952354 sc-eQTL 2.38e-01 0.138 0.117 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -133459 sc-eQTL 1.02e-02 -0.299 0.115 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -182863 sc-eQTL 8.02e-01 0.0192 0.0768 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -233973 sc-eQTL 8.46e-01 0.0108 0.0553 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232743 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0169 0.102 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 67398 sc-eQTL 2.33e-01 -0.164 0.137 0.142 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 952354 sc-eQTL 5.80e-01 0.0818 0.147 0.142 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -182863 sc-eQTL 3.83e-01 -0.133 0.152 0.142 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -233973 sc-eQTL 9.83e-01 0.00121 0.058 0.142 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232743 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0904 0.15 0.142 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 67398 sc-eQTL 1.62e-01 0.163 0.116 0.142 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -154169 sc-eQTL 1.22e-01 -0.181 0.117 0.142 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 952354 sc-eQTL 4.65e-01 0.0942 0.129 0.142 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -133459 sc-eQTL 1.63e-01 -0.162 0.115 0.142 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -182863 sc-eQTL 1.84e-01 -0.157 0.117 0.142 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -233973 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0572 0.0511 0.142 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232743 sc-eQTL 2.68e-01 -0.138 0.125 0.142 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 67398 sc-eQTL 9.11e-01 0.0096 0.0857 0.145 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -154169 sc-eQTL 3.04e-01 0.124 0.121 0.145 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 952354 sc-eQTL 9.35e-01 0.01 0.123 0.145 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -133459 sc-eQTL 9.06e-02 -0.203 0.119 0.145 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -182863 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0243 0.115 0.145 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -233973 sc-eQTL 2.33e-02 -0.131 0.0572 0.145 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232743 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0159 0.102 0.145 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 67398 sc-eQTL 5.60e-01 0.0578 0.0991 0.141 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -154169 sc-eQTL 7.46e-01 0.0324 0.0998 0.141 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 952354 sc-eQTL 2.56e-01 0.158 0.139 0.141 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -133459 sc-eQTL 3.60e-01 -0.093 0.101 0.141 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -182863 sc-eQTL 5.97e-01 0.0641 0.121 0.141 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -233973 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0871 0.083 0.141 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -232743 sc-eQTL 4.20e-01 0.0996 0.123 0.141 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -522532 sc-eQTL 5.52e-01 0.0703 0.118 0.141 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 179121 sc-eQTL 1.05e-01 0.202 0.124 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 67398 sc-eQTL 9.23e-01 0.00685 0.0709 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 952354 sc-eQTL 3.82e-01 0.0947 0.108 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -182863 sc-eQTL 7.88e-01 0.0302 0.112 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -233973 sc-eQTL 1.09e-01 0.102 0.0635 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -232743 sc-eQTL 2.81e-01 -0.126 0.117 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 448708 sc-eQTL 3.18e-01 -0.113 0.113 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 179121 sc-eQTL 1.45e-01 0.191 0.131 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 67398 sc-eQTL 8.52e-01 0.0101 0.0539 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 952354 sc-eQTL 2.62e-01 -0.113 0.101 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -182863 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0538 0.105 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -233973 sc-eQTL 2.39e-01 0.0745 0.0631 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -232743 sc-eQTL 1.34e-02 -0.294 0.118 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 448708 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0496 0.0758 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 67398 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0429 0.067 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -154169 sc-eQTL 9.13e-01 0.012 0.109 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 952354 sc-eQTL 4.65e-01 0.0768 0.105 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -133459 sc-eQTL 1.82e-02 -0.268 0.113 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -182863 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0162 0.0754 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -233973 sc-eQTL 7.53e-01 0.0163 0.0517 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -232743 sc-eQTL 1.48e-01 -0.133 0.0916 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 67398 sc-eQTL 2.64e-01 0.0905 0.0808 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -154169 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0304 0.119 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 952354 sc-eQTL 2.15e-01 0.144 0.116 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -133459 sc-eQTL 7.25e-02 -0.212 0.117 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -182863 sc-eQTL 2.98e-01 -0.116 0.111 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -233973 sc-eQTL 5.97e-01 -0.025 0.0473 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -232743 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0601 0.115 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 67398 sc-eQTL 3.02e-01 0.0979 0.0946 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 952354 sc-eQTL 7.70e-02 -0.162 0.0914 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -182863 sc-eQTL 5.38e-01 -0.074 0.12 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -233973 sc-eQTL 7.93e-01 0.0129 0.049 0.142 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079931 MOXD1 179121 eQTL 0.0318 0.0894 0.0416 0.0 0.0 0.139
ENSG00000112299 VNN1 -133459 eQTL 0.000265 -0.109 0.0299 0.0 0.0 0.139
ENSG00000154269 ENPP3 952154 eQTL 0.0507 0.0662 0.0338 0.00113 0.0 0.139


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112299 VNN1 -133459 4.34e-06 4.7e-06 9.35e-07 2.39e-06 1.35e-06 1.23e-06 3.33e-06 9.55e-07 4.13e-06 2.12e-06 4.16e-06 3.3e-06 6.98e-06 1.96e-06 1.42e-06 2.82e-06 2.06e-06 2.75e-06 1.41e-06 9.86e-07 2.67e-06 4.25e-06 3.38e-06 1.56e-06 5.16e-06 1.37e-06 2.41e-06 1.55e-06 4.26e-06 4.17e-06 1.98e-06 5.06e-07 6.32e-07 1.86e-06 2.06e-06 9.01e-07 9.05e-07 3.91e-07 1.06e-06 3.4e-07 4.32e-07 4.84e-06 3.82e-07 1.54e-07 4.86e-07 4.13e-07 8.71e-07 4.42e-07 3.91e-07
ENSG00000154269 ENPP3 952154 2.69e-07 1.19e-07 4.98e-08 1.86e-07 9.25e-08 9.76e-08 1.49e-07 5.4e-08 1.44e-07 4.94e-08 1.6e-07 8.59e-08 1.41e-07 6.56e-08 6.02e-08 7.3e-08 3.93e-08 1.26e-07 5.97e-08 4.16e-08 1.21e-07 1.28e-07 1.39e-07 2.95e-08 1.37e-07 1.14e-07 1.07e-07 9.57e-08 1.09e-07 1.07e-07 9.91e-08 3.06e-08 3.66e-08 8.25e-08 7.36e-08 3.2e-08 5.04e-08 8.61e-08 6.59e-08 3.76e-08 5.13e-08 1.35e-07 5.22e-08 1.34e-08 3.84e-08 1.84e-08 1.19e-07 1.88e-09 4.99e-08