logo

Genes within 1Mb (chr6:132535173:C:CT):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 133698 sc-eQTL 7.97e-01 0.0258 0.1 0.252 B L1
ENSG00000079950 STX7 21975 sc-eQTL 1.35e-01 0.0564 0.0376 0.252 B L1
ENSG00000112282 MED23 906931 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0169 0.0753 0.252 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -228286 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0137 0.071 0.252 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -279396 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0447 0.0428 0.252 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -278166 sc-eQTL 2.45e-02 0.202 0.0892 0.252 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 403285 sc-eQTL 1.56e-01 -0.084 0.059 0.252 B L1
ENSG00000079950 STX7 21975 sc-eQTL 9.36e-02 0.123 0.073 0.252 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 906931 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0175 0.0583 0.252 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -228286 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0388 0.0636 0.252 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -279396 sc-eQTL 2.98e-01 0.0451 0.0432 0.252 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -278166 sc-eQTL 1.98e-02 0.203 0.0864 0.252 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 21975 sc-eQTL 2.91e-01 0.0766 0.0724 0.252 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 906931 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00591 0.0715 0.252 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -228286 sc-eQTL 1.97e-01 0.109 0.0844 0.252 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -279396 sc-eQTL 7.83e-01 -0.00799 0.029 0.252 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -278166 sc-eQTL 6.01e-03 0.239 0.086 0.252 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 21975 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0383 0.0653 0.248 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -199592 sc-eQTL 3.92e-01 0.0694 0.0809 0.248 DC L1
ENSG00000112282 MED23 906931 sc-eQTL 4.81e-01 0.067 0.095 0.248 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -178882 sc-eQTL 7.87e-01 0.0237 0.0875 0.248 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -228286 sc-eQTL 8.55e-01 0.0172 0.0936 0.248 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -279396 sc-eQTL 7.75e-01 0.015 0.0525 0.248 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -278166 sc-eQTL 7.19e-02 0.149 0.0824 0.248 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -567955 sc-eQTL 1.28e-01 -0.115 0.0751 0.248 DC L1
ENSG00000079950 STX7 21975 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0331 0.0489 0.252 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -199592 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0372 0.0841 0.252 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 906931 sc-eQTL 2.55e-01 0.0909 0.0796 0.252 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -178882 sc-eQTL 1.02e-01 0.148 0.0899 0.252 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -228286 sc-eQTL 5.06e-03 0.178 0.0627 0.252 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -279396 sc-eQTL 9.69e-01 0.0015 0.0383 0.252 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -278166 sc-eQTL 2.92e-01 0.0797 0.0755 0.252 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 21975 sc-eQTL 1.45e-01 0.108 0.074 0.253 NK L1
ENSG00000112282 MED23 906931 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0326 0.0679 0.253 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -228286 sc-eQTL 3.98e-01 0.0783 0.0924 0.253 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -279396 sc-eQTL 6.13e-01 0.0194 0.0383 0.253 NK L1
ENSG00000079950 STX7 21975 sc-eQTL 9.21e-01 0.00731 0.0735 0.252 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 906931 sc-eQTL 3.52e-01 0.0855 0.0916 0.252 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -228286 sc-eQTL 9.95e-01 0.000566 0.0889 0.252 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -279396 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00204 0.0353 0.252 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -278166 sc-eQTL 3.24e-01 0.0952 0.0963 0.252 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 133698 sc-eQTL 1.06e-01 0.162 0.1 0.242 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 21975 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0148 0.0945 0.242 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 906931 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0375 0.105 0.242 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -228286 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0445 0.1 0.242 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -279396 sc-eQTL 1.33e-01 0.0809 0.0535 0.242 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -278166 sc-eQTL 3.06e-01 0.0967 0.0941 0.242 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 403285 sc-eQTL 2.75e-01 0.0982 0.0897 0.242 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 133698 sc-eQTL 2.33e-01 0.109 0.0911 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 21975 sc-eQTL 3.62e-01 0.0546 0.0597 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 906931 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00994 0.091 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -228286 sc-eQTL 3.77e-01 0.0796 0.0899 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -279396 sc-eQTL 1.66e-01 -0.0763 0.0549 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -278166 sc-eQTL 1.57e-01 0.141 0.0989 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 403285 sc-eQTL 2.07e-02 -0.194 0.0834 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 133698 sc-eQTL 8.28e-01 0.0201 0.0922 0.252 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 21975 sc-eQTL 3.38e-01 0.0694 0.0722 0.252 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 906931 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0324 0.0932 0.252 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -228286 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0326 0.0946 0.252 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -279396 sc-eQTL 1.06e-01 -0.0736 0.0453 0.252 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -278166 sc-eQTL 9.86e-01 -0.0017 0.0952 0.252 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 403285 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0166 0.0887 0.252 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 133698 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0748 0.105 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 21975 sc-eQTL 7.59e-01 0.0141 0.0458 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 906931 sc-eQTL 8.66e-01 0.0138 0.0821 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -228286 sc-eQTL 2.93e-02 -0.193 0.088 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -279396 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0163 0.0507 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -278166 sc-eQTL 1.58e-02 0.235 0.0964 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 403285 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0657 0.0646 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 133698 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0373 0.0982 0.253 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 21975 sc-eQTL 2.86e-01 0.057 0.0534 0.253 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 906931 sc-eQTL 6.90e-01 0.0395 0.0988 0.253 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -228286 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0147 0.0982 0.253 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -279396 sc-eQTL 8.54e-01 -0.00955 0.052 0.253 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -278166 sc-eQTL 9.57e-01 0.0053 0.0992 0.253 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 403285 sc-eQTL 8.53e-02 -0.118 0.0683 0.253 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 21975 sc-eQTL 8.89e-01 0.014 0.1 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 906931 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0136 0.104 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -228286 sc-eQTL 9.45e-01 0.00703 0.101 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -279396 sc-eQTL 1.21e-01 -0.0722 0.0463 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -278166 sc-eQTL 9.20e-02 0.158 0.0933 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 21975 sc-eQTL 2.69e-01 0.087 0.0785 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 906931 sc-eQTL 8.07e-01 0.0164 0.0672 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -228286 sc-eQTL 8.96e-01 0.00951 0.073 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -279396 sc-eQTL 3.34e-01 0.0457 0.0472 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -278166 sc-eQTL 1.19e-01 0.142 0.0906 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 21975 sc-eQTL 9.00e-04 0.286 0.085 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 906931 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0594 0.0732 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -228286 sc-eQTL 9.54e-01 0.00499 0.086 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -279396 sc-eQTL 3.93e-01 0.0381 0.0445 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -278166 sc-eQTL 3.12e-01 0.104 0.103 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 21975 sc-eQTL 3.34e-01 0.0974 0.101 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 906931 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0397 0.0928 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -228286 sc-eQTL 1.78e-01 -0.13 0.0963 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -279396 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00164 0.0397 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -278166 sc-eQTL 1.15e-02 0.248 0.0971 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 21975 sc-eQTL 6.58e-01 0.0369 0.0832 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 906931 sc-eQTL 5.97e-01 0.0451 0.0853 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -228286 sc-eQTL 2.98e-02 0.205 0.0935 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -279396 sc-eQTL 2.61e-01 0.0569 0.0505 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -278166 sc-eQTL 2.22e-01 0.12 0.0977 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 21975 sc-eQTL 2.38e-01 0.12 0.102 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 906931 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0166 0.0819 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -228286 sc-eQTL 6.30e-01 0.0423 0.0878 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -279396 sc-eQTL 8.36e-01 0.0104 0.0503 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -278166 sc-eQTL 3.42e-02 0.213 0.0999 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 21975 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0142 0.0971 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 906931 sc-eQTL 2.14e-01 -0.121 0.0971 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -228286 sc-eQTL 1.04e-01 -0.156 0.0957 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -279396 sc-eQTL 1.64e-01 0.0654 0.0467 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -278166 sc-eQTL 2.19e-01 0.126 0.103 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 21975 sc-eQTL 8.77e-01 0.0168 0.108 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 906931 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0118 0.104 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -228286 sc-eQTL 3.10e-01 0.109 0.108 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -279396 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0399 0.0579 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -278166 sc-eQTL 7.65e-01 0.0328 0.11 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 21975 sc-eQTL 9.71e-01 0.0034 0.0928 0.249 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 906931 sc-eQTL 1.42e-01 0.142 0.0966 0.249 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -228286 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0626 0.0943 0.249 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -279396 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0154 0.0464 0.249 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -278166 sc-eQTL 4.25e-01 0.0777 0.0972 0.249 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 21975 sc-eQTL 2.22e-01 0.118 0.0964 0.253 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 906931 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0839 0.102 0.253 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -228286 sc-eQTL 5.30e-02 0.189 0.0973 0.253 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -279396 sc-eQTL 4.76e-01 0.039 0.0547 0.253 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 21975 sc-eQTL 4.34e-01 0.0619 0.079 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 906931 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0332 0.0812 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -228286 sc-eQTL 7.46e-01 0.032 0.0989 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -279396 sc-eQTL 3.20e-01 0.039 0.0392 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 21975 sc-eQTL 6.11e-01 0.0488 0.0959 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 906931 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0106 0.0969 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -228286 sc-eQTL 9.46e-01 0.00659 0.0971 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -279396 sc-eQTL 7.59e-01 0.0139 0.0452 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 21975 sc-eQTL 2.30e-01 0.103 0.0856 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 906931 sc-eQTL 3.99e-01 0.0749 0.0886 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -228286 sc-eQTL 4.80e-01 0.0682 0.0964 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -279396 sc-eQTL 9.81e-01 0.00124 0.0524 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 133698 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000602 0.1 0.27 PB L2
ENSG00000079950 STX7 21975 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00268 0.0836 0.27 PB L2
ENSG00000112282 MED23 906931 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0128 0.114 0.27 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -228286 sc-eQTL 1.93e-02 0.237 0.0997 0.27 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -279396 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0679 0.0577 0.27 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -278166 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00831 0.109 0.27 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 403285 sc-eQTL 3.86e-01 -0.062 0.0712 0.27 PB L2
ENSG00000079950 STX7 21975 sc-eQTL 3.04e-01 0.0919 0.0892 0.257 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 906931 sc-eQTL 5.59e-01 0.0589 0.101 0.257 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -228286 sc-eQTL 4.58e-01 0.0712 0.0958 0.257 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -279396 sc-eQTL 4.32e-01 0.0285 0.0363 0.257 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -278166 sc-eQTL 5.78e-01 0.0523 0.0939 0.257 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 21975 sc-eQTL 9.45e-01 0.00663 0.0958 0.252 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 906931 sc-eQTL 2.83e-01 -0.106 0.0982 0.252 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -228286 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0191 0.0806 0.252 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -279396 sc-eQTL 8.77e-01 0.00552 0.0357 0.252 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -278166 sc-eQTL 1.20e-01 0.156 0.1 0.252 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 21975 sc-eQTL 7.91e-01 0.022 0.083 0.246 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -199592 sc-eQTL 9.60e-01 0.00417 0.0825 0.246 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 906931 sc-eQTL 1.17e-01 0.168 0.107 0.246 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -178882 sc-eQTL 9.62e-01 0.00468 0.097 0.246 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -228286 sc-eQTL 9.49e-01 0.00606 0.0945 0.246 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -279396 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0182 0.0466 0.246 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -278166 sc-eQTL 3.13e-01 0.0931 0.0921 0.246 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -567955 sc-eQTL 6.01e-02 -0.138 0.0731 0.246 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 21975 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0628 0.0629 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -199592 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0812 0.0889 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 906931 sc-eQTL 4.73e-01 0.0631 0.0879 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -178882 sc-eQTL 3.49e-01 0.0842 0.0897 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -228286 sc-eQTL 1.42e-02 0.175 0.0708 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -279396 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0108 0.0399 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -278166 sc-eQTL 9.58e-01 0.00403 0.077 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 21975 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0494 0.0685 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -199592 sc-eQTL 9.66e-01 0.00366 0.0856 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 906931 sc-eQTL 7.86e-01 0.0252 0.0929 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -178882 sc-eQTL 2.04e-01 0.118 0.0926 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -228286 sc-eQTL 7.60e-02 0.108 0.0604 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -279396 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0254 0.0438 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -278166 sc-eQTL 3.10e-01 0.0823 0.081 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 21975 sc-eQTL 6.90e-01 0.0452 0.113 0.245 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 906931 sc-eQTL 9.46e-01 0.00821 0.121 0.245 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -228286 sc-eQTL 7.60e-01 0.0382 0.125 0.245 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -279396 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0238 0.0476 0.245 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -278166 sc-eQTL 8.63e-02 0.211 0.122 0.245 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 21975 sc-eQTL 8.36e-01 0.019 0.0915 0.251 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -199592 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00555 0.0924 0.251 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 906931 sc-eQTL 9.81e-01 0.00246 0.102 0.251 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -178882 sc-eQTL 6.64e-06 0.402 0.0869 0.251 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -228286 sc-eQTL 4.57e-01 0.0691 0.0927 0.251 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -279396 sc-eQTL 6.49e-01 0.0184 0.0404 0.251 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -278166 sc-eQTL 6.90e-01 0.0393 0.0983 0.251 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 21975 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00404 0.0688 0.249 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -199592 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0637 0.097 0.249 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 906931 sc-eQTL 6.50e-01 0.0447 0.0983 0.249 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -178882 sc-eQTL 2.78e-02 0.211 0.0952 0.249 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -228286 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0231 0.0927 0.249 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -279396 sc-eQTL 5.95e-01 0.0247 0.0465 0.249 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -278166 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00574 0.0821 0.249 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 21975 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0707 0.0776 0.251 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -199592 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0695 0.0781 0.251 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 906931 sc-eQTL 9.23e-01 0.0105 0.109 0.251 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -178882 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0819 0.0794 0.251 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -228286 sc-eQTL 7.98e-01 0.0243 0.0948 0.251 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -279396 sc-eQTL 9.24e-01 0.00625 0.0653 0.251 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -278166 sc-eQTL 1.79e-01 0.13 0.0962 0.251 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -567955 sc-eQTL 2.22e-01 -0.113 0.0921 0.251 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 133698 sc-eQTL 2.84e-02 0.212 0.0963 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 21975 sc-eQTL 2.94e-01 0.058 0.055 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 906931 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00299 0.0845 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -228286 sc-eQTL 8.26e-01 0.0192 0.0873 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -279396 sc-eQTL 1.20e-01 -0.0771 0.0494 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -278166 sc-eQTL 2.44e-01 0.106 0.091 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 403285 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00894 0.0881 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 133698 sc-eQTL 6.33e-01 -0.05 0.105 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 21975 sc-eQTL 5.96e-01 0.0228 0.0429 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 906931 sc-eQTL 9.06e-01 0.00951 0.0806 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -228286 sc-eQTL 1.14e-01 -0.132 0.0829 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -279396 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0194 0.0504 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -278166 sc-eQTL 3.03e-02 0.205 0.0941 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 403285 sc-eQTL 8.36e-02 -0.104 0.06 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 21975 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0614 0.0526 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -199592 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0315 0.086 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 906931 sc-eQTL 3.56e-01 0.0764 0.0825 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -178882 sc-eQTL 1.25e-01 0.137 0.0892 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -228286 sc-eQTL 2.86e-03 0.175 0.0581 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -279396 sc-eQTL 8.74e-01 -0.00647 0.0407 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -278166 sc-eQTL 4.48e-01 0.0549 0.0723 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 21975 sc-eQTL 4.92e-01 0.0445 0.0647 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -199592 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0939 0.0951 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 906931 sc-eQTL 5.23e-01 0.0594 0.0928 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -178882 sc-eQTL 1.50e-02 0.228 0.0932 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -228286 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0112 0.0891 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -279396 sc-eQTL 5.47e-01 0.0228 0.0378 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -278166 sc-eQTL 1.72e-01 0.125 0.0914 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 21975 sc-eQTL 2.29e-01 0.0896 0.0743 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 906931 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0217 0.0724 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -228286 sc-eQTL 4.55e-01 0.0706 0.0943 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -279396 sc-eQTL 6.19e-01 0.0192 0.0385 0.254 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 21975 eQTL 0.000142 0.0696 0.0182 0.0 0.0 0.241

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina