logo

Genes within 1Mb (chr6:132575748:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 174273 sc-eQTL 2.92e-02 0.268 0.122 0.143 B L1
ENSG00000079950 STX7 62550 sc-eQTL 6.35e-01 0.0221 0.0466 0.143 B L1
ENSG00000112282 MED23 947506 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00526 0.0929 0.143 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -187711 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0683 0.0875 0.143 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -238821 sc-eQTL 1.14e-01 0.0835 0.0526 0.143 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -237591 sc-eQTL 1.57e-02 -0.268 0.11 0.143 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 443860 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0155 0.0731 0.143 B L1
ENSG00000079950 STX7 62550 sc-eQTL 7.24e-01 0.0325 0.0919 0.143 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 947506 sc-eQTL 2.24e-01 -0.0887 0.0727 0.143 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -187711 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000885 0.0796 0.143 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -238821 sc-eQTL 9.94e-01 0.000407 0.0541 0.143 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -237591 sc-eQTL 2.00e-01 -0.14 0.109 0.143 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 62550 sc-eQTL 1.40e-01 0.131 0.0883 0.143 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 947506 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0204 0.0874 0.143 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -187711 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0699 0.104 0.143 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -238821 sc-eQTL 9.58e-01 0.00189 0.0354 0.143 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -237591 sc-eQTL 3.16e-01 -0.107 0.107 0.143 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 62550 sc-eQTL 7.52e-01 0.0255 0.0806 0.144 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -159017 sc-eQTL 3.46e-01 0.0943 0.0998 0.144 DC L1
ENSG00000112282 MED23 947506 sc-eQTL 4.03e-01 0.0981 0.117 0.144 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -138307 sc-eQTL 1.95e-01 0.14 0.108 0.144 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -187711 sc-eQTL 2.98e-01 -0.12 0.115 0.144 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -238821 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0558 0.0646 0.144 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -237591 sc-eQTL 6.03e-01 0.0534 0.102 0.144 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -527380 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00442 0.0933 0.144 DC L1
ENSG00000079950 STX7 62550 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0122 0.0608 0.143 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -159017 sc-eQTL 5.98e-01 0.0551 0.104 0.143 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 947506 sc-eQTL 2.09e-01 0.124 0.0988 0.143 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -138307 sc-eQTL 2.39e-02 -0.253 0.111 0.143 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -187711 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0178 0.0793 0.143 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -238821 sc-eQTL 5.21e-01 0.0305 0.0475 0.143 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -237591 sc-eQTL 1.36e-01 -0.14 0.0935 0.143 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 62550 sc-eQTL 4.87e-01 0.0642 0.0922 0.144 NK L1
ENSG00000112282 MED23 947506 sc-eQTL 1.47e-01 -0.122 0.084 0.144 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -187711 sc-eQTL 4.09e-01 -0.095 0.115 0.144 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -238821 sc-eQTL 5.09e-01 0.0314 0.0475 0.144 NK L1
ENSG00000079950 STX7 62550 sc-eQTL 1.33e-01 -0.137 0.091 0.143 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 947506 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0335 0.114 0.143 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -187711 sc-eQTL 3.20e-02 -0.236 0.109 0.143 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -238821 sc-eQTL 6.37e-01 0.0208 0.0439 0.143 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -237591 sc-eQTL 3.76e-01 -0.106 0.12 0.143 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 174273 sc-eQTL 5.85e-01 0.0679 0.124 0.14 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 62550 sc-eQTL 7.86e-01 0.0316 0.117 0.14 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 947506 sc-eQTL 3.67e-01 -0.117 0.129 0.14 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -187711 sc-eQTL 9.03e-01 0.0151 0.124 0.14 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -238821 sc-eQTL 9.05e-01 0.00794 0.0665 0.14 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -237591 sc-eQTL 2.96e-01 -0.122 0.116 0.14 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 443860 sc-eQTL 9.62e-01 0.00529 0.111 0.14 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 174273 sc-eQTL 4.66e-02 0.228 0.114 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 62550 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00703 0.0753 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 947506 sc-eQTL 1.72e-01 0.156 0.114 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -187711 sc-eQTL 1.10e-01 0.181 0.113 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -238821 sc-eQTL 2.30e-01 0.0833 0.0692 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -237591 sc-eQTL 1.72e-01 -0.171 0.125 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 443860 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0514 0.106 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 174273 sc-eQTL 1.75e-01 -0.159 0.117 0.144 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 62550 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00081 0.0919 0.144 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 947506 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0461 0.118 0.144 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -187711 sc-eQTL 1.47e-01 -0.174 0.12 0.144 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -238821 sc-eQTL 1.96e-01 0.0748 0.0577 0.144 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -237591 sc-eQTL 2.61e-01 -0.136 0.121 0.144 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 443860 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0592 0.113 0.144 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 174273 sc-eQTL 5.63e-02 0.245 0.128 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 62550 sc-eQTL 5.74e-01 0.0317 0.0563 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 947506 sc-eQTL 1.89e-01 -0.132 0.1 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -187711 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0531 0.109 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -238821 sc-eQTL 6.88e-01 0.0251 0.0622 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -237591 sc-eQTL 1.69e-02 -0.285 0.119 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 443860 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0263 0.0796 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 174273 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0463 0.121 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 62550 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0467 0.0661 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 947506 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0612 0.122 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -187711 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00783 0.122 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -238821 sc-eQTL 3.58e-01 0.0592 0.0642 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -237591 sc-eQTL 3.29e-01 -0.12 0.122 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 443860 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0993 0.0848 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 62550 sc-eQTL 3.25e-01 0.119 0.121 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 947506 sc-eQTL 9.87e-02 -0.208 0.125 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -187711 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0605 0.122 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -238821 sc-eQTL 3.07e-01 0.0577 0.0563 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -237591 sc-eQTL 1.75e-01 0.154 0.113 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 62550 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0572 0.0969 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 947506 sc-eQTL 7.06e-01 0.0313 0.0828 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -187711 sc-eQTL 7.13e-01 0.0331 0.0898 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -238821 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0124 0.0583 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -237591 sc-eQTL 4.43e-01 -0.086 0.112 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 62550 sc-eQTL 6.47e-01 0.0494 0.108 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 947506 sc-eQTL 2.48e-01 -0.105 0.0903 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -187711 sc-eQTL 2.64e-01 -0.119 0.106 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -238821 sc-eQTL 7.16e-01 0.02 0.0551 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -237591 sc-eQTL 8.86e-02 -0.217 0.127 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 62550 sc-eQTL 1.67e-02 0.301 0.125 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 947506 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0465 0.116 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -187711 sc-eQTL 1.53e-01 0.173 0.121 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -238821 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0296 0.0497 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -237591 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0149 0.124 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 62550 sc-eQTL 2.10e-01 0.127 0.101 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 947506 sc-eQTL 7.71e-01 0.0301 0.104 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -187711 sc-eQTL 1.43e-01 -0.168 0.114 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -238821 sc-eQTL 4.83e-01 0.0431 0.0614 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -237591 sc-eQTL 1.81e-01 -0.159 0.119 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 62550 sc-eQTL 4.43e-01 0.0939 0.122 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 947506 sc-eQTL 5.10e-01 0.0648 0.0982 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -187711 sc-eQTL 5.49e-01 0.0632 0.105 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -238821 sc-eQTL 5.69e-02 -0.115 0.0598 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -237591 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0934 0.121 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 62550 sc-eQTL 4.03e-01 0.103 0.123 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 947506 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0488 0.123 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -187711 sc-eQTL 5.78e-01 0.0679 0.122 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -238821 sc-eQTL 8.86e-02 -0.101 0.0591 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -237591 sc-eQTL 2.19e-01 -0.16 0.13 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 62550 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00154 0.126 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 947506 sc-eQTL 2.51e-01 -0.139 0.121 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -187711 sc-eQTL 6.91e-02 -0.227 0.124 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -238821 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0119 0.0674 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -237591 sc-eQTL 3.07e-01 0.13 0.127 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 62550 sc-eQTL 9.04e-01 0.014 0.116 0.145 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 947506 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0728 0.121 0.145 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -187711 sc-eQTL 1.90e-01 -0.154 0.117 0.145 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -238821 sc-eQTL 1.87e-01 -0.0763 0.0577 0.145 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -237591 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00927 0.121 0.145 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 62550 sc-eQTL 8.57e-01 0.0219 0.122 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 947506 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00316 0.129 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -187711 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0262 0.123 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -238821 sc-eQTL 4.73e-01 0.0494 0.0687 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 62550 sc-eQTL 6.47e-01 0.0453 0.0987 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 947506 sc-eQTL 5.29e-01 -0.064 0.101 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -187711 sc-eQTL 7.78e-02 -0.217 0.123 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -238821 sc-eQTL 6.48e-01 0.0224 0.049 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 62550 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0672 0.118 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 947506 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0596 0.12 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -187711 sc-eQTL 9.94e-01 0.00088 0.12 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -238821 sc-eQTL 2.66e-01 0.0621 0.0557 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 62550 sc-eQTL 4.23e-02 0.215 0.105 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 947506 sc-eQTL 3.94e-03 -0.315 0.108 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -187711 sc-eQTL 4.14e-01 0.0978 0.119 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -238821 sc-eQTL 9.23e-01 0.00631 0.0649 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 174273 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0108 0.141 0.133 PB L2
ENSG00000079950 STX7 62550 sc-eQTL 3.95e-01 0.1 0.118 0.133 PB L2
ENSG00000112282 MED23 947506 sc-eQTL 5.85e-01 0.0878 0.16 0.133 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -187711 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0484 0.144 0.133 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -238821 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0255 0.0818 0.133 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -237591 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0896 0.153 0.133 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 443860 sc-eQTL 1.71e-01 -0.138 0.1 0.133 PB L2
ENSG00000079950 STX7 62550 sc-eQTL 1.56e-01 -0.157 0.111 0.143 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 947506 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0813 0.125 0.143 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -187711 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0344 0.119 0.143 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -238821 sc-eQTL 4.86e-01 0.0315 0.0451 0.143 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -237591 sc-eQTL 2.43e-01 -0.136 0.116 0.143 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 62550 sc-eQTL 6.16e-01 0.0593 0.118 0.143 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 947506 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0805 0.121 0.143 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -187711 sc-eQTL 7.09e-01 0.0371 0.0994 0.143 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -238821 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00357 0.044 0.143 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -237591 sc-eQTL 4.00e-01 0.105 0.124 0.143 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 62550 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0726 0.103 0.141 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -159017 sc-eQTL 3.17e-01 0.103 0.102 0.141 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 947506 sc-eQTL 2.77e-01 -0.145 0.133 0.141 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -138307 sc-eQTL 3.78e-02 0.25 0.119 0.141 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -187711 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0658 0.118 0.141 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -238821 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0135 0.0581 0.141 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -237591 sc-eQTL 3.81e-01 0.101 0.115 0.141 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -527380 sc-eQTL 8.33e-01 0.0194 0.092 0.141 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 62550 sc-eQTL 5.40e-01 0.0482 0.0784 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -159017 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00779 0.111 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 947506 sc-eQTL 9.29e-01 0.00977 0.11 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -138307 sc-eQTL 5.50e-02 -0.214 0.111 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -187711 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0393 0.0895 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -238821 sc-eQTL 8.96e-01 0.0065 0.0497 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -237591 sc-eQTL 1.32e-01 -0.144 0.0954 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 62550 sc-eQTL 8.34e-02 -0.146 0.0841 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -159017 sc-eQTL 4.79e-01 0.075 0.106 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 947506 sc-eQTL 2.85e-01 0.123 0.115 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -138307 sc-eQTL 5.02e-03 -0.32 0.113 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -187711 sc-eQTL 8.17e-01 0.0174 0.0752 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -238821 sc-eQTL 8.93e-01 0.00729 0.0542 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -237591 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0116 0.1 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 62550 sc-eQTL 1.91e-01 -0.174 0.132 0.145 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 947506 sc-eQTL 5.45e-01 0.0866 0.143 0.145 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -187711 sc-eQTL 2.83e-01 -0.158 0.147 0.145 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -238821 sc-eQTL 9.98e-01 0.000148 0.0562 0.145 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -237591 sc-eQTL 4.74e-01 -0.104 0.145 0.145 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 62550 sc-eQTL 2.17e-01 0.14 0.114 0.144 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -159017 sc-eQTL 1.89e-01 -0.151 0.115 0.144 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 947506 sc-eQTL 5.93e-01 0.0676 0.126 0.144 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -138307 sc-eQTL 1.50e-01 -0.164 0.113 0.144 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -187711 sc-eQTL 2.33e-01 -0.138 0.115 0.144 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -238821 sc-eQTL 2.28e-01 -0.0606 0.0501 0.144 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -237591 sc-eQTL 3.03e-01 -0.126 0.122 0.144 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 62550 sc-eQTL 9.63e-01 0.0039 0.0838 0.147 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -159017 sc-eQTL 4.08e-01 0.0978 0.118 0.147 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 947506 sc-eQTL 9.91e-01 0.0013 0.12 0.147 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -138307 sc-eQTL 9.71e-02 -0.194 0.117 0.147 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -187711 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0202 0.113 0.147 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -238821 sc-eQTL 3.17e-02 -0.121 0.056 0.147 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -237591 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0231 0.1 0.147 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 62550 sc-eQTL 5.39e-01 0.0596 0.0967 0.144 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -159017 sc-eQTL 5.04e-01 0.0651 0.0973 0.144 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 947506 sc-eQTL 1.57e-01 0.192 0.135 0.144 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -138307 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0948 0.0989 0.144 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -187711 sc-eQTL 6.54e-01 0.0529 0.118 0.144 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -238821 sc-eQTL 2.74e-01 -0.089 0.081 0.144 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -237591 sc-eQTL 4.11e-01 0.099 0.12 0.144 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -527380 sc-eQTL 4.15e-01 0.094 0.115 0.144 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 174273 sc-eQTL 1.07e-01 0.197 0.122 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 62550 sc-eQTL 8.25e-01 0.0153 0.0693 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 947506 sc-eQTL 3.98e-01 0.0897 0.106 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -187711 sc-eQTL 7.33e-01 0.0374 0.11 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -238821 sc-eQTL 9.80e-02 0.103 0.0621 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -237591 sc-eQTL 3.63e-01 -0.104 0.114 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 443860 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0947 0.11 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 174273 sc-eQTL 1.71e-01 0.175 0.128 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 62550 sc-eQTL 8.41e-01 0.0106 0.0527 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 947506 sc-eQTL 2.37e-01 -0.117 0.0986 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -187711 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0489 0.102 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -238821 sc-eQTL 2.72e-01 0.068 0.0617 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -237591 sc-eQTL 1.22e-02 -0.291 0.115 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 443860 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0563 0.0741 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 62550 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0346 0.0657 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -159017 sc-eQTL 8.06e-01 0.0263 0.107 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 947506 sc-eQTL 4.10e-01 0.0848 0.103 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -138307 sc-eQTL 1.34e-02 -0.275 0.11 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -187711 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0181 0.0739 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -238821 sc-eQTL 7.80e-01 0.0142 0.0506 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -237591 sc-eQTL 1.71e-01 -0.123 0.0897 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 62550 sc-eQTL 3.45e-01 0.075 0.0792 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -159017 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0323 0.117 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 947506 sc-eQTL 2.74e-01 0.124 0.113 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -138307 sc-eQTL 7.50e-02 -0.206 0.115 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -187711 sc-eQTL 3.23e-01 -0.108 0.109 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -238821 sc-eQTL 6.81e-01 -0.019 0.0463 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -237591 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0591 0.112 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 62550 sc-eQTL 2.91e-01 0.0979 0.0926 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 947506 sc-eQTL 9.05e-02 -0.152 0.0895 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -187711 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0885 0.117 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -238821 sc-eQTL 7.66e-01 0.0143 0.0479 0.144 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 -138307 eQTL 0.000229 -0.111 0.03 0.0 0.0 0.139

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112299 VNN1 -138307 3.91e-06 3.5e-06 7.57e-07 1.91e-06 1.12e-06 8.44e-07 2.48e-06 9.28e-07 2.75e-06 1.67e-06 3.27e-06 2.2e-06 5.3e-06 1.2e-06 1.07e-06 2.3e-06 1.72e-06 2.38e-06 1.44e-06 9.54e-07 1.98e-06 3.58e-06 3.21e-06 1.71e-06 4.51e-06 1.3e-06 1.82e-06 1.45e-06 3.82e-06 3.21e-06 1.99e-06 6.26e-07 8.13e-07 1.82e-06 1.75e-06 8.53e-07 9.66e-07 4.89e-07 1.27e-06 3.63e-07 5.18e-07 3.99e-06 4.6e-07 1.78e-07 4.54e-07 3.21e-07 7.59e-07 2.72e-07 3.41e-07
ENSG00000154269 \N 947306 2.74e-07 1.25e-07 4.91e-08 1.84e-07 9.24e-08 9.8e-08 1.49e-07 5.43e-08 1.45e-07 4.94e-08 1.57e-07 8.68e-08 1.45e-07 6.76e-08 6.02e-08 7.36e-08 3.93e-08 1.27e-07 5.75e-08 4.16e-08 1.19e-07 1.27e-07 1.39e-07 2.95e-08 1.4e-07 1.21e-07 1.07e-07 9.65e-08 1.12e-07 1.03e-07 9.7e-08 3.64e-08 3.56e-08 8.25e-08 7.51e-08 3.62e-08 5.11e-08 9.36e-08 6.54e-08 3.71e-08 5.13e-08 1.33e-07 5.21e-08 1.86e-08 4.7e-08 1.84e-08 1.22e-07 3.8e-09 4.88e-08