logo

Genes within 1Mb (chr6:132475783:A:ACTTTGTTTTCCAG):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 74308 sc-eQTL 1.47e-04 -0.385 0.0996 0.22 B L1
ENSG00000079950 STX7 -37415 sc-eQTL 4.80e-04 -0.134 0.0378 0.22 B L1
ENSG00000112282 MED23 847541 sc-eQTL 1.40e-01 0.114 0.0771 0.22 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -287676 sc-eQTL 8.80e-03 0.19 0.0719 0.22 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -338786 sc-eQTL 1.46e-01 -0.0642 0.044 0.22 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -337556 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0563 0.0929 0.22 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 343895 sc-eQTL 8.73e-01 0.00975 0.061 0.22 B L1
ENSG00000079950 STX7 -37415 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0534 0.0776 0.22 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 847541 sc-eQTL 4.61e-01 0.0455 0.0616 0.22 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -287676 sc-eQTL 6.52e-01 0.0303 0.0673 0.22 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -338786 sc-eQTL 9.24e-01 0.00436 0.0458 0.22 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -337556 sc-eQTL 9.46e-01 0.0063 0.0926 0.22 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -37415 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0182 0.0764 0.22 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 847541 sc-eQTL 1.43e-02 0.183 0.0743 0.22 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -287676 sc-eQTL 1.13e-03 0.287 0.087 0.22 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -338786 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0163 0.0305 0.22 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -337556 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0726 0.0921 0.22 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 -37415 sc-eQTL 8.74e-01 0.011 0.069 0.216 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -258982 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0426 0.0855 0.216 DC L1
ENSG00000112282 MED23 847541 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0143 0.1 0.216 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -238272 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0955 0.0921 0.216 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -287676 sc-eQTL 3.95e-02 -0.203 0.0978 0.216 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -338786 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0127 0.0554 0.216 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -337556 sc-eQTL 8.19e-01 0.0201 0.0877 0.216 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -627345 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0978 0.0795 0.216 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -37415 sc-eQTL 1.38e-01 -0.0764 0.0513 0.22 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -258982 sc-eQTL 1.31e-01 -0.134 0.0881 0.22 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 847541 sc-eQTL 1.99e-02 0.195 0.0831 0.22 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -238272 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0976 0.0951 0.22 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -287676 sc-eQTL 1.47e-01 0.0974 0.0669 0.22 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -338786 sc-eQTL 7.19e-01 0.0145 0.0403 0.22 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -337556 sc-eQTL 1.26e-01 -0.122 0.0793 0.22 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -37415 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000864 0.0788 0.221 NK L1
ENSG00000112282 MED23 847541 sc-eQTL 6.38e-01 -0.034 0.072 0.221 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -287676 sc-eQTL 9.73e-01 0.00335 0.0981 0.221 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -338786 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0173 0.0406 0.221 NK L1
ENSG00000079950 STX7 -37415 sc-eQTL 4.05e-01 0.0646 0.0775 0.22 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 847541 sc-eQTL 3.08e-01 0.0988 0.0967 0.22 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -287676 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0416 0.0938 0.22 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -338786 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0399 0.0371 0.22 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -337556 sc-eQTL 9.87e-01 0.00164 0.102 0.22 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 74308 sc-eQTL 8.07e-02 -0.193 0.11 0.204 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -37415 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0632 0.104 0.204 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 847541 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0411 0.115 0.204 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -287676 sc-eQTL 9.28e-01 0.00994 0.11 0.204 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -338786 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0614 0.0589 0.204 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -337556 sc-eQTL 2.60e-01 0.117 0.103 0.204 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 343895 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0898 0.0985 0.204 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 74308 sc-eQTL 5.16e-02 -0.189 0.0968 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -37415 sc-eQTL 1.03e-02 -0.163 0.0629 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 847541 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0361 0.0972 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -287676 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0412 0.0962 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -338786 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0345 0.0589 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -337556 sc-eQTL 8.71e-01 0.0172 0.106 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 343895 sc-eQTL 3.44e-01 0.0854 0.0901 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 74308 sc-eQTL 3.00e-02 -0.212 0.0968 0.222 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -37415 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0619 0.0767 0.222 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 847541 sc-eQTL 1.68e-01 -0.136 0.0985 0.222 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -287676 sc-eQTL 3.63e-02 0.21 0.0994 0.222 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -338786 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0312 0.0484 0.222 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -337556 sc-eQTL 6.89e-02 -0.183 0.1 0.222 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 343895 sc-eQTL 2.30e-01 -0.113 0.0938 0.222 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 74308 sc-eQTL 3.88e-04 -0.384 0.106 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -37415 sc-eQTL 2.01e-03 -0.146 0.0468 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 847541 sc-eQTL 9.55e-02 0.143 0.0852 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -287676 sc-eQTL 3.16e-01 0.0933 0.0928 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -338786 sc-eQTL 1.23e-01 -0.0816 0.0527 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -337556 sc-eQTL 2.59e-01 -0.115 0.102 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 343895 sc-eQTL 1.45e-01 0.0986 0.0673 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 74308 sc-eQTL 2.64e-03 -0.308 0.101 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -37415 sc-eQTL 1.62e-04 -0.209 0.0545 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 847541 sc-eQTL 2.91e-02 0.226 0.103 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -287676 sc-eQTL 5.05e-02 0.202 0.103 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -338786 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0572 0.0547 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -337556 sc-eQTL 1.00e+00 8.6e-06 0.105 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 343895 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0153 0.0725 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -37415 sc-eQTL 2.42e-01 -0.12 0.102 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 847541 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0105 0.107 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -287676 sc-eQTL 9.28e-01 0.0094 0.104 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -338786 sc-eQTL 1.78e-01 -0.0645 0.0477 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -337556 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0125 0.0965 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -37415 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0278 0.0831 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 847541 sc-eQTL 6.21e-01 0.0351 0.0709 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -287676 sc-eQTL 3.58e-01 0.0708 0.0768 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -338786 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0127 0.0499 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -337556 sc-eQTL 9.19e-01 0.00974 0.0961 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -37415 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00763 0.0913 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 847541 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0593 0.0767 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -287676 sc-eQTL 7.83e-01 0.0248 0.09 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -338786 sc-eQTL 8.02e-01 0.0117 0.0466 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -337556 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00955 0.108 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -37415 sc-eQTL 5.76e-01 0.0586 0.104 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 847541 sc-eQTL 7.32e-01 0.033 0.0963 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -287676 sc-eQTL 3.05e-01 0.103 0.1 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -338786 sc-eQTL 7.79e-01 0.0115 0.0411 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -337556 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0181 0.102 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -37415 sc-eQTL 3.19e-01 0.0865 0.0866 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 847541 sc-eQTL 1.34e-01 0.133 0.0885 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -287676 sc-eQTL 8.08e-03 0.259 0.097 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -338786 sc-eQTL 6.95e-01 0.0207 0.0528 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -337556 sc-eQTL 1.71e-01 -0.14 0.102 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -37415 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0815 0.106 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 847541 sc-eQTL 3.51e-01 0.0798 0.0853 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -287676 sc-eQTL 2.12e-03 0.279 0.0896 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -338786 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0277 0.0524 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -337556 sc-eQTL 1.68e-01 -0.145 0.105 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -37415 sc-eQTL 4.05e-01 0.0872 0.105 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 847541 sc-eQTL 4.85e-01 0.0734 0.105 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -287676 sc-eQTL 1.44e-01 -0.152 0.103 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -338786 sc-eQTL 3.50e-01 0.0473 0.0506 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -337556 sc-eQTL 3.01e-01 -0.115 0.111 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -37415 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0899 0.111 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 847541 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0384 0.107 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -287676 sc-eQTL 2.61e-01 0.124 0.11 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -338786 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0484 0.0594 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -337556 sc-eQTL 2.23e-01 0.137 0.112 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -37415 sc-eQTL 9.53e-01 0.0058 0.0994 0.219 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 847541 sc-eQTL 3.63e-01 0.0946 0.104 0.219 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -287676 sc-eQTL 1.68e-01 -0.139 0.101 0.219 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -338786 sc-eQTL 1.44e-01 -0.0726 0.0495 0.219 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -337556 sc-eQTL 9.62e-01 0.00496 0.104 0.219 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -37415 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000925 0.105 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 847541 sc-eQTL 2.06e-01 -0.14 0.11 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -287676 sc-eQTL 9.07e-01 0.0125 0.106 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -338786 sc-eQTL 6.26e-02 -0.11 0.0588 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -37415 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0561 0.0835 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 847541 sc-eQTL 9.08e-01 0.0099 0.0859 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -287676 sc-eQTL 6.65e-01 0.0453 0.105 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -338786 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0122 0.0415 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -37415 sc-eQTL 1.64e-01 0.144 0.103 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 847541 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0153 0.105 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -287676 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0768 0.105 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -338786 sc-eQTL 1.25e-01 -0.0748 0.0486 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -37415 sc-eQTL 4.83e-01 0.0659 0.0938 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 847541 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0631 0.097 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -287676 sc-eQTL 8.98e-01 0.0135 0.106 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -338786 sc-eQTL 6.37e-01 0.027 0.0572 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 74308 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0633 0.115 0.215 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -37415 sc-eQTL 1.90e-01 0.126 0.0958 0.215 PB L2
ENSG00000112282 MED23 847541 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0845 0.131 0.215 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -287676 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0177 0.118 0.215 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -338786 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0283 0.0669 0.215 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -337556 sc-eQTL 9.29e-01 0.0112 0.126 0.215 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 343895 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0261 0.0825 0.215 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -37415 sc-eQTL 2.01e-01 0.118 0.092 0.222 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 847541 sc-eQTL 4.87e-01 0.0722 0.104 0.222 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -287676 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0628 0.099 0.222 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -338786 sc-eQTL 4.87e-01 -0.026 0.0374 0.222 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -337556 sc-eQTL 4.29e-01 0.0768 0.0968 0.222 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -37415 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0535 0.101 0.22 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 847541 sc-eQTL 4.66e-01 0.0758 0.104 0.22 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -287676 sc-eQTL 2.14e-01 -0.106 0.0848 0.22 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -338786 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00411 0.0377 0.22 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -337556 sc-eQTL 3.06e-01 0.109 0.106 0.22 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -37415 sc-eQTL 2.17e-01 0.111 0.0895 0.22 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -258982 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00417 0.0892 0.22 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 847541 sc-eQTL 6.20e-01 0.0577 0.116 0.22 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -238272 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0368 0.105 0.22 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -287676 sc-eQTL 2.71e-01 -0.112 0.102 0.22 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -338786 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0203 0.0504 0.22 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -337556 sc-eQTL 5.43e-01 0.0608 0.0998 0.22 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -627345 sc-eQTL 5.12e-02 -0.155 0.0791 0.22 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -37415 sc-eQTL 9.09e-01 0.00756 0.0661 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -258982 sc-eQTL 6.31e-02 -0.173 0.0927 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 847541 sc-eQTL 9.60e-02 0.153 0.0918 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -238272 sc-eQTL 2.66e-01 -0.105 0.094 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -287676 sc-eQTL 1.35e-01 0.113 0.075 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -338786 sc-eQTL 7.30e-01 0.0145 0.0419 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -337556 sc-eQTL 4.96e-02 -0.158 0.08 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -37415 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0417 0.0716 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -258982 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0752 0.0893 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 847541 sc-eQTL 7.36e-01 0.0328 0.0971 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -238272 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0967 0.0969 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -287676 sc-eQTL 3.66e-01 0.0575 0.0635 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -338786 sc-eQTL 7.32e-01 0.0157 0.0458 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -337556 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00658 0.0848 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -37415 sc-eQTL 1.37e-01 0.176 0.118 0.206 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 847541 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00586 0.127 0.206 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -287676 sc-eQTL 6.95e-01 0.0515 0.131 0.206 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -338786 sc-eQTL 4.20e-02 -0.101 0.0492 0.206 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -337556 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0786 0.129 0.206 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -37415 sc-eQTL 8.10e-02 -0.168 0.0955 0.218 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -258982 sc-eQTL 1.48e-01 -0.14 0.0967 0.218 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 847541 sc-eQTL 3.67e-02 0.222 0.106 0.218 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -238272 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0771 0.0959 0.218 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -287676 sc-eQTL 2.07e-01 0.123 0.0973 0.218 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -338786 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0214 0.0425 0.218 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -337556 sc-eQTL 1.11e-01 -0.165 0.103 0.218 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -37415 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0322 0.0724 0.217 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -258982 sc-eQTL 3.09e-01 0.104 0.102 0.217 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 847541 sc-eQTL 4.07e-01 0.0859 0.103 0.217 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -238272 sc-eQTL 8.73e-02 -0.173 0.101 0.217 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -287676 sc-eQTL 7.41e-01 0.0323 0.0976 0.217 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -338786 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0315 0.0489 0.217 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -337556 sc-eQTL 3.03e-01 0.089 0.0862 0.217 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -37415 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0697 0.085 0.223 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -258982 sc-eQTL 4.01e-02 -0.175 0.0845 0.223 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 847541 sc-eQTL 1.50e-01 -0.172 0.119 0.223 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -238272 sc-eQTL 1.47e-01 -0.126 0.0866 0.223 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -287676 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0988 0.104 0.223 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -338786 sc-eQTL 8.31e-01 0.0153 0.0715 0.223 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -337556 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0184 0.106 0.223 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -627345 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0802 0.101 0.223 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 74308 sc-eQTL 1.52e-03 -0.321 0.1 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -37415 sc-eQTL 2.80e-02 -0.127 0.0574 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 847541 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0799 0.0887 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -287676 sc-eQTL 7.05e-02 0.166 0.0911 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -338786 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0492 0.0522 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -337556 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0797 0.0959 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 343895 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0178 0.0927 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 74308 sc-eQTL 7.15e-05 -0.429 0.106 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -37415 sc-eQTL 5.99e-05 -0.178 0.0434 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 847541 sc-eQTL 3.05e-02 0.182 0.0837 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -287676 sc-eQTL 4.54e-02 0.174 0.0867 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -338786 sc-eQTL 2.55e-01 -0.0602 0.0528 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -337556 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0754 0.0997 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 343895 sc-eQTL 3.04e-01 0.0652 0.0633 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -37415 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0298 0.0552 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -258982 sc-eQTL 6.57e-02 -0.165 0.0893 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 847541 sc-eQTL 5.56e-02 0.165 0.0858 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -238272 sc-eQTL 2.26e-01 -0.114 0.0936 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -287676 sc-eQTL 1.50e-01 0.0893 0.0618 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -338786 sc-eQTL 8.04e-01 0.0106 0.0426 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -337556 sc-eQTL 1.73e-01 -0.103 0.0754 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -37415 sc-eQTL 2.13e-01 -0.0846 0.0677 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -258982 sc-eQTL 9.10e-01 0.0113 0.0999 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 847541 sc-eQTL 3.09e-02 0.209 0.0962 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -238272 sc-eQTL 1.95e-01 -0.128 0.0986 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -287676 sc-eQTL 2.54e-01 0.106 0.0931 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -338786 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0366 0.0395 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -337556 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0115 0.0962 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -37415 sc-eQTL 9.27e-01 0.00727 0.0794 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 847541 sc-eQTL 9.70e-01 0.0029 0.0771 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -287676 sc-eQTL 9.53e-01 0.00596 0.101 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -338786 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0173 0.041 0.222 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079931 MOXD1 74308 eQTL 7.13e-07 -0.172 0.0344 0.00139 0.0 0.22
ENSG00000118520 ARG1 902639 eQTL 0.00967 0.0551 0.0212 0.0 0.0 0.22
ENSG00000146409 SLC18B1 -337556 eQTL 0.0455 -0.0516 0.0258 0.0 0.0 0.22

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina