Genes within 1Mb (chr6:132468714:G:GC):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 67239 sc-eQTL 1.04e-04 -0.395 0.0998 0.22 B L1
ENSG00000079950 STX7 -44484 sc-eQTL 1.04e-03 -0.127 0.038 0.22 B L1
ENSG00000112282 MED23 840472 sc-eQTL 1.08e-01 0.125 0.0773 0.22 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -294745 sc-eQTL 6.76e-03 0.197 0.0721 0.22 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -345855 sc-eQTL 1.31e-01 -0.0669 0.0441 0.22 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -344625 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0448 0.0933 0.22 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 336826 sc-eQTL 7.47e-01 0.0198 0.0612 0.22 B L1
ENSG00000079950 STX7 -44484 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0601 0.0779 0.22 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 840472 sc-eQTL 4.99e-01 0.0419 0.0619 0.22 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -294745 sc-eQTL 6.04e-01 0.0351 0.0675 0.22 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -345855 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00438 0.0459 0.22 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -344625 sc-eQTL 9.75e-01 0.00293 0.093 0.22 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -44484 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0254 0.0766 0.22 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 840472 sc-eQTL 3.62e-02 0.158 0.0747 0.22 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -294745 sc-eQTL 2.25e-03 0.271 0.0875 0.22 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -345855 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0177 0.0306 0.22 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -344625 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0552 0.0924 0.22 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 -44484 sc-eQTL 7.78e-01 0.0195 0.0693 0.216 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -266051 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0245 0.0859 0.216 DC L1
ENSG00000112282 MED23 840472 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0149 0.101 0.216 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -245341 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0712 0.0926 0.216 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -294745 sc-eQTL 4.40e-02 -0.199 0.0982 0.216 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -345855 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00594 0.0556 0.216 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -344625 sc-eQTL 8.12e-01 0.0209 0.088 0.216 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -634414 sc-eQTL 2.03e-01 -0.102 0.0798 0.216 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -44484 sc-eQTL 1.33e-01 -0.0777 0.0515 0.22 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -266051 sc-eQTL 2.20e-01 -0.109 0.0886 0.22 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 840472 sc-eQTL 1.95e-02 0.196 0.0834 0.22 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -245341 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0837 0.0955 0.22 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -294745 sc-eQTL 1.13e-01 0.107 0.0671 0.22 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -345855 sc-eQTL 7.05e-01 0.0153 0.0404 0.22 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -344625 sc-eQTL 1.35e-01 -0.12 0.0796 0.22 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -44484 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0207 0.0789 0.221 NK L1
ENSG00000112282 MED23 840472 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0393 0.0721 0.221 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -294745 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00508 0.0982 0.221 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -345855 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0134 0.0406 0.221 NK L1
ENSG00000079950 STX7 -44484 sc-eQTL 3.80e-01 0.0683 0.0777 0.22 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 840472 sc-eQTL 3.48e-01 0.0911 0.097 0.22 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -294745 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0365 0.0941 0.22 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -345855 sc-eQTL 2.30e-01 -0.0448 0.0372 0.22 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -344625 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00259 0.102 0.22 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 67239 sc-eQTL 4.33e-02 -0.224 0.11 0.204 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -44484 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0316 0.104 0.204 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 840472 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0581 0.116 0.204 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -294745 sc-eQTL 8.04e-01 0.0276 0.111 0.204 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -345855 sc-eQTL 2.08e-01 -0.075 0.0593 0.204 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -344625 sc-eQTL 1.50e-01 0.15 0.104 0.204 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 336826 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0829 0.0993 0.204 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 67239 sc-eQTL 4.78e-02 -0.194 0.0972 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -44484 sc-eQTL 1.15e-02 -0.161 0.0632 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 840472 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0343 0.0976 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -294745 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0364 0.0967 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -345855 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0381 0.0592 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -344625 sc-eQTL 7.37e-01 0.0358 0.107 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 336826 sc-eQTL 3.31e-01 0.0882 0.0905 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 67239 sc-eQTL 2.46e-02 -0.22 0.0971 0.222 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -44484 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0496 0.077 0.222 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 840472 sc-eQTL 2.51e-01 -0.114 0.099 0.222 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -294745 sc-eQTL 2.15e-02 0.231 0.0995 0.222 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -345855 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0352 0.0485 0.222 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -344625 sc-eQTL 7.01e-02 -0.183 0.101 0.222 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 336826 sc-eQTL 1.99e-01 -0.121 0.0941 0.222 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 67239 sc-eQTL 4.14e-04 -0.382 0.107 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -44484 sc-eQTL 3.44e-03 -0.139 0.047 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 840472 sc-eQTL 1.23e-01 0.132 0.0854 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -294745 sc-eQTL 2.90e-01 0.0985 0.0929 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -345855 sc-eQTL 9.70e-02 -0.0879 0.0527 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -344625 sc-eQTL 3.53e-01 -0.095 0.102 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 336826 sc-eQTL 1.49e-01 0.0976 0.0674 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 67239 sc-eQTL 4.53e-03 -0.292 0.102 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -44484 sc-eQTL 4.13e-04 -0.197 0.0549 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 840472 sc-eQTL 1.05e-02 0.265 0.103 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -294745 sc-eQTL 4.37e-02 0.209 0.103 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -345855 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0586 0.0548 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -344625 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000329 0.105 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 336826 sc-eQTL 9.71e-01 0.00263 0.0727 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -44484 sc-eQTL 2.49e-01 -0.119 0.103 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 840472 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0214 0.107 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -294745 sc-eQTL 9.10e-01 0.0118 0.104 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -345855 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0571 0.048 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -344625 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00183 0.0971 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -44484 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0397 0.0833 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 840472 sc-eQTL 6.29e-01 0.0344 0.0711 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -294745 sc-eQTL 2.78e-01 0.0837 0.077 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -345855 sc-eQTL 7.20e-01 -0.018 0.0501 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -344625 sc-eQTL 9.26e-01 0.00893 0.0964 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -44484 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00135 0.0916 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 840472 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0595 0.0769 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -294745 sc-eQTL 9.19e-01 0.00917 0.0902 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -345855 sc-eQTL 9.71e-01 0.0017 0.0468 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -344625 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00747 0.108 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -44484 sc-eQTL 6.76e-01 0.0439 0.105 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 840472 sc-eQTL 7.38e-01 0.0323 0.0965 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -294745 sc-eQTL 4.34e-01 0.0787 0.1 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -345855 sc-eQTL 9.55e-01 0.00234 0.0413 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -344625 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0268 0.103 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -44484 sc-eQTL 3.57e-01 0.0802 0.0869 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 840472 sc-eQTL 2.11e-01 0.112 0.0889 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -294745 sc-eQTL 5.15e-03 0.275 0.0971 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -345855 sc-eQTL 6.09e-01 0.0271 0.0529 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -344625 sc-eQTL 1.23e-01 -0.158 0.102 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -44484 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0827 0.106 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 840472 sc-eQTL 4.63e-01 0.063 0.0857 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -294745 sc-eQTL 5.72e-03 0.252 0.0904 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -345855 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0328 0.0526 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -344625 sc-eQTL 2.62e-01 -0.119 0.105 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -44484 sc-eQTL 4.66e-01 0.0767 0.105 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 840472 sc-eQTL 5.39e-01 0.0648 0.105 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -294745 sc-eQTL 1.40e-01 -0.154 0.104 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -345855 sc-eQTL 3.64e-01 0.0461 0.0507 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -344625 sc-eQTL 2.98e-01 -0.116 0.111 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -44484 sc-eQTL 3.02e-01 -0.115 0.111 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 840472 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0363 0.107 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -294745 sc-eQTL 3.17e-01 0.111 0.111 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -345855 sc-eQTL 3.93e-01 -0.051 0.0595 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -344625 sc-eQTL 1.97e-01 0.145 0.112 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -44484 sc-eQTL 7.92e-01 0.0263 0.0997 0.219 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 840472 sc-eQTL 4.66e-01 0.0761 0.104 0.219 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -294745 sc-eQTL 2.20e-01 -0.124 0.101 0.219 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -345855 sc-eQTL 1.45e-01 -0.0726 0.0496 0.219 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -344625 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00722 0.105 0.219 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -44484 sc-eQTL 9.09e-01 -0.012 0.105 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 840472 sc-eQTL 2.23e-01 -0.135 0.111 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -294745 sc-eQTL 8.92e-01 0.0145 0.107 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -345855 sc-eQTL 8.72e-02 -0.101 0.059 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -44484 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0709 0.0834 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 840472 sc-eQTL 9.79e-01 0.00229 0.0858 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -294745 sc-eQTL 8.27e-01 0.0228 0.104 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -345855 sc-eQTL 9.93e-01 0.000343 0.0415 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -44484 sc-eQTL 2.20e-01 0.127 0.103 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 840472 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0138 0.105 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -294745 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0781 0.105 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -345855 sc-eQTL 1.35e-01 -0.0731 0.0487 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -44484 sc-eQTL 5.36e-01 0.0582 0.0938 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 840472 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0655 0.097 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -294745 sc-eQTL 9.13e-01 0.0116 0.106 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -345855 sc-eQTL 7.01e-01 0.022 0.0573 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 67239 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0818 0.116 0.219 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -44484 sc-eQTL 1.79e-01 0.13 0.0964 0.219 PB L2
ENSG00000112282 MED23 840472 sc-eQTL 4.77e-01 -0.094 0.132 0.219 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -294745 sc-eQTL 9.00e-01 -0.015 0.119 0.219 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -345855 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0364 0.0674 0.219 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -344625 sc-eQTL 9.02e-01 0.0155 0.126 0.219 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 336826 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0283 0.0831 0.219 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -44484 sc-eQTL 2.12e-01 0.115 0.0923 0.222 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 840472 sc-eQTL 5.26e-01 0.0661 0.104 0.222 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -294745 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0673 0.0993 0.222 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -345855 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0246 0.0376 0.222 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -344625 sc-eQTL 4.24e-01 0.0778 0.0971 0.222 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -44484 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0623 0.102 0.22 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 840472 sc-eQTL 5.07e-01 0.0695 0.104 0.22 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -294745 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0956 0.0853 0.22 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -345855 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0146 0.0379 0.22 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -344625 sc-eQTL 3.80e-01 0.094 0.107 0.22 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -44484 sc-eQTL 1.75e-01 0.122 0.0899 0.22 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -266051 sc-eQTL 8.62e-01 0.0157 0.0898 0.22 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 840472 sc-eQTL 6.34e-01 0.0556 0.117 0.22 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -245341 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0169 0.106 0.22 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -294745 sc-eQTL 2.53e-01 -0.117 0.102 0.22 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -345855 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0136 0.0508 0.22 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -344625 sc-eQTL 5.54e-01 0.0596 0.1 0.22 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -634414 sc-eQTL 4.54e-02 -0.16 0.0795 0.22 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -44484 sc-eQTL 9.42e-01 0.00484 0.0664 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -266051 sc-eQTL 9.85e-02 -0.155 0.0932 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 840472 sc-eQTL 9.28e-02 0.156 0.0921 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -245341 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0898 0.0944 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -294745 sc-eQTL 1.13e-01 0.12 0.0752 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -345855 sc-eQTL 7.21e-01 0.015 0.042 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -344625 sc-eQTL 5.67e-02 -0.154 0.0804 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -44484 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0489 0.0718 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -266051 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0477 0.0897 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 840472 sc-eQTL 6.20e-01 0.0483 0.0974 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -245341 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0948 0.0973 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -294745 sc-eQTL 3.19e-01 0.0636 0.0637 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -345855 sc-eQTL 6.55e-01 0.0206 0.046 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -344625 sc-eQTL 9.69e-01 0.00333 0.0851 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -44484 sc-eQTL 1.54e-01 0.169 0.118 0.203 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 840472 sc-eQTL 9.51e-01 0.00792 0.127 0.203 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -294745 sc-eQTL 6.64e-01 0.0571 0.131 0.203 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -345855 sc-eQTL 4.72e-02 -0.0988 0.0493 0.203 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -344625 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0824 0.129 0.203 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -44484 sc-eQTL 8.42e-02 -0.166 0.0959 0.218 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -266051 sc-eQTL 1.76e-01 -0.132 0.0971 0.218 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 840472 sc-eQTL 6.32e-02 0.199 0.106 0.218 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -245341 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0605 0.0964 0.218 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -294745 sc-eQTL 2.17e-01 0.121 0.0977 0.218 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -345855 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0121 0.0427 0.218 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -344625 sc-eQTL 5.75e-02 -0.197 0.103 0.218 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -44484 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0381 0.0727 0.217 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -266051 sc-eQTL 3.63e-01 0.0934 0.103 0.217 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 840472 sc-eQTL 3.75e-01 0.0924 0.104 0.217 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -245341 sc-eQTL 7.69e-02 -0.18 0.101 0.217 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -294745 sc-eQTL 9.31e-01 0.0085 0.0981 0.217 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -345855 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0251 0.0492 0.217 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -344625 sc-eQTL 2.49e-01 0.1 0.0866 0.217 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -44484 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0658 0.0859 0.223 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -266051 sc-eQTL 6.55e-02 -0.159 0.0857 0.223 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 840472 sc-eQTL 1.40e-01 -0.178 0.12 0.223 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -245341 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0978 0.0878 0.223 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -294745 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0987 0.105 0.223 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -345855 sc-eQTL 7.14e-01 0.0265 0.0723 0.223 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -344625 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0191 0.107 0.223 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -634414 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0858 0.102 0.223 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 67239 sc-eQTL 8.17e-04 -0.34 0.1 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -44484 sc-eQTL 3.06e-02 -0.126 0.0577 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 840472 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0705 0.0891 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -294745 sc-eQTL 4.47e-02 0.185 0.0914 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -345855 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0561 0.0524 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -344625 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0678 0.0963 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 336826 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00359 0.0931 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 67239 sc-eQTL 9.65e-05 -0.422 0.106 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -44484 sc-eQTL 1.15e-04 -0.171 0.0436 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 840472 sc-eQTL 2.92e-02 0.184 0.0838 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -294745 sc-eQTL 4.02e-02 0.179 0.0867 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -345855 sc-eQTL 2.19e-01 -0.0651 0.0528 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -344625 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0608 0.0999 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 336826 sc-eQTL 2.73e-01 0.0696 0.0633 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -44484 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0329 0.0554 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -266051 sc-eQTL 1.19e-01 -0.141 0.0899 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 840472 sc-eQTL 4.54e-02 0.173 0.0861 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -245341 sc-eQTL 2.81e-01 -0.102 0.094 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -294745 sc-eQTL 1.12e-01 0.0989 0.062 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -345855 sc-eQTL 7.86e-01 0.0116 0.0427 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -344625 sc-eQTL 1.96e-01 -0.0983 0.0758 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -44484 sc-eQTL 2.01e-01 -0.0871 0.0679 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -266051 sc-eQTL 9.11e-01 0.0113 0.1 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 840472 sc-eQTL 3.82e-02 0.202 0.0967 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -245341 sc-eQTL 2.05e-01 -0.126 0.099 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -294745 sc-eQTL 3.29e-01 0.0915 0.0935 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -345855 sc-eQTL 4.07e-01 -0.033 0.0397 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -344625 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0229 0.0965 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -44484 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0185 0.0794 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 840472 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00345 0.0771 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -294745 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00441 0.101 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -345855 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0146 0.041 0.222 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079931 MOXD1 67239 eQTL 8.97e-07 -0.17 0.0343 0.00124 0.0 0.22
ENSG00000118520 ARG1 895570 eQTL 0.0185 0.05 0.0212 0.0 0.0 0.22
ENSG00000146409 SLC18B1 -344625 eQTL 0.0488 -0.0507 0.0257 0.0 0.0 0.22


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina