logo

Genes within 1Mb (chr6:132498829:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 97354 sc-eQTL 9.68e-05 -0.412 0.104 0.214 B L1
ENSG00000079950 STX7 -14369 sc-eQTL 1.07e-04 -0.155 0.0391 0.214 B L1
ENSG00000112282 MED23 870587 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0311 0.0808 0.214 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -264630 sc-eQTL 4.33e-01 0.0598 0.0761 0.214 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -315740 sc-eQTL 8.87e-01 0.00653 0.0461 0.214 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -314510 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0616 0.0969 0.214 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 366941 sc-eQTL 1.30e-01 -0.0962 0.0633 0.214 B L1
ENSG00000079950 STX7 -14369 sc-eQTL 4.31e-04 -0.273 0.0764 0.214 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 870587 sc-eQTL 1.92e-02 0.145 0.0617 0.214 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -264630 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0322 0.0681 0.214 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -315740 sc-eQTL 6.96e-01 0.0181 0.0463 0.214 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -314510 sc-eQTL 6.88e-01 0.0376 0.0937 0.214 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -14369 sc-eQTL 9.78e-03 -0.199 0.0764 0.214 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 870587 sc-eQTL 1.62e-01 0.107 0.0762 0.214 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -264630 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0297 0.0906 0.214 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -315740 sc-eQTL 9.68e-02 0.0513 0.0308 0.214 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -314510 sc-eQTL 7.19e-01 0.0338 0.0936 0.214 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 -14369 sc-eQTL 7.65e-01 0.0214 0.0715 0.212 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -235936 sc-eQTL 1.70e-01 -0.121 0.0883 0.212 DC L1
ENSG00000112282 MED23 870587 sc-eQTL 8.52e-01 0.0195 0.104 0.212 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -215226 sc-eQTL 5.90e-02 -0.18 0.0949 0.212 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -264630 sc-eQTL 2.97e-01 -0.107 0.102 0.212 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -315740 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0497 0.0573 0.212 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -314510 sc-eQTL 6.29e-01 0.0439 0.0908 0.212 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -604299 sc-eQTL 7.24e-01 0.0293 0.0827 0.212 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -14369 sc-eQTL 3.94e-01 0.0454 0.0531 0.214 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -235936 sc-eQTL 2.57e-01 -0.103 0.091 0.214 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 870587 sc-eQTL 2.71e-01 0.0954 0.0864 0.214 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -215226 sc-eQTL 1.55e-01 -0.14 0.0977 0.214 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -264630 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0512 0.0692 0.214 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -315740 sc-eQTL 7.67e-01 0.0123 0.0415 0.214 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -314510 sc-eQTL 6.06e-01 0.0424 0.0821 0.214 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -14369 sc-eQTL 7.80e-03 -0.21 0.0781 0.212 NK L1
ENSG00000112282 MED23 870587 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0569 0.0725 0.212 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -264630 sc-eQTL 9.81e-01 -0.0024 0.0989 0.212 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -315740 sc-eQTL 2.18e-01 0.0504 0.0408 0.212 NK L1
ENSG00000079950 STX7 -14369 sc-eQTL 8.39e-02 -0.139 0.0803 0.214 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 870587 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0331 0.101 0.214 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -264630 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0723 0.0977 0.214 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -315740 sc-eQTL 5.10e-02 0.0754 0.0384 0.214 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -314510 sc-eQTL 6.93e-01 -0.042 0.106 0.214 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 97354 sc-eQTL 1.63e-02 -0.263 0.108 0.207 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -14369 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0917 0.103 0.207 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 870587 sc-eQTL 5.09e-01 0.0756 0.114 0.207 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -264630 sc-eQTL 2.44e-01 -0.128 0.11 0.207 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -315740 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0583 0.0587 0.207 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -314510 sc-eQTL 9.42e-01 0.00746 0.103 0.207 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 366941 sc-eQTL 1.44e-01 -0.143 0.0978 0.207 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 97354 sc-eQTL 1.11e-01 -0.162 0.101 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -14369 sc-eQTL 5.94e-03 -0.182 0.0654 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 870587 sc-eQTL 3.07e-01 -0.104 0.101 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -264630 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0829 0.1 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -315740 sc-eQTL 7.74e-01 0.0176 0.0614 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -314510 sc-eQTL 2.24e-01 -0.135 0.11 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 366941 sc-eQTL 5.32e-01 0.0589 0.094 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 97354 sc-eQTL 5.96e-02 -0.189 0.1 0.216 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -14369 sc-eQTL 4.70e-02 -0.157 0.0784 0.216 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 870587 sc-eQTL 1.31e-01 0.154 0.101 0.216 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -264630 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00214 0.103 0.216 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -315740 sc-eQTL 3.52e-01 0.0465 0.0498 0.216 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -314510 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00614 0.104 0.216 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 366941 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0957 0.0967 0.216 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 97354 sc-eQTL 2.55e-03 -0.337 0.11 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -14369 sc-eQTL 1.21e-02 -0.123 0.0485 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 870587 sc-eQTL 9.09e-01 0.0101 0.0882 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -264630 sc-eQTL 5.41e-02 0.184 0.0948 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -315740 sc-eQTL 7.66e-01 0.0162 0.0545 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -314510 sc-eQTL 8.38e-02 -0.181 0.104 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 366941 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0563 0.0695 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 97354 sc-eQTL 1.29e-03 -0.336 0.103 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -14369 sc-eQTL 1.08e-03 -0.186 0.056 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 870587 sc-eQTL 7.29e-01 0.0368 0.106 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -264630 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0207 0.105 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -315740 sc-eQTL 7.40e-01 0.0185 0.0558 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -314510 sc-eQTL 1.68e-01 0.147 0.106 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 366941 sc-eQTL 2.10e-01 -0.0926 0.0736 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -14369 sc-eQTL 1.16e-01 -0.17 0.108 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 870587 sc-eQTL 6.73e-01 0.0475 0.112 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -264630 sc-eQTL 4.39e-02 -0.219 0.108 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -315740 sc-eQTL 4.87e-02 0.099 0.0499 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -314510 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0252 0.102 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -14369 sc-eQTL 1.90e-02 -0.198 0.0837 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 870587 sc-eQTL 1.27e-03 0.231 0.0706 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -264630 sc-eQTL 7.70e-01 0.023 0.0785 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -315740 sc-eQTL 6.23e-01 0.0251 0.0509 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -314510 sc-eQTL 4.27e-01 0.0779 0.0979 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -14369 sc-eQTL 3.32e-03 -0.268 0.0902 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 870587 sc-eQTL 1.81e-01 -0.103 0.0771 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -264630 sc-eQTL 6.33e-01 0.0434 0.0907 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -315740 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00173 0.047 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -314510 sc-eQTL 7.18e-01 0.0393 0.109 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -14369 sc-eQTL 8.97e-02 -0.183 0.108 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 870587 sc-eQTL 5.05e-01 0.0665 0.0996 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -264630 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0342 0.104 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -315740 sc-eQTL 6.43e-02 0.0786 0.0423 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -314510 sc-eQTL 1.09e-02 -0.268 0.104 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -14369 sc-eQTL 2.44e-01 -0.102 0.0876 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 870587 sc-eQTL 2.92e-01 0.0949 0.0898 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -264630 sc-eQTL 8.99e-01 0.0127 0.0998 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -315740 sc-eQTL 8.54e-03 0.14 0.0526 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -314510 sc-eQTL 9.91e-01 0.00114 0.104 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -14369 sc-eQTL 1.05e-01 -0.177 0.109 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 870587 sc-eQTL 9.47e-01 0.00581 0.088 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -264630 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00102 0.0944 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -315740 sc-eQTL 5.44e-01 0.0329 0.054 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -314510 sc-eQTL 2.94e-01 -0.114 0.108 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -14369 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0406 0.109 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 870587 sc-eQTL 6.03e-02 0.205 0.109 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -264630 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0638 0.108 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -315740 sc-eQTL 3.00e-01 0.0547 0.0526 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -314510 sc-eQTL 7.23e-01 -0.041 0.116 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -14369 sc-eQTL 2.50e-01 -0.127 0.11 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 870587 sc-eQTL 4.23e-03 -0.3 0.104 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -264630 sc-eQTL 6.94e-01 0.0432 0.109 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -315740 sc-eQTL 4.16e-02 0.119 0.0582 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -314510 sc-eQTL 3.47e-02 0.234 0.11 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -14369 sc-eQTL 1.75e-01 -0.137 0.101 0.21 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 870587 sc-eQTL 6.14e-01 0.0536 0.106 0.21 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -264630 sc-eQTL 1.78e-01 -0.139 0.103 0.21 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -315740 sc-eQTL 7.33e-02 0.0906 0.0503 0.21 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -314510 sc-eQTL 1.95e-01 -0.138 0.106 0.21 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -14369 sc-eQTL 7.47e-01 0.0354 0.109 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 870587 sc-eQTL 2.82e-01 -0.125 0.115 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -264630 sc-eQTL 8.03e-01 0.0278 0.111 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -315740 sc-eQTL 2.47e-01 0.0717 0.0618 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -14369 sc-eQTL 9.05e-03 -0.22 0.0836 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 870587 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000964 0.0873 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -264630 sc-eQTL 8.57e-01 0.0192 0.106 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -315740 sc-eQTL 4.12e-01 0.0346 0.0421 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -14369 sc-eQTL 6.92e-02 -0.198 0.108 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 870587 sc-eQTL 8.95e-01 0.0146 0.11 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -264630 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0755 0.111 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -315740 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00091 0.0515 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -14369 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0339 0.0938 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 870587 sc-eQTL 3.92e-01 -0.083 0.0969 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -264630 sc-eQTL 9.39e-01 0.00809 0.105 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -315740 sc-eQTL 7.89e-02 0.1 0.0568 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 97354 sc-eQTL 2.27e-01 -0.137 0.113 0.222 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -14369 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0411 0.0947 0.222 PB L2
ENSG00000112282 MED23 870587 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0554 0.129 0.222 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -264630 sc-eQTL 8.67e-01 0.0194 0.116 0.222 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -315740 sc-eQTL 6.70e-01 0.0281 0.0657 0.222 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -314510 sc-eQTL 2.38e-01 0.145 0.122 0.222 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 366941 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000797 0.081 0.222 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -14369 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0302 0.0978 0.213 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 870587 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0294 0.11 0.213 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -264630 sc-eQTL 2.87e-01 -0.112 0.105 0.213 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -315740 sc-eQTL 1.65e-01 0.055 0.0395 0.213 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -314510 sc-eQTL 1.44e-01 0.15 0.102 0.213 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -14369 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0999 0.104 0.214 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 870587 sc-eQTL 4.47e-01 0.0816 0.107 0.214 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -264630 sc-eQTL 2.05e-02 -0.202 0.0866 0.214 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -315740 sc-eQTL 1.05e-01 0.0628 0.0386 0.214 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -314510 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0575 0.11 0.214 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -14369 sc-eQTL 6.95e-01 0.0372 0.0949 0.21 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -235936 sc-eQTL 2.84e-01 -0.101 0.0939 0.21 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 870587 sc-eQTL 5.80e-01 0.068 0.122 0.21 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -215226 sc-eQTL 2.61e-01 -0.125 0.11 0.21 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -264630 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0688 0.108 0.21 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -315740 sc-eQTL 8.79e-01 -0.00816 0.0533 0.21 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -314510 sc-eQTL 1.13e-01 0.167 0.105 0.21 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -604299 sc-eQTL 2.35e-01 0.1 0.0841 0.21 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -14369 sc-eQTL 1.93e-01 0.0889 0.0681 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -235936 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0431 0.0966 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 870587 sc-eQTL 1.14e-01 0.151 0.095 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -215226 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0879 0.0973 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -264630 sc-eQTL 8.91e-01 0.0107 0.078 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -315740 sc-eQTL 9.48e-01 0.00281 0.0433 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -314510 sc-eQTL 9.04e-01 0.0101 0.0835 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -14369 sc-eQTL 8.39e-01 0.0152 0.0748 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -235936 sc-eQTL 2.52e-01 -0.107 0.0931 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 870587 sc-eQTL 2.61e-01 -0.114 0.101 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -215226 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0576 0.101 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -264630 sc-eQTL 8.83e-01 -0.00982 0.0664 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -315740 sc-eQTL 1.78e-01 0.0644 0.0476 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -314510 sc-eQTL 8.25e-02 0.153 0.0879 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -14369 sc-eQTL 6.51e-01 0.0571 0.126 0.203 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 870587 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0989 0.135 0.203 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -264630 sc-eQTL 6.52e-01 0.0632 0.14 0.203 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -315740 sc-eQTL 4.31e-01 -0.042 0.0531 0.203 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -314510 sc-eQTL 7.86e-01 0.0374 0.138 0.203 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -14369 sc-eQTL 4.78e-02 -0.198 0.0995 0.213 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -235936 sc-eQTL 2.33e-01 0.121 0.101 0.213 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 870587 sc-eQTL 2.31e-01 0.133 0.111 0.213 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -215226 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00994 0.1 0.213 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -264630 sc-eQTL 8.37e-01 -0.021 0.102 0.213 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -315740 sc-eQTL 3.32e-01 0.043 0.0443 0.213 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -314510 sc-eQTL 2.09e-01 -0.135 0.108 0.213 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -14369 sc-eQTL 5.55e-01 0.0431 0.0729 0.208 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -235936 sc-eQTL 6.10e-01 0.0526 0.103 0.208 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 870587 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0573 0.104 0.208 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -215226 sc-eQTL 5.03e-02 -0.199 0.101 0.208 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -264630 sc-eQTL 6.06e-01 0.0508 0.0982 0.208 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -315740 sc-eQTL 6.89e-01 0.0198 0.0493 0.208 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -314510 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00209 0.0871 0.208 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -14369 sc-eQTL 5.50e-01 0.0516 0.0861 0.209 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -235936 sc-eQTL 2.26e-01 -0.105 0.0863 0.209 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 870587 sc-eQTL 9.58e-02 -0.201 0.12 0.209 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -215226 sc-eQTL 9.06e-02 -0.149 0.0875 0.209 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -264630 sc-eQTL 8.87e-01 -0.015 0.105 0.209 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -315740 sc-eQTL 4.90e-01 0.05 0.0723 0.209 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -314510 sc-eQTL 2.39e-01 -0.126 0.107 0.209 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -604299 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0738 0.102 0.209 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 97354 sc-eQTL 1.90e-03 -0.327 0.104 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -14369 sc-eQTL 1.82e-03 -0.186 0.0588 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 870587 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0323 0.0921 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -264630 sc-eQTL 8.64e-01 0.0163 0.0952 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -315740 sc-eQTL 7.24e-01 0.0191 0.0543 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -314510 sc-eQTL 1.27e-01 -0.152 0.0991 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 366941 sc-eQTL 2.94e-01 -0.101 0.0958 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 97354 sc-eQTL 7.54e-05 -0.436 0.108 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -14369 sc-eQTL 6.18e-04 -0.155 0.0447 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 870587 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0201 0.0862 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -264630 sc-eQTL 1.45e-01 0.13 0.0888 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -315740 sc-eQTL 7.19e-01 0.0194 0.054 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -314510 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0601 0.102 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 366941 sc-eQTL 2.93e-01 -0.068 0.0645 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -14369 sc-eQTL 5.33e-01 0.0357 0.0572 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -235936 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0987 0.093 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 870587 sc-eQTL 4.65e-01 0.0655 0.0895 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -215226 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0882 0.0971 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -264630 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0253 0.0643 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -315740 sc-eQTL 7.09e-01 0.0165 0.0441 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -314510 sc-eQTL 4.33e-01 0.0616 0.0784 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -14369 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0265 0.0696 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -235936 sc-eQTL 7.47e-01 0.0331 0.102 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 870587 sc-eQTL 3.52e-01 0.0929 0.0996 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -215226 sc-eQTL 2.18e-02 -0.232 0.1 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -264630 sc-eQTL 8.43e-01 0.019 0.0958 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -315740 sc-eQTL 5.70e-01 0.0231 0.0406 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -314510 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0688 0.0985 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -14369 sc-eQTL 6.66e-03 -0.216 0.0787 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 870587 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00906 0.0778 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -264630 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0338 0.101 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -315740 sc-eQTL 2.72e-01 0.0454 0.0413 0.213 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079931 MOXD1 97354 eQTL 9.15e-11 -0.236 0.0359 0.00429 0.00415 0.208
ENSG00000079950 STX7 -14369 pQTL 3.59e-27 -0.289 0.0261 0.0 0.0 0.217
ENSG00000079950 STX7 -14369 eQTL 0.000262 -0.0706 0.0193 0.0 0.0 0.208
ENSG00000093134 VNN3 -235936 eQTL 0.0273 -0.0393 0.0178 0.0 0.0 0.208
ENSG00000112282 MED23 870587 eQTL 0.00318 0.0599 0.0202 0.0 0.0 0.208
ENSG00000112299 VNN1 -215226 pQTL 1.58e-09 0.253 0.0417 0.0 0.0 0.217
ENSG00000112299 VNN1 -215226 eQTL 0.000431 0.0931 0.0264 0.0 0.0 0.208
ENSG00000112303 VNN2 -264630 pQTL 0.0483 -0.06 0.0304 0.0 0.0 0.217
ENSG00000112303 VNN2 -264630 eQTL 0.00394 -0.0456 0.0158 0.00103 0.0 0.208
ENSG00000146409 SLC18B1 -314510 eQTL 0.0166 -0.0652 0.0272 0.0 0.0 0.208

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 MOXD1 97354 1.34e-06 1.31e-06 3.35e-07 1.64e-06 1.07e-07 6.45e-07 1.5e-06 8.11e-08 1.39e-06 3.46e-07 1.75e-06 5.76e-07 2.58e-06 2.74e-07 5.36e-07 6.7e-07 7.73e-07 6.96e-07 6.18e-07 1.73e-07 2.97e-07 6.48e-07 9.22e-07 4.62e-07 2.09e-06 3.91e-07 3.48e-07 4.06e-07 1.43e-06 1.29e-06 4.65e-07 6.78e-08 5.78e-08 5.42e-07 5.41e-07 2.42e-07 1.23e-07 1.06e-07 2.21e-07 2.32e-07 4.53e-08 2.35e-06 4.24e-08 1.69e-07 1.47e-07 3.19e-07 1.21e-07 5.79e-08 6.12e-08
ENSG00000079950 STX7 -14369 2.06e-05 2.48e-05 2.53e-06 1.08e-05 2.53e-06 6.33e-06 2.5e-05 2.16e-06 1.64e-05 6.44e-06 2.33e-05 6.86e-06 3.83e-05 7.19e-06 4.39e-06 9.44e-06 7.74e-06 1.18e-05 3.32e-06 2.95e-06 6.88e-06 1.35e-05 1.67e-05 3.73e-06 2.35e-05 4.71e-06 7.34e-06 6.14e-06 1.82e-05 1.21e-05 1.12e-05 9.98e-07 1.27e-06 3.33e-06 6.01e-06 2.76e-06 1.77e-06 1.95e-06 2.01e-06 2.44e-06 8.36e-07 3.49e-05 2.64e-06 1.46e-07 7.05e-07 2e-06 1.4e-06 6.88e-07 6.37e-07
ENSG00000112299 VNN1 -215226 2.69e-07 1.3e-07 3.59e-08 2.09e-07 9.91e-08 8.45e-08 1.67e-07 5.24e-08 1.44e-07 4.74e-08 1.62e-07 7.75e-08 1.87e-07 6.38e-08 5.53e-08 7.37e-08 4.94e-08 1.26e-07 5.39e-08 3.29e-08 1.05e-07 1.27e-07 1.34e-07 4.67e-08 1.37e-07 1.14e-07 1.12e-07 8.7e-08 1.23e-07 1.03e-07 9.73e-08 3.59e-08 2.74e-08 8.65e-08 8.38e-08 3.93e-08 4.95e-08 9.06e-08 8.3e-08 3.86e-08 3.71e-08 1.46e-07 4.01e-08 8.04e-08 1.09e-07 1.8e-08 1.34e-07 4.6e-09 4.61e-08
ENSG00000112306 \N -315740 2.6e-07 1.08e-07 3.34e-08 1.78e-07 1.03e-07 9.32e-08 1.39e-07 5.29e-08 1.36e-07 4.23e-08 1.61e-07 7.6e-08 1.27e-07 6.07e-08 4.89e-08 7.87e-08 5.15e-08 1.07e-07 5.22e-08 2.88e-08 1.03e-07 1.31e-07 1.31e-07 5.19e-08 1.32e-07 1.09e-07 1.11e-07 8.49e-08 9.97e-08 1.09e-07 9.5e-08 3.29e-08 2.75e-08 8e-08 9.56e-08 4.14e-08 4.01e-08 8.48e-08 8.44e-08 3.74e-08 2.6e-08 1.37e-07 4.51e-08 7.23e-09 1.15e-07 1.75e-08 1.5e-07 4.96e-09 4.72e-08
ENSG00000118520 \N 925685 2.56e-07 1.16e-07 3.49e-08 1.67e-07 1.03e-07 8.95e-08 1.31e-07 5.29e-08 1.33e-07 3.99e-08 1.55e-07 7.4e-08 1.19e-07 6.1e-08 4.48e-08 7.4e-08 5.2e-08 1.02e-07 4.91e-08 2.93e-08 1.04e-07 1.31e-07 1.31e-07 5.23e-08 1.32e-07 1.03e-07 1.12e-07 8.27e-08 1.04e-07 1.08e-07 9.43e-08 3.29e-08 2.6e-08 8.21e-08 1.06e-07 4.32e-08 3.84e-08 8e-08 8.39e-08 3.96e-08 2.71e-08 1.43e-07 4.51e-08 0.0 1.15e-07 1.86e-08 1.47e-07 4.96e-09 4.72e-08