logo

Genes within 1Mb (chr6:132575308:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 173833 sc-eQTL 3.51e-02 0.255 0.12 0.152 B L1
ENSG00000079950 STX7 62110 sc-eQTL 6.48e-01 0.021 0.0458 0.152 B L1
ENSG00000112282 MED23 947066 sc-eQTL 6.49e-01 0.0416 0.0913 0.152 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -188151 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0682 0.086 0.152 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -239261 sc-eQTL 7.25e-02 0.0932 0.0517 0.152 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -238031 sc-eQTL 1.16e-02 -0.275 0.108 0.152 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 443420 sc-eQTL 8.46e-01 -0.014 0.0719 0.152 B L1
ENSG00000079950 STX7 62110 sc-eQTL 7.23e-01 0.0321 0.0906 0.152 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 947066 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0479 0.0718 0.152 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -188151 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00528 0.0785 0.152 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -239261 sc-eQTL 6.40e-01 0.025 0.0533 0.152 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -238031 sc-eQTL 1.83e-01 -0.144 0.107 0.152 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 62110 sc-eQTL 1.41e-01 0.13 0.0876 0.152 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 947066 sc-eQTL 8.72e-01 -0.014 0.0868 0.152 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -188151 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0651 0.103 0.152 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -239261 sc-eQTL 6.12e-01 0.0178 0.0351 0.152 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -238031 sc-eQTL 2.91e-01 -0.112 0.106 0.152 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 62110 sc-eQTL 9.52e-01 0.00481 0.0801 0.151 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -159457 sc-eQTL 5.39e-01 0.0611 0.0992 0.151 DC L1
ENSG00000112282 MED23 947066 sc-eQTL 5.18e-01 0.0754 0.116 0.151 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -138747 sc-eQTL 1.65e-01 0.148 0.107 0.151 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -188151 sc-eQTL 3.67e-01 -0.103 0.114 0.151 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -239261 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0641 0.0641 0.151 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -238031 sc-eQTL 3.50e-01 0.0951 0.102 0.151 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -527820 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0348 0.0926 0.151 DC L1
ENSG00000079950 STX7 62110 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0315 0.0601 0.152 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -159457 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00378 0.103 0.152 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 947066 sc-eQTL 2.43e-01 0.114 0.0977 0.152 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -138747 sc-eQTL 1.15e-02 -0.279 0.109 0.152 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -188151 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00668 0.0784 0.152 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -239261 sc-eQTL 5.63e-01 0.0272 0.0469 0.152 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -238031 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0933 0.0927 0.152 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 62110 sc-eQTL 5.00e-01 0.0614 0.0909 0.152 NK L1
ENSG00000112282 MED23 947066 sc-eQTL 1.85e-01 -0.11 0.0829 0.152 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -188151 sc-eQTL 3.77e-01 -0.1 0.113 0.152 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -239261 sc-eQTL 2.64e-01 0.0524 0.0467 0.152 NK L1
ENSG00000079950 STX7 62110 sc-eQTL 3.24e-02 -0.193 0.0898 0.152 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 947066 sc-eQTL 8.46e-01 -0.022 0.113 0.152 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -188151 sc-eQTL 1.89e-02 -0.256 0.108 0.152 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -239261 sc-eQTL 5.14e-01 0.0285 0.0435 0.152 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -238031 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0778 0.119 0.152 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 173833 sc-eQTL 5.45e-01 0.0742 0.122 0.151 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 62110 sc-eQTL 7.78e-01 0.0324 0.115 0.151 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 947066 sc-eQTL 2.79e-01 -0.138 0.127 0.151 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -188151 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00528 0.122 0.151 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -239261 sc-eQTL 9.91e-01 0.000744 0.0655 0.151 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -238031 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0802 0.115 0.151 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 443420 sc-eQTL 9.85e-01 0.00201 0.109 0.151 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 173833 sc-eQTL 4.37e-02 0.228 0.112 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 62110 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0114 0.0743 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 947066 sc-eQTL 6.01e-02 0.212 0.112 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -188151 sc-eQTL 2.46e-01 0.13 0.112 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -239261 sc-eQTL 2.04e-01 0.0869 0.0682 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -238031 sc-eQTL 1.76e-01 -0.167 0.123 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 443420 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0445 0.105 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 173833 sc-eQTL 1.46e-01 -0.167 0.115 0.153 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 62110 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0322 0.0904 0.153 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 947066 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0832 0.116 0.153 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -188151 sc-eQTL 8.18e-02 -0.205 0.117 0.153 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -239261 sc-eQTL 1.48e-01 0.0824 0.0567 0.153 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -238031 sc-eQTL 2.39e-01 -0.14 0.119 0.153 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 443420 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0489 0.111 0.153 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 173833 sc-eQTL 9.03e-02 0.214 0.126 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 62110 sc-eQTL 7.31e-01 0.0191 0.0554 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 947066 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0692 0.0992 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -188151 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0235 0.108 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -239261 sc-eQTL 3.90e-01 0.0527 0.0612 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -238031 sc-eQTL 9.32e-03 -0.306 0.116 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 443420 sc-eQTL 9.62e-01 -0.0037 0.0783 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 173833 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0752 0.12 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 62110 sc-eQTL 3.61e-01 -0.06 0.0656 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 947066 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0214 0.121 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -188151 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00855 0.121 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -239261 sc-eQTL 2.03e-01 0.0812 0.0636 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -238031 sc-eQTL 3.30e-01 -0.119 0.122 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 443420 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0989 0.0842 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 62110 sc-eQTL 3.90e-01 0.103 0.12 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 947066 sc-eQTL 2.64e-01 -0.139 0.124 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -188151 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0865 0.121 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -239261 sc-eQTL 2.33e-01 0.0667 0.0557 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -238031 sc-eQTL 2.12e-01 0.141 0.112 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 62110 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0838 0.0956 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 947066 sc-eQTL 5.59e-01 0.0478 0.0817 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -188151 sc-eQTL 7.65e-01 0.0265 0.0887 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -239261 sc-eQTL 8.57e-01 0.0104 0.0576 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -238031 sc-eQTL 3.63e-01 -0.101 0.111 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 62110 sc-eQTL 5.01e-01 0.0714 0.106 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 947066 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0778 0.0891 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -188151 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0779 0.104 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -239261 sc-eQTL 3.69e-01 0.0487 0.0541 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -238031 sc-eQTL 9.14e-02 -0.211 0.125 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 62110 sc-eQTL 1.01e-02 0.318 0.123 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 947066 sc-eQTL 9.47e-01 -0.0077 0.115 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -188151 sc-eQTL 2.00e-01 0.153 0.119 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -239261 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00506 0.0491 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -238031 sc-eQTL 8.83e-01 -0.018 0.122 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 62110 sc-eQTL 2.25e-01 0.122 0.0998 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 947066 sc-eQTL 5.61e-01 0.0597 0.103 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -188151 sc-eQTL 1.36e-01 -0.17 0.113 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -239261 sc-eQTL 2.51e-01 0.0699 0.0607 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -238031 sc-eQTL 1.66e-01 -0.163 0.117 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 62110 sc-eQTL 3.82e-01 0.106 0.121 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 947066 sc-eQTL 6.12e-01 0.0493 0.0971 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -188151 sc-eQTL 7.69e-01 0.0306 0.104 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -239261 sc-eQTL 9.49e-02 -0.0994 0.0593 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -238031 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0754 0.12 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 62110 sc-eQTL 4.90e-01 0.0835 0.121 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 947066 sc-eQTL 7.54e-01 -0.038 0.121 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -188151 sc-eQTL 3.70e-01 0.108 0.12 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -239261 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0604 0.0583 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -238031 sc-eQTL 9.51e-02 -0.214 0.127 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 62110 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0558 0.124 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 947066 sc-eQTL 3.34e-01 -0.115 0.119 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -188151 sc-eQTL 1.07e-01 -0.199 0.123 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -239261 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0116 0.0664 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -238031 sc-eQTL 3.85e-01 0.109 0.125 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 62110 sc-eQTL 9.09e-01 0.0131 0.114 0.154 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 947066 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0262 0.119 0.154 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -188151 sc-eQTL 1.00e-01 -0.19 0.115 0.154 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -239261 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0629 0.0569 0.154 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -238031 sc-eQTL 8.79e-01 0.0182 0.12 0.154 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 62110 sc-eQTL 5.37e-01 0.0738 0.119 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 947066 sc-eQTL 7.36e-01 0.0427 0.126 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -188151 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0282 0.121 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -239261 sc-eQTL 1.58e-01 0.0955 0.0673 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 62110 sc-eQTL 6.90e-01 0.0389 0.0975 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 947066 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0776 0.1 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -188151 sc-eQTL 5.43e-02 -0.234 0.121 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -239261 sc-eQTL 4.88e-01 0.0336 0.0484 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 62110 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0364 0.118 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 947066 sc-eQTL 8.27e-01 0.0259 0.119 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -188151 sc-eQTL 7.53e-01 0.0375 0.119 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -239261 sc-eQTL 2.12e-01 0.0691 0.0552 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 62110 sc-eQTL 4.90e-02 0.206 0.104 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 947066 sc-eQTL 7.54e-03 -0.288 0.107 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -188151 sc-eQTL 3.65e-01 0.107 0.118 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -239261 sc-eQTL 6.98e-01 0.0249 0.0641 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 173833 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000667 0.142 0.148 PB L2
ENSG00000079950 STX7 62110 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0306 0.118 0.148 PB L2
ENSG00000112282 MED23 947066 sc-eQTL 7.88e-01 0.0434 0.161 0.148 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -188151 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0761 0.144 0.148 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -239261 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0145 0.082 0.148 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -238031 sc-eQTL 4.67e-01 -0.112 0.153 0.148 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 443420 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0944 0.101 0.148 PB L2
ENSG00000079950 STX7 62110 sc-eQTL 6.12e-02 -0.205 0.109 0.152 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 947066 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0581 0.124 0.152 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -188151 sc-eQTL 8.25e-01 -0.026 0.118 0.152 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -239261 sc-eQTL 2.88e-01 0.0474 0.0444 0.152 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -238031 sc-eQTL 4.10e-01 -0.095 0.115 0.152 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 62110 sc-eQTL 5.13e-01 0.0763 0.116 0.152 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 947066 sc-eQTL 8.02e-01 -0.03 0.12 0.152 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -188151 sc-eQTL 5.52e-01 0.0583 0.0979 0.152 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -239261 sc-eQTL 8.00e-01 0.011 0.0433 0.152 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -238031 sc-eQTL 4.24e-01 0.0978 0.122 0.152 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 62110 sc-eQTL 3.03e-01 -0.105 0.102 0.149 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -159457 sc-eQTL 4.59e-01 0.0751 0.101 0.149 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 947066 sc-eQTL 2.27e-01 -0.159 0.131 0.149 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -138747 sc-eQTL 2.39e-02 0.268 0.117 0.149 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -188151 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0449 0.116 0.149 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -239261 sc-eQTL 8.75e-01 -0.00904 0.0573 0.149 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -238031 sc-eQTL 1.45e-01 0.165 0.113 0.149 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -527820 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0118 0.0907 0.149 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 62110 sc-eQTL 4.50e-01 0.0586 0.0775 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -159457 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0907 0.109 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 947066 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0257 0.108 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -138747 sc-eQTL 1.81e-02 -0.26 0.109 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -188151 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0428 0.0884 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -239261 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00216 0.0491 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -238031 sc-eQTL 1.52e-01 -0.136 0.0943 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 62110 sc-eQTL 1.34e-02 -0.206 0.0826 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -159457 sc-eQTL 6.06e-01 0.0541 0.105 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 947066 sc-eQTL 1.65e-01 0.157 0.113 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -138747 sc-eQTL 3.41e-03 -0.33 0.111 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -188151 sc-eQTL 7.92e-01 0.0197 0.0744 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -239261 sc-eQTL 9.44e-01 0.00374 0.0536 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -238031 sc-eQTL 5.61e-01 0.0578 0.0991 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 62110 sc-eQTL 1.75e-01 -0.182 0.133 0.148 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 947066 sc-eQTL 5.50e-01 0.0862 0.144 0.148 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -188151 sc-eQTL 2.85e-01 -0.159 0.148 0.148 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -239261 sc-eQTL 9.18e-01 0.00581 0.0566 0.148 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -238031 sc-eQTL 4.55e-01 -0.109 0.146 0.148 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 62110 sc-eQTL 2.53e-01 0.129 0.113 0.151 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -159457 sc-eQTL 3.13e-01 -0.115 0.114 0.151 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 947066 sc-eQTL 5.35e-01 0.0779 0.125 0.151 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -138747 sc-eQTL 1.33e-01 -0.169 0.112 0.151 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -188151 sc-eQTL 2.30e-01 -0.137 0.114 0.151 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -239261 sc-eQTL 2.10e-01 -0.0625 0.0497 0.151 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -238031 sc-eQTL 3.77e-01 -0.107 0.121 0.151 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 62110 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00284 0.0831 0.154 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -159457 sc-eQTL 3.52e-01 0.109 0.117 0.154 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 947066 sc-eQTL 8.90e-01 0.0165 0.119 0.154 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -138747 sc-eQTL 4.07e-02 -0.237 0.115 0.154 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -188151 sc-eQTL 7.53e-01 0.0353 0.112 0.154 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -239261 sc-eQTL 4.16e-02 -0.114 0.0556 0.154 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -238031 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0239 0.0991 0.154 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 62110 sc-eQTL 5.52e-01 0.0576 0.0966 0.147 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -159457 sc-eQTL 4.35e-01 0.076 0.0971 0.147 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 947066 sc-eQTL 2.03e-01 0.173 0.135 0.147 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -138747 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0938 0.0987 0.147 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -188151 sc-eQTL 5.55e-01 0.0697 0.118 0.147 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -239261 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0969 0.0808 0.147 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -238031 sc-eQTL 4.78e-01 0.0854 0.12 0.147 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -527820 sc-eQTL 5.35e-01 0.0715 0.115 0.147 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 173833 sc-eQTL 1.02e-01 0.197 0.12 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 62110 sc-eQTL 7.58e-01 0.0212 0.0685 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 947066 sc-eQTL 2.29e-01 0.126 0.104 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -188151 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0297 0.108 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -239261 sc-eQTL 1.36e-01 0.0919 0.0614 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -238031 sc-eQTL 3.35e-01 -0.109 0.113 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 443420 sc-eQTL 3.28e-01 -0.107 0.109 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 173833 sc-eQTL 3.00e-01 0.131 0.126 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 62110 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000247 0.0518 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 947066 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0492 0.0972 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -188151 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0426 0.101 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -239261 sc-eQTL 1.18e-01 0.095 0.0605 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -238031 sc-eQTL 7.26e-03 -0.306 0.113 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 443420 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0467 0.0728 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 62110 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0578 0.0648 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -159457 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0386 0.106 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 947066 sc-eQTL 4.84e-01 0.0712 0.102 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -138747 sc-eQTL 6.12e-03 -0.3 0.108 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -188151 sc-eQTL 8.96e-01 -0.00953 0.073 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -239261 sc-eQTL 8.02e-01 0.0126 0.05 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -238031 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0854 0.0889 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 62110 sc-eQTL 4.25e-01 0.0629 0.0786 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -159457 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0172 0.116 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 947066 sc-eQTL 2.13e-01 0.14 0.112 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -138747 sc-eQTL 4.05e-02 -0.234 0.114 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -188151 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0746 0.108 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -239261 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0174 0.0459 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -238031 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0488 0.111 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 62110 sc-eQTL 3.17e-01 0.0916 0.0913 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 947066 sc-eQTL 1.06e-01 -0.143 0.0883 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -188151 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0951 0.116 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -239261 sc-eQTL 4.89e-01 0.0328 0.0472 0.153 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 -138747 eQTL 8.49e-05 -0.114 0.0289 0.0 0.0 0.157

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112299 VNN1 -138747 3.99e-06 4.1e-06 6.9e-07 2e-06 7.59e-07 7.84e-07 2.92e-06 9.98e-07 3.03e-06 1.61e-06 3.74e-06 2.45e-06 6.49e-06 1.37e-06 8.94e-07 2.28e-06 1.55e-06 2.38e-06 1.44e-06 1.2e-06 1.53e-06 3.49e-06 3.32e-06 1.71e-06 4.68e-06 1.03e-06 1.61e-06 1.68e-06 3.82e-06 3.97e-06 1.93e-06 5.25e-07 7.33e-07 1.67e-06 1.88e-06 8.84e-07 8.96e-07 4.52e-07 1.04e-06 3.63e-07 2.37e-07 5.03e-06 5.43e-07 1.6e-07 3.13e-07 3.73e-07 8.61e-07 2.41e-07 3.24e-07
ENSG00000154269 \N 946866 2.67e-07 1.19e-07 3.69e-08 1.82e-07 8.92e-08 9.71e-08 1.44e-07 5.33e-08 1.41e-07 4.57e-08 1.56e-07 8.36e-08 1.41e-07 6.38e-08 5.84e-08 7.17e-08 4.48e-08 1.18e-07 5.36e-08 4.03e-08 1.04e-07 1.26e-07 1.34e-07 4.05e-08 1.32e-07 1.19e-07 1.12e-07 9.32e-08 1.05e-07 1.1e-07 9.91e-08 4.03e-08 3.09e-08 8.65e-08 8.82e-08 3.95e-08 5.02e-08 9.68e-08 6.55e-08 3.54e-08 3.98e-08 1.33e-07 3.99e-08 3.33e-08 5.59e-08 1.68e-08 1.23e-07 3.92e-09 4.85e-08