logo

Genes within 1Mb (chr6:132579320:T:TA):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 177845 sc-eQTL 3.78e-02 -0.264 0.126 0.15 B L1
ENSG00000079950 STX7 66122 sc-eQTL 2.08e-01 0.0604 0.0479 0.15 B L1
ENSG00000112282 MED23 951078 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0841 0.0957 0.15 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -184139 sc-eQTL 1.03e-01 0.147 0.0898 0.15 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -235249 sc-eQTL 5.13e-02 -0.106 0.0541 0.15 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -234019 sc-eQTL 2.49e-01 0.132 0.115 0.15 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 447432 sc-eQTL 5.13e-01 0.0494 0.0754 0.15 B L1
ENSG00000079950 STX7 66122 sc-eQTL 6.82e-01 0.0385 0.094 0.15 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 951078 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0477 0.0745 0.15 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -184139 sc-eQTL 8.32e-02 0.141 0.0808 0.15 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -235249 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0384 0.0553 0.15 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -234019 sc-eQTL 7.02e-02 0.202 0.111 0.15 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 66122 sc-eQTL 3.70e-01 0.082 0.0913 0.15 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 951078 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0437 0.0901 0.15 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -184139 sc-eQTL 1.66e-01 0.148 0.106 0.15 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -235249 sc-eQTL 1.66e-01 -0.0505 0.0363 0.15 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -234019 sc-eQTL 4.13e-01 0.0904 0.11 0.15 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 66122 sc-eQTL 2.93e-01 0.0872 0.0828 0.151 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -155445 sc-eQTL 3.68e-01 0.0926 0.103 0.151 DC L1
ENSG00000112282 MED23 951078 sc-eQTL 5.09e-01 0.0798 0.121 0.151 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -134735 sc-eQTL 3.39e-01 -0.106 0.111 0.151 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -184139 sc-eQTL 4.29e-01 0.0939 0.119 0.151 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -235249 sc-eQTL 5.54e-01 0.0394 0.0666 0.151 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -234019 sc-eQTL 6.15e-01 0.0531 0.105 0.151 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -523808 sc-eQTL 1.17e-01 0.15 0.0954 0.151 DC L1
ENSG00000079950 STX7 66122 sc-eQTL 6.63e-02 0.114 0.0616 0.15 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -155445 sc-eQTL 1.77e-01 -0.144 0.106 0.15 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 951078 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0259 0.101 0.15 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -134735 sc-eQTL 3.98e-02 -0.235 0.114 0.15 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -184139 sc-eQTL 6.79e-01 0.0335 0.0809 0.15 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -235249 sc-eQTL 6.50e-01 -0.022 0.0485 0.15 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -234019 sc-eQTL 4.20e-01 0.0774 0.0958 0.15 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 66122 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0379 0.095 0.15 NK L1
ENSG00000112282 MED23 951078 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0336 0.0868 0.15 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -184139 sc-eQTL 3.36e-01 0.114 0.118 0.15 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -235249 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0436 0.0488 0.15 NK L1
ENSG00000079950 STX7 66122 sc-eQTL 7.44e-01 0.0307 0.0939 0.15 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 951078 sc-eQTL 8.25e-01 0.0259 0.117 0.15 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -184139 sc-eQTL 4.28e-01 0.0901 0.113 0.15 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -235249 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0183 0.045 0.15 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -234019 sc-eQTL 7.18e-01 0.0446 0.123 0.15 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 177845 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0466 0.135 0.153 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 66122 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0801 0.127 0.153 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 951078 sc-eQTL 2.56e-01 -0.159 0.14 0.153 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -184139 sc-eQTL 1.92e-01 0.176 0.134 0.153 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -235249 sc-eQTL 1.41e-01 -0.106 0.0718 0.153 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -234019 sc-eQTL 1.53e-02 0.305 0.124 0.153 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 447432 sc-eQTL 6.43e-02 -0.222 0.119 0.153 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 177845 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0916 0.119 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 66122 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00359 0.0778 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 951078 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0962 0.118 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -184139 sc-eQTL 2.09e-01 0.147 0.117 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -235249 sc-eQTL 9.89e-01 0.00095 0.0718 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -234019 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0476 0.129 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 447432 sc-eQTL 4.91e-01 0.0757 0.11 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 177845 sc-eQTL 3.42e-01 -0.111 0.117 0.149 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 66122 sc-eQTL 3.55e-01 0.0851 0.0918 0.149 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 951078 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00999 0.119 0.149 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -184139 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0811 0.12 0.149 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -235249 sc-eQTL 9.82e-01 0.00134 0.058 0.149 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -234019 sc-eQTL 6.67e-02 0.221 0.12 0.149 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 447432 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0957 0.113 0.149 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 177845 sc-eQTL 2.36e-01 -0.156 0.131 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 66122 sc-eQTL 1.48e-01 0.0832 0.0574 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 951078 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0428 0.103 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -184139 sc-eQTL 7.21e-01 0.0401 0.112 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -235249 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0531 0.0637 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -234019 sc-eQTL 7.37e-02 0.219 0.122 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 447432 sc-eQTL 8.48e-02 0.14 0.0809 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 177845 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0883 0.126 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 66122 sc-eQTL 6.64e-01 0.0297 0.0684 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 951078 sc-eQTL 4.21e-01 0.102 0.126 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -184139 sc-eQTL 5.68e-02 0.239 0.125 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -235249 sc-eQTL 5.78e-01 -0.037 0.0665 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -234019 sc-eQTL 4.00e-01 0.107 0.127 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 447432 sc-eQTL 6.14e-01 0.0444 0.0879 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 66122 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0246 0.126 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 951078 sc-eQTL 8.79e-01 -0.02 0.131 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -184139 sc-eQTL 1.58e-02 0.306 0.126 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -235249 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0207 0.0589 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -234019 sc-eQTL 2.05e-02 -0.274 0.117 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 66122 sc-eQTL 2.86e-01 0.108 0.101 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 951078 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0736 0.0865 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -184139 sc-eQTL 2.70e-01 0.104 0.0938 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -235249 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0196 0.061 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -234019 sc-eQTL 9.64e-02 0.195 0.117 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 66122 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0843 0.112 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 951078 sc-eQTL 5.65e-01 0.0545 0.0945 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -184139 sc-eQTL 1.62e-01 0.155 0.11 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -235249 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0435 0.0574 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -234019 sc-eQTL 1.86e-01 0.176 0.133 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 66122 sc-eQTL 4.36e-01 0.0996 0.128 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 951078 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0662 0.118 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -184139 sc-eQTL 1.62e-01 -0.171 0.122 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -235249 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0139 0.0502 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -234019 sc-eQTL 9.32e-01 0.0106 0.125 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 66122 sc-eQTL 1.00e-01 0.172 0.104 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 951078 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0541 0.107 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -184139 sc-eQTL 1.56e-01 0.169 0.119 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -235249 sc-eQTL 2.15e-01 -0.079 0.0635 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -234019 sc-eQTL 4.07e-01 0.103 0.123 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 66122 sc-eQTL 9.18e-01 0.0132 0.128 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 951078 sc-eQTL 2.09e-01 -0.129 0.103 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -184139 sc-eQTL 3.43e-01 0.105 0.11 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -235249 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0281 0.0633 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -234019 sc-eQTL 1.59e-01 0.179 0.126 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 66122 sc-eQTL 8.42e-01 0.0255 0.128 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 951078 sc-eQTL 1.46e-01 0.186 0.128 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -184139 sc-eQTL 1.20e-01 0.197 0.126 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -235249 sc-eQTL 7.73e-01 0.0178 0.0618 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -234019 sc-eQTL 1.36e-01 0.202 0.135 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 66122 sc-eQTL 9.71e-01 0.00484 0.135 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 951078 sc-eQTL 3.87e-01 0.112 0.13 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -184139 sc-eQTL 3.18e-01 0.134 0.134 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -235249 sc-eQTL 5.31e-01 0.0453 0.0722 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -234019 sc-eQTL 3.02e-01 -0.141 0.136 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 66122 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0924 0.12 0.147 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 951078 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0504 0.126 0.147 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -184139 sc-eQTL 6.44e-01 0.0565 0.122 0.147 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -235249 sc-eQTL 1.96e-01 0.0777 0.0599 0.147 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -234019 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0486 0.126 0.147 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 66122 sc-eQTL 1.40e-01 -0.185 0.125 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 951078 sc-eQTL 5.66e-01 0.0761 0.132 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -184139 sc-eQTL 7.43e-01 0.0418 0.127 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -235249 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0802 0.0707 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 66122 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00289 0.101 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 951078 sc-eQTL 8.75e-01 0.0162 0.103 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -184139 sc-eQTL 2.49e-01 0.145 0.125 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -235249 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0235 0.0499 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 66122 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00292 0.122 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 951078 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0336 0.124 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -184139 sc-eQTL 4.89e-01 0.0857 0.124 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -235249 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0286 0.0577 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 66122 sc-eQTL 6.03e-02 -0.207 0.109 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 951078 sc-eQTL 6.66e-01 0.0493 0.114 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -184139 sc-eQTL 3.55e-01 -0.115 0.124 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -235249 sc-eQTL 8.01e-01 0.017 0.0673 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 177845 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0603 0.131 0.144 PB L2
ENSG00000079950 STX7 66122 sc-eQTL 9.64e-01 0.00498 0.109 0.144 PB L2
ENSG00000112282 MED23 951078 sc-eQTL 1.13e-01 0.235 0.147 0.144 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -184139 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0832 0.134 0.144 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -235249 sc-eQTL 4.52e-01 0.0572 0.0757 0.144 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -234019 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0288 0.142 0.144 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 447432 sc-eQTL 1.04e-01 -0.151 0.0925 0.144 PB L2
ENSG00000079950 STX7 66122 sc-eQTL 2.14e-01 0.14 0.112 0.15 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 951078 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0168 0.127 0.15 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -184139 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0661 0.121 0.15 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -235249 sc-eQTL 7.43e-01 0.015 0.0457 0.15 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -234019 sc-eQTL 6.98e-01 -0.046 0.118 0.15 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 66122 sc-eQTL 1.31e-01 0.185 0.122 0.15 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 951078 sc-eQTL 8.05e-01 0.0311 0.126 0.15 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -184139 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0395 0.103 0.15 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -235249 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0272 0.0456 0.15 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -234019 sc-eQTL 1.71e-01 0.176 0.128 0.15 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 66122 sc-eQTL 7.83e-01 0.0292 0.106 0.156 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -155445 sc-eQTL 7.04e-01 0.0399 0.105 0.156 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 951078 sc-eQTL 4.70e-01 0.0987 0.136 0.156 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -134735 sc-eQTL 1.22e-01 -0.191 0.123 0.156 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -184139 sc-eQTL 4.41e-01 0.0929 0.12 0.156 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -235249 sc-eQTL 3.43e-01 0.0563 0.0593 0.156 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -234019 sc-eQTL 4.65e-01 0.086 0.118 0.156 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -523808 sc-eQTL 2.18e-01 0.116 0.0937 0.156 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 66122 sc-eQTL 5.35e-01 0.05 0.0804 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -155445 sc-eQTL 2.89e-01 -0.121 0.113 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 951078 sc-eQTL 8.32e-01 0.0239 0.112 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -134735 sc-eQTL 5.98e-02 -0.215 0.114 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -184139 sc-eQTL 6.85e-01 0.0373 0.0917 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -235249 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0483 0.0508 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -234019 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0779 0.0981 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 66122 sc-eQTL 1.25e-01 0.133 0.0861 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -155445 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0908 0.108 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 951078 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0685 0.117 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -134735 sc-eQTL 1.73e-01 -0.16 0.117 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -184139 sc-eQTL 9.45e-01 0.00535 0.0769 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -235249 sc-eQTL 7.63e-01 0.0167 0.0554 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -234019 sc-eQTL 2.95e-01 0.107 0.102 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 66122 sc-eQTL 3.29e-01 0.149 0.152 0.142 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 951078 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0467 0.164 0.142 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -184139 sc-eQTL 9.93e-01 0.00156 0.169 0.142 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -235249 sc-eQTL 4.28e-02 0.129 0.0633 0.142 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -234019 sc-eQTL 1.40e-01 0.245 0.165 0.142 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 66122 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0862 0.116 0.149 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -155445 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0525 0.117 0.149 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 951078 sc-eQTL 8.77e-01 0.02 0.129 0.149 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -134735 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0577 0.116 0.149 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -184139 sc-eQTL 4.50e-01 0.0889 0.117 0.149 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -235249 sc-eQTL 9.75e-01 -0.0016 0.0512 0.149 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -234019 sc-eQTL 3.00e-01 0.129 0.124 0.149 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 66122 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00376 0.0858 0.149 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -155445 sc-eQTL 9.48e-01 0.00785 0.121 0.149 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 951078 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0729 0.123 0.149 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -134735 sc-eQTL 1.32e-02 -0.296 0.118 0.149 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -184139 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0314 0.116 0.149 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -235249 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0283 0.0579 0.149 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -234019 sc-eQTL 9.22e-01 0.01 0.102 0.149 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 66122 sc-eQTL 6.38e-01 0.047 0.0998 0.153 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -155445 sc-eQTL 5.38e-01 0.062 0.1 0.153 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 951078 sc-eQTL 3.71e-01 -0.125 0.14 0.153 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -134735 sc-eQTL 5.72e-01 0.0578 0.102 0.153 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -184139 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0229 0.122 0.153 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -235249 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0208 0.0838 0.153 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -234019 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0264 0.124 0.153 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -523808 sc-eQTL 1.13e-01 0.188 0.118 0.153 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 177845 sc-eQTL 3.92e-01 -0.106 0.124 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 66122 sc-eQTL 6.49e-01 0.032 0.0704 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 951078 sc-eQTL 3.24e-01 -0.106 0.107 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -184139 sc-eQTL 4.43e-01 0.0855 0.111 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -235249 sc-eQTL 8.76e-01 0.00988 0.0634 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -234019 sc-eQTL 3.72e-01 0.104 0.116 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 447432 sc-eQTL 3.52e-01 -0.105 0.112 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 177845 sc-eQTL 1.90e-01 -0.173 0.132 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 66122 sc-eQTL 1.01e-01 0.0888 0.0539 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 951078 sc-eQTL 9.48e-01 0.00666 0.102 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -184139 sc-eQTL 1.20e-01 0.164 0.105 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -235249 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0537 0.0636 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -234019 sc-eQTL 1.82e-01 0.16 0.12 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 447432 sc-eQTL 7.11e-02 0.138 0.0758 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 66122 sc-eQTL 1.42e-01 0.0986 0.0669 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -155445 sc-eQTL 2.03e-01 -0.139 0.109 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 951078 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000506 0.105 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -134735 sc-eQTL 9.51e-02 -0.191 0.114 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -184139 sc-eQTL 8.81e-01 0.0113 0.0756 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -235249 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0373 0.0518 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -234019 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00103 0.0923 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 66122 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0675 0.0808 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -155445 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0844 0.119 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 951078 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0286 0.116 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -134735 sc-eQTL 3.72e-02 -0.245 0.117 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -184139 sc-eQTL 9.19e-01 0.0114 0.111 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -235249 sc-eQTL 9.36e-01 0.00377 0.0472 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -234019 sc-eQTL 8.17e-01 0.0266 0.115 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 66122 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0438 0.0951 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 951078 sc-eQTL 9.99e-01 -0.00013 0.0924 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -184139 sc-eQTL 4.62e-01 0.0886 0.12 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -235249 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0311 0.0491 0.149 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 66122 pQTL 0.0453 0.0623 0.0311 0.0 0.0 0.153
ENSG00000112299 VNN1 -134735 pQTL 0.000831 -0.161 0.0479 0.0 0.0 0.153
ENSG00000112299 VNN1 -134735 eQTL 0.0243 -0.0669 0.0296 0.0 0.0 0.15
ENSG00000234484 AL032821.1 -173355 eQTL 0.0203 -0.0987 0.0424 0.0 0.0 0.15

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina