logo

Genes within 1Mb (chr6:132544410:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 142935 sc-eQTL 5.52e-01 0.0611 0.102 0.248 B L1
ENSG00000079950 STX7 31212 sc-eQTL 1.36e-01 0.0576 0.0385 0.248 B L1
ENSG00000112282 MED23 916168 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0491 0.077 0.248 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -219049 sc-eQTL 9.22e-01 0.00709 0.0727 0.248 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -270159 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0429 0.0439 0.248 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -268929 sc-eQTL 3.28e-02 0.197 0.0915 0.248 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 412522 sc-eQTL 1.20e-01 -0.0943 0.0604 0.248 B L1
ENSG00000079950 STX7 31212 sc-eQTL 9.66e-02 0.125 0.0749 0.248 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 916168 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0361 0.0597 0.248 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -219049 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0327 0.0652 0.248 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -270159 sc-eQTL 3.18e-01 0.0443 0.0443 0.248 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -268929 sc-eQTL 2.16e-02 0.205 0.0886 0.248 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 31212 sc-eQTL 3.15e-01 0.0746 0.0741 0.248 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 916168 sc-eQTL 9.78e-01 0.00203 0.0732 0.248 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -219049 sc-eQTL 3.22e-01 0.086 0.0866 0.248 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -270159 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0189 0.0296 0.248 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -268929 sc-eQTL 1.10e-02 0.227 0.0883 0.248 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 31212 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0232 0.0669 0.243 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -190355 sc-eQTL 1.78e-01 0.111 0.0826 0.243 DC L1
ENSG00000112282 MED23 916168 sc-eQTL 4.20e-01 0.0785 0.0972 0.243 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -169645 sc-eQTL 6.77e-01 0.0373 0.0895 0.243 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -219049 sc-eQTL 8.14e-01 0.0225 0.0958 0.243 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -270159 sc-eQTL 5.84e-01 0.0294 0.0537 0.243 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -268929 sc-eQTL 3.52e-02 0.178 0.0841 0.243 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -558718 sc-eQTL 3.59e-01 -0.071 0.0772 0.243 DC L1
ENSG00000079950 STX7 31212 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0242 0.0502 0.248 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -190355 sc-eQTL 9.99e-01 -5.46e-05 0.0862 0.248 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 916168 sc-eQTL 3.71e-01 0.0733 0.0818 0.248 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -169645 sc-eQTL 4.18e-02 0.188 0.0919 0.248 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -219049 sc-eQTL 1.35e-02 0.161 0.0645 0.248 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -270159 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00198 0.0392 0.248 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -268929 sc-eQTL 2.19e-01 0.0954 0.0774 0.248 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 31212 sc-eQTL 1.88e-01 0.099 0.075 0.249 NK L1
ENSG00000112282 MED23 916168 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0574 0.0687 0.249 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -219049 sc-eQTL 3.30e-01 0.0913 0.0935 0.249 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -270159 sc-eQTL 5.55e-01 0.0229 0.0387 0.249 NK L1
ENSG00000079950 STX7 31212 sc-eQTL 5.80e-01 0.0415 0.075 0.248 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 916168 sc-eQTL 3.85e-01 0.0816 0.0936 0.248 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -219049 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00129 0.0908 0.248 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -270159 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00423 0.036 0.248 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -268929 sc-eQTL 2.95e-01 0.103 0.0983 0.248 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 142935 sc-eQTL 8.37e-02 0.179 0.103 0.237 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 31212 sc-eQTL 8.37e-01 -0.02 0.097 0.237 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 916168 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0536 0.107 0.237 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -219049 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00582 0.103 0.237 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -270159 sc-eQTL 9.12e-02 0.0932 0.0549 0.237 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -268929 sc-eQTL 3.94e-01 0.0827 0.0967 0.237 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 412522 sc-eQTL 1.92e-01 0.121 0.092 0.237 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 142935 sc-eQTL 1.35e-01 0.139 0.0928 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 31212 sc-eQTL 3.24e-01 0.0602 0.061 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 916168 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0118 0.0929 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -219049 sc-eQTL 3.83e-01 0.0803 0.0918 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -270159 sc-eQTL 2.28e-01 -0.0678 0.0561 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -268929 sc-eQTL 1.14e-01 0.16 0.101 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 412522 sc-eQTL 1.15e-02 -0.217 0.0849 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 142935 sc-eQTL 5.66e-01 0.054 0.0941 0.248 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 31212 sc-eQTL 3.10e-01 0.075 0.0737 0.248 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 916168 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0435 0.0951 0.248 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -219049 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00817 0.0966 0.248 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -270159 sc-eQTL 1.19e-01 -0.0725 0.0463 0.248 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -268929 sc-eQTL 9.88e-01 0.00144 0.0971 0.248 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 412522 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0263 0.0905 0.248 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 142935 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0848 0.107 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 31212 sc-eQTL 7.20e-01 0.0168 0.0468 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 916168 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0403 0.0839 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -219049 sc-eQTL 2.60e-02 -0.202 0.0899 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -270159 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0309 0.0518 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -268929 sc-eQTL 1.32e-02 0.246 0.0986 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 412522 sc-eQTL 1.57e-01 -0.0935 0.0659 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 142935 sc-eQTL 9.99e-01 0.00011 0.1 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 31212 sc-eQTL 2.44e-01 0.0637 0.0545 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 916168 sc-eQTL 6.88e-01 0.0407 0.101 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -219049 sc-eQTL 7.79e-01 0.0282 0.1 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -270159 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00384 0.0532 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -268929 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00473 0.101 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 412522 sc-eQTL 5.51e-02 -0.134 0.0697 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 31212 sc-eQTL 9.04e-01 0.0124 0.103 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 916168 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0525 0.107 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -219049 sc-eQTL 7.92e-01 0.0273 0.104 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -270159 sc-eQTL 1.98e-01 -0.0616 0.0477 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -268929 sc-eQTL 8.42e-02 0.166 0.0958 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 31212 sc-eQTL 1.97e-01 0.104 0.0806 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 916168 sc-eQTL 9.95e-01 0.0004 0.069 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -219049 sc-eQTL 7.41e-01 0.0248 0.0749 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -270159 sc-eQTL 3.44e-01 0.046 0.0485 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -268929 sc-eQTL 1.39e-01 0.138 0.0931 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 31212 sc-eQTL 1.42e-03 0.282 0.0872 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 916168 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0639 0.075 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -219049 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0331 0.088 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -270159 sc-eQTL 3.75e-01 0.0405 0.0455 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -268929 sc-eQTL 4.05e-01 0.0881 0.106 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 31212 sc-eQTL 3.50e-01 0.0962 0.103 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 916168 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0555 0.0947 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -219049 sc-eQTL 1.95e-01 -0.128 0.0984 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -270159 sc-eQTL 8.60e-01 -0.00716 0.0405 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -268929 sc-eQTL 4.04e-03 0.287 0.0987 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 31212 sc-eQTL 7.53e-01 0.0268 0.085 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 916168 sc-eQTL 5.95e-01 0.0464 0.087 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -219049 sc-eQTL 7.76e-02 0.17 0.0959 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -270159 sc-eQTL 3.50e-01 0.0484 0.0516 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -268929 sc-eQTL 2.16e-01 0.124 0.0998 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 31212 sc-eQTL 2.27e-01 0.126 0.104 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 916168 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0123 0.0842 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -219049 sc-eQTL 8.13e-01 0.0214 0.0904 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -270159 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00519 0.0518 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -268929 sc-eQTL 5.67e-02 0.197 0.103 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 31212 sc-eQTL 9.47e-01 0.00664 0.0997 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 916168 sc-eQTL 2.59e-01 -0.113 0.0998 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -219049 sc-eQTL 5.14e-02 -0.192 0.098 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -270159 sc-eQTL 2.13e-01 0.06 0.0481 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -268929 sc-eQTL 1.14e-01 0.167 0.105 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 31212 sc-eQTL 9.18e-01 0.0113 0.11 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 916168 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00607 0.106 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -219049 sc-eQTL 4.24e-01 0.0871 0.109 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -270159 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0688 0.0584 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -268929 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0113 0.111 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 31212 sc-eQTL 8.69e-01 0.0157 0.0948 0.245 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 916168 sc-eQTL 2.10e-01 0.124 0.0988 0.245 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -219049 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0501 0.0963 0.245 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -270159 sc-eQTL 8.52e-01 -0.00887 0.0474 0.245 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -268929 sc-eQTL 4.27e-01 0.079 0.0992 0.245 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 31212 sc-eQTL 3.72e-01 0.0884 0.0988 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 916168 sc-eQTL 3.07e-01 -0.107 0.104 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -219049 sc-eQTL 9.49e-02 0.167 0.0998 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -270159 sc-eQTL 4.35e-01 0.0437 0.0559 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 31212 sc-eQTL 3.56e-01 0.074 0.08 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 916168 sc-eQTL 5.13e-01 -0.054 0.0823 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -219049 sc-eQTL 7.00e-01 0.0387 0.1 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -270159 sc-eQTL 3.15e-01 0.04 0.0397 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 31212 sc-eQTL 7.70e-01 0.0287 0.0981 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 916168 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00291 0.0991 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -219049 sc-eQTL 8.42e-01 0.0199 0.0993 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -270159 sc-eQTL 6.72e-01 0.0196 0.0462 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 31212 sc-eQTL 4.45e-01 0.0667 0.0872 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 916168 sc-eQTL 5.16e-01 0.0587 0.0902 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -219049 sc-eQTL 4.23e-01 0.0787 0.098 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -270159 sc-eQTL 8.36e-01 0.0111 0.0533 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 142935 sc-eQTL 9.47e-01 0.00696 0.104 0.263 PB L2
ENSG00000079950 STX7 31212 sc-eQTL 9.29e-01 0.00769 0.0865 0.263 PB L2
ENSG00000112282 MED23 916168 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0325 0.118 0.263 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -219049 sc-eQTL 1.23e-02 0.261 0.103 0.263 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -270159 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0557 0.0598 0.263 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -268929 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0333 0.112 0.263 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 412522 sc-eQTL 2.85e-01 -0.079 0.0736 0.263 PB L2
ENSG00000079950 STX7 31212 sc-eQTL 2.83e-01 0.0978 0.0907 0.252 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 916168 sc-eQTL 6.82e-01 0.042 0.102 0.252 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -219049 sc-eQTL 4.63e-01 0.0717 0.0975 0.252 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -270159 sc-eQTL 5.30e-01 0.0232 0.0369 0.252 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -268929 sc-eQTL 2.90e-01 0.101 0.0953 0.252 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 31212 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0177 0.0982 0.248 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 916168 sc-eQTL 1.78e-01 -0.136 0.1 0.248 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -219049 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0229 0.0826 0.248 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -270159 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000402 0.0365 0.248 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -268929 sc-eQTL 1.86e-01 0.136 0.103 0.248 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 31212 sc-eQTL 5.88e-01 0.0461 0.0851 0.241 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -190355 sc-eQTL 6.22e-01 0.0417 0.0845 0.241 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 916168 sc-eQTL 5.40e-02 0.211 0.109 0.241 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -169645 sc-eQTL 9.18e-01 0.0103 0.0994 0.241 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -219049 sc-eQTL 8.48e-01 0.0186 0.0969 0.241 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -270159 sc-eQTL 8.92e-01 -0.00649 0.0478 0.241 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -268929 sc-eQTL 1.58e-01 0.133 0.0942 0.241 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -558718 sc-eQTL 8.33e-02 -0.131 0.0751 0.241 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 31212 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0584 0.0645 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -190355 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0605 0.0912 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 916168 sc-eQTL 7.82e-01 0.025 0.0902 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -169645 sc-eQTL 1.62e-01 0.129 0.0917 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -219049 sc-eQTL 2.92e-02 0.16 0.0728 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -270159 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0185 0.0409 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -268929 sc-eQTL 8.02e-01 0.0198 0.0789 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 31212 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0447 0.0702 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -190355 sc-eQTL 5.44e-01 0.0533 0.0877 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 916168 sc-eQTL 6.09e-01 0.0488 0.0952 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -169645 sc-eQTL 1.46e-01 0.138 0.0948 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -219049 sc-eQTL 2.27e-01 0.0753 0.0622 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -270159 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0236 0.0449 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -268929 sc-eQTL 3.24e-01 0.082 0.083 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 31212 sc-eQTL 5.42e-01 0.0714 0.117 0.239 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 916168 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0122 0.125 0.239 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -219049 sc-eQTL 9.56e-01 0.00709 0.129 0.239 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -270159 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0314 0.0492 0.239 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -268929 sc-eQTL 1.29e-01 0.193 0.126 0.239 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 31212 sc-eQTL 6.77e-01 0.0391 0.0935 0.247 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -190355 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0132 0.0945 0.247 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 916168 sc-eQTL 9.91e-01 0.00111 0.104 0.247 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -169645 sc-eQTL 1.29e-06 0.44 0.0881 0.247 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -219049 sc-eQTL 3.40e-01 0.0907 0.0947 0.247 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -270159 sc-eQTL 7.80e-01 0.0116 0.0413 0.247 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -268929 sc-eQTL 6.69e-01 0.043 0.101 0.247 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 31212 sc-eQTL 9.04e-01 -0.00851 0.0704 0.244 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -190355 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0599 0.0993 0.244 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 916168 sc-eQTL 5.76e-01 0.0563 0.101 0.244 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -169645 sc-eQTL 1.63e-02 0.236 0.0972 0.244 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -219049 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0328 0.0948 0.244 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -270159 sc-eQTL 6.90e-01 0.019 0.0476 0.244 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -268929 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00841 0.084 0.244 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 31212 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0618 0.0785 0.249 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -190355 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0632 0.079 0.249 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 916168 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00883 0.11 0.249 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -169645 sc-eQTL 3.58e-01 -0.074 0.0804 0.249 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -219049 sc-eQTL 9.63e-01 0.00442 0.0959 0.249 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -270159 sc-eQTL 9.09e-01 0.00755 0.0661 0.249 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -268929 sc-eQTL 1.50e-01 0.141 0.0972 0.249 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -558718 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0633 0.0934 0.249 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 142935 sc-eQTL 6.99e-03 0.266 0.0976 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 31212 sc-eQTL 2.69e-01 0.0622 0.0561 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 916168 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0314 0.0861 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -219049 sc-eQTL 6.44e-01 0.0411 0.089 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -270159 sc-eQTL 1.55e-01 -0.0721 0.0505 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -268929 sc-eQTL 2.33e-01 0.111 0.0928 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 412522 sc-eQTL 9.25e-01 0.00842 0.0898 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 142935 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0258 0.107 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 31212 sc-eQTL 5.60e-01 0.0256 0.0439 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 916168 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0207 0.0825 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -219049 sc-eQTL 1.93e-01 -0.111 0.085 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -270159 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0259 0.0516 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -268929 sc-eQTL 3.28e-02 0.207 0.0963 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 412522 sc-eQTL 4.93e-02 -0.121 0.0613 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 31212 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0551 0.054 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -190355 sc-eQTL 9.75e-01 0.00275 0.0881 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 916168 sc-eQTL 5.18e-01 0.0548 0.0846 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -169645 sc-eQTL 5.52e-02 0.176 0.0911 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -219049 sc-eQTL 1.14e-02 0.153 0.0599 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -270159 sc-eQTL 8.22e-01 -0.00939 0.0417 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -268929 sc-eQTL 3.69e-01 0.0666 0.074 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 31212 sc-eQTL 4.83e-01 0.0466 0.0663 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -190355 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0903 0.0974 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 916168 sc-eQTL 4.84e-01 0.0665 0.0949 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -169645 sc-eQTL 7.01e-03 0.259 0.095 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -219049 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0101 0.0912 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -270159 sc-eQTL 6.88e-01 0.0155 0.0387 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -268929 sc-eQTL 1.54e-01 0.134 0.0935 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 31212 sc-eQTL 2.75e-01 0.0823 0.0753 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 916168 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0447 0.0733 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -219049 sc-eQTL 3.57e-01 0.0881 0.0954 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -270159 sc-eQTL 5.68e-01 0.0223 0.039 0.25 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 31212 eQTL 0.000202 0.0694 0.0186 0.0 0.0 0.227

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina