Genes within 1Mb (chr6:132518841:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 117366 sc-eQTL 5.82e-02 0.262 0.138 0.118 B L1
ENSG00000079950 STX7 5643 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0324 0.0524 0.118 B L1
ENSG00000112282 MED23 890599 sc-eQTL 1.24e-01 -0.161 0.104 0.118 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -244618 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0218 0.0986 0.118 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -295728 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0446 0.0595 0.118 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -294498 sc-eQTL 1.22e-01 0.194 0.125 0.118 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 386953 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0749 0.0822 0.118 B L1
ENSG00000079950 STX7 5643 sc-eQTL 5.58e-01 0.0594 0.101 0.118 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 890599 sc-eQTL 7.97e-01 0.0207 0.0803 0.118 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -244618 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0435 0.0876 0.118 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -295728 sc-eQTL 6.26e-01 0.0291 0.0596 0.118 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -294498 sc-eQTL 5.81e-02 0.228 0.12 0.118 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 5643 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0224 0.101 0.118 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 890599 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0413 0.0998 0.118 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -244618 sc-eQTL 9.78e-01 0.00319 0.118 0.118 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -295728 sc-eQTL 3.65e-01 0.0367 0.0404 0.118 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -294498 sc-eQTL 4.37e-03 0.346 0.12 0.118 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 5643 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0369 0.0925 0.119 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -215924 sc-eQTL 8.25e-01 0.0254 0.115 0.119 DC L1
ENSG00000112282 MED23 890599 sc-eQTL 6.82e-01 0.0552 0.135 0.119 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -195214 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0724 0.124 0.119 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -244618 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00283 0.133 0.119 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -295728 sc-eQTL 2.97e-01 0.0776 0.0741 0.119 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -294498 sc-eQTL 1.05e-01 0.19 0.117 0.119 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -584287 sc-eQTL 1.56e-01 -0.152 0.107 0.119 DC L1
ENSG00000079950 STX7 5643 sc-eQTL 4.22e-02 -0.141 0.0687 0.118 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -215924 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0675 0.119 0.118 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 890599 sc-eQTL 5.09e-01 0.0748 0.113 0.118 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -195214 sc-eQTL 6.68e-01 0.0551 0.128 0.118 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -244618 sc-eQTL 4.77e-01 0.0643 0.0904 0.118 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -295728 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0161 0.0542 0.118 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -294498 sc-eQTL 4.05e-01 0.0893 0.107 0.118 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 5643 sc-eQTL 8.16e-01 -0.024 0.103 0.118 NK L1
ENSG00000112282 MED23 890599 sc-eQTL 4.45e-01 -0.072 0.0942 0.118 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -244618 sc-eQTL 8.68e-01 0.0214 0.128 0.118 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -295728 sc-eQTL 4.05e-01 0.0443 0.053 0.118 NK L1
ENSG00000079950 STX7 5643 sc-eQTL 7.18e-01 0.0368 0.102 0.118 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 890599 sc-eQTL 5.84e-01 0.0697 0.127 0.118 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -244618 sc-eQTL 5.09e-01 0.0813 0.123 0.118 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -295728 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0101 0.0488 0.118 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -294498 sc-eQTL 1.54e-01 0.19 0.133 0.118 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 117366 sc-eQTL 5.83e-03 0.397 0.142 0.11 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 5643 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0259 0.136 0.11 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 890599 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0387 0.151 0.11 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -244618 sc-eQTL 6.39e-01 0.0681 0.145 0.11 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -295728 sc-eQTL 5.44e-01 0.0472 0.0777 0.11 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -294498 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0311 0.136 0.11 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 386953 sc-eQTL 3.64e-02 0.27 0.128 0.11 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 117366 sc-eQTL 3.88e-02 0.263 0.126 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 5643 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0634 0.0834 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 890599 sc-eQTL 1.78e-01 -0.171 0.126 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -244618 sc-eQTL 8.08e-02 0.219 0.125 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -295728 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0654 0.0769 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -294498 sc-eQTL 2.92e-01 0.146 0.138 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 386953 sc-eQTL 1.69e-01 -0.162 0.117 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 117366 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0555 0.129 0.116 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 5643 sc-eQTL 7.28e-01 0.0353 0.101 0.116 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 890599 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00197 0.131 0.116 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -244618 sc-eQTL 4.98e-01 -0.09 0.133 0.116 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -295728 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0121 0.0639 0.116 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -294498 sc-eQTL 1.45e-01 0.194 0.133 0.116 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 386953 sc-eQTL 6.72e-01 0.0528 0.124 0.116 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 117366 sc-eQTL 5.99e-01 0.0758 0.144 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 5643 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0663 0.0627 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 890599 sc-eQTL 2.29e-01 -0.135 0.112 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -244618 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0927 0.122 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -295728 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0192 0.0695 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -294498 sc-eQTL 1.86e-01 0.177 0.134 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 386953 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0356 0.0888 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 117366 sc-eQTL 8.79e-01 0.0207 0.135 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 5643 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0299 0.0738 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 890599 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0303 0.136 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -244618 sc-eQTL 6.51e-01 0.0614 0.135 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -295728 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0218 0.0717 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -294498 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0693 0.137 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 386953 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0753 0.0947 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 5643 sc-eQTL 4.40e-01 0.111 0.143 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 890599 sc-eQTL 4.81e-01 -0.105 0.149 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -244618 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0642 0.144 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -295728 sc-eQTL 1.92e-01 -0.0871 0.0665 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -294498 sc-eQTL 5.62e-01 0.078 0.134 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 5643 sc-eQTL 8.45e-01 0.0212 0.109 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 890599 sc-eQTL 3.07e-01 0.0947 0.0925 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -244618 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0221 0.101 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -295728 sc-eQTL 6.77e-01 0.0272 0.0652 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -294498 sc-eQTL 8.40e-02 0.217 0.125 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 5643 sc-eQTL 1.17e-01 0.189 0.12 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 890599 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0147 0.102 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -244618 sc-eQTL 5.11e-01 0.0784 0.119 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -295728 sc-eQTL 3.07e-01 0.0631 0.0616 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -294498 sc-eQTL 9.79e-02 0.236 0.142 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 5643 sc-eQTL 6.35e-01 0.0661 0.139 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 890599 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0368 0.128 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -244618 sc-eQTL 5.50e-01 0.0799 0.133 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -295728 sc-eQTL 9.84e-01 0.0011 0.0548 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -294498 sc-eQTL 3.63e-03 0.393 0.133 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 5643 sc-eQTL 3.04e-01 -0.12 0.117 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 890599 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0187 0.12 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -244618 sc-eQTL 8.26e-01 0.0293 0.133 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -295728 sc-eQTL 5.14e-01 0.0464 0.0711 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -294498 sc-eQTL 4.02e-01 0.116 0.138 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 5643 sc-eQTL 5.43e-02 0.266 0.137 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 890599 sc-eQTL 1.63e-01 0.155 0.111 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -244618 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0281 0.12 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -295728 sc-eQTL 9.15e-01 0.00735 0.0684 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -294498 sc-eQTL 8.36e-03 0.36 0.135 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 5643 sc-eQTL 8.77e-01 0.0212 0.137 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 890599 sc-eQTL 1.38e-01 -0.204 0.137 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -244618 sc-eQTL 3.51e-01 -0.127 0.136 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -295728 sc-eQTL 2.57e-01 0.0751 0.066 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -294498 sc-eQTL 9.02e-03 0.376 0.143 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 5643 sc-eQTL 3.09e-01 -0.15 0.147 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 890599 sc-eQTL 2.40e-01 -0.166 0.141 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -244618 sc-eQTL 4.95e-01 0.0998 0.146 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -295728 sc-eQTL 1.37e-01 -0.117 0.0782 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -294498 sc-eQTL 6.38e-01 -0.07 0.149 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 5643 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0174 0.13 0.117 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 890599 sc-eQTL 3.52e-02 0.285 0.134 0.117 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -244618 sc-eQTL 8.36e-01 0.0274 0.132 0.117 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -295728 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0529 0.0648 0.117 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -294498 sc-eQTL 7.52e-01 0.0431 0.136 0.117 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 5643 sc-eQTL 5.79e-01 0.0761 0.137 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 890599 sc-eQTL 2.51e-01 -0.166 0.144 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -244618 sc-eQTL 4.97e-01 0.0946 0.139 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -295728 sc-eQTL 1.39e-01 0.114 0.0771 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 5643 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0348 0.109 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 890599 sc-eQTL 3.69e-01 -0.1 0.112 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -244618 sc-eQTL 9.37e-01 0.0108 0.136 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -295728 sc-eQTL 3.66e-01 0.0488 0.0539 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 5643 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0838 0.13 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 890599 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00456 0.132 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -244618 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00627 0.132 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -295728 sc-eQTL 5.79e-02 0.116 0.061 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 5643 sc-eQTL 3.03e-01 -0.124 0.12 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 890599 sc-eQTL 1.35e-01 0.186 0.124 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -244618 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0496 0.136 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -295728 sc-eQTL 3.82e-01 0.0645 0.0736 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 117366 sc-eQTL 3.31e-01 0.142 0.145 0.122 PB L2
ENSG00000079950 STX7 5643 sc-eQTL 6.67e-01 0.0525 0.122 0.122 PB L2
ENSG00000112282 MED23 890599 sc-eQTL 6.41e-01 0.0773 0.165 0.122 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -244618 sc-eQTL 2.05e-01 0.188 0.148 0.122 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -295728 sc-eQTL 1.55e-01 -0.12 0.0837 0.122 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -294498 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0201 0.158 0.122 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 386953 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0963 0.104 0.122 PB L2
ENSG00000079950 STX7 5643 sc-eQTL 6.69e-01 0.0527 0.123 0.12 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 890599 sc-eQTL 7.27e-01 0.0483 0.138 0.12 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -244618 sc-eQTL 4.39e-01 0.102 0.132 0.12 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -295728 sc-eQTL 2.10e-01 0.0625 0.0497 0.12 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -294498 sc-eQTL 5.56e-01 0.0761 0.129 0.12 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 5643 sc-eQTL 5.99e-01 0.0698 0.133 0.118 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 890599 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0612 0.136 0.118 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -244618 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0425 0.112 0.118 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -295728 sc-eQTL 6.16e-01 0.0248 0.0494 0.118 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -294498 sc-eQTL 7.88e-01 0.0376 0.139 0.118 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 5643 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0863 0.12 0.112 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -215924 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0722 0.119 0.112 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 890599 sc-eQTL 1.09e-01 0.249 0.154 0.112 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -195214 sc-eQTL 1.20e-01 -0.218 0.14 0.112 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -244618 sc-eQTL 6.71e-01 0.0583 0.137 0.112 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -295728 sc-eQTL 6.79e-01 -0.028 0.0676 0.112 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -294498 sc-eQTL 4.32e-01 0.105 0.134 0.112 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -584287 sc-eQTL 2.29e-01 -0.129 0.107 0.112 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 5643 sc-eQTL 2.78e-03 -0.265 0.0876 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -215924 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0412 0.126 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 890599 sc-eQTL 8.31e-01 0.0267 0.125 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -195214 sc-eQTL 7.94e-01 0.0333 0.128 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -244618 sc-eQTL 2.93e-01 0.107 0.102 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -295728 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0187 0.0566 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -294498 sc-eQTL 7.78e-01 0.0309 0.109 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 5643 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0324 0.0973 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -215924 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0722 0.121 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 890599 sc-eQTL 3.42e-01 0.125 0.132 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -195214 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00516 0.132 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -244618 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0211 0.0864 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -295728 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0277 0.0622 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -294498 sc-eQTL 7.90e-01 0.0307 0.115 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 5643 sc-eQTL 7.21e-01 0.0548 0.154 0.121 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 890599 sc-eQTL 4.96e-01 -0.112 0.164 0.121 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -244618 sc-eQTL 1.40e-01 0.25 0.169 0.121 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -295728 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0542 0.0646 0.121 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -294498 sc-eQTL 1.32e-02 0.411 0.164 0.121 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 5643 sc-eQTL 3.17e-01 0.129 0.128 0.118 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -215924 sc-eQTL 4.28e-01 0.103 0.129 0.118 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 890599 sc-eQTL 3.08e-01 -0.145 0.142 0.118 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -195214 sc-eQTL 1.94e-02 0.298 0.126 0.118 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -244618 sc-eQTL 2.35e-01 -0.155 0.13 0.118 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -295728 sc-eQTL 5.06e-01 0.0377 0.0566 0.118 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -294498 sc-eQTL 3.11e-01 0.14 0.138 0.118 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 5643 sc-eQTL 2.39e-01 -0.111 0.0941 0.118 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -215924 sc-eQTL 3.98e-01 -0.113 0.133 0.118 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 890599 sc-eQTL 5.60e-01 0.0788 0.135 0.118 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -195214 sc-eQTL 5.95e-01 0.0703 0.132 0.118 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -244618 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0632 0.127 0.118 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -295728 sc-eQTL 4.52e-01 0.048 0.0637 0.118 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -294498 sc-eQTL 6.19e-02 0.21 0.112 0.118 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 5643 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0549 0.111 0.113 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -215924 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0137 0.112 0.113 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 890599 sc-eQTL 4.92e-01 0.107 0.156 0.113 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -195214 sc-eQTL 5.99e-01 -0.06 0.114 0.113 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -244618 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0935 0.135 0.113 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -295728 sc-eQTL 9.28e-01 0.0085 0.0933 0.113 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -294498 sc-eQTL 1.90e-01 0.181 0.137 0.113 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -584287 sc-eQTL 1.06e-01 -0.213 0.131 0.113 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 117366 sc-eQTL 4.25e-02 0.277 0.136 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 5643 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00557 0.0777 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 890599 sc-eQTL 1.73e-01 -0.162 0.118 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -244618 sc-eQTL 6.30e-01 0.0593 0.123 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -295728 sc-eQTL 2.25e-01 -0.085 0.0697 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -294498 sc-eQTL 3.65e-01 0.116 0.128 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 386953 sc-eQTL 4.75e-01 0.0885 0.124 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 117366 sc-eQTL 4.05e-01 0.12 0.143 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 5643 sc-eQTL 2.62e-01 -0.066 0.0587 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 890599 sc-eQTL 2.13e-01 -0.138 0.11 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -244618 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0564 0.114 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -295728 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0266 0.0692 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -294498 sc-eQTL 3.20e-01 0.13 0.13 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 386953 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0859 0.0827 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 5643 sc-eQTL 6.07e-03 -0.203 0.0733 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -215924 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0423 0.122 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 890599 sc-eQTL 5.12e-01 0.0767 0.117 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -195214 sc-eQTL 6.36e-01 0.0601 0.127 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -244618 sc-eQTL 4.67e-01 0.061 0.0837 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -295728 sc-eQTL 7.55e-01 -0.018 0.0575 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -294498 sc-eQTL 5.83e-01 0.0562 0.102 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 5643 sc-eQTL 6.89e-01 0.036 0.0898 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -215924 sc-eQTL 7.34e-01 -0.045 0.132 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 890599 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0187 0.129 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -195214 sc-eQTL 5.57e-01 0.077 0.131 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -244618 sc-eQTL 2.94e-01 -0.13 0.123 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -295728 sc-eQTL 2.77e-01 0.0569 0.0523 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -294498 sc-eQTL 4.55e-03 0.358 0.125 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 5643 sc-eQTL 6.71e-01 -0.044 0.103 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 890599 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0527 0.1 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -244618 sc-eQTL 8.19e-01 0.03 0.131 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -295728 sc-eQTL 3.93e-01 0.0456 0.0533 0.119 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079931 MOXD1 117366 eQTL 0.0375 0.0963 0.0462 0.0 0.0 0.108
ENSG00000079950 STX7 5643 pQTL 1.89e-07 -0.184 0.0351 0.0 0.0 0.107
ENSG00000079950 STX7 5643 eQTL 2.18e-06 -0.115 0.0242 0.0 0.0 0.108
ENSG00000234484 AL032821.1 -233834 eQTL 0.0497 0.094 0.0478 0.0 0.0 0.108


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079950 STX7 5643 3.54e-05 3.25e-05 6.07e-06 1.54e-05 5.65e-06 1.38e-05 4.33e-05 4.44e-06 2.98e-05 1.49e-05 3.69e-05 1.63e-05 4.6e-05 1.35e-05 6.84e-06 1.81e-05 1.65e-05 2.44e-05 7.62e-06 6.57e-06 1.43e-05 3.17e-05 3.06e-05 8.57e-06 4.3e-05 7.8e-06 1.35e-05 1.26e-05 3.11e-05 2.4e-05 1.96e-05 1.61e-06 2.53e-06 6.95e-06 1.12e-05 5.61e-06 2.98e-06 3.17e-06 4.54e-06 3.22e-06 1.72e-06 3.66e-05 3.5e-06 3.6e-07 2.32e-06 3.75e-06 4.09e-06 1.53e-06 1.53e-06
ENSG00000093134 \N -215924 1.4e-06 2.09e-06 2.14e-07 1.42e-06 3.37e-07 6.94e-07 1.52e-06 4.08e-07 1.73e-06 6.73e-07 2e-06 7.37e-07 2.6e-06 3.58e-07 4.81e-07 9.54e-07 9.15e-07 9.58e-07 8.59e-07 5.13e-07 7.49e-07 1.97e-06 1.11e-06 6.4e-07 2.41e-06 7.81e-07 1.01e-06 8.7e-07 1.59e-06 1.25e-06 8.35e-07 2.62e-07 1.89e-07 6.08e-07 8.57e-07 4.66e-07 6.8e-07 3.45e-07 4.87e-07 3.15e-07 2.8e-07 1.95e-06 4.42e-07 1.99e-07 1.67e-07 3.25e-07 2.66e-07 1.41e-07 1.71e-07