Genes within 1Mb (chr6:132519773:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 118298 sc-eQTL 7.50e-01 0.0304 0.0953 0.284 B L1
ENSG00000079950 STX7 6575 sc-eQTL 3.85e-01 0.0313 0.0359 0.284 B L1
ENSG00000112282 MED23 891531 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0347 0.0716 0.284 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -243686 sc-eQTL 8.36e-01 -0.014 0.0676 0.284 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -294796 sc-eQTL 2.19e-01 -0.0502 0.0407 0.284 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -293566 sc-eQTL 1.19e-01 0.134 0.0855 0.284 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 387885 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0299 0.0564 0.284 B L1
ENSG00000079950 STX7 6575 sc-eQTL 4.99e-01 0.0474 0.07 0.284 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 891531 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0493 0.0555 0.284 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -243686 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0606 0.0605 0.284 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -294796 sc-eQTL 7.16e-01 0.015 0.0412 0.284 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -293566 sc-eQTL 4.53e-02 0.166 0.0826 0.284 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 6575 sc-eQTL 5.91e-01 0.0372 0.069 0.284 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 891531 sc-eQTL 2.46e-01 -0.0789 0.0678 0.284 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -243686 sc-eQTL 2.81e-01 0.0869 0.0804 0.284 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -294796 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0291 0.0275 0.284 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -293566 sc-eQTL 2.57e-02 0.185 0.0823 0.284 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 6575 sc-eQTL 3.17e-01 0.0623 0.0621 0.282 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -214992 sc-eQTL 7.47e-02 0.137 0.0766 0.282 DC L1
ENSG00000112282 MED23 891531 sc-eQTL 1.68e-01 0.125 0.0902 0.282 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -194282 sc-eQTL 3.77e-01 0.0737 0.0832 0.282 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -243686 sc-eQTL 3.13e-01 0.09 0.0889 0.282 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -294796 sc-eQTL 6.78e-01 0.0208 0.05 0.282 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -293566 sc-eQTL 2.31e-02 0.179 0.0781 0.282 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -583355 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00826 0.072 0.282 DC L1
ENSG00000079950 STX7 6575 sc-eQTL 8.71e-01 0.00766 0.0471 0.284 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -214992 sc-eQTL 5.19e-01 0.0522 0.0808 0.284 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 891531 sc-eQTL 7.58e-01 0.0237 0.0768 0.284 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -194282 sc-eQTL 1.10e-01 0.139 0.0865 0.284 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -243686 sc-eQTL 1.28e-02 0.152 0.0605 0.284 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -294796 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00214 0.0368 0.284 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -293566 sc-eQTL 5.89e-01 0.0394 0.0728 0.284 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 6575 sc-eQTL 7.75e-02 0.124 0.0696 0.285 NK L1
ENSG00000112282 MED23 891531 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0649 0.064 0.285 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -243686 sc-eQTL 1.20e-01 0.136 0.0868 0.285 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -294796 sc-eQTL 8.84e-01 0.00529 0.0361 0.285 NK L1
ENSG00000079950 STX7 6575 sc-eQTL 3.30e-01 0.0685 0.0702 0.284 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 891531 sc-eQTL 5.90e-01 0.0474 0.0878 0.284 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -243686 sc-eQTL 9.17e-01 0.00885 0.0851 0.284 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -294796 sc-eQTL 7.00e-01 -0.013 0.0337 0.284 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -293566 sc-eQTL 4.02e-01 0.0774 0.0922 0.284 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 118298 sc-eQTL 9.26e-02 0.16 0.0948 0.278 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 6575 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0189 0.0896 0.278 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 891531 sc-eQTL 6.66e-01 0.0428 0.0992 0.278 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -243686 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0414 0.0953 0.278 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -294796 sc-eQTL 1.53e-01 0.0728 0.0508 0.278 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -293566 sc-eQTL 6.87e-01 0.036 0.0894 0.278 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 387885 sc-eQTL 4.15e-02 0.173 0.0843 0.278 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 118298 sc-eQTL 2.69e-01 0.0963 0.0869 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 6575 sc-eQTL 7.86e-01 0.0155 0.0571 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 891531 sc-eQTL 6.54e-01 -0.039 0.0868 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -243686 sc-eQTL 6.49e-01 0.0391 0.0859 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -294796 sc-eQTL 1.93e-01 -0.0684 0.0524 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -293566 sc-eQTL 1.11e-01 0.151 0.0942 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 387885 sc-eQTL 8.52e-02 -0.138 0.08 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 118298 sc-eQTL 7.50e-01 0.0281 0.088 0.284 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 6575 sc-eQTL 4.48e-01 0.0524 0.069 0.284 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 891531 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0184 0.089 0.284 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -243686 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0222 0.0903 0.284 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -294796 sc-eQTL 1.36e-01 -0.0648 0.0433 0.284 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -293566 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0639 0.0907 0.284 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 387885 sc-eQTL 6.50e-01 0.0385 0.0846 0.284 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 118298 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0844 0.0999 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 6575 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00379 0.0437 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 891531 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0776 0.0781 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -243686 sc-eQTL 9.97e-02 -0.139 0.0844 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -294796 sc-eQTL 4.70e-01 -0.035 0.0483 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -293566 sc-eQTL 1.41e-01 0.137 0.0928 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 387885 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0424 0.0617 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 118298 sc-eQTL 4.28e-01 0.0747 0.0939 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 6575 sc-eQTL 4.10e-01 0.0422 0.0512 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 891531 sc-eQTL 4.83e-01 0.0664 0.0945 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -243686 sc-eQTL 8.87e-01 0.0134 0.0941 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -294796 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0299 0.0498 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -293566 sc-eQTL 7.99e-01 0.0242 0.095 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 387885 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0592 0.0657 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 6575 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0409 0.096 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 891531 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0395 0.0998 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -243686 sc-eQTL 6.42e-01 0.0451 0.0968 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -294796 sc-eQTL 8.01e-02 -0.0781 0.0444 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -293566 sc-eQTL 6.29e-02 0.167 0.0894 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 6575 sc-eQTL 7.05e-01 0.0286 0.0753 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 891531 sc-eQTL 8.86e-01 -0.00922 0.0643 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -243686 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0197 0.0698 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -294796 sc-eQTL 7.83e-01 0.0125 0.0453 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -293566 sc-eQTL 1.31e-01 0.131 0.0867 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 6575 sc-eQTL 1.52e-02 0.201 0.0822 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 891531 sc-eQTL 3.39e-01 -0.067 0.0699 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -243686 sc-eQTL 9.23e-01 0.00791 0.0822 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -294796 sc-eQTL 9.69e-01 0.00164 0.0426 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -293566 sc-eQTL 7.54e-01 0.0309 0.0986 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 6575 sc-eQTL 6.86e-01 0.0388 0.0959 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 891531 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0372 0.0883 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -243686 sc-eQTL 2.32e-01 -0.11 0.0917 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -294796 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0254 0.0377 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -293566 sc-eQTL 6.42e-03 0.254 0.0922 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 6575 sc-eQTL 9.05e-01 0.00949 0.0793 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 891531 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00228 0.0812 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -243686 sc-eQTL 1.04e-02 0.229 0.0887 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -294796 sc-eQTL 4.88e-01 0.0334 0.0481 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -293566 sc-eQTL 4.90e-01 0.0646 0.0933 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 6575 sc-eQTL 2.28e-01 0.117 0.0964 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 891531 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0432 0.0777 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -243686 sc-eQTL 7.45e-01 0.0272 0.0835 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -294796 sc-eQTL 8.76e-01 -0.00744 0.0478 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -293566 sc-eQTL 5.71e-02 0.182 0.0951 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 6575 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0474 0.0933 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 891531 sc-eQTL 1.31e-01 -0.141 0.0932 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -243686 sc-eQTL 1.60e-01 -0.13 0.0922 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -294796 sc-eQTL 6.06e-01 0.0233 0.0451 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -293566 sc-eQTL 1.05e-01 0.16 0.0983 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 6575 sc-eQTL 9.87e-01 0.0017 0.102 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 891531 sc-eQTL 2.17e-01 -0.121 0.098 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -243686 sc-eQTL 7.80e-01 0.0285 0.102 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -294796 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0614 0.0545 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -293566 sc-eQTL 8.47e-01 -0.02 0.103 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 6575 sc-eQTL 9.00e-01 0.0112 0.0893 0.281 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 891531 sc-eQTL 3.10e-01 0.0949 0.0932 0.281 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -243686 sc-eQTL 4.28e-01 -0.072 0.0907 0.281 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -294796 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0278 0.0447 0.281 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -293566 sc-eQTL 4.46e-01 0.0714 0.0936 0.281 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 6575 sc-eQTL 1.51e-01 0.133 0.0925 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 891531 sc-eQTL 2.45e-01 -0.114 0.098 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -243686 sc-eQTL 2.50e-02 0.21 0.0932 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -294796 sc-eQTL 6.83e-01 0.0215 0.0526 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 6575 sc-eQTL 1.18e-01 0.117 0.0743 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 891531 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0167 0.0768 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -243686 sc-eQTL 4.14e-01 0.0764 0.0934 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -294796 sc-eQTL 7.45e-01 0.0121 0.0371 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 6575 sc-eQTL 7.77e-01 0.0261 0.092 0.297 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 891531 sc-eQTL 9.82e-01 0.00212 0.093 0.297 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -243686 sc-eQTL 4.69e-01 0.0675 0.093 0.297 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -294796 sc-eQTL 4.82e-01 0.0305 0.0433 0.297 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 6575 sc-eQTL 7.18e-01 0.0295 0.0818 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 891531 sc-eQTL 7.08e-01 0.0317 0.0846 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -243686 sc-eQTL 3.00e-01 0.0953 0.0917 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -294796 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0062 0.0499 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 118298 sc-eQTL 9.35e-01 0.00789 0.0964 0.304 PB L2
ENSG00000079950 STX7 6575 sc-eQTL 7.65e-01 0.0241 0.0805 0.304 PB L2
ENSG00000112282 MED23 891531 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0315 0.109 0.304 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -243686 sc-eQTL 1.56e-02 0.235 0.0958 0.304 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -294796 sc-eQTL 8.52e-02 -0.0957 0.0551 0.304 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -293566 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0386 0.105 0.304 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 387885 sc-eQTL 1.79e-01 -0.0923 0.0683 0.304 PB L2
ENSG00000079950 STX7 6575 sc-eQTL 3.12e-02 0.182 0.0837 0.287 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 891531 sc-eQTL 4.38e-01 0.0739 0.0951 0.287 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -243686 sc-eQTL 5.69e-01 0.0517 0.0907 0.287 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -294796 sc-eQTL 3.36e-01 0.0331 0.0343 0.287 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -293566 sc-eQTL 3.68e-01 0.08 0.0887 0.287 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 6575 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0456 0.0923 0.284 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 891531 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0883 0.0947 0.284 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -243686 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00245 0.0777 0.284 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -294796 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0051 0.0344 0.284 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -293566 sc-eQTL 2.53e-01 0.111 0.0968 0.284 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 6575 sc-eQTL 5.11e-01 0.0526 0.08 0.278 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -214992 sc-eQTL 4.43e-01 0.0611 0.0794 0.278 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 891531 sc-eQTL 2.83e-02 0.226 0.102 0.278 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -194282 sc-eQTL 9.27e-01 0.00858 0.0935 0.278 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -243686 sc-eQTL 5.36e-01 0.0564 0.091 0.278 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -294796 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0232 0.0449 0.278 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -293566 sc-eQTL 4.59e-01 0.066 0.0889 0.278 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -583355 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0187 0.0712 0.278 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 6575 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0363 0.0607 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -214992 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00793 0.0858 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 891531 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0138 0.0849 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -194282 sc-eQTL 2.35e-01 0.103 0.0863 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -243686 sc-eQTL 3.63e-02 0.144 0.0685 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -294796 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0113 0.0385 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -293566 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0274 0.0742 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 6575 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0192 0.066 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -214992 sc-eQTL 2.24e-01 0.1 0.0822 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 891531 sc-eQTL 5.42e-01 0.0546 0.0894 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -194282 sc-eQTL 2.68e-01 0.0992 0.0893 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -243686 sc-eQTL 1.23e-01 0.0902 0.0583 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -294796 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0179 0.0422 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -293566 sc-eQTL 3.87e-01 0.0676 0.078 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 6575 sc-eQTL 5.26e-01 0.0671 0.106 0.276 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 891531 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0151 0.113 0.276 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -243686 sc-eQTL 3.00e-01 0.121 0.116 0.276 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -294796 sc-eQTL 8.47e-01 -0.00858 0.0445 0.276 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -293566 sc-eQTL 9.00e-02 0.194 0.114 0.276 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 6575 sc-eQTL 5.99e-01 0.0462 0.0878 0.284 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -214992 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00913 0.0887 0.284 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 891531 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0216 0.0974 0.284 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -194282 sc-eQTL 1.44e-05 0.372 0.0837 0.284 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -243686 sc-eQTL 6.33e-01 0.0426 0.089 0.284 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -294796 sc-eQTL 5.53e-01 0.023 0.0387 0.284 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -293566 sc-eQTL 7.10e-01 0.0352 0.0943 0.284 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 6575 sc-eQTL 8.72e-01 0.0107 0.0663 0.283 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -214992 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0616 0.0934 0.283 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 891531 sc-eQTL 4.85e-01 0.0662 0.0946 0.283 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -194282 sc-eQTL 7.44e-02 0.165 0.0921 0.283 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -243686 sc-eQTL 7.66e-01 0.0266 0.0892 0.283 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -294796 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00221 0.0448 0.283 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -293566 sc-eQTL 9.41e-01 0.00587 0.0791 0.283 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 6575 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0218 0.0742 0.285 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -214992 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00194 0.0747 0.285 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 891531 sc-eQTL 8.83e-01 0.0153 0.104 0.285 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -194282 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00802 0.076 0.285 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -243686 sc-eQTL 8.75e-01 0.0142 0.0905 0.285 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -294796 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0242 0.0623 0.285 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -293566 sc-eQTL 8.35e-03 0.241 0.0902 0.285 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -583355 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00737 0.0883 0.285 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 118298 sc-eQTL 3.83e-02 0.191 0.0919 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 6575 sc-eQTL 8.83e-01 0.00773 0.0526 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 891531 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0209 0.0805 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -243686 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00365 0.0832 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -294796 sc-eQTL 1.52e-01 -0.0678 0.0472 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -293566 sc-eQTL 4.94e-01 0.0595 0.0869 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 387885 sc-eQTL 1.77e-01 0.113 0.0835 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 118298 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0213 0.1 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 6575 sc-eQTL 7.22e-01 0.0146 0.0411 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 891531 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0301 0.0771 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -243686 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0839 0.0795 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -294796 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0341 0.0482 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -293566 sc-eQTL 9.51e-02 0.152 0.0904 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 387885 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0594 0.0577 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 6575 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0214 0.0508 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -214992 sc-eQTL 5.36e-01 0.0513 0.0828 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 891531 sc-eQTL 9.24e-01 0.00761 0.0796 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -194282 sc-eQTL 1.19e-01 0.134 0.0859 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -243686 sc-eQTL 1.33e-02 0.141 0.0563 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -294796 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0101 0.0392 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -293566 sc-eQTL 8.07e-01 0.017 0.0697 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 6575 sc-eQTL 2.83e-01 0.0667 0.062 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -214992 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0797 0.0912 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 891531 sc-eQTL 5.07e-01 0.0592 0.0889 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -194282 sc-eQTL 3.94e-02 0.186 0.0897 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -243686 sc-eQTL 9.78e-01 0.00236 0.0854 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -294796 sc-eQTL 7.87e-01 0.00978 0.0362 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -293566 sc-eQTL 1.95e-01 0.114 0.0876 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 6575 sc-eQTL 1.56e-01 0.0997 0.0699 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 891531 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0429 0.0682 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -243686 sc-eQTL 1.67e-01 0.123 0.0885 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -294796 sc-eQTL 9.60e-01 0.00184 0.0363 0.287 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 6575 eQTL 0.001 0.06 0.0182 0.0 0.0 0.243


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000154269 \N 891331 2.69e-07 1.11e-07 3.59e-08 1.78e-07 8.92e-08 9.71e-08 1.38e-07 5.33e-08 1.4e-07 4.4e-08 1.56e-07 7.78e-08 1.33e-07 6.38e-08 5.53e-08 7.26e-08 3.88e-08 1.14e-07 5.19e-08 4.2e-08 1.04e-07 1.27e-07 1.32e-07 4.13e-08 1.33e-07 1.19e-07 1.12e-07 9.15e-08 1.03e-07 1.11e-07 9.91e-08 3.96e-08 3.26e-08 8.65e-08 8.87e-08 3.77e-08 5.06e-08 9.49e-08 7.52e-08 3.55e-08 4.39e-08 1.31e-07 4.04e-08 3.16e-08 6.38e-08 1.68e-08 1.26e-07 3.99e-09 4.73e-08