Genes within 1Mb (chr6:132515437:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 113962 sc-eQTL 2.42e-01 0.123 0.105 0.265 B L1
ENSG00000079950 STX7 2239 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0275 0.0396 0.265 B L1
ENSG00000112282 MED23 887195 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00766 0.0791 0.265 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -248022 sc-eQTL 7.89e-01 -0.02 0.0746 0.265 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -299132 sc-eQTL 5.72e-01 0.0255 0.0451 0.265 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -297902 sc-eQTL 5.03e-01 0.0636 0.0948 0.265 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 383549 sc-eQTL 6.72e-02 0.114 0.0618 0.265 B L1
ENSG00000079950 STX7 2239 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0646 0.0761 0.265 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 887195 sc-eQTL 1.50e-01 -0.0871 0.0602 0.265 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -248022 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0626 0.0659 0.265 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -299132 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0342 0.0448 0.265 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -297902 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0507 0.0908 0.265 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 2239 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0866 0.0766 0.265 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 887195 sc-eQTL 1.04e-01 -0.123 0.0752 0.265 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -248022 sc-eQTL 6.29e-01 0.0434 0.0896 0.265 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -299132 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0124 0.0306 0.265 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -297902 sc-eQTL 6.96e-01 0.0362 0.0926 0.265 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 2239 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0726 0.0698 0.273 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -219328 sc-eQTL 1.50e-01 0.125 0.0863 0.273 DC L1
ENSG00000112282 MED23 887195 sc-eQTL 7.24e-02 0.182 0.101 0.273 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -198618 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0658 0.0935 0.273 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -248022 sc-eQTL 4.96e-01 0.0682 0.1 0.273 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -299132 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0149 0.0562 0.273 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -297902 sc-eQTL 6.95e-02 -0.161 0.0882 0.273 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -587691 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0308 0.0809 0.273 DC L1
ENSG00000079950 STX7 2239 sc-eQTL 8.42e-01 0.0102 0.0512 0.265 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -219328 sc-eQTL 4.01e-01 0.0739 0.0878 0.265 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 887195 sc-eQTL 1.87e-01 -0.11 0.0832 0.265 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -198618 sc-eQTL 5.00e-01 0.0638 0.0945 0.265 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -248022 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0376 0.0667 0.265 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -299132 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0358 0.0399 0.265 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -297902 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0306 0.0791 0.265 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 2239 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0588 0.0764 0.266 NK L1
ENSG00000112282 MED23 887195 sc-eQTL 1.78e-01 0.0943 0.0697 0.266 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -248022 sc-eQTL 4.36e-01 0.0742 0.0951 0.266 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -299132 sc-eQTL 1.07e-01 -0.0633 0.0392 0.266 NK L1
ENSG00000079950 STX7 2239 sc-eQTL 8.10e-01 0.0188 0.0782 0.265 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 887195 sc-eQTL 2.39e-01 0.115 0.0974 0.265 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -248022 sc-eQTL 2.50e-01 0.109 0.0943 0.265 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -299132 sc-eQTL 7.59e-02 -0.0664 0.0372 0.265 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -297902 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0275 0.103 0.265 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 113962 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0135 0.102 0.283 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 2239 sc-eQTL 6.72e-01 0.0408 0.096 0.283 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 887195 sc-eQTL 4.84e-01 0.0746 0.106 0.283 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -248022 sc-eQTL 5.79e-01 0.0568 0.102 0.283 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -299132 sc-eQTL 6.51e-01 0.0248 0.0548 0.283 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -297902 sc-eQTL 7.86e-01 0.0261 0.0959 0.283 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 383549 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0153 0.0915 0.283 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 113962 sc-eQTL 2.21e-01 0.116 0.0948 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 2239 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0501 0.0622 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 887195 sc-eQTL 5.71e-01 0.0536 0.0947 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -248022 sc-eQTL 2.86e-01 0.1 0.0935 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -299132 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0251 0.0574 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -297902 sc-eQTL 1.92e-01 -0.135 0.103 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 383549 sc-eQTL 3.05e-01 0.0902 0.0877 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 113962 sc-eQTL 1.91e-01 0.126 0.0962 0.263 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 2239 sc-eQTL 8.47e-01 0.0146 0.0758 0.263 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 887195 sc-eQTL 7.13e-01 0.0359 0.0976 0.263 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -248022 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0779 0.099 0.263 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -299132 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0378 0.0477 0.263 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -297902 sc-eQTL 1.91e-01 0.13 0.0993 0.263 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 383549 sc-eQTL 3.44e-01 0.088 0.0927 0.263 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 113962 sc-eQTL 1.42e-01 0.159 0.108 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 2239 sc-eQTL 8.09e-01 0.0115 0.0475 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 887195 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0586 0.0849 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -248022 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0919 0.092 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -299132 sc-eQTL 1.97e-01 -0.0676 0.0523 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -297902 sc-eQTL 6.23e-01 0.0498 0.101 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 383549 sc-eQTL 5.64e-01 0.0387 0.067 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 113962 sc-eQTL 7.63e-02 0.179 0.101 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 2239 sc-eQTL 8.76e-01 0.00866 0.0552 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 887195 sc-eQTL 6.40e-02 -0.188 0.101 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -248022 sc-eQTL 9.61e-01 -0.005 0.101 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -299132 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0216 0.0536 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -297902 sc-eQTL 8.57e-02 0.176 0.102 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 383549 sc-eQTL 1.01e-01 0.116 0.0705 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 2239 sc-eQTL 7.70e-02 0.179 0.101 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 887195 sc-eQTL 9.36e-01 0.00849 0.106 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -248022 sc-eQTL 9.49e-02 0.171 0.102 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -299132 sc-eQTL 9.50e-01 0.00297 0.0474 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -297902 sc-eQTL 5.37e-01 -0.059 0.0955 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 2239 sc-eQTL 5.88e-02 -0.154 0.081 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 887195 sc-eQTL 1.96e-01 -0.09 0.0695 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -248022 sc-eQTL 2.05e-01 -0.0958 0.0754 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -299132 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0499 0.049 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -297902 sc-eQTL 8.53e-01 0.0175 0.0945 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 2239 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0622 0.0894 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 887195 sc-eQTL 8.51e-01 0.0141 0.0752 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -248022 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0504 0.0881 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -299132 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0368 0.0457 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -297902 sc-eQTL 7.27e-01 -0.037 0.106 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 2239 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0683 0.103 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 887195 sc-eQTL 1.73e-01 0.129 0.0942 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -248022 sc-eQTL 1.88e-02 -0.23 0.0973 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -299132 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0444 0.0403 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -297902 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0869 0.1 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 2239 sc-eQTL 1.96e-01 -0.113 0.0868 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 887195 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0912 0.089 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -248022 sc-eQTL 8.97e-01 0.0128 0.099 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -299132 sc-eQTL 1.73e-02 -0.125 0.0523 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -297902 sc-eQTL 2.75e-01 0.112 0.102 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 2239 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0483 0.105 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 887195 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0842 0.0845 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -248022 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00566 0.0909 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -299132 sc-eQTL 8.67e-01 -0.00875 0.052 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -297902 sc-eQTL 4.30e-01 0.0824 0.104 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 2239 sc-eQTL 5.18e-02 -0.198 0.101 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 887195 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0663 0.103 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -248022 sc-eQTL 5.30e-02 0.196 0.101 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -299132 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0512 0.0494 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -297902 sc-eQTL 6.71e-01 0.0462 0.108 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 2239 sc-eQTL 4.34e-01 0.086 0.11 0.267 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 887195 sc-eQTL 9.13e-01 0.0116 0.106 0.267 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -248022 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0362 0.109 0.267 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -299132 sc-eQTL 2.06e-01 -0.0742 0.0585 0.267 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -297902 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0452 0.111 0.267 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 2239 sc-eQTL 7.24e-01 0.0347 0.0984 0.264 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 887195 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0681 0.103 0.264 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -248022 sc-eQTL 1.44e-01 0.146 0.0996 0.264 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -299132 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00141 0.0493 0.264 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -297902 sc-eQTL 6.01e-01 0.054 0.103 0.264 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 2239 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0599 0.104 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 887195 sc-eQTL 2.82e-01 0.118 0.11 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -248022 sc-eQTL 9.33e-01 0.00894 0.106 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -299132 sc-eQTL 8.25e-02 -0.102 0.0585 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 2239 sc-eQTL 8.15e-01 -0.019 0.0813 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 887195 sc-eQTL 7.55e-01 0.0261 0.0835 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -248022 sc-eQTL 8.12e-01 0.0242 0.102 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -299132 sc-eQTL 1.76e-01 -0.0545 0.0402 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 2239 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0247 0.104 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 887195 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0724 0.105 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -248022 sc-eQTL 6.28e-02 0.195 0.104 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -299132 sc-eQTL 9.77e-01 0.00138 0.0489 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 2239 sc-eQTL 2.28e-02 -0.201 0.0877 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 887195 sc-eQTL 2.19e-01 0.113 0.0915 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -248022 sc-eQTL 2.44e-01 0.116 0.0995 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -299132 sc-eQTL 1.33e-01 -0.0812 0.0539 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 113962 sc-eQTL 5.75e-01 0.0621 0.11 0.27 PB L2
ENSG00000079950 STX7 2239 sc-eQTL 3.41e-01 0.088 0.092 0.27 PB L2
ENSG00000112282 MED23 887195 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0201 0.126 0.27 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -248022 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0302 0.113 0.27 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -299132 sc-eQTL 9.38e-01 0.00503 0.0641 0.27 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -297902 sc-eQTL 5.10e-01 0.0792 0.12 0.27 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 383549 sc-eQTL 2.51e-01 0.0906 0.0785 0.27 PB L2
ENSG00000079950 STX7 2239 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0771 0.0921 0.267 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 887195 sc-eQTL 8.33e-01 0.0219 0.104 0.267 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -248022 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0103 0.099 0.267 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -299132 sc-eQTL 9.67e-03 -0.0962 0.0368 0.267 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -297902 sc-eQTL 5.88e-01 0.0526 0.0968 0.267 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 2239 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0596 0.0985 0.265 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 887195 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0418 0.101 0.265 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -248022 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0122 0.0829 0.265 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -299132 sc-eQTL 1.25e-01 -0.0561 0.0365 0.265 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -297902 sc-eQTL 1.98e-01 -0.133 0.103 0.265 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 2239 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0906 0.0871 0.268 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -219328 sc-eQTL 3.37e-02 0.183 0.0857 0.268 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 887195 sc-eQTL 5.61e-02 0.215 0.112 0.268 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -198618 sc-eQTL 2.76e-01 -0.111 0.102 0.268 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -248022 sc-eQTL 3.38e-01 0.0951 0.0991 0.268 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -299132 sc-eQTL 5.27e-01 -0.031 0.049 0.268 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -297902 sc-eQTL 2.06e-01 -0.123 0.0967 0.268 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -587691 sc-eQTL 4.12e-01 0.0638 0.0775 0.268 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 2239 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0136 0.066 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -219328 sc-eQTL 3.32e-01 0.0904 0.0931 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 887195 sc-eQTL 1.86e-01 -0.122 0.0918 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -198618 sc-eQTL 6.78e-01 0.0392 0.0941 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -248022 sc-eQTL 8.73e-01 -0.012 0.0752 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -299132 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0352 0.0417 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -297902 sc-eQTL 4.69e-01 0.0584 0.0805 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 2239 sc-eQTL 6.27e-01 0.0344 0.0706 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -219328 sc-eQTL 4.66e-01 0.0643 0.0881 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 887195 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00364 0.0957 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -198618 sc-eQTL 2.58e-01 0.108 0.0955 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -248022 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00327 0.0627 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -299132 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0374 0.0451 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -297902 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0693 0.0835 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 2239 sc-eQTL 3.10e-01 -0.126 0.123 0.258 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 887195 sc-eQTL 6.03e-02 0.248 0.131 0.258 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -248022 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0223 0.137 0.258 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -299132 sc-eQTL 4.32e-01 0.041 0.052 0.258 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -297902 sc-eQTL 8.37e-02 -0.232 0.133 0.258 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 2239 sc-eQTL 2.56e-01 -0.107 0.094 0.271 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -219328 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0668 0.0951 0.271 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 887195 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0669 0.104 0.271 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -198618 sc-eQTL 2.57e-01 -0.107 0.0938 0.271 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -248022 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0209 0.0956 0.271 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -299132 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0417 0.0415 0.271 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -297902 sc-eQTL 2.04e-01 0.129 0.101 0.271 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 2239 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0174 0.0729 0.265 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -219328 sc-eQTL 8.49e-01 0.0196 0.103 0.265 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 887195 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0636 0.104 0.265 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -198618 sc-eQTL 5.74e-01 0.0575 0.102 0.265 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -248022 sc-eQTL 9.33e-01 0.00824 0.0982 0.265 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -299132 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0362 0.0492 0.265 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -297902 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0868 0.0868 0.265 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 2239 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0417 0.084 0.251 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -219328 sc-eQTL 5.60e-02 0.161 0.0836 0.251 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 887195 sc-eQTL 8.48e-01 0.0227 0.118 0.251 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -198618 sc-eQTL 8.20e-02 0.149 0.0852 0.251 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -248022 sc-eQTL 2.97e-01 0.107 0.102 0.251 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -299132 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0253 0.0705 0.251 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -297902 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0774 0.104 0.251 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -587691 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0777 0.0998 0.251 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 113962 sc-eQTL 2.77e-01 0.109 0.1 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 2239 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0451 0.0569 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 887195 sc-eQTL 4.52e-01 0.0656 0.0871 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -248022 sc-eQTL 6.75e-01 0.0378 0.0901 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -299132 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0246 0.0513 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -297902 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0535 0.0942 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 383549 sc-eQTL 2.77e-01 0.0989 0.0906 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 113962 sc-eQTL 6.48e-02 0.199 0.107 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 2239 sc-eQTL 7.66e-01 0.0132 0.0443 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 887195 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0994 0.0828 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -248022 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0408 0.0859 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -299132 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0568 0.0519 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -297902 sc-eQTL 2.73e-01 0.108 0.0978 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 383549 sc-eQTL 1.52e-01 0.0893 0.062 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 2239 sc-eQTL 6.06e-01 0.0285 0.0551 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -219328 sc-eQTL 3.06e-01 0.092 0.0897 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 887195 sc-eQTL 1.92e-01 -0.113 0.0861 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -198618 sc-eQTL 6.24e-01 0.046 0.0937 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -248022 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0378 0.062 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -299132 sc-eQTL 2.39e-01 -0.0501 0.0424 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -297902 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0351 0.0756 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 2239 sc-eQTL 1.86e-01 -0.0891 0.0672 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -219328 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00326 0.0992 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 887195 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0892 0.0964 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -198618 sc-eQTL 6.56e-01 0.0438 0.0983 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -248022 sc-eQTL 8.98e-01 0.0119 0.0927 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -299132 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0179 0.0393 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -297902 sc-eQTL 9.60e-01 0.00484 0.0955 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 2239 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0452 0.0767 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 887195 sc-eQTL 3.64e-01 0.0677 0.0744 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -248022 sc-eQTL 4.19e-01 0.0786 0.0971 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -299132 sc-eQTL 2.06e-01 -0.0501 0.0395 0.265 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079931 MOXD1 113962 eQTL 0.00655 0.0911 0.0334 0.0 0.0 0.273
ENSG00000079950 STX7 2239 pQTL 0.00037 0.0917 0.0257 0.0 0.0 0.269
ENSG00000093134 VNN3 -219328 eQTL 0.000759 0.0547 0.0162 0.0 0.0 0.273
ENSG00000118520 ARG1 942293 eQTL 0.0181 -0.0485 0.0205 0.0 0.0 0.273


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 MOXD1 113962 3.61e-06 4.35e-06 7.87e-07 3.34e-06 1.14e-06 1.66e-06 3e-06 6.28e-07 2.47e-06 1.43e-06 4.22e-06 2.51e-06 6.46e-06 2.13e-06 1.22e-06 1.69e-06 2.02e-06 2.09e-06 1.38e-06 9.88e-07 1.41e-06 3.17e-06 3.45e-06 1.22e-06 5.44e-06 1.36e-06 1.57e-06 1.7e-06 4.3e-06 3.75e-06 2.02e-06 4.91e-07 5.2e-07 1.79e-06 2.03e-06 9.85e-07 9.59e-07 4.94e-07 9.31e-07 4.08e-07 2.79e-07 4.74e-06 3.96e-07 1.53e-07 2.97e-07 1.32e-06 8.22e-07 1.82e-07 1.53e-07
ENSG00000093134 VNN3 -219328 1.34e-06 9.55e-07 3.45e-07 1.35e-06 2.93e-07 6.02e-07 1.58e-06 2.28e-07 1.13e-06 3.8e-07 1.87e-06 6.02e-07 2.01e-06 5.23e-07 4.55e-07 4.84e-07 9.08e-07 5.67e-07 7.73e-07 6.9e-07 3.87e-07 1.05e-06 8.96e-07 5.53e-07 2.18e-06 2.54e-07 6.91e-07 5.65e-07 1.24e-06 1.22e-06 6.04e-07 3.86e-08 1.27e-07 6.27e-07 6.11e-07 3.71e-07 5.15e-07 1.57e-07 4.52e-07 3.1e-07 2.58e-07 1.5e-06 9.42e-08 1.8e-07 1.93e-07 2.32e-07 1.28e-07 4.47e-08 6.36e-08
ENSG00000118520 ARG1 942293 2.6e-07 1.11e-07 3.28e-08 1.7e-07 1.02e-07 9.36e-08 1.39e-07 5.24e-08 1.36e-07 4.23e-08 1.63e-07 7.6e-08 1.23e-07 6.07e-08 4.77e-08 7.76e-08 5.1e-08 1.06e-07 5.22e-08 2.85e-08 1.03e-07 1.31e-07 1.31e-07 5.01e-08 1.32e-07 1.09e-07 1.13e-07 8.49e-08 1.03e-07 1.1e-07 9.5e-08 3.59e-08 2.74e-08 8.3e-08 9.56e-08 4.26e-08 4.96e-08 8.78e-08 8.42e-08 3.59e-08 3.77e-08 1.42e-07 4.23e-08 1.19e-08 1.12e-07 1.75e-08 1.45e-07 4.7e-09 4.61e-08