logo

Genes within 1Mb (chr6:132512283:G:GT):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 110808 sc-eQTL 3.03e-02 -0.329 0.151 0.109 B L1
ENSG00000079950 STX7 -915 sc-eQTL 9.97e-03 0.147 0.0567 0.109 B L1
ENSG00000112282 MED23 884041 sc-eQTL 1.70e-01 0.157 0.114 0.109 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -251176 sc-eQTL 2.92e-01 0.114 0.108 0.109 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -302286 sc-eQTL 9.08e-03 -0.17 0.0644 0.109 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -301056 sc-eQTL 2.50e-01 -0.158 0.137 0.109 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 380395 sc-eQTL 3.73e-01 0.0805 0.0902 0.109 B L1
ENSG00000079950 STX7 -915 sc-eQTL 6.15e-05 0.441 0.108 0.109 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 884041 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00302 0.089 0.109 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -251176 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0569 0.097 0.109 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -302286 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0169 0.066 0.109 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -301056 sc-eQTL 5.20e-01 0.0859 0.133 0.109 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -915 sc-eQTL 2.26e-03 0.333 0.108 0.109 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 884041 sc-eQTL 4.59e-01 0.0804 0.108 0.109 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -251176 sc-eQTL 3.41e-01 0.122 0.128 0.109 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -302286 sc-eQTL 6.44e-03 -0.119 0.0432 0.109 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -301056 sc-eQTL 4.01e-01 -0.111 0.133 0.109 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 -915 sc-eQTL 9.03e-01 0.0122 0.1 0.108 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -222482 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0182 0.124 0.108 DC L1
ENSG00000112282 MED23 884041 sc-eQTL 4.59e-01 -0.108 0.145 0.108 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -201772 sc-eQTL 1.44e-01 0.195 0.133 0.108 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -251176 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0469 0.143 0.108 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -302286 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0882 0.08 0.108 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -301056 sc-eQTL 1.23e-01 0.196 0.126 0.108 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -590845 sc-eQTL 7.45e-01 0.0377 0.116 0.108 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -915 sc-eQTL 6.36e-01 0.0362 0.0764 0.109 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -222482 sc-eQTL 5.88e-01 0.0712 0.131 0.109 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 884041 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0116 0.125 0.109 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -201772 sc-eQTL 2.44e-01 0.164 0.141 0.109 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -251176 sc-eQTL 1.31e-02 0.245 0.0981 0.109 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -302286 sc-eQTL 2.04e-01 -0.0758 0.0595 0.109 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -301056 sc-eQTL 3.02e-01 -0.122 0.118 0.109 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -915 sc-eQTL 5.81e-04 0.398 0.114 0.109 NK L1
ENSG00000112282 MED23 884041 sc-eQTL 7.27e-01 0.0374 0.107 0.109 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -251176 sc-eQTL 4.65e-01 -0.106 0.145 0.109 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -302286 sc-eQTL 1.66e-02 -0.144 0.0595 0.109 NK L1
ENSG00000079950 STX7 -915 sc-eQTL 1.96e-03 0.344 0.11 0.109 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 884041 sc-eQTL 5.88e-01 0.076 0.14 0.109 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -251176 sc-eQTL 8.51e-02 -0.233 0.135 0.109 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -302286 sc-eQTL 1.21e-01 -0.0833 0.0535 0.109 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -301056 sc-eQTL 9.51e-01 0.00908 0.147 0.109 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 110808 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0207 0.16 0.107 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -915 sc-eQTL 3.62e-01 0.136 0.149 0.107 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 884041 sc-eQTL 5.11e-01 -0.109 0.166 0.107 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -251176 sc-eQTL 3.81e-01 -0.14 0.159 0.107 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -302286 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0599 0.0852 0.107 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -301056 sc-eQTL 4.81e-01 -0.105 0.149 0.107 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 380395 sc-eQTL 8.43e-01 0.0284 0.143 0.107 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 110808 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0425 0.138 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -915 sc-eQTL 2.14e-01 0.112 0.0897 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 884041 sc-eQTL 2.47e-01 0.159 0.137 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -251176 sc-eQTL 8.30e-01 0.0292 0.136 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -302286 sc-eQTL 7.51e-02 -0.147 0.0824 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -301056 sc-eQTL 2.06e-01 0.189 0.149 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 380395 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0289 0.127 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 110808 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00491 0.138 0.11 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -915 sc-eQTL 1.22e-01 0.167 0.107 0.11 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 884041 sc-eQTL 5.52e-02 -0.266 0.138 0.11 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -251176 sc-eQTL 3.96e-02 0.289 0.14 0.11 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -302286 sc-eQTL 3.25e-03 -0.198 0.0666 0.11 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -301056 sc-eQTL 2.68e-02 -0.313 0.14 0.11 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 380395 sc-eQTL 2.08e-01 -0.167 0.132 0.11 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 110808 sc-eQTL 3.41e-02 -0.335 0.157 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -915 sc-eQTL 4.45e-03 0.195 0.068 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 884041 sc-eQTL 8.01e-02 0.217 0.123 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -251176 sc-eQTL 2.06e-01 -0.17 0.134 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -302286 sc-eQTL 9.33e-02 -0.128 0.0761 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -301056 sc-eQTL 1.49e-01 -0.213 0.147 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 380395 sc-eQTL 1.93e-01 0.127 0.0976 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 110808 sc-eQTL 1.86e-02 -0.345 0.146 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -915 sc-eQTL 4.90e-01 0.0556 0.0803 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 884041 sc-eQTL 6.84e-01 0.0605 0.148 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -251176 sc-eQTL 4.90e-01 0.102 0.147 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -302286 sc-eQTL 3.59e-02 -0.163 0.0773 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -301056 sc-eQTL 1.76e-01 -0.202 0.148 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 380395 sc-eQTL 5.68e-01 0.059 0.103 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -915 sc-eQTL 8.02e-01 0.037 0.147 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 884041 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0162 0.153 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -251176 sc-eQTL 1.02e-02 0.378 0.146 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -302286 sc-eQTL 4.21e-02 -0.139 0.0678 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -301056 sc-eQTL 8.74e-01 -0.022 0.138 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -915 sc-eQTL 1.19e-03 0.387 0.118 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 884041 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0816 0.103 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -251176 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0168 0.112 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -302286 sc-eQTL 8.48e-01 0.0139 0.0726 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -301056 sc-eQTL 6.53e-01 0.0628 0.14 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -915 sc-eQTL 2.01e-05 0.556 0.127 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 884041 sc-eQTL 6.66e-01 0.0483 0.112 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -251176 sc-eQTL 1.46e-01 -0.19 0.13 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -302286 sc-eQTL 6.70e-01 -0.029 0.0679 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -301056 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0287 0.157 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -915 sc-eQTL 7.37e-02 0.269 0.15 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 884041 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0786 0.139 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -251176 sc-eQTL 5.59e-01 0.0847 0.145 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -302286 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0511 0.0593 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -301056 sc-eQTL 5.95e-01 0.0786 0.148 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -915 sc-eQTL 6.60e-05 0.496 0.122 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 884041 sc-eQTL 8.87e-01 0.0184 0.13 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -251176 sc-eQTL 9.30e-03 0.371 0.141 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -302286 sc-eQTL 1.87e-01 -0.101 0.0766 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -301056 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00636 0.149 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -915 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0338 0.151 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 884041 sc-eQTL 8.57e-01 -0.022 0.122 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -251176 sc-eQTL 8.91e-01 0.018 0.131 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -302286 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0421 0.0747 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -301056 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0548 0.15 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -915 sc-eQTL 5.15e-01 0.0968 0.149 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 884041 sc-eQTL 8.09e-01 0.0361 0.149 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -251176 sc-eQTL 1.72e-01 -0.201 0.147 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -302286 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0379 0.0719 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -301056 sc-eQTL 1.01e-01 -0.258 0.157 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -915 sc-eQTL 2.00e-01 0.203 0.158 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 884041 sc-eQTL 6.61e-01 0.0668 0.152 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -251176 sc-eQTL 5.25e-01 0.1 0.157 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -302286 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0456 0.0846 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -301056 sc-eQTL 5.18e-01 -0.104 0.16 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -915 sc-eQTL 6.67e-03 0.386 0.141 0.108 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 884041 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00418 0.15 0.108 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -251176 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0916 0.146 0.108 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -302286 sc-eQTL 1.11e-03 -0.231 0.0699 0.108 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -301056 sc-eQTL 2.55e-02 0.334 0.148 0.108 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -915 sc-eQTL 1.06e-02 0.374 0.145 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 884041 sc-eQTL 8.59e-01 0.0278 0.156 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -251176 sc-eQTL 3.09e-01 0.152 0.149 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -302286 sc-eQTL 1.74e-03 -0.258 0.0813 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -915 sc-eQTL 3.27e-03 0.361 0.121 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 884041 sc-eQTL 4.97e-01 0.0865 0.127 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -251176 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0369 0.155 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -302286 sc-eQTL 4.50e-02 -0.123 0.0609 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -915 sc-eQTL 1.90e-01 0.194 0.148 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 884041 sc-eQTL 6.87e-01 0.0605 0.15 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -251176 sc-eQTL 2.47e-01 -0.174 0.15 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -302286 sc-eQTL 3.77e-02 -0.145 0.0693 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -915 sc-eQTL 1.05e-02 0.335 0.13 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 884041 sc-eQTL 4.05e-01 -0.113 0.136 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -251176 sc-eQTL 4.43e-01 -0.114 0.148 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -302286 sc-eQTL 1.88e-02 -0.188 0.0794 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 110808 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0256 0.159 0.107 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -915 sc-eQTL 7.98e-01 0.0341 0.133 0.107 PB L2
ENSG00000112282 MED23 884041 sc-eQTL 4.90e-01 -0.125 0.18 0.107 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -251176 sc-eQTL 9.68e-01 -0.0065 0.162 0.107 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -302286 sc-eQTL 1.24e-01 -0.141 0.091 0.107 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -301056 sc-eQTL 3.67e-01 0.156 0.172 0.107 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 380395 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0145 0.113 0.107 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -915 sc-eQTL 2.17e-03 0.406 0.131 0.111 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 884041 sc-eQTL 3.24e-01 0.149 0.15 0.111 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -251176 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0532 0.144 0.111 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -302286 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0177 0.0543 0.111 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -301056 sc-eQTL 2.78e-01 -0.152 0.14 0.111 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -915 sc-eQTL 5.53e-01 0.0885 0.149 0.109 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 884041 sc-eQTL 6.33e-01 0.0733 0.153 0.109 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -251176 sc-eQTL 3.68e-01 0.113 0.125 0.109 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -302286 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0245 0.0554 0.109 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -301056 sc-eQTL 5.78e-01 0.0873 0.157 0.109 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -915 sc-eQTL 9.03e-01 0.0162 0.133 0.11 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -222482 sc-eQTL 8.11e-01 0.0315 0.132 0.11 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 884041 sc-eQTL 1.38e-01 -0.253 0.17 0.11 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -201772 sc-eQTL 7.40e-02 0.276 0.153 0.11 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -251176 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0895 0.151 0.11 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -302286 sc-eQTL 4.45e-02 -0.149 0.0737 0.11 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -301056 sc-eQTL 1.85e-01 0.195 0.147 0.11 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -590845 sc-eQTL 3.34e-01 -0.114 0.118 0.11 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -915 sc-eQTL 1.84e-01 0.129 0.0964 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -222482 sc-eQTL 7.82e-01 -0.038 0.137 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 884041 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0574 0.135 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -201772 sc-eQTL 8.37e-01 0.0285 0.138 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -251176 sc-eQTL 2.19e-01 0.135 0.11 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -302286 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0624 0.0611 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -301056 sc-eQTL 1.12e-01 -0.187 0.117 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -915 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0278 0.106 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -222482 sc-eQTL 8.31e-01 0.0283 0.132 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 884041 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0481 0.143 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -201772 sc-eQTL 7.14e-01 0.0526 0.143 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -251176 sc-eQTL 4.90e-02 0.184 0.0931 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -302286 sc-eQTL 6.63e-02 -0.124 0.0671 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -301056 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0602 0.125 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -915 sc-eQTL 5.12e-01 0.105 0.16 0.115 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 884041 sc-eQTL 5.28e-01 0.108 0.171 0.115 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -251176 sc-eQTL 3.31e-01 -0.172 0.176 0.115 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -302286 sc-eQTL 9.68e-02 -0.111 0.0667 0.115 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -301056 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0527 0.174 0.115 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -915 sc-eQTL 4.62e-01 -0.105 0.143 0.107 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -222482 sc-eQTL 2.28e-01 -0.174 0.144 0.107 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 884041 sc-eQTL 3.72e-01 0.142 0.159 0.107 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -201772 sc-eQTL 2.26e-01 0.173 0.143 0.107 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -251176 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0103 0.145 0.107 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -302286 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0708 0.0631 0.107 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -301056 sc-eQTL 2.29e-01 0.185 0.153 0.107 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -915 sc-eQTL 9.39e-02 0.173 0.103 0.111 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -222482 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00115 0.146 0.111 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 884041 sc-eQTL 1.91e-01 0.194 0.148 0.111 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -201772 sc-eQTL 4.20e-01 0.117 0.145 0.111 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -251176 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0496 0.14 0.111 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -302286 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0651 0.0699 0.111 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -301056 sc-eQTL 6.75e-01 -0.052 0.124 0.111 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -915 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0852 0.119 0.116 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -222482 sc-eQTL 8.41e-02 -0.207 0.119 0.116 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 884041 sc-eQTL 7.17e-01 0.0609 0.167 0.116 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -201772 sc-eQTL 9.64e-01 0.00554 0.122 0.116 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -251176 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00357 0.146 0.116 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -302286 sc-eQTL 9.20e-01 0.01 0.1 0.116 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -301056 sc-eQTL 4.03e-01 0.124 0.148 0.116 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -590845 sc-eQTL 3.51e-01 0.133 0.142 0.116 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 110808 sc-eQTL 7.80e-01 0.0414 0.148 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -915 sc-eQTL 1.26e-01 0.128 0.0835 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 884041 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0699 0.128 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -251176 sc-eQTL 3.57e-01 0.122 0.133 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -302286 sc-eQTL 3.89e-02 -0.156 0.0749 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -301056 sc-eQTL 6.55e-01 0.0621 0.139 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 380395 sc-eQTL 8.46e-01 -0.026 0.134 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 110808 sc-eQTL 2.99e-03 -0.469 0.156 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -915 sc-eQTL 9.27e-03 0.169 0.0643 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 884041 sc-eQTL 5.82e-02 0.232 0.122 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -251176 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0755 0.127 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -302286 sc-eQTL 9.79e-02 -0.127 0.0763 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -301056 sc-eQTL 1.76e-01 -0.196 0.144 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 380395 sc-eQTL 2.29e-01 0.111 0.0917 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -915 sc-eQTL 3.27e-01 0.0804 0.0818 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -222482 sc-eQTL 8.03e-01 0.0334 0.134 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 884041 sc-eQTL 5.75e-01 -0.072 0.128 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -201772 sc-eQTL 5.56e-01 0.0821 0.139 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -251176 sc-eQTL 9.93e-03 0.236 0.0907 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -302286 sc-eQTL 2.15e-01 -0.0783 0.063 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -301056 sc-eQTL 2.18e-01 -0.139 0.112 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -915 sc-eQTL 3.79e-01 0.0871 0.0988 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -222482 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0369 0.146 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 884041 sc-eQTL 1.82e-01 0.189 0.141 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -201772 sc-eQTL 8.45e-02 0.248 0.143 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -251176 sc-eQTL 7.88e-01 0.0367 0.136 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -302286 sc-eQTL 1.31e-01 -0.087 0.0574 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -301056 sc-eQTL 6.24e-01 0.0687 0.14 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -915 sc-eQTL 2.12e-03 0.356 0.114 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 884041 sc-eQTL 8.54e-01 0.0209 0.114 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -251176 sc-eQTL 3.88e-01 -0.128 0.148 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -302286 sc-eQTL 2.10e-02 -0.139 0.0597 0.11 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079931 MOXD1 110808 eQTL 0.0363 -0.096 0.0458 0.0187 0.0092 0.117
ENSG00000079950 STX7 -915 pQTL 1.83e-17 0.289 0.0335 0.316 0.323 0.118
ENSG00000079950 STX7 -915 eQTL 3.11e-34 0.284 0.0224 0.0 0.0 0.117
ENSG00000118523 CCN2 560911 pQTL 0.00829 -0.084 0.0318 0.0 0.0 0.118

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079950 STX7 -915 0.000245 0.000245 3.28e-05 4.88e-05 2.64e-05 7.61e-05 0.000224 2.54e-05 0.000173 6.91e-05 0.00024 0.000101 0.000295 8.29e-05 3.6e-05 0.000147 9.21e-05 0.00012 3.91e-05 2.72e-05 7.84e-05 0.000224 0.000188 4.63e-05 0.000235 5.07e-05 9.58e-05 6.11e-05 0.000182 8.19e-05 0.000133 7.53e-06 1.15e-05 2.84e-05 4.06e-05 2.15e-05 8.6e-06 1.05e-05 1.69e-05 1.06e-05 4.83e-06 0.000318 2.29e-05 7.5e-07 1.51e-05 2.11e-05 2.02e-05 8.71e-06 6.06e-06
ENSG00000112282 \N 884041 4.37e-07 1.53e-07 6.41e-08 3.92e-07 9.24e-08 8.45e-08 1.67e-07 5.35e-08 1.5e-07 4.4e-08 1.52e-07 8.14e-08 1.95e-07 7.64e-08 5.55e-08 7.37e-08 4.09e-08 1.4e-07 5.75e-08 3.59e-08 1.05e-07 1.27e-07 1.5e-07 4.67e-08 1.46e-07 1.21e-07 1.11e-07 9.15e-08 1.12e-07 1.05e-07 1.02e-07 3.19e-08 2.74e-08 8.55e-08 3.81e-08 3.95e-08 5.03e-08 9.06e-08 8.3e-08 3.07e-08 3.18e-08 1.55e-07 4.19e-08 1.32e-07 9.88e-08 1.68e-08 1.19e-07 4.82e-09 4.61e-08