logo

Genes within 1Mb (chr6:132525032:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 123557 sc-eQTL 1.45e-01 0.251 0.172 0.079 B L1
ENSG00000079950 STX7 11834 sc-eQTL 2.32e-01 0.0778 0.0648 0.079 B L1
ENSG00000112282 MED23 896790 sc-eQTL 1.56e-01 0.184 0.129 0.079 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -238427 sc-eQTL 6.66e-02 -0.224 0.121 0.079 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -289537 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0863 0.0737 0.079 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -288307 sc-eQTL 9.61e-01 0.00754 0.156 0.079 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 393144 sc-eQTL 2.30e-01 -0.122 0.102 0.079 B L1
ENSG00000079950 STX7 11834 sc-eQTL 2.46e-01 0.146 0.125 0.079 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 896790 sc-eQTL 8.00e-01 0.0252 0.0998 0.079 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -238427 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0475 0.109 0.079 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -289537 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0374 0.074 0.079 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -288307 sc-eQTL 4.49e-01 0.113 0.15 0.079 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 11834 sc-eQTL 2.79e-01 0.133 0.123 0.079 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 896790 sc-eQTL 3.76e-01 0.108 0.121 0.079 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -238427 sc-eQTL 2.31e-01 -0.172 0.143 0.079 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -289537 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0101 0.0491 0.079 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -288307 sc-eQTL 9.93e-01 -0.0014 0.149 0.079 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 11834 sc-eQTL 9.79e-01 0.00313 0.117 0.077 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -209733 sc-eQTL 8.48e-01 0.0278 0.145 0.077 DC L1
ENSG00000112282 MED23 896790 sc-eQTL 1.58e-01 -0.24 0.17 0.077 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -189023 sc-eQTL 2.98e-01 0.163 0.156 0.077 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -238427 sc-eQTL 1.94e-01 -0.218 0.167 0.077 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -289537 sc-eQTL 5.80e-01 0.052 0.0939 0.077 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -288307 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0525 0.149 0.077 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -578096 sc-eQTL 1.49e-01 0.195 0.135 0.077 DC L1
ENSG00000079950 STX7 11834 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0389 0.0861 0.079 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -209733 sc-eQTL 4.59e-01 0.11 0.148 0.079 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 896790 sc-eQTL 4.45e-01 -0.107 0.14 0.079 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -189023 sc-eQTL 1.90e-01 -0.209 0.158 0.079 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -238427 sc-eQTL 3.16e-01 -0.113 0.112 0.079 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -289537 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0197 0.0673 0.079 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -288307 sc-eQTL 3.08e-01 -0.136 0.133 0.079 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 11834 sc-eQTL 8.63e-01 0.0221 0.128 0.079 NK L1
ENSG00000112282 MED23 896790 sc-eQTL 7.51e-01 0.0372 0.117 0.079 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -238427 sc-eQTL 1.79e-01 -0.214 0.159 0.079 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -289537 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00211 0.066 0.079 NK L1
ENSG00000079950 STX7 11834 sc-eQTL 7.25e-01 0.0452 0.128 0.079 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 896790 sc-eQTL 2.77e-01 -0.174 0.16 0.079 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -238427 sc-eQTL 1.22e-02 -0.386 0.153 0.079 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -289537 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0676 0.0613 0.079 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -288307 sc-eQTL 1.20e-01 0.261 0.167 0.079 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 123557 sc-eQTL 1.61e-01 0.264 0.188 0.074 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 11834 sc-eQTL 6.63e-01 0.0771 0.177 0.074 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 896790 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0637 0.196 0.074 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -238427 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0407 0.188 0.074 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -289537 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0754 0.101 0.074 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -288307 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0195 0.177 0.074 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 393144 sc-eQTL 3.65e-01 -0.153 0.168 0.074 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 123557 sc-eQTL 3.01e-01 -0.166 0.16 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 11834 sc-eQTL 7.40e-02 0.188 0.104 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 896790 sc-eQTL 3.53e-01 0.149 0.16 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -238427 sc-eQTL 1.20e-01 -0.246 0.158 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -289537 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0206 0.0971 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -288307 sc-eQTL 8.07e-01 0.0427 0.175 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 393144 sc-eQTL 1.05e-01 -0.241 0.148 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 123557 sc-eQTL 9.65e-01 0.00712 0.162 0.08 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 11834 sc-eQTL 2.61e-01 0.143 0.127 0.08 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 896790 sc-eQTL 5.97e-02 0.308 0.163 0.08 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -238427 sc-eQTL 3.89e-01 -0.144 0.166 0.08 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -289537 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0542 0.0802 0.08 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -288307 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0708 0.167 0.08 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 393144 sc-eQTL 2.71e-01 -0.172 0.156 0.08 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 123557 sc-eQTL 3.23e-01 0.177 0.179 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 11834 sc-eQTL 5.58e-01 0.0459 0.0782 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 896790 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00866 0.14 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -238427 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0695 0.152 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -289537 sc-eQTL 2.39e-01 -0.102 0.0863 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -288307 sc-eQTL 2.70e-01 0.184 0.167 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 393144 sc-eQTL 9.19e-01 0.0112 0.111 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 123557 sc-eQTL 8.10e-02 0.299 0.171 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 11834 sc-eQTL 7.93e-01 0.0247 0.0937 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 896790 sc-eQTL 2.47e-01 0.2 0.173 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -238427 sc-eQTL 9.08e-01 0.02 0.172 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -289537 sc-eQTL 1.93e-01 -0.119 0.0907 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -288307 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0825 0.174 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 393144 sc-eQTL 1.11e-01 -0.192 0.12 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 11834 sc-eQTL 4.41e-01 0.13 0.169 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 896790 sc-eQTL 3.70e-01 0.158 0.175 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -238427 sc-eQTL 1.39e-01 -0.252 0.169 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -289537 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0472 0.0787 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -288307 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0298 0.159 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 11834 sc-eQTL 3.51e-01 0.127 0.135 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 896790 sc-eQTL 9.70e-01 0.00441 0.116 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -238427 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0871 0.126 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -289537 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00159 0.0816 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -288307 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0211 0.157 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 11834 sc-eQTL 7.21e-01 0.054 0.151 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 896790 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0262 0.127 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -238427 sc-eQTL 5.00e-01 -0.1 0.149 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -289537 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00406 0.0771 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -288307 sc-eQTL 4.84e-01 0.125 0.178 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 11834 sc-eQTL 1.10e-02 0.434 0.169 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 896790 sc-eQTL 2.44e-01 -0.184 0.158 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -238427 sc-eQTL 2.04e-01 0.209 0.164 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -289537 sc-eQTL 1.93e-01 -0.088 0.0673 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -288307 sc-eQTL 5.74e-01 0.0945 0.168 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 11834 sc-eQTL 9.16e-01 0.0149 0.141 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 896790 sc-eQTL 6.47e-01 0.0664 0.145 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -238427 sc-eQTL 6.05e-02 -0.3 0.159 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -289537 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0475 0.0858 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -288307 sc-eQTL 8.89e-01 0.0232 0.166 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 11834 sc-eQTL 1.69e-01 0.232 0.168 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 896790 sc-eQTL 1.89e-01 0.178 0.135 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -238427 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0394 0.146 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -289537 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0796 0.0832 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -288307 sc-eQTL 5.14e-01 0.109 0.167 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 11834 sc-eQTL 3.32e-01 0.162 0.167 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 896790 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0158 0.168 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -238427 sc-eQTL 9.92e-01 0.00157 0.166 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -289537 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0911 0.0805 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -288307 sc-eQTL 8.92e-01 0.024 0.177 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 11834 sc-eQTL 6.75e-01 0.0744 0.177 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 896790 sc-eQTL 1.07e-01 0.274 0.169 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -238427 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0955 0.176 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -289537 sc-eQTL 4.31e-01 0.0746 0.0945 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -288307 sc-eQTL 2.44e-01 -0.209 0.178 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 11834 sc-eQTL 2.64e-01 0.183 0.164 0.08 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 896790 sc-eQTL 2.76e-01 -0.187 0.171 0.08 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -238427 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00708 0.167 0.08 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -289537 sc-eQTL 1.75e-01 -0.111 0.0817 0.08 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -288307 sc-eQTL 8.50e-02 0.296 0.171 0.08 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 11834 sc-eQTL 1.94e-01 -0.215 0.165 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 896790 sc-eQTL 5.55e-02 0.335 0.174 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -238427 sc-eQTL 1.63e-01 -0.235 0.168 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -289537 sc-eQTL 7.40e-01 0.0312 0.0939 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 11834 sc-eQTL 3.17e-01 0.139 0.138 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 896790 sc-eQTL 6.94e-01 0.056 0.142 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -238427 sc-eQTL 1.35e-01 -0.258 0.172 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -289537 sc-eQTL 5.52e-01 0.0409 0.0687 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 11834 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0662 0.165 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 896790 sc-eQTL 9.33e-01 -0.014 0.167 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -238427 sc-eQTL 8.90e-02 -0.284 0.166 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -289537 sc-eQTL 2.13e-01 0.097 0.0776 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 11834 sc-eQTL 9.82e-01 0.0033 0.149 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 896790 sc-eQTL 4.88e-01 -0.107 0.154 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -238427 sc-eQTL 1.37e-01 -0.248 0.166 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -289537 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0059 0.0907 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 123557 sc-eQTL 8.30e-02 0.364 0.208 0.059 PB L2
ENSG00000079950 STX7 11834 sc-eQTL 5.88e-01 0.0955 0.176 0.059 PB L2
ENSG00000112282 MED23 896790 sc-eQTL 1.38e-01 0.354 0.237 0.059 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -238427 sc-eQTL 5.81e-01 -0.119 0.215 0.059 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -289537 sc-eQTL 1.08e-01 0.196 0.121 0.059 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -288307 sc-eQTL 8.87e-01 0.0326 0.229 0.059 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 393144 sc-eQTL 1.31e-01 0.227 0.149 0.059 PB L2
ENSG00000079950 STX7 11834 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0355 0.159 0.076 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 896790 sc-eQTL 7.29e-01 0.0622 0.179 0.076 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -238427 sc-eQTL 4.79e-01 -0.121 0.171 0.076 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -289537 sc-eQTL 5.92e-01 0.0347 0.0646 0.076 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -288307 sc-eQTL 1.09e-01 -0.267 0.166 0.076 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 11834 sc-eQTL 8.27e-01 0.0361 0.165 0.079 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 896790 sc-eQTL 6.08e-02 0.317 0.168 0.079 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -238427 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0363 0.139 0.079 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -289537 sc-eQTL 1.28e-01 -0.0932 0.061 0.079 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -288307 sc-eQTL 6.28e-02 0.321 0.172 0.079 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 11834 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0507 0.149 0.08 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -209733 sc-eQTL 9.14e-01 0.0159 0.148 0.08 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 896790 sc-eQTL 3.90e-02 -0.395 0.19 0.08 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -189023 sc-eQTL 4.28e-02 0.35 0.172 0.08 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -238427 sc-eQTL 4.94e-01 -0.116 0.169 0.08 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -289537 sc-eQTL 5.87e-02 0.157 0.0827 0.08 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -288307 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0256 0.165 0.08 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -578096 sc-eQTL 2.21e-01 0.162 0.132 0.08 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 11834 sc-eQTL 6.34e-01 0.0533 0.112 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -209733 sc-eQTL 6.64e-01 0.0687 0.158 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 896790 sc-eQTL 4.44e-01 -0.12 0.156 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -189023 sc-eQTL 3.57e-01 -0.147 0.159 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -238427 sc-eQTL 5.07e-02 -0.248 0.126 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -289537 sc-eQTL 6.40e-01 0.0331 0.0707 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -288307 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0956 0.136 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 11834 sc-eQTL 1.11e-01 -0.191 0.12 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -209733 sc-eQTL 6.63e-01 0.0656 0.15 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 896790 sc-eQTL 6.17e-01 0.0816 0.163 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -189023 sc-eQTL 1.17e-01 -0.255 0.162 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -238427 sc-eQTL 2.47e-01 -0.124 0.106 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -289537 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0665 0.0768 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -288307 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0532 0.142 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 11834 sc-eQTL 1.92e-01 -0.249 0.19 0.082 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 896790 sc-eQTL 3.67e-01 -0.185 0.204 0.082 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -238427 sc-eQTL 8.94e-02 -0.358 0.209 0.082 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -289537 sc-eQTL 5.14e-01 0.0525 0.0803 0.082 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -288307 sc-eQTL 6.10e-01 -0.106 0.208 0.082 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 11834 sc-eQTL 3.57e-01 0.149 0.161 0.08 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -209733 sc-eQTL 2.51e-01 0.187 0.162 0.08 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 896790 sc-eQTL 3.13e-01 -0.18 0.179 0.08 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -189023 sc-eQTL 9.22e-02 -0.271 0.16 0.08 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -238427 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0297 0.164 0.08 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -289537 sc-eQTL 8.95e-01 0.0094 0.0712 0.08 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -288307 sc-eQTL 2.72e-01 -0.19 0.173 0.08 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 11834 sc-eQTL 5.14e-01 0.0772 0.118 0.081 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -209733 sc-eQTL 1.87e-01 0.22 0.166 0.081 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 896790 sc-eQTL 5.73e-02 -0.32 0.168 0.081 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -189023 sc-eQTL 3.58e-01 -0.152 0.165 0.081 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -238427 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0471 0.159 0.081 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -289537 sc-eQTL 7.18e-04 -0.267 0.0776 0.081 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -288307 sc-eQTL 8.76e-01 0.022 0.141 0.081 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 11834 sc-eQTL 1.15e-01 0.228 0.144 0.073 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -209733 sc-eQTL 7.55e-01 0.0456 0.146 0.073 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 896790 sc-eQTL 5.75e-01 -0.114 0.204 0.073 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -189023 sc-eQTL 1.20e-01 -0.231 0.148 0.073 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -238427 sc-eQTL 5.68e-01 -0.101 0.177 0.073 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -289537 sc-eQTL 6.05e-01 0.0631 0.122 0.073 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -288307 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0283 0.181 0.073 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -578096 sc-eQTL 2.19e-02 0.393 0.17 0.073 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 123557 sc-eQTL 7.10e-01 0.0635 0.171 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 11834 sc-eQTL 7.45e-02 0.172 0.0959 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 896790 sc-eQTL 1.59e-01 0.208 0.147 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -238427 sc-eQTL 4.56e-02 -0.305 0.151 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -289537 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0481 0.0871 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -288307 sc-eQTL 6.12e-01 0.0811 0.16 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 393144 sc-eQTL 1.13e-01 -0.244 0.153 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 123557 sc-eQTL 1.51e-01 0.256 0.178 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 11834 sc-eQTL 4.09e-01 0.0604 0.0731 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 896790 sc-eQTL 3.30e-01 0.134 0.137 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -238427 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0577 0.142 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -289537 sc-eQTL 3.59e-01 -0.079 0.0859 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -288307 sc-eQTL 8.74e-01 0.0257 0.162 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 393144 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0951 0.103 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 11834 sc-eQTL 6.89e-01 -0.037 0.0925 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -209733 sc-eQTL 6.50e-01 0.0684 0.151 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 896790 sc-eQTL 9.23e-01 -0.014 0.145 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -189023 sc-eQTL 1.25e-01 -0.241 0.156 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -238427 sc-eQTL 1.12e-01 -0.165 0.103 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -289537 sc-eQTL 8.09e-01 0.0172 0.0713 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -288307 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0671 0.127 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 11834 sc-eQTL 3.96e-01 0.0944 0.111 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -209733 sc-eQTL 7.70e-02 0.288 0.162 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 896790 sc-eQTL 6.22e-02 -0.296 0.158 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -189023 sc-eQTL 2.40e-01 -0.19 0.161 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -238427 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0479 0.153 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -289537 sc-eQTL 5.79e-02 -0.123 0.0643 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -288307 sc-eQTL 2.21e-01 -0.193 0.157 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 11834 sc-eQTL 7.69e-01 0.0382 0.13 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 896790 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00412 0.126 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -238427 sc-eQTL 1.91e-01 -0.215 0.164 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -289537 sc-eQTL 7.77e-01 0.0191 0.0672 0.08 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 -189023 pQTL 5.35e-07 -0.366 0.0726 0.0 0.0 0.0607
ENSG00000112299 VNN1 -189023 eQTL 0.0225 -0.101 0.0441 0.0 0.0 0.0623
ENSG00000146409 SLC18B1 -288307 eQTL 0.0245 0.102 0.0453 0.0 0.0 0.0623

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112299 VNN1 -189023 5.72e-06 4.34e-06 7.29e-07 3.39e-06 1.38e-06 1.52e-06 4.27e-06 9.91e-07 5.25e-06 2.53e-06 5.38e-06 3.41e-06 7.48e-06 2.43e-06 1.26e-06 3.75e-06 1.85e-06 3.85e-06 1.32e-06 1.13e-06 2.63e-06 4.6e-06 4.09e-06 1.65e-06 7.14e-06 1.37e-06 2.35e-06 1.69e-06 4.47e-06 4.02e-06 2.79e-06 4.18e-07 6.65e-07 1.81e-06 1.96e-06 1.16e-06 1.08e-06 4.75e-07 1.31e-06 3.27e-07 2.88e-07 5.6e-06 6.89e-07 1.49e-07 3.06e-07 3.75e-07 7.91e-07 2.11e-07 1.59e-07
ENSG00000112303 \N -238427 4.36e-06 2.54e-06 6.03e-07 2.1e-06 6.04e-07 1.27e-06 2.18e-06 6.28e-07 2.27e-06 1.19e-06 3.16e-06 1.26e-06 5.05e-06 1.36e-06 5.41e-07 2.1e-06 1.07e-06 2.1e-06 7.88e-07 1.39e-06 1.14e-06 2.88e-06 2.67e-06 1.03e-06 4.32e-06 1.33e-06 1.6e-06 1.8e-06 2.85e-06 2.17e-06 1.98e-06 4.56e-07 3.98e-07 1.74e-06 1.97e-06 9.33e-07 9.41e-07 4.24e-07 6.91e-07 1.85e-07 2.82e-07 3.93e-06 3.82e-07 9.61e-08 3.55e-07 3.13e-07 5.64e-07 2.41e-07 2.89e-07
ENSG00000112306 \N -289537 2.7e-06 1.13e-06 2.59e-07 1.76e-06 5.07e-07 8.09e-07 1.27e-06 4.08e-07 1.73e-06 7.25e-07 1.83e-06 8.48e-07 3.04e-06 4.46e-07 5.34e-07 1.11e-06 9.34e-07 1.42e-06 6.6e-07 6.87e-07 7.41e-07 1.92e-06 1.58e-06 5.89e-07 2.59e-06 7.75e-07 1.12e-06 9.82e-07 1.75e-06 1.39e-06 7.46e-07 2.48e-07 2.19e-07 1.24e-06 1.23e-06 6.58e-07 7.01e-07 3.25e-07 4.26e-07 3.08e-07 2.12e-07 2.62e-06 5.88e-07 4.11e-08 1.9e-07 2.35e-07 2.42e-07 4.82e-08 1.06e-07