Genes within 1Mb (chr6:132521785:T:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 120310 sc-eQTL 6.27e-01 0.0469 0.0964 0.282 B L1
ENSG00000079950 STX7 8587 sc-eQTL 3.12e-01 0.0368 0.0363 0.282 B L1
ENSG00000112282 MED23 893543 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0443 0.0725 0.282 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -241674 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00704 0.0684 0.282 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -292784 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0468 0.0412 0.282 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -291554 sc-eQTL 1.25e-01 0.133 0.0866 0.282 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 389897 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0328 0.0571 0.282 B L1
ENSG00000079950 STX7 8587 sc-eQTL 5.33e-01 0.0442 0.0707 0.282 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 893543 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0516 0.0561 0.282 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -241674 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0569 0.0612 0.282 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -292784 sc-eQTL 6.86e-01 0.0169 0.0417 0.282 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -291554 sc-eQTL 5.29e-02 0.163 0.0836 0.282 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 8587 sc-eQTL 5.52e-01 0.0415 0.0697 0.282 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 893543 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0719 0.0685 0.282 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -241674 sc-eQTL 3.07e-01 0.0831 0.0812 0.282 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -292784 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0283 0.0278 0.282 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -291554 sc-eQTL 2.18e-02 0.192 0.0831 0.282 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 8587 sc-eQTL 2.93e-01 0.0662 0.0628 0.279 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -212980 sc-eQTL 8.16e-02 0.136 0.0775 0.279 DC L1
ENSG00000112282 MED23 893543 sc-eQTL 1.84e-01 0.122 0.0913 0.279 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -192270 sc-eQTL 3.66e-01 0.0762 0.0841 0.279 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -241674 sc-eQTL 3.04e-01 0.0927 0.09 0.279 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -292784 sc-eQTL 7.35e-01 0.0171 0.0506 0.279 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -291554 sc-eQTL 1.95e-02 0.186 0.079 0.279 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -581343 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000515 0.0729 0.279 DC L1
ENSG00000079950 STX7 8587 sc-eQTL 8.67e-01 0.00801 0.0476 0.282 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -212980 sc-eQTL 4.38e-01 0.0635 0.0816 0.282 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 893543 sc-eQTL 7.71e-01 0.0226 0.0776 0.282 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -192270 sc-eQTL 1.19e-01 0.137 0.0875 0.282 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -241674 sc-eQTL 1.18e-02 0.155 0.0612 0.282 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -292784 sc-eQTL 8.00e-01 -0.00946 0.0372 0.282 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -291554 sc-eQTL 5.09e-01 0.0487 0.0735 0.282 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 8587 sc-eQTL 8.75e-02 0.121 0.0704 0.283 NK L1
ENSG00000112282 MED23 893543 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0716 0.0646 0.283 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -241674 sc-eQTL 1.23e-01 0.136 0.0877 0.283 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -292784 sc-eQTL 8.14e-01 0.0086 0.0365 0.283 NK L1
ENSG00000079950 STX7 8587 sc-eQTL 2.05e-01 0.0901 0.0709 0.282 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 893543 sc-eQTL 6.88e-01 0.0357 0.0889 0.282 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -241674 sc-eQTL 8.36e-01 0.0178 0.0861 0.282 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -292784 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0105 0.0341 0.282 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -291554 sc-eQTL 4.32e-01 0.0734 0.0933 0.282 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 120310 sc-eQTL 6.03e-02 0.181 0.0959 0.276 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 8587 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0108 0.0908 0.276 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 893543 sc-eQTL 7.58e-01 0.0311 0.101 0.276 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -241674 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0193 0.0966 0.276 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -292784 sc-eQTL 1.85e-01 0.0685 0.0515 0.276 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -291554 sc-eQTL 6.27e-01 0.0441 0.0907 0.276 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 389897 sc-eQTL 4.15e-02 0.176 0.0855 0.276 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 120310 sc-eQTL 2.20e-01 0.108 0.0878 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 8587 sc-eQTL 6.79e-01 0.0239 0.0577 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 893543 sc-eQTL 7.24e-01 -0.031 0.0877 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -241674 sc-eQTL 5.96e-01 0.0461 0.0868 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -292784 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0613 0.053 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -291554 sc-eQTL 1.01e-01 0.157 0.0952 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 389897 sc-eQTL 5.47e-02 -0.156 0.0807 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 120310 sc-eQTL 7.17e-01 0.0324 0.089 0.282 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 8587 sc-eQTL 3.85e-01 0.0607 0.0697 0.282 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 893543 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0337 0.09 0.282 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -241674 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0279 0.0913 0.282 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -292784 sc-eQTL 1.77e-01 -0.0594 0.0438 0.282 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -291554 sc-eQTL 4.21e-01 -0.074 0.0917 0.282 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 389897 sc-eQTL 5.90e-01 0.0462 0.0856 0.282 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 120310 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0777 0.101 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 8587 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000251 0.0442 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 893543 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0835 0.079 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -241674 sc-eQTL 1.02e-01 -0.14 0.0853 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -292784 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0287 0.0488 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -291554 sc-eQTL 1.54e-01 0.134 0.0939 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 389897 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0432 0.0624 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 120310 sc-eQTL 4.10e-01 0.0784 0.095 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 8587 sc-eQTL 3.37e-01 0.0497 0.0517 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 893543 sc-eQTL 5.91e-01 0.0515 0.0957 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -241674 sc-eQTL 8.11e-01 0.0228 0.0952 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -292784 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0268 0.0504 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -291554 sc-eQTL 7.73e-01 0.0277 0.0961 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 389897 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0737 0.0665 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 8587 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0487 0.0974 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 893543 sc-eQTL 6.36e-01 -0.048 0.101 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -241674 sc-eQTL 5.84e-01 0.0538 0.0983 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -292784 sc-eQTL 9.50e-02 -0.0757 0.0451 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -291554 sc-eQTL 9.49e-02 0.153 0.091 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 8587 sc-eQTL 7.00e-01 0.0294 0.0762 0.282 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 893543 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0153 0.065 0.282 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -241674 sc-eQTL 8.54e-01 -0.013 0.0706 0.282 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -292784 sc-eQTL 7.68e-01 0.0135 0.0458 0.282 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -291554 sc-eQTL 1.34e-01 0.132 0.0877 0.282 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 8587 sc-eQTL 1.98e-02 0.195 0.0832 0.282 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 893543 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0678 0.0707 0.282 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -241674 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000605 0.0831 0.282 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -292784 sc-eQTL 8.83e-01 0.00633 0.0431 0.282 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -291554 sc-eQTL 8.68e-01 0.0166 0.0997 0.282 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 8587 sc-eQTL 6.92e-01 0.0385 0.097 0.282 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 893543 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0336 0.0894 0.282 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -241674 sc-eQTL 2.35e-01 -0.111 0.0929 0.282 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -292784 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0227 0.0382 0.282 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -291554 sc-eQTL 7.20e-03 0.253 0.0933 0.282 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 8587 sc-eQTL 8.11e-01 0.0192 0.0802 0.282 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 893543 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00192 0.0822 0.282 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -241674 sc-eQTL 1.68e-02 0.217 0.0899 0.282 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -292784 sc-eQTL 3.83e-01 0.0426 0.0487 0.282 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -291554 sc-eQTL 3.90e-01 0.0813 0.0943 0.282 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 8587 sc-eQTL 2.11e-01 0.122 0.0974 0.282 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 893543 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0378 0.0786 0.282 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -241674 sc-eQTL 8.09e-01 0.0204 0.0844 0.282 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -292784 sc-eQTL 8.96e-01 -0.00632 0.0483 0.282 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -291554 sc-eQTL 4.90e-02 0.19 0.0961 0.282 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 8587 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0495 0.0944 0.285 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 893543 sc-eQTL 1.34e-01 -0.142 0.0942 0.285 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -241674 sc-eQTL 2.11e-01 -0.117 0.0933 0.285 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -292784 sc-eQTL 5.66e-01 0.0262 0.0456 0.285 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -291554 sc-eQTL 1.11e-01 0.159 0.0995 0.285 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 8587 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0133 0.102 0.269 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 893543 sc-eQTL 2.79e-01 -0.107 0.0983 0.269 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -241674 sc-eQTL 9.23e-01 0.0098 0.102 0.269 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -292784 sc-eQTL 1.96e-01 -0.0707 0.0545 0.269 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -291554 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0264 0.104 0.269 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 8587 sc-eQTL 7.62e-01 0.0273 0.0903 0.279 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 893543 sc-eQTL 3.37e-01 0.0906 0.0943 0.279 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -241674 sc-eQTL 5.21e-01 -0.059 0.0917 0.279 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -292784 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0243 0.0451 0.279 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -291554 sc-eQTL 4.79e-01 0.0671 0.0946 0.279 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 8587 sc-eQTL 1.84e-01 0.125 0.0936 0.284 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 893543 sc-eQTL 2.38e-01 -0.117 0.0991 0.284 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -241674 sc-eQTL 3.23e-02 0.204 0.0944 0.284 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -292784 sc-eQTL 6.25e-01 0.026 0.0532 0.284 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 8587 sc-eQTL 1.20e-01 0.117 0.0751 0.284 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 893543 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0267 0.0777 0.284 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -241674 sc-eQTL 3.96e-01 0.0803 0.0944 0.284 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -292784 sc-eQTL 6.82e-01 0.0154 0.0375 0.284 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 8587 sc-eQTL 8.41e-01 0.0187 0.093 0.295 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 893543 sc-eQTL 8.31e-01 0.02 0.094 0.295 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -241674 sc-eQTL 4.18e-01 0.0763 0.094 0.295 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -292784 sc-eQTL 4.09e-01 0.0362 0.0438 0.295 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 8587 sc-eQTL 7.71e-01 0.0241 0.0828 0.284 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 893543 sc-eQTL 6.96e-01 0.0335 0.0856 0.284 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -241674 sc-eQTL 3.20e-01 0.0926 0.0928 0.284 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -292784 sc-eQTL 9.94e-01 0.000358 0.0505 0.284 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 120310 sc-eQTL 9.33e-01 0.00828 0.0978 0.3 PB L2
ENSG00000079950 STX7 8587 sc-eQTL 6.92e-01 0.0325 0.0816 0.3 PB L2
ENSG00000112282 MED23 893543 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0451 0.111 0.3 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -241674 sc-eQTL 7.69e-03 0.262 0.0967 0.3 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -292784 sc-eQTL 1.24e-01 -0.087 0.0561 0.3 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -291554 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0496 0.106 0.3 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 389897 sc-eQTL 1.99e-01 -0.0896 0.0693 0.3 PB L2
ENSG00000079950 STX7 8587 sc-eQTL 2.67e-02 0.189 0.0846 0.285 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 893543 sc-eQTL 5.19e-01 0.0621 0.0962 0.285 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -241674 sc-eQTL 5.18e-01 0.0593 0.0917 0.285 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -292784 sc-eQTL 3.35e-01 0.0335 0.0346 0.285 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -291554 sc-eQTL 3.22e-01 0.089 0.0896 0.285 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 8587 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0421 0.0933 0.282 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 893543 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0837 0.0957 0.282 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -241674 sc-eQTL 9.79e-01 0.00209 0.0785 0.282 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -292784 sc-eQTL 8.75e-01 -0.00549 0.0347 0.282 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -291554 sc-eQTL 2.86e-01 0.105 0.0978 0.282 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 8587 sc-eQTL 5.18e-01 0.0524 0.081 0.276 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -212980 sc-eQTL 5.01e-01 0.0542 0.0804 0.276 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 893543 sc-eQTL 2.90e-02 0.227 0.103 0.276 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -192270 sc-eQTL 9.49e-01 0.00608 0.0947 0.276 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -241674 sc-eQTL 5.07e-01 0.0613 0.0921 0.276 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -292784 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0263 0.0455 0.276 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -291554 sc-eQTL 4.28e-01 0.0714 0.09 0.276 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -581343 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0129 0.0721 0.276 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 8587 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0389 0.0614 0.282 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -212980 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000194 0.0868 0.282 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 893543 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0212 0.0858 0.282 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -192270 sc-eQTL 2.50e-01 0.101 0.0873 0.282 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -241674 sc-eQTL 3.66e-02 0.146 0.0693 0.282 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -292784 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0196 0.0389 0.282 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -291554 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0238 0.075 0.282 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 8587 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0233 0.0667 0.282 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -212980 sc-eQTL 1.86e-01 0.11 0.083 0.282 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 893543 sc-eQTL 5.29e-01 0.057 0.0904 0.282 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -192270 sc-eQTL 2.72e-01 0.0994 0.0902 0.282 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -241674 sc-eQTL 1.24e-01 0.0909 0.0589 0.282 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -292784 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0218 0.0426 0.282 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -291554 sc-eQTL 3.17e-01 0.0791 0.0788 0.282 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 8587 sc-eQTL 4.54e-01 0.0805 0.107 0.273 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 893543 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0335 0.115 0.273 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -241674 sc-eQTL 3.42e-01 0.113 0.119 0.273 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -292784 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00365 0.0453 0.273 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -291554 sc-eQTL 1.12e-01 0.186 0.116 0.273 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 8587 sc-eQTL 5.59e-01 0.0519 0.0888 0.282 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -212980 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00132 0.0897 0.282 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 893543 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0129 0.0985 0.282 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -192270 sc-eQTL 2.38e-05 0.367 0.0848 0.282 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -241674 sc-eQTL 7.23e-01 0.032 0.0901 0.282 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -292784 sc-eQTL 6.21e-01 0.0194 0.0392 0.282 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -291554 sc-eQTL 6.39e-01 0.0449 0.0954 0.282 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 8587 sc-eQTL 8.41e-01 0.0134 0.067 0.281 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -212980 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0576 0.0945 0.281 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 893543 sc-eQTL 4.69e-01 0.0694 0.0957 0.281 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -192270 sc-eQTL 7.88e-02 0.165 0.0932 0.281 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -241674 sc-eQTL 7.28e-01 0.0315 0.0902 0.281 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -292784 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00401 0.0453 0.281 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -291554 sc-eQTL 8.72e-01 0.0129 0.08 0.281 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 8587 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0128 0.0753 0.282 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -212980 sc-eQTL 9.56e-01 0.0042 0.0758 0.282 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 893543 sc-eQTL 9.30e-01 0.00927 0.106 0.282 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -192270 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00538 0.0771 0.282 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -241674 sc-eQTL 9.63e-01 0.00425 0.0918 0.282 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -292784 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0325 0.0632 0.282 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -291554 sc-eQTL 9.53e-03 0.24 0.0916 0.282 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -581343 sc-eQTL 9.52e-01 0.00545 0.0896 0.282 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 120310 sc-eQTL 2.31e-02 0.212 0.0926 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 8587 sc-eQTL 7.52e-01 0.0168 0.0531 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 893543 sc-eQTL 7.31e-01 -0.028 0.0813 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -241674 sc-eQTL 9.80e-01 0.00209 0.0841 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -292784 sc-eQTL 1.98e-01 -0.0616 0.0477 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -291554 sc-eQTL 5.13e-01 0.0575 0.0878 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 389897 sc-eQTL 1.95e-01 0.11 0.0845 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 120310 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0101 0.101 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 8587 sc-eQTL 6.41e-01 0.0194 0.0415 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 893543 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0389 0.0779 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -241674 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0819 0.0804 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -292784 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0282 0.0487 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -291554 sc-eQTL 9.78e-02 0.152 0.0914 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 389897 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0635 0.0583 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 8587 sc-eQTL 6.41e-01 -0.024 0.0514 0.282 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -212980 sc-eQTL 4.61e-01 0.0618 0.0836 0.282 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 893543 sc-eQTL 9.76e-01 0.00243 0.0805 0.282 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -192270 sc-eQTL 1.25e-01 0.134 0.0868 0.282 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -241674 sc-eQTL 1.28e-02 0.143 0.0569 0.282 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -292784 sc-eQTL 6.68e-01 -0.017 0.0396 0.282 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -291554 sc-eQTL 7.31e-01 0.0243 0.0704 0.282 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 8587 sc-eQTL 2.55e-01 0.0714 0.0626 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -212980 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0742 0.0923 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 893543 sc-eQTL 4.70e-01 0.0651 0.0899 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -192270 sc-eQTL 4.40e-02 0.184 0.0907 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -241674 sc-eQTL 9.59e-01 0.00448 0.0864 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -292784 sc-eQTL 8.29e-01 0.00794 0.0366 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -291554 sc-eQTL 1.57e-01 0.126 0.0885 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 8587 sc-eQTL 1.68e-01 0.0977 0.0707 0.284 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 893543 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0498 0.0689 0.284 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -241674 sc-eQTL 1.66e-01 0.124 0.0895 0.284 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -292784 sc-eQTL 8.85e-01 0.00533 0.0367 0.284 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 8587 eQTL 0.00101 0.06 0.0182 0.0 0.0 0.243


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000154269 \N 893343 2.67e-07 1.16e-07 3.88e-08 1.82e-07 9.25e-08 9.87e-08 1.42e-07 5.19e-08 1.41e-07 4.57e-08 1.56e-07 8.14e-08 1.3e-07 6.38e-08 6e-08 7.26e-08 3.9e-08 1.18e-07 5.39e-08 4.45e-08 1.05e-07 1.26e-07 1.32e-07 3.79e-08 1.33e-07 1.19e-07 1.08e-07 9.32e-08 1.05e-07 1.1e-07 9.73e-08 3.59e-08 3.3e-08 8.65e-08 8.98e-08 3.95e-08 5.03e-08 9.22e-08 7.47e-08 3.37e-08 4.35e-08 1.31e-07 4.89e-08 1.66e-08 4.67e-08 1.83e-08 1.22e-07 3.79e-09 5.04e-08